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Homology
BLAST of jgi.p|Trimin1|349938 vs. uniprot
Match: A0A836CAP6_9STRA (EGF-like domain-containing protein n=1 Tax=Tribonema minus TaxID=303371 RepID=A0A836CAP6_9STRA) HSP 1 Score: 506 bits (1302), Expect = 5.430e-182 Identity = 224/224 (100.00%), Postives = 224/224 (100.00%), Query Frame = 1
Query: 1 MGAGLCPLLVCCPKNCPLCANRANCLKNADDPSCCPKKDITTSLQRVDTGLSDIEVSCRYKAPPCTMPPADDPCVGQHGDRVVCLRNARCGVRYVSDDPGYVQGTSTSADNGCIGTEFYCKCPEGVTGRRCERKCKKGQTACGYGFDPVCVRVGEHYGYTTKCVPKGHPEKCSPSAWAHPQLPDPCQNGGKCVNLNYWQQPYNAAYVCRCAKGFHGPLCQYKDK 672
MGAGLCPLLVCCPKNCPLCANRANCLKNADDPSCCPKKDITTSLQRVDTGLSDIEVSCRYKAPPCTMPPADDPCVGQHGDRVVCLRNARCGVRYVSDDPGYVQGTSTSADNGCIGTEFYCKCPEGVTGRRCERKCKKGQTACGYGFDPVCVRVGEHYGYTTKCVPKGHPEKCSPSAWAHPQLPDPCQNGGKCVNLNYWQQPYNAAYVCRCAKGFHGPLCQYKDK
Sbjct: 1 MGAGLCPLLVCCPKNCPLCANRANCLKNADDPSCCPKKDITTSLQRVDTGLSDIEVSCRYKAPPCTMPPADDPCVGQHGDRVVCLRNARCGVRYVSDDPGYVQGTSTSADNGCIGTEFYCKCPEGVTGRRCERKCKKGQTACGYGFDPVCVRVGEHYGYTTKCVPKGHPEKCSPSAWAHPQLPDPCQNGGKCVNLNYWQQPYNAAYVCRCAKGFHGPLCQYKDK 224
BLAST of jgi.p|Trimin1|349938 vs. uniprot
Match: A0A836CBA5_9STRA (EGF-like domain-containing protein n=1 Tax=Tribonema minus TaxID=303371 RepID=A0A836CBA5_9STRA) HSP 1 Score: 409 bits (1050), Expect = 6.990e-143 Identity = 183/241 (75.93%), Postives = 200/241 (82.99%), Query Frame = 1
Query: 1 MGAGLCPLLVCCPKNCPLCANRANCLKNADDPSCCPKKDITTSLQRVDTGLSDIEVSCRYKAPPCTMPPADDPCVGQHGDRVVCLRNARCGVRYVSDDPGYVQGTSTSADNGCIGTEFYCKCPEGVTGRRCERKCKKGQTACGYGFDPV-----------------CVRVGEHYGYTTKCVPKGHPEKCSPSAWAHPQLPDPCQNGGKCVNLNYWQQPYNAAYVCRCAKGFHGPLCQYKDK 672
MGAGLCPLLVCCPKNCPLCA+RANCLK+ADDPSCCPK DI TSLQ +DTGLSDIEVSCRYKAPPCTMPPADDPCV +HG VC ++ARCGVRYVSD P YVQGTSTS D+GCIG E YC CPEG TG RCERKCKKGQT CGYG+ PV CV+VGEH+GY T+C+PKG P+KC+PS + HPQ+PDPC+NGGKCVNLNYWQQP AAYVCRCAKGFHGPLCQYKDK
Sbjct: 30 MGAGLCPLLVCCPKNCPLCADRANCLKHADDPSCCPKPDIATSLQHIDTGLSDIEVSCRYKAPPCTMPPADDPCVDRHG--AVCRQDARCGVRYVSDAPSYVQGTSTSTDSGCIGAEAYCACPEGFTGPRCERKCKKGQTPCGYGYSPVRSKSFGPNDICCARDRVCVKVGEHWGYNTRCLPKGRPQKCTPSKFTHPQVPDPCRNGGKCVNLNYWQQPQYAAYVCRCAKGFHGPLCQYKDK 268
BLAST of jgi.p|Trimin1|349938 vs. uniprot
Match: A0A836CBW0_9STRA (EGF-like domain-containing protein n=1 Tax=Tribonema minus TaxID=303371 RepID=A0A836CBW0_9STRA) HSP 1 Score: 417 bits (1071), Expect = 1.020e-142 Identity = 194/261 (74.33%), Postives = 206/261 (78.93%), Query Frame = 1
Query: 1 MGAGLCPLLVCCPKNCPLCANRANCLKNADDPSCCPKKDITTSLQRVDTGLSDIEVSCRYKAPPCTMPPADDPCVGQHGDRVVCLRNARCGVRYVSDDPGYVQ------------GTSTSADNGCIGTEFYCKCPEGVTGRRCERKCKKGQTACGYGFDP-------------------------VCVRVGEHYGYTTKCVPKGHPEKCSPSAWAHPQLPDPCQNGGKCVNLNYWQQPYNAAYVCRCAKGFHGPLCQYKDK 672
MGAGLCPLLVCCPKNCPLCANRANCLKNA +PSCCP+KDI +LQR+DTGLSDIEVSCRYKAPPCTMPPADDPCVGQHGDRVVCLRNARCGVRYVSDDPGYVQ GT+TS DNGCIGTEFYC+C + VTG RCERKCKKGQTACGY FDP VC RVGE YG+TTKC+PKGHP+KCSPS WAHPQLPDPCQNGGKCVN+N Q AAY+C CAKGFHGPLCQYKDK
Sbjct: 234 MGAGLCPLLVCCPKNCPLCANRANCLKNAKNPSCCPEKDIAATLQRIDTGLSDIEVSCRYKAPPCTMPPADDPCVGQHGDRVVCLRNARCGVRYVSDDPGYVQEDLAYYALGGVQGTTTSTDNGCIGTEFYCECAKDVTGSRCERKCKKGQTACGYEFDPYRSKDFRPNDIARNAPMSGYRHTVLVCERVGEKYGFTTKCLPKGHPKKCSPSPWAHPQLPDPCQNGGKCVNINSNQVAQYAAYLCDCAKGFHGPLCQYKDK 494
BLAST of jgi.p|Trimin1|349938 vs. uniprot
Match: A0A836CCT3_9STRA (EGF-like domain-containing protein n=1 Tax=Tribonema minus TaxID=303371 RepID=A0A836CCT3_9STRA) HSP 1 Score: 343 bits (879), Expect = 3.310e-116 Identity = 163/258 (63.18%), Postives = 183/258 (70.93%), Query Frame = 1
Query: 1 MGAGLCPLLVCCPKNCPLCANRANCLKNADDPSCCPKKDITTSLQRVDTGLSDIEVSCRYKAPPCTMPPADDPCVGQHGDRVVCLRNARCGVRYVSDDPGYVQGTSTSADNGCIGTEFYCKCPEGVTGRRCERKCKKGQTACGY--------GFDP---------VCVRVGEHYGYTTKCVPKGHPEKCSPSAWAHPQLP-----------------DPCQNGGKCVNLNYWQQPYNAAYVCRCAKGFHGPLCQYKDK 672
MGAGLCP+LVCCPKNCPLCA+RANCLK+ADDPSCCPK+DI T+L +DTGLSDIEVSCRYKAPPCTMPPADDPCVG +C ++ARCGVRY+SDDP YVQGT+TS DNGCIGTE YC CP G TGRRCERKCKKGQTACGY GF P VC+RV E +G+ T C+P+GHP +PCQNGG+CVNLN +QQ AYVCRCAKGFHG LCQ+KDK
Sbjct: 56 MGAGLCPMLVCCPKNCPLCADRANCLKHADDPSCCPKQDIATTLLHIDTGLSDIEVSCRYKAPPCTMPPADDPCVGTQAS--MCRQDARCGVRYISDDPSYVQGTTTSTDNGCIGTESYCACPAGFTGRRCERKCKKGQTACGYEVISYHSKGFTPNDICCARNQVCMRVAERFGFKTLCLPEGHPNDSGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXKKCTLNPCQNGGRCVNLNEYQQDQYGAYVCRCAKGFHGALCQFKDK 311
BLAST of jgi.p|Trimin1|349938 vs. uniprot
Match: A0A8C6U631_9GOBI (Uncharacterized protein n=2 Tax=Neogobius melanostomus TaxID=47308 RepID=A0A8C6U631_9GOBI) HSP 1 Score: 60.8 bits (146), Expect = 3.530e-7 Identity = 36/104 (34.62%), Postives = 48/104 (46.15%), Query Frame = 1
Query: 349 EFYCKCPEGVTGRRCERKCKKGQTACGYGFDPVCVRVGEHYGYTTKCVPKGHPEKCSPSAWAHPQLPDPCQNGGKCVNLNYWQQPYNAAYVCRCAKGFHGPLCQ 660
+F C CP+ G++C ++CK+GQ CG G CV + Y KC P C P +PCQNGG CV + C C+ GF G LC+
Sbjct: 97 KFKCDCPKPFKGKKCPKRCKRGQ--CGRG---ECVVTSKPPYYECKCKAPFLPPNCVDYEVCEP---NPCQNGGTCVRDGN-------DFDCTCSPGFTGRLCK 185
BLAST of jgi.p|Trimin1|349938 vs. uniprot
Match: A0A6I9NF02_9TELE (hyaluronan-binding protein 2 n=7 Tax=Notothenioidei TaxID=8205 RepID=A0A6I9NF02_9TELE) HSP 1 Score: 60.1 bits (144), Expect = 6.800e-7 Identity = 35/105 (33.33%), Postives = 48/105 (45.71%), Query Frame = 1
Query: 352 FYCKCPEGVTGRRCER---KCKKGQTACGYGFDPVCVRVGEHYGYTTKCVPKGHPEKCSPSAWAHPQLPDPCQNGGKCVNLNYWQQPYNAAYVCRCAKGFHGPLC 657
F C CP+ G++C+R C++G+ CG G CV + Y KC P C + P +PC+NGGKCVN + C+C GF G C
Sbjct: 112 FECDCPKPFKGKKCQRGPKACRRGR--CGRG---ECVLISNRPYYECKCKAPFQPPHCRSYSLCEP---NPCRNGGKCVNEGN-------DFDCQCQAGFRGRFC 201
BLAST of jgi.p|Trimin1|349938 vs. uniprot
Match: UPI000719DB15 (adhesive plaque matrix protein 2-like n=1 Tax=Priapulus caudatus TaxID=37621 RepID=UPI000719DB15) HSP 1 Score: 56.2 bits (134), Expect = 1.060e-5 Identity = 34/127 (26.77%), Postives = 59/127 (46.46%), Query Frame = 1
Query: 349 EFYCKCPEGVTGRRCERK------------CKKGQ---TACGYGFDPVCVRVGEHYGYTTKCVPKGHPEKCSPSAWAHPQL--PDPCQNGGKCV--NLNYWQQPYNAA-YVCRCAKGFHGPLCQYKD 669
+FYC+CP G +G RCER C+ G T+ +G+D V + KC +C ++P P+PC+NGG C+ + N W + + + + C+C + + G C++ +
Sbjct: 230 DFYCRCPTGYSGTRCERDESSNSDYCYSNPCRNGGVCLTSSSHGWDRSWGSVN----FYCKCPRDYSGTRCERYESSNPDYCHPNPCRNGGVCLTSSSNGWDRSWGSVNFYCKCPRDYSGRHCEHYE 352
BLAST of jgi.p|Trimin1|349938 vs. uniprot
Match: A0A835YZW3_9STRA (Uncharacterized protein (Fragment) n=1 Tax=Tribonema minus TaxID=303371 RepID=A0A835YZW3_9STRA) HSP 1 Score: 503 bits (1294), Expect = 2.840e-171 Identity = 422/429 (98.37%), Postives = 422/429 (98.37%), Query Frame = 2
Query: 2 MARRLAALLLVGQCLHQSIAVVSNLAQIPSAGPALWSANTNINASVRDALRAAKTELDKHTQGARGRTLLGLDDCSDGSAVLPSADVNDRLLAAARSAAAAYSERALTAPSAVGRAAFADGFGKLQEAVEARVRVASANHAACLLQLNARVAELVADVAAXXXXXATCCSGGSGDAXXXXXXXXXXXXXALVECARAAALEAVLEEVPSEALRHELPAVAALDSLDAFVDATALHELCGDGDEAAQQSPRKAAGAAGVVAADAAHLLPQLAAAVPRAAAAAKDAAAQXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXFLAEQIRLVTKAASAAGRAXXXXXXXDPSGAVASIVARMAPPAPQALEAAAA 1288
MARRLAALLLVGQCLHQSIAVVSNLAQIPSAGPALWSANTNINASVRDALRAAKTELDKHTQGARGRTLLGLDDCSDGSAVLPSADVNDRLLAAARSAAAAYSERALTAPSAVGRAAFADGFGKLQEAVEARVRVASANHAACLLQLNARVAELVADVAAXXXXXATCCSGGSGDAXXXXXXXXXXXXXALVECARAAALEAVLEEVPSEALRHELPAVAALDSLDAFVDATALHELCGDGDEAAQQSPRKAAGAAGVVAADAAHLLPQLAAAVPRAAAAAKDAAAQXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXFLAEQIRLVTKAASAAGRA DPSGAVASIVARMAPPAPQALEAAAA
Sbjct: 1 MARRLAALLLVGQCLHQSIAVVSNLAQIPSAGPALWSANTNINASVRDALRAAKTELDKHTQGARGRTLLGLDDCSDGSAVLPSADVNDRLLAAARSAAAAYSERALTAPSAVGRAAFADGFGKLQEAVEARVRVASANHAACLLQLNARVAELVADVAAXXXXXATCCSGGSGDAXXXXXXXXXXXXXALVECARAAALEAVLEEVPSEALRHELPAVAALDSLDAFVDATALHELCGDGDEAAQQSPRKAAGAAGVVAADAAHLLPQLAAAVPRAAAAAKDAAAQXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXFLAEQIRLVTKAASAAGRASAAAAWADPSGAVASIVARMAPPAPQALEAAAA 429
The following BLAST results are available for this feature:
Alignments
The following features are aligned
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Properties
| Property Name | Value |
| ProteomeId | Trimin1|349938|estExt_Genemark1.C_Ctg_520019 |
| BRITE | ko00000,ko00001,ko00002 |
| KEGG Module | M00682 |
| KEGG Pathway | ko01522,ko04320,ko04330,ko04658,ko04919,ko05020,ko05165,ko05200,ko05206,ko05224,map01522,map04320,map04330,map04658,map04919,map05020,map05165,map05200,map05206,map05224 |
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|
| Preferred name | NOTCH2 |
| Description | Neurogenic locus notch homolog protein |
| COG category | T |
| Max annot lvl | 33208|Metazoa |
| EggNOG OGs | KOG1217@1|root,KOG1217@2759|Eukaryota,38BUP@33154|Opisthokonta,3BAFT@33208|Metazoa,3CRZB@33213|Bilateria,485Y1@7711|Chordata,48V3W@7742|Vertebrata,3JA3Y@40674|Mammalia,34ZWA@311790|Afrotheria |
| Evalue | 8.11e-06 |
| Seed ortholog | 9371.XP_004717315.1 |
| Hectar predicted targeting category | other localisation |
| TranscriptId | 350260 |
| Track | FilteredModels1 |
| ProteinId | 349938 |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
spliced messenger RNA >mRNA_9919 ID=mRNA_9919|Name=jgi.p|Trimin1|349938|organism=Tribonema minus UTEX_B_3156 |type=mRNA|length=687bp|location=Sequence derived from alignment at Contig_52:132874..137546+ (Tribonema minus UTEX_B_3156 )|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.
ATGGGTGCCGGGCTGTGTCCATTGCTGGTCTGCTGCCCCAAAAACTGCCC GCTGTGCGCGAACCGCGCCAACTGCCTCAAGAACGCGGACGACCCGTCGT GCTGCCCGAAAAAAGACATCACGACGTCGCTGCAGCGCGTCGACACGGGC CTGTCCGACATTGAGGTCTCCTGCAGGTACAAGGCGCCGCCCTGCACCAT GCCACCCGCGGATGACCCGTGCGTCGGCCAGCACGGCGACAGGGTCGTGT GCCTGCGCAACGCGCGCTGCGGCGTACGCTACGTCAGCGACGACCCCGGC TACGTGCAGGGAACGTCAACTTCAGCCGACAACGGCTGCATCGGCACCGA GTTCTACTGCAAGTGCCCCGAGGGCGTGACCGGGCGGCGCTGCGAGAGGA AGTGCAAGAAGGGACAGACGGCGTGCGGCTACGGGTTCGACCCGGTCTGC GTGAGGGTGGGCGAGCACTACGGCTACACCACCAAGTGCGTGCCCAAGGG GCACCCCGAGAAGTGCTCGCCGAGCGCGTGGGCGCACCCGCAGCTGCCCG ACCCCTGCCAGAACGGCGGCAAGTGCGTCAACCTCAACTACTGGCAGCAG CCGTACAACGCCGCGTACGTGTGCCGCTGCGCCAAGGGGTTCCACGGGCC GCTGTGCCAGTACAAGGACAAGTGACGACGCTCCTTT back to topprotein sequence of jgi.p|Trimin1|349938 >Trimin1|349938|estExt_Genemark1.C_Ctg_520019 ID=Trimin1|349938|estExt_Genemark1.C_Ctg_520019|Name=jgi.p|Trimin1|349938|organism=Tribonema minus UTEX_B_3156 |type=polypeptide|length=225bp
MGAGLCPLLVCCPKNCPLCANRANCLKNADDPSCCPKKDITTSLQRVDTG LSDIEVSCRYKAPPCTMPPADDPCVGQHGDRVVCLRNARCGVRYVSDDPG YVQGTSTSADNGCIGTEFYCKCPEGVTGRRCERKCKKGQTACGYGFDPVC VRVGEHYGYTTKCVPKGHPEKCSPSAWAHPQLPDPCQNGGKCVNLNYWQQ PYNAAYVCRCAKGFHGPLCQYKDK* back to topmRNA from alignment at Contig_52:132874..137546+ Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >mRNA_9919 ID=mRNA_9919|Name=jgi.p|Trimin1|349938|organism=Tribonema minus UTEX_B_3156 |type=mRNA|length=4673bp|location=Sequence derived from alignment at Contig_52:132874..137546+ (Tribonema minus UTEX_B_3156 ) ATGGGTGCCGGGCTGTGTCCATTGCTGGTCTGCTGCCCCAAAAAGTGAGT
CGCCCCCCCCCCCACCCCCCAAGAGTGAGTTACTCATGCCTTGCTTCCTG
CAGGCATGCGCGGCGCGTCGTTCTAACAGTGGGTGCAACAGCGTGCGCCC
GAGGGCGGCATATGTCAGTGCCCACATGCGCGGCAGTATCTCTGCGCTGT
TGCTCCTCCCCGCGGCTGGCTGCAGCGGCTGTCGCTGCTGGTTACGACCG
TGAACCTGCGGCAGACTCATTGAGGCAGGCAGTAGCATTTGTGTGTGCAT
AATGCGGCACGCAGCAGTGGACTCCGCCCAGTGTCGGACCTCTGGACCGG
GGCAGGCGCGTAATGTTCTTCAAGGTAGATCGGCGGCAAGCTGGCAGTGC
TCATCTTACAGCACGTGGCGCAACCCCCGAGTCACTCACGCCCGTCCCCA
GCCCCCCCCGTCCGCCCCTACCCCCCCTTCCCCAGCACAGCACTACATCA
AGTACCCTGCGCTCAATAGACATTGCCCTCCTGCCGATGTTCGTTGTCGC
CGCCGCTGCGTCGTAGCAGACGCTTCGCCTGCTGCGCGCTGCACCGCATG
TTAGGCCTTACAAGCAAGGGGGCCCGGGGCTACGTAATATATGCCGTCAA
GCAACGTTTCTAACTTGAAGCACTCCTCATTGCGCCTTGCTATGGCTGAC
AGATGTGGTCCATGGAGATGTGCCAGATGGGGCCAGCGCATATCGGCGCC
ATTGTCACGGTTGTGCGCCGCCAGCTCACTCACTCACTCACTCACTCACT
CAGTGACACTCACTCTCTCACTCACTCACTCACTCTCAGCACTGCCAGGG
ACTGTGGGGTGCTCAAATACTGCATTGAGCACGCACCGCGATTTTTGTGC
ATCGGAGTATTGTGCTCATGGCAGTGGGACTGAGAAGCTCGCAATTATGC
AGCTGATGGTTGGGCATGCTACGCACTCAGGCTGCTGTGCTGCCCGCCGG
CTGCCCAGGGCCCGCTGCAGAGCAGAAAGTTGTGCGTCGACCATTTAATC
AGGAGGCTCCGAGCCCAAGAAGTGCTGTACTAGGCCTGGTTGCACTTGGC
TTTCAAGTGCAAATAGCATGTGCTAAGGGGCACACCGTATCGCCGCCATT
GCTTTAAAATTTGTGGTACGCTTTGCTGTTGCAGCTGCCCGCTGTGCGCG
AACCGCGCCAACTGCCTCAAGAACGCGGACGACCCGTCGTGCTGCCCGAA
AAAAGACATCACGACGTCGCTGCAGCGCGTCGACACGGGCCTGTCCGACA
TTGAGGTCTCCTGCAGGTGAATGAACAAACAAACCATCAGCACCTTTGCG
CATTTTGATGTAGTTGCGCACCGCGCGCAATGTGGACATGACAGTTGCGT
GCACGGCACATGTGCCACTGCGCTTATGACATGGACATTTTGTACCACTT
CAAGTCTCCTGCAGGTGAGAAGAAGAGTCAATCAGCCCCACTTCGCACTC
CACACTTGGGGTGCCTGTCGTGCTGCTCATACCGTATGCAGACATGTGGG
CCTGCGTACTGAACAAGCATAAAGGCGACCCTAGAGACACAGAGCAGATG
TGCCAGGTACAGGCCTTGTCGAGCTTGAGTGGCAGAGCAACATTCAGGAC
ACAGAGACCAAAATACACGGTGCAACGCTTACATTTAGACTGCTGGCACT
GCAGGTACAAGGACCACACACACAACTTGTAGTTGACGACAATATCTCAA
GCGCAAACGAGCGCGGTGCCGGCCGGATGCTGAGCACTGATGTTGCAGGT
ACACCCCCCCCCGCCTTGCGACGGTGCCACACACGGACCCTCTACTTCAG
GTGCAGAGCACAAATCTCTAGCACTGACGCTGCAGGTGTTCCGCCCTGCA
ACACGTCACCCACAGACGATAGATCTCGCTCACAACAGCGTCTGAGAGTC
GAGCGCGAACGAGAGCGATGCTGGCTGCGTAGACTCTCGGAAGCGACCAT
GGCAATGCGCAGTGATGCTGCAGGTGTTTCGCCCTGCATCACGCCACCCG
CAGACAGTAGATCTCGCTCACAACAGCGTCTCCGAGTCGAGCGCGAACAA
GTGCGGTGCTGACCGCGCTGTGTCGCAACTGCACTGCTGACTGCGCTGCG
GCGATGCACTGCGCGCGGACGCTGCTGCAGGTGCAAGGCGCCGCGCTGCA
CCGCGCCGCCTGCAACTGTTACAGATGCATGCAGAAACTCAACCTGCAAA
GTGTTCACTGCCTGACTTGAAAGCACGGCTGCAGAGCAGTGCTGACTGCG
TGGTGGCGATGGCGTGCTGAGCGCTGATGCTGCAGGTACAAGGCGCCAGA
TACATGTAGGCACTTTACCTGCCAGTAACAAGCATTCGTTGCTTGACTTG
AGATCATGGTTGAGAGCAATGCTGATGGCTGCGATGGCTTGCTGAGCGCT
GACGCTGCAGGCACAAGGCGCCGCCCTGCACCACGCCGCCCGCGCACGAC
AGGCCGTTCGAGCTCAACCTGCAAAGTACTTATCGGAGCCCTGAGCACTG
ACATTGAGCACTACCGTGCTGCTGCAGGTACAAGGCGCCGCCCTGCACCA
TGCCACCCGCGGATGACCCGTGCGTCGGCCAGCACGGCGACAGGGTCGTG
TGCCTGCGCAACGCGCGCTGCGGCGTACGCTACGTCAGCGACGACCCCGG
CTACGTGCAGGTACGACGCTCTCAGTAAGAACATGCGATCTGCGCACTGC
CGGTGTGTGCTACCGCCATGGCCTTGTTCAAACTTCTCTGTGCTCTGATA
GGGGGGTTTTGGCGCACTAGGCTACCCCCCCGGCTGCGTGCAGCTGCGCC
GCCCTTGCGTGCTCGAGTGCCTTTGTCGTGTTGGCCCCAAGTCACAGGGG
CTTTGAAGTAGTACGCCCCCCCGCTTTGGGCAGGTGCGCCCCGCCTGCGC
CACCAAGTCTGGTCTTTGTCAGGAGCGTTCGTGATGTACTCAGTGTAGCA
GGAACCTTCGCTTGTTGATTGCGCCTGCGTGGTAAAGGCAGCAGCACTTC
CCTTTGCGCGCTGCCTGGTCAGACATTCTTGATCGGGTAGCCAGTTGCGC
TACTGCGTCAAGCCTTGGTGGTGCTGCGGCTTCGCTGTTGCTGCGCGAAA
TGCGGCCAAACCTGCAGGCCACGTCCCTGTTGCCCTGAACTGCTCTGCAC
AAGCAACGCGTACGAGCCTTGTGACCCCCTCGGATGCCGTTCCCGCTCCT
GCATCTGGGGCACGTTGACTTTGCCAGACGACGGCTGCAGTGGCACCAGG
TTCTACTGCTTGAAGTATGCAGCGACCCCGCTGCTCGGATTGCGGCGCCA
TGTGCTCTCTCACACACACACGCCATGAACTTGATATGCTCTTCGGCTGC
CGCTCCCCCTCCCCCTCCAGGGTACGTCAACTTCGACCGACAACGGCTGC
ATCGGCACCGAGTTCTACAGCTTGAAGGACGCAATGACCCTGCCGCTTGG
ATTGCTCTTCCATTTGCTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACACACACA
CACACCATGAATCCGATGCACCCCTCATTGCTGCTCTCACTCCCCATCCA
GGGAACGTCAACTTCAGCCGACAACGGCTGCATCGGCACCGAGTTCTACT
GCAAGTGCCCCGAGGGCGTGACCGGGCGGCGCTGCGAGAGGAAGTGCAAG
AAGGGACAGACGGCGTGCGGCTACGGGTTCGACCCGGTCCGCTCCAAGTA
CTTCACGCCGAACACCATCTGCTGCGCGCGCGGAAAGGCGAGCCGTTGAA
GTCGTGGAGTTGAAGTTTCTGTGCAGTTTTGTGCGCCTGCCATCGCGTGA
CCGGCCGTCTCGCCATCTCTTCAACTGAGGCACCGCTGCCGTCCATGTAC
ATAGGGCGTACGCCGTGCGCCCGCGCGTCCGCCGCGTGCTCTGCCCTTGC
GATTTTCAGTGGATTGTTGCTTAGGGCGCGGACGTTCTTGTTGATCAGTC
CTTGCTCAGGGCGCAGTGTCGCCCAGATGGTCGACGTTTCTCACAGCACG
CTCAGAGCGCGAAGCGGCGCGCATGCGGGTGCCGCCACCCTGCCTGGTCA
CCGATCCAGCAATTTCAAGTCATTGCGCCCAAGTGATGGGAGCCCGCAAC
TGCTCACTGCGGCGCGCCGCCATACTGCGCGTGTGTTGTCTTGCAAGGGT
ATGACACTGCAAAATACGGATTTGCCAACACTGGCAGTGGTGATATGCCT
GGCGCCACTTGCAAATCGCCGGAGGAAGCAGCTGCGCACGCACGCACGCA
CGAACACACCCCGTGCGCAACACGCACTATGTACGCCATTCAGCTGAAGT
CGCTCTCAAGCAAACTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
CCTCCCCCCCCCCCACACACACCGGTGCAGGTCTGCGTGAGGGTGGGCGA
GCACTACGGCTACACCACCAAGTGCGTGCCCAAGGGGCACCCCGAGAAGT
GCTCGCCGAGCGCGTGGGCGCACCCGCAGCTGCCCGACCCCTGCCAGAAC
GGCGGCAAGTGCGTCAACCTCAACTACTGGCAGCAGCCGTACAACGCCGC
GTACGTGTGCCGCTGCGCCAAGGGGTTCCACGGGCCGCTGTGCCAGTACA
AGGACAAGTGACGACGCTCCTTT back to topCoding sequence (CDS) from alignment at Contig_52:132874..137546+ >mRNA_9919 ID=mRNA_9919|Name=jgi.p|Trimin1|349938|organism=Tribonema minus UTEX_B_3156 |type=CDS|length=675bp|location=Sequence derived from alignment at Contig_52:132874..137546+ (Tribonema minus UTEX_B_3156 ) ATGGGTGCCGGGCTGTGTCCATTGCTGGTCTGCTGCCCCAAAAACTGCCC GCTGTGCGCGAACCGCGCCAACTGCCTCAAGAACGCGGACGACCCGTCGT GCTGCCCGAAAAAAGACATCACGACGTCGCTGCAGCGCGTCGACACGGGC CTGTCCGACATTGAGGTCTCCTGCAGGTACAAGGCGCCGCCCTGCACCAT GCCACCCGCGGATGACCCGTGCGTCGGCCAGCACGGCGACAGGGTCGTGT GCCTGCGCAACGCGCGCTGCGGCGTACGCTACGTCAGCGACGACCCCGGC TACGTGCAGGGAACGTCAACTTCAGCCGACAACGGCTGCATCGGCACCGA GTTCTACTGCAAGTGCCCCGAGGGCGTGACCGGGCGGCGCTGCGAGAGGA AGTGCAAGAAGGGACAGACGGCGTGCGGCTACGGGTTCGACCCGGTCTGC GTGAGGGTGGGCGAGCACTACGGCTACACCACCAAGTGCGTGCCCAAGGG GCACCCCGAGAAGTGCTCGCCGAGCGCGTGGGCGCACCCGCAGCTGCCCG ACCCCTGCCAGAACGGCGGCAAGTGCGTCAACCTCAACTACTGGCAGCAG CCGTACAACGCCGCGTACGTGTGCCGCTGCGCCAAGGGGTTCCACGGGCC GCTGTGCCAGTACAAGGACAAGTGA back to top
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