mRNA_S-ischiensis_contig110.2402.1 (mRNA) Schizocladia ischiensis KU_0333

You are viewing an mRNA, more information available on the corresponding polypeptide page

Overview
NamemRNA_S-ischiensis_contig110.2402.1
Unique NamemRNA_S-ischiensis_contig110.2402.1
TypemRNA
OrganismSchizocladia ischiensis KU_0333 (Schizocladia ischiensis KU_0333)
Homology
BLAST of mRNA_S-ischiensis_contig110.2402.1 vs. uniprot
Match: A0A7U3NQV8_9STRA (DNA-directed RNA polymerase subunit beta'' n=1 Tax=Schizocladia ischiensis TaxID=196139 RepID=A0A7U3NQV8_9STRA)

HSP 1 Score: 2503 bits (6486), Expect = 0.000e+0
Identity = 1268/1268 (100.00%), Postives = 1268/1268 (100.00%), Query Frame = 1
Query:    1 MIEQSNLFCNNVLNKKELKTIIAWAFKNFGSLKAAYLVDELKDIGFQYATKAGISISLEDLKIPPSKTNLVRDALANTVEAEWETIKGEISEVERLQKVINIWNITSETLKERVIKYFQEKDPLNSVYIMAFSGARGNISQVRQLVGMRGLMSDPNGQIIDIPIQSNFREGLSITDYIISSYGARKGLVDTAIKTADSGYLTRRLVDIAQSVVIRELDCRSQRGIKIKEIIEDNDILFSLQERIVGRVLACNIIDPRTKTIIAYKNELITPRLAEKIMKYNNNSIIVRSPLTCECRRSICQKCYGNNLATGNLVELGEPVGIIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVFTSDFSRQVRAQCSGYIKFSSTLNTRELRTNYGKDVLVCENQSFIKLITYTNQIKEIKIFPKSIIIVGNNSFVKKNDILFELPPKNKMMQDDASALNDVIAKQSGEIIIEKQNFFNQNKTLNVRKSNIVHNLVWILSGYVTKIPFATKLKIYPLMNISKNQNLTQSKITNKFSGYIKFIKNLNTSKIIRFKLISSLGMCQKQKIILESKDTKITQCKIYLAKFGSIYLNPYPLDKSVLTLGCLKLLKYKTKTGGNFYSTNSQRTEYGSSVFYIPESTYNINFDVTALKVNFGDYVNKKTEIYKNYFIDIAGIIQFDETKPNNREIIIKPGYIIPFPNSLIDILEYDGQIFYPGEIIFDNFEINTASYIEVCSIKNNLFLLLRPVIRYEIPNPENFNNFFPNWFDPHQIELDQVPLNLISEMKIKTENPIYFIKHHFFINFLENYSNIFFEINQATQPDNYGYFKLILGTNIIPEKILPKEMFKEEVRLSLFIQDKQFVEQETLLASFDVIIPFATTVLGIKKQIKNKQKKILLTTEQDYKVIFIEDTDFQLKNNQLIKLGKKIGTNFFNKESRLIEQISGNKITFRISHPYLFSKGAQLRIESGDLIKLKDVLGQLVYERLITGDIVQGLPRVEEILEARHPKVEAKVAPYPGIITKVIEHQVNTLIWIKHKGSRFDQLINIEGSPNSIQGSPNLLIRKFDFVNVCQCLTEGTLNPHTILDVYFQYYCSIKILSMYQASYYSFKKVQFFLLNSVQAVYYSQGVFIADKHLEIIIKQMTNRIEIIYPGDTNFLSGDLLELEQVRYINACLSKKRKIYFKPILLGITKSALKAEGFLSAASFQYTTRVLTQASIEGRVDWITGLKENVIVGKLIPCGTGFYSNNDFSYLKVKMPTLNNNHNSNIKNDDQTKHHKLRSAIKFRYRI 3804
            MIEQSNLFCNNVLNKKELKTIIAWAFKNFGSLKAAYLVDELKDIGFQYATKAGISISLEDLKIPPSKTNLVRDALANTVEAEWETIKGEISEVERLQKVINIWNITSETLKERVIKYFQEKDPLNSVYIMAFSGARGNISQVRQLVGMRGLMSDPNGQIIDIPIQSNFREGLSITDYIISSYGARKGLVDTAIKTADSGYLTRRLVDIAQSVVIRELDCRSQRGIKIKEIIEDNDILFSLQERIVGRVLACNIIDPRTKTIIAYKNELITPRLAEKIMKYNNNSIIVRSPLTCECRRSICQKCYGNNLATGNLVELGEPVGIIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVFTSDFSRQVRAQCSGYIKFSSTLNTRELRTNYGKDVLVCENQSFIKLITYTNQIKEIKIFPKSIIIVGNNSFVKKNDILFELPPKNKMMQDDASALNDVIAKQSGEIIIEKQNFFNQNKTLNVRKSNIVHNLVWILSGYVTKIPFATKLKIYPLMNISKNQNLTQSKITNKFSGYIKFIKNLNTSKIIRFKLISSLGMCQKQKIILESKDTKITQCKIYLAKFGSIYLNPYPLDKSVLTLGCLKLLKYKTKTGGNFYSTNSQRTEYGSSVFYIPESTYNINFDVTALKVNFGDYVNKKTEIYKNYFIDIAGIIQFDETKPNNREIIIKPGYIIPFPNSLIDILEYDGQIFYPGEIIFDNFEINTASYIEVCSIKNNLFLLLRPVIRYEIPNPENFNNFFPNWFDPHQIELDQVPLNLISEMKIKTENPIYFIKHHFFINFLENYSNIFFEINQATQPDNYGYFKLILGTNIIPEKILPKEMFKEEVRLSLFIQDKQFVEQETLLASFDVIIPFATTVLGIKKQIKNKQKKILLTTEQDYKVIFIEDTDFQLKNNQLIKLGKKIGTNFFNKESRLIEQISGNKITFRISHPYLFSKGAQLRIESGDLIKLKDVLGQLVYERLITGDIVQGLPRVEEILEARHPKVEAKVAPYPGIITKVIEHQVNTLIWIKHKGSRFDQLINIEGSPNSIQGSPNLLIRKFDFVNVCQCLTEGTLNPHTILDVYFQYYCSIKILSMYQASYYSFKKVQFFLLNSVQAVYYSQGVFIADKHLEIIIKQMTNRIEIIYPGDTNFLSGDLLELEQVRYINACLSKKRKIYFKPILLGITKSALKAEGFLSAASFQYTTRVLTQASIEGRVDWITGLKENVIVGKLIPCGTGFYSNNDFSYLKVKMPTLNNNHNSNIKNDDQTKHHKLRSAIKFRYRI
Sbjct:    1 MIEQSNLFCNNVLNKKELKTIIAWAFKNFGSLKAAYLVDELKDIGFQYATKAGISISLEDLKIPPSKTNLVRDALANTVEAEWETIKGEISEVERLQKVINIWNITSETLKERVIKYFQEKDPLNSVYIMAFSGARGNISQVRQLVGMRGLMSDPNGQIIDIPIQSNFREGLSITDYIISSYGARKGLVDTAIKTADSGYLTRRLVDIAQSVVIRELDCRSQRGIKIKEIIEDNDILFSLQERIVGRVLACNIIDPRTKTIIAYKNELITPRLAEKIMKYNNNSIIVRSPLTCECRRSICQKCYGNNLATGNLVELGEPVGIIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVFTSDFSRQVRAQCSGYIKFSSTLNTRELRTNYGKDVLVCENQSFIKLITYTNQIKEIKIFPKSIIIVGNNSFVKKNDILFELPPKNKMMQDDASALNDVIAKQSGEIIIEKQNFFNQNKTLNVRKSNIVHNLVWILSGYVTKIPFATKLKIYPLMNISKNQNLTQSKITNKFSGYIKFIKNLNTSKIIRFKLISSLGMCQKQKIILESKDTKITQCKIYLAKFGSIYLNPYPLDKSVLTLGCLKLLKYKTKTGGNFYSTNSQRTEYGSSVFYIPESTYNINFDVTALKVNFGDYVNKKTEIYKNYFIDIAGIIQFDETKPNNREIIIKPGYIIPFPNSLIDILEYDGQIFYPGEIIFDNFEINTASYIEVCSIKNNLFLLLRPVIRYEIPNPENFNNFFPNWFDPHQIELDQVPLNLISEMKIKTENPIYFIKHHFFINFLENYSNIFFEINQATQPDNYGYFKLILGTNIIPEKILPKEMFKEEVRLSLFIQDKQFVEQETLLASFDVIIPFATTVLGIKKQIKNKQKKILLTTEQDYKVIFIEDTDFQLKNNQLIKLGKKIGTNFFNKESRLIEQISGNKITFRISHPYLFSKGAQLRIESGDLIKLKDVLGQLVYERLITGDIVQGLPRVEEILEARHPKVEAKVAPYPGIITKVIEHQVNTLIWIKHKGSRFDQLINIEGSPNSIQGSPNLLIRKFDFVNVCQCLTEGTLNPHTILDVYFQYYCSIKILSMYQASYYSFKKVQFFLLNSVQAVYYSQGVFIADKHLEIIIKQMTNRIEIIYPGDTNFLSGDLLELEQVRYINACLSKKRKIYFKPILLGITKSALKAEGFLSAASFQYTTRVLTQASIEGRVDWITGLKENVIVGKLIPCGTGFYSNNDFSYLKVKMPTLNNNHNSNIKNDDQTKHHKLRSAIKFRYRI 1268          
BLAST of mRNA_S-ischiensis_contig110.2402.1 vs. uniprot
Match: A0A8F0FAT1_9PHAE (DNA-directed RNA polymerase n=1 Tax=Desmarestia aculeata TaxID=62298 RepID=A0A8F0FAT1_9PHAE)

HSP 1 Score: 1176 bits (3042), Expect = 0.000e+0
Identity = 611/1287 (47.47%), Postives = 873/1287 (67.83%), Query Frame = 1
Query:    1 MIEQSNLFCNNVLNKKELKTIIAWAFKNFGSLKAAYLVDELKDIGFQYATKAGISISLEDLKIPPSKTNLVRDALANTVEAEWETIKGEISEVERLQKVINIWNITSETLKERVIKYFQEKDPLNSVYIMAFSGARGNISQVRQLVGMRGLMSDPNGQIIDIPIQSNFREGLSITDYIISSYGARKGLVDTAIKTADSGYLTRRLVDIAQSVVIRELDCRSQRGIKIKEIIE-DNDILFSLQERIVGRVLACNIIDPRTKTIIAYKNELITPRLAEKIMKYNNNSIIVRSPLTCECRRSICQKCYGNNLATGNLVELGEPVGIIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVFTSDFSRQVRAQCSGYIKFSSTLNTRELRTNYGKDVLVCENQSFIKLITYTNQIKEIKIFPKSIIIVGNNSFVKKNDILFELPPKNKMMQDDASALNDVIAKQSGEIIIEKQNFFNQNKTLNVRKSNIVHNLVWILSGYVTKIPFATKLKIYPLMNISKNQNLTQSKITNKFSGYIKFIKNLNTSKIIRFKLISSLGMCQKQKIILESKDTKITQCKIYLAKFGSIYLNPYPLDKSVLTLGCLKLLKYKTKTGGNFYSTN---------------SQRTEYGSSVFYIPESTYNINFDVTALKVNFGDYVNKKTEIYKNYFIDIAGIIQFDETKPNNREIIIKPGYIIPFPNSLIDILEYDGQIFYPGEIIFDNFEINTASYIEVCSIKNNLFLLLRPVIRYEIPNPENFNNFFPNWFDPHQIELDQVPLNLISEMKIKTENPIYFIKHHFFIN--FLENYSNIFFEINQATQPDNYGYFKLILGTNIIPEKILPKEMFKEEVRLSLFIQDKQFVEQETLLASFDVIIPFATTVLGIKKQIKNKQKKILLTTEQDYKVIFIEDTDFQLKNNQLIKLGKKIGTNFFNKESRLIEQISGNKITFRISHPYLFSKGAQLRIESGDLIKLKDVLGQLVYERLITGDIVQGLPRVEEILEARHPKVEAKVAPYPGIITKVIEHQVNTLIWIKHKGSRFDQLINIEGSPNSIQGSPNLLIRKFDFVNVCQCLTEGTLNPHTILDVYFQYYCSIKILSMYQASYYSFKKVQFFLLNSVQAVYYSQGVFIADKHLEIIIKQMTNRIEIIYPGDTNFLSGDLLELEQVRYINACLSKKR-KIYFKPILLGITKSALKAEGFLSAASFQYTTRVLTQASIEGRVDWITGLKENVIVGKLIPCGTGFYSNNDFSYLKVKMPT--LNNNHNSNIKNDDQTKHHKLRSAIKFRY 3798
            M++QS +F NNV+NKKELK II WAF N+G  KAA+ VD LK+IGF+YATK+GISIS+EDL+IPP+KT L+++A  +    E     GEI+EVER QK+I IWN TSE LKER+I + ++ DPLNSVYIMAFSGARGNISQVRQL+GMRGLMSDPNGQIID  I +NFREGLSITDYIISSYGARKG+VDTAIKTADSGYLTRRLV++AQS++I ELDC+++RGI ++E +E DN    SL++ + GRVLA +I  P T  IIA +NE IT  L EK++      +++RSPLTC+CRRS+CQ CYG NLA+GNLV+LGE VG+IAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGG+FTS+  RQ R++CSGYI F  TL  R  RT+YG+D L+ EN+S+++++ Y N++  +++  +++I+V NN ++K N++LFE  PK K ++     +  + AK+SG+II+E   F  +    +  + +  + + W+LSG V  I F+ KL++  L  + K+Q++ QSK+     G+  F +N  T +I   K+ +        KI LE    +I +CK+YL+ +  + + P  L+  +  +G L   KYKTKTGG F+ +N               + + + GS++FY+PE++     +    K   GD+VNKKTEI+ NYF  I G I F+  K   +EI IKPG       ++ +  ++D QI+YPGEII  N++I   SY+E+ +    ++L LRP+ RYE  N   FN F PN+F    + +    L+++S  +IK + PI FI      +  F EN + + FE     + +++G   L+   ++  + ++PKE+ K+++ L+LFI++KQF +  +++ SFD I+PF   +  IK +    +  +LLTT+ DYK IF++      K NQLIK+ +    N   K+S L++++ GNK+ + +  PYLFSKGA +R   GD IK +++ GQL+YE + TGDIVQGLP++E+ILEAR PK EA ++   G I K I++  + LI+I  K S       ++    +   S  LL++K++ +++ Q LTEG LNPHT+L VYF+Y+ S+  LS+Y+++Y+S K++Q  LLNSVQA+Y SQGV I+ KH+E+I+++MT+++ I YPG TNFL GD+++L+Q  YIN C+ K   K+ F+PILLGITKS+LK +GFL+AASFQ TTRVLTQA+I+G+ DW+ GLKEN I G+LIP GTGFY N D ++ KV +P   L   +NS++K   + K  KL+  IKF+Y
Sbjct:    1 MLKQSKIFSNNVINKKELKKIIEWAFNNYGQRKAAFFVDRLKEIGFEYATKSGISISIEDLRIPPAKTVLMQNATEDVFTTESRANNGEITEVERFQKLIYIWNTTSEELKERLIDFLKKTDPLNSVYIMAFSGARGNISQVRQLIGMRGLMSDPNGQIIDRAIGANFREGLSITDYIISSYGARKGIVDTAIKTADSGYLTRRLVEVAQSIIISELDCKTERGIFLQESLEIDNKRFLSLKQLVNGRVLASSIFKPGTNEIIASRNEQITNELVEKLISLKITKVLIRSPLTCQCRRSVCQHCYGWNLASGNLVDLGETVGLIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGIFTSELIRQSRSECSGYISFLPTLKIRPYRTDYGQDALISENRSWLRIVNYANEVLNVRVEDQTLILVKNNQYIKNNEVLFEAAPKLKEIKLAQKEIKYIYAKESGKIILENNGFPQEIVNDDFDRRSKKNYIFWVLSGQVLSIAFSAKLRVRKLKKVYKDQSIAQSKMVTTIGGFAHFCRNELTQEINGVKIQNFSKSLDSFKIFLEKSSFEIIKCKLYLSHYHEVLIKPEMLENRLFLIGFLNNKKYKTKTGGKFFISNFYKPTLLGTKLRNKINHKIKSGSTIFYLPEASIQTRTNKKDFKFKKGDFVNKKTEIFPNYFTSIDGFIDFEVGK-QIKEITIKPGQRYQVEGNISNWEQFDEQIYYPGEIILGNYKIEVLSYVEIENNNEAIYLHLRPITRYEFTNERPFNFFAPNFFTQVNLIIQDFNLHILSGQQIKLDAPIQFIDSPLTADYSFEENNTEMLFEFKGPEKKNSWGKVNLVYSQSLNFDVVIPKELTKQDICLNLFIEEKQFTDPYSIIGSFDSIMPFDNFIYNIKIKQNEVKSNVLLTTKADYKEIFLDSFTHTYKKNQLIKVHRLFNNNILIKDSGLLKEVLGNKLLYHLGQPYLFSKGALIRKVPGDYIKKQEIFGQLIYELMKTGDIVQGLPKIEDILEARKPKAEALLSTRQGFI-KAIKY-TSELIFIITKPS-------LKSDYYTASRSDRLLVKKYESISIGQPLTEGALNPHTLLHVYFRYFYSLGTLSIYESAYHSIKRLQTLLLNSVQAIYISQGVIISSKHVELIVREMTHKVYIEYPGKTNFLPGDIVDLDQANYINLCIKKNNNKVGFRPILLGITKSSLKTDGFLAAASFQETTRVLTQAAIQGKTDWLRGLKENAITGRLIPAGTGFYLNQDITFNKVLLPKTGLEEKNNSSLKKQLRLKQAKLKRVIKFKY 1277          
BLAST of mRNA_S-ischiensis_contig110.2402.1 vs. uniprot
Match: A0A8F0F804_9PHAE (DNA-directed RNA polymerase n=2 Tax=Laminariales TaxID=2886 RepID=A0A8F0F804_9PHAE)

HSP 1 Score: 1166 bits (3017), Expect = 0.000e+0
Identity = 616/1286 (47.90%), Postives = 850/1286 (66.10%), Query Frame = 1
Query:    1 MIEQSNLFCNNVLNKKELKTIIAWAFKNFGSLKAAYLVDELKDIGFQYATKAGISISLEDLKIPPSKTNLVRDALANTVEAEWETIKGEISEVERLQKVINIWNITSETLKERVIKYFQEKDPLNSVYIMAFSGARGNISQVRQLVGMRGLMSDPNGQIIDIPIQSNFREGLSITDYIISSYGARKGLVDTAIKTADSGYLTRRLVDIAQSVVIRELDCRSQRGIKIKEIIEDNDILF-SLQERIVGRVLACNIIDPRTKTIIAYKNELITPRLAEKIMKYNNNSIIVRSPLTCECRRSICQKCYGNNLATGNLVELGEPVGIIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVFTSDFSRQVRAQCSGYIKFSSTLNTRELRTNYGKDVLVCENQSFIKLITYTNQIKEIKIFPKSIIIVGNNSFVKKNDILFELPPKNKMMQDDASALNDVIAKQSGEIIIEKQNFFNQNKTLNVRKSNIVHNLVWILSGYVTKIPFATKLKIYPLMNISKNQNLTQSKITNKFSGYIKFIKNLNTSKIIRFKLISSLGMCQKQKIILESKDTKITQCKIYLAKFGSIYLNPYPLDKSVLTLGCLKLLKYKTKTGGNFYSTN---------------SQRTEYGSSVFYIPESTYNINFDVTALKVNFGDYVNKKTEIYKNYFIDIAGIIQFDETKPNNREIIIKPGYIIPFPNSLIDILEYDGQIFYPGEIIFDNFEINTASYIEVCSIKNNLFLLLRPVIRYEIPNPENFNNFFPNWFDPHQIELDQVPLNLISEMKIKTENPIYFIKHHFFINFL--ENYSNIFFEINQATQPDNYGYFKLILGTNIIPEKILPKEMFKEEVRLSLFIQDKQFVEQETLLASFDVIIPFATTVLGIKKQIKNKQKKILLTTEQDYKVIFIEDTDFQLKNNQLIKLGKKIGTNFFNKESRLIEQISGNKITFRISHPYLFSKGAQLRIESGDLIKLKDVLGQLVYERLITGDIVQGLPRVEEILEARHPKVEAKVAPYPGIITKVIEHQVNTLIWIKHKGSRFDQLINIEGSPNSIQGSPNLLIRKFDFVNVCQCLTEGTLNPHTILDVYFQYYCSIKILSMYQASYYSFKKVQFFLLNSVQAVYYSQGVFIADKHLEIIIKQMTNRIEIIYPGDTNFLSGDLLELEQVRYINACLSKKRKIYFKPILLGITKSALKAEGFLSAASFQYTTRVLTQASIEGRVDWITGLKENVIVGKLIPCGTGFYSNNDFSYLKVKMPT--LNNNHNSNIKNDDQTKHHKLRSAIKFRY 3798
            M+ +S +F NN +NKKELK II WAFKN+G  KAAY VD+LK+IGF+YATK+GISIS+EDL+IPP+K  L++ A  +   AE +   GEI+EVER Q++I IWN TSE LKER+I +F++ DPLNSVYIMAFSGARGNI+QVRQLVGMRGLMSDPNG+IID  I +NFREGLSITDYIISSYGARKGLVDTAIKTADSGYLTRRLV++AQS++I ELDC+++RGI I+E +E ++  F SL E + GRVLA +I  P TK  IA +N+ ITP L EK++K+  N +++RSPLTCECRR++CQ CYG NLA G LVELGE VG+IAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGG+FTS+  RQ RA CSGY+ F   L     RTNYG+D +V ENQS++ +I Y N+I ++++  ++II+V N++++K+N +LFE  PK K +      +  + AK+ GEI++EK  F   +      + +  + + W+LSG V  I F T LKI  L  I +NQ + QSK+     G++ F +N  T +I    + +S       KI LE  + ++T+CK+YL+    I L P   +  + +LG L+  KYKTKTGG FY +N               + + + GS++FYIPE+T     +    K   G YVNK  EI+ NYF +I G   + ET+   + I IKPG       ++    E + Q++YPGE I + FEI   SYIE   I   ++L +RP+ RYE  N     NF PN F P  + ++   L ++S   IK + PI F+     I++    N + + FE     + ++YG  KL      + + ++PKE+ K ++ L+L +++KQFV+  T+L SFD + PF   V  IK +  + +  +LLTT+ DY+ IF++      K NQ +K+ K    N   K S L+ +++GNKI   +  PY FSKGA +R   GD IK ++  GQLVYERL TGDIVQGLP+++ ILEAR PK EA ++   G I K I++  + ++       R D  I           S  LL++K++ ++V Q LTEG LNPHT+L VYF+Y+CS+  LS+Y+++Y S KK+Q  LL SVQA+Y SQGV I+ KH+E+I+++MT+++ I YPG TNFL GD+++L+Q +YIN C+    K+ F+PILLGITKS+LK +GFL+AASFQ TTRVLT+A+I+G+ DW+ GLKEN I G+LIP GTGFY+N D ++ K  +P   +    N ++K   + K  KL+  IKF+Y
Sbjct:    1 MLNRSKIFSNNTINKKELKKIIEWAFKNYGQRKAAYFVDQLKEIGFEYATKSGISISIEDLRIPPAKIPLMKIASQDVFLAESQANNGEITEVERFQRIIYIWNSTSEELKERLIDFFKKNDPLNSVYIMAFSGARGNIAQVRQLVGMRGLMSDPNGKIIDRAIGANFREGLSITDYIISSYGARKGLVDTAIKTADSGYLTRRLVEVAQSIIISELDCKTERGIFIEEDLEKDEKGFLSLNELLNGRVLASSIFKPGTKDSIALRNQQITPSLLEKLLKFKINKVLIRSPLTCECRRAVCQHCYGWNLALGTLVELGETVGLIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGIFTSELIRQGRAHCSGYLNFLPELKVSPYRTNYGQDAVVSENQSWLAIINYANEIVKVRVEARTIILVANHNYIKRNQVLFEAAPKIKEINLAEKEIKYICAKEPGEIVLEKNGFPEDSSNEIFTQRSKKNYIFWVLSGQVFSIGFNTALKIRKLEKIYRNQAIAQSKMVTTIGGFVHFSRNKLTQEINSLNIQNSSEGLGNFKIFLERNNIEVTKCKVYLSHTHEILLKPELFNNRLFSLGFLRNKKYKTKTGGQFYISNFYKPTLIGNKLGNKSTGKFKSGSTIFYIPEATIQTTSNKKDFKFKKGSYVNKNKEIFPNYFTNIEGFADY-ETEKRTKCITIKPGQRYLLDKNIKLHKEINEQVYYPGEFILNQFEIEVLSYIEFEDINEQVYLYIRPITRYEFTNERPIKNFQPNCFAPLDVMVENFNLQIVSGQHIKIDYPIQFVDSPLVIDYSLQSNDTELIFEFKGPEKKNSYGQVKLSYSQTFLFDTVIPKELKKTDISLNLIVEEKQFVDPYTILGSFDTLFPFDNFVHSIKIKRNSIKSNVLLTTKSDYQEIFLDSFTHNYKQNQFLKVNKLFNNNALIKNSGLMHEVAGNKIVLHLGQPYFFSKGALIRKIPGDYIKKQENFGQLVYERLKTGDIVQGLPKIDNILEARKPKAEALLSTRQGFI-KSIKYSSDLILISTTPSLRQDYYI--------ASRSERLLVKKYECISVGQPLTEGPLNPHTLLHVYFRYFCSLGTLSVYESAYRSLKKLQTLLLTSVQAIYISQGVIISGKHVELIVREMTHKVFIEYPGKTNFLPGDIIDLDQAQYINLCIKNNNKLGFRPILLGITKSSLKTDGFLAAASFQETTRVLTRAAIQGKTDWLRGLKENAITGRLIPAGTGFYANQDITFNKALLPEKLVTKKDNLSLKKQLKLKQTKLKKLIKFKY 1276          
BLAST of mRNA_S-ischiensis_contig110.2402.1 vs. uniprot
Match: D1GJH4_FUCVE (DNA-directed RNA polymerase subunit beta'' n=3 Tax=Fucaceae TaxID=3010 RepID=D1GJH4_FUCVE)

HSP 1 Score: 1151 bits (2978), Expect = 0.000e+0
Identity = 614/1286 (47.74%), Postives = 852/1286 (66.25%), Query Frame = 1
Query:    1 MIEQSNLFCNNVLNKKELKTIIAWAFKNFGSLKAAYLVDELKDIGFQYATKAGISISLEDLKIPPSKTNLVRDALANTVEAEWETIKGEISEVERLQKVINIWNITSETLKERVIKYFQEKDPLNSVYIMAFSGARGNISQVRQLVGMRGLMSDPNGQIIDIPIQSNFREGLSITDYIISSYGARKGLVDTAIKTADSGYLTRRLVDIAQSVVIRELDCRSQRGIKIKEIIE-DNDILFSLQERIVGRVLACNIIDPRTKTIIAYKNELITPRLAEKIMKYNNNSIIVRSPLTCECRRSICQKCYGNNLATGNLVELGEPVGIIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVFTSDFSRQVRAQCSGYIKFSSTLNTRELRTNYGKDVLVCENQSFIKLITYTNQIKEIKIFPKSIIIVGNNSFVKKNDILFELPPKNKMMQDDASALNDVIAKQSGEIIIEKQNFFNQNKTLNVRKSNIVHNLVWILSGYVTKIPFATKLKIYPLMNISKNQNLTQSKITNKFSGYIKFIKNLNTSKIIRFKLISSLGMCQKQKIILESKDTKITQCKIYLAKFGSIYLNPYPLDKSVLTLGCLKLLKYKTKTGGNFYSTNS---------------QRTEYGSSVFYIPESTYNINFDVTALKVNFGDYVNKKTEIYKNYFIDIAGIIQFDETKPNNREIIIKPGYIIPFPNSLIDILEYDGQIFYPGEIIFDNFEINTASYIEVCSIKNNLFLLLRPVIRYEIPNPENFNNFFPNWFDPHQIELDQVPLNLISEMKIKTENPIYFIKHHFFINFLENYSN--IFFEINQATQPDNYGYFKLILGTNIIPEKILPKEMFKEEVRLSLFIQDKQFVEQETLLASFDVIIPFATTVLGIKKQIKNKQKKILLTTEQDYKVIFIEDTDFQLKNNQLIKLGKKIGTNFFNKESRLIEQISGNKITFRISHPYLFSKGAQLRIESGDLIKLKDVLGQLVYERLITGDIVQGLPRVEEILEARHPKVEAKVAPYPGIITKVIEHQVNTLIWIKHKGSRFDQLINIEGSPNSIQGSPNLLIRKFDFVNVCQCLTEGTLNPHTILDVYFQYYCSIKILSMYQASYYSFKKVQFFLLNSVQAVYYSQGVFIADKHLEIIIKQMTNRIEIIYPGDTNFLSGDLLELEQVRYINACLSKKRKIYFKPILLGITKSALKAEGFLSAASFQYTTRVLTQASIEGRVDWITGLKENVIVGKLIPCGTGFYSNNDFSYLKVKMPT--LNNNHNSNIKNDDQTKHHKLRSAIKFRY 3798
            M   S +F NN++NKKELK II WAF N+G  KAAY VD+LK +GF+YATK+GISIS+EDL+IPP KT L+++A  +    E +   GEI+EVER QK+I IWN TSE LKER+I +F++ DPLNSVYIMAFSGARGNISQVRQLVGMRGLMSDPNGQIID  I +NFREGLSITDYIISSYGARKGLVDTAIKTADSGYLTRRLV++AQS++I ELDC+++RGI ++E IE D     S++E I GRVLA +I  P TK ++A++N+ +T  L ++I+      I++RSPLTCECRR++CQ CYG NLA+GNLVELGE VG+IAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVFT + +RQ RA+CSGYI+F  TL     RTNYG+DV++ ENQS++ +I Y N+I  IK+  +++I+V N++++K+N +LFE  PK K +      +  V AK+SGEII+EK  F       +  + +  + + W+LSG V  IPF T +KI  L  I KNQ L QSKI     G+I F +N  T +II  K+ +S       KI LE+K+ ++  CK+YL+    I L P  L   + +LG LK  KYKTKTGG FY +NS                R ++GS++FYIPE+T   N + +  K     YV +  EI+ NYF +I G I F E +   + I IKPG       ++   L+ + Q+++PGE+I + FEI + SY+E+ +  N L+L +RPV RYE  N  +      N F+  +++++     ++S  ++K + PI F+     I+   + +N  I FE+ Q  + ++Y    L+   N + + I+P E+    + L+L +++KQF++    +AS D IIPF+  V  IK +    +  ILLTT+ DY+ +F++       NNQLI +      N   K S L++ I GNKI   +  PY FSKGA +R   GD IK ++  GQL+Y+RL TGDIVQGLP++ +ILEAR PK EA ++   G I K I++    +I +      ++          +      LL++K++ ++V Q +TEG LNPHT+L VYF+Y+ S+  LS+Y+A+Y S KK+Q  LL SVQA+Y SQGV I+ KH+E+I+++MT+++ I YPG TNFL GD+++L Q +YIN  +    K+ F+PILLGITKS+LK +GFL+AASFQ TTRVLT A+++G+ DW+ GLKEN I G+LIP GTGFY + D ++ KV +P   +   +N ++K     K +KLR+ I+F+Y
Sbjct:    6 MSSNSKIFSNNIINKKELKKIIEWAFNNYGQRKAAYFVDQLKGLGFEYATKSGISISIEDLRIPPVKTTLMKNATRDVFITESKANNGEITEVERFQKIIYIWNNTSEELKERLIDFFKKTDPLNSVYIMAFSGARGNISQVRQLVGMRGLMSDPNGQIIDRAITANFREGLSITDYIISSYGARKGLVDTAIKTADSGYLTRRLVEVAQSIIISELDCKTKRGILLQEDIESDKKKFLSVKELINGRVLATSICKPGTKELVAFRNQQVTSSLTKQIINLKIAKILIRSPLTCECRRAVCQHCYGWNLASGNLVELGETVGLIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVFTGELTRQGRAECSGYIQFLPTLKVIPYRTNYGQDVVMSENQSWLTIINYANKIINIKVESRTLILVNNHNYIKQNQVLFEAAPKIKDINLSQKEIKYVCAKRSGEIILEKNGFPGAFSNEDFTRRSKKNYIFWVLSGKVFSIPFNTSIKIRKLEKIYKNQALAQSKIVTTMGGFIHFCRNTLTQEIISLKVQNSFQSQNNFKIFLETKNLEVINCKVYLSHNHEITLKPELLKNQLFSLGLLKNNKYKTKTGGYFYISNSYKSNLLDDKKVNNLINRLKFGSTIFYIPEATIQTNTNKSDFKFKKDSYVTRHQEIFPNYFTNIKGFIDF-ELEKQIKYITIKPGEKYLLKENINSFLDINEQVYFPGELILNKFEIKSLSYLEIINSNNQLYLFIRPVTRYEFTNEISKKILERNPFNDIKLKINNFNFYILSGQQVKIDEPIQFLDSTITIDSFLHLNNREIMFELKQIKEKNSYIQVNLLYSQNFLFDTIIPNEIKNSNINLTLIVEEKQFIDPYATIASLDTIIPFSNFVYNIKTKRNAVKANILLTTKSDYQEVFLDSFTHNYINNQLIHINNLFPNNVCIKNSGLLKSIKGNKILLHLGDPYFFSKGALIRKIPGDYIKKQENFGQLIYQRLKTGDIVQGLPKIADILEARKPKTEALLSTRQGFI-KSIKYTEELIIIVTKPTISYECF--------TTSRPERLLVKKYESISVGQPITEGPLNPHTLLYVYFRYFHSLGTLSIYEAAYRSIKKLQILLLMSVQAIYTSQGVIISAKHIELIVREMTHKVYIEYPGKTNFLPGDIIDLNQAQYINLSIQNGHKLGFRPILLGITKSSLKTDGFLAAASFQETTRVLTHAALQGKTDWLRGLKENAITGRLIPAGTGFYLDQDIAFNKVLLPEKLITGQNNLSLKKQLNLKKNKLRTRIRFKY 1281          
BLAST of mRNA_S-ischiensis_contig110.2402.1 vs. uniprot
Match: A0A0R6M448_UNDPI (DNA-directed RNA polymerase n=32 Tax=Laminariales TaxID=2886 RepID=A0A0R6M448_UNDPI)

HSP 1 Score: 1148 bits (2970), Expect = 0.000e+0
Identity = 612/1293 (47.33%), Postives = 851/1293 (65.82%), Query Frame = 1
Query:    1 MIEQSNLFCNNVLNKKELKTIIAWAFKNFGSLKAAYLVDELKDIGFQYATKAGISISLEDLKIPPSKTNLVRDALANTVEAEWETIKGEISEVERLQKVINIWNITSETLKERVIKYFQEKDPLNSVYIMAFSGARGNISQVRQLVGMRGLMSDPNGQIIDIPIQSNFREGLSITDYIISSYGARKGLVDTAIKTADSGYLTRRLVDIAQSVVIRELDCRSQRGIKIKEIIEDNDILF-SLQERIVGRVLACNIIDPRTKTIIAYKNELITPRLAEKIMKYNNNSIIVRSPLTCECRRSICQKCYGNNLATGNLVELGEPVGIIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVFTSDFSRQVRAQCSGYIKFSSTLNTRELRTNYGKDVLVCENQSFIKLITYTNQIKEIKIFPKSIIIVGNNSFVKKNDILFELPPKNKMMQDDASALNDVIAKQSGEIIIEKQNFFNQNKTLNVRKSNIVHNLVWILSGYVTKIPFATKLKIYPLMNISKNQNLTQSKITNKFSGYIKFIKNLNTSKIIRFKLISSLGMCQKQKIILESKDTKITQCKIYLAKFGSIYLNPYPLDKSVLTLGCLKLLKYKTKTGGNFYSTN---------------SQRTEYGSSVFYIPESTYNINFDVTALKVNFGDYVNKKTEIYKNYFIDIAGIIQFDETKPNNREIIIKPGYIIPFPNSLID-----ILEYDGQIFYPGEIIFDNFEINTASYIEVCSIKNNLFLLLRPVIRYEIPNPENFNNFFPNWFDPHQIELDQVPLNLISEMKIKTENPIYFIKHHFFINFL--ENYSNIFFEINQATQPDNYGYFKLILGTNIIPEKILPKEMFKEEVRLSLFIQDKQFVEQETLLASFDVIIPFATTVLGIKKQIKNKQKKILLTTEQDYKVIFIEDTDFQLKNNQLIKLGKKIGTNFFNKESRLIEQISGNKITFRISHPYLFSKGAQLRIESGDLIKLKDVLGQLVYERLITGDIVQGLPRVEEILEARHPKVEAKVAPYPGIITKVIEHQVNTLIWIKHKGSRFDQLINIEGSPNSIQGSPNLLIRKFDFVNVCQCLTEGTLNPHTILDVYFQYYCSIKILSMYQASYYSFKKVQFFLLNSVQAVYYSQGVFIADKHLEIIIKQMTNRIEIIYPGDTNFLSGDLLELEQVRYINACLSKKRKIYFKPILLGITKSALKAEGFLSAASFQYTTRVLTQASIEGRVDWITGLKENVIVGKLIPCGTG--FYSNNDFSYLKVKMPT--LNNNHNSNIKNDDQTKHHKLRSAIKFRY 3798
            M++QS +F NN++NKKELK II WAFKN+G  KA Y VD+LK+IGF+YATK+GISIS+EDLKI P+K+ L+  A  +   AE +   GEI+EVER Q++I IWN TSE LK+R+I++F++ DPLNSVYIMAFSGARGNI+QVRQLVGMRGLMSDPNG+IID  I +NFREGLSITDYIISSYGARKGLVDTAIKTADSGYLTRRLV++AQS++I ELDC+++RGI ++E +E ++  F SL+E + GR+LA  I  P +K I+A +N+ ITP + E+++K+  N +++RSPLTCECRR++CQ+CYG NLA G LVELGE VG+IAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGG+FTS+  RQ RAQCSGYI F   L     RTNYG+D +V ENQS++ +I Y N+I ++++  ++II+V NN+++K+N +LFE  PK K +      +  + AK+ GEI +E   F       N  K +  + + W+LSG V  I F T L++     I KNQ + QSK+     G+    +N  T +I    + +        KI +E  + ++T+CK+YL+    I L P  L+  + +LG L+  KY+TKTGG FY +N               + + + GS++FYIPE+      +    +   GDYV K  EI+ NY  +I G I F E +   + I IKPG        L+D       E++ Q++YPGE++ D FE+   SYIE   I N ++L +RP+ RYE  N      F  N F P  + ++   L + S  +IK + PI F+     I++    N + + FE     + ++YG   LI     + + ++PKE+ K ++ L+LF+++KQF++  T++ SFD I PF   V  +K +  N +  ILLTT+ DY+ IF++    + K NQ +K+ K    N   K S L+EQ+SGNKIT  +  PY FS GA +R   GD IK ++  GQLVYERL TGDIVQGLP+++ ILEAR PK EA +A   G I K I++  N ++        +D  I           S  LL++ ++ + V Q LTEG LNPHT+L VYF+Y+CS+  LS+Y+++Y S KK+Q  LL SVQA+Y SQGV I+ KH+E+I+++MT+++ I YPG TNFL GD+++L+Q +YIN C+    K+ F+PILLGITKS+LK +GFL+AASFQ TTRVLT+A+I+G+ DW+ GLKEN I G+LIP GTG  FY+N D ++ KV +P   +    N ++K   + K  KL+  IKF+Y
Sbjct:    1 MLKQSKIFSNNIINKKELKKIIEWAFKNYGQRKAVYFVDQLKEIGFEYATKSGISISIEDLKISPAKSALMEIASNDVFLAESQANNGEITEVERFQRIIYIWNSTSEELKDRLIEFFKKNDPLNSVYIMAFSGARGNIAQVRQLVGMRGLMSDPNGKIIDRAIGANFREGLSITDYIISSYGARKGLVDTAIKTADSGYLTRRLVEVAQSIIISELDCKTERGIFLEEDVEKDEKGFLSLKELLNGRILALTIFKPGSKEILALRNQEITPSVIEELVKFKINKVLIRSPLTCECRRAVCQQCYGWNLALGTLVELGETVGLIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGIFTSELIRQGRAQCSGYINFLPELKISPYRTNYGQDAVVSENQSWLAIINYANEIVKVRVEARTIILVNNNNYIKRNQVLFEAAPKIKEINLAEKEIKYICAKEPGEIFLENDGFPQTLINDNFSKRSKKNYIFWVLSGQVFSIAFNTNLRVRKSEKIYKNQAIAQSKMVTTIGGFTHLSRNRLTQEINSLSIQNCSYGLNDFKIFIERNNIELTKCKVYLSHTHEIVLKPELLNNRLFSLGSLRNKKYRTKTGGKFYISNFYKPSLFGHPSGNNFTNKLKSGSTIFYIPEALVQTTSNKKDFRFKKGDYVKKDIEIFPNYITNIEGFIDF-EVEKRIKYISIKPGQ-----RHLLDKRPKLSKEFNEQVYYPGELVLDKFEVKVLSYIEFEEINNEIYLYIRPITRYEFTNERAVKIFESNCFAPLNLLVENFNLQVRSGQQIKIDYPIQFVDSPLTIDYSLQSNDTELIFEYKGPEKKNSYGQVNLIYSQTFLFDSVIPKEIKKTDISLNLFVEEKQFIDPYTVVGSFDTIFPFDNFVYNVKIKRNNIKSNILLTTKSDYEEIFLDSFTHKYKQNQFLKVNKLFNNNVLIKNSGLMEQVSGNKITLHLGQPYFFSTGALIRKIPGDYIKGQENFGQLVYERLKTGDIVQGLPKIDNILEARKPKNEALLATRQGFI-KSIKYTSNLILISTLPSKSYDYYI--------ASRSERLLVKNYESICVGQPLTEGPLNPHTLLHVYFRYFCSLGTLSIYESAYRSLKKLQTLLLTSVQAIYISQGVIISGKHVELIVREMTHKVYIEYPGKTNFLPGDIIDLDQAQYINLCIKNNNKLGFRPILLGITKSSLKTDGFLAAASFQETTRVLTRAAIQGKTDWLRGLKENAITGRLIPAGTGTGFYANQDITFNKVLLPDSLITKKDNLSLKKQLKLKQTKLKKLIKFKY 1278          
BLAST of mRNA_S-ischiensis_contig110.2402.1 vs. uniprot
Match: A0A8E6D2G6_9PHAE (DNA-directed RNA polymerase subunit beta'' n=1 Tax=Ishige okamurae TaxID=233772 RepID=A0A8E6D2G6_9PHAE)

HSP 1 Score: 1130 bits (2922), Expect = 0.000e+0
Identity = 582/1253 (46.45%), Postives = 841/1253 (67.12%), Query Frame = 1
Query:    1 MIEQSNLFCNNVLNKKELKTIIAWAFKNFGSLKAAYLVDELKDIGFQYATKAGISISLEDLKIPPSKTNLVRDALANTVEAEWETIKGEISEVERLQKVINIWNITSETLKERVIKYFQEKDPLNSVYIMAFSGARGNISQVRQLVGMRGLMSDPNGQIIDIPIQSNFREGLSITDYIISSYGARKGLVDTAIKTADSGYLTRRLVDIAQSVVIRELDCRSQRGIKIKEIIEDNDILFSLQERIVGRVLACNIIDPRTKTIIAYKNELITPRLAEKIMKYNNNSIIVRSPLTCECRRSICQKCYGNNLATGNLVELGEPVGIIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVFTSDFSRQVRAQCSGYIKFSSTLNTRELRTNYGKDVLVCENQSFIKLITYTNQIKEIKIFPKSIIIVGNNSFVKKNDILFELPPKNKMMQDDASALNDVIAKQSGEIIIEKQNFFNQNKTLNVRKSNIVHNLVWILSGYVTKIPFATKLKIYPLMNISKNQNLTQSKITNKFSGYIKFIKNLNTSKIIRFKLISSLGMCQKQKIILESKDTKITQCKIYLAKFGSIYLNPYPLDKSVLTLGCLKLLKYKTKTGGNFY--------STNS---QRTEYGSSVFYIPESTYNINFDVTALKVNFGDYVNKKTEIYKNYFIDIAGIIQFDETKPNNREIIIKPGYIIPFPNSLIDILEYDGQIFYPGEIIFDNFEINTASYIEVCSI-KNNLFLLLRPVIRYEIPNPENFNNFFPNWFDPHQIELDQVPLNLISEMKIKTENPIYFIKHHFFINFL--ENYSNIFFEINQATQPDNYGYFKLILGTNIIPEKILPKEMFKEEVRLSLFIQDKQFVEQETLLASFDVIIPFATTVLGIKKQIKNKQKKILLTTEQDYKVIFIEDTDFQLKNNQLIKLGKKIGTNFFNKESRLIEQISGNKITFRISHPYLFSKGAQLRIESGDLIKLKDVLGQLVYERLITGDIVQGLPRVEEILEARHPKVEAKVAPYPGIITKVIEHQVNTLIWIKHKGSRFDQLINIEGSPNSIQGSPNLLIRKFDFVNVCQCLTEGTLNPHTILDVYFQYYCSIKILSMYQASYYSFKKVQFFLLNSVQAVYYSQGVFIADKHLEIIIKQMTNRIEIIYPGDTNFLSGDLLELEQVRYINACLSKKRKIYFKPILLGITKSALKAEGFLSAASFQYTTRVLTQASIEGRVDWITGLKENVIVGKLIPCGTGFYSNNDFSYLKVKMPTL 3717
            M ++S +FCN ++NK+ELK +I+WAFKN+G  KA +LVD+LK +GF+YATK+GISISLEDLK+PP KT L+  A  + ++ E+E   GEI+EVER QK+I IWN TSE LK+RV+ +F+  DPLNSVYIMAFSGARG+++QVRQLVGMRGLM+DPNGQIID+PI +NFREGLS+TDYIISSYGARKG+VDTAIKTADSGYLTRRLV++AQ ++I E DC ++ G+ +++ +  N++  SL++R +GRVLA  +  P+   I+  +N+ ITP LAE+   +   SI++RSPLTCECRRS+CQ+CYG NLA+  LV+LGE +GI+AAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVFTS+ +RQVRA  +GYI F  T+  R +RTNYG+D L+ +  S I+LITY+N+IK+IK+ P++II+V N  +VKKND+L E   + + M      +  V+AK  GEI+ E++ +     +   + +  V+ L WILSG V  IP   K+       + KNQ+L QS+I     G++ F+   +T K++  K+ +S  + ++ +I +E     I  CK+Y ++   I +N     +    LG L   K+KT+T G FY        S+N+   +RT  G +VFY+P+ST      +   K     +V++  E++ N+F  + G + F ETK   +E+ IKPG      NS++D+   D Q++YPGEI+F   EI   SY+E+ SI K  +++ +RP+ RYE+    +      N+F   ++++    +N  S + +K      FI      ++    N S I FE   + +  ++    L      + + ++PKE+ K+++ ++L +Q++QFVE  + L + D++      +  IK++   K++ I++ T+ D+K I+++D D   + +Q IK  +K G N     S LI+++ GNK+ + +  PYLFS+GA +    GD IK  + LGQLVYERL TGDIVQGLP+VEEILEAR+PK +A ++  PG+I   I+  +   I I  + S      ++      +  +  LL++KFDFVNV Q LTEG LNPH +LD+YFQY+CS+  LS+YQ++Y+S KKVQ FL++SVQ++Y+SQGV I+DKH+E+II++MT++I I  PG+TNFL GD+L+LEQ  +IN  L  + KI F+PIL GITKS+LKA+ FL+AASFQ TTRVLT A+++G+ DW+ GLKENVI G+LI  GTGFY NND +Y K  +P +
Sbjct:    1 MRKKSRIFCNKIVNKQELKKLISWAFKNYGQRKAVFLVDQLKALGFEYATKSGISISLEDLKVPPVKTFLMTKATQDVIQTEFEVNNGEITEVERFQKIIRIWNNTSEDLKDRVVDFFKTTDPLNSVYIMAFSGARGSLAQVRQLVGMRGLMADPNGQIIDLPITTNFREGLSVTDYIISSYGARKGIVDTAIKTADSGYLTRRLVEVAQGIIISERDCYTRSGLLLRKRVTKNEVPLSLKQRAIGRVLANAVFSPKNGQILGKRNQCITPHLAEEFTNFQIPSILIRSPLTCECRRSVCQQCYGWNLASAKLVDLGESIGIVAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVFTSEKTRQVRANHAGYINFLPTMKARFIRTNYGQDALINDRDSHIQLITYSNEIKKIKVSPETIILVKNKIYVKKNDVLLEFTSRTRNMYPAEKEVKYVLAKHGGEIVSEEKGYRQPFDSEQFKVNKGVNRLFWILSGQVYDIPIKAKINARTFQKVYKNQSLAQSRIVTMIGGFVSFLMIPSTEKVLGIKINNSFRITKQARIFIERSYLGIRSCKMYFSRKSDISINFGLSHEQHFLLGYLNSRKFKTRTAGTFYTDQFYNSSSSNNHSERRTRSGGTVFYLPKSTVETTTAIRNFKFKKRSFVSRDKEVFPNFFTSVEGFVNF-ETKNKIKEVSIKPGLRYFLKNSIVDVDTIDQQLYYPGEILFKTIEIKKLSYLEIESITKRGIYIYVRPITRYEVTRDNSRKFLQRNYFGDIKLKVGNFVMNATSGINLKGNGAFQFIYSPVVFDYPLHSNNSEIRFEFRNSRKRKSWSEVFLNCSQTFLIDPLIPKELKKDDISVNLLVQNEQFVEPYSTLIAIDIVARKDNFIYEIKQKYTGKKRTIIMITKADHKSIYLDDFDHPYRKDQFIKRDQKFGGNLTISSSGLIKKVDGNKLLYHLGQPYLFSQGAFVNKLPGDFIKTHENLGQLVYERLKTGDIVQGLPKVEEILEARNPKNQAVLSKRPGLIYD-IDRDIPQSILISARPS------SLYFGNYFVSKANRLLVKKFDFVNVGQPLTEGPLNPHNLLDIYFQYFCSLNTLSLYQSAYFSIKKVQSFLISSVQSIYFSQGVIISDKHIELIIREMTSKIWIEDPGETNFLPGDILDLEQANFINLSLRSENKILFRPILFGITKSSLKADSFLAAASFQETTRVLTNAAVQGKTDWLRGLKENVITGRLITAGTGFYLNNDLTYKKALLPPV 1245          
BLAST of mRNA_S-ischiensis_contig110.2402.1 vs. uniprot
Match: A0A8F0F9S6_9PHAE (DNA-directed RNA polymerase n=1 Tax=Chorda asiatica TaxID=1281577 RepID=A0A8F0F9S6_9PHAE)

HSP 1 Score: 1114 bits (2881), Expect = 0.000e+0
Identity = 594/1293 (45.94%), Postives = 838/1293 (64.81%), Query Frame = 1
Query:    1 MIEQSNLFCNNVLNKKELKTIIAWAFKNFGSLKAAYLVDELKDIGFQYATKAGISISLEDLKIPPSKTNLVRDALANTVEAEWETIKGEISEVERLQKVINIWNITSETLKERVIKYFQEKDPLNSVYIMAFSGARGNISQVRQLVGMRGLMSDPNGQIIDIPIQSNFREGLSITDYIISSYGARKGLVDTAIKTADSGYLTRRLVDIAQSVVIRELDCRSQRGIKIK--EIIEDNDILFSLQERIVGRVLACNIIDPRTKTIIAYKNELITPRLAEKIMKYNNNSIIVRSPLTCECRRSICQKCYGNNLATGNLVELGEPVGIIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVFTSDFSRQVRAQCSGYIKFSSTLNTRELRTNYGKDVLVCENQSFIKLITYTNQIKEIKIFPKSIIIVGNNSFVKKNDILFELPPKNKMMQDDASALNDVIAKQSGEIIIEKQNFFNQNKTLNVRKSNIVHNLVWILSGYVTKIPFATKLKIYPLMNISKNQNLTQSKITNKFSGYIKFIKNLNTSKIIRFKLISSLGMCQKQKIILESKDTKITQCKIYLAKFGSIYLNPYPLDKSVLTLGCLKLLKYKTKTGGNFYSTNSQRTEY---------------GSSVFYIPESTYNINFDVTALKVNFGDYVNKKTEIYKNYFIDIAGIIQFDETKPNNREII-IKPGYIIPFPNSLIDILEYDGQIFYPGEIIFDNFEINTASYIEVCSIKNNLFLLLRPVIRYEIPNPENFNNFFPNWFDPHQIELDQVPLNLISEMKIKTENPIYFIKHHFFINF-LE-NYSNIFFEINQATQPDNYGYFKLILGTNIIPEKILPKEMFKEEVRLSLFIQDKQFVEQETLLASFDVIIPFATTVLGIKKQIKNKQKKILLTTEQDYKVIFIEDTDFQLKNNQLIKLGKKIGTNFFNKESRLIEQISGNKITFRISHPYLFSKGAQLRIESGDLIKLKDVLGQLVYERLITGDIVQGLPRVEEILEARHPKVEAKVAPYPGIITKVIEHQVNTLIWIKHK---GSRFDQLINIEGSPNSIQGSPNLLIRKFDFVNVCQCLTEGTLNPHTILDVYFQYYCSIKILSMYQASYYSFKKVQFFLLNSVQAVYYSQGVFIADKHLEIIIKQMTNRIEIIYPGDTNFLSGDLLELEQVRYINACLSKKRKIYFKPILLGITKSALKAEGFLSAASFQYTTRVLTQASIEGRVDWITGLKENVIVGKLIPCGTGFYSNNDFSYLKVKMP----TLNNNHNSNIKNDDQTKHHKLRSAIKFRY 3798
            M+++S +F NN++NKKELK II WAF+N+G  KAAY VD+LK+IGF+YATK+GISIS+EDLKIPP+K +L+  A      AE +   GEI+EVER Q++I+IW+ TSE LKER++ +F+++DPLNSVYIMAFSGARGNI QVRQLVGMRGLM+DPNG+IID  I +NFREGLSITDYIISSYGARKGLVDTAIKTADSGYLTRRLV++AQS++I ELDC+++RGI ++  E  ++ND+L  ++E + GRVLA +I  P T  +I  +NE +T  L ++++K+    I++RSPLTC+CRR++CQ CYG NLA G LV+LGE VG+IAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVFT    RQ RA  SGYI F   L     RT+YG+D +V ENQS++ ++ Y+N++ ++++  ++II+V N   +++N +LFE  PK   M      +  + AK+SGEI++EK +F   +   N  K    +   W+LSG V  I F TKLK   L  I KNQ + QSKI     G++ F +N  T++I    + +        KI +E  +T++TQCK+YL++   I + P   D  + +LG L   KYKTKTGGNFY ++  + +                GS++FY+PE+T     +    K     Y+ K  +I+ NYF  I G I F+  K N    I IKPG      N L    E D Q++YPGEI+ D FE+   SY+E+ +  N ++L  RP+ RYE  N    N    N F P  I +D   L + S  +IK + PI F+     +++ LE N + + FE     + ++YG   LI     + + ++PKE+ K+ + L++ +++ QF +  T++ SFD I  F   +  IK +  +++  +LLT + DY+ IF++      K NQ + + K    N   + S  I+++SGNKI   ++ PY FS+GA +R   GD IK +++ GQL+Y RL TGDIVQGLP+++ ILEAR PK E+ +A   G +  +     +  IWI  K   G R   L            S  ++++ ++ ++V Q LTEG LNPHT+L VYF+YYCS+  LS Y+++Y S KK+Q  LL SVQA+Y +QGV I+ KH+E+II++MT ++ I Y G TNFL GD+++L+Q  YIN C+    K+ F+PILLGITKS+LK +GFL+AASFQ T RVLT+A+I+G+ DW+ GLKENVI G+LIP GTGFYSN D ++ K  +P    T+  + N ++K   + K  KL+  IKF++
Sbjct:    1 MLKRSKIFSNNIINKKELKKIIEWAFRNYGQRKAAYFVDQLKEIGFEYATKSGISISIEDLKIPPAKISLMESASHAISLAESQASNGEITEVERFQRIIHIWSTTSEELKERLVDFFKKRDPLNSVYIMAFSGARGNIEQVRQLVGMRGLMADPNGKIIDKAIGANFREGLSITDYIISSYGARKGLVDTAIKTADSGYLTRRLVEVAQSIIINELDCKTRRGIFLEDEEKTDENDVL-PMRELLNGRVLASSICKPDTNEVIGVRNEQLTSTLIDELIKFKIPKILIRSPLTCQCRRAVCQHCYGWNLALGTLVDLGETVGLIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVFTGQLIRQGRATSSGYINFLPELKLSPYRTDYGQDAVVSENQSWLGILNYSNRMVKVRVEARTIILVANKKHIRRNQVLFEAAPKINEMNLAEKEIKYICAKESGEIVLEKNSFPYDSSNENFTKRTKKNYSFWVLSGQVFSIAFNTKLKARKLEKIYKNQAIAQSKIVTTIGGFVHFSRNKLTNEINGLSIQNRYHGQNNFKIFIEKNNTEVTQCKVYLSQTLEILIKPELFDNQLFSLGFLSNKKYKTKTGGNFYISDFYKPKLLGDKSTKNLIGKQKSGSTIFYLPEATIKTTSNKKDFKFKRKTYIKKNKKIFPNYFSTIDGFIDFEVDKENKYITINIKPGQRYLLENQLDLYKELDEQVYYPGEIVLDQFEVKRLSYLEIENGTNEIYLYFRPITRYEFTNTSPVNILKSNCFAPLNIVIDNFNLKISSGQEIKIDYPIQFVDSPLVVDYSLESNDTELIFEFKGPYKQNSYGELNLICSQTFLFDTLIPKEIKKDSIALNVLVEENQFTDPYTIVGSFDSIFRFDNFIYTIKTKRNSRKSNVLLTVKSDYEEIFLDSFTHNYKQNQFLGVNKLFNNNSLIRNSGWIKELSGNKIVLHLAQPYFFSRGALIRKIPGDYIKKQEIFGQLIYVRLKTGDIVQGLPKIDNILEARKPKTESMLATQQGFVRSI--RYTSDSIWIITKPALGLRRYLLTR----------SQRIVVKNYESISVGQPLTEGPLNPHTLLHVYFRYYCSLGTLSTYESAYRSLKKLQGLLLMSVQAIYMAQGVIISGKHVELIIREMTQKVSIEYQGTTNFLPGDIIDLDQANYINKCIKNDDKLEFRPILLGITKSSLKTDGFLAAASFQETARVLTRAAIQGKTDWLRGLKENVITGRLIPAGTGFYSNQDLTFNKALLPEKQLTMKKD-NLSLKKQLKLKEKKLKKIIKFKF 1279          
BLAST of mRNA_S-ischiensis_contig110.2402.1 vs. uniprot
Match: A0A110AQ85_9PHAE (DNA-directed RNA polymerase n=15 Tax=Sargassaceae TaxID=3014 RepID=A0A110AQ85_9PHAE)

HSP 1 Score: 1111 bits (2874), Expect = 0.000e+0
Identity = 596/1291 (46.17%), Postives = 842/1291 (65.22%), Query Frame = 1
Query:    1 MIEQSNLFCNNVLNKKELKTIIAWAFKNFGSLKAAYLVDELKDIGFQYATKAGISISLEDLKIPPSKTNLVRDALANTVEAEWETIKGEISEVERLQKVINIWNITSETLKERVIKYFQEKDPLNSVYIMAFSGARGNISQVRQLVGMRGLMSDPNGQIIDIPIQSNFREGLSITDYIISSYGARKGLVDTAIKTADSGYLTRRLVDIAQSVVIRELDCRSQRGIKIKEIIEDNDILFSLQERIVGRVLACNIIDPRTKTIIAYKNELITPRLAEKIMKYNNNSIIVRSPLTCECRRSICQKCYGNNLATGNLVELGEPVGIIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVFTSDFSRQVRAQCSGYIKFSSTLNTRELRTNYGKDVLVCENQSFIKLITYTNQIKEIKIFPKSIIIVGNNSFVKKNDILFELPPKNKMMQDDASALNDVIAKQSGEIIIEKQNFFNQNKTLNVRKSNIVHNLVWILSGYVTKIPFATKLKIYPLMNISKNQNLTQSKITNKFSGYIKFIKNLNTSKIIRFKLISSLGMCQKQKIILESKDTKITQCKIYLAKFGSIYLNPYPLDKSVLTLGCLKLLKYKTKTGGNFYSTN---------------SQRTEYGSSVFYIPESTYNINFDVTALKVNFGDYVNKKTEIYKNYFIDIAGIIQFDETKPNNREIIIKPGYIIPFPNSLIDILEYDGQIFYPGEIIFDNFEINTASYIEVCSIKNNLFLLLRPVIRYEIPNPENFNNFFPNWFDPHQIELDQVPLNLISEMKIKTENPIYFIKHHFFIN-FLE-NYSNIFFEINQATQPDNYGYFKLILGTNIIPEKILPKEMFKEEVRLSLFIQDKQFVEQETLLASFDVIIPFATTVLGIKKQIKNKQKKILLTTEQDYKVIFIEDTDFQLKNNQLIKLGKKIGTNFFNKESRLIEQISGNKITFRISHPYLFSKGAQLRIESGDLIKLKDVLGQLVYERLITGDIVQGLPRVEEILEARHPKVEAKVAPYPGIITKVIEHQVNTLIWIKHKGSRFDQLINIEGSPN------SIQGSPNLLIRKFDFVNVCQCLTEGTLNPHTILDVYFQYYCSIKILSMYQASYYSFKKVQFFLLNSVQAVYYSQGVFIADKHLEIIIKQMTNRIEIIYPGDTNFLSGDLLELEQVRYINACLSKKRKIYFKPILLGITKSALKAEGFLSAASFQYTTRVLTQASIEGRVDWITGLKENVIVGKLIPCGTGFYSNNDFSYLKVKMPT--LNNNHNSNIKNDDQTKHHKLRSAIKFRY 3798
            M+ +S +F NN++NKKELK II WAF N+G  KAAY VD+LK++GF+YATK+GISIS+EDL+IP SK  L++ A       E     G I+EVER QK+I+IWN TSE LKE +I + +  DPLNSVY+MAFSGARGNISQVRQL+GMRGLMSDPNGQIID  I +NFREGLSITDYIISSYGARKGLVDTAIKTADSGYLTRRLV++AQS++I +LDC+++RGI +++   D+    S +E + GR+LA +I  P+TK II ++N+L+T  L E+I+K+N   I++RSPLTCECRRSICQ CYG NLA+GNLVELGE VG+IAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVFT   +RQ RA+CSGY+ F  TL     RT+YG+DV++ ENQS +K+I Y N+  ++K+  +++I+V N++++K+N +LFE  PK K +      +  +  K+ GEII+E+  F    ++ +  K +  + + W+LSG V  + F   LK   L NI KNQ L QSKI     G+I   +   T +++  K+ +S       KI LE+ + +I  CKIYL+    I L P      + ++G L+  KYKTKTGG FY +N               + + ++GS++FYIPE+T   N +    +   G Y+ +  EI+ NYF  IAG ++ +  K   + + IKPG      +++        Q+++PGE+I + F I   SY+E+ +  NN++L +RP+IRYE            N F+   ++++   L + S  +I+ + PI  +     I+ FL+ N + + FE  +  + ++Y    L    N I + I+P E+ K ++ L+L ++D QF +  ++LASFD +I F   V  IK +  N +  +LLTT+ DY+ IF++  + Q K  QLI        N   K S L++ + GNKIT  +  PY FSKGA +R   GD IK ++  GQL+YERL TGDIVQGLP++ +ILEAR PKVEA ++     I K I++               D+LI I   PN      +   S  LLI+K++ + + Q LTEG LNPHT+L +YF Y+ S+  LS+Y+++Y S KK+Q FLL SVQ +Y SQGV I+ KH+E+I+++MT+++ I YPG T FL GD+++L+Q +YIN  L  + K+ F+PILLGITKS+LK +GFL+AASFQ TTRVLT A+++G+ DW+ GLKEN I G+LIP GTGFY + D +Y K+ +P   +N  +N N+K   ++K  + ++ IKF+Y
Sbjct:    1 MLRKSKIFSNNIINKKELKKIIEWAFNNYGQRKAAYFVDQLKEMGFKYATKSGISISIEDLRIPASKVTLMQAATKEVFFTESRANNGAITEVERFQKIISIWNRTSEELKESLIDFLKRNDPLNSVYVMAFSGARGNISQVRQLIGMRGLMSDPNGQIIDRAITANFREGLSITDYIISSYGARKGLVDTAIKTADSGYLTRRLVEVAQSIIISQLDCQTKRGIVLQQ---DSKEFLSTKELLYGRILASSICKPKTKEIIGFRNQLVTSSLIEQIIKFNIPKILIRSPLTCECRRSICQHCYGENLASGNLVELGETVGLIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVFTGQLTRQGRAECSGYVIFLPTLKVIPYRTSYGEDVVMSENQSSLKIINYANKDIKVKVESRTLILVNNHNYIKRNQVLFEAAPKIKDINLAKKEIKYIYVKEGGEIILERNGFPQNCESEDFTKRSRKNYIFWVLSGRVFSLSFNINLKARKLENIYKNQALAQSKIITTIGGFIYIYRCKLTQRVMGLKVQNSFQGQNNFKIFLENNNLEILHCKIYLSHNDEIILKPKLFQNRIFSIGFLQNNKYKTKTGGYFYISNYYKPNLLKSNEINKLNYKLKFGSTIFYIPEATIQTNTNKKDFRFKDGSYIERHQEIFPNYFATIAGFLKLEGEK-QIKCVTIKPGEKYLLEDNIDFFRTLSEQVYFPGELIGNQFSIKVLSYLEIIADNNNIYLYIRPIIRYEFTTLSCNKILKSNIFNITNLKINNFNLRVSSGQQIQIDEPIQILDSTITIDSFLQSNDTEVLFEFKEVKRKNSYIKVNLFYSQNFIFDNIIPNEIKKTDIFLNLIVEDNQFTDPYSILASFDTLIQFNNFVYTIKTKRNNIKSNMLLTTKSDYQEIFLDTHNHQYKQAQLIYRNSLFPNNVCIKNSGLLKSVIGNKITLHLGEPYFFSKGALIRKLPGDYIKKQENFGQLIYERLKTGDIVQGLPKIADILEARRPKVEALLSTRQSFI-KAIKYT--------------DELIIIITKPNRGYEYFTTPRSERLLIKKYESICIGQPLTEGPLNPHTLLHIYFHYFYSLGTLSIYESAYRSLKKLQIFLLMSVQDIYMSQGVIISGKHVELIVREMTHKVYIEYPGKTTFLPGDIIDLDQAQYINQSLKTRYKLGFRPILLGITKSSLKTDGFLAAASFQETTRVLTHAALQGKTDWLRGLKENAITGRLIPAGTGFYLDQDITYNKILLPNRLINKKNNLNLKKQLRSKQKQFKNLIKFKY 1272          
BLAST of mRNA_S-ischiensis_contig110.2402.1 vs. uniprot
Match: D1J789_ECTSI (DNA-directed RNA polymerase n=2 Tax=Ectocarpus siliculosus TaxID=2880 RepID=D1J789_ECTSI)

HSP 1 Score: 1107 bits (2864), Expect = 0.000e+0
Identity = 593/1287 (46.08%), Postives = 832/1287 (64.65%), Query Frame = 1
Query:    1 MIEQSNLFCNNVLNKKELKTIIAWAFKNFGSLKAAYLVDELKDIGFQYATKAGISISLEDLKIPPSKTNLVRDALANTVEAEWETIKGEISEVERLQKVINIWNITSETLKERVIKYFQEKDPLNSVYIMAFSGARGNISQVRQLVGMRGLMSDPNGQIIDIPIQSNFREGLSITDYIISSYGARKGLVDTAIKTADSGYLTRRLVDIAQSVVIRELDCRSQRGIKIKEIIEDNDI--LFSLQERIVGRVLACNIIDPRTKTIIAYKNELITPRLAEKIMKYNNNSIIVRSPLTCECRRSICQKCYGNNLATGNLVELGEPVGIIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVFTSDFSRQVRAQCSGYIKFSSTLNTRELRTNYGKDVLVCENQSFIKLITYTNQIKEIKIFPKSIIIVGNNSFVKKNDILFELPPKNKMMQDDASALNDVIAKQSGEIIIEK----QNFFNQNKTLNVRKSNIVHNLVWILSGYVTKIPFATKLKIYPLMNISKNQNLTQSKITNKFSGYIKFIKNLNTSKIIRFKLISSLGMCQKQKIILESKDTKITQCKIYLAKFGSIYLNPYPLDKSVLTLGCLKLLKYKTKTGGNFYSTN-----------SQRTEYGSSVFYIPESTYNINFDVTALKVNFGDYVNKKTEIYKNYFIDIAGIIQFDETKPNNREIIIKPGYIIPFPNSLIDILEYDGQIFYPGEIIFDNFEINTASYIEVCSIKNNLFLLLRPVIRYEIPNPENFNNFFPNWFDPHQIELDQVPLNLISEMKIKTENPIYFIKHHFFINFLENYSN--IFFEINQATQPDNYGYFKLILGTNIIPEKILPKEMFKEEVRLSLFIQDKQFVEQETLLASFDVIIPFATTVLGIKKQIKNKQKKILLTTEQDYKVIFIEDTDFQLKNNQLIKLGKKIGTNFFNKESRLIEQISGNKITFRISHPYLFSKGAQLRIESGDLIKLKDVLGQLVYERLITGDIVQGLPRVEEILEARHPKVEAKVAPYPGIITKVIEHQVNTLIWIKHKGSRFDQLINIEGSPNSIQGSPNLLIRKFDFVNVCQCLTEGTLNPHTILDVYFQYYCSIKILSMYQASYYSFKKVQFFLLNSVQAVYYSQGVFIADKHLEIIIKQMTNRIEIIYPGDTNFLSGDLLELEQVRYINACLSKKRKIYFKPILLGITKSALKAEGFLSAASFQYTTRVLTQASIEGRVDWITGLKENVIVGKLIPCGTGFYSNNDFSYLKVKMP--TLNNNHNSNIKNDDQTKHHKLRSAIKFRY 3798
            M+++SN+F NN +NKKELK II WAFKN+G  KAAY VD+LK++GF+YATK+GISIS+EDL+IPP K +L+R A  +    E +   GEI+EVER Q++I IWN TSE LKER+I++F++ DPLNSVYIMAFSGARGNI+QVRQLVGMRGLMSDP+G+IID  I +NFREGLSITDYIISSYGARKGLVDTAIKTADSGYLTRRLV++AQS++I ELDC+++RGI ++E ++D D      L E + GRVLA +I  P TK IIA++N+ IT  L E ++K N   ++VRSPLTCECRR++CQ CYG NLA GNLVELGE VG+IAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVFTS+  RQ R   SGY+ F S L     RT YG+  L+ EN S++ +ITY N+I  + I   +II   N+ ++  N +L E  PK K M      +  V A+  G+I +E+    Q+F  QN     RK    +   W+LSG V    F T ++   L  I K+Q++ QSKI     G+++F +N +T +++  K  ++       KI +ES   +I+ CK+YL+    I L P  ++K + + G L   KYKTKTGGNFY +N           + + + GS++FY+P++T     +    K   G YV K  EI+ +YFI I G I FD      + I IKPG        L    + + QI+YPGE+I D FE+   SYIE  S     FL +RP+ RYE  N         N+F P  + ++   + +IS  +IK + PI FI+    I++  +  +  + FE  +  + ++      I     + + ++PKE+ K ++ ++L +++KQF +  T++ +FD + PF  T+L IKK+    + +ILLTT+ DY+ IF++    Q +  +  K  K    +   +E  L++++ GNK+   +   Y FS GA +R   GD I+ ++ LGQL++ERLITGDIVQGLP++  ILEAR PK+E+ ++  PG I  +     +  I I  K S       I+        S  L++RK++ V+V Q LT+G+LNPHT+L VYF+Y+CS+ +LS Y+++Y S KK+Q  LL SVQA+Y SQGV I+ KH+E+I+++MT+++ +  PG TNFL GD+++LEQ +YIN C+    ++ F+PILLGITKS+LK + FL+AASFQ TTRVLT A+I+G+ DW+ GLKEN I G+LIP GTGFY N D ++ KV +P  + N   N  +K   + K  KL+  ++F+Y
Sbjct:    1 MLKRSNIFSNNTINKKELKKIIEWAFKNYGQRKAAYFVDQLKEMGFEYATKSGISISIEDLRIPPVKIDLMRRASFDAFLTEAQAKNGEITEVERFQRIIYIWNTTSEELKERLIEFFKKTDPLNSVYIMAFSGARGNIAQVRQLVGMRGLMSDPSGRIIDRAIGANFREGLSITDYIISSYGARKGLVDTAIKTADSGYLTRRLVEVAQSIIISELDCKTERGIFLQESVKDKDEKGFLPLTELLNGRVLASSIFKPGTKKIIAFRNQEITSSLVENLIKANITKVLVRSPLTCECRRAVCQHCYGWNLALGNLVELGETVGLIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVFTSELIRQGRVNYSGYLDFMSELKLCPYRTEYGQAALLSENNSWLGIITYENKIIRLPIPEDTIIFSKNHKYITDNQVLLEAAPKMKEMTLGEKEIKYVNARHPGQIFLEENSCPQDFLTQN-IAEFRKRGQKNYSFWVLSGEVLPTAFDTIIRARILEKIYKDQSIAQSKIVTTIGGFVRFSRNKSTQELLGLKTQNTTREQSIFKIFIESNHIEISNCKVYLSHTYQIILKPQLINKRLFSFGSLCNNKYKTKTGGNFYISNLYKPRPIGKKLNNKVKSGSTIFYLPKATIRTGSNEKEFKFKKGSYVKKHDEIFPDYFISINGFINFD-IAAQTKSITIKPGEKHRVDKELKFYTDLNEQIYYPGELILDKFEVTVLSYIEFESNAGKTFLYIRPITRYEFTNEYPRQILNSNYFAPLNLIVEDFKVQIISGQEIKIDKPIQFIESPLIIDYSLDLDDTELVFEFKKPEKKNSPSKINFIYSQICLFDTVIPKEIKKTDIEVNLLVEEKQFTDPYTIIGAFDTLSPFNNTILSIKKKCNRVRSEILLTTKTDYREIFLDSFSHQYEEKKFFKTNKLFNNDIIIREDGLLKEVKGNKLVLHLGQSYFFSNGALVRKIPGDYIRRQETLGQLIFERLITGDIVQGLPKINNILEARKPKIESLLSTRPGFINSI--RYTSNFIVIGTKPS-------IKNDYYKASRSQRLVVRKYESVSVGQPLTQGSLNPHTLLHVYFRYFCSLGLLSTYESAYRSLKKLQGLLLTSVQAIYVSQGVMISSKHVELIVREMTHKVYVESPGKTNFLPGDIIDLEQAQYINLCIKNNNQLGFRPILLGITKSSLKTDSFLAAASFQETTRVLTGAAIQGKTDWLRGLKENAITGRLIPAGTGFYINKDITFTKVLVPEKSANEEQNLTLKAQLKVKEAKLKKLVRFKY 1276          
BLAST of mRNA_S-ischiensis_contig110.2402.1 vs. uniprot
Match: A0A1I9LV94_9PHAE (DNA-directed RNA polymerase n=1 Tax=Pleurocladia lacustris TaxID=246121 RepID=A0A1I9LV94_9PHAE)

HSP 1 Score: 1107 bits (2862), Expect = 0.000e+0
Identity = 595/1288 (46.20%), Postives = 836/1288 (64.91%), Query Frame = 1
Query:    1 MIEQSNLFCNNVLNKKELKTIIAWAFKNFGSLKAAYLVDELKDIGFQYATKAGISISLEDLKIPPSKTNLVRDALANTVEAEWETIKGEISEVERLQKVINIWNITSETLKERVIKYFQEKDPLNSVYIMAFSGARGNISQVRQLVGMRGLMSDPNGQIIDIPIQSNFREGLSITDYIISSYGARKGLVDTAIKTADSGYLTRRLVDIAQSVVIRELDCRSQRGIKIKEIIEDNDI--LFSLQERIVGRVLACNIIDPRTKTIIAYKNELITPRLAEKIMKYNNNSIIVRSPLTCECRRSICQKCYGNNLATGNLVELGEPVGIIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVFTSDFSRQVRAQCSGYIKFSSTLNTRELRTNYGKDVLVCENQSFIKLITYTNQIKEIKIFPKSIIIVGNNSFVKKNDILFELPPKNKMMQDDASALNDVIAKQSGEIIIEKQNF---FNQNKTLNVRKSNIVHNLVWILSGYVTKIPFATKLKIYPLMNISKNQNLTQSKITNKFSGYIKFIKNLNTSKIIRFKLISSLGMCQKQKIILESKDTKITQCKIYLAKFGSIYLNPYPLDKSVLTLGCLKLLKYKTKTGGNFYSTN-----------SQRTEYGSSVFYIPESTYNINFDVTALKVNFGDYVNKKTEIYKNYFIDIAGIIQFDETKPNNREIIIKPGYIIPFPNSLIDILEYDGQIFYPGEIIFDNFEINTASYIEVCSIKNN--LFLLLRPVIRYEIPNPENFNNFFPNWFDPHQIELDQVPLNLISEMKIKTENPIYFIKHHFFIN-FLE-NYSNIFFEINQATQPDNYGYFKLILGTNIIPEKILPKEMFKEEVRLSLFIQDKQFVEQETLLASFDVIIPFATTVLGIKKQIKNKQKKILLTTEQDYKVIFIEDTDFQLKNNQLIKLGKKIGTNFFNKESRLIEQISGNKITFRISHPYLFSKGAQLRIESGDLIKLKDVLGQLVYERLITGDIVQGLPRVEEILEARHPKVEAKVAPYPGIITKVIEHQVNTLIWIKHKGSRFDQLINIEGSPNSIQGSPNLLIRKFDFVNVCQCLTEGTLNPHTILDVYFQYYCSIKILSMYQASYYSFKKVQFFLLNSVQAVYYSQGVFIADKHLEIIIKQMTNRIEIIYPGDTNFLSGDLLELEQVRYINACLSKKRKIYFKPILLGITKSALKAEGFLSAASFQYTTRVLTQASIEGRVDWITGLKENVIVGKLIPCGTGFYSNNDFSYLKVKMPT--LNNNHNSNIKNDDQTKHHKLRSAIKFRY 3798
            M+++SN+F NN +NKKELK II WAF N+G  KAAY VD+LK+IGF+YATK+GISIS+EDLK+PP K  L++ A ++ +  E +   GEI+EVER Q++I IWN TSE LKER+I++F++ DPLNSVYIMAFSGARGNISQVRQLVGMRGLM DP+G+IID  I +NFREGLSITDYIISSYGARKGLVDTAIKTADSGYLTRRLV++AQS++I ELDCR+QRG+ ++E I+D D     SL E + GRVLA +I +P TK IIA++N+ IT  L E ++K+    I+VRSPLTCECRR++CQ CYG NLA GNLVELGE VG+IAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVFT +  RQ R    GY+ F S +  R  RT YG+D L+ EN+S+I +ITY N I  + I   +II   N+ +V  N +L E  PK + M      +  V A  SG+I +EK      +N+   +  RK +  +   W+LSG V  I F T ++   L  I K Q++ QSKI     G+IKF K  +T +I+  K+ + +      KI +ES   +++ CKIYL+    I L P  ++K + + G L    YKTKTGG+FY +N           + + + GS++FY+PE+T   +      K   G YV K  EI+ + F+ I G I F+  +P  + I IKPG         I   + + QI+YPGE I D FE+   SY+E+    NN   +L +RP+ RYE  N   F     N F P  + ++   + +IS  KIK + PI FI     ++ F++ + + + FE+ +  + ++ GY + I     + + ++PK + K ++  ++ +++ QF +  T++ +FD + P    +  IKK+    + ++L+TT  +Y+ IF++  +   + ++  K  K    +    E  L++++ GNKI   +   Y FS GA +R   GD I+ ++ LGQL++ERLITGDIVQGLP++  ILEAR PK+E+ ++  PG I+  I++  N +I I  K S       I+        S  LL+RK + ++V Q LT+G+LNPHT+L VYF+Y+CS+ +LS Y+A+Y S KK+Q  LL SVQA+Y SQGV I+ KH+E+II++MT ++ + YPG+TNFL GD+++L+Q +YIN C+ K  ++ F+PILLGITKS+LK + FL+AASFQ TTRVLT A+I+G+ DW+ GLKEN I G+LIP GTGFY N D +  KV +P   L    N  +K+  + K  KL+  I+F+Y
Sbjct:    1 MVKRSNIFSNNTINKKELKKIIEWAFTNYGQRKAAYFVDQLKEIGFEYATKSGISISIEDLKVPPVKIELMKRASSDAILTEAQAKNGEITEVERFQRLIYIWNSTSEELKERLIEFFKKTDPLNSVYIMAFSGARGNISQVRQLVGMRGLMCDPSGRIIDKAIAANFREGLSITDYIISSYGARKGLVDTAIKTADSGYLTRRLVEVAQSIIISELDCRTQRGVFLQEGIDDEDEKGFLSLTELLKGRVLASSIFEPGTKKIIAFRNQQITSSLVEMLIKFKIYKILVRSPLTCECRRAVCQHCYGWNLALGNLVELGETVGLIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVFTGELIRQARITFCGYLDFMSEVKLRPYRTQYGEDALLAENKSWIGIITYGNNILRLSIAEDTIIFSENHQYVSNNQVLLEAAPKRREMTLGEKEIKYVNAIHSGKIFLEKNGSPQDYNKQNIVKFRKRSKRNYSFWVLSGNVLSIGFETVIRARILEKIYKEQSIAQSKIVTTIGGFIKFFKTKSTQEILGLKIQNYIDGKSIFKIFIESTHIEVSNCKIYLSHIHQIILKPQIINKQLFSFGYLCNNNYKTKTGGSFYISNLYKPRPLVNKLNNKLKSGSTIFYLPEATIQTDSKEKEFKFKNGGYVKKYEEIFPDCFVSIDGFINFEVEEPT-KYITIKPGQKYILDKEFIFYKDLNEQIYYPGEFILDEFEVYVLSYLELEHNHNNGETYLYVRPITRYEFTNEYPFQFLNSNSFAPLNLIVEDFKVKIISGQKIKIDKPIQFIDSRLILDCFIDLDDTELVFEVKKPNKKNSPGYIRFIYSQIFLFDNVMPKGINKTDLEFNILVEENQFTDPYTIIGTFDTLSPSNNIISSIKKKCNRIRSELLVTTTSNYREIFLDSFNNNYEEHKFFKTNKLCDNDLLIYEDGLVKEVQGNKIVLHLGQSYFFSTGALIRKIPGDYIRQQETLGQLIFERLITGDIVQGLPKINNILEARKPKIESLISTRPGFISS-IQYTTNFII-ISTKPS-------IKNDYYKANRSQRLLVRKSESISVGQPLTQGSLNPHTLLHVYFRYFCSLGVLSSYEAAYISLKKLQGLLLRSVQAIYVSQGVMISGKHVELIIREMTYKVYVEYPGNTNFLPGDIIDLDQAQYINLCIKKNNQLVFRPILLGITKSSLKTDSFLAAASFQETTRVLTGAAIQGKTDWLRGLKENAITGRLIPAGTGFYINKDATSNKVLLPQKGLKEEDNVTLKSALKLKESKLKKLIRFKY 1278          
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of mRNA_S-ischiensis_contig110.2402.1 vs. uniprot
Analysis Date: 2022-09-19 (Diamond blastx: OGS1.0 vs UniRef90)
Total hits: 25
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A7U3NQV8_9STRA0.000e+0100.00DNA-directed RNA polymerase subunit beta'' n=1 Tax... [more]
A0A8F0FAT1_9PHAE0.000e+047.47DNA-directed RNA polymerase n=1 Tax=Desmarestia ac... [more]
A0A8F0F804_9PHAE0.000e+047.90DNA-directed RNA polymerase n=2 Tax=Laminariales T... [more]
D1GJH4_FUCVE0.000e+047.74DNA-directed RNA polymerase subunit beta'' n=3 Tax... [more]
A0A0R6M448_UNDPI0.000e+047.33DNA-directed RNA polymerase n=32 Tax=Laminariales ... [more]
A0A8E6D2G6_9PHAE0.000e+046.45DNA-directed RNA polymerase subunit beta'' n=1 Tax... [more]
A0A8F0F9S6_9PHAE0.000e+045.94DNA-directed RNA polymerase n=1 Tax=Chorda asiatic... [more]
A0A110AQ85_9PHAE0.000e+046.17DNA-directed RNA polymerase n=15 Tax=Sargassaceae ... [more]
D1J789_ECTSI0.000e+046.08DNA-directed RNA polymerase n=2 Tax=Ectocarpus sil... [more]
A0A1I9LV94_9PHAE0.000e+046.20DNA-directed RNA polymerase n=1 Tax=Pleurocladia l... [more]

Pages

back to top
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
S-ischiensis_contig110contigS-ischiensis_contig110:50684..54490 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Diamond blastx: OGS1.0 vs UniRef902022-09-19
OGS1.0 of Schizocladia ischiensis KU_03332021-02-24
Properties
Property NameValue
Taxonomic scopeBacteria
Seed ortholog score785.8
Seed ortholog evalue3e-224
Seed eggNOG ortholog1487953.JMKF01000015_gene6234
Preferred namerpoC2
KEGG rclassRC02795
KEGG koko:K03046
KEGG ReactionR00435,R00441,R00442,R00443
KEGG Pathwayko00230,ko00240,ko01100,ko03020,map00230,map00240,map01100,map03020
KEGG ModuleM00183
GOsGO:0000428,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0030880,GO:0032991,GO:0044424,GO:0044464,GO:0061695,GO:1902494,GO:1990234
EggNOG free text desc.DNA-dependent RNA polymerase catalyzes the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates
EggNOG OGs1G08B@1117,1H7GD@1150,COG0086@1,COG0086@2
EC2.7.7.6
COG Functional cat.K
Best tax levelOscillatoriales
Best eggNOG OGNA|NA|NA
BRITEbr01611,ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03021,ko03400
Hectar predicted targeting categoryother localisation
Exons1
Model size3807
Cds size3807
Stop1
Start1
Relationships

The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
1622815621.1128569-CDS-S-ischiensis_contig110:50683..544901622815621.1128569-CDS-S-ischiensis_contig110:50683..54490Schizocladia ischiensis KU_0333CDSS-ischiensis_contig110 50684..54490 +
1695739809.4798725-CDS-S-ischiensis_contig110:50683..544901695739809.4798725-CDS-S-ischiensis_contig110:50683..54490Schizocladia ischiensis KU_0333CDSS-ischiensis_contig110 50684..54490 +


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
mRNA_S-ischiensis_contig110.2402.1prot_S-ischiensis_contig110.2402.1Schizocladia ischiensis KU_0333polypeptideS-ischiensis_contig110 50684..54490 +


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of mRNA_S-ischiensis_contig110.2402.1

>prot_S-ischiensis_contig110.2402.1 ID=prot_S-ischiensis_contig110.2402.1|Name=mRNA_S-ischiensis_contig110.2402.1|organism=Schizocladia ischiensis KU_0333|type=polypeptide|length=1269bp
MIEQSNLFCNNVLNKKELKTIIAWAFKNFGSLKAAYLVDELKDIGFQYAT
KAGISISLEDLKIPPSKTNLVRDALANTVEAEWETIKGEISEVERLQKVI
NIWNITSETLKERVIKYFQEKDPLNSVYIMAFSGARGNISQVRQLVGMRG
LMSDPNGQIIDIPIQSNFREGLSITDYIISSYGARKGLVDTAIKTADSGY
LTRRLVDIAQSVVIRELDCRSQRGIKIKEIIEDNDILFSLQERIVGRVLA
CNIIDPRTKTIIAYKNELITPRLAEKIMKYNNNSIIVRSPLTCECRRSIC
QKCYGNNLATGNLVELGEPVGIIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVFTSDF
SRQVRAQCSGYIKFSSTLNTRELRTNYGKDVLVCENQSFIKLITYTNQIK
EIKIFPKSIIIVGNNSFVKKNDILFELPPKNKMMQDDASALNDVIAKQSG
EIIIEKQNFFNQNKTLNVRKSNIVHNLVWILSGYVTKIPFATKLKIYPLM
NISKNQNLTQSKITNKFSGYIKFIKNLNTSKIIRFKLISSLGMCQKQKII
LESKDTKITQCKIYLAKFGSIYLNPYPLDKSVLTLGCLKLLKYKTKTGGN
FYSTNSQRTEYGSSVFYIPESTYNINFDVTALKVNFGDYVNKKTEIYKNY
FIDIAGIIQFDETKPNNREIIIKPGYIIPFPNSLIDILEYDGQIFYPGEI
IFDNFEINTASYIEVCSIKNNLFLLLRPVIRYEIPNPENFNNFFPNWFDP
HQIELDQVPLNLISEMKIKTENPIYFIKHHFFINFLENYSNIFFEINQAT
QPDNYGYFKLILGTNIIPEKILPKEMFKEEVRLSLFIQDKQFVEQETLLA
SFDVIIPFATTVLGIKKQIKNKQKKILLTTEQDYKVIFIEDTDFQLKNNQ
LIKLGKKIGTNFFNKESRLIEQISGNKITFRISHPYLFSKGAQLRIESGD
LIKLKDVLGQLVYERLITGDIVQGLPRVEEILEARHPKVEAKVAPYPGII
TKVIEHQVNTLIWIKHKGSRFDQLINIEGSPNSIQGSPNLLIRKFDFVNV
CQCLTEGTLNPHTILDVYFQYYCSIKILSMYQASYYSFKKVQFFLLNSVQ
AVYYSQGVFIADKHLEIIIKQMTNRIEIIYPGDTNFLSGDLLELEQVRYI
NACLSKKRKIYFKPILLGITKSALKAEGFLSAASFQYTTRVLTQASIEGR
VDWITGLKENVIVGKLIPCGTGFYSNNDFSYLKVKMPTLNNNHNSNIKND
DQTKHHKLRSAIKFRYRI*
back to top

mRNA from alignment at S-ischiensis_contig110:50684..54490+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>mRNA_S-ischiensis_contig110.2402.1 ID=mRNA_S-ischiensis_contig110.2402.1|Name=mRNA_S-ischiensis_contig110.2402.1|organism=Schizocladia ischiensis KU_0333|type=mRNA|length=3807bp|location=Sequence derived from alignment at S-ischiensis_contig110:50684..54490+ (Schizocladia ischiensis KU_0333)
ATGATTGAACAATCAAATCTATTTTGTAATAATGTTCTGAATAAAAAAGA ATTAAAAACAATTATTGCTTGGGCATTTAAAAATTTTGGATCGTTAAAAG CAGCCTATTTAGTAGATGAATTGAAAGATATTGGGTTTCAATATGCAACA AAAGCTGGAATTTCAATTAGTTTAGAAGATTTAAAAATTCCACCGAGTAA AACTAATCTTGTTAGAGACGCTCTTGCTAACACGGTAGAAGCAGAATGGG AAACAATAAAGGGGGAAATAAGTGAAGTTGAACGATTACAAAAAGTTATT AATATTTGGAATATTACAAGTGAGACGTTAAAAGAAAGAGTAATTAAATA TTTTCAAGAAAAAGATCCATTGAATTCAGTATATATTATGGCTTTTTCGG GCGCACGAGGTAATATTTCTCAGGTCCGCCAATTAGTTGGTATGCGTGGA TTAATGTCAGATCCGAACGGACAAATCATAGATATTCCTATTCAATCAAA TTTTCGCGAAGGATTATCTATTACTGATTATATTATTTCGTCTTATGGTG CACGAAAAGGTTTAGTGGATACCGCTATCAAGACAGCAGATTCAGGTTAT TTAACACGCCGTTTAGTAGATATAGCTCAGAGTGTTGTAATTCGAGAATT AGATTGTAGAAGTCAACGGGGCATTAAAATAAAAGAAATAATAGAGGACA ATGATATATTATTTTCTTTACAAGAACGAATTGTTGGTAGAGTTTTGGCT TGCAATATTATTGATCCAAGGACAAAAACTATCATTGCTTATAAAAATGA GTTGATAACGCCTAGATTAGCAGAGAAAATTATGAAATACAATAACAACA GTATTATTGTCCGTTCGCCATTAACTTGTGAATGTCGAAGGTCCATTTGC CAAAAGTGTTATGGTAATAATCTAGCTACGGGAAATTTAGTAGAATTAGG AGAACCGGTAGGTATAATTGCTGCTCAGTCTATAGGGGAACCTGGAACTC AATTAACAATGCGAACATTTCATACAGGGGGGGTCTTTACTAGTGATTTT AGTCGTCAAGTTCGAGCCCAATGTTCAGGATATATTAAATTTTCTTCTAC CTTAAACACCAGAGAATTAAGGACAAATTATGGTAAAGATGTATTAGTAT GTGAAAATCAATCTTTTATAAAGCTTATAACATACACTAATCAAATTAAA GAAATAAAAATTTTTCCAAAATCAATAATTATTGTTGGTAACAATTCTTT TGTTAAAAAAAATGACATTTTATTTGAGTTGCCTCCCAAAAATAAAATGA TGCAAGATGATGCATCTGCTCTTAACGATGTAATAGCAAAACAATCTGGA GAAATAATTATTGAAAAACAAAATTTTTTTAATCAAAATAAAACCTTAAA TGTAAGAAAATCTAATATAGTACATAATTTAGTTTGGATCTTGTCAGGAT ATGTAACCAAAATCCCTTTTGCGACAAAGCTTAAAATATATCCATTAATG AATATATCTAAAAATCAAAATTTGACCCAATCAAAAATTACGAATAAATT TAGTGGTTATATAAAATTTATAAAGAATTTAAATACGTCAAAAATAATAA GATTTAAACTAATAAGTTCTTTAGGAATGTGTCAAAAACAAAAAATTATT TTAGAGAGTAAAGATACCAAAATAACTCAATGTAAAATTTATTTGGCAAA ATTTGGAAGCATTTATTTAAATCCTTATCCACTAGACAAGTCAGTTTTAA CTCTAGGTTGTTTAAAGTTATTAAAATATAAAACAAAAACAGGAGGAAAT TTCTATTCAACAAATTCTCAAAGAACTGAATATGGTTCCAGTGTATTCTA TATACCTGAAAGCACTTATAACATTAATTTTGATGTAACTGCTTTAAAAG TCAATTTTGGTGATTATGTAAACAAGAAGACAGAAATATATAAAAATTAC TTTATTGATATCGCCGGTATTATTCAATTTGATGAAACTAAACCAAATAA TAGAGAAATTATTATTAAACCTGGTTATATAATACCATTTCCCAATTCTT TAATCGATATTTTAGAGTACGATGGTCAAATTTTTTATCCAGGTGAAATT ATCTTTGATAACTTTGAAATTAATACTGCAAGTTATATTGAAGTTTGTAG TATCAAAAATAATTTGTTTTTGTTATTACGACCGGTAATTCGATATGAAA TTCCAAATCCGGAAAATTTTAATAATTTCTTTCCTAATTGGTTTGATCCA CATCAAATAGAATTAGATCAAGTTCCATTAAATTTAATTTCAGAAATGAA GATAAAAACAGAAAATCCAATTTACTTTATCAAACATCATTTCTTTATTA ATTTTCTCGAAAATTATTCAAATATTTTTTTTGAGATTAATCAAGCAACT CAACCTGACAATTATGGTTATTTCAAATTAATTTTAGGTACTAATATAAT TCCTGAAAAAATATTACCAAAAGAAATGTTTAAAGAGGAAGTTAGATTAT CTCTATTTATTCAAGATAAACAATTTGTTGAACAGGAAACATTACTAGCC TCCTTTGATGTTATTATTCCATTTGCTACTACTGTTTTGGGAATTAAAAA ACAAATAAAAAATAAACAGAAAAAAATTTTGTTGACGACAGAACAAGATT ATAAAGTTATTTTTATCGAAGATACAGATTTCCAACTAAAAAATAATCAA TTAATTAAATTAGGAAAAAAAATTGGTACCAATTTTTTTAATAAAGAATC AAGATTAATTGAACAAATTAGCGGAAACAAAATTACTTTTCGTATCAGTC ATCCGTATTTATTTTCGAAAGGAGCACAGCTTCGAATAGAATCGGGAGAT CTTATCAAATTAAAAGATGTTTTAGGTCAGTTAGTTTATGAACGTCTTAT AACTGGCGATATTGTTCAAGGATTGCCACGTGTGGAAGAAATTTTAGAGG CTAGACACCCAAAAGTAGAAGCTAAAGTTGCTCCATATCCAGGTATTATC ACAAAAGTAATTGAACATCAAGTTAATACACTTATTTGGATCAAACATAA GGGCTCAAGGTTCGATCAATTAATTAATATTGAAGGTTCTCCAAATAGTA TTCAAGGTTCCCCAAATTTATTAATTCGTAAATTTGATTTTGTTAACGTA TGTCAATGTTTAACTGAGGGTACTTTAAATCCTCATACTATTTTAGACGT TTATTTTCAGTACTATTGTTCTATTAAAATTTTATCTATGTATCAAGCAT CTTATTATAGTTTTAAAAAAGTTCAATTTTTTTTACTTAATTCTGTACAA GCAGTTTATTATTCTCAAGGTGTGTTTATTGCTGATAAGCATCTTGAAAT TATTATTAAACAAATGACAAATCGAATAGAAATTATATATCCAGGTGATA CAAATTTTTTATCGGGTGATTTATTAGAATTAGAACAAGTTAGATATATA AATGCATGTTTATCAAAAAAACGAAAAATATATTTTAAACCCATTTTATT GGGAATTACAAAATCAGCATTAAAAGCAGAAGGTTTTCTCTCTGCAGCTA GTTTTCAGTATACTACAAGAGTTTTAACCCAAGCATCCATTGAGGGTCGT GTTGATTGGATTACAGGTTTAAAAGAAAATGTTATCGTTGGAAAATTAAT TCCATGTGGCACTGGATTTTATAGCAATAATGACTTTTCTTATCTAAAGG TCAAAATGCCAACATTGAACAATAATCATAATTCTAATATTAAAAATGAT GATCAAACTAAACATCATAAATTAAGATCTGCTATAAAATTTCGCTATAG AATTTGA
back to top

Coding sequence (CDS) from alignment at S-ischiensis_contig110:50684..54490+

>mRNA_S-ischiensis_contig110.2402.1 ID=mRNA_S-ischiensis_contig110.2402.1|Name=mRNA_S-ischiensis_contig110.2402.1|organism=Schizocladia ischiensis KU_0333|type=CDS|length=7614bp|location=Sequence derived from alignment at S-ischiensis_contig110:50684..54490+ (Schizocladia ischiensis KU_0333)
ATGATTGAACAATCAAATCTATTTTGTAATAATGTTCTGAATAAAAAAGA
ATTAAAAACAATTATTGCTTGGGCATTTAAAAATTTTGGATCGTTAAAAG
CAGCCTATTTAGTAGATGAATTGAAAGATATTGGGTTTCAATATGCAACA
AAAGCTGGAATTTCAATTAGTTTAGAAGATTTAAAAATTCCACCGAGTAA
AACTAATCTTGTTAGAGACGCTCTTGCTAACACGGTAGAAGCAGAATGGG
AAACAATAAAGGGGGAAATAAGTGAAGTTGAACGATTACAAAAAGTTATT
AATATTTGGAATATTACAAGTGAGACGTTAAAAGAAAGAGTAATTAAATA
TTTTCAAGAAAAAGATCCATTGAATTCAGTATATATTATGGCTTTTTCGG
GCGCACGAGGTAATATTTCTCAGGTCCGCCAATTAGTTGGTATGCGTGGA
TTAATGTCAGATCCGAACGGACAAATCATAGATATTCCTATTCAATCAAA
TTTTCGCGAAGGATTATCTATTACTGATTATATTATTTCGTCTTATGGTG
CACGAAAAGGTTTAGTGGATACCGCTATCAAGACAGCAGATTCAGGTTAT
TTAACACGCCGTTTAGTAGATATAGCTCAGAGTGTTGTAATTCGAGAATT
AGATTGTAGAAGTCAACGGGGCATTAAAATAAAAGAAATAATAGAGGACA
ATGATATATTATTTTCTTTACAAGAACGAATTGTTGGTAGAGTTTTGGCT
TGCAATATTATTGATCCAAGGACAAAAACTATCATTGCTTATAAAAATGA
GTTGATAACGCCTAGATTAGCAGAGAAAATTATGAAATACAATAACAACA
GTATTATTGTCCGTTCGCCATTAACTTGTGAATGTCGAAGGTCCATTTGC
CAAAAGTGTTATGGTAATAATCTAGCTACGGGAAATTTAGTAGAATTAGG
AGAACCGGTAGGTATAATTGCTGCTCAGTCTATAGGGGAACCTGGAACTC
AATTAACAATGCGAACATTTCATACAGGGGGGGTCTTTACTAGTGATTTT
AGTCGTCAAGTTCGAGCCCAATGTTCAGGATATATTAAATTTTCTTCTAC
CTTAAACACCAGAGAATTAAGGACAAATTATGGTAAAGATGTATTAGTAT
GTGAAAATCAATCTTTTATAAAGCTTATAACATACACTAATCAAATTAAA
GAAATAAAAATTTTTCCAAAATCAATAATTATTGTTGGTAACAATTCTTT
TGTTAAAAAAAATGACATTTTATTTGAGTTGCCTCCCAAAAATAAAATGA
TGCAAGATGATGCATCTGCTCTTAACGATGTAATAGCAAAACAATCTGGA
GAAATAATTATTGAAAAACAAAATTTTTTTAATCAAAATAAAACCTTAAA
TGTAAGAAAATCTAATATAGTACATAATTTAGTTTGGATCTTGTCAGGAT
ATGTAACCAAAATCCCTTTTGCGACAAAGCTTAAAATATATCCATTAATG
AATATATCTAAAAATCAAAATTTGACCCAATCAAAAATTACGAATAAATT
TAGTGGTTATATAAAATTTATAAAGAATTTAAATACGTCAAAAATAATAA
GATTTAAACTAATAAGTTCTTTAGGAATGTGTCAAAAACAAAAAATTATT
TTAGAGAGTAAAGATACCAAAATAACTCAATGTAAAATTTATTTGGCAAA
ATTTGGAAGCATTTATTTAAATCCTTATCCACTAGACAAGTCAGTTTTAA
CTCTAGGTTGTTTAAAGTTATTAAAATATAAAACAAAAACAGGAGGAAAT
TTCTATTCAACAAATTCTCAAAGAACTGAATATGGTTCCAGTGTATTCTA
TATACCTGAAAGCACTTATAACATTAATTTTGATGTAACTGCTTTAAAAG
TCAATTTTGGTGATTATGTAAACAAGAAGACAGAAATATATAAAAATTAC
TTTATTGATATCGCCGGTATTATTCAATTTGATGAAACTAAACCAAATAA
TAGAGAAATTATTATTAAACCTGGTTATATAATACCATTTCCCAATTCTT
TAATCGATATTTTAGAGTACGATGGTCAAATTTTTTATCCAGGTGAAATT
ATCTTTGATAACTTTGAAATTAATACTGCAAGTTATATTGAAGTTTGTAG
TATCAAAAATAATTTGTTTTTGTTATTACGACCGGTAATTCGATATGAAA
TTCCAAATCCGGAAAATTTTAATAATTTCTTTCCTAATTGGTTTGATCCA
CATCAAATAGAATTAGATCAAGTTCCATTAAATTTAATTTCAGAAATGAA
GATAAAAACAGAAAATCCAATTTACTTTATCAAACATCATTTCTTTATTA
ATTTTCTCGAAAATTATTCAAATATTTTTTTTGAGATTAATCAAGCAACT
CAACCTGACAATTATGGTTATTTCAAATTAATTTTAGGTACTAATATAAT
TCCTGAAAAAATATTACCAAAAGAAATGTTTAAAGAGGAAGTTAGATTAT
CTCTATTTATTCAAGATAAACAATTTGTTGAACAGGAAACATTACTAGCC
TCCTTTGATGTTATTATTCCATTTGCTACTACTGTTTTGGGAATTAAAAA
ACAAATAAAAAATAAACAGAAAAAAATTTTGTTGACGACAGAACAAGATT
ATAAAGTTATTTTTATCGAAGATACAGATTTCCAACTAAAAAATAATCAA
TTAATTAAATTAGGAAAAAAAATTGGTACCAATTTTTTTAATAAAGAATC
AAGATTAATTGAACAAATTAGCGGAAACAAAATTACTTTTCGTATCAGTC
ATCCGTATTTATTTTCGAAAGGAGCACAGCTTCGAATAGAATCGGGAGAT
CTTATCAAATTAAAAGATGTTTTAGGTCAGTTAGTTTATGAACGTCTTAT
AACTGGCGATATTGTTCAAGGATTGCCACGTGTGGAAGAAATTTTAGAGG
CTAGACACCCAAAAGTAGAAGCTAAAGTTGCTCCATATCCAGGTATTATC
ACAAAAGTAATTGAACATCAAGTTAATACACTTATTTGGATCAAACATAA
GGGCTCAAGGTTCGATCAATTAATTAATATTGAAGGTTCTCCAAATAGTA
TTCAAGGTTCCCCAAATTTATTAATTCGTAAATTTGATTTTGTTAACGTA
TGTCAATGTTTAACTGAGGGTACTTTAAATCCTCATACTATTTTAGACGT
TTATTTTCAGTACTATTGTTCTATTAAAATTTTATCTATGTATCAAGCAT
CTTATTATAGTTTTAAAAAAGTTCAATTTTTTTTACTTAATTCTGTACAA
GCAGTTTATTATTCTCAAGGTGTGTTTATTGCTGATAAGCATCTTGAAAT
TATTATTAAACAAATGACAAATCGAATAGAAATTATATATCCAGGTGATA
CAAATTTTTTATCGGGTGATTTATTAGAATTAGAACAAGTTAGATATATA
AATGCATGTTTATCAAAAAAACGAAAAATATATTTTAAACCCATTTTATT
GGGAATTACAAAATCAGCATTAAAAGCAGAAGGTTTTCTCTCTGCAGCTA
GTTTTCAGTATACTACAAGAGTTTTAACCCAAGCATCCATTGAGGGTCGT
GTTGATTGGATTACAGGTTTAAAAGAAAATGTTATCGTTGGAAAATTAAT
TCCATGTGGCACTGGATTTTATAGCAATAATGACTTTTCTTATCTAAAGG
TCAAAATGCCAACATTGAACAATAATCATAATTCTAATATTAAAAATGAT
GATCAAACTAAACATCATAAATTAAGATCTGCTATAAAATTTCGCTATAG
AATTTGAATGATTGAACAATCAAATCTATTTTGTAATAATGTTCTGAATA
AAAAAGAATTAAAAACAATTATTGCTTGGGCATTTAAAAATTTTGGATCG
TTAAAAGCAGCCTATTTAGTAGATGAATTGAAAGATATTGGGTTTCAATA
TGCAACAAAAGCTGGAATTTCAATTAGTTTAGAAGATTTAAAAATTCCAC
CGAGTAAAACTAATCTTGTTAGAGACGCTCTTGCTAACACGGTAGAAGCA
GAATGGGAAACAATAAAGGGGGAAATAAGTGAAGTTGAACGATTACAAAA
AGTTATTAATATTTGGAATATTACAAGTGAGACGTTAAAAGAAAGAGTAA
TTAAATATTTTCAAGAAAAAGATCCATTGAATTCAGTATATATTATGGCT
TTTTCGGGCGCACGAGGTAATATTTCTCAGGTCCGCCAATTAGTTGGTAT
GCGTGGATTAATGTCAGATCCGAACGGACAAATCATAGATATTCCTATTC
AATCAAATTTTCGCGAAGGATTATCTATTACTGATTATATTATTTCGTCT
TATGGTGCACGAAAAGGTTTAGTGGATACCGCTATCAAGACAGCAGATTC
AGGTTATTTAACACGCCGTTTAGTAGATATAGCTCAGAGTGTTGTAATTC
GAGAATTAGATTGTAGAAGTCAACGGGGCATTAAAATAAAAGAAATAATA
GAGGACAATGATATATTATTTTCTTTACAAGAACGAATTGTTGGTAGAGT
TTTGGCTTGCAATATTATTGATCCAAGGACAAAAACTATCATTGCTTATA
AAAATGAGTTGATAACGCCTAGATTAGCAGAGAAAATTATGAAATACAAT
AACAACAGTATTATTGTCCGTTCGCCATTAACTTGTGAATGTCGAAGGTC
CATTTGCCAAAAGTGTTATGGTAATAATCTAGCTACGGGAAATTTAGTAG
AATTAGGAGAACCGGTAGGTATAATTGCTGCTCAGTCTATAGGGGAACCT
GGAACTCAATTAACAATGCGAACATTTCATACAGGGGGGGTCTTTACTAG
TGATTTTAGTCGTCAAGTTCGAGCCCAATGTTCAGGATATATTAAATTTT
CTTCTACCTTAAACACCAGAGAATTAAGGACAAATTATGGTAAAGATGTA
TTAGTATGTGAAAATCAATCTTTTATAAAGCTTATAACATACACTAATCA
AATTAAAGAAATAAAAATTTTTCCAAAATCAATAATTATTGTTGGTAACA
ATTCTTTTGTTAAAAAAAATGACATTTTATTTGAGTTGCCTCCCAAAAAT
AAAATGATGCAAGATGATGCATCTGCTCTTAACGATGTAATAGCAAAACA
ATCTGGAGAAATAATTATTGAAAAACAAAATTTTTTTAATCAAAATAAAA
CCTTAAATGTAAGAAAATCTAATATAGTACATAATTTAGTTTGGATCTTG
TCAGGATATGTAACCAAAATCCCTTTTGCGACAAAGCTTAAAATATATCC
ATTAATGAATATATCTAAAAATCAAAATTTGACCCAATCAAAAATTACGA
ATAAATTTAGTGGTTATATAAAATTTATAAAGAATTTAAATACGTCAAAA
ATAATAAGATTTAAACTAATAAGTTCTTTAGGAATGTGTCAAAAACAAAA
AATTATTTTAGAGAGTAAAGATACCAAAATAACTCAATGTAAAATTTATT
TGGCAAAATTTGGAAGCATTTATTTAAATCCTTATCCACTAGACAAGTCA
GTTTTAACTCTAGGTTGTTTAAAGTTATTAAAATATAAAACAAAAACAGG
AGGAAATTTCTATTCAACAAATTCTCAAAGAACTGAATATGGTTCCAGTG
TATTCTATATACCTGAAAGCACTTATAACATTAATTTTGATGTAACTGCT
TTAAAAGTCAATTTTGGTGATTATGTAAACAAGAAGACAGAAATATATAA
AAATTACTTTATTGATATCGCCGGTATTATTCAATTTGATGAAACTAAAC
CAAATAATAGAGAAATTATTATTAAACCTGGTTATATAATACCATTTCCC
AATTCTTTAATCGATATTTTAGAGTACGATGGTCAAATTTTTTATCCAGG
TGAAATTATCTTTGATAACTTTGAAATTAATACTGCAAGTTATATTGAAG
TTTGTAGTATCAAAAATAATTTGTTTTTGTTATTACGACCGGTAATTCGA
TATGAAATTCCAAATCCGGAAAATTTTAATAATTTCTTTCCTAATTGGTT
TGATCCACATCAAATAGAATTAGATCAAGTTCCATTAAATTTAATTTCAG
AAATGAAGATAAAAACAGAAAATCCAATTTACTTTATCAAACATCATTTC
TTTATTAATTTTCTCGAAAATTATTCAAATATTTTTTTTGAGATTAATCA
AGCAACTCAACCTGACAATTATGGTTATTTCAAATTAATTTTAGGTACTA
ATATAATTCCTGAAAAAATATTACCAAAAGAAATGTTTAAAGAGGAAGTT
AGATTATCTCTATTTATTCAAGATAAACAATTTGTTGAACAGGAAACATT
ACTAGCCTCCTTTGATGTTATTATTCCATTTGCTACTACTGTTTTGGGAA
TTAAAAAACAAATAAAAAATAAACAGAAAAAAATTTTGTTGACGACAGAA
CAAGATTATAAAGTTATTTTTATCGAAGATACAGATTTCCAACTAAAAAA
TAATCAATTAATTAAATTAGGAAAAAAAATTGGTACCAATTTTTTTAATA
AAGAATCAAGATTAATTGAACAAATTAGCGGAAACAAAATTACTTTTCGT
ATCAGTCATCCGTATTTATTTTCGAAAGGAGCACAGCTTCGAATAGAATC
GGGAGATCTTATCAAATTAAAAGATGTTTTAGGTCAGTTAGTTTATGAAC
GTCTTATAACTGGCGATATTGTTCAAGGATTGCCACGTGTGGAAGAAATT
TTAGAGGCTAGACACCCAAAAGTAGAAGCTAAAGTTGCTCCATATCCAGG
TATTATCACAAAAGTAATTGAACATCAAGTTAATACACTTATTTGGATCA
AACATAAGGGCTCAAGGTTCGATCAATTAATTAATATTGAAGGTTCTCCA
AATAGTATTCAAGGTTCCCCAAATTTATTAATTCGTAAATTTGATTTTGT
TAACGTATGTCAATGTTTAACTGAGGGTACTTTAAATCCTCATACTATTT
TAGACGTTTATTTTCAGTACTATTGTTCTATTAAAATTTTATCTATGTAT
CAAGCATCTTATTATAGTTTTAAAAAAGTTCAATTTTTTTTACTTAATTC
TGTACAAGCAGTTTATTATTCTCAAGGTGTGTTTATTGCTGATAAGCATC
TTGAAATTATTATTAAACAAATGACAAATCGAATAGAAATTATATATCCA
GGTGATACAAATTTTTTATCGGGTGATTTATTAGAATTAGAACAAGTTAG
ATATATAAATGCATGTTTATCAAAAAAACGAAAAATATATTTTAAACCCA
TTTTATTGGGAATTACAAAATCAGCATTAAAAGCAGAAGGTTTTCTCTCT
GCAGCTAGTTTTCAGTATACTACAAGAGTTTTAACCCAAGCATCCATTGA
GGGTCGTGTTGATTGGATTACAGGTTTAAAAGAAAATGTTATCGTTGGAA
AATTAATTCCATGTGGCACTGGATTTTATAGCAATAATGACTTTTCTTAT
CTAAAGGTCAAAATGCCAACATTGAACAATAATCATAATTCTAATATTAA
AAATGATGATCAAACTAAACATCATAAATTAAGATCTGCTATAAAATTTC
GCTATAGAATTTGA
back to top