Ggra3969.t1 (mRNA) Gracilaria gracilis GNS1m male

You are viewing an mRNA, more information available on the corresponding polypeptide page

Overview
NameGgra3969.t1
Unique NameGgra3969.t1
TypemRNA
OrganismGracilaria gracilis GNS1m male (Gracilaria gracilis GNS1m male (Slender Wart Weed))
Sequence length681
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
tig00000908_piloncontigtig00000908_pilon:243225..245267 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Gracilaria gracilis GNS1m male OGS1.02022-05-09
Properties
Property NameValue
Seed ortholog130081.XP_005708037.1
Preferred nameDDX3X
PFAMsDEAD,Helicase_C
Max annot lvl2759|Eukaryota
KEGG koko:K10268,ko:K11594,ko:K17642
KEGG Pathwayko04622,ko05161,ko05203,map04622,map05161,map05203
GOsGO:0000003,GO:0000070,GO:0000278,GO:0000280,GO:0000375,GO:0000377,GO:0000390,GO:0000398,GO:0000819,GO:0001558,GO:0001775,GO:0001817,GO:0001819,GO:0001932,GO:0001934,GO:0002164,GO:0002165,GO:0002168,GO:0002181,GO:0002183,GO:0002252,GO:0002263,GO:0002274,GO:0002275,GO:0002283,GO:0002366,GO:0002376,GO:0002443,GO:0002444,GO:0002446,GO:0003006,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003678,GO:0003723,GO:0003724,GO:0003725,GO:0003727,GO:0003729,GO:0003743,GO:0003824,GO:0003924,GO:0004003,GO:0004004,GO:0004386,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005576,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005730,GO:0005737,GO:0005739,GO:0005740,GO:0005741,GO:0005777,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006139,GO:0006355,GO:0006357,GO:0006396,GO:0006397,GO:0006412,GO:0006413,GO:0006417,GO:0006446,GO:0006518,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006810,GO:0006887,GO:0006915,GO:0006950,GO:0006952,GO:0006955,GO:0006970,GO:0006996,GO:0007049,GO:0007059,GO:0007154,GO:0007165,GO:0007166,GO:0007267,GO:0007275,GO:0007276,GO:0007281,GO:0007283,GO:0007292,GO:0007346,GO:0007431,GO:0007435,GO:0007552,GO:0008026,GO:0008047,GO:0008094,GO:0008104,GO:0008134,GO:0008135,GO:0008143,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008186,GO:0008190,GO:0008219,GO:0008380,GO:0008625,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009605,GO:0009607,GO:0009615,GO:0009628,GO:0009653,GO:0009719,GO:0009725,GO:0009791,GO:0009886,GO:0009887,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009891,GO:0009892,GO:0009893,GO:0009966,GO:0009967,GO:0009968,GO:0009987,GO:0010033,GO:0010466,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010494,GO:0010501,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010558,GO:0010562,GO:0010564,GO:0010604,GO:0010605,GO:0010608,GO:0010623,GO:0010628,GO:0010629,GO:0010646,GO:0010647,GO:0010648,GO:0010941,GO:0010942,GO:0010950,GO:0010951,GO:0010952,GO:0012501,GO:0012502,GO:0012505,GO:0014070,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016055,GO:0016070,GO:0016071,GO:0016192,GO:0016246,GO:0016441,GO:0016442,GO:0016458,GO:0016462,GO:0016604,GO:0016607,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0017148,GO:0019207,GO:0019209,GO:0019219,GO:0019220,GO:0019222,GO:0019538,GO:0019827,GO:0019867,GO:0019887,GO:0019953,GO:0022402,GO:0022411,GO:0022412,GO:0022414,GO:0022607,GO:0022612,GO:0022613,GO:0022618,GO:0023051,GO:0023052,GO:0023056,GO:0023057,GO:0030111,GO:0030141,GO:0030154,GO:0030162,GO:0030177,GO:0030234,GO:0030295,GO:0030307,GO:0030308,GO:0030718,GO:0031047,GO:0031090,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031328,GO:0031332,GO:0031333,GO:0031369,GO:0031399,GO:0031401,GO:0031410,GO:0031966,GO:0031967,GO:0031968,GO:0031974,GO:0031975,GO:0031981,GO:0031982,GO:0031983,GO:0032147,GO:0032268,GO:0032269,GO:0032270,GO:0032392,GO:0032479,GO:0032481,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032504,GO:0032508,GO:0032642,GO:0032648,GO:0032722,GO:0032728,GO:0032940,GO:0032984,GO:0032988,GO:0032991,GO:0033036,GO:0033365,GO:0033554,GO:0033592,GO:0033674,GO:0033993,GO:0034063,GO:0034248,GO:0034249,GO:0034250,GO:0034613,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034774,GO:0035070,GO:0035071,GO:0035072,GO:0035075,GO:0035078,GO:0035081,GO:0035194,GO:0035272,GO:0035556,GO:0035613,GO:0035770,GO:0036098,GO:0036230,GO:0036314,GO:0036464,GO:0036477,GO:0040008,GO:0040029,GO:0042119,GO:0042221,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042256,GO:0042325,GO:0042327,GO:0042579,GO:0042623,GO:0042981,GO:0043021,GO:0043024,GO:0043025,GO:0043043,GO:0043065,GO:0043066,GO:0043067,GO:0043068,GO:0043069,GO:0043085,GO:0043086,GO:0043154,GO:0043170,GO:0043186,GO:0043207,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043233,GO:0043254,GO:0043273,GO:0043280,GO:0043281,GO:0043299,GO:0043312,GO:0043539,GO:0043549,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043900,GO:0043902,GO:0043903,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044087,GO:0044092,GO:0044093,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044297,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044428,GO:0044429,GO:0044433,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044451,GO:0044464,GO:0044703,GO:0044877,GO:0045055,GO:0045069,GO:0045070,GO:0045087,GO:0045321,GO:0045495,GO:0045727,GO:0045787,GO:0045859,GO:0045860,GO:0045861,GO:0045862,GO:0045893,GO:0045926,GO:0045927,GO:0045931,GO:0045935,GO:0045937,GO:0045944,GO:0045948,GO:0046483,GO:0046677,GO:0046685,GO:0046903,GO:0048027,GO:0048102,GO:0048232,GO:0048285,GO:0048468,GO:0048477,GO:0048513,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0048524,GO:0048583,GO:0048584,GO:0048585,GO:0048609,GO:0048707,GO:0048731,GO:0048732,GO:0048856,GO:0048869,GO:0050789,GO:0050790,GO:0050792,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051128,GO:0051129,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051173,GO:0051174,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051239,GO:0051240,GO:0051246,GO:0051247,GO:0051248,GO:0051252,GO:0051254,GO:0051276,GO:0051336,GO:0051338,GO:0051345,GO:0051346,GO:0051347,GO:0051641,GO:0051704,GO:0051707,GO:0051716,GO:0051726,GO:0052547,GO:0052548,GO:0060033,GO:0060205,GO:0060255,GO:0060293,GO:0060548,GO:0060828,GO:0065003,GO:0065007,GO:0065009,GO:0070013,GO:0070035,GO:0070717,GO:0070727,GO:0070887,GO:0070925,GO:0071103,GO:0071214,GO:0071236,GO:0071243,GO:0071310,GO:0071396,GO:0071470,GO:0071649,GO:0071651,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0071900,GO:0071902,GO:0071944,GO:0080090,GO:0090068,GO:0090263,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097190,GO:0097191,GO:0097193,GO:0097305,GO:0097306,GO:0097307,GO:0097308,GO:0097458,GO:0097617,GO:0097708,GO:0098588,GO:0098727,GO:0098772,GO:0098805,GO:0098813,GO:0099503,GO:0101002,GO:0104004,GO:0140014,GO:0140097,GO:0140098,GO:0198738,GO:1900087,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901654,GO:1901700,GO:1901701,GO:1901987,GO:1901989,GO:1901990,GO:1901992,GO:1902531,GO:1902532,GO:1902680,GO:1902806,GO:1902808,GO:1903047,GO:1903506,GO:1903508,GO:1903608,GO:1903900,GO:1903902,GO:1904813,GO:1905114,GO:1990904,GO:2000045,GO:2000112,GO:2000113,GO:2000116,GO:2000117,GO:2001056,GO:2001141,GO:2001233,GO:2001234,GO:2001242,GO:2001243
Evalue1.16e-203
EggNOG OGsCOG0513@1|root,KOG0335@2759|Eukaryota
EC3.6.4.13
Descriptionhelicase activity
COG categoryJKL
BRITEko00000,ko00001,ko01000,ko03019,ko03036,ko03041,ko04121
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra3969Ggra3969Gracilaria gracilis GNS1m malegenetig00000908_pilon 243225..245267 -


The following stop_codon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra3969.t1.stop1Ggra3969.t1.stop1Gracilaria gracilis GNS1m malestop_codontig00000908_pilon 243225..243227 -


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra3969.t1.CDS1Ggra3969.t1.CDS1Gracilaria gracilis GNS1m maleCDStig00000908_pilon 243225..245267 -


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra3969.t1.exon1Ggra3969.t1.exon1Gracilaria gracilis GNS1m maleexontig00000908_pilon 243225..245267 -


The following start_codon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra3969.t1.start1Ggra3969.t1.start1Gracilaria gracilis GNS1m malestart_codontig00000908_pilon 245265..245267 -


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra3969.t1Ggra3969.t1Gracilaria gracilis GNS1m malepolypeptidetig00000908_pilon 243225..245267 -


Sequences
The following sequences are available for this feature:

mRNA sequence

>Ggra3969.t1 ID=Ggra3969.t1|Name=Ggra3969.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=mRNA|length=681bp
METKGAVRQLTAATAELRVQDVASPPEKPPQKRNANGPSKGRGGSRYVPP
HMRSRMLGMANNANNAPQPAATGATGATVASVASVDAGRTPSYGGRFGGG
GRDGGRDGRSQRWSDEPRQRTWGDKGPSSNNPGSSSSRWSADDSPFAGKP
DVEEDDIFNGMNTGINFDKYNDIPVEKSGTGSNDITGIDSFEKSGLHIRL
LKNIKLAKYTSPTPVQKNAIPIVSSKRDLMACAQTGSGKTAAFLVPTLHR
MLEMGGPPTPPANTRPSRRRLVYPTALVLAPTRELASQIYEESQKFCHST
GILARVVYGGADVRDQMRQLERGCDLIVATPGRLVDMVERGRISLECVNF
LILDEADRMLDMGFEPQIRQIVEAFYLPPKGERQTLMFSATFPREIQQLA
SDFLDDYIFLTVGRVGSTTDFIQQRVEYCDEASKRDMVLNLLNTISGLTL
VFVETKRGADALEEFLIRSGYPATSIHGDRSQPEREDALRSFRSGRTPIM
VATDVAARGLDIPNVTHVINFDLPNEIDDYVHRIGRTGRAGNSGLATALI
NEKNRNIVRDLTELLSEAGQEVPPFLTKMSEAVSHSGGRRRNGGRFGGRD
FRKDGGSGGGRHNRSNYGNYSGGGGGYGFGNSYGGGGYGGGGYGGGGGGY
GGGGGGYGGGGSYGGGGSGGSYQNGSGSNW*
back to top

spliced messenger RNA

>Ggra3969.t1 ID=Ggra3969.t1|Name=Ggra3969.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=mRNA|length=2043bp|location=Sequence derived from alignment at tig00000908_pilon:243225..245267- (Gracilaria gracilis GNS1m male)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.  
ATGGAGACAAAAGGAGCTGTTCGTCAGCTTACGGCGGCCACCGCCGAGCT
TCGCGTACAAGACGTTGCTTCTCCGCCTGAGAAGCCGCCACAAAAACGCA
ACGCCAACGGGCCTTCCAAGGGAAGAGGTGGTTCGCGCTACGTGCCGCCA
CACATGCGCAGTCGCATGCTTGGCATGGCCAACAACGCAAACAATGCCCC
TCAACCCGCTGCCACTGGCGCTACTGGCGCTACCGTCGCCTCCGTCGCCT
CCGTCGACGCAGGACGCACGCCCTCTTACGGCGGCCGCTTTGGCGGTGGC
GGCCGTGATGGCGGCCGTGATGGTCGCTCTCAGCGCTGGTCGGATGAGCC
TCGCCAGCGCACCTGGGGTGACAAAGGCCCCTCTAGTAATAATCCTGGTT
CCTCGTCGTCGAGATGGTCTGCTGACGACTCGCCGTTTGCCGGTAAGCCA
GACGTTGAGGAAGACGATATTTTCAATGGAATGAATACTGGAATTAACTT
CGACAAGTACAACGACATCCCTGTTGAGAAGTCCGGAACTGGTAGCAATG
ACATAACTGGCATCGATAGTTTTGAAAAGTCTGGGTTGCATATTCGCTTG
CTTAAGAACATCAAGTTGGCAAAGTACACATCACCCACACCTGTCCAGAA
GAACGCTATCCCCATTGTCTCCTCCAAGCGCGATCTTATGGCATGTGCTC
AAACTGGTTCAGGAAAGACTGCAGCCTTTTTGGTTCCTACTTTGCACCGA
ATGTTAGAGATGGGTGGCCCGCCCACCCCTCCGGCCAACACCCGTCCTTC
CCGACGTCGTCTTGTCTACCCAACTGCCCTTGTACTGGCCCCCACCCGTG
AACTTGCGAGTCAGATTTACGAAGAATCGCAGAAGTTTTGCCATTCCACT
GGTATTCTTGCACGTGTTGTTTACGGTGGTGCTGATGTTCGCGATCAAAT
GCGTCAACTTGAACGTGGATGTGATCTTATTGTTGCCACTCCCGGACGTC
TTGTTGATATGGTTGAGCGTGGACGTATTTCGCTTGAATGTGTCAATTTC
CTTATTCTCGACGAGGCTGATCGTATGCTCGATATGGGATTCGAGCCGCA
AATTCGCCAAATTGTGGAAGCCTTTTATCTTCCTCCGAAGGGGGAACGTC
AGACTCTTATGTTCTCTGCAACGTTCCCAAGAGAAATTCAACAGCTCGCA
AGTGATTTCCTGGACGACTATATATTCCTCACAGTCGGTCGCGTTGGCTC
TACTACGGACTTCATTCAACAGAGGGTTGAGTATTGTGATGAAGCTTCAA
AGCGTGATATGGTTCTTAACCTACTCAACACCATCTCTGGTCTAACCCTC
GTCTTTGTGGAAACGAAGCGTGGTGCGGATGCACTTGAAGAGTTCCTCAT
TCGCAGTGGCTATCCTGCTACGTCCATTCACGGTGACCGAAGCCAGCCTG
AACGAGAGGACGCTCTTCGTTCGTTCCGCTCAGGGCGCACCCCTATTATG
GTTGCAACTGATGTTGCTGCGAGGGGACTCGATATTCCGAATGTCACCCA
TGTTATTAACTTCGATCTACCCAATGAGATCGATGATTATGTGCACAGGA
TTGGAAGAACTGGACGTGCCGGAAACTCCGGACTCGCCACCGCACTTATC
AACGAGAAGAATCGCAATATCGTCAGAGACCTGACCGAGTTGCTCAGCGA
AGCTGGCCAAGAGGTACCCCCGTTCCTCACCAAGATGTCAGAAGCTGTGT
CGCACTCAGGCGGTCGCAGGCGTAACGGCGGCCGCTTTGGAGGTCGCGAT
TTCCGTAAGGATGGCGGTAGCGGTGGTGGCCGCCACAACCGTAGCAACTA
TGGTAACTACAGCGGTGGTGGAGGTGGCTATGGCTTCGGAAACTCCTATG
GCGGCGGTGGCTATGGTGGTGGTGGATACGGCGGCGGTGGTGGTGGATAT
GGCGGTGGTGGTGGTGGATACGGCGGTGGTGGAAGCTACGGAGGAGGTGG
TAGTGGTGGCTCGTATCAAAACGGCTCTGGTAGCAACTGGTAA
back to top

protein sequence of Ggra3969.t1

>Ggra3969.t1 ID=Ggra3969.t1|Name=Ggra3969.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=polypeptide|length=681bp
METKGAVRQLTAATAELRVQDVASPPEKPPQKRNANGPSKGRGGSRYVPP
HMRSRMLGMANNANNAPQPAATGATGATVASVASVDAGRTPSYGGRFGGG
GRDGGRDGRSQRWSDEPRQRTWGDKGPSSNNPGSSSSRWSADDSPFAGKP
DVEEDDIFNGMNTGINFDKYNDIPVEKSGTGSNDITGIDSFEKSGLHIRL
LKNIKLAKYTSPTPVQKNAIPIVSSKRDLMACAQTGSGKTAAFLVPTLHR
MLEMGGPPTPPANTRPSRRRLVYPTALVLAPTRELASQIYEESQKFCHST
GILARVVYGGADVRDQMRQLERGCDLIVATPGRLVDMVERGRISLECVNF
LILDEADRMLDMGFEPQIRQIVEAFYLPPKGERQTLMFSATFPREIQQLA
SDFLDDYIFLTVGRVGSTTDFIQQRVEYCDEASKRDMVLNLLNTISGLTL
VFVETKRGADALEEFLIRSGYPATSIHGDRSQPEREDALRSFRSGRTPIM
VATDVAARGLDIPNVTHVINFDLPNEIDDYVHRIGRTGRAGNSGLATALI
NEKNRNIVRDLTELLSEAGQEVPPFLTKMSEAVSHSGGRRRNGGRFGGRD
FRKDGGSGGGRHNRSNYGNYSGGGGGYGFGNSYGGGGYGGGGYGGGGGGY
GGGGGGYGGGGSYGGGGSGGSYQNGSGSNW*
back to top

mRNA from alignment at tig00000908_pilon:243225..245267-

Legend: polypeptideCDSexonstart_codonstop_codon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Ggra3969.t1 ID=Ggra3969.t1|Name=Ggra3969.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=mRNA|length=2043bp|location=Sequence derived from alignment at tig00000908_pilon:243225..245267- (Gracilaria gracilis GNS1m male)
ATGGAGACAAAAGGAGCTGTTCGTCAGCTTACGGCGGCCACCGCCGAGCT
TCGCGTACAAGACGTTGCTTCTCCGCCTGAGAAGCCGCCACAAAAACGCA
ACGCCAACGGGCCTTCCAAGGGAAGAGGTGGTTCGCGCTACGTGCCGCCA
CACATGCGCAGTCGCATGCTTGGCATGGCCAACAACGCAAACAATGCCCC
TCAACCCGCTGCCACTGGCGCTACTGGCGCTACCGTCGCCTCCGTCGCCT
CCGTCGACGCAGGACGCACGCCCTCTTACGGCGGCCGCTTTGGCGGTGGC
GGCCGTGATGGCGGCCGTGATGGTCGCTCTCAGCGCTGGTCGGATGAGCC
TCGCCAGCGCACCTGGGGTGACAAAGGCCCCTCTAGTAATAATCCTGGTT
CCTCGTCGTCGAGATGGTCTGCTGACGACTCGCCGTTTGCCGGTAAGCCA
GACGTTGAGGAAGACGATATTTTCAATGGAATGAATACTGGAATTAACTT
CGACAAGTACAACGACATCCCTGTTGAGAAGTCCGGAACTGGTAGCAATG
ACATAACTGGCATCGATAGTTTTGAAAAGTCTGGGTTGCATATTCGCTTG
CTTAAGAACATCAAGTTGGCAAAGTACACATCACCCACACCTGTCCAGAA
GAACGCTATCCCCATTGTCTCCTCCAAGCGCGATCTTATGGCATGTGCTC
AAACTGGTTCAGGAAAGACTGCAGCCTTTTTGGTTCCTACTTTGCACCGA
ATGTTAGAGATGGGTGGCCCGCCCACCCCTCCGGCCAACACCCGTCCTTC
CCGACGTCGTCTTGTCTACCCAACTGCCCTTGTACTGGCCCCCACCCGTG
AACTTGCGAGTCAGATTTACGAAGAATCGCAGAAGTTTTGCCATTCCACT
GGTATTCTTGCACGTGTTGTTTACGGTGGTGCTGATGTTCGCGATCAAAT
GCGTCAACTTGAACGTGGATGTGATCTTATTGTTGCCACTCCCGGACGTC
TTGTTGATATGGTTGAGCGTGGACGTATTTCGCTTGAATGTGTCAATTTC
CTTATTCTCGACGAGGCTGATCGTATGCTCGATATGGGATTCGAGCCGCA
AATTCGCCAAATTGTGGAAGCCTTTTATCTTCCTCCGAAGGGGGAACGTC
AGACTCTTATGTTCTCTGCAACGTTCCCAAGAGAAATTCAACAGCTCGCA
AGTGATTTCCTGGACGACTATATATTCCTCACAGTCGGTCGCGTTGGCTC
TACTACGGACTTCATTCAACAGAGGGTTGAGTATTGTGATGAAGCTTCAA
AGCGTGATATGGTTCTTAACCTACTCAACACCATCTCTGGTCTAACCCTC
GTCTTTGTGGAAACGAAGCGTGGTGCGGATGCACTTGAAGAGTTCCTCAT
TCGCAGTGGCTATCCTGCTACGTCCATTCACGGTGACCGAAGCCAGCCTG
AACGAGAGGACGCTCTTCGTTCGTTCCGCTCAGGGCGCACCCCTATTATG
GTTGCAACTGATGTTGCTGCGAGGGGACTCGATATTCCGAATGTCACCCA
TGTTATTAACTTCGATCTACCCAATGAGATCGATGATTATGTGCACAGGA
TTGGAAGAACTGGACGTGCCGGAAACTCCGGACTCGCCACCGCACTTATC
AACGAGAAGAATCGCAATATCGTCAGAGACCTGACCGAGTTGCTCAGCGA
AGCTGGCCAAGAGGTACCCCCGTTCCTCACCAAGATGTCAGAAGCTGTGT
CGCACTCAGGCGGTCGCAGGCGTAACGGCGGCCGCTTTGGAGGTCGCGAT
TTCCGTAAGGATGGCGGTAGCGGTGGTGGCCGCCACAACCGTAGCAACTA
TGGTAACTACAGCGGTGGTGGAGGTGGCTATGGCTTCGGAAACTCCTATG
GCGGCGGTGGCTATGGTGGTGGTGGATACGGCGGCGGTGGTGGTGGATAT
GGCGGTGGTGGTGGTGGATACGGCGGTGGTGGAAGCTACGGAGGAGGTGG
TAGTGGTGGCTCGTATCAAAACGGCTCTGGTAGCAACTGGTAA
back to top

Coding sequence (CDS) from alignment at tig00000908_pilon:243225..245267-

>Ggra3969.t1 ID=Ggra3969.t1|Name=Ggra3969.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=CDS|length=2043bp|location=Sequence derived from alignment at tig00000908_pilon:243225..245267- (Gracilaria gracilis GNS1m male)
ATGGAGACAAAAGGAGCTGTTCGTCAGCTTACGGCGGCCACCGCCGAGCT
TCGCGTACAAGACGTTGCTTCTCCGCCTGAGAAGCCGCCACAAAAACGCA
ACGCCAACGGGCCTTCCAAGGGAAGAGGTGGTTCGCGCTACGTGCCGCCA
CACATGCGCAGTCGCATGCTTGGCATGGCCAACAACGCAAACAATGCCCC
TCAACCCGCTGCCACTGGCGCTACTGGCGCTACCGTCGCCTCCGTCGCCT
CCGTCGACGCAGGACGCACGCCCTCTTACGGCGGCCGCTTTGGCGGTGGC
GGCCGTGATGGCGGCCGTGATGGTCGCTCTCAGCGCTGGTCGGATGAGCC
TCGCCAGCGCACCTGGGGTGACAAAGGCCCCTCTAGTAATAATCCTGGTT
CCTCGTCGTCGAGATGGTCTGCTGACGACTCGCCGTTTGCCGGTAAGCCA
GACGTTGAGGAAGACGATATTTTCAATGGAATGAATACTGGAATTAACTT
CGACAAGTACAACGACATCCCTGTTGAGAAGTCCGGAACTGGTAGCAATG
ACATAACTGGCATCGATAGTTTTGAAAAGTCTGGGTTGCATATTCGCTTG
CTTAAGAACATCAAGTTGGCAAAGTACACATCACCCACACCTGTCCAGAA
GAACGCTATCCCCATTGTCTCCTCCAAGCGCGATCTTATGGCATGTGCTC
AAACTGGTTCAGGAAAGACTGCAGCCTTTTTGGTTCCTACTTTGCACCGA
ATGTTAGAGATGGGTGGCCCGCCCACCCCTCCGGCCAACACCCGTCCTTC
CCGACGTCGTCTTGTCTACCCAACTGCCCTTGTACTGGCCCCCACCCGTG
AACTTGCGAGTCAGATTTACGAAGAATCGCAGAAGTTTTGCCATTCCACT
GGTATTCTTGCACGTGTTGTTTACGGTGGTGCTGATGTTCGCGATCAAAT
GCGTCAACTTGAACGTGGATGTGATCTTATTGTTGCCACTCCCGGACGTC
TTGTTGATATGGTTGAGCGTGGACGTATTTCGCTTGAATGTGTCAATTTC
CTTATTCTCGACGAGGCTGATCGTATGCTCGATATGGGATTCGAGCCGCA
AATTCGCCAAATTGTGGAAGCCTTTTATCTTCCTCCGAAGGGGGAACGTC
AGACTCTTATGTTCTCTGCAACGTTCCCAAGAGAAATTCAACAGCTCGCA
AGTGATTTCCTGGACGACTATATATTCCTCACAGTCGGTCGCGTTGGCTC
TACTACGGACTTCATTCAACAGAGGGTTGAGTATTGTGATGAAGCTTCAA
AGCGTGATATGGTTCTTAACCTACTCAACACCATCTCTGGTCTAACCCTC
GTCTTTGTGGAAACGAAGCGTGGTGCGGATGCACTTGAAGAGTTCCTCAT
TCGCAGTGGCTATCCTGCTACGTCCATTCACGGTGACCGAAGCCAGCCTG
AACGAGAGGACGCTCTTCGTTCGTTCCGCTCAGGGCGCACCCCTATTATG
GTTGCAACTGATGTTGCTGCGAGGGGACTCGATATTCCGAATGTCACCCA
TGTTATTAACTTCGATCTACCCAATGAGATCGATGATTATGTGCACAGGA
TTGGAAGAACTGGACGTGCCGGAAACTCCGGACTCGCCACCGCACTTATC
AACGAGAAGAATCGCAATATCGTCAGAGACCTGACCGAGTTGCTCAGCGA
AGCTGGCCAAGAGGTACCCCCGTTCCTCACCAAGATGTCAGAAGCTGTGT
CGCACTCAGGCGGTCGCAGGCGTAACGGCGGCCGCTTTGGAGGTCGCGAT
TTCCGTAAGGATGGCGGTAGCGGTGGTGGCCGCCACAACCGTAGCAACTA
TGGTAACTACAGCGGTGGTGGAGGTGGCTATGGCTTCGGAAACTCCTATG
GCGGCGGTGGCTATGGTGGTGGTGGATACGGCGGCGGTGGTGGTGGATAT
GGCGGTGGTGGTGGTGGATACGGCGGTGGTGGAAGCTACGGAGGAGGTGG
TAGTGGTGGCTCGTATCAAAACGGCTCTGGTAGCAACTGGTAA
back to top