mRNA_S-firma_F_contig10295.434.1 (mRNA) Sphaerotrichia firma ET2_F female

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Overview


Name	mRNA_S-firma_F_contig10295.434.1
Unique Name	mRNA_S-firma_F_contig10295.434.1
Type	mRNA
Organism	Sphaerotrichia firma ET2_F female (Sphaerotrichia firma ET2_F female)

Homology

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BLAST of mRNA_S-firma_F_contig10295.434.1 vs. uniprot
Match: A0A418B8S4_9STRA (Non-specific serine/threonine protein kinase n=1 Tax=Aphanomyces invadans TaxID=157072 RepID=A0A418B8S4_9STRA)

HSP 1 Score: 125 bits (314), Expect = 1.590e-32
Identity = 61/107 (57.01%), Postives = 76/107 (71.03%), Query Frame = 1

Query:  301 ASLKRRRWYLGIQSKKDPVHVMNEVVRALRDGSFEWQALGPYRLRCR-------------VVDAHRVKVGLQLYRVQRGIYLLDLQKLAGDSFSFMNMCARIITELK 582
            A  KRRRWYLGIQSKK+P HVM+EV +AL    FEW+ L PYR++CR               DA  +K+GLQLY+VQ+ IYLLD + L GD+F++MN+CARIITELK
Sbjct:   55 AEKKRRRWYLGIQSKKEPAHVMSEVYKALLVLHFEWKVLAPYRVKCRWQPLAFAPPPSTGPSDAKPIKIGLQLYKVQQHIYLLDFENLGGDAFTYMNLCARIITELK 161

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BLAST of mRNA_S-firma_F_contig10295.434.1 vs. uniprot
Match: A0A067CJL6_SAPPC (Non-specific serine/threonine protein kinase n=3 Tax=Saprolegniaceae TaxID=4764 RepID=A0A067CJL6_SAPPC)

HSP 1 Score: 132 bits (332), Expect = 1.940e-32
Identity = 70/122 (57.38%), Postives = 87/122 (71.31%), Query Frame = 1

Query:  277 SFGSTPAGASLKRRRWYLGIQSKKDPVHVMNEVVRALRDGSFEWQALGPYRLRCR-----VVDAH---RVKVGLQLYRVQRGIYLLDLQKLAGDSFSFMNMCARIITELKVKVPTTAHGVAP 618
            S  S  + A  KRRRWYLGIQSKK+P HVM+EV +AL    FEW+ L PYR++CR     V DA+   ++K+GLQLY+VQ+ IYLLD QKL GD+F++MN+CARIITELK     T  GV P
Sbjct:  409 SLASQESVAEKKRRRWYLGIQSKKEPAHVMSEVYKALHVLHFEWKVLAPYRVKCRWHLANVPDANPMKQIKIGLQLYKVQQHIYLLDFQKLGGDAFTYMNLCARIITELK-----TLSGVRP 525

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BLAST of mRNA_S-firma_F_contig10295.434.1 vs. uniprot
Match: A0A425D9J8_9STRA (Non-specific serine/threonine protein kinase n=11 Tax=Aphanomyces astaci TaxID=112090 RepID=A0A425D9J8_9STRA)

HSP 1 Score: 127 bits (318), Expect = 8.800e-32
Identity = 69/121 (57.02%), Postives = 83/121 (68.60%), Query Frame = 1

Query:  301 ASLKRRRWYLGIQSKKDPVHVMNEVVRALRDGSFEWQALGPYRLRCRVVDA----------HR-VKVGLQLYRVQRGIYLLDLQKLAGDSFSFMNMCARIITELKVKVPTTAHGVAPAPAA 630
            A  KRRRWYLGIQSKK+P HVM+EV +AL    FEW+ L PYR++CR   A          H+ VK+GLQLY+VQ+ IYLLD Q L GD+F++MN+CARIITELK     T  GV P  AA
Sbjct:  180 AEKKRRRWYLGIQSKKEPAHVMSEVYKALLVLHFEWKVLAPYRVKCRWQPAPPPPSCSTSVHKPVKIGLQLYKVQQHIYLLDFQNLGGDAFTYMNLCARIITELK-----TLSGVRPTAAA 295

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BLAST of mRNA_S-firma_F_contig10295.434.1 vs. uniprot
Match: W4FVS7_9STRA (Non-specific serine/threonine protein kinase n=3 Tax=Aphanomyces astaci TaxID=112090 RepID=W4FVS7_9STRA)

HSP 1 Score: 127 bits (318), Expect = 1.980e-30
Identity = 69/121 (57.02%), Postives = 83/121 (68.60%), Query Frame = 1

Query:  301 ASLKRRRWYLGIQSKKDPVHVMNEVVRALRDGSFEWQALGPYRLRCRVVDA----------HR-VKVGLQLYRVQRGIYLLDLQKLAGDSFSFMNMCARIITELKVKVPTTAHGVAPAPAA 630
            A  KRRRWYLGIQSKK+P HVM+EV +AL    FEW+ L PYR++CR   A          H+ VK+GLQLY+VQ+ IYLLD Q L GD+F++MN+CARIITELK     T  GV P  AA
Sbjct:  426 AEKKRRRWYLGIQSKKEPAHVMSEVYKALLVLHFEWKVLAPYRVKCRWQPAPPPPSCSTSVHKPVKIGLQLYKVQQHIYLLDFQNLGGDAFTYMNLCARIITELK-----TLSGVRPTAAA 541

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BLAST of mRNA_S-firma_F_contig10295.434.1 vs. uniprot
Match: F0W7F9_9STRA (Non-specific serine/threonine protein kinase n=2 Tax=Albugo laibachii Nc14 TaxID=890382 RepID=F0W7F9_9STRA)

HSP 1 Score: 126 bits (317), Expect = 4.870e-30
Identity = 59/106 (55.66%), Postives = 79/106 (74.53%), Query Frame = 1

Query:  304 SLKRRRWYLGIQSKKDPVHVMNEVVRALRDGSFEWQALGPYRLRCR-------------VVDAHRVKVGLQLYRVQRGIYLLDLQKLAGDSFSFMNMCARIITELK 582
            ++KRRRWYLGIQSKK+P HVM+EV +AL    F+W+A  PYR++CR              ++  R+K+GLQLY+VQ+ IYLLD QKL G++F++MN+CARIITELK
Sbjct:  323 AVKRRRWYLGIQSKKEPAHVMSEVYKALHVLHFDWKAAAPYRVKCRWQAPKTSNLYHNKTLNGSRIKIGLQLYKVQQHIYLLDFQKLEGNAFTYMNLCARIITELK 428

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BLAST of mRNA_S-firma_F_contig10295.434.1 vs. uniprot
Match: A0A024GKN6_9STRA (Non-specific serine/threonine protein kinase n=1 Tax=Albugo candida TaxID=65357 RepID=A0A024GKN6_9STRA)

HSP 1 Score: 125 bits (314), Expect = 1.290e-29
Identity = 59/104 (56.73%), Postives = 77/104 (74.04%), Query Frame = 1

Query:  310 KRRRWYLGIQSKKDPVHVMNEVVRALRDGSFEWQALGPYRLRCR-------------VVDAHRVKVGLQLYRVQRGIYLLDLQKLAGDSFSFMNMCARIITELK 582
            KRRRWYLGIQSKK+P HVM+EV +AL    F+W+A  PYR++CR              ++  R+K+GLQLY+VQ+ IYLLD QKL G++F++MN+CARIITELK
Sbjct:  405 KRRRWYLGIQSKKEPAHVMSEVYKALHVLHFDWKAAAPYRVKCRWQAPKTSNLYHNKTLNGSRIKIGLQLYKVQQHIYLLDFQKLEGNAFTYMNLCARIITELK 508

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BLAST of mRNA_S-firma_F_contig10295.434.1 vs. uniprot
Match: A0A2P4X1Y6_9STRA (Non-specific serine/threonine protein kinase n=1 Tax=Phytophthora palmivora var. palmivora TaxID=611791 RepID=A0A2P4X1Y6_9STRA)

HSP 1 Score: 117 bits (292), Expect = 1.760e-29
Identity = 59/120 (49.17%), Postives = 77/120 (64.17%), Query Frame = 1

Query:  295 AGASLKRRRWYLGIQSKKDPVHVMNEVVRALRDGSFEWQALGPYRLRCR------------------------VVDAHRVKVGLQLYRVQRGIYLLDLQKLAGDSFSFMNMCARIITELK 582
            A  + KRRRWYLGIQSKK+P HVM+EV +AL    FEW+ + PYR++CR                             R+K+GLQLY+VQ+ IYLLD Q+L G++F++MN+CARIITELK
Sbjct:   19 AAPTPKRRRWYLGIQSKKEPAHVMSEVYKALFVLHFEWKVVAPYRVKCRWQSPAGDPNNLNGGAMMSSDEAKLQQQMQRIKIGLQLYKVQQHIYLLDFQRLDGNAFTYMNLCARIITELK 138

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BLAST of mRNA_S-firma_F_contig10295.434.1 vs. uniprot
Match: A0A024TAC9_9STRA (Non-specific serine/threonine protein kinase n=3 Tax=Aphanomyces invadans TaxID=157072 RepID=A0A024TAC9_9STRA)

HSP 1 Score: 123 bits (308), Expect = 4.340e-29
Identity = 60/106 (56.60%), Postives = 75/106 (70.75%), Query Frame = 1

Query:  301 ASLKRRRWYLGIQSKKDPVHVMNEVVRALRDGSFEWQALGPYRLRCR------------VVDAHRVKVGLQLYRVQRGIYLLDLQKLAGDSFSFMNMCARIITELK 582
            A  KRRRWYLGIQSKK+P HVM+EV +AL    FEW+ L PYR++CR               A  +K+GLQLY+VQ+ IYLLD + L GD+F++MN+CARIITELK
Sbjct:  412 AEKKRRRWYLGIQSKKEPAHVMSEVYKALLVLHFEWKVLAPYRVKCRWQPPLAFAPSTGPSHAKPIKIGLQLYKVQQHIYLLDFENLGGDAFTYMNLCARIITELK 517

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BLAST of mRNA_S-firma_F_contig10295.434.1 vs. uniprot
Match: A0A2D4BLB2_PYTIN (Non-specific serine/threonine protein kinase n=1 Tax=Pythium insidiosum TaxID=114742 RepID=A0A2D4BLB2_PYTIN)

HSP 1 Score: 122 bits (305), Expect = 5.520e-29
Identity = 92/240 (38.33%), Postives = 123/240 (51.25%), Query Frame = 1

Query:    7 RNHHELSVLYELMVDDKRRATRSAEMRAIRQAAGAETPPTWAPP---AAAMPGTG----AGAXXXXXXXXXXXXXXXXXAPPVSLPIPAVGYGYGSS---SFGSTP-----AGASL---KRRRWYLGIQSKKDPVHVMNEVVRALRDGSFEWQALGPYRLRCRVVD----------------AHRVKVGLQLYRVQRGIYLLDLQKLAGDSFSFMNMCARIITELKVKVPTTAHGVAPAP 624
            R +H + V YEL++D K    R  E+R +R A     P T++ P      +PG G    A +                   P+       G GY  S   S G  P     +GA L   KRRRWYLGIQSKK+P HVM+EV +AL    F+W+ + PYR++CR                   +  VK+GLQLY+VQ+ IYLLD Q+L G++F++MN+CARIITELK     T  G+ P P
Sbjct:  176 RENHPVRVAYELILDHKNAKIRVDELRDVRLAP--SQPKTFSTPEPNTLLLPGRGPIPMAASPLITPSGSDPRQFGGRHPFPMQQRPGFPGGGYDPSNPLSTGMAPNVAAASGADLPAQKRRRWYLGIQSKKEPAHVMSEVYKALHVLHFDWKVVAPYRVKCRWQSKPQNQQXXXXXXXSSGSQAVKIGLQLYKVQQHIYLLDFQRLDGNAFTYMNLCARIITELK-----TLSGLRPVP 408

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BLAST of mRNA_S-firma_F_contig10295.434.1 vs. uniprot
Match: A0A6G0WDC3_9STRA (Non-specific serine/threonine protein kinase n=2 Tax=Aphanomyces TaxID=100860 RepID=A0A6G0WDC3_9STRA)

HSP 1 Score: 122 bits (307), Expect = 6.240e-29
Identity = 62/113 (54.87%), Postives = 80/113 (70.80%), Query Frame = 1

Query:  301 ASLKRRRWYLGIQSKKDPVHVMNEVVRALRDGSFEWQALGPYRLRCRVVDAH-------RVKVGLQLYRVQRGIYLLDLQKLAGDSFSFMNMCARIITELKVKVPTTAHGVAP 618
            A  KRRRWYLGIQSKK+P HVM+EV +AL    FEW+ + PYR++CR  +          +K+GLQLY+ Q+ IY+LD QKL+GD+F++MN+CARIITELK     T  GV P
Sbjct:  412 AEKKRRRWYLGIQSKKEPGHVMSEVYKALFVLHFEWKVIAPYRVKCRWQNQSPDESTLKNIKIGLQLYKYQQHIYVLDFQKLSGDAFTYMNLCARIITELK-----TLSGVRP 519

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of mRNA_S-firma_F_contig10295.434.1 vs. uniprot

BLAST of mRNA_S-firma_F_contig10295.434.1 vs. uniprot
Analysis Date: 2022-09-19 (Diamond blastx: OGS1.0 of Sphaerotrichia firma female vs UniRef90)
Total hits: 25


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A418B8S4_9STRA	1.590e-32	57.01	Non-specific serine/threonine protein kinase n=1 T...	[more]
A0A067CJL6_SAPPC	1.940e-32	57.38	Non-specific serine/threonine protein kinase n=3 T...	[more]
A0A425D9J8_9STRA	8.800e-32	57.02	Non-specific serine/threonine protein kinase n=11 ...	[more]
W4FVS7_9STRA	1.980e-30	57.02	Non-specific serine/threonine protein kinase n=3 T...	[more]
F0W7F9_9STRA	4.870e-30	55.66	Non-specific serine/threonine protein kinase n=2 T...	[more]
A0A024GKN6_9STRA	1.290e-29	56.73	Non-specific serine/threonine protein kinase n=1 T...	[more]
A0A2P4X1Y6_9STRA	1.760e-29	49.17	Non-specific serine/threonine protein kinase n=1 T...	[more]
A0A024TAC9_9STRA	4.340e-29	56.60	Non-specific serine/threonine protein kinase n=3 T...	[more]
A0A2D4BLB2_PYTIN	5.520e-29	38.33	Non-specific serine/threonine protein kinase n=1 T...	[more]
A0A6G0WDC3_9STRA	6.240e-29	54.87	Non-specific serine/threonine protein kinase n=2 T...	[more]

Pages

Alignments

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
S-firma_F_contig10295	contig	S-firma_F_contig10295:287..969 +

Analyses

This mRNA is derived from or has results from the following analyses


Analysis Name	Date Performed
Diamond blastx: OGS1.0 of Sphaerotrichia firma female vs UniRef90	2022-09-19
OGS1.0 of Sphaerotrichia firma ET2_F female	2021-02-24

Properties


Property Name	Value
Seed ortholog	112098.XP_008607940.1
Preferred name	PRKAA1
PFAMs	AdenylateSensor,KA1,Pkinase,UBA,UBA_2
Max annot lvl	2759\|Eukaryota
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:0042556,GO:0042557,GO:0042592,GO:0042593,GO:0042594,GO:0042595,GO:0042710,GO:0042752,GO:0042770,GO:0042981,GO:0042995,GO:0043005,GO:0043025,GO:0043066,GO:0043067,GO:0043069,GO:0043085,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043233,GO:0043255,GO:0043279,GO:0043405,GO:0043406,GO:0043408,GO:0043410,GO:0043412,GO:0043436,GO:0043467,GO:0043470,GO:0043549,GO:0043562,GO:0043900,GO:0043933,GO:0044010,GO:0044057,GO:0044058,GO:0044085,GO:0044087,GO:0044093,GO:0044182,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044275,GO:0044281,GO:0044297,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044428,GO:0044430,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044451,GO:0044459,GO:0044463,GO:0044464,GO:0044764,GO:0044770,GO:0044772,GO:0044773,GO:0044774,GO:0044783,GO:0044819,GO:0044839,GO:0044843,GO:0045137,GO:0045177,GO:0045178,GO:0045197,GO:0045229,GO:0045471,GO:0045540,GO:0045542,GO:0045595,GO:0045597,GO:0045664,GO:0045666,GO:0045722,GO:0045786,GO:0045787,GO:0045792,GO:0045821,GO:0045833,GO:0045834,GO:0045844,GO:0045859,GO:0045860,GO:0045893,GO:0045913,GO:0045923,GO:0045927,GO:0045930,GO:0045935,GO:0045937,GO:0045940,GO:0045981,GO:0046015,GO:0046034,GO:0046317,GO:0046318,GO:0046320,GO:0046321,GO:0046324,GO:0046325,GO:0046326,GO:0046352,GO:0046390,GO:0046483,GO:0046677,GO:0046777,GO:0046822,GO:0046824,GO:0046825,GO:0046827,GO:0046889,GO:0046890,GO:0046956,GO:0048364,GO:0048366,GO:0048367,GO:0048468,GO:0048513,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0048580,GO:0048582,GO:0048583,GO:0048584,GO:0048585,GO:0048608,GO:0048634,GO:0048636,GO:0048641,GO:0048643,GO:0048666,GO:0048667,GO:0048699,GO:0048731,GO:0048812,GO:0048813,GO:0048827,GO:0048856,GO:0048858,GO:0048869,GO:0048871,GO:0048878,GO:0050708,GO:0050709,GO:0050714,GO:0050767,GO:0050769,GO:0050770,GO:0050772,GO:0050789,GO:0050790,GO:0050793,GO:0050794,GO:0050801,GO:0050810,GO:0050896,GO:0050920,GO:0050921,GO:0050994,GO:0050995,GO:0051020,GO:0051046,GO:0051047,GO:0051048,GO:0051049,GO:0051050,GO:0051051,GO:0051055,GO:0051094,GO:0051128,GO:0051130,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051173,GO:0051174,GO:0051179,GO:0051193,GO:0051194,GO:0051196,GO:0051197,GO:0051222,GO:0051223,GO:0051224,GO:0051235,GO:0051239,GO:0051240,GO:0051246,GO:0051247,GO:0051248,GO:0051252,GO:0051254,GO:0051259,GO:0051270,GO:0051272,GO:0051276,GO:0051291,GO:0051298,GO:0051321,GO:0051338,GO:0051347,GO:0051493,GO:0051592,GO:0051606,GO:0051704,GO:0051716,GO:0051726,GO:0051960,GO:0051962,GO:0052128,GO:0055081,GO:0055082,GO:0055086,GO:0055088,GO:0055089,GO:0055114,GO:0060090,GO:0060176,GO:0060249,GO:0060255,GO:0060284,GO:0060341,GO:0060548,GO:0060627,GO:0060968,GO:0061062,GO:0061063,GO:0061065,GO:0061066,GO:0061245,GO:0061458,GO:0061695,GO:0061744,GO:0061762,GO:0061919,GO:0062012,GO:0062013,GO:0065003,GO:0065007,GO:0065008,GO:0065009,GO:0070013,GO:0070050,GO:0070201,GO:0070301,GO:0070482,GO:0070507,GO:0070542,GO:0070726,GO:0070783,GO:0070887,GO:0070925,GO:0071156,GO:0071158,GO:0071215,GO:0071229,GO:0071236,GO:0071241,GO:0071248,GO:0071277,GO:0071310,GO:0071322,GO:0071326,GO:0071331,GO:0071333,GO:0071361,GO:0071379,GO:0071380,GO:0071396,GO:0071398,GO:0071417,GO:0071453,GO:0071456,GO:0071495,GO:0071496,GO:0071554,GO:0071555,GO:0071704,GO:0071731,GO:0071732,GO:0071840,GO:0071852,GO:0071900,GO:0071902,GO:0071940,GO:0071944,GO:0072331,GO:0072395,GO:0072401,GO:0072413,GO:0072422,GO:0072431,GO:0072521,GO:0072522,GO:0080022,GO:0080090,GO:0080134,GO:0080135,GO:0090033,GO:0090043,GO:0090066,GO:0090068,GO:0090087,GO:0090153,GO:0090155,GO:0090181,GO:0090205,GO:0090304,GO:0090311,GO:0090316,GO:0090407,GO:0090604,GO:0090606,GO:0090693,GO:0097009,GO:0097124,GO:0097159,GO:0097237,GO:0097305,GO:0097306,GO:0097327,GO:0097366,GO:0097367,GO:0097447,GO:0097458,GO:0097472,GO:0097574,GO:0097708,GO:0098534,GO:0098590,GO:0098772,GO:0099004,GO:0099402,GO:0106118,GO:0106120,GO:0120025,GO:0120035,GO:0120036,GO:0120038,GO:0120039,GO:0140030,GO:0140096,GO:1900060,GO:1900076,GO:1900077,GO:1900371,GO:1900373,GO:1900428,GO:1900430,GO:1900434,GO:1900436,GO:1900542,GO:1900544,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901261,GO:1901265,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901563,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901575,GO:1901576,GO:1901654,GO:1901655,GO:1901698,GO:1901699,GO:1901700,GO:1901701,GO:1901796,GO:1901861,GO:1901863,GO:1901983,GO:1901985,GO:1901987,GO:1901988,GO:1901990,GO:1901991,GO:1902170,GO:1902400,GO:1902402,GO:1902403,GO:1902494,GO:1902531,GO:1902532,GO:1902533,GO:1902554,GO:1902667,GO:1902669,GO:1902680,GO:1902749,GO:1902806,GO:1902807,GO:1902911,GO:1902930,GO:1902932,GO:1903047,GO:1903108,GO:1903109,GO:1903214,GO:1903432,GO:1903506,GO:1903508,GO:1903530,GO:1903531,GO:1903532,GO:1903533,GO:1903578,GO:1903580,GO:1903664,GO:1903665,GO:1903747,GO:1903749,GO:1903827,GO:1903829,GO:1903955,GO:1904262,GO:1904428,GO:1904950,GO:1904951,GO:1905038,GO:1990234,GO:1990794,GO:1990904,GO:2000026,GO:2000045,GO:2000112,GO:2000113,GO:2000134,GO:2000241,GO:2000303,GO:2000756,GO:2000758,GO:2000765,GO:2000766,GO:2001141,GO:2001169,GO:2001171,GO:2001273,GO:2001274
Evalue	5.81e-33
EggNOG OGs	KOG0583@1\|root,KOG0583@2759\|Eukaryota
Ec32 ortholog description	SNF1-related protein kinase
Ec32 ortholog	Ec-01_011080.3
EC	2.7.11.1,2.7.11.11
Description	protein serine/threonine kinase activity
COG category	G
BRITE	ko00000,ko00001,ko01000,ko01001,ko02000,ko03029,ko04131
Hectar predicted targeting category	other localisation
Exons	2
Model size	630
Cds size	630
Stop	0
Start	1

Relationships

The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
1622815559.9493737-CDS-S-firma_F_contig10295:286..688	1622815559.9493737-CDS-S-firma_F_contig10295:286..688	Sphaerotrichia firma ET2_F female	CDS	S-firma_F_contig10295 287..688 +
1696949415.7023969-CDS-S-firma_F_contig10295:286..688	1696949415.7023969-CDS-S-firma_F_contig10295:286..688	Sphaerotrichia firma ET2_F female	CDS	S-firma_F_contig10295 287..688 +
1622815559.9622383-CDS-S-firma_F_contig10295:741..969	1622815559.9622383-CDS-S-firma_F_contig10295:741..969	Sphaerotrichia firma ET2_F female	CDS	S-firma_F_contig10295 742..969 +
1696949415.7159836-CDS-S-firma_F_contig10295:741..969	1696949415.7159836-CDS-S-firma_F_contig10295:741..969	Sphaerotrichia firma ET2_F female	CDS	S-firma_F_contig10295 742..969 +

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
mRNA_S-firma_F_contig10295.434.1	prot_S-firma_F_contig10295.434.1	Sphaerotrichia firma ET2_F female	polypeptide	S-firma_F_contig10295 287..969 +

Sequences

The following sequences are available for this feature:

protein sequence
mRNA from alignment at S-firma_F_contig10295:287..969+
coding sequence from alignment at S-firma_F_contig10295:287..969+

protein sequence of mRNA_S-firma_F_contig10295.434.1

>prot_S-firma_F_contig10295.434.1 ID=prot_S-firma_F_contig10295.434.1|Name=mRNA_S-firma_F_contig10295.434.1|organism=Sphaerotrichia firma ET2_F female|type=polypeptide|length=210bp
MHRNHHELSVLYELMVDDKRRATRSAEMRAIRQAAGAETPPTWAPPAAAM
PGTGAGAPNGMTPFLAALPLTPSAAPPVSLPIPAVGYGYGSSSFGSTPAG
ASLKRRRWYLGIQSKKDPVHVMNEVVRALRDGSFEWQALGPYRLRCRVVD
AHRVKVGLQLYRVQRGIYLLDLQKLAGDSFSFMNMCARIITELKVKVPTT
AHGVAPAPAA

mRNA from alignment at S-firma_F_contig10295:287..969+

Legend: CDSpolypeptide

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>mRNA_S-firma_F_contig10295.434.1 ID=mRNA_S-firma_F_contig10295.434.1|Name=mRNA_S-firma_F_contig10295.434.1|organism=Sphaerotrichia firma ET2_F female|type=mRNA|length=683bp|location=Sequence derived from alignment at S-firma_F_contig10295:287..969+ (Sphaerotrichia firma ET2_F female)
ATGCACCGCAACCACCACGAGCTGTCCGTCCTGTACGAGCTCATGGTGGA
CGACAAACGCCGTGCCACACGGTCTGCGGAGATGCGGGCCATTCGGCAGG
CGGCGGGCGCGGAGACGCCACCAACGTGGGCGCCACCTGCGGCTGCCATG
CCGGGCACCGGCGCCGGAGCCCCCAACGGCATGACACCTTTCCTGGCGGC
ATTGCCCTTGACGCCCTCTGCGGCGCCGCCCGTGTCCCTGCCCATCCCCG
CCGTCGGTTACGGGTATGGCAGCAGCAGCTTTGGTAGCACGCCTGCGGGC
GCCAGCCTGAAGCGCCGCCGGTGGTACCTTGGTATCCAGTCCAAGAAGGA
CCCCGTGCACGTCATGAACGAGGTTGTACGCGCGTTACGGGACGGCAGCT
TTGTACGTGCGGGAGCGTCCCCCCCCCCCCTCGTCACCACCCCCGCTTCC
CACAGGAATGGCAAGCGCTGGGCCCGTACCGGCTCCGCTGTCGTGTGGTT
GACGCCCACCGCGTCAAGGTTGGCTTGCAGCTGTACCGCGTCCAGCGCGG
CATTTACTTGCTGGACCTCCAAAAGCTGGCTGGAGACTCGTTTTCATTCA
TGAACATGTGCGCCCGCATCATCACGGAGCTCAAGGTGAAAGTACCCACC
ACCGCACACGGCGTGGCCCCGGCACCAGCCGCC

Coding sequence (CDS) from alignment at S-firma_F_contig10295:287..969+

>mRNA_S-firma_F_contig10295.434.1 ID=mRNA_S-firma_F_contig10295.434.1|Name=mRNA_S-firma_F_contig10295.434.1|organism=Sphaerotrichia firma ET2_F female|type=CDS|length=1260bp|location=Sequence derived from alignment at S-firma_F_contig10295:287..969+ (Sphaerotrichia firma ET2_F female)
ATGCACCGCAACCACCACGAGCTGTCCGTCCTGTACGAGCTCATGGTGGA
CGACAAACGCCGTGCCACACGGTCTGCGGAGATGCGGGCCATTCGGCAGG
CGGCGGGCGCGGAGACGCCACCAACGTGGGCGCCACCTGCGGCTGCCATG
CCGGGCACCGGCGCCGGAGCCCCCAACGGCATGACACCTTTCCTGGCGGC
ATTGCCCTTGACGCCCTCTGCGGCGCCGCCCGTGTCCCTGCCCATCCCCG
CCGTCGGTTACGGGTATGGCAGCAGCAGCTTTGGTAGCACGCCTGCGGGC
GCCAGCCTGAAGCGCCGCCGGTGGTACCTTGGTATCCAGTCCAAGAAGGA
CCCCGTGCACGTCATGAACGAGGTTGTACGCGCGTTACGGGACGGCAGCT
TTATGCACCGCAACCACCACGAGCTGTCCGTCCTGTACGAGCTCATGGTG
GACGACAAACGCCGTGCCACACGGTCTGCGGAGATGCGGGCCATTCGGCA
GGCGGCGGGCGCGGAGACGCCACCAACGTGGGCGCCACCTGCGGCTGCCA
TGCCGGGCACCGGCGCCGGAGCCCCCAACGGCATGACACCTTTCCTGGCG
GCATTGCCCTTGACGCCCTCTGCGGCGCCGCCCGTGTCCCTGCCCATCCC
CGCCGTCGGTTACGGGTATGGCAGCAGCAGCTTTGGTAGCACGCCTGCGG
GCGCCAGCCTGAAGCGCCGCCGGTGGTACCTTGGTATCCAGTCCAAGAAG
GACCCCGTGCACGTCATGAACGAGGTTGTACGCGCGTTACGGGACGGCAG
CTTTGAATGGCAAGCGCTGGGCCCGTACCGGCTCCGCTGTCGTGTGGTTG
ACGCCCACCGCGTCAAGGTTGGCTTGCAGCTGTACCGCGTCCAGCGCGGC
ATTTACTTGCTGGACCTCCAAAAGCTGGCTGGAGACTCGTTTTCATTCAT
GAACATGTGCGCCCGCATCATCACGGAGCTCAAGGTGAAAGTACCCACCA
CCGCACACGGCGTGGCCCCGGCACCAGCCGCCGAATGGCAAGCGCTGGGC
CCGTACCGGCTCCGCTGTCGTGTGGTTGACGCCCACCGCGTCAAGGTTGG
CTTGCAGCTGTACCGCGTCCAGCGCGGCATTTACTTGCTGGACCTCCAAA
AGCTGGCTGGAGACTCGTTTTCATTCATGAACATGTGCGCCCGCATCATC
ACGGAGCTCAAGGTGAAAGTACCCACCACCGCACACGGCGTGGCCCCGGC
ACCAGCCGCC