mRNA_P-wetherbeei_contig6554.1.1 (mRNA) Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79

You are viewing an mRNA, more information available on the corresponding polypeptide page

Overview


Name	mRNA_P-wetherbeei_contig6554.1.1
Unique Name	mRNA_P-wetherbeei_contig6554.1.1
Type	mRNA
Organism	Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79 (Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79)

Homology

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of mRNA_P-wetherbeei_contig6554.1.1 vs. uniprot

BLAST of mRNA_P-wetherbeei_contig6554.1.1 vs. uniprot
Analysis Date: 2022-09-19 (Diamond blastx: OGS1.0 vs UniRef90)
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

Alignments

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
P-wetherbeei_contig6554	contig	P-wetherbeei_contig6554:99..2629 +

Analyses

This mRNA is derived from or has results from the following analyses


Analysis Name	Date Performed
Diamond blastx: OGS1.0 vs UniRef90	2022-09-19
Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79 OGS1.0	2022-07-08

Properties


Property Name	Value
Stop	1
Start	1
Seed ortholog	8364.ENSXETP00000001676
Preferred name	NOTCH1
PFAMs	Ank,Ank_2,Ank_5,DUF3454,EGF,EGF_CA,NOD,NODP,Notch,hEGF
Model size	2423
Max annot lvl	33208\|Metazoa
KEGG ko	ko:K02599,ko:K20994,ko:K20995
KEGG Pathway	ko01522,ko04320,ko04330,ko04371,ko04658,ko04919,ko05020,ko05165,ko05200,ko05206,ko05224,map01522,map04320,map04330,map04371,map04658,map04919,map05020,map05165,map05200,map05206,map05224
KEGG Module	M00682
Hectar predicted targeting category	other localisation
GOs	GO:0000003,GO:0000122,GO:0000139,GO:0000278,GO:0000578,GO:0000902,GO:0000904,GO:0000976,GO:0000977,GO:0000978,GO:0000987,GO:0000988,GO:0000989,GO:0001012,GO:0001067,GO:0001076,GO:0001190,GO:0001503,GO:0001525,GO:0001568,GO:0001570,GO:0001649,GO:0001654,GO:0001655,GO:0001666,GO:0001667,GO:0001669,GO:0001700,GO:0001701,GO:0001708,GO:0001709,GO:0001726,GO:0001736,GO:0001738,GO:0001745,GO:0001751,GO:0001752,GO:0001754,GO:0001756,GO:0001763,GO:0001816,GO:0001822,GO:0001837,GO:0001840,GO:0001889,GO:0001894,GO:0001932,GO:0001933,GO:0001934,GO:0001942,GO:0001944,GO:0001947,GO:0002009,GO:0002011,GO:0002040,GO:0002051,GO:0002052,GO:0002064,GO:0002065,GO:0002066,GO:0002067,GO:0002085,GO:0002164,GO:0002165,GO:0002193,GO:0002213,GO:0002237,GO:0002244,GO:0002376,GO:0002437,GO:0002520,GO:0002682,GO:0002683,GO:0002684,GO:0002790,GO:0003002,GO:0003006,GO:0003007,GO:0003008,GO:0003143,GO:0003151,GO:0003156,GO:0003157,GO:0003158,GO:0003160,GO:0003161,GO:0003162,GO:0003169,GO:0003170,GO:0003171,GO:0003174,GO:0003176,GO:0003177,GO:0003178,GO:0003179,GO:0003180,GO:0003181,GO:0003182,GO:0003183,GO:0003184,GO:0003188,GO:0003190,GO:0003192,GO:0003197,GO:0003198,GO:0003203,GO:0003205,GO:0003206,GO:0003207,GO:0003208,GO:0003209,GO:0003211,GO:0003213,GO:0003214,GO:0003215,GO:0003219,GO:0003222,GO:0003229,GO:0003230,GO:0003231,GO:0003241,GO:0003250,GO:0003252,GO:0003256,GO:0003264,GO:0003266,GO:0003270,GO:0003272,GO:0003273,GO:0003279,GO:0003281,GO:0003330,GO:0003332,GO:0003344,GO:0003348,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003682,GO:0003690,GO:0003700,GO:0004857,GO:0004888,GO:0005102,GO:0005112,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005576,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005737,GO:0005768,GO:0005770,GO:0005783,GO:0005789,GO:0005794,GO:0005796,GO:0005829,GO:0005856,GO:0005886,GO:0005887,GO:0005911,GO:0005912,GO:0006109,GO:0006110,GO:0006139,GO:0006140,GO:0006351,GO:0006352,GO:0006355,GO:0006357,GO:0006366,GO:0006367,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006810,GO:0006915,GO:0006928,GO:0006935,GO:0006950,GO:0006952,GO:0006954,GO:0006955,GO:0006959,GO:0006996,GO:0007010,GO:0007015,GO:0007049,GO:0007050,GO:0007154,GO:0007155,GO:0007157,GO:0007162,GO:0007163,GO:0007164,GO:0007165,GO:0007166,GO:0007219,GO:0007221,GO:0007267,GO:0007275,GO:0007276,GO:0007281,GO:0007283,GO:0007292,GO:0007293,GO:0007297,GO:0007298,GO:0007304,GO:0007306,GO:0007308,GO:0007309,GO:0007314,GO:0007346,GO:0007350,GO:0007351,GO:0007368,GO:0007386,GO:0007389,GO:0007391,GO:0007398,GO:0007399,GO:0007400,GO:0007403,GO:0007405,GO:0007409,GO:0007411,GO:0007417,GO:0007419,GO:0007420,GO:0007422,GO:0007423,GO:0007424,GO:0007440,GO:0007442,GO:0007443,GO:0007444,GO:0007446,GO:0007447,GO:0007449,GO:0007450,GO:0007451,GO:0007455,GO:0007460,GO:0007464,GO:0007472,GO:0007473,GO:0007474,GO:0007476,GO:0007478,GO:0007480,GO:0007483,GO:0007484,GO:0007485,GO:0007492,GO:0007498,GO:0007507,GO:0007517,GO:0007519,GO:0007521,GO:0007548,GO:0007552,GO:0007560,GO:0007568,GO:0007610,GO:0007611,GO:0007613,GO:0007616,GO:0008045,GO:0008052,GO:0008104,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008219,GO:0008283,GO:0008284,GO:0008285,GO:0008340,GO:0008347,GO:0008356,GO:0008358,GO:0008407,GO:0008544,GO:0008587,GO:0008593,GO:0008595,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009306,GO:0009605,GO:0009607,GO:0009608,GO:0009611,GO:0009617,GO:0009628,GO:0009653,GO:0009719,GO:0009725,GO:0009790,GO:0009791,GO:0009792,GO:0009798,GO:0009799,GO:0009855,GO:0009880,GO:0009886,GO:0009887,GO:0009888,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009891,GO:0009892,GO:0009893,GO:0009894,GO:0009912,GO:0009913,GO:0009948,GO:0009950,GO:0009952,GO:0009953,GO:0009954,GO:0009966,GO:0009967,GO:0009968,GO:0009986,GO:0009987,GO:0009994,GO:0009996,GO:0010001,GO:0010002,GO:0010033,GO:0010160,GO:0010243,GO:0010259,GO:0010453,GO:0010454,GO:0010455,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010470,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010558,GO:0010562,GO:0010563,GO:0010564,GO:0010594,GO:0010596,GO:0010604,GO:0010605,GO:0010611,GO:0010614,GO:0010623,GO:0010628,GO:0010629,GO:0010631,GO:0010632,GO:0010633,GO:0010646,GO:0010647,GO:0010648,GO:0010717,GO:0010718,GO:0010720,GO:0010721,GO:0010810,GO:0010812,GO:0010830,GO:0010832,GO:0010927,GO:0010941,GO:0010942,GO:0012501,GO:0012505,GO:0014013,GO:0014014,GO:0014015,GO:0014016,GO:0014017,GO:0014019,GO:0014031,GO:0014070,GO:0014706,GO:0014741,GO:0014743,GO:0014807,GO:0014855,GO:0015031,GO:0015833,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016043,GO:0016070,GO:0016202,GO:0016324,GO:0016330,GO:0016331,GO:0016333,GO:0016348,GO:0016360,GO:0016477,GO:0016525,GO:0017145,GO:0017157,GO:0017158,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019220,GO:0019222,GO:0019438,GO:0019827,GO:0019899,GO:0019953,GO:0021510,GO:0021514,GO:0021515,GO:0021517,GO:0021522,GO:0021523,GO:0021531,GO:0021536,GO:0021538,GO:0021700,GO:0021781,GO:0021915,GO:0021953,GO:0021986,GO:0022008,GO:0022402,GO:0022404,GO:0022405,GO:0022407,GO:0022408,GO:0022412,GO:0022414,GO:0022416,GO:0022603,GO:0022607,GO:0022610,GO:0022612,GO:0023051,GO:0023052,GO:0023056,GO:0023057,GO:0030027,GO:0030029,GO:0030030,GO:0030031,GO:0030036,GO:0030054,GO:0030097,GO:0030100,GO:0030111,GO:0030139,GO:0030141,GO:0030154,GO:0030155,GO:0030178,GO:0030182,GO:0030216,GO:0030234,GO:0030278,GO:0030279,GO:0030323,GO:0030324,GO:0030326,GO:0030334,GO:0030335,GO:0030336,GO:0030510,GO:0030513,GO:0030514,GO:0030539,GO:0030703,GO:0030707,GO:0030708,GO:0030713,GO:0030718,GO:0030720,GO:0030808,GO:0030811,GO:0030850,GO:0030855,GO:0030856,GO:0030857,GO:0030858,GO:0030900,GO:0031016,GO:0031017,GO:0031069,GO:0031090,GO:0031099,GO:0031100,GO:0031175,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031252,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031328,GO:0031329,GO:0031344,GO:0031399,GO:0031400,GO:0031401,GO:0031410,GO:0031490,GO:0031960,GO:0031974,GO:0031981,GO:0031982,GO:0031984,GO:0032101,GO:0032102,GO:0032268,GO:0032269,GO:0032270,GO:0032354,GO:0032495,GO:0032496,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032504,GO:0032633,GO:0032774,GO:0032835,GO:0032870,GO:0032872,GO:0032873,GO:0032879,GO:0032940,GO:0032989,GO:0032990,GO:0032991,GO:0033002,GO:0033036,GO:0033554,GO:0033993,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0034698,GO:0035003,GO:0035050,GO:0035051,GO:0035107,GO:0035108,GO:0035112,GO:0035113,GO:0035114,GO:0035116,GO:0035120,GO:0035126,GO:0035137,GO:0035148,GO:0035153,GO:0035155,GO:0035157,GO:0035161,GO:0035162,GO:0035163,GO:0035165,GO:0035166,GO:0035167,GO:0035168,GO:0035170,GO:0035171,GO:0035172,GO:0035203,GO:0035204,GO:0035214,GO:0035215,GO:0035218,GO:0035220,GO:0035222,GO:0035239,GO:0035265,GO:0035272,GO:0035282,GO:0035285,GO:0035295,GO:0035315,GO:0035850,GO:0035886,GO:0035904,GO:0035907,GO:0035914,GO:0035924,GO:0036003,GO:0036011,GO:0036099,GO:0036293,GO:0036294,GO:0036335,GO:0038023,GO:0040007,GO:0040008,GO:0040009,GO:0040011,GO:0040012,GO:0040013,GO:0040017,GO:0040019,GO:0040034,GO:0042051,GO:0042060,GO:0042063,GO:0042067,GO:0042127,GO:0042175,GO:0042221,GO:0042246,GO:0042303,GO:0042325,GO:0042326,GO:0042327,GO:0042330,GO:0042386,GO:0042387,GO:0042461,GO:0042462,GO:0042478,GO:0042480,GO:0042490,GO:0042491,GO:0042493,GO:0042592,GO:0042633,GO:0042659,GO:0042660,GO:0042661,GO:0042663,GO:0042675,GO:0042676,GO:0042686,GO:0042688,GO:0042689,GO:0042691,GO:0042692,GO:0042693,GO:0042706,GO:0042733,GO:0042886,GO:0042981,GO:0042995,GO:0043009,GO:0043065,GO:0043066,GO:0043067,GO:0043068,GO:0043069,GO:0043086,GO:0043170,GO:0043207,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043233,GO:0043235,GO:0043296,GO:0043408,GO:0043409,GO:0043410,GO:0043467,GO:0043470,GO:0043502,GO:0043523,GO:0043525,GO:0043535,GO:0043537,GO:0043565,GO:0043583,GO:0043588,GO:0043618,GO:0043620,GO:0043696,GO:0043697,GO:0043900,GO:0043902,GO:0043903,GO:0044057,GO:0044085,GO:0044087,GO:0044092,GO:0044212,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044428,GO:0044431,GO:0044432,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044459,GO:0044464,GO:0044703,GO:0044782,GO:0045069,GO:0045070,GO:0045165,GO:0045168,GO:0045177,GO:0045184,GO:0045314,GO:0045316,GO:0045445,GO:0045446,GO:0045463,GO:0045465,GO:0045466,GO:0045468,GO:0045595,GO:0045596,GO:0045597,GO:0045601,GO:0045603,GO:0045604,GO:0045605,GO:0045606,GO:0045607,GO:0045608,GO:0045610,GO:0045611,GO:0045612,GO:0045613,GO:0045614,GO:0045616,GO:0045618,GO:0045631,GO:0045632,GO:0045661,GO:0045662,GO:0045664,GO:0045665,GO:0045667,GO:0045668,GO:0045682,GO:0045683,GO:0045684,GO:0045685,GO:0045686,GO:0045687,GO:0045747,GO:0045765,GO:0045786,GO:0045787,GO:0045844,GO:0045892,GO:0045893,GO:0045920,GO:0045926,GO:0045927,GO:0045931,GO:0045934,GO:0045935,GO:0045936,GO:0045937,GO:0045944,GO:0045955,GO:0045967,GO:0045995,GO:0046328,GO:0046329,GO:0046331,GO:0046425,GO:0046427,GO:0046483,GO:0046530,GO:0046532,GO:0046533,GO:0046552,GO:0046578,GO:0046579,GO:0046620,GO:0046622,GO:0046661,GO:0046666,GO:0046667,GO:0046782,GO:0046843,GO:0046903,GO:0046982,GO:0046983,GO:0048052,GO:0048056,GO:0048103,GO:0048138,GO:0048139,GO:0048190,GO:0048232,GO:0048259,GO:0048337,GO:0048468,GO:0048469,GO:0048477,GO:0048505,GO:0048513,GO:0048514,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0048524,GO:0048534,GO:0048542,GO:0048545,GO:0048546,GO:0048562,GO:0048563,GO:0048565,GO:0048568,GO:0048569,GO:0048580,GO:0048581,GO:0048583,GO:0048584,GO:0048585,GO:0048589,GO:0048592,GO:0048598,GO:0048599,GO:0048608,GO:0048609,GO:0048619,GO:0048634,GO:0048636,GO:0048638,GO:0048639,GO:0048644,GO:0048645,GO:0048646,GO:0048663,GO:0048666,GO:0048667,GO:0048699,GO:0048707,GO:0048708,GO:0048709,GO:0048710,GO:0048711,GO:0048713,GO:0048715,GO:0048729,GO:0048730,GO:0048731,GO:0048732,GO:0048736,GO:0048737,GO:0048738,GO:0048749,GO:0048754,GO:0048762,GO:0048803,GO:0048805,GO:0048806,GO:0048808,GO:0048812,GO:0048839,GO:0048844,GO:0048845,GO:0048856,GO:0048858,GO:0048859,GO:0048863,GO:0048864,GO:0048865,GO:0048867,GO:0048869,GO:0048870,GO:0048871,GO:0048872,GO:0048873,GO:0048934,GO:0048935,GO:0048936,GO:0050434,GO:0050663,GO:0050673,GO:0050678,GO:0050679,GO:0050767,GO:0050768,GO:0050769,GO:0050789,GO:0050790,GO:0050792,GO:0050793,GO:0050794,GO:0050877,GO:0050890,GO:0050896,GO:0050920,GO:0050922,GO:0051046,GO:0051048,GO:0051049,GO:0051051,GO:0051056,GO:0051057,GO:0051093,GO:0051094,GO:0051128,GO:0051129,GO:0051145,GO:0051147,GO:0051148,GO:0051153,GO:0051154,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051173,GO:0051174,GO:0051179,GO:0051193,GO:0051196,GO:0051234,GO:0051239,GO:0051240,GO:0051241,GO:0051246,GO:0051247,GO:0051248,GO:0051252,GO:0051253,GO:0051254,GO:0051270,GO:0051271,GO:0051272,GO:0051301,GO:0051489,GO:0051674,GO:0051704,GO:0051707,GO:0051716,GO:0051726,GO:0051890,GO:0051960,GO:0051961,GO:0051962,GO:0055001,GO:0055006,GO:0055008,GO:0055010,GO:0055016,GO:0055017,GO:0055021,GO:0055023,GO:0055024,GO:0055025,GO:0055123,GO:0060019,GO:0060038,GO:0060039,GO:0060043,GO:0060045,GO:0060089,GO:0060113,GO:0060120,GO:0060173,GO:0060249,GO:0060250,GO:0060251,GO:0060253,GO:0060255,GO:0060271,GO:0060284,GO:0060288,GO:0060289,GO:0060317,GO:0060322,GO:0060379,GO:0060411,GO:0060412,GO:0060415,GO:0060419,GO:0060420,GO:0060421,GO:0060429,GO:0060485,GO:0060491,GO:0060512,GO:0060525,GO:0060528,GO:0060537,GO:0060538,GO:0060541,GO:0060548,GO:0060560,GO:0060561,GO:0060562,GO:0060563,GO:0060571,GO:0060581,GO:0060582,GO:0060627,GO:0060740,GO:0060742,GO:0060768,GO:0060828,GO:0060837,GO:0060840,GO:0060841,GO:0060842,GO:0060843,GO:0060947,GO:0060948,GO:0060956,GO:0060972,GO:0060973,GO:0060976,GO:0060977,GO:0060979,GO:0060982,GO:0061005,GO:0061008,GO:0061053,GO:0061061,GO:0061138,GO:0061311,GO:0061314,GO:0061326,GO:0061331,GO:0061333,GO:0061344,GO:0061351,GO:0061371,GO:0061382,GO:0061383,GO:0061384,GO:0061418,GO:0061419,GO:0061437,GO:0061440,GO:0061448,GO:0061458,GO:0061525,GO:0061564,GO:0062012,GO:0065007,GO:0065008,GO:0065009,GO:0070013,GO:0070161,GO:0070167,GO:0070168,GO:0070302,GO:0070303,GO:0070372,GO:0070374,GO:0070482,GO:0070848,GO:0070887,GO:0070925,GO:0070986,GO:0071310,GO:0071363,GO:0071371,GO:0071372,GO:0071453,GO:0071456,GO:0071495,GO:0071702,GO:0071704,GO:0071705,GO:0071840,GO:0071944,GO:0072001,GO:0072002,GO:0072006,GO:0072007,GO:0072008,GO:0072009,GO:0072012,GO:0072017,GO:0072044,GO:0072073,GO:0072080,GO:0072089,GO:0072091,GO:0072109,GO:0072132,GO:0072143,GO:0072144,GO:0072148,GO:0072358,GO:0072359,GO:0072602,GO:0080090,GO:0080134,GO:0080135,GO:0090049,GO:0090051,GO:0090068,GO:0090090,GO:0090092,GO:0090100,GO:0090101,GO:0090130,GO:0090132,GO:0090257,GO:0090287,GO:0090288,GO:0090304,GO:0090596,GO:0090598,GO:0097084,GO:0097150,GO:0097159,GO:0097223,GO:0097435,GO:0097485,GO:0097659,GO:0097708,GO:0098588,GO:0098590,GO:0098609,GO:0098727,GO:0098742,GO:0098772,GO:0098773,GO:0098791,GO:0098796,GO:0098797,GO:0098827,GO:0099503,GO:0120025,GO:0120031,GO:0120032,GO:0120035,GO:0120036,GO:0120039,GO:0140110,GO:1900087,GO:1900371,GO:1900542,GO:1901187,GO:1901189,GO:1901201,GO:1901213,GO:1901214,GO:1901216,GO:1901342,GO:1901343,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901522,GO:1901532,GO:1901533,GO:1901576,GO:1901652,GO:1901698,GO:1901700,GO:1901861,GO:1901863,GO:1901987,GO:1901989,GO:1901990,GO:1901992,GO:1902263,GO:1902337,GO:1902339,GO:1902531,GO:1902532,GO:1902533,GO:1902679,GO:1902680,GO:1902692,GO:1902742,GO:1902806,GO:1902808,GO:1903053,GO:1903054,GO:1903224,GO:1903305,GO:1903306,GO:1903506,GO:1903507,GO:1903508,GO:1903530,GO:1903531,GO:1903578,GO:1903670,GO:1903671,GO:1903706,GO:1903707,GO:1903847,GO:1903849,GO:1903900,GO:1903902,GO:1904018,GO:1904238,GO:1904747,GO:1904748,GO:1904892,GO:1904894,GO:1905207,GO:1905314,GO:1905456,GO:1905457,GO:1905651,GO:1905653,GO:1905770,GO:1905772,GO:1905902,GO:1905904,GO:1990837,GO:2000026,GO:2000027,GO:2000043,GO:2000045,GO:2000047,GO:2000048,GO:2000112,GO:2000113,GO:2000136,GO:2000137,GO:2000145,GO:2000146,GO:2000147,GO:2000177,GO:2000179,GO:2000181,GO:2000209,GO:2000241,GO:2000380,GO:2000382,GO:2000543,GO:2000648,GO:2000736,GO:2000737,GO:2000811,GO:2000826,GO:2000973,GO:2000974,GO:2000980,GO:2000981,GO:2001013,GO:2001026,GO:2001027,GO:2001141,GO:2001169
Exons	2
Evalue	3.46e-05
EggNOG OGs	KOG1217@1\|root,KOG1217@2759\|Eukaryota,38BUP@33154\|Opisthokonta,3BAFT@33208\|Metazoa,3CRZB@33213\|Bilateria,485Y1@7711\|Chordata,48WDE@7742\|Vertebrata
Description	neurogenic locus notch homolog protein
Cds size	2175
COG category	T
BRITE	ko00000,ko00001,ko00002

Relationships

The following UTR feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
1683186921.5442429-UTR-P-wetherbeei_contig6554:98..179	1683186921.5442429-UTR-P-wetherbeei_contig6554:98..179	Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79	UTR	P-wetherbeei_contig6554 99..179 +
1683186921.5555465-UTR-P-wetherbeei_contig6554:287..386	1683186921.5555465-UTR-P-wetherbeei_contig6554:287..386	Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79	UTR	P-wetherbeei_contig6554 288..386 +
1683186921.5724165-UTR-P-wetherbeei_contig6554:2561..2629	1683186921.5724165-UTR-P-wetherbeei_contig6554:2561..2629	Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79	UTR	P-wetherbeei_contig6554 2562..2629 +

The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
1683186921.5640576-CDS-P-wetherbeei_contig6554:386..2561	1683186921.5640576-CDS-P-wetherbeei_contig6554:386..2561	Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79	CDS	P-wetherbeei_contig6554 387..2561 +

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
mRNA_P-wetherbeei_contig6554.1.1	prot_P-wetherbeei_contig6554.1.1	Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79	polypeptide	P-wetherbeei_contig6554 387..2561 +

Sequences

The following sequences are available for this feature:

protein sequence
mRNA from alignment at P-wetherbeei_contig6554:99..2629+
coding sequence from alignment at P-wetherbeei_contig6554:99..2629+

protein sequence of mRNA_P-wetherbeei_contig6554.1.1

>prot_P-wetherbeei_contig6554.1.1 ID=prot_P-wetherbeei_contig6554.1.1|Name=mRNA_P-wetherbeei_contig6554.1.1|organism=Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79|type=polypeptide|length=725bp
MASFTSLHQFNIHDALSALEVLHTSDAVDEIVQHECFGESRPSSSLVRAL
STSPVGADQMRALVQCGHIKKEQLLAKDSFGCTALETAAGAGALGVVQYL
ITELGALAAPSLLLLAARGRTRRHWDVVRRLVNDKPGLLAQATDQTSRTT
VLHIAAALSQHDVALEVAEFLVAAGADADVADMDGETPLHASLRAGNHAL
AERLLQLGATDLDRPSRLDSATPLLLAVGQRALSVAKALVAAGAAADGPA
AATAAASAAARPAATFIIVPPPISPLCLAAALGNYAMVAYLVDGAGATVL
TRGTAAGGGGSNSESSNNGGGGGGGGGRQEESCVHAASAGGHLAMLRFLV
ERGADPAAACARGLPLQAAARNGHEDCVRWLVDCAGVSPEPPTPPAVAAG
ATTPLMAACQGGHASVVEFLLARGADVRRRDDARGWSALEWACIGPDDCF
LRCAGSLRVVRFLLEEAGAEMETGVRREREAQDGAAVAGRSNTSGVGEES
AAAAAGSPSNGDDVSGATNNNSGGGIGTAADAGGRRDGDNRQGGSALHAT
VRSAWKMPRQQTNLLRYLMSAPWVNRALTVAFPHGLIPALRRPLPLDVEA
ALRGFLMPDVRRALSIRDGAGRTPLEVALRASSSTRALFALMAAAGADTS
GLSAADAAVVARGVQEEAEAAARASAAGGAKVAVGGDVSHCSKKKPRDER
HRSEGASGEPATVKLSFLLGSRQL*

mRNA from alignment at P-wetherbeei_contig6554:99..2629+

Legend: UTRpolypeptideCDS

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>mRNA_P-wetherbeei_contig6554.1.1 ID=mRNA_P-wetherbeei_contig6554.1.1|Name=mRNA_P-wetherbeei_contig6554.1.1|organism=Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79|type=mRNA|length=2531bp|location=Sequence derived from alignment at P-wetherbeei_contig6554:99..2629+ (Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79)
CGTTGATCTTTATTTCTCGCTCCACAGAGGCCCGTCTCCCCTTCTTCTAC
CAATTCGTCGTTTGCAAGAAGGTGTTAGCCGGTGAGCGACCTTCCTTTTC
TCGGCAACTCTCCGTCTCTGTCGTTTTGTCTTTTTTCGTCTTGTTCTCTA
CAGTATACTGACTTAGCACACGCCTTCACTTCTCTGTAGGCGACTACGAT
GACAAGGAGTCAGAAATTGGACAACTGACTGGCCGTTCTTCTTTGAAGCG
CTGATAACGAGCACGGAATCACGACAACGGAGAAGGAAATGGCATCGTTC
ACTAGCTTGCATCAATTCAACATCCACGATGCCTTGAGCGCTCTGGAAGT
CTTGCACACCTCGGACGCCGTCGATGAGATCGTGCAGCACGAGTGTTTCG
GCGAAAGCCGGCCGTCCTCTTCCCTAGTGCGTGCACTCTCAACATCTCCA
GTTGGTGCGGACCAAATGCGCGCGTTGGTGCAGTGCGGCCACATCAAAAA
GGAACAGCTGCTGGCCAAAGATTCTTTCGGCTGCACGGCTCTCGAGACGG
CTGCCGGGGCCGGTGCGCTTGGCGTTGTACAGTATTTAATAACTGAGCTC
GGCGCGCTGGCAGCACCATCCCTACTCCTGCTCGCGGCACGCGGGCGGAC
ACGAAGGCATTGGGACGTCGTCCGTCGGCTCGTCAACGATAAACCAGGGC
TTCTCGCTCAGGCGACGGACCAGACCTCGAGGACGACTGTGCTCCACATC
GCTGCCGCGCTCTCACAACACGACGTTGCTTTGGAGGTGGCTGAGTTCCT
CGTGGCCGCCGGCGCCGACGCCGACGTTGCTGACATGGACGGCGAGACAC
CCCTGCACGCAAGCCTCCGCGCCGGCAACCACGCGCTGGCGGAGCGGCTG
CTGCAGCTAGGAGCGACCGACTTGGATCGCCCGAGCCGCCTCGACAGCGC
GACGCCGCTCCTGCTGGCCGTGGGGCAGCGGGCCCTCTCTGTGGCGAAAG
CGCTGGTGGCAGCGGGCGCCGCGGCCGACGGACCGGCCGCTGCCACTGCT
GCCGCGAGTGCCGCAGCAAGGCCCGCTGCCACCTTTATCATCGTCCCTCC
TCCGATCTCGCCGCTTTGTCTAGCGGCGGCCCTTGGCAACTATGCCATGG
TCGCCTATCTCGTGGATGGCGCCGGTGCCACAGTGCTAACACGGGGAACA
GCTGCCGGCGGTGGCGGCAGCAACAGCGAGAGCAGCAACAACGGCGGCGG
CGGCGGCGGCGGCGGCGGCAGGCAGGAGGAAAGCTGCGTCCACGCCGCAA
GCGCCGGCGGCCACCTCGCCATGCTGCGCTTTCTCGTGGAGCGCGGCGCC
GACCCGGCGGCTGCCTGCGCACGCGGCCTGCCCTTACAGGCCGCAGCACG
AAATGGTCATGAGGACTGCGTGCGTTGGCTGGTCGACTGTGCCGGCGTCT
CGCCCGAGCCACCGACGCCTCCAGCAGTGGCGGCGGGAGCTACGACGCCG
CTGATGGCGGCGTGCCAGGGCGGCCACGCGTCCGTCGTTGAGTTTCTGCT
GGCCCGCGGCGCCGACGTTCGGCGCCGCGACGACGCCCGCGGATGGTCGG
CGCTCGAGTGGGCGTGCATCGGCCCCGACGACTGCTTCCTGCGATGCGCC
GGCAGCCTGCGCGTCGTGCGCTTCCTGCTAGAGGAAGCGGGTGCCGAGAT
GGAGACTGGCGTTCGAAGGGAGAGAGAGGCGCAGGACGGAGCTGCAGTAG
CGGGGAGGAGCAACACCAGTGGAGTTGGGGAGGAGAGCGCCGCCGCCGCG
GCTGGCAGCCCCAGCAACGGCGATGACGTCAGCGGCGCCACCAACAACAA
CAGCGGCGGTGGCATTGGCACCGCAGCCGACGCTGGCGGCCGACGCGACG
GCGACAACCGCCAGGGCGGCTCGGCGCTGCACGCCACGGTCCGCTCGGCC
TGGAAGATGCCGCGGCAGCAGACGAACCTGCTGCGCTATCTCATGAGCGC
TCCCTGGGTCAACCGCGCCCTGACGGTCGCCTTCCCGCACGGGCTCATCC
CGGCGTTGCGGCGGCCATTGCCGTTGGACGTCGAAGCGGCGCTCCGCGGC
TTCCTTATGCCGGACGTCCGAAGGGCCCTCAGCATCCGGGATGGCGCCGG
AAGGACGCCGCTCGAGGTGGCGCTGCGTGCAAGCTCCAGCACGCGGGCAC
TGTTTGCGCTGATGGCGGCTGCCGGCGCCGACACGAGCGGGCTAAGCGCT
GCTGATGCCGCCGTCGTGGCAAGGGGGGTCCAAGAGGAAGCCGAGGCAGC
GGCGAGGGCAAGCGCGGCGGGAGGGGCGAAGGTGGCGGTGGGAGGTGATG
TGTCTCATTGTAGCAAGAAGAAGCCGCGGGACGAACGGCATCGCTCCGAA
GGCGCCAGCGGGGAGCCGGCGACAGTGAAGCTGTCTTTTTTGCTCGGCAG
CCGGCAGCTTTAGGAGCCTTTATTGGGATCCTTTAAAAGAGATTGGCGGC
GGTGCTGCATCGTAAATCAAGCTCACCCACC

Coding sequence (CDS) from alignment at P-wetherbeei_contig6554:99..2629+

>mRNA_P-wetherbeei_contig6554.1.1 ID=mRNA_P-wetherbeei_contig6554.1.1|Name=mRNA_P-wetherbeei_contig6554.1.1|organism=Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79|type=CDS|length=2175bp|location=Sequence derived from alignment at P-wetherbeei_contig6554:99..2629+ (Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79)
ATGGCATCGTTCACTAGCTTGCATCAATTCAACATCCACGATGCCTTGAG
CGCTCTGGAAGTCTTGCACACCTCGGACGCCGTCGATGAGATCGTGCAGC
ACGAGTGTTTCGGCGAAAGCCGGCCGTCCTCTTCCCTAGTGCGTGCACTC
TCAACATCTCCAGTTGGTGCGGACCAAATGCGCGCGTTGGTGCAGTGCGG
CCACATCAAAAAGGAACAGCTGCTGGCCAAAGATTCTTTCGGCTGCACGG
CTCTCGAGACGGCTGCCGGGGCCGGTGCGCTTGGCGTTGTACAGTATTTA
ATAACTGAGCTCGGCGCGCTGGCAGCACCATCCCTACTCCTGCTCGCGGC
ACGCGGGCGGACACGAAGGCATTGGGACGTCGTCCGTCGGCTCGTCAACG
ATAAACCAGGGCTTCTCGCTCAGGCGACGGACCAGACCTCGAGGACGACT
GTGCTCCACATCGCTGCCGCGCTCTCACAACACGACGTTGCTTTGGAGGT
GGCTGAGTTCCTCGTGGCCGCCGGCGCCGACGCCGACGTTGCTGACATGG
ACGGCGAGACACCCCTGCACGCAAGCCTCCGCGCCGGCAACCACGCGCTG
GCGGAGCGGCTGCTGCAGCTAGGAGCGACCGACTTGGATCGCCCGAGCCG
CCTCGACAGCGCGACGCCGCTCCTGCTGGCCGTGGGGCAGCGGGCCCTCT
CTGTGGCGAAAGCGCTGGTGGCAGCGGGCGCCGCGGCCGACGGACCGGCC
GCTGCCACTGCTGCCGCGAGTGCCGCAGCAAGGCCCGCTGCCACCTTTAT
CATCGTCCCTCCTCCGATCTCGCCGCTTTGTCTAGCGGCGGCCCTTGGCA
ACTATGCCATGGTCGCCTATCTCGTGGATGGCGCCGGTGCCACAGTGCTA
ACACGGGGAACAGCTGCCGGCGGTGGCGGCAGCAACAGCGAGAGCAGCAA
CAACGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCAGGCAGGAGGAAAGCTGCG
TCCACGCCGCAAGCGCCGGCGGCCACCTCGCCATGCTGCGCTTTCTCGTG
GAGCGCGGCGCCGACCCGGCGGCTGCCTGCGCACGCGGCCTGCCCTTACA
GGCCGCAGCACGAAATGGTCATGAGGACTGCGTGCGTTGGCTGGTCGACT
GTGCCGGCGTCTCGCCCGAGCCACCGACGCCTCCAGCAGTGGCGGCGGGA
GCTACGACGCCGCTGATGGCGGCGTGCCAGGGCGGCCACGCGTCCGTCGT
TGAGTTTCTGCTGGCCCGCGGCGCCGACGTTCGGCGCCGCGACGACGCCC
GCGGATGGTCGGCGCTCGAGTGGGCGTGCATCGGCCCCGACGACTGCTTC
CTGCGATGCGCCGGCAGCCTGCGCGTCGTGCGCTTCCTGCTAGAGGAAGC
GGGTGCCGAGATGGAGACTGGCGTTCGAAGGGAGAGAGAGGCGCAGGACG
GAGCTGCAGTAGCGGGGAGGAGCAACACCAGTGGAGTTGGGGAGGAGAGC
GCCGCCGCCGCGGCTGGCAGCCCCAGCAACGGCGATGACGTCAGCGGCGC
CACCAACAACAACAGCGGCGGTGGCATTGGCACCGCAGCCGACGCTGGCG
GCCGACGCGACGGCGACAACCGCCAGGGCGGCTCGGCGCTGCACGCCACG
GTCCGCTCGGCCTGGAAGATGCCGCGGCAGCAGACGAACCTGCTGCGCTA
TCTCATGAGCGCTCCCTGGGTCAACCGCGCCCTGACGGTCGCCTTCCCGC
ACGGGCTCATCCCGGCGTTGCGGCGGCCATTGCCGTTGGACGTCGAAGCG
GCGCTCCGCGGCTTCCTTATGCCGGACGTCCGAAGGGCCCTCAGCATCCG
GGATGGCGCCGGAAGGACGCCGCTCGAGGTGGCGCTGCGTGCAAGCTCCA
GCACGCGGGCACTGTTTGCGCTGATGGCGGCTGCCGGCGCCGACACGAGC
GGGCTAAGCGCTGCTGATGCCGCCGTCGTGGCAAGGGGGGTCCAAGAGGA
AGCCGAGGCAGCGGCGAGGGCAAGCGCGGCGGGAGGGGCGAAGGTGGCGG
TGGGAGGTGATGTGTCTCATTGTAGCAAGAAGAAGCCGCGGGACGAACGG
CATCGCTCCGAAGGCGCCAGCGGGGAGCCGGCGACAGTGAAGCTGTCTTT
TTTGCTCGGCAGCCGGCAGCTTTAG