mRNA_P-wetherbeei_contig20713.2.1 (mRNA) Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79

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Overview
NamemRNA_P-wetherbeei_contig20713.2.1
Unique NamemRNA_P-wetherbeei_contig20713.2.1
TypemRNA
OrganismPhaeothamnion wetherbeei SAG_119_79 (Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79)
Homology
BLAST of mRNA_P-wetherbeei_contig20713.2.1 vs. uniprot
Match: UPI00074FCF40 (DNA-binding protein RFXANK n=1 Tax=Gekko japonicus TaxID=146911 RepID=UPI00074FCF40)

HSP 1 Score: 86.7 bits (213), Expect = 1.580e-17
Identity = 46/135 (34.07%), Postives = 70/135 (51.85%), Query Frame = 1
Query:    4 GEREKIRQALESHPELINARDNTGWGPIQWATFIGRDDIARWLLARGSDPGYDANHVMGPVHVACAWDQPDALQVLLEKNPDVNARGPGGWTPIFWCALTGRSKLMETLLKRGADVTMKDDYGRSALHIAAARNH 408
            GE   +++ L+    L+N  D  G+ P+ WA+  G  +  R LL  G+DP   A+     V +A        + +LLEKN ++N+    G TPI +       K +ETLL RGAD+TM+ D G + + +A A  H
Sbjct:   38 GELTLLKENLQKDENLVNKPDKRGFTPLMWASAFGEIETVRCLLELGADPHALADQRESAVSLASTGGYTGIVVLLLEKNVNINSYDWNGGTPILYAVRGNHVKCVETLLARGADLTMEADSGYTPMDLAVALGH 172          
BLAST of mRNA_P-wetherbeei_contig20713.2.1 vs. uniprot
Match: UPI001EE5B382 (serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit C-like n=1 Tax=Haliotis rubra TaxID=36100 RepID=UPI001EE5B382)

HSP 1 Score: 84.3 bits (207), Expect = 2.830e-15
Identity = 54/189 (28.57%), Postives = 89/189 (47.09%), Query Frame = 1
Query:   52 INARDNTGWGPIQWATFIGRDDIARWLLARGSDPGYDANHVMGPVHVACAWDQPDALQVLLEKNPDVNARGPGGWTPIFWCALTGRSKLMETLLKRGADVTMKDDYGRSALHIAAARNHLGTVATLIGGGAVVNQIAP-------GESS-TPLXXXXXXXXXXXXXXLIFNGANLALKDKDGRTALELA 594
            IN R   GW P+  A + G+ D+   L+++G+D     +     +HVAC       ++ LL +  D+N RG  GWTP+   A  G+  +++ L+ +GAD+T++DD  R+ LH+A             G   +V  + P       G+   TPL              L+  GA+L L++ +  T L +A
Sbjct:   54 INCRGQLGWTPLMAAAWCGKQDVFDLLVSKGADLTLRDDCNRNVLHVACDGGNSPIVEDLLPQF-DINCRGFVGWTPLIAAAWCGKKDVVDLLVSKGADLTLRDDCNRNVLHLACQG----------GNSPIVEYLLPQFDINCRGQLGWTPLMTAALNRKKDVVNLLVSKGADLTLRNDNNDTLLHVA 231          
BLAST of mRNA_P-wetherbeei_contig20713.2.1 vs. uniprot
Match: A0A4W4H7C6_ELEEL (Neurogenic locus notch homolog protein 1 n=1 Tax=Electrophorus electricus TaxID=8005 RepID=A0A4W4H7C6_ELEEL)

HSP 1 Score: 84.0 bits (206), Expect = 4.500e-15
Identity = 60/205 (29.27%), Postives = 88/205 (42.93%), Query Frame = 1
Query:   19 IRQALESHPELINARDNTGWGPIQWATFIGRDDIARWLLARGSDPGYDANHVMGPVHVACAWDQPDALQVLLEKNP-DVNARGPGGWTPIFWCALTGRSKLMETLLKRGADVTMKDDYGRSALHIAAARNHLGTVATLIGGGAVVNQIAPGESSTPLXXXXXXXXXXXXXXLIFNGANLALKDKDGRTALELAQKNRHHLLARAI 630
            I   +     L N  D TG   +  A    R D A+ LL   +D     N    P+H A A D     Q+L+     D++AR   G TP+   A      ++E L+   ADV   DD+G+SALH AAA N++     L+  GA    +   +  TPL              L+ + AN  + D   R   ++AQ+  HH + R +
Sbjct: 1643 INDFIYQGANLHNQTDRTGETALHLAARYARSDAAKRLLEASADANIQDNMGRTPLHAAVAADAQGVFQILIRNRATDLDARMHDGTTPLILAARLAVEGMVEELINCHADVNAIDDFGKSALHWAAAVNNVDATVVLLKNGAN-KDMQNNKEETPLFLAAREGSYETAKVLLDHFANREITDHMDRLPRDIAQERMHHDIVRLM 1846          
BLAST of mRNA_P-wetherbeei_contig20713.2.1 vs. uniprot
Match: A0A4W4HFD1_ELEEL (Neurogenic locus notch homolog protein 1 n=1 Tax=Electrophorus electricus TaxID=8005 RepID=A0A4W4HFD1_ELEEL)

HSP 1 Score: 84.0 bits (206), Expect = 4.520e-15
Identity = 60/205 (29.27%), Postives = 88/205 (42.93%), Query Frame = 1
Query:   19 IRQALESHPELINARDNTGWGPIQWATFIGRDDIARWLLARGSDPGYDANHVMGPVHVACAWDQPDALQVLLEKNP-DVNARGPGGWTPIFWCALTGRSKLMETLLKRGADVTMKDDYGRSALHIAAARNHLGTVATLIGGGAVVNQIAPGESSTPLXXXXXXXXXXXXXXLIFNGANLALKDKDGRTALELAQKNRHHLLARAI 630
            I   +     L N  D TG   +  A    R D A+ LL   +D     N    P+H A A D     Q+L+     D++AR   G TP+   A      ++E L+   ADV   DD+G+SALH AAA N++     L+  GA    +   +  TPL              L+ + AN  + D   R   ++AQ+  HH + R +
Sbjct: 1777 INDFIYQGANLHNQTDRTGETALHLAARYARSDAAKRLLEASADANIQDNMGRTPLHAAVAADAQGVFQILIRNRATDLDARMHDGTTPLILAARLAVEGMVEELINCHADVNAIDDFGKSALHWAAAVNNVDATVVLLKNGAN-KDMQNNKEETPLFLAAREGSYETAKVLLDHFANREITDHMDRLPRDIAQERMHHDIVRLM 1980          
BLAST of mRNA_P-wetherbeei_contig20713.2.1 vs. uniprot
Match: A0A4W4H7B4_ELEEL (Neurogenic locus notch homolog protein 1 n=6 Tax=Electrophorus electricus TaxID=8005 RepID=A0A4W4H7B4_ELEEL)

HSP 1 Score: 84.0 bits (206), Expect = 4.520e-15
Identity = 60/205 (29.27%), Postives = 88/205 (42.93%), Query Frame = 1
Query:   19 IRQALESHPELINARDNTGWGPIQWATFIGRDDIARWLLARGSDPGYDANHVMGPVHVACAWDQPDALQVLLEKNP-DVNARGPGGWTPIFWCALTGRSKLMETLLKRGADVTMKDDYGRSALHIAAARNHLGTVATLIGGGAVVNQIAPGESSTPLXXXXXXXXXXXXXXLIFNGANLALKDKDGRTALELAQKNRHHLLARAI 630
            I   +     L N  D TG   +  A    R D A+ LL   +D     N    P+H A A D     Q+L+     D++AR   G TP+   A      ++E L+   ADV   DD+G+SALH AAA N++     L+  GA    +   +  TPL              L+ + AN  + D   R   ++AQ+  HH + R +
Sbjct: 1795 INDFIYQGANLHNQTDRTGETALHLAARYARSDAAKRLLEASADANIQDNMGRTPLHAAVAADAQGVFQILIRNRATDLDARMHDGTTPLILAARLAVEGMVEELINCHADVNAIDDFGKSALHWAAAVNNVDATVVLLKNGAN-KDMQNNKEETPLFLAAREGSYETAKVLLDHFANREITDHMDRLPRDIAQERMHHDIVRLM 1998          
BLAST of mRNA_P-wetherbeei_contig20713.2.1 vs. uniprot
Match: UPI001EE5DB1B (uncharacterized protein LOC124261872 n=1 Tax=Haliotis rubra TaxID=36100 RepID=UPI001EE5DB1B)

HSP 1 Score: 83.6 bits (205), Expect = 5.660e-15
Identity = 57/184 (30.98%), Postives = 92/184 (50.00%), Query Frame = 1
Query:   52 INARDNTGWGPIQWATFIGRDDIARWLLARGSDPGY--DANHVMGPVHVACAWDQPDALQVLLEKNPDVNARGPGGWTPIFWCALTGRSKLMETLLKRGADVTMKDDYGRSALHIAAARNHLGTVATLIGGGAVVNQIAPGESS-TPLXXXXXXXXXXXXXXLIFNGANLALKDKDGRTALELA 594
            IN R   GW P+  A   G+ D+   L+++G+D     D N+ +  +H+ACA    + ++ LL    D+N RG  G TP+   A  G+  +++ L+ +GAD+T+KD+  R+ALH+A+   + G V  L+    + +    G    TPL              L+  GA+L  +D    T L LA
Sbjct:  873 INCRGQEGWTPLMAAARYGKKDLFALLVSKGADLTQRDDKNNTL--LHLACAGGNSNIVEHLLPLF-DINCRGYVGCTPLMVAAFHGKKDVVDLLVSKGADLTLKDEKSRNALHVASQVGNSGIVEHLL---PLFDINCRGYVGWTPLMEAAWYGKKDVFALLVSKGADLTQRDDKNNTLLHLA 1050          
BLAST of mRNA_P-wetherbeei_contig20713.2.1 vs. uniprot
Match: A0A5J5DH33_9PERO (Neurogenic locus notch homolog protein 1 n=1 Tax=Etheostoma spectabile TaxID=54343 RepID=A0A5J5DH33_9PERO)

HSP 1 Score: 83.6 bits (205), Expect = 5.910e-15
Identity = 61/196 (31.12%), Postives = 88/196 (44.90%), Query Frame = 1
Query:   49 LINARDNTGWGPIQWATFIGRDDIARWLLARGSDPGYDANHVMGPVHVACAWDQPDALQVLLEKNP-DVNARGPGGWTPIFWCA-LTGRSKLMETLLKRGADVTMKDDYGRSALHIAAARNHLGTVATLIGGGAVVNQIAPGESSTPLXXXXXXXXXXXXXXLIFNGANLALKDKDGRTALELAQKNRHHLLARAI 630
            L N  D TG   +  A    R D A+ LL   +D     N    P+H A A D     Q+L+     D++AR   G TP+   A L G   ++E L+   ADV   DD+G+SALH AAA N++     L+  GA    +   +  TPL              L+ + AN  + D   R   ++AQ+  HH + R +
Sbjct:  951 LHNQTDRTGETALHLAARYARSDAAKRLLEASADANVQDNMGRTPLHAAVAADAQGVFQILIRNRATDLDARMHDGTTPLILAARLAGVEGMVEELINCHADVNAIDDFGKSALHWAAAVNNVEAAIVLLKNGAN-KDMQNNKEETPLFLAAREGSYASAKVLLDHFANREITDHMDRLPRDIAQERMHHDIVRLL 1145          
BLAST of mRNA_P-wetherbeei_contig20713.2.1 vs. uniprot
Match: UPI0013AE9F11 (neurogenic locus notch homolog protein 1 isoform X1 n=5 Tax=Percomorphaceae TaxID=1489872 RepID=UPI0013AE9F11)

HSP 1 Score: 83.6 bits (205), Expect = 6.150e-15
Identity = 61/196 (31.12%), Postives = 88/196 (44.90%), Query Frame = 1
Query:   49 LINARDNTGWGPIQWATFIGRDDIARWLLARGSDPGYDANHVMGPVHVACAWDQPDALQVLLEKNP-DVNARGPGGWTPIFWCA-LTGRSKLMETLLKRGADVTMKDDYGRSALHIAAARNHLGTVATLIGGGAVVNQIAPGESSTPLXXXXXXXXXXXXXXLIFNGANLALKDKDGRTALELAQKNRHHLLARAI 630
            L N  D TG   +  A    R D A+ LL   +D     N    P+H A A D     Q+L+     D++AR   G TP+   A L G   ++E L+   ADV   DD+G+SALH AAA N++     L+  GA    +   +  TPL              L+ + AN  + D   R   ++AQ+  HH + R +
Sbjct: 1922 LHNQTDRTGETALHLAARYARSDAAKRLLEASADANVQDNMGRTPLHAAVAADAQGVFQILIRNRATDLDARMHDGTTPLILAARLAGVEGMVEELINCHADVNAIDDFGKSALHWAAAVNNVEAAIVLLKNGAN-KDMQNNKEETPLFLAAREGSYASAKVLLDHFANREITDHMDRLPRDIAQERMHHDIVRLL 2116          
BLAST of mRNA_P-wetherbeei_contig20713.2.1 vs. uniprot
Match: A0A3Q2YEN4_HIPCM (Neurogenic locus notch homolog protein 1 n=4 Tax=Syngnathidae TaxID=72045 RepID=A0A3Q2YEN4_HIPCM)

HSP 1 Score: 82.4 bits (202), Expect = 1.530e-14
Identity = 59/205 (28.78%), Postives = 88/205 (42.93%), Query Frame = 1
Query:   19 IRQALESHPELINARDNTGWGPIQWATFIGRDDIARWLLARGSDPGYDANHVMGPVHVACAWDQPDALQVLLEKNP-DVNARGPGGWTPIFWCALTGRSKLMETLLKRGADVTMKDDYGRSALHIAAARNHLGTVATLIGGGAVVNQIAPGESSTPLXXXXXXXXXXXXXXLIFNGANLALKDKDGRTALELAQKNRHHLLARAI 630
            I   +     L N  D TG   +  A    R D A+ LL   +D     N    P+H A A D     Q+L+     D++AR   G TP+   A      +++ L+   ADV   DD+G+SALH AAA N++     L+  GA    +   +  TPL              L+ + AN  + D   R   ++AQ+  HH + R +
Sbjct: 1909 INDFIYQGASLHNQTDRTGETALHLAARYARSDAAKRLLEASADANIQDNMGRTPLHAAVAADAQGVFQILIRNRATDLDARMHDGTTPLILAARLAVEGMVDELINCHADVNAIDDFGKSALHWAAAVNNVAAAIMLLKSGAN-KDMQNNKEETPLFLAAREGSYETAKVLLDHFANREITDHMDRLPRDIAQERMHHDIVRLM 2112          
BLAST of mRNA_P-wetherbeei_contig20713.2.1 vs. uniprot
Match: A0A8C9Y0I2_SANLU (Neurogenic locus notch homolog protein 1 n=1 Tax=Sander lucioperca TaxID=283035 RepID=A0A8C9Y0I2_SANLU)

HSP 1 Score: 81.3 bits (199), Expect = 3.820e-14
Identity = 60/196 (30.61%), Postives = 87/196 (44.39%), Query Frame = 1
Query:   49 LINARDNTGWGPIQWATFIGRDDIARWLLARGSDPGYDANHVMGPVHVACAWDQPDALQVLLEKNP-DVNARGPGGWTPIFWCA-LTGRSKLMETLLKRGADVTMKDDYGRSALHIAAARNHLGTVATLIGGGAVVNQIAPGESSTPLXXXXXXXXXXXXXXLIFNGANLALKDKDGRTALELAQKNRHHLLARAI 630
            L N  D TG   +  A    R D A+ LL   +D     N    P+H A A D     Q+L+     D++AR   G TP+   A L     ++E L+   ADV   DD+G+SALH AAA N++     L+  GA    +   +  TPL              L+ + AN  + D   R   ++AQ+  HH + R +
Sbjct: 1817 LHNQTDRTGETALHLAARYARSDAAKRLLEASADANVQDNMGRTPLHAAVAADAQGVFQILIRNRATDLDARMHDGTTPLILAARLAAVEGMVEELINCHADVNAIDDFGKSALHWAAAVNNVEAAIVLLKNGAN-KDMQNNKEETPLFLAAREGSYASAKVLLDHFANREITDHMDRLPRDIAQERMHHDIVRLL 2011          
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of mRNA_P-wetherbeei_contig20713.2.1 vs. uniprot
Analysis Date: 2022-09-19 (Diamond blastx: OGS1.0 vs UniRef90)
Total hits: 25
Match NameE-valueIdentityDescription
UPI00074FCF401.580e-1734.07DNA-binding protein RFXANK n=1 Tax=Gekko japonicus... [more]
UPI001EE5B3822.830e-1528.57serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ... [more]
A0A4W4H7C6_ELEEL4.500e-1529.27Neurogenic locus notch homolog protein 1 n=1 Tax=E... [more]
A0A4W4HFD1_ELEEL4.520e-1529.27Neurogenic locus notch homolog protein 1 n=1 Tax=E... [more]
A0A4W4H7B4_ELEEL4.520e-1529.27Neurogenic locus notch homolog protein 1 n=6 Tax=E... [more]
UPI001EE5DB1B5.660e-1530.98uncharacterized protein LOC124261872 n=1 Tax=Halio... [more]
A0A5J5DH33_9PERO5.910e-1531.12Neurogenic locus notch homolog protein 1 n=1 Tax=E... [more]
UPI0013AE9F116.150e-1531.12neurogenic locus notch homolog protein 1 isoform X... [more]
A0A3Q2YEN4_HIPCM1.530e-1428.78Neurogenic locus notch homolog protein 1 n=4 Tax=S... [more]
A0A8C9Y0I2_SANLU3.820e-1430.61Neurogenic locus notch homolog protein 1 n=1 Tax=S... [more]

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Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
P-wetherbeei_contig20713contigP-wetherbeei_contig20713:482..1132 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Diamond blastx: OGS1.0 vs UniRef902022-09-19
Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79 OGS1.02022-07-08
Properties
Property NameValue
Stop0
Start0
Seed ortholog9733.XP_004285023.1
Preferred nameNOTCH1
PFAMsAnk,Ank_2,Ank_5,DUF3454,EGF,EGF_CA,NOD,NODP,Notch,hEGF
Model size651
Max annot lvl33208|Metazoa
KEGG koko:K02599,ko:K20994,ko:K20995
KEGG Pathwayko01522,ko04320,ko04330,ko04371,ko04658,ko04919,ko05020,ko05165,ko05200,ko05206,ko05224,map01522,map04320,map04330,map04371,map04658,map04919,map05020,map05165,map05200,map05206,map05224
KEGG ModuleM00682
Hectar predicted targeting categoryother localisation
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DescriptionDomain of unknown function
Cds size651
COG categoryT
BRITEko00000,ko00001,ko00002
Relationships

The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
1683186207.1554708-CDS-P-wetherbeei_contig20713:481..11321683186207.1554708-CDS-P-wetherbeei_contig20713:481..1132Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79CDSP-wetherbeei_contig20713 482..1132 +


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
mRNA_P-wetherbeei_contig20713.2.1prot_P-wetherbeei_contig20713.2.1Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79polypeptideP-wetherbeei_contig20713 482..1132 +


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of mRNA_P-wetherbeei_contig20713.2.1

>prot_P-wetherbeei_contig20713.2.1 ID=prot_P-wetherbeei_contig20713.2.1|Name=mRNA_P-wetherbeei_contig20713.2.1|organism=Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79|type=polypeptide|length=217bp
LGEREKIRQALESHPELINARDNTGWGPIQWATFIGRDDIARWLLARGSD
PGYDANHVMGPVHVACAWDQPDALQVLLEKNPDVNARGPGGWTPIFWCAL
TGRSKLMETLLKRGADVTMKDDYGRSALHIAAARNHLGTVATLIGGGAVV
NQIAPGESSTPLHMAAERGHLAVCDCLIFNGANLALKDKDGRTALELAQK
NRHHLLARAIRKHSKEG
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mRNA from alignment at P-wetherbeei_contig20713:482..1132+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>mRNA_P-wetherbeei_contig20713.2.1 ID=mRNA_P-wetherbeei_contig20713.2.1|Name=mRNA_P-wetherbeei_contig20713.2.1|organism=Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79|type=mRNA|length=651bp|location=Sequence derived from alignment at P-wetherbeei_contig20713:482..1132+ (Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79)
CTGGGAGAACGCGAGAAGATTCGTCAAGCTCTGGAGAGTCATCCGGAGCT GATCAACGCTCGCGACAACACCGGCTGGGGCCCCATTCAGTGGGCCACTT TCATCGGTCGCGACGACATCGCGCGTTGGCTGCTCGCGCGAGGCTCAGAT CCGGGCTATGACGCCAATCATGTGATGGGGCCGGTGCATGTGGCCTGTGC CTGGGATCAGCCCGACGCGCTACAGGTCTTGCTCGAGAAGAATCCTGACG TGAACGCTCGCGGCCCGGGCGGGTGGACTCCCATTTTCTGGTGCGCTCTT ACAGGCCGCTCCAAGCTGATGGAAACTTTGCTCAAGCGTGGAGCCGACGT CACGATGAAGGACGACTACGGTCGTTCGGCTTTGCATATCGCCGCCGCTA GGAATCACCTGGGCACTGTCGCGACGTTGATCGGTGGAGGAGCCGTGGTG AATCAAATCGCTCCCGGCGAGTCGAGTACCCCTTTGCATATGGCCGCGGA AAGGGGGCACCTGGCCGTCTGCGATTGCCTGATCTTCAATGGCGCAAATC TGGCGCTCAAAGACAAGGACGGTCGGACAGCACTCGAGTTAGCTCAAAAG AATCGCCACCACCTGCTGGCGCGCGCTATCCGCAAACACTCCAAAGAGGG T
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Coding sequence (CDS) from alignment at P-wetherbeei_contig20713:482..1132+

>mRNA_P-wetherbeei_contig20713.2.1 ID=mRNA_P-wetherbeei_contig20713.2.1|Name=mRNA_P-wetherbeei_contig20713.2.1|organism=Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79|type=CDS|length=651bp|location=Sequence derived from alignment at P-wetherbeei_contig20713:482..1132+ (Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79)
CTGGGAGAACGCGAGAAGATTCGTCAAGCTCTGGAGAGTCATCCGGAGCT
GATCAACGCTCGCGACAACACCGGCTGGGGCCCCATTCAGTGGGCCACTT
TCATCGGTCGCGACGACATCGCGCGTTGGCTGCTCGCGCGAGGCTCAGAT
CCGGGCTATGACGCCAATCATGTGATGGGGCCGGTGCATGTGGCCTGTGC
CTGGGATCAGCCCGACGCGCTACAGGTCTTGCTCGAGAAGAATCCTGACG
TGAACGCTCGCGGCCCGGGCGGGTGGACTCCCATTTTCTGGTGCGCTCTT
ACAGGCCGCTCCAAGCTGATGGAAACTTTGCTCAAGCGTGGAGCCGACGT
CACGATGAAGGACGACTACGGTCGTTCGGCTTTGCATATCGCCGCCGCTA
GGAATCACCTGGGCACTGTCGCGACGTTGATCGGTGGAGGAGCCGTGGTG
AATCAAATCGCTCCCGGCGAGTCGAGTACCCCTTTGCATATGGCCGCGGA
AAGGGGGCACCTGGCCGTCTGCGATTGCCTGATCTTCAATGGCGCAAATC
TGGCGCTCAAAGACAAGGACGGTCGGACAGCACTCGAGTTAGCTCAAAAG
AATCGCCACCACCTGCTGGCGCGCGCTATCCGCAAACACTCCAAAGAGGG
T
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