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Homology
BLAST of mRNA_P-wetherbeei_contig10058.1.2 vs. uniprot
Match: A0A7S1UB55_9STRA (Hypothetical protein (Fragment) n=1 Tax=Phaeomonas parva TaxID=124430 RepID=A0A7S1UB55_9STRA) HSP 1 Score: 355 bits (910), Expect = 8.710e-116 Identity = 181/287 (63.07%), Postives = 219/287 (76.31%), Query Frame = 1
Query: 19 HVNQQNLQRAWDVTQRSTREDWDEWIRRFAVEVLRESPSPALRSCSALAQVYQPLGRELFHAAFVSCWFELSEPYQENLVKSLEAAFRSASIPPEILQMLLNLAEFMEHEVEVSTRGSLPIDIRVLAELAQKCHAYAKALHYKEIEFQTSPALCIEALININKKLGQPEAAMGILTYAQSRLGSVMAVKESWLAKLGHWQEALALYGRRHEADPADVGAIIGCMKCLDALGECDALLRMCRESWAALTSAEAADADDRAHRKAATLAARAAWNLGEWRLFEHHVGAM 879
HVNQQ+LQRAWDVTQR+TREDWDEWIRRF V +L+ESP+P LR+CS LAQVY L ELFH +FVSCW EL E YQ +L++SLE AFRSA+IPP+ILQ+LLNLAEFMEHEVE +LPIDIRVLAELA KCHAYAKALHYKE++FQT P C++AL+ INKKL Q +AA G+L +AQ RLGSVM VKESWL K+G W+EAL Y R AD D A++G MKCLDA+GE D +L +C+++W L +A D D + +K TL + AA +L +W E V AM
Sbjct: 84 HVNQQSLQRAWDVTQRTTREDWDEWIRRFGVTLLQESPAPTLRACSELAQVYPTLATELFHGSFVSCWNELGERYQLHLIRSLEIAFRSATIPPKILQILLNLAEFMEHEVE-----ALPIDIRVLAELAFKCHAYAKALHYKELQFQTRPEDCVDALVTINKKLNQTDAARGMLKFAQERLGSVMTVKESWLVKMGQWEEALKKYRERFSADGLDTSALLGMMKCLDAIGEWDTMLDLCQDAWGLLVD-DAGD-DRKTRQKVITLGSLAALSLRKWDTMEKQVAAM 363
BLAST of mRNA_P-wetherbeei_contig10058.1.2 vs. uniprot
Match: A0A7R9UF45_9STRA (Hypothetical protein (Fragment) n=2 Tax=Pinguiococcus pyrenoidosus TaxID=172671 RepID=A0A7R9UF45_9STRA) HSP 1 Score: 358 bits (920), Expect = 1.700e-114 Identity = 183/291 (62.89%), Postives = 220/291 (75.60%), Query Frame = 1
Query: 7 VQKLHVNQQNLQRAWDVTQRSTREDWDEWIRRFAVEVLRESPSPALRSCSALAQVYQPLGRELFHAAFVSCWFELSEPYQENLVKSLEAAFRSASIPPEILQMLLNLAEFMEHEVEVSTRGSLPIDIRVLAELAQKCHAYAKALHYKEIEFQTSPALCIEALININKKLGQPEAAMGILTYAQSRLGSVMAVKESWLAKLGHWQEALALYGRRHEADPADVGAIIGCMKCLDALGECDALLRMCRESWAALTSAEAADADDRAHRKAATLAARAAWNLGEWRLFEHHVGAM 879
+ + HVNQQ+LQRAWDVTQR+TR+DWDEWIRRF V +L+ESP+PALR+CS LAQVY PL RELFH +FVSCW EL E YQ NL++SLE AFRSA+IPP+ILQ+LLNLAEFMEHEVE +LPIDIRVLAELA KCHAYAKALHYKE++FQT P CI+AL+ INKKL Q +AA G+L YAQ R S + VKESWL K+G W+EAL Y R E + D+ A++G +KCLDA+GE D +L +C SW+ LTS D R +K TL +RAA L W L + V AM
Sbjct: 232 ISRSHVNQQSLQRAWDVTQRTTRDDWDEWIRRFGVTLLQESPAPALRACSELAQVYPPLARELFHGSFVSCWNELGERYQLNLIRSLEIAFRSATIPPKILQILLNLAEFMEHEVE-----ALPIDIRVLAELAFKCHAYAKALHYKELQFQTRPEDCIDALVTINKKLNQTDAARGMLKYAQERPNSEVTVKESWLVKMGQWEEALRKYRERFENNSKDISALLGMLKCLDAIGEWDKVLELCAASWSTLTSKRKEDRKTR--QKVITLGSRAALALRRWDLMDKQVAAM 515
BLAST of mRNA_P-wetherbeei_contig10058.1.2 vs. uniprot
Match: W7TTX4_9STRA (Serine/threonine-protein kinase TOR n=3 Tax=Monodopsidaceae TaxID=425072 RepID=W7TTX4_9STRA) HSP 1 Score: 356 bits (914), Expect = 9.720e-109 Identity = 187/304 (61.51%), Postives = 220/304 (72.37%), Query Frame = 1
Query: 4 GVQKLHVNQQNLQRAWDVTQRSTREDWDEWIRRFAVEVLRESPSPALRSCSALAQVYQPLGRELFHAAFVSCWFELSEPYQENLVKSLEAAFRSASIPPEILQMLLNLAEFMEHEVEVSTRGSLPIDIRVLAELAQKCHAYAKALHYKEIEFQTSPALCIEALININKKLGQPEAAMGILTYAQSRLGSVMAVKESWLAKLGHWQEALALYGRR-----HEADPADVGAIIGCMKCLDALGECDALLRMCRESWAALTS-----AEAADADDRAH--RKAATLAARAAWNLGEWRLFEHHVGAM 879
G Q+LHVNQ NLQRAWDV+QR T E+W EWIRRF++E+LRESPS ALRSCSALAQVY PL RELFHAAF S WF LSE YQ++LV+SLEAAFRS + PP+I+Q LLNLAEFMEH+VE +LPIDI +LAELAQKCHAYAKALHYKE+EF T+PA C+E+LI INKKLGQPEAA+GIL YAQ +LGS + VKESWLAKLG+W EAL LY R E D+ I+G MKC DALG ++++C+ W L R H +K LAA A W LG+W EH + M
Sbjct: 1193 GGQRLHVNQANLQRAWDVSQRGTGEEWTEWIRRFSLELLRESPSSALRSCSALAQVYPPLARELFHAAFASSWFVLSESYQDHLVRSLEAAFRSPTTPPDIVQTLLNLAEFMEHDVE-----ALPIDIHILAELAQKCHAYAKALHYKELEFPTAPAACVESLITINKKLGQPEAALGILKYAQKKLGSEIVVKESWLAKLGNWSEALGLYEERARKAEEEGGEEDLETILGMMKCWDALGRWGEIVQLCQREWERLMGNGEGGGREGGRGGRQHVQKKVINLAAHACWKLGQWNGMEHFLRYM 1491
BLAST of mRNA_P-wetherbeei_contig10058.1.2 vs. uniprot
Match: A0A835YM18_9STRA (Serine/threonine-protein kinase TOR n=1 Tax=Tribonema minus TaxID=303371 RepID=A0A835YM18_9STRA) HSP 1 Score: 351 bits (900), Expect = 9.100e-108 Identity = 201/375 (53.60%), Postives = 233/375 (62.13%), Query Frame = 1
Query: 7 VQKLHVNQQNLQRAWDVTQRSTREDWDEWIRRFAVEVLRESPSPALRSCSALAQ----------------------VYQPLGRELFHAAFVSCWFELSEPYQENLVKSLEAAFRSASIPPEILQMLLNLAE------------------------------------------FMEHEVEVSTRGSLPIDIRVLAELAQKCHAYAKALHYKEIEFQTSPALCIEALININKKLGQPEAAMGILTYAQSRLGSVMAVKESWLAKLGHWQEALALYGRRH------------------------------EADPADVGAIIGCMKCLDALGECDALLRMCRESWAALTSAEAADADDRAHRKAATLAARAAWNLGEW 849
V KLHVNQQNL RAWDV+QRSTREDW EW+RRF E+LRESPSPALRSCSALA VY PL R+LFHAAFVSCWFELSE YQE L+++LE AFRS SIPPE LQMLL+LA FMEH+VE +LPI VLA+LAQKCHAYAKALHYKE++FQ +PA +EALI INKKLGQPEAA+G+LTYAQ RLGSV+AV+ESWLAKLGHW+EALALY E+ P D A+IGCMKC+DALG+ ++L+ +C SW+ LT DD+AHRKAATLAARA W+LG+W
Sbjct: 780 VAKLHVNQQNLARAWDVSQRSTREDWAEWMRRFCGELLRESPSPALRSCSALAXXXXXXXXXXXXXXQVWEFSRALVYNPLARKLFHAAFVSCWFELSETYQEGLMRALETAFRSPSIPPETLQMLLDLAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXFMEHDVE-----ALPIRTSVLADLAQKCHAYAKALHYKEVDFQVAPAESVEALIAINKKLGQPEAALGVLTYAQKRLGSVIAVQESWLAKLGHWEEALALYQXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXLESAPDDPAAVIGCMKCMDALGKWESLVALCDVSWSTLTGP---GTDDKAHRKAATLAARATWSLGQW 1146
BLAST of mRNA_P-wetherbeei_contig10058.1.2 vs. uniprot
Match: A0A6G0W5V6_9STRA (FAT domain-containing protein (Fragment) n=2 Tax=Aphanomyces euteiches TaxID=100861 RepID=A0A6G0W5V6_9STRA) HSP 1 Score: 321 bits (823), Expect = 1.230e-98 Identity = 171/299 (57.19%), Postives = 212/299 (70.90%), Query Frame = 1
Query: 13 KLHVNQQNLQRAWDVTQRSTREDWDEWIRRFAVEVLRESPSPALRSCSALAQVYQPLGRELFHAAFVSCWFELSEPYQENLVKSLEAAFRSASIPPEILQMLLNLAEFMEHEVEVSTRGSLPIDIRVLAELAQKCHAYAKALHYKEIEFQTSPALCIEALININKKLGQPEAAMGILTYAQSRLGSVMAVKESWLAKLGHWQEALALYGRRHEADPADVGAIIGCMKCLDALGECDALLRMCRESWAALTSAEAADADDRAHRKA----------ATLAARAAWNLGEWRLFEHHVGAM 879
KLHVNQQNL+RAW+ +QRST+EDW EW+RRF++E+LRESPS ALRSC +LAQ Y PL R LF++AFVSCW EL EP Q+NLV++LE AF+S +IP EILQ LLNLAEFMEH+VE +LPIDIR L ELAQKCHAYAKALHYKE+EF TSP+ CIEALI+IN ++GQPEAA+GIL YAQ +V+ VKESW KL W AL LY ++ P D+ A G M+CL+ALGE + L M ++ W + D + R +K+ L ARA W L EW+ E +V +
Sbjct: 332 KLHVNQQNLRRAWEASQRSTKEDWLEWMRRFSIELLRESPSAALRSCCSLAQAYNPLARALFNSAFVSCWNELYEPNQDNLVRALETAFQSDTIPAEILQTLLNLAEFMEHDVE-----ALPIDIRELGELAQKCHAYAKALHYKELEFHTSPSTCIEALISINNQVGQPEAAVGILKYAQWHHRNVIQVKESWYEKLQDWSNALELYDKKLIETPNDLEACTGKMRCLEALGEWEQLADMAKQVWTQVDLVR--DDNTRPMKKSLFDESLVKTVGLLGARACWWLSEWQTMEQYVSGV 623
BLAST of mRNA_P-wetherbeei_contig10058.1.2 vs. uniprot
Match: W4FQI3_9STRA (Serine/threonine-protein kinase TOR n=4 Tax=Aphanomyces astaci TaxID=112090 RepID=W4FQI3_9STRA) HSP 1 Score: 323 bits (829), Expect = 2.480e-97 Identity = 167/288 (57.99%), Postives = 207/288 (71.88%), Query Frame = 1
Query: 16 LHVNQQNLQRAWDVTQRSTREDWDEWIRRFAVEVLRESPSPALRSCSALAQVYQPLGRELFHAAFVSCWFELSEPYQENLVKSLEAAFRSASIPPEILQMLLNLAEFMEHEVEVSTRGSLPIDIRVLAELAQKCHAYAKALHYKEIEFQTSPALCIEALININKKLGQPEAAMGILTYAQSRLGSVMAVKESWLAKLGHWQEALALYGRRHEADPADVGAIIGCMKCLDALGECDALLRMCRESWAALTSAEAADADDRAHRKAATLAARAAWNLGEWRLFEHHVGAM 879
+HVNQ NL+RAW+ +QRST+EDW EW+RRF++E+LRESPS ALRSC +LAQ Y PL R LF++AFVSCW +L E YQ+ LV++LE AF+S +IP EILQ LLNLAEFMEH+VE +LPIDIR L ELAQKCHAYAKALHYKE+EF TSP+ CIEALI+IN ++GQPEAA+GIL YAQ SV+ VKESW KL W AL LY + + P D+ A G M+CL+ALGE D L + R+ W + D+ + A L ARA W L +W E +VG +
Sbjct: 1271 IHVNQANLKRAWEASQRSTKEDWLEWMRRFSIELLRESPSAALRSCCSLAQAYNPLARALFNSAFVSCWNQLFEQYQDYLVRALETAFQSDTIPAEILQTLLNLAEFMEHDVE-----ALPIDIRELGELAQKCHAYAKALHYKELEFHTSPSTCIEALISINNQVGQPEAAVGILKYAQLHHKSVIHVKESWFEKLQDWDNALDLYNVKLQETPNDLDACTGKMRCLEALGEWDQLAELARQVWDTVDPVTRGLKDESLVKTVALLGARACWWLRDWSTMEQYVGGV 1553
BLAST of mRNA_P-wetherbeei_contig10058.1.2 vs. uniprot
Match: A0A485L8R6_9STRA (Serine/threonine-protein kinase TOR n=1 Tax=Aphanomyces stellatus TaxID=120398 RepID=A0A485L8R6_9STRA) HSP 1 Score: 322 bits (826), Expect = 6.260e-97 Identity = 170/297 (57.24%), Postives = 212/297 (71.38%), Query Frame = 1
Query: 13 KLHVNQQNLQRAWDVTQRSTREDWDEWIRRFAVEVLRESPSPALRSCSALAQVYQPLGRELFHAAFVSCWFELSEPYQENLVKSLEAAFRSASIPPEILQMLLNLAEFMEHEVEVSTRGSLPIDIRVLAELAQKCHAYAKALHYKEIEFQTSPALCIEALININKKLGQPEAAMGILTYAQSRLGSVMAVKESWLAKLGHWQEALALYGRRHEADPADVGAIIGCMKCLDALGECDALLRMCRESWAALTSAEAAD--------ADDRAHRKAATLAARAAWNLGEWRLFEHHVGAM 879
+LHVNQQNL+RAW+ +QRST+EDW EW+RRF++E+LRESPS ALRSC +LAQ Y PL R LF++AFVSCW EL E YQ+ LV++LE AF+S +IP EILQ LLNLAEFMEH+VE +LPIDIR L ELAQKCHAYAKALHYKE+EF TSP+ CIEALI+IN ++GQPEAA+GIL YAQ SV+ VKE+W KL +W AL Y + + P D+ A G M+CL+ALGE D L + ++ WA + A+ + DD + A L ARA W L EW E +V +
Sbjct: 1235 RLHVNQQNLRRAWEASQRSTKEDWLEWMRRFSIELLRESPSAALRSCCSLAQAYNPLARALFNSAFVSCWNELYEQYQDYLVRALETAFQSDTIPAEILQTLLNLAEFMEHDVE-----ALPIDIRELGELAQKCHAYAKALHYKELEFHTSPSTCIEALISINNQVGQPEAAVGILKYAQLHHRSVIQVKETWYEKLQNWSNALESYDTKLKETPNDLEACTGKMRCLEALGEWDQLAVLAKQVWAQVDLAKDDNQKPSKRPLVDDSQVKTVALLGARACWWLSEWTTMEQYVSGV 1526
BLAST of mRNA_P-wetherbeei_contig10058.1.2 vs. uniprot
Match: A0A6G0WIT3_9STRA (Serine/threonine-protein kinase TOR n=2 Tax=Aphanomyces euteiches TaxID=100861 RepID=A0A6G0WIT3_9STRA) HSP 1 Score: 321 bits (823), Expect = 1.580e-96 Identity = 171/299 (57.19%), Postives = 212/299 (70.90%), Query Frame = 1
Query: 13 KLHVNQQNLQRAWDVTQRSTREDWDEWIRRFAVEVLRESPSPALRSCSALAQVYQPLGRELFHAAFVSCWFELSEPYQENLVKSLEAAFRSASIPPEILQMLLNLAEFMEHEVEVSTRGSLPIDIRVLAELAQKCHAYAKALHYKEIEFQTSPALCIEALININKKLGQPEAAMGILTYAQSRLGSVMAVKESWLAKLGHWQEALALYGRRHEADPADVGAIIGCMKCLDALGECDALLRMCRESWAALTSAEAADADDRAHRKA----------ATLAARAAWNLGEWRLFEHHVGAM 879
KLHVNQQNL+RAW+ +QRST+EDW EW+RRF++E+LRESPS ALRSC +LAQ Y PL R LF++AFVSCW EL EP Q+NLV++LE AF+S +IP EILQ LLNLAEFMEH+VE +LPIDIR L ELAQKCHAYAKALHYKE+EF TSP+ CIEALI+IN ++GQPEAA+GIL YAQ +V+ VKESW KL W AL LY ++ P D+ A G M+CL+ALGE + L M ++ W + D + R +K+ L ARA W L EW+ E +V +
Sbjct: 1205 KLHVNQQNLRRAWEASQRSTKEDWLEWMRRFSIELLRESPSAALRSCCSLAQAYNPLARALFNSAFVSCWNELYEPNQDNLVRALETAFQSDTIPAEILQTLLNLAEFMEHDVE-----ALPIDIRELGELAQKCHAYAKALHYKELEFHTSPSTCIEALISINNQVGQPEAAVGILKYAQWHHRNVIQVKESWYEKLQDWSNALELYDKKLIETPNDLEACTGKMRCLEALGEWEQLADMAKQVWTQVDLVR--DDNTRPMKKSLFDESLVKTVGLLGARACWWLSEWQTMEQYVSGV 1496
BLAST of mRNA_P-wetherbeei_contig10058.1.2 vs. uniprot
Match: A0A6G0WIQ7_9STRA (Serine/threonine-protein kinase TOR n=1 Tax=Aphanomyces euteiches TaxID=100861 RepID=A0A6G0WIQ7_9STRA) HSP 1 Score: 321 bits (823), Expect = 1.580e-96 Identity = 171/299 (57.19%), Postives = 212/299 (70.90%), Query Frame = 1
Query: 13 KLHVNQQNLQRAWDVTQRSTREDWDEWIRRFAVEVLRESPSPALRSCSALAQVYQPLGRELFHAAFVSCWFELSEPYQENLVKSLEAAFRSASIPPEILQMLLNLAEFMEHEVEVSTRGSLPIDIRVLAELAQKCHAYAKALHYKEIEFQTSPALCIEALININKKLGQPEAAMGILTYAQSRLGSVMAVKESWLAKLGHWQEALALYGRRHEADPADVGAIIGCMKCLDALGECDALLRMCRESWAALTSAEAADADDRAHRKA----------ATLAARAAWNLGEWRLFEHHVGAM 879
KLHVNQQNL+RAW+ +QRST+EDW EW+RRF++E+LRESPS ALRSC +LAQ Y PL R LF++AFVSCW EL EP Q+NLV++LE AF+S +IP EILQ LLNLAEFMEH+VE +LPIDIR L ELAQKCHAYAKALHYKE+EF TSP+ CIEALI+IN ++GQPEAA+GIL YAQ +V+ VKESW KL W AL LY ++ P D+ A G M+CL+ALGE + L M ++ W + D + R +K+ L ARA W L EW+ E +V +
Sbjct: 1235 KLHVNQQNLRRAWEASQRSTKEDWLEWMRRFSIELLRESPSAALRSCCSLAQAYNPLARALFNSAFVSCWNELYEPNQDNLVRALETAFQSDTIPAEILQTLLNLAEFMEHDVE-----ALPIDIRELGELAQKCHAYAKALHYKELEFHTSPSTCIEALISINNQVGQPEAAVGILKYAQWHHRNVIQVKESWYEKLQDWSNALELYDKKLIETPNDLEACTGKMRCLEALGEWEQLADMAKQVWTQVDLVR--DDNTRPMKKSLFDESLVKTVGLLGARACWWLSEWQTMEQYVSGV 1526
BLAST of mRNA_P-wetherbeei_contig10058.1.2 vs. uniprot
Match: A0A7S1BCF9_9STRA (Hypothetical protein (Fragment) n=1 Tax=Corethron hystrix TaxID=216773 RepID=A0A7S1BCF9_9STRA) HSP 1 Score: 308 bits (788), Expect = 3.640e-96 Identity = 165/285 (57.89%), Postives = 199/285 (69.82%), Query Frame = 1
Query: 10 QKLHVNQQNLQRAWDVTQRSTREDWDEWIRRFAVEVLRESPSPALRSCSALAQVYQPLGRELFHAAFVSCWFELSEPYQENLVKSLEAAFRSASIPPEILQMLLNLAEFMEHEVEVSTRGSLPIDIRVLAELAQKCHAYAKALHYKEIEFQTSPAL-CIEALININKKLGQPEAAMGILTYAQSRLGSVMA---------------------------------VKESWLAKLGHWQEALALYGRRHEADPADVGAIIGCMKCLDALGECDALLRMCRESWAALT 762
QKLHVNQQNLQRAWDV+QR+TR+DW+EW+RRF+V++LRE+PSPALR+C+ LAQ Y PL RELF+AAF SCWF+LS+ Y+ NLVKSL+ AF + ++PPEILQ LLNLAEFME +VE LPIDI++LA+LA KC AYAKALHYKE E+ TSP CIE LI INKKL P AA+G+L AQ RLG + VKESWLAKLG WQEAL LY RR P DVGAI+GCM+CL + GE ++L + SW AL+
Sbjct: 425 QKLHVNQQNLQRAWDVSQRTTRDDWEEWMRRFSVQLLREAPSPALRACADLAQGYPPLARELFYAAFASCWFDLSDQYKNNLVKSLKVAFVAPNVPPEILQSLLNLAEFMEQDVE-----KLPIDIQILADLAIKCRAYAKALHYKEQEYDTSPGYTCIEDLIWINKKLDLPAAALGVLEAAQHRLGETLKRSNSELYDAHGTALELTDDESNTTGEGGWAGTEVKESWLAKLGSWQEALRLYERRLAEHPYDVGAILGCMQCLVSRGEWKSVLDLSERSWGALS 704
The following BLAST results are available for this feature:
Alignments
The following features are aligned
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Properties
Property Name | Value |
Stop | 0 |
Start | 1 |
Seed ortholog | 157072.XP_008878028.1 |
Preferred name | MTOR |
PFAMs | BolA,DUF3385,FAT,FATC,FRB_dom,HEAT,PI3_PI4_kinase |
Model size | 879 |
Max annot lvl | 2759|Eukaryota |
KEGG ko | ko:K07203 |
KEGG Pathway | ko01521,ko01522,ko04012,ko04066,ko04072,ko04136,ko04138,ko04139,ko04140,ko04150,ko04151,ko04152,ko04211,ko04212,ko04213,ko04218,ko04371,ko04630,ko04659,ko04714,ko04910,ko04919,ko04920,ko04930,ko04931,ko05165,ko05167,ko05200,ko05205,ko05206,ko05210,ko05212,ko05214,ko05215,ko05221,ko05224,ko05225,ko05226,ko05230,ko05231,map01521,map01522,map04012,map04066,map04072,map04136,map04138,map04139,map04140,map04150,map04151,map04152,map04211,map04212,map04213,map04218,map04371,map04630,map04659,map04714,map04910,map04919,map04920,map04930,map04931,map05165,map05167,map05200,map05205,map05206,map05210,map05212,map05214,map05215,map05221,map05224,map05225,map05226,map05230,map05231 |
Hectar predicted targeting category | other localisation |
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|
Exons | 2 |
Evalue | 1.06e-95 |
EggNOG OGs | COG5032@1|root,KOG0891@2759|Eukaryota |
EC | 2.7.11.1 |
Description | protein serine/threonine kinase activity |
Cds size | 879 |
COG category | BDLTU |
BiGG Reaction | iMM904.YKL203C,iND750.YKL203C |
BRITE | ko00000,ko00001,ko01000,ko01001,ko04131 |
Relationships
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Feature Name | Unique Name | Species | Type | Position |
1683185852.2541647-CDS-P-wetherbeei_contig10058:932..1301 | 1683185852.2541647-CDS-P-wetherbeei_contig10058:932..1301 | Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79 | CDS | P-wetherbeei_contig10058 933..1301 + |
1683185852.2712963-CDS-P-wetherbeei_contig10058:1437..1947 | 1683185852.2712963-CDS-P-wetherbeei_contig10058:1437..1947 | Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79 | CDS | P-wetherbeei_contig10058 1438..1947 + |
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of mRNA_P-wetherbeei_contig10058.1.2 >prot_P-wetherbeei_contig10058.1.2 ID=prot_P-wetherbeei_contig10058.1.2|Name=mRNA_P-wetherbeei_contig10058.1.2|organism=Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79|type=polypeptide|length=293bp
MGVQKLHVNQQNLQRAWDVTQRSTREDWDEWIRRFAVEVLRESPSPALRS CSALAQVYQPLGRELFHAAFVSCWFELSEPYQENLVKSLEAAFRSASIPP EILQMLLNLAEFMEHEVEVSTRGSLPIDIRVLAELAQKCHAYAKALHYKE IEFQTSPALCIEALININKKLGQPEAAMGILTYAQSRLGSVMAVKESWLA KLGHWQEALALYGRRHEADPADVGAIIGCMKCLDALGECDALLRMCRESW AALTSAEAADADDRAHRKAATLAARAAWNLGEWRLFEHHVGAM back to topmRNA from alignment at P-wetherbeei_contig10058:933..1947+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >mRNA_P-wetherbeei_contig10058.1.2 ID=mRNA_P-wetherbeei_contig10058.1.2|Name=mRNA_P-wetherbeei_contig10058.1.2|organism=Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79|type=mRNA|length=1015bp|location=Sequence derived from alignment at P-wetherbeei_contig10058:933..1947+ (Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79) ATGGGCGTTCAAAAGCTGCACGTGAACCAGCAGAACCTGCAGCGTGCGTG
GGACGTGACACAGCGCAGCACACGCGAAGACTGGGACGAGTGGATCCGCC
GCTTCGCCGTCGAGGTGCTGCGCGAGTCGCCCTCACCGGCGCTGCGCAGC
TGCAGCGCACTGGCGCAGGTCTATCAGCCGCTGGGACGGGAGCTGTTTCA
CGCGGCCTTTGTGAGTTGCTGGTTTGAGCTGTCGGAGCCATACCAGGAGA
ATTTGGTCAAGAGCCTCGAGGCGGCGTTCCGGAGCGCATCCATTCCCCCC
GAGATTCTACAGATGCTGCTAAACTTGGCCGAGTTCATGGAGCACGAGGT
CGAGGTGAGCACGCGAGGCGTCTGAATTCAATGGAGTGTTGGCGTGAAGG
GTTTAGTGGGAAGTAGGTTGGCTGCGGTTGCTGCGGCGGAGCCTGTCTTT
CATTCGTTTCAGGCCCTTTGGACCGCTGTCGTCTCTCCGTCCGTCTCCGC
CGCAGTCGCTGCCGATCGACATCCGTGTGCTGGCAGAGCTGGCGCAGAAG
TGCCACGCCTACGCCAAGGCGCTCCACTACAAGGAGATCGAGTTCCAGAC
GTCGCCCGCGCTCTGCATCGAGGCGCTTATTAACATAAACAAGAAGCTCG
GCCAGCCCGAGGCCGCCATGGGCATCCTGACATACGCCCAGTCCCGTCTG
GGTTCTGTAATGGCCGTGAAGGAGTCCTGGCTGGCCAAGCTCGGCCACTG
GCAGGAGGCGCTCGCGCTGTACGGGCGGCGGCACGAAGCGGACCCCGCCG
ACGTCGGCGCCATCATTGGCTGCATGAAGTGTCTGGACGCGCTTGGCGAA
TGCGACGCGCTGCTGCGCATGTGCCGCGAGAGCTGGGCGGCGCTGACGAG
CGCCGAGGCTGCGGACGCCGACGACCGCGCGCACCGCAAGGCGGCGACGC
TGGCGGCGCGGGCGGCGTGGAACCTGGGGGAGTGGCGGCTGTTTGAGCAC
CATGTCGGCGCCATG back to topCoding sequence (CDS) from alignment at P-wetherbeei_contig10058:933..1947+ >mRNA_P-wetherbeei_contig10058.1.2 ID=mRNA_P-wetherbeei_contig10058.1.2|Name=mRNA_P-wetherbeei_contig10058.1.2|organism=Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79|type=CDS|length=879bp|location=Sequence derived from alignment at P-wetherbeei_contig10058:933..1947+ (Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79) ATGGGCGTTCAAAAGCTGCACGTGAACCAGCAGAACCTGCAGCGTGCGTG GGACGTGACACAGCGCAGCACACGCGAAGACTGGGACGAGTGGATCCGCC GCTTCGCCGTCGAGGTGCTGCGCGAGTCGCCCTCACCGGCGCTGCGCAGC TGCAGCGCACTGGCGCAGGTCTATCAGCCGCTGGGACGGGAGCTGTTTCA CGCGGCCTTTGTGAGTTGCTGGTTTGAGCTGTCGGAGCCATACCAGGAGA ATTTGGTCAAGAGCCTCGAGGCGGCGTTCCGGAGCGCATCCATTCCCCCC GAGATTCTACAGATGCTGCTAAACTTGGCCGAGTTCATGGAGCACGAGGT CGAGGTGAGCACGCGAGGCTCGCTGCCGATCGACATCCGTGTGCTGGCAG AGCTGGCGCAGAAGTGCCACGCCTACGCCAAGGCGCTCCACTACAAGGAG ATCGAGTTCCAGACGTCGCCCGCGCTCTGCATCGAGGCGCTTATTAACAT AAACAAGAAGCTCGGCCAGCCCGAGGCCGCCATGGGCATCCTGACATACG CCCAGTCCCGTCTGGGTTCTGTAATGGCCGTGAAGGAGTCCTGGCTGGCC AAGCTCGGCCACTGGCAGGAGGCGCTCGCGCTGTACGGGCGGCGGCACGA AGCGGACCCCGCCGACGTCGGCGCCATCATTGGCTGCATGAAGTGTCTGG ACGCGCTTGGCGAATGCGACGCGCTGCTGCGCATGTGCCGCGAGAGCTGG GCGGCGCTGACGAGCGCCGAGGCTGCGGACGCCGACGACCGCGCGCACCG CAAGGCGGCGACGCTGGCGGCGCGGGCGGCGTGGAACCTGGGGGAGTGGC GGCTGTTTGAGCACCATGTCGGCGCCATG back to top
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