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Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Alignments
The following features are aligned
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Properties
| Property Name | Value |
| Stop | 0 |
| Start | 0 |
| Seed ortholog | 2880.D8LNB7 |
| Preferred name | ATM |
| PFAMs | FAT,FATC,PI3_PI4_kinase,TAN |
| Model size | 1416 |
| Max annot lvl | 2759|Eukaryota |
| KEGG ko | ko:K04728 |
| KEGG Pathway | ko01524,ko03440,ko04064,ko04068,ko04110,ko04115,ko04210,ko04214,ko04218,ko05165,ko05166,ko05202,ko05206,map01524,map03440,map04064,map04068,map04110,map04115,map04210,map04214,map04218,map05165,map05166,map05202,map05206 |
| KEGG Module | M00295,M00691 |
| Hectar predicted targeting category | other localisation |
| GOs | GO:0000003,GO:0000075,GO:0000077,GO:0000278,GO:0000280,GO:0000706,GO:0000723,GO:0000724,GO:0000725,GO:0000726,GO:0000729,GO:0000956,GO:0001541,GO:0001666,GO:0001756,GO:0001775,GO:0001894,GO:0001895,GO:0001932,GO:0001934,GO:0002200,GO:0002327,GO:0002329,GO:0002331,GO:0002376,GO:0002377,GO:0002440,GO:0002520,GO:0002521,GO:0002562,GO:0002682,GO:0002683,GO:0002694,GO:0002695,GO:0003002,GO:0003006,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004672,GO:0004674,GO:0004677,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005730,GO:0005737,GO:0005819,GO:0005856,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006260,GO:0006281,GO:0006302,GO:0006303,GO:0006310,GO:0006325,GO:0006342,GO:0006348,GO:0006355,GO:0006401,GO:0006402,GO:0006403,GO:0006464,GO:0006468,GO:0006629,GO:0006644,GO:0006650,GO:0006661,GO:0006725,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006915,GO:0006950,GO:0006974,GO:0006975,GO:0006977,GO:0006996,GO:0007049,GO:0007050,GO:0007059,GO:0007088,GO:0007093,GO:0007094,GO:0007095,GO:0007127,GO:0007131,GO:0007140,GO:0007143,GO:0007154,GO:0007165,GO:0007275,GO:0007276,GO:0007281,GO:0007292,GO:0007346,GO:0007389,GO:0007399,GO:0007417,GO:0007420,GO:0007507,GO:0007548,GO:0007568,GO:0007569,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008219,GO:0008285,GO:0008334,GO:0008340,GO:0008406,GO:0008585,GO:0008610,GO:0008630,GO:0008654,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009314,GO:0009410,GO:0009628,GO:0009653,GO:0009790,GO:0009791,GO:0009792,GO:0009888,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009891,GO:0009892,GO:0009893,GO:0009894,GO:0009896,GO:0009952,GO:0009966,GO:0009967,GO:0009968,GO:0009987,GO:0009994,GO:0010033,GO:0010165,GO:0010212,GO:0010243,GO:0010259,GO:0010332,GO:0010389,GO:0010468,GO:0010506,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010558,GO:0010562,GO:0010564,GO:0010604,GO:0010605,GO:0010629,GO:0010638,GO:0010639,GO:0010646,GO:0010647,GO:0010648,GO:0010941,GO:0010942,GO:0010948,GO:0010965,GO:0010972,GO:0012501,GO:0014070,GO:0014074,GO:0015630,GO:0016043,GO:0016070,GO:0016071,GO:0016233,GO:0016301,GO:0016303,GO:0016310,GO:0016444,GO:0016458,GO:0016569,GO:0016570,GO:0016572,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0018105,GO:0018193,GO:0018209,GO:0019219,GO:0019220,GO:0019222,GO:0019439,GO:0019538,GO:0019637,GO:0019953,GO:0022402,GO:0022412,GO:0022414,GO:0023051,GO:0023052,GO:0023056,GO:0023057,GO:0030071,GO:0030097,GO:0030098,GO:0030154,GO:0030163,GO:0030183,GO:0030258,GO:0030330,GO:0030717,GO:0030888,GO:0030889,GO:0031000,GO:0031056,GO:0031058,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031328,GO:0031329,GO:0031331,GO:0031334,GO:0031347,GO:0031348,GO:0031399,GO:0031401,GO:0031503,GO:0031570,GO:0031571,GO:0031572,GO:0031577,GO:0031974,GO:0031981,GO:0032006,GO:0032007,GO:0032200,GO:0032204,GO:0032205,GO:0032206,GO:0032210,GO:0032212,GO:0032268,GO:0032270,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032504,GO:0032944,GO:0032945,GO:0032991,GO:0033036,GO:0033043,GO:0033044,GO:0033045,GO:0033046,GO:0033047,GO:0033048,GO:0033127,GO:0033129,GO:0033151,GO:0033554,GO:0034350,GO:0034351,GO:0034397,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034655,GO:0035004,GO:0035173,GO:0035264,GO:0035282,GO:0035556,GO:0035825,GO:0036092,GO:0036211,GO:0036270,GO:0036289,GO:0036293,GO:0040007,GO:0040029,GO:0042113,GO:0042127,GO:0042157,GO:0042159,GO:0042221,GO:0042325,GO:0042327,GO:0042493,GO:0042592,GO:0042770,GO:0042981,GO:0043009,GO:0043030,GO:0043065,GO:0043066,GO:0043067,GO:0043068,GO:0043069,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043233,GO:0043254,GO:0043279,GO:0043412,GO:0043516,GO:0043517,GO:0043523,GO:0043525,GO:0044087,GO:0044089,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044267,GO:0044270,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044428,GO:0044430,GO:0044446,GO:0044464,GO:0044703,GO:0044773,GO:0044774,GO:0044783,GO:0044818,GO:0044819,GO:0044877,GO:0045017,GO:0045088,GO:0045132,GO:0045137,GO:0045141,GO:0045143,GO:0045321,GO:0045494,GO:0045786,GO:0045787,GO:0045814,GO:0045824,GO:0045839,GO:0045841,GO:0045892,GO:0045930,GO:0045934,GO:0045935,GO:0045937,GO:0046474,GO:0046483,GO:0046486,GO:0046488,GO:0046545,GO:0046649,GO:0046660,GO:0046700,GO:0046777,GO:0046834,GO:0046854,GO:0046983,GO:0047485,GO:0048232,GO:0048285,GO:0048468,GO:0048477,GO:0048513,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0048534,GO:0048538,GO:0048583,GO:0048584,GO:0048585,GO:0048589,GO:0048599,GO:0048608,GO:0048609,GO:0048646,GO:0048731,GO:0048732,GO:0048856,GO:0048869,GO:0048871,GO:0050000,GO:0050670,GO:0050672,GO:0050776,GO:0050777,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050864,GO:0050865,GO:0050866,GO:0050869,GO:0050896,GO:0051052,GO:0051053,GO:0051054,GO:0051128,GO:0051129,GO:0051130,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051173,GO:0051174,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051236,GO:0051246,GO:0051247,GO:0051249,GO:0051250,GO:0051252,GO:0051253,GO:0051276,GO:0051303,GO:0051321,GO:0051402,GO:0051409,GO:0051640,GO:0051641,GO:0051649,GO:0051656,GO:0051704,GO:0051716,GO:0051726,GO:0051783,GO:0051784,GO:0051983,GO:0051985,GO:0052742,GO:0060249,GO:0060255,GO:0060322,GO:0060429,GO:0060548,GO:0061053,GO:0061458,GO:0061982,GO:0061988,GO:0065007,GO:0065008,GO:0070013,GO:0070192,GO:0070482,GO:0070663,GO:0070664,GO:0070727,GO:0070997,GO:0071044,GO:0071156,GO:0071158,GO:0071173,GO:0071174,GO:0071214,GO:0071478,GO:0071479,GO:0071480,GO:0071481,GO:0071500,GO:0071704,GO:0071840,GO:0072331,GO:0072359,GO:0072395,GO:0072401,GO:0072413,GO:0072422,GO:0072425,GO:0072431,GO:0072434,GO:0080090,GO:0080134,GO:0080135,GO:0090068,GO:0090220,GO:0090304,GO:0090399,GO:0090407,GO:0097190,GO:0097193,GO:0097694,GO:0097695,GO:0098813,GO:0104004,GO:0140013,GO:0140096,GO:1900034,GO:1901214,GO:1901215,GO:1901216,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575,GO:1901576,GO:1901698,GO:1901796,GO:1901798,GO:1901987,GO:1901988,GO:1901990,GO:1901991,GO:1902099,GO:1902100,GO:1902275,GO:1902400,GO:1902402,GO:1902403,GO:1902531,GO:1902532,GO:1902533,GO:1902679,GO:1902749,GO:1902750,GO:1902806,GO:1902807,GO:1903046,GO:1903047,GO:1903432,GO:1903506,GO:1903507,GO:1903624,GO:1903626,GO:1903978,GO:1904262,GO:1904353,GO:1904354,GO:1904356,GO:1904358,GO:1904882,GO:1904884,GO:1905269,GO:1905818,GO:1905819,GO:1905843,GO:1990164,GO:1990391,GO:2000045,GO:2000112,GO:2000113,GO:2000134,GO:2000278,GO:2000573,GO:2000816,GO:2001020,GO:2001022,GO:2001141,GO:2001228,GO:2001251,GO:2001252 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| Exons | 6 |
| Evalue | 2.92e-11 |
| EggNOG OGs | KOG0892@1|root,KOG0892@2759|Eukaryota |
| EC | 2.7.11.1 |
| Description | protein serine/threonine kinase activity |
| Cds size | 1416 |
| COG category | T |
| BRITE | ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01001,ko03032,ko03400 |
Relationships
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type | Position |
| 1683187026.7845194-CDS-P-wetherbeei_contig8214:59..319 | 1683187026.7845194-CDS-P-wetherbeei_contig8214:59..319 | Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79 | CDS | P-wetherbeei_contig8214 60..319 - |
| 1683187026.7989347-CDS-P-wetherbeei_contig8214:477..790 | 1683187026.7989347-CDS-P-wetherbeei_contig8214:477..790 | Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79 | CDS | P-wetherbeei_contig8214 478..790 - |
| 1683187026.8099837-CDS-P-wetherbeei_contig8214:1171..1366 | 1683187026.8099837-CDS-P-wetherbeei_contig8214:1171..1366 | Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79 | CDS | P-wetherbeei_contig8214 1172..1366 - |
| 1683187026.8182688-CDS-P-wetherbeei_contig8214:1695..1899 | 1683187026.8182688-CDS-P-wetherbeei_contig8214:1695..1899 | Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79 | CDS | P-wetherbeei_contig8214 1696..1899 - |
| 1683187026.8270755-CDS-P-wetherbeei_contig8214:2179..2387 | 1683187026.8270755-CDS-P-wetherbeei_contig8214:2179..2387 | Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79 | CDS | P-wetherbeei_contig8214 2180..2387 - |
| 1683187026.836293-CDS-P-wetherbeei_contig8214:2494..2730 | 1683187026.836293-CDS-P-wetherbeei_contig8214:2494..2730 | Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79 | CDS | P-wetherbeei_contig8214 2495..2730 - |
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of mRNA_P-wetherbeei_contig8214.1.1 >prot_P-wetherbeei_contig8214.1.1 ID=prot_P-wetherbeei_contig8214.1.1|Name=mRNA_P-wetherbeei_contig8214.1.1|organism=Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79|type=polypeptide|length=472bp
GEGGKRRSGAREKASSCHSSLWRRPASPFHTDMSLRLKVTQACTELRSKR ATDRKKAAQEVMNLVASEAIKSLLFSEPGLWSNLVASTVHAAKYSAEFIG TRAKEPPQEAARLLWYLVRMSDDTLLRSLASKADVVLHHLRKSLADDRVR LILEVNYMPTLIRLLSSPTFLECVTPEEFEHVLRFLMEMAPRPRAHPSYA ICLQQLLCNYGRDIHTRLEPVVQSIARWCAHSHDALAPAVLHVFPALVAL LQSYGATCAPMLCAHGRDIYIFVMRTEAKWKRNFKDHVLAYLRLHLHIAA AAARTDASGGSDDPIMGQLDHLLALLLREADIVSAVSSAAIHTRGGRGAV VQPLDRKAREHVLACADVMRFWRERHGGGDGRGCQGTAAAVSQVDEERAR KRRRRVDPWKEVKGSLLRCLQPQPNSGSSPTSRGGALSAAVMAAGGATAG GAAAGGGRGGDGGGVAAGGERG back to topmRNA from alignment at P-wetherbeei_contig8214:60..2730- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >mRNA_P-wetherbeei_contig8214.1.1 ID=mRNA_P-wetherbeei_contig8214.1.1|Name=mRNA_P-wetherbeei_contig8214.1.1|organism=Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79|type=mRNA|length=2671bp|location=Sequence derived from alignment at P-wetherbeei_contig8214:60..2730- (Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79) GGAGAGGGCGGGAAAAGGCGTAGTGGAGCGCGGGAAAAGGCCTCTTCCTG
CCATTCTTCTCTTTGGAGGCGTCCAGCCTCTCCCTTCCATACAGACATGT
CTTTGCGGTTAAAAGTTACACAGGCATGCACTGAGCTTCGATCGAAGCGC
GCCACGGACCGCAAGAAGGCTGCACAGGAGGTCATGAACTTGGTGGCGTC
GGAAGCCATCAAAAGCCTCCTCTTCTCCGAGCCTGGGTGAGTTCGAAGAT
GCGAAATCACCCCTCCTCACTTCAAACATTGGTCTCCTCTCAGCCTTCAC
CTTTCCATCTCTCACGCGATGGTCGGTGCTCATTTCGTTTCAGGCTTTGG
TCTAATCTCGTCGCAAGCACTGTGCATGCCGCCAAGTATAGTGCCGAGTT
CATCGGCACGAGAGCGAAGGAGCCACCGCAAGAGGCTGCACGGCTCCTCT
GGTACCTCGTGCGCATGTCAGACGATACGCTGCTGCGGAGCCTCGCCAGC
AAGGCGGACGTTGTGCTCCATCACTTGCGAAAGTCGCTGGCAGACGACAG
GGTGCGATTCGATTTTAGAGTTCTCGATCCGGCTTTAAGGCTCTAGATCA
AGAGAACGAAAAAGGAGCGCCGAAGTCGAATTCCGGGCCGTCGTTCATGT
CGTCTTCGAATTGGAGCCCCCTTTTGCCCTTGCTTTGTCTATGCTGGTGC
TGACTCTTTCTGTTGCTGACTTTTTAAAAGGTGAATGTCTTTCACTCCTG
TCGAACCCCGCCGTCATTTCCCACATCCTTTTCTTACACTCTCGTTTTCC
CCCTGTCTTTTCCGGGCTGGCCGGCCGGCAGGTGCGCCTGATCCTGGAGG
TCAACTACATGCCGACGCTGATCCGTCTGCTGTCGTCCCCAACATTCCTG
GAGTGCGTCACGCCGGAGGAGTTCGAGCACGTGCTCCGGTTCCTCATGGA
GATGGCGCCGCGGCCACGTGCCCACCCGTCCTACGCCATATGCTTGCAGC
AGCTGCTCTGCAACTACGGCCGCGACATCCACACGGTGAGGGCAGGAGGC
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GCGGCAGGCGGCGAACGTGGT back to topCoding sequence (CDS) from alignment at P-wetherbeei_contig8214:60..2730- >mRNA_P-wetherbeei_contig8214.1.1 ID=mRNA_P-wetherbeei_contig8214.1.1|Name=mRNA_P-wetherbeei_contig8214.1.1|organism=Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79|type=CDS|length=1416bp|location=Sequence derived from alignment at P-wetherbeei_contig8214:60..2730- (Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79) GGAGAGGGCGGGAAAAGGCGTAGTGGAGCGCGGGAAAAGGCCTCTTCCTG CCATTCTTCTCTTTGGAGGCGTCCAGCCTCTCCCTTCCATACAGACATGT CTTTGCGGTTAAAAGTTACACAGGCATGCACTGAGCTTCGATCGAAGCGC GCCACGGACCGCAAGAAGGCTGCACAGGAGGTCATGAACTTGGTGGCGTC GGAAGCCATCAAAAGCCTCCTCTTCTCCGAGCCTGGGCTTTGGTCTAATC TCGTCGCAAGCACTGTGCATGCCGCCAAGTATAGTGCCGAGTTCATCGGC ACGAGAGCGAAGGAGCCACCGCAAGAGGCTGCACGGCTCCTCTGGTACCT CGTGCGCATGTCAGACGATACGCTGCTGCGGAGCCTCGCCAGCAAGGCGG ACGTTGTGCTCCATCACTTGCGAAAGTCGCTGGCAGACGACAGGGTGCGC CTGATCCTGGAGGTCAACTACATGCCGACGCTGATCCGTCTGCTGTCGTC CCCAACATTCCTGGAGTGCGTCACGCCGGAGGAGTTCGAGCACGTGCTCC GGTTCCTCATGGAGATGGCGCCGCGGCCACGTGCCCACCCGTCCTACGCC ATATGCTTGCAGCAGCTGCTCTGCAACTACGGCCGCGACATCCACACGCG GCTGGAGCCGGTCGTGCAGTCCATCGCGCGGTGGTGCGCGCATTCGCACG ATGCACTGGCTCCGGCGGTGCTGCACGTCTTCCCGGCGCTCGTCGCCCTC CTCCAGAGCTACGGTGCCACGTGCGCCCCCATGCTGTGCGCCCACGGCCG CGACATCTACATCTTCGTGATGCGGACCGAGGCCAAGTGGAAGCGCAACT TCAAGGACCACGTCCTCGCGTACTTACGGCTGCATCTCCACATCGCCGCC GCCGCCGCCCGCACCGACGCGTCTGGCGGCAGCGACGACCCCATCATGGG CCAGCTGGACCACCTCCTGGCGCTGCTCCTGCGTGAGGCAGACATCGTGT CGGCCGTCAGCAGCGCGGCAATTCACACTCGGGGCGGCCGAGGCGCCGTG GTGCAGCCGCTTGACCGCAAGGCGCGCGAGCACGTGCTGGCGTGCGCAGA CGTCATGCGCTTCTGGCGGGAGCGCCATGGTGGCGGTGATGGACGCGGAT GCCAGGGCACAGCGGCAGCGGTGTCGCAAGTGGACGAGGAGCGTGCCCGA AAACGGCGGCGCCGCGTTGACCCGTGGAAGGAAGTGAAAGGATCCCTGCT GCGCTGCCTCCAGCCGCAGCCTAACAGCGGCAGCAGCCCCACGAGCCGTG GCGGCGCGTTAAGTGCGGCGGTCATGGCAGCAGGAGGCGCAACGGCAGGC GGCGCAGCGGCAGGCGGCGGACGTGGCGGTGACGGCGGCGGCGTAGCGGC AGGCGGCGAACGTGGT back to top
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