mRNA_M-pyrifera_M_contig77562.18252.1 (mRNA) Macrocystis pyrifera P11B4 male

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Overview
NamemRNA_M-pyrifera_M_contig77562.18252.1
Unique NamemRNA_M-pyrifera_M_contig77562.18252.1
TypemRNA
OrganismMacrocystis pyrifera P11B4 male (Macrocystis pyrifera P11B4 male (Giant kelp))
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of mRNA_M-pyrifera_M_contig77562.18252.1 vs. uniprot
Analysis Date: 2022-09-19 (Diamond blastx: OGS1.0 of Macrocystis pyrifera male vs UniRef90)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
M-pyrifera_M_contig77562contigM-pyrifera_M_contig77562:623..945 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Diamond blastx: OGS1.0 of Macrocystis pyrifera male vs UniRef902022-09-19
OGS1.0 of Macrocystis pyrifera P11B4 male2021-02-24
Properties
Property NameValue
Taxonomic scopeEukaryota
Seed ortholog score64.7
Seed ortholog evalue2.3e-08
Seed eggNOG ortholog44689.DDB0238473
Preferred nameHTT
KEGG koko:K04533
KEGG Pathwayko05016,map05016
Hectar predicted targeting categoryother localisation
GOsGO:0000003,GO:0000050,GO:0000052,GO:0000132,GO:0000226,GO:0000278,GO:0000920,GO:0001672,GO:0001704,GO:0001707,GO:0001839,GO:0001840,GO:0001932,GO:0002009,GO:0002039,GO:0002790,GO:0003002,GO:0003008,GO:0003674,GO:0005102,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005522,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005737,GO:0005768,GO:0005770,GO:0005773,GO:0005776,GO:0005783,GO:0005794,GO:0005814,GO:0005815,GO:0005829,GO:0005856,GO:0005886,GO:0006082,GO:0006089,GO:0006090,GO:0006403,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006520,GO:0006807,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006820,GO:0006835,GO:0006836,GO:0006839,GO:0006865,GO:0006873,GO:0006874,GO:0006875,GO:0006888,GO:0006890,GO:0006915,GO:0006928,GO:0006935,GO:0006950,GO:0006970,GO:0006971,GO:0006996,GO:0007005,GO:0007006,GO:0007010,GO:0007017,GO:0007018,GO:0007029,GO:0007030,GO:0007049,GO:0007154,GO:0007155,GO:0007163,GO:0007165,GO:0007186,GO:0007204,GO:0007212,GO:0007267,GO:0007275,GO:0007276,GO:0007283,GO:0007369,GO:0007389,GO:0007399,GO:0007417,GO:0007420,GO:0007498,GO:0007568,GO:0007569,GO:0007610,GO:0007611,GO:0007612,GO:0007625,GO:0007626,GO:0007632,GO:0007638,GO:0008088,GO:0008092,GO:0008104,GO:0008134,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008219,GO:0008306,GO:0008340,GO:0008542,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009306,GO:0009314,GO:0009416,GO:0009605,GO:0009612,GO:0009628,GO:0009653,GO:0009790,GO:0009792,GO:0009887,GO:0009888,GO:0009892,GO:0009893,GO:0009894,GO:0009896,GO:0009914,GO:0009952,GO:0009966,GO:0009967,GO:0009968,GO:0009987,GO:0010035,GO:0010038,GO:0010256,GO:0010259,GO:0010466,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010506,GO:0010508,GO:0010522,GO:0010524,GO:0010605,GO:0010638,GO:0010646,GO:0010647,GO:0010648,GO:0010817,GO:0010821,GO:0010822,GO:0010847,GO:0010921,GO:0010941,GO:0010942,GO:0010951,GO:0010959,GO:0010970,GO:0010996,GO:0012501,GO:0012505,GO:0012506,GO:0014069,GO:0015031,GO:0015630,GO:0015631,GO:0015711,GO:0015800,GO:0015807,GO:0015833,GO:0015849,GO:0015893,GO:0015931,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016053,GO:0016192,GO:0016197,GO:0016234,GO:0016239,GO:0016241,GO:0016331,GO:0016339,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019220,GO:0019222,GO:0019244,GO:0019249,GO:0019538,GO:0019627,GO:0019725,GO:0019752,GO:0019805,GO:0019899,GO:0019900,GO:0019953,GO:0021537,GO:0021544,GO:0021756,GO:0021988,GO:0021990,GO:0022008,GO:0022402,GO:0022414,GO:0022610,GO:0022898,GO:0023051,GO:0023052,GO:0023056,GO:0023057,GO:0023061,GO:0030003,GO:0030010,GO:0030072,GO:0030073,GO:0030135,GO:0030136,GO:0030154,GO:0030162,GO:0030182,GO:0030424,GO:0030425,GO:0030659,GO:0030705,GO:0030900,GO:0031072,GO:0031090,GO:0031156,GO:0031223,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031325,GO:0031329,GO:0031331,GO:0031344,GO:0031346,GO:0031399,GO:0031410,GO:0031445,GO:0031453,GO:0031454,GO:0031585,GO:0031587,GO:0031647,GO:0031648,GO:0031974,GO:0031981,GO:0031982,GO:0032101,GO:0032104,GO:0032107,GO:0032268,GO:0032269,GO:0032279,GO:0032409,GO:0032411,GO:0032412,GO:0032414,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032504,GO:0032787,GO:0032838,GO:0032879,GO:0032880,GO:0032940,GO:0032956,GO:0032970,GO:0032991,GO:0033036,GO:0033043,GO:0033044,GO:0033365,GO:0033697,GO:0034452,GO:0034504,GO:0034613,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034762,GO:0034764,GO:0034765,GO:0034767,GO:0035176,GO:0035303,GO:0035304,GO:0035770,GO:0035864,GO:0036464,GO:0036477,GO:0040001,GO:0040011,GO:0042221,GO:0042297,GO:0042325,GO:0042330,GO:0042391,GO:0042445,GO:0042493,GO:0042592,GO:0042802,GO:0042886,GO:0042981,GO:0042995,GO:0043005,GO:0043009,GO:0043025,GO:0043043,GO:0043065,GO:0043066,GO:0043067,GO:0043068,GO:0043069,GO:0043086,GO:0043090,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043233,GO:0043254,GO:0043269,GO:0043270,GO:0043327,GO:0043436,GO:0043519,GO:0043520,GO:0043523,GO:0043524,GO:0043549,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043648,GO:0043650,GO:0043666,GO:0043900,GO:0044087,GO:0044089,GO:0044092,GO:0044093,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044297,GO:0044325,GO:0044380,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044428,GO:0044430,GO:0044433,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044450,GO:0044456,GO:0044459,GO:0044463,GO:0044464,GO:0044703,GO:0045184,GO:0045202,GO:0045505,GO:0045724,GO:0045799,GO:0045859,GO:0045861,GO:0046394,GO:0046483,GO:0046874,GO:0046879,GO:0046902,GO:0046903,GO:0046907,GO:0046942,GO:0047496,GO:0048167,GO:0048193,GO:0048232,GO:0048332,GO:0048339,GO:0048340,GO:0048341,GO:0048468,GO:0048471,GO:0048487,GO:0048489,GO:0048513,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0048583,GO:0048584,GO:0048585,GO:0048598,GO:0048609,GO:0048646,GO:0048666,GO:0048699,GO:0048729,GO:0048731,GO:0048856,GO:0048869,GO:0048878,GO:0050657,GO:0050658,GO:0050789,GO:0050790,GO:0050793,GO:0050794,GO:0050801,GO:0050804,GO:0050809,GO:0050848,GO:0050850,GO:0050877,GO:0050890,GO:0050896,GO:0051028,GO:0051049,GO:0051050,GO:0051128,GO:0051130,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051174,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051236,GO:0051246,GO:0051248,GO:0051279,GO:0051281,GO:0051282,GO:0051293,GO:0051294,GO:0051301,GO:0051336,GO:0051338,GO:0051346,GO:0051402,GO:0051480,GO:0051493,GO:0051592,GO:0051640,GO:0051641,GO:0051648,GO:0051649,GO:0051650,GO:0051653,GO:0051656,GO:0051703,GO:0051704,GO:0051705,GO:0051716,GO:0051881,GO:0051924,GO:0051928,GO:0051938,GO:0052547,GO:0052548,GO:0055065,GO:0055072,GO:0055074,GO:0055076,GO:0055080,GO:0055082,GO:0060176,GO:0060255,GO:0060322,GO:0060341,GO:0060429,GO:0060485,GO:0060491,GO:0060548,GO:0061024,GO:0065007,GO:0065008,GO:0065009,GO:0070013,GO:0070727,GO:0070997,GO:0071539,GO:0071598,GO:0071702,GO:0071704,GO:0071705,GO:0071840,GO:0071900,GO:0071941,GO:0071944,GO:0072132,GO:0072330,GO:0072384,GO:0072503,GO:0072507,GO:0072524,GO:0072525,GO:0072698,GO:0080090,GO:0080134,GO:0080135,GO:0090559,GO:0097060,GO:0097159,GO:0097447,GO:0097458,GO:0097479,GO:0097480,GO:0097708,GO:0098590,GO:0098596,GO:0098597,GO:0098598,GO:0098609,GO:0098742,GO:0098771,GO:0098794,GO:0098984,GO:0099003,GO:0099111,GO:0099177,GO:0099518,GO:0099568,GO:0099572,GO:0120025,GO:0120032,GO:0120034,GO:0120035,GO:0120038,GO:0120111,GO:1900180,GO:1901019,GO:1901021,GO:1901214,GO:1901215,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901615,GO:1901617,GO:1902017,GO:1902115,GO:1902117,GO:1902275,GO:1902463,GO:1902531,GO:1902533,GO:1902850,GO:1902855,GO:1902857,GO:1903047,GO:1903146,GO:1903169,GO:1903599,GO:1903827,GO:1904062,GO:1904064,GO:1904427,GO:1904502,GO:1904504,GO:1904580,GO:1905269,GO:1905289,GO:1905335,GO:1905337,GO:1905503,GO:1905505,GO:1905508,GO:1990904,GO:2000116,GO:2000117,GO:2000479,GO:2001233,GO:2001234,GO:2001236,GO:2001237,GO:2001252,GO:2001257,GO:2001259
EggNOG free text desc.regulation of aggrephagy
EggNOG OGs28IQ9@1,2QR1D@2759,3XE6G@554915
COG Functional cat.J
Best tax levelAmoebozoa
Best eggNOG OGNA|NA|NA
BRITEko00000,ko00001,ko03019,ko03029,ko04131
Exons2
Model size270
Cds size243
Stop0
Start1
Relationships

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
mRNA_M-pyrifera_M_contig77562.18252.1prot_M-pyrifera_M_contig77562.18252.1Macrocystis pyrifera P11B4 malepolypeptideM-pyrifera_M_contig77562 650..945 +


The following UTR feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
1622816676.406813-UTR-M-pyrifera_M_contig77562:622..6491622816676.406813-UTR-M-pyrifera_M_contig77562:622..649Macrocystis pyrifera P11B4 maleUTRM-pyrifera_M_contig77562 623..649 +
1692278113.318863-UTR-M-pyrifera_M_contig77562:622..6491692278113.318863-UTR-M-pyrifera_M_contig77562:622..649Macrocystis pyrifera P11B4 maleUTRM-pyrifera_M_contig77562 623..649 +


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
1622816676.4190617-CDS-M-pyrifera_M_contig77562:649..7631622816676.4190617-CDS-M-pyrifera_M_contig77562:649..763Macrocystis pyrifera P11B4 maleCDSM-pyrifera_M_contig77562 650..763 +
1692278113.3334146-CDS-M-pyrifera_M_contig77562:649..7631692278113.3334146-CDS-M-pyrifera_M_contig77562:649..763Macrocystis pyrifera P11B4 maleCDSM-pyrifera_M_contig77562 650..763 +
1622816676.4310052-CDS-M-pyrifera_M_contig77562:816..9451622816676.4310052-CDS-M-pyrifera_M_contig77562:816..945Macrocystis pyrifera P11B4 maleCDSM-pyrifera_M_contig77562 817..945 +
1692278113.3457801-CDS-M-pyrifera_M_contig77562:816..9451692278113.3457801-CDS-M-pyrifera_M_contig77562:816..945Macrocystis pyrifera P11B4 maleCDSM-pyrifera_M_contig77562 817..945 +


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of mRNA_M-pyrifera_M_contig77562.18252.1

>prot_M-pyrifera_M_contig77562.18252.1 ID=prot_M-pyrifera_M_contig77562.18252.1|Name=mRNA_M-pyrifera_M_contig77562.18252.1|organism=Macrocystis pyrifera P11B4 male|type=polypeptide|length=81bp
MPVYVELHNALLKQMTAGSTNASLDSTKLDVLTKACLKTLASAIRCAGQA
ILPYAGEIISYLSIHTDKYPGCVVECIHELF
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mRNA from alignment at M-pyrifera_M_contig77562:623..945+

Legend: UTRpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>mRNA_M-pyrifera_M_contig77562.18252.1 ID=mRNA_M-pyrifera_M_contig77562.18252.1|Name=mRNA_M-pyrifera_M_contig77562.18252.1|organism=Macrocystis pyrifera P11B4 male|type=mRNA|length=323bp|location=Sequence derived from alignment at M-pyrifera_M_contig77562:623..945+ (Macrocystis pyrifera P11B4 male)
GGCCAGCCGCTTGGTTTCTTTGCGAGCATGCCTGTGTATGTGGAGCTTCA
CAATGCTCTGCTCAAGCAGATGACAGCTGGCAGCACTAACGCCTCTTTGG
ATTCCACAAAGCTGGATGTCCTTACCAAGGCTTGTCTGAAGGTATGTTTT
CCGCGAGGAGCCCGTCAGCACAGAACAAGTGCTGACCAGAACAGACGCTT
GCGAGTGCCATCCGCTGTGCCGGGCAGGCCATTCTTCCGTATGCGGGAGA
GATCATCAGCTACTTGTCTATTCACACAGACAAGTACCCAGGCTGTGTGG
TGGAGTGCATTCACGAGCTTTTT
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Coding sequence (CDS) from alignment at M-pyrifera_M_contig77562:623..945+

>mRNA_M-pyrifera_M_contig77562.18252.1 ID=mRNA_M-pyrifera_M_contig77562.18252.1|Name=mRNA_M-pyrifera_M_contig77562.18252.1|organism=Macrocystis pyrifera P11B4 male|type=CDS|length=486bp|location=Sequence derived from alignment at M-pyrifera_M_contig77562:623..945+ (Macrocystis pyrifera P11B4 male)
ATGCCTGTGTATGTGGAGCTTCACAATGCTCTGCTCAAGCAGATGACAGC
TGGCAGCACTAACGCCTCTTTGGATTCCACAAAGCTGGATGTCCTTACCA
AGGCTTGTCTGAAGATGCCTGTGTATGTGGAGCTTCACAATGCTCTGCTC
AAGCAGATGACAGCTGGCAGCACTAACGCCTCTTTGGATTCCACAAAGCT
GGATGTCCTTACCAAGGCTTGTCTGAAGACGCTTGCGAGTGCCATCCGCT
GTGCCGGGCAGGCCATTCTTCCGTATGCGGGAGAGATCATCAGCTACTTG
TCTATTCACACAGACAAGTACCCAGGCTGTGTGGTGGAGTGCATTCACGA
GCTTTTTACGCTTGCGAGTGCCATCCGCTGTGCCGGGCAGGCCATTCTTC
CGTATGCGGGAGAGATCATCAGCTACTTGTCTATTCACACAGACAAGTAC
CCAGGCTGTGTGGTGGAGTGCATTCACGAGCTTTTT
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