mRNA_L-elsbetiae_contig14390.3238.1 (mRNA) Laminarionema elsbetiae ELsaHSoW15

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Overview


Name	mRNA_L-elsbetiae_contig14390.3238.1
Unique Name	mRNA_L-elsbetiae_contig14390.3238.1
Type	mRNA
Organism	Laminarionema elsbetiae ELsaHSoW15 (Laminarionema elsbetiae ELsaHSoW15)

Homology

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BLAST of mRNA_L-elsbetiae_contig14390.3238.1 vs. uniprot
Match: A0A6H5LE99_9PHAE (Myosin motor domain-containing protein n=2 Tax=Ectocarpus TaxID=2879 RepID=A0A6H5LE99_9PHAE)

HSP 1 Score: 391 bits (1004), Expect = 1.120e-124
Identity = 188/199 (94.47%), Postives = 194/199 (97.49%), Query Frame = 1

Query:    1 HRTVKVEGKTINVPLSPAAAADSLDGLAKEIYCRVFDWLVAKINDSMSCAKGSNKGTIDLLDIFGFETFEHNSFEQFCINYANEKLQQKFTQDVFKNVQVEYQEEGIPWSHIDFQDNAAVLGMIEEPRRGLLSLLDEECMLPQGTDEAYASKAVKAYKGHENFNKERFATKLEFTVHHYAGRVIYNTGGFVEKNKDQLQ 597
            HR+VKVEGKTINVPLSPAAA DSLDGLAKEIYCRVFDWLVAKINDSM C+ GSNKGTIDLLDIFGFETF+HNSFEQFCINYANEKLQQKFTQDVFKNVQVEYQEEGIPWSHIDFQDNAAVLGMIEEPRRGLLSLLDEECMLPQGTDEAYASKA+KAYK HENF K+RFATKLEFTVHHYAGRV+YNTGGFVEKNKDQLQ
Sbjct:  410 HRSVKVEGKTINVPLSPAAATDSLDGLAKEIYCRVFDWLVAKINDSMRCSDGSNKGTIDLLDIFGFETFQHNSFEQFCINYANEKLQQKFTQDVFKNVQVEYQEEGIPWSHIDFQDNAAVLGMIEEPRRGLLSLLDEECMLPQGTDEAYASKAIKAYKDHENFGKDRFATKLEFTVHHYAGRVVYNTGGFVEKNKDQLQ 608

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BLAST of mRNA_L-elsbetiae_contig14390.3238.1 vs. uniprot
Match: C9K4U6_SACJA (Unconventional myosin n=1 Tax=Saccharina japonica TaxID=88149 RepID=C9K4U6_SACJA)

HSP 1 Score: 372 bits (956), Expect = 6.970e-118
Identity = 180/199 (90.45%), Postives = 189/199 (94.97%), Query Frame = 1

Query:    1 HRTVKVEGKTINVPLSPAAAADSLDGLAKEIYCRVFDWLVAKINDSMSCAKGSNKGTIDLLDIFGFETFEHNSFEQFCINYANEKLQQKFTQDVFKNVQVEYQEEGIPWSHIDFQDNAAVLGMIEEPRRGLLSLLDEECMLPQGTDEAYASKAVKAYKGHENFNKERFATKLEFTVHHYAGRVIYNTGGFVEKNKDQLQ 597
            HRTV+VEGKTI+VPL PA A DSLDGLAKEIYCRVFDWLVAKINDS  CAKG+ KGTIDLLDIFGFETFEHNSFEQFCINYANEKLQQKFTQDVFKNVQVEYQ+EGIPWSHIDFQDNAAVLGMIEEPRRGLLSLLDEECMLPQGTDEA+ASKA KAYK HENF+K RFATKLEFTV+HYAG V+YNTGGFVEKN+DQLQ
Sbjct:  407 HRTVQVEGKTIDVPLPPAGATDSLDGLAKEIYCRVFDWLVAKINDSTRCAKGAVKGTIDLLDIFGFETFEHNSFEQFCINYANEKLQQKFTQDVFKNVQVEYQDEGIPWSHIDFQDNAAVLGMIEEPRRGLLSLLDEECMLPQGTDEAFASKAFKAYKDHENFDKSRFATKLEFTVNHYAGSVVYNTGGFVEKNRDQLQ 605

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BLAST of mRNA_L-elsbetiae_contig14390.3238.1 vs. uniprot
Match: A0A835YWV8_9STRA (P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase protein n=1 Tax=Tribonema minus TaxID=303371 RepID=A0A835YWV8_9STRA)

HSP 1 Score: 212 bits (539), Expect = 1.020e-61
Identity = 107/200 (53.50%), Postives = 146/200 (73.00%), Query Frame = 1

Query:    1 HRTVKVEGKTINVPLSPAAAADSLDGLAKEIYCRVFDWLVAKINDSMSCAKGSNKGTIDLLDIFGFETFEHNSFEQFCINYANEKLQQKFTQDVFKNVQVEYQEEGIPWSHIDFQDNAAVLGMIEEPRRGLLSLLDEECMLPQGTDEAYASKAVKAYKGHENFNK-ERFATKLEFTVHHYAGRVIYNTGGFVEKNKDQLQ 597
             R +    ++I V LS   AA++ DGLAKE+Y R+FDWLVA+IN S +    + +  + LLDIFGFE+F  NSFEQFCINYANEKLQQKFT+DVFK VQVEY  EGI WSHID++DNA+ L ++E  R G+ +LLDEE +LP+G++EA+ +KA KA+  H +F +  + +  +EFT+ HYAG + Y   G+++KNKD +Q
Sbjct:  310 RRVITARMESIEVLLSVDRAAEACDGLAKEVYFRLFDWLVARINQSTNHPASAAR-KVGLLDIFGFESFAVNSFEQFCINYANEKLQQKFTEDVFKTVQVEYASEGIAWSHIDYKDNASTLDLLEAFRTGMFALLDEEGVLPKGSEEAFVTKATKAHVQHASFLRTNKGSGGVEFTIRHYAGDINYTALGWLDKNKDTIQ 508

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BLAST of mRNA_L-elsbetiae_contig14390.3238.1 vs. uniprot
Match: A0A6H5K1W6_9PHAE (Myosin motor domain-containing protein n=1 Tax=Ectocarpus sp. CCAP 1310/34 TaxID=867726 RepID=A0A6H5K1W6_9PHAE)

HSP 1 Score: 211 bits (537), Expect = 6.300e-60
Identity = 107/219 (48.86%), Postives = 143/219 (65.30%), Query Frame = 1

Query:    1 HRTVKVEGKTINVPLSPAAAADSLDGLAKEIYCRVFDWLVAKINDSM-SCAKGSNK--------------------GTIDLLDIFGFETFEHNSFEQFCINYANEKLQQKFTQDVFKNVQVEYQEEGIPWSHIDFQDNAAVLGMIEEPRRGLLSLLDEECMLPQGTDEAYASKAVKAYKGHENFNKERFATKLEFTVHHYAGRVIYNTGGFVEKNKDQL 594
            +RT++     +    SPA AAD+ D +AK IY  +F+WLV +IN S  S A  +N                     GT+ LLDIFGFE+F+ N FEQ CINYANEKLQQKFTQDVFKNVQ EY+EEGIPWSH+DF DNA VLG++E  R G++++L+EEC+ P+G D ++ SK    +  H  F + + A   EF+V HYAG V+Y+  GF++KN+D +
Sbjct:  390 YRTIRARNDVLRADSSPAQAADARDAMAKAIYGGLFEWLVERINRSTASSAPDANGPGGAGPGAKTRHAGEALAPGGTVALLDIFGFESFKVNRFEQLCINYANEKLQQKFTQDVFKNVQAEYEEEGIPWSHVDFSDNAEVLGLVES-RMGIIAVLNEECVRPRGGDNSFVSKLATLHADHSAFARAKLAGPFEFSVRHYAGEVLYHAEGFLDKNRDSV 607

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BLAST of mRNA_L-elsbetiae_contig14390.3238.1 vs. uniprot
Match: A0A484ECT1_BRELC (Myosin motor domain-containing protein n=1 Tax=Bremia lactucae TaxID=4779 RepID=A0A484ECT1_BRELC)

HSP 1 Score: 211 bits (536), Expect = 1.270e-59
Identity = 106/198 (53.54%), Postives = 135/198 (68.18%), Query Frame = 1

Query:    1 HRTVKVEGKTINVPLSPAAAADSLDGLAKEIYCRVFDWLVAKINDSMSCAKGSNKGTIDLLDIFGFETFEHNSFEQFCINYANEKLQQKFTQDVFKNVQVEYQEEGIPWSHIDFQDNAAVLGMIEEPRRGLLSLLDEECMLPQGTDEAYASKAVKAYKGHENFNKERFATKLEFTVHHYAGRVIYNTGGFVEKNKDQL 594
            HRT+K  G+   VPL+   A    D LAK IY  +FDWLVA IN S+         TI +LDIFGFE+FEHNSFEQ CINYANEKLQQKFTQDVF++VQ EY+ E I W+HI + DN+  LG+IE  R GLL+LL+EE + P+G +E + SK   AY  H+   +    +K +F +HHYAG V+Y+  GF+EK+KD L
Sbjct:  165 HRTMKAAGEIYLVPLTVEQAQSGRDALAKAIYASIFDWLVAGINASLGAKAQQTTSTIGVLDIFGFESFEHNSFEQLCINYANEKLQQKFTQDVFRSVQEEYEREQITWAHIAYADNSETLGLIES-RMGLLALLNEEIVRPRGHEEGFVSKLSSAYCKHKTLIEFPRISKTQFAIHHYAGTVLYDATGFLEKHKDAL 361

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BLAST of mRNA_L-elsbetiae_contig14390.3238.1 vs. uniprot
Match: A0A7S1TR97_9STRA (Hypothetical protein (Fragment) n=1 Tax=Phaeomonas parva TaxID=124430 RepID=A0A7S1TR97_9STRA)

HSP 1 Score: 200 bits (509), Expect = 6.140e-59
Identity = 104/202 (51.49%), Postives = 135/202 (66.83%), Query Frame = 1

Query:    4 RTVKVEGKTINVPLSPAAAADSLDGLAKEIYCRVFDWLVAKINDSMSCAK-----GSNKGTIDLLDIFGFETFEHNSFEQFCINYANEKLQQKFTQDVFKNVQVEYQEEGIPWSHIDFQDNAAVLGMIEEPRRGLLSLLDEECMLPQGTDEAYASKAVKAYKGHENFNKERFATKLEFTVHHYAGRVIYNTGGFVEKNKDQL 594
            R V   G++  VPL+   AA+S D LAK++Y R+FD +V +IN S + ++        +GTI LLDIFGFE+F  N FEQ CINYANEKLQQKFTQDVFK VQ EY+EEGI WS +DF DNA+ L +IE  R G++S+L+EEC+ P+G+D A  SK    +  HE+F+K        F V HYAG V Y   G ++KN+D L
Sbjct:   45 RIVSARGESYTVPLTLEKAANSRDALAKDLYARLFDEVVRRINGSTAASEQPAEADERRGTISLLDIFGFESFTVNRFEQLCINYANEKLQQKFTQDVFKTVQTEYEEEGIEWSFVDFVDNASTLALIEA-RMGIISVLNEECVRPRGSDGALVSKLASLHMDHESFDKPAKLRDTGFIVRHYAGAVTYMVDGILDKNRDAL 245

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BLAST of mRNA_L-elsbetiae_contig14390.3238.1 vs. uniprot
Match: A0A7S1VYN9_ALECA (Hypothetical protein (Fragment) n=1 Tax=Alexandrium catenella TaxID=2925 RepID=A0A7S1VYN9_ALECA)

HSP 1 Score: 195 bits (496), Expect = 1.860e-58
Identity = 94/200 (47.00%), Postives = 133/200 (66.50%), Query Frame = 1

Query:    1 HRTVKVEGKTINVPLSPAAAADSLDGLAKEIYCRVFDWLVAKINDSMSCAKGSNKGTIDLLDIFGFETFEHNSFEQFCINYANEKLQQKFTQDVFKNVQVEYQEEGIPWSHIDFQDNAAVLGMIEEPRRGLLSLLDEECMLPQGTDEAYASKAVKAYKGHENFNKERFAT--KLEFTVHHYAGRVIYNTGGFVEKNKDQL 594
             RT+++  +    PL P AA ++ D  AKE+Y RVFDWLV +I  + S     +   + LLDIFGFE+F  N F QFCINYANEKLQQKFT DVFK VQ EY +EGIPW  I+F+DNA +L ++E  + G++++L+EEC+ P+G DE + SK    +K    F+  +     +++FT+ HYAG V+Y   G++E+NKD +
Sbjct:    9 QRTIRMRSEVFVKPLPPGAAIETRDATAKELYARVFDWLVGRICAATSAPSAQSNHFVGLLDIFGFESFAINRFAQFCINYANEKLQQKFTLDVFKAVQQEYSDEGIPWERIEFKDNAPLLALVES-KLGIIAMLNEECVRPKGNDENFVSKLSTVHKADPAFSTPKLGAHREVQFTIKHYAGPVLYTASGWLERNKDTI 207

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BLAST of mRNA_L-elsbetiae_contig14390.3238.1 vs. uniprot
Match: D8LHM3_ECTSI (Myosin motor domain-containing protein n=1 Tax=Ectocarpus siliculosus TaxID=2880 RepID=D8LHM3_ECTSI)

HSP 1 Score: 206 bits (524), Expect = 6.140e-58
Identity = 105/219 (47.95%), Postives = 141/219 (64.38%), Query Frame = 1

Query:    1 HRTVKVEGKTINVPLSPAAAADSLDGLAKEIYCRVFDWLVAKINDSMSC--------------AKGSNKG-------TIDLLDIFGFETFEHNSFEQFCINYANEKLQQKFTQDVFKNVQVEYQEEGIPWSHIDFQDNAAVLGMIEEPRRGLLSLLDEECMLPQGTDEAYASKAVKAYKGHENFNKERFATKLEFTVHHYAGRVIYNTGGFVEKNKDQL 594
            +RT++     +    SPA AAD+ D +AK IY  +F+WLV +IN S +               AK  + G       T+ LLDIFGFE+F+ N FEQ CINYANEKLQQKFTQDVFKNVQ EY+EEGIPWSH+DF DNA VLG++E  R G++++L+EEC+ P+G D ++ SK    +  H  F + + A   EF+V HY G  +Y+  GF++KN+D L
Sbjct:  435 YRTIRARNDVLRADSSPAQAADARDAMAKAIYGGLFEWLVERINRSTASSAPDADGPGGAGAGAKTRHAGEALAPGGTVALLDIFGFESFKVNRFEQLCINYANEKLQQKFTQDVFKNVQAEYEEEGIPWSHVDFSDNAEVLGLVES-RMGIIAVLNEECVRPRGGDNSFVSKLATLHADHSAFARAKLAGPFEFSVGHYPGEFLYHAEGFLDKNRDSL 652

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BLAST of mRNA_L-elsbetiae_contig14390.3238.1 vs. uniprot
Match: A0A7S2WAC4_9STRA (Hypothetical protein n=1 Tax=Rhizochromulina marina TaxID=1034831 RepID=A0A7S2WAC4_9STRA)

HSP 1 Score: 204 bits (518), Expect = 2.510e-57
Identity = 105/198 (53.03%), Postives = 135/198 (68.18%), Query Frame = 1

Query:    1 HRTVKVEGKTINVPLSPAAAADSLDGLAKEIYCRVFDWLVAKINDSMSCAKGSNKGTIDLLDIFGFETFEHNSFEQFCINYANEKLQQKFTQDVFKNVQVEYQEEGIPWSHIDFQDNAAVLGMIEEPRRGLLSLLDEECMLPQGTDEAYASKAVKAYKGHENFNKERFATKLEFTVHHYAGRVIYNTGGFVEKNKDQL 594
             RT++   +   VPL  + A+ +   LAKE+Y RVFD+LV +IN+S S A  S   TI LLDIFGFE F+ NSFEQ CINYANEKLQQKFT DVFK+VQ EY  E IPW  I F+DN+  L +IE  R G++S+L EEC  P+G+DE++ SK    +  H +F++ +   K +FT+HHYAG V Y   GF+EKNKD L
Sbjct:  233 ERTMRARDEVYAVPLKASDASLATGSLAKELYARVFDFLVHRINESTSAAASSVHRTIALLDIFGFEFFKVNSFEQLCINYANEKLQQKFTHDVFKSVQEEYTRECIPWESIAFKDNSETLALIEA-RMGVISVLTEECRRPKGSDESFVSKLGTLHGKHPDFSQPKLHAKTQFTIHHYAGAVPYTVTGFLEKNKDHL 429

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BLAST of mRNA_L-elsbetiae_contig14390.3238.1 vs. uniprot
Match: A0A2P4YJE3_9STRA (Myosin-like protein (Fragment) n=2 Tax=Phytophthora palmivora var. palmivora TaxID=611791 RepID=A0A2P4YJE3_9STRA)

HSP 1 Score: 204 bits (519), Expect = 2.590e-57
Identity = 105/198 (53.03%), Postives = 131/198 (66.16%), Query Frame = 1

Query:    1 HRTVKVEGKTINVPLSPAAAADSLDGLAKEIYCRVFDWLVAKINDSMSCAKGSNKGTIDLLDIFGFETFEHNSFEQFCINYANEKLQQKFTQDVFKNVQVEYQEEGIPWSHIDFQDNAAVLGMIEEPRRGLLSLLDEECMLPQGTDEAYASKAVKAYKGHENFNKERFATKLEFTVHHYAGRVIYNTGGFVEKNKDQL 594
            HRT+K  G+   VPL+   A    D LAK IY  +FDWLVA IN S+  A      TI +LDIFGFE+FEHNSFEQ CINYANEKLQQKFTQDVFK VQ EY+ E I W+HI + DN+  L +IE  R G+L+LL+EE + P+G +E + SK   AY   +   +    +K +F +HHYAG V Y   GF+EK+KD L
Sbjct:   94 HRTMKAAGEVYLVPLTVEQAQSGRDALAKAIYASIFDWLVAGINASLGAAARRTANTIGVLDIFGFESFEHNSFEQLCINYANEKLQQKFTQDVFKAVQEEYEREQITWAHIAYADNSETLALIEG-RMGVLALLNEEIVRPRGNEEGFVSKLSSAYLKQKKLVEFPRISKTQFAIHHYAGTVKYEATGFLEKHKDAL 290

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of mRNA_L-elsbetiae_contig14390.3238.1 vs. uniprot

BLAST of mRNA_L-elsbetiae_contig14390.3238.1 vs. uniprot
Analysis Date: 2022-09-19 (Diamond blastx: OGS1.0 vs UniRef90)
Total hits: 25


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A6H5LE99_9PHAE	1.120e-124	94.47	Myosin motor domain-containing protein n=2 Tax=Ect...	[more]
C9K4U6_SACJA	6.970e-118	90.45	Unconventional myosin n=1 Tax=Saccharina japonica ...	[more]
A0A835YWV8_9STRA	1.020e-61	53.50	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolas...	[more]
A0A6H5K1W6_9PHAE	6.300e-60	48.86	Myosin motor domain-containing protein n=1 Tax=Ect...	[more]
A0A484ECT1_BRELC	1.270e-59	53.54	Myosin motor domain-containing protein n=1 Tax=Bre...	[more]
A0A7S1TR97_9STRA	6.140e-59	51.49	Hypothetical protein (Fragment) n=1 Tax=Phaeomonas...	[more]
A0A7S1VYN9_ALECA	1.860e-58	47.00	Hypothetical protein (Fragment) n=1 Tax=Alexandriu...	[more]
D8LHM3_ECTSI	6.140e-58	47.95	Myosin motor domain-containing protein n=1 Tax=Ect...	[more]
A0A7S2WAC4_9STRA	2.510e-57	53.03	Hypothetical protein n=1 Tax=Rhizochromulina marin...	[more]
A0A2P4YJE3_9STRA	2.590e-57	53.03	Myosin-like protein (Fragment) n=2 Tax=Phytophthor...	[more]

Pages

Alignments

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
L-elsbetiae_contig14390	contig	L-elsbetiae_contig14390:611..4223 +

Analyses

This mRNA is derived from or has results from the following analyses


Analysis Name	Date Performed
Diamond blastx: OGS1.0 vs UniRef90	2022-09-19
OGS1.0 of Laminarionema elsbetiae ELsaHSoW15	2021-02-24

Properties


Property Name	Value
Taxonomic scope	Eukaryota
Seed ortholog score	390.6
Seed ortholog evalue	4.4e-106
Seed eggNOG ortholog	2880.D7G0D6
Preferred name	MYO19
KEGG ko	ko:K10356,ko:K10357,ko:K22366
Hectar predicted targeting category	other localisation
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:0042759,GO:0042802,GO:0042803,GO:0042886,GO:0042995,GO:0043005,GO:0043008,GO:0043025,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043197,GO:0043200,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043254,GO:0043269,GO:0043325,GO:0043332,GO:0043434,GO:0043436,GO:0043473,GO:0043531,GO:0043588,GO:0043900,GO:0043902,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044087,GO:0044089,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044297,GO:0044309,GO:0044380,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044428,GO:0044429,GO:0044430,GO:0044433,GO:0044441,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044448,GO:0044456,GO:0044459,GO:0044463,GO:0044464,GO:0044550,GO:0044703,GO:0044706,GO:0044764,GO:0044837,GO:0044877,GO:0045033,GO:0045111,GO:0045165,GO:0045177,GO:0045179,GO:0045184,GO:0045202,GO:0045335,GO:0045595,GO:0045597,GO:0045664,GO:0045666,GO:0045773,GO:0045856,GO:0045921,GO:0045927,GO:0045995,GO:0046148,GO:0046189,GO:0046394,GO:0046530,GO:0046677,GO:0046683,GO:0046847,GO:0046872,GO:0046879,GO:0046903,GO:0046907,GO:0046982,GO:0046983,GO:0047497,GO:0048066,GO:0048193,GO:0048232,GO:0048278,GO:0048306,GO:0048308,GO:0048309,GO:0048311,GO:0048313,GO:0048364,GO:0048366,GO:0048367,GO:0048438,GO:0048467,GO:0048468,GO:0048469,GO:0048471,GO:0048513,GO:0048515,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0048583,GO:0048584,GO:0048588,GO:0048589,GO:0048592,GO:0048608,GO:0048609,GO:0048638,GO:0048639,GO:0048646,GO:0048666,GO:0048667,GO:0048699,GO:0048731,GO:0048749,GO:0048764,GO:0048765,GO:0048767,GO:0048768,GO:0048770,GO:0048812,GO:0048813,GO:0048814,GO:0048820,GO:0048827,GO:0048856,GO:0048858,GO:0048868,GO:0048869,GO:0048870,GO:0048871,GO:0048878,GO:0050767,GO:0050769,GO:0050770,GO:0050772,GO:0050773,GO:0050775,GO:0050776,GO:0050778,GO:0050789,GO:0050793,GO:0050794,GO:0050808,GO:0050848,GO:0050877,GO:0050878,GO:0050891,GO:0050896,GO:0050900,GO:0050931,GO:0050953,GO:0050982,GO:0051015,GO:0051017,GO:0051020,GO:0051046,GO:0051047,GO:0051049,GO:0051050,GO:0051094,GO:0051128,GO:0051129,GO:0051130,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051239,GO:0051240,GO:0051270,GO:0051272,GO:0051279,GO:0051282,GO:0051285,GO:0051286,GO:0051293,GO:0051294,GO:0051301,GO:0051302,GO:0051493,GO:0051494,GO:0051591,GO:0051606,GO:0051640,GO:0051641,GO:0051643,GO:0051645,GO:0051646,GO:0051647,GO:0051648,GO:0051649,GO:0051650,GO:0051653,GO:0051654,GO:0051656,GO:0051674,GO:0051686,GO:0051703,GO:0051704,GO:0051716,GO:0051726,GO:0051875,GO:0051904,GO:0051905,GO:0051924,GO:0051960,GO:0051962,GO:0055037,GO:0055044,GO:0060001,GO:0060002,GO:0060151,GO:0060281,GO:0060282,GO:0060284,GO:0060327,GO:0060328,GO:0060341,GO:0060429,GO:0060560,GO:0060627,GO:0060996,GO:0060997,GO:0061024,GO:0061387,GO:0061458,GO:0061572,GO:0061573,GO:0061640,GO:0061645,GO:0065003,GO:0065007,GO:0065008,GO:0065009,GO:0070252,GO:0070382,GO:0070648,GO:0070649,GO:0070650,GO:0070727,GO:0070887,GO:0070938,GO:0071229,GO:0071230,GO:0071310,GO:0071375,GO:0071417,GO:0071495,GO:0071496,GO:0071520,GO:0071563,GO:0071695,GO:0071702,GO:0071704,GO:0071705,GO:0071840,GO:0071889,GO:0071944,GO:0071963,GO:0071976,GO:0072330,GO:0072384,GO:0072657,GO:0072659,GO:0072676,GO:0072678,GO:0072697,GO:0080147,GO:0090066,GO:0090140,GO:0090426,GO:0090436,GO:0090558,GO:0090567,GO:0090596,GO:0090626,GO:0090627,GO:0090702,GO:0090726,GO:0097061,GO:0097159,GO:0097204,GO:0097367,GO:0097435,GO:0097447,GO:0097458,GO:0097518,GO:0097574,GO:0097575,GO:0097708,GO:0097718,GO:0097730,GO:0097731,GO:0097733,GO:0098588,GO:0098630,GO:0098657,GO:0098743,GO:0098773,GO:0098793,GO:0098794,GO:0098805,GO:0098840,GO:0098858,GO:0098862,GO:0098916,GO:0099080,GO:0099081,GO:0099089,GO:0099111,GO:0099118,GO:0099120,GO:0099173,GO:0099402,GO:0099503,GO:0099512,GO:0099513,GO:0099515,GO:0099518,GO:0099536,GO:0099537,GO:0099568,GO:0099640,GO:0099738,GO:0106027,GO:0110009,GO:0110053,GO:0120025,GO:0120031,GO:0120035,GO:0120036,GO:0120038,GO:0120039,GO:0120104,GO:0120117,GO:0140027,GO:0140029,GO:0140056,GO:0150034,GO:1900006,GO:1900076,GO:1900078,GO:1901019,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576,GO:1901615,GO:1901617,GO:1901652,GO:1901653,GO:1901698,GO:1901699,GO:1901700,GO:1901701,GO:1901981,GO:1902407,GO:1902410,GO:1902531,GO:1902716,GO:1902850,GO:1902875,GO:1902877,GO:1902903,GO:1902904,GO:1902936,GO:1903047,GO:1903076,GO:1903078,GO:1903119,GO:1903169,GO:1903260,GO:1903429,GO:1903431,GO:1903475,GO:1903478,GO:1903479,GO:1903530,GO:1903532,GO:1903541,GO:1903543,GO:1903827,GO:1903829,GO:1904062,GO:1904375,GO:1904377,GO:1904580,GO:1904582,GO:1904601,GO:1904752,GO:1904754,GO:1905392,GO:1905429,GO:1905430,GO:1905475,GO:1905477,GO:1905879,GO:1905881,GO:1990151,GO:1990753,GO:1990778,GO:1990819,GO:1990896,GO:1990904,GO:2000026,GO:2000145,GO:2000147,GO:2000241,GO:2000243,GO:2000689,GO:2000769,GO:2001257
EggNOG free text desc.	translation initiation factor activity
EggNOG OGs	COG5022@1,KOG0160@2759,KOG2502@1,KOG2502@2759
COG Functional cat.	Z
Best tax level	Eukaryota
Best eggNOG OG	NA\|NA\|NA
BRITE	ko00000,ko01009,ko03019,ko03029,ko03036,ko04131,ko04147,ko04812
Exons	4
Model size	597
Cds size	597
Stop	0
Start	0

Relationships

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
mRNA_L-elsbetiae_contig14390.3238.1	prot_L-elsbetiae_contig14390.3238.1	Laminarionema elsbetiae ELsaHSoW15	polypeptide	L-elsbetiae_contig14390 611..4223 +

The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
1622815575.5160303-CDS-L-elsbetiae_contig14390:610..711	1622815575.5160303-CDS-L-elsbetiae_contig14390:610..711	Laminarionema elsbetiae ELsaHSoW15	CDS	L-elsbetiae_contig14390 611..711 +
1691682968.7939792-CDS-L-elsbetiae_contig14390:610..711	1691682968.7939792-CDS-L-elsbetiae_contig14390:610..711	Laminarionema elsbetiae ELsaHSoW15	CDS	L-elsbetiae_contig14390 611..711 +
1622815575.5310855-CDS-L-elsbetiae_contig14390:1273..1469	1622815575.5310855-CDS-L-elsbetiae_contig14390:1273..1469	Laminarionema elsbetiae ELsaHSoW15	CDS	L-elsbetiae_contig14390 1274..1469 +
1691682968.808401-CDS-L-elsbetiae_contig14390:1273..1469	1691682968.808401-CDS-L-elsbetiae_contig14390:1273..1469	Laminarionema elsbetiae ELsaHSoW15	CDS	L-elsbetiae_contig14390 1274..1469 +
1622815575.542429-CDS-L-elsbetiae_contig14390:2164..2332	1622815575.542429-CDS-L-elsbetiae_contig14390:2164..2332	Laminarionema elsbetiae ELsaHSoW15	CDS	L-elsbetiae_contig14390 2165..2332 +
1691682968.8173878-CDS-L-elsbetiae_contig14390:2164..2332	1691682968.8173878-CDS-L-elsbetiae_contig14390:2164..2332	Laminarionema elsbetiae ELsaHSoW15	CDS	L-elsbetiae_contig14390 2165..2332 +
1622815575.5542185-CDS-L-elsbetiae_contig14390:4091..4223	1622815575.5542185-CDS-L-elsbetiae_contig14390:4091..4223	Laminarionema elsbetiae ELsaHSoW15	CDS	L-elsbetiae_contig14390 4092..4223 +
1691682968.8263965-CDS-L-elsbetiae_contig14390:4091..4223	1691682968.8263965-CDS-L-elsbetiae_contig14390:4091..4223	Laminarionema elsbetiae ELsaHSoW15	CDS	L-elsbetiae_contig14390 4092..4223 +

Sequences

The following sequences are available for this feature:

protein sequence
mRNA from alignment at L-elsbetiae_contig14390:611..4223+
coding sequence from alignment at L-elsbetiae_contig14390:611..4223+

protein sequence of mRNA_L-elsbetiae_contig14390.3238.1

>prot_L-elsbetiae_contig14390.3238.1 ID=prot_L-elsbetiae_contig14390.3238.1|Name=mRNA_L-elsbetiae_contig14390.3238.1|organism=Laminarionema elsbetiae ELsaHSoW15|type=polypeptide|length=199bp
HRTVKVEGKTINVPLSPAAAADSLDGLAKEIYCRVFDWLVAKINDSMSCA
KGSNKGTIDLLDIFGFETFEHNSFEQFCINYANEKLQQKFTQDVFKNVQV
EYQEEGIPWSHIDFQDNAAVLGMIEEPRRGLLSLLDEECMLPQGTDEAYA
SKAVKAYKGHENFNKERFATKLEFTVHHYAGRVIYNTGGFVEKNKDQLQ

mRNA from alignment at L-elsbetiae_contig14390:611..4223+

Legend: polypeptideCDS

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>mRNA_L-elsbetiae_contig14390.3238.1 ID=mRNA_L-elsbetiae_contig14390.3238.1|Name=mRNA_L-elsbetiae_contig14390.3238.1|organism=Laminarionema elsbetiae ELsaHSoW15|type=mRNA|length=3613bp|location=Sequence derived from alignment at L-elsbetiae_contig14390:611..4223+ (Laminarionema elsbetiae ELsaHSoW15)
CACAGAACGGTGAAAGTGGAGGGGAAGACGATCAACGTGCCGCTATCGCC
TGCCGCTGCGGCGGACAGCCTGGACGGCCTAGCCAAGGAGATCTACTGCA
GGTATCTACTACATACTTCTACTACGTACTTAACGAAATTGGTAGATTTC
GTAGATTTGGTAAATTTATTTTTCTTACGACTACCCACACGTTTCCCAGC
ATTTCGTAGTTTTCGTAGTTTTTATGTCTCCTGCCGCGGCGGTGGACAGC
CTGAACCGCTCGCCTATGTATCTAGCCGAGGAAATCAATCAAATGGTGGC
GATATCGTAGATTTCGTGTTTGGATGTTCTTGTTATTTGTCTCGAATTTG
GCGTGTACCTACATAGAAGAGTCCTCCGCTGGCTAGTCTCTGCGCCGAAA
ATGTTGCCTGTGGATATGGTGTTTCATGGCGTTGTTCGCAGGGGGTTGTT
GACAAGGGGTCCCGTGTTTCAGGTCGGTAGTTTATCATGAAGAAAAAAAA
CTGTTTTTGTCCTTCGTCGTTTGCTGCTGCTGCTTGCTGCTGCTTGCTTG
CTGATGATGTTACGCCATTTGTCCGTGGTCGTTTTTTTGCTGCTGCTGCT
GCTGCTTGCTGCTGATTTTACTTGCTGCCTGCTGATGTTGCGTGCGCGCG
CGCGCGTGCACAGAGTTTTCGACTGGCTGGTGGCGAAGATCAACGACTCG
ATGAGCTGCGCCAAGGGGAGCAACAAGGGGACGATCGACCTCCTCGACAT
CTTCGGCTTCGAGACCTTCGAGCACAACAGCTTCGAGCAGTTCTGCATCA
ACTACGCCAACGAGAAGCTGCAGCAGAAGTTCACGCAGGACGTCTTCAAG
AACGTGCAGGTGGGTGGATGGGTGGGTGTTGTGGGATATATATATATATT
TTTTGCGTTTATTGAAGCCTCCGTCCCGTTATTATTATTGGTGTGGGGGT
AGGTTGTGATTGTTTTGGCTCTTCTGTGGTGTTGTTTTGTGGTGAGTTTA
TTTCGCGGATTATTCTTTGGCGCCGTGGTACTTTTTTTTTTTTTGCAGCC
CTAAATATCCCTGATCCGTATCCCCTACAGTAGTAGGTGACACAAGATAC
CACACCCCCGGGACAGATTTTCAAGGGTCGATTCCTCCCCAGCAAGAAGC
GTGCCAGCGCCGACAGGGGGTGGCGTTGGAAATATCTAGTCGAGGGCTGT
CCGAAAATGTGTCGTTTGGTGCTGGCGCCCTCTTCGTTACGGAGTAATGG
AGCTCTAAAACTCGGTCCAGGGGGGTGTGGTATCTTGTGTCATCTACGTT
ACCCTGTCCCTAGGCTAACCCTCATCGCTGATGATGATGCCGACCTGTAC
TTAGGGTGGATTGCCTACCTCCATCTCTAGCCCTTAGGTTATGCTAAAAC
TGTACTTCACTACTCCATCACTATCCGTCATAGCTGATAATGATGCTAAA
ACCTGTACGATGGTGGAGCACCTACCCCATCCCTAAAACCCTCAACCGCT
GATGATGATGATGCTATCCATGCCAAACCTGTACATACGTACATATGTAC
ACAGGTGGAGTACCAGGAGGAAGGGATCCCGTGGTCGCACATCGACTTCC
AGGACAACGCCGCCGTGCTGGGGATGATCGAGGAGCCGAGGAGAGGGCTG
CTGTCTCTCCTGGACGAGGAGTGCATGCTGCCGCAGGGCACGGACGAGGC
GTATGCATCCAAGGCGGTCAAGGTATGTCCCTATTCTTGTGTGCGTTGCC
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
CCCCCCCTCTCTCTCTCTTCTCCTCTGGCTGGCTCTTTGTTCTGTTTTCG
CTCTGTTTTATCGCCATTCGGCGATAAAAGCGCAGAGGGGCACCGCAGTG
CGAAGTGCGTGGTGAACAGCATGTTCTCCCTCCCACACAGTGTGCGGGCG
AGGCCCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTTTGTGCGTGTCTCTCTCTCTG
GCTGTCTCCATCGTTGGCTGGCTCTTTCTTCTGTTTCGGCTTTCTTTTTT
CTTGTTATCCGACGACGACAAAGGCGCAGAGGGGTACCGCAGTGCGAAGT
GCGTGGTAAACAGCATGCCCTCCCTCCCGCCCGCACGGGGTGCAGGCGAG
GCGCAGAGGTTATCTCCTCTGATTTATTTCCCCACGTGTTTCTCAAAGGA
TACTCGGAAGTTTGATTAGACTAGTGTTTCGAATCGGATTGCAGATTAGT
GTAATTACTTGGAATTCATCTTCACACACTGGTACCTACCTACATCCTAT
GTACACTGCTGTTGTCGGTACCCTTGCACTTCTTGACCACGCCTTCCAAG
GATGTGGTGACCGTCGAAACAATCAAAAATATTTAATGTTTACCCCGGTT
GGTTCTAGTTGTACAGGTGTAGTACACGTCTCCACTTGGGGGGACTGTCG
CCAAAATAAATGGGAAGGACACACACACACACACATGTATGACGTCACAT
GTTTCATTAGGCATATGTATGTATGTATGTATGTACAAGGATCGCGAGAA
CTTCAACGAGGAGCGAATCGTATTTTTAATTAATCGTTACTCAGGCCAAA
TGTCACGGGAGCAGATTGGAATCCTGGATTCCAATCCGCTGGTGGCACGC
AGACGAACTTTTTTTGGCTGAGAATCGCTCTTTTTGGCTCAGGGCTCGCC
TCCCAGACACCCGCTTGCAGCCCAACCAACAGGGATGTGTGCTCCGATGG
TGTGACTGTCTAGGAGCCAAGTTTGGCGAGCAACGGTGAGGTGTGGGCCT
CACACGCTTTGAAATTGAAACCCGAGGATTCCAAACTGAAATTTTGCGTC
GGAATCCGGCCGATTTTCCAACAGGGAATCCTCCGCAATTCCAATTTGGA
ATTCTTTGGTTTCAAAGCGTGTGAGGCCCGCACCCCACCGTTGCTCCCCA
AACTTGGCTCCGAGAAAGTCACGCCGTTGAAGCACACATTCCTGTTGGTT
GGGATGCAGACGGGTGTCTGGGAGGCGAGCCCTGCTGAGCAAAAAAGAGC
GATTCTCACTTCATCTGCGTGTGCCCCCAGCGGATTGGAATCCTGGATTC
CAATCTGCTCCCATAACATTTGGCCTGCATCAACTAAAAATTCTACAATC
ATGTCACGTGTTTTATTTCAAGGCGTACAAGGGTCACGAGAACTTCAACG
AAGAGCGAATCGTATTTTAATTAATCGTAACTCATCAACTAATATTATAT
CATGTCACGTTTTTTTTCTAAGGCGTACAAGGATCACGAGAACTTCAACG
AGGAGCGAATCGTATTTTAATTGGTCATAAGTCATCAACTAAAAATTACA
TCATGTCAAATATATTTTTTCTAAGGCGTACATACAAGGATCACGAGAAC
TTCAACGAGGAGCGAATCGTATTTTAATTAGTCATAACTCATCAACTAAA
AATAACATCATTTCACATGTTTTATCTCAAGGCGTACAAGGGGCACGAGA
ACTTCAACAAGGAGCGGTTCGCGACGAAGCTCGAGTTTACGGTGCACCAC
TACGCCGGCAGGGTTATCTACAACACCGGGGGCTTCGTGGAGAAGAACAA
AGACCAGCTGCAG

Coding sequence (CDS) from alignment at L-elsbetiae_contig14390:611..4223+

>mRNA_L-elsbetiae_contig14390.3238.1 ID=mRNA_L-elsbetiae_contig14390.3238.1|Name=mRNA_L-elsbetiae_contig14390.3238.1|organism=Laminarionema elsbetiae ELsaHSoW15|type=CDS|length=1194bp|location=Sequence derived from alignment at L-elsbetiae_contig14390:611..4223+ (Laminarionema elsbetiae ELsaHSoW15)
CACAGAACGGTGAAAGTGGAGGGGAAGACGATCAACGTGCCGCTATCGCC
TGCCGCTGCGGCGGACAGCCTGGACGGCCTAGCCAAGGAGATCTACTGCA
GCACAGAACGGTGAAAGTGGAGGGGAAGACGATCAACGTGCCGCTATCGC
CTGCCGCTGCGGCGGACAGCCTGGACGGCCTAGCCAAGGAGATCTACTGC
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