mRNA_H-elongata_contig18374.4943.1 (mRNA) Himanthalia elongata Himel1 dioecious

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Overview


Name	mRNA_H-elongata_contig18374.4943.1
Unique Name	mRNA_H-elongata_contig18374.4943.1
Type	mRNA
Organism	Himanthalia elongata Himel1 dioecious (Himanthalia elongata Himel1 dioecious)

Homology

[Close]

BLAST of mRNA_H-elongata_contig18374.4943.1 vs. uniprot
Match: D7G264_ECTSI (Non-specific serine/threonine protein kinase n=1 Tax=Ectocarpus siliculosus TaxID=2880 RepID=D7G264_ECTSI)

HSP 1 Score: 72.4 bits (176), Expect = 1.690e-11
Identity = 37/65 (56.92%), Postives = 44/65 (67.69%), Query Frame = 1

Query:   13 GHGLLR-EKVSSPPPLALLDEITDGSQAAHSFMWEQSFMSAQPNPISQPPTLTVMSPMYNENVAV 204
            GHGLL  +         +L +  D  QAAHS MWEQSFMSAQPNPI +P TLTV+  MYNE+VA+
Sbjct:  853 GHGLLEGDGGQGAAHDTMLSQTHDDDQAAHSVMWEQSFMSAQPNPIMEPTTLTVLQDMYNEDVAI 917

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of mRNA_H-elongata_contig18374.4943.1 vs. uniprot

BLAST of mRNA_H-elongata_contig18374.4943.1 vs. uniprot
Analysis Date: 2022-09-19 (Diamond blastx: OGS1.0 vs UniRef90)
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
D7G264_ECTSI	1.690e-11	56.92	Non-specific serine/threonine protein kinase n=1 T...	[more]

Alignments

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
H-elongata_contig18374	contig	H-elongata_contig18374:1965..5131 +

Analyses

This mRNA is derived from or has results from the following analyses


Analysis Name	Date Performed
Diamond blastx: OGS1.0 vs UniRef90	2022-09-19
OGS1.0 of Himanthalia elongata Himel1 dioecious	2021-02-24

Properties


Property Name	Value
Taxonomic scope	Eukaryota
Seed ortholog score	73.2
Seed ortholog evalue	1.4e-10
Seed eggNOG ortholog	2880.D7G264
Preferred name	MTOR
KEGG ko	ko:K07203
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EggNOG free text desc.	phosphatidylinositol kinase activity
EggNOG OGs	COG5032@1,KOG0891@2759
EC	2.7.11.1
COG Functional cat.	BDLTU
BiGG Reaction	iMM904.YKL203C,iND750.YKL203C
Best tax level	Eukaryota
Best eggNOG OG	NA\|NA\|NA
BRITE	ko00000,ko00001,ko01000,ko01001,ko04131
Hectar predicted targeting category	other localisation
Exons	5
Model size	546
Cds size	546
Stop	1
Start	0

Relationships

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
mRNA_H-elongata_contig18374.4943.1	prot_H-elongata_contig18374.4943.1	Himanthalia elongata Himel1 dioecious	polypeptide	H-elongata_contig18374 1965..5131 +

The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
1622930053.9339473-CDS-H-elongata_contig18374:1964..2054	1622930053.9339473-CDS-H-elongata_contig18374:1964..2054	Himanthalia elongata Himel1 dioecious	CDS	H-elongata_contig18374 1965..2054 +
1691679262.8288617-CDS-H-elongata_contig18374:1964..2054	1691679262.8288617-CDS-H-elongata_contig18374:1964..2054	Himanthalia elongata Himel1 dioecious	CDS	H-elongata_contig18374 1965..2054 +
1622930053.951288-CDS-H-elongata_contig18374:2629..2737	1622930053.951288-CDS-H-elongata_contig18374:2629..2737	Himanthalia elongata Himel1 dioecious	CDS	H-elongata_contig18374 2630..2737 +
1691679262.8474493-CDS-H-elongata_contig18374:2629..2737	1691679262.8474493-CDS-H-elongata_contig18374:2629..2737	Himanthalia elongata Himel1 dioecious	CDS	H-elongata_contig18374 2630..2737 +
1622930053.9664598-CDS-H-elongata_contig18374:3643..3767	1622930053.9664598-CDS-H-elongata_contig18374:3643..3767	Himanthalia elongata Himel1 dioecious	CDS	H-elongata_contig18374 3644..3767 +
1691679262.8578296-CDS-H-elongata_contig18374:3643..3767	1691679262.8578296-CDS-H-elongata_contig18374:3643..3767	Himanthalia elongata Himel1 dioecious	CDS	H-elongata_contig18374 3644..3767 +
1622930053.9794347-CDS-H-elongata_contig18374:4189..4308	1622930053.9794347-CDS-H-elongata_contig18374:4189..4308	Himanthalia elongata Himel1 dioecious	CDS	H-elongata_contig18374 4190..4308 +
1691679262.865659-CDS-H-elongata_contig18374:4189..4308	1691679262.865659-CDS-H-elongata_contig18374:4189..4308	Himanthalia elongata Himel1 dioecious	CDS	H-elongata_contig18374 4190..4308 +
1622930053.9956264-CDS-H-elongata_contig18374:5026..5131	1622930053.9956264-CDS-H-elongata_contig18374:5026..5131	Himanthalia elongata Himel1 dioecious	CDS	H-elongata_contig18374 5027..5131 +
1691679262.8732162-CDS-H-elongata_contig18374:5026..5131	1691679262.8732162-CDS-H-elongata_contig18374:5026..5131	Himanthalia elongata Himel1 dioecious	CDS	H-elongata_contig18374 5027..5131 +

Sequences

The following sequences are available for this feature:

protein sequence
mRNA from alignment at H-elongata_contig18374:1965..5131+
coding sequence from alignment at H-elongata_contig18374:1965..5131+

protein sequence of mRNA_H-elongata_contig18374.4943.1

>prot_H-elongata_contig18374.4943.1 ID=prot_H-elongata_contig18374.4943.1|Name=mRNA_H-elongata_contig18374.4943.1|organism=Himanthalia elongata Himel1 dioecious|type=polypeptide|length=182bp
VVEEGHGLLREKVSSPPPLALLDEITDGSQAAHSFMWEQSFMSAQPNPIS
QPPTLTVMSPMYNENVAVRGRTTVEPTPPDAGACAHAEAKHGSVPVRDSR
LGDSLLDGAYGGSGSVVAGDDRLHSGRLCFPRPRHYALVAVIPHLAGALA
HEDAEARHGRSADGYSAVDGTWPDRRNAVAA*

mRNA from alignment at H-elongata_contig18374:1965..5131+

Legend: polypeptideCDS

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>mRNA_H-elongata_contig18374.4943.1 ID=mRNA_H-elongata_contig18374.4943.1|Name=mRNA_H-elongata_contig18374.4943.1|organism=Himanthalia elongata Himel1 dioecious|type=mRNA|length=3167bp|location=Sequence derived from alignment at H-elongata_contig18374:1965..5131+ (Himanthalia elongata Himel1 dioecious)
GTCGTGGAAGAGGGCCACGGGTTGCTGAGGGAGAAAGTGTCGTCGCCTCC
TCCCCTTGCGCTTCTGGATGAGATTACCGACGGCAGCCAGGTAAGCACCG
AAACAGCGTGAACTACTGCCTTCGACGTTCTGCAGAGGAACAAAGTCTGT
TTCTGTGTCTTGTGTGGGAATAATCTGGGTTGGGAAGTGGGATCTCGCAG
CAGTCAGAAATGGGATGGCGGTAAGACATGCCACGATGTTCGGAGTAACC
CGGAGCTTTTGTTCGTATGATCACCAAGGGCTCTAGACCGCTGGTCGGAT
GTAATGGAGCGAGTTTTAGATATCGGCTCCCCCTGAATGAAGTTGTACGA
TCATTTATTCCCTCTTGTCAGCTATTTTCCCATCTTGTCCCTCCTGTATA
TTTTTTGGGCTCCACGGTCCCGCGGATGTCGCATATATATATATATATAT
ATATATATATATATTTTAAAGATATATTACTATTTTTTAGTATCGCGGAT
GTCGCATGTTTTATTTTTATTTATTTTTTAAATATTTATATATATATATA
TATATTTTTTTTTAACATCGCGGATGTCGCATGTTTTGTTTTGTTTTGTT
TTTAGGCTTTTTTTCTAATCCCGCGAACGTCGCATGCTTTTTTTTTGTAT
TTGGCGGATGCACAGGCGGCGCACTCCTTCATGTGGGAGCAGAGCTTTAT
GTCCGCGCAGCCGAACCCCATTTCCCAGCCTCCGACCTTGACGGTTATGT
CCCCCATGTACAACGAAAACGTGGCCATCACTAGCCTCATGGCGATACTG
GTGAGTTAGCCCGCCTTTTCTTCCTGTTTCTTATACTTTGCCCTACATAT
GTAGTATGCATGTATGGTCTTGTCTTCATAATCATTTATATATTATGCCA
TAGGCCTATCGACGCACAGAAAACCTAACGAAATCGATGACACACACACA
CACACACACACACGTACATAGCACTTTATTTTCAGTATGATTTTAATCAT
GCCCGTCCCTTGCCCCACCGCTTTTCAATGCAATGCACGTTTTTTCGTTT
TACCGTGGTATCGACATCGACATCGCCATCGCAGAGGGATCCATGCCTCA
ACGCTCACCACAGTCAAGTCTCACAGGCGGTCATGCGAATCTTGAAGAGC
CTCGGGCTTCAGAGCGTGGAGTTTCTAGCCTCTATCCTTCCGACCATCCT
TGAAGTGACGAGGTACCCTGCTGTCGACTCTAAAAATGAAACAAGAAGAA
AAAAACACATACAAAAAACAATGGATTAAGACAAGAATATGTTTGCCTCG
CTATGGTCCTGTACAGCCTACCTATGATTGATTTTTGGGTTAGGGTCCTA
AATATTCCTGAATCTATCCTCGCTAGTGGACATTATCTTAGAGTGGCCAT
ATTACAGTGTCTATTATAATTTGTTAGGTGACTTCTTACGCTGTCAAATT
TTATTTTATTTTATTTGCTAGCGTAACTGACCAAAAATACAAATATTTAT
GCTGTCAAAATAACGCCGTTTTGGATCGACGTCTTTAAAAACTCGTTTTG
ATAACCCCACCCTGTCCAAAAATGTGTTGTTTGGCACCAAAGGCCACTTT
TTGACAACATTTTTTGACAGCGTAGGAAGTTAAAAAATAAATTGTGCGCT
GTTTTTTTAACATGTTTTGGGTATGGCAGGCGGTGCGAGGCCGGACTACG
GTCGAGCCTACTCCGCCAGATGCAGGTGCTTGTGCGCATGCTGAAGCTAA
ACATGGTTCCGTACCTGTCCGAGATTCTCGACTTGGTGACTCACTGCTGG
ACGGTGAGAGAGATATGCTCGTCATACATTACTTCCTACGAGCATAGAGT
GCACGTTTGGCCGTTAGTGTGTGCGTATGCAGTACTTTTCCTCCTTAAAA
GCACTTGTGTGTTACCAGCATGTTATACTGCTTTCTTCGAAGGCTTCATA
CGGACTGAAATGCATCTTTCGGAGGCCATAGGACTCCCTTGAGATTATTC
TGATATGTTAGTCGCCTGAGTTTTAATTAATAATGAATACTCTATTCATA
GTATATTAAAAGAAGATTCATAGAAGATTCATATAGTCTAGAGGGGCGCC
CCGCTGCTCTGTAATTGTGATTGAAAATCGCGGTGCTGTGCTGTGCTGTG
CTGTGCTGTGCTGTGATGTGCTCTGCTGGGGGGCGCCTGCTGGGGCATGC
TGTTCGCCGTTCTCTGTGATGGCAGGAGCATATGGAGGAAGTGGTTCCGT
TGTTGCAGGAGATGACCGGTTGCATTCCGGACGACTTTGCTTCCCACGTC
CACGACATTATGCCCTTGTTGCTGTCATCCCTCACCTGGCCGGAGTGAGA
ACTACTATTATTATTATAGTAAACCGTAGTCTATTAATGGTACATTTATC
GCATAGTAGTATCAGGTGTTGTTGACTGTAAAATAGTATGGTGTGGCTTC
GGACCGGAGACCCTGCCCAACGTGGAAGGCGTTTTCTGTAACTGACCACT
CTCGGTATTGTATTGTATTGTATTTTATATTATACGAGGTATTATTTGAA
TGTACAGTTGGATGATATGGGTCAAACAGCAAAATGAGCATAACTTTAGT
AACCTGACGATAGTTGGTCCCCTGGACTGCACCTCTCGTGGTGATATAAG
GAGGCGTGTATGTTTGGAAGATTTAAATAAGTTCATATGCCTTTTAAGAA
AAAAATGTATAGTGGAATGCCGTCTAGTTTGCATCATCCCTTTGTGGTTG
TGTTTAACGTAATTTGACACTATATTCTCTATACTGTACGCTATATACTT
GAGTTTAGCCCTTAAAGGTACCGTTTAGACTAAATAAAAAGAGCGGGGAA
CAAGGCTCTCTTTCAGAGATACTGCAGAAATGATATGCGGATACGAAGTA
TAGCATTAAATTATTAAGAGTCGTCACGCTTTGGTTCTCTATACTGTACT
GTTAATACTATACTCTATATTAATACACTCTACCAATAATGTTGATGCCA
TATTTGACACGTTTTAGCCGTTGGTGGTGATTCCTGATTGTTCGCCATGC
TCGACATTCCAGGCACTTGCGCATGAAGACGCTGAGGCTAGACACGGCCG
TTCGGCGGACGGATATTCGGCTGTCGATGGTACTTGGCCTGATAGGCGGA
ATGCGGTCGCTGCTTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at H-elongata_contig18374:1965..5131+

>mRNA_H-elongata_contig18374.4943.1 ID=mRNA_H-elongata_contig18374.4943.1|Name=mRNA_H-elongata_contig18374.4943.1|organism=Himanthalia elongata Himel1 dioecious|type=CDS|length=1092bp|location=Sequence derived from alignment at H-elongata_contig18374:1965..5131+ (Himanthalia elongata Himel1 dioecious)
GTCGTGGAAGAGGGCCACGGGTTGCTGAGGGAGAAAGTGTCGTCGCCTCC
TCCCCTTGCGCTTCTGGATGAGATTACCGACGGCAGCCAGGTCGTGGAAG
AGGGCCACGGGTTGCTGAGGGAGAAAGTGTCGTCGCCTCCTCCCCTTGCG
CTTCTGGATGAGATTACCGACGGCAGCCAGGCGGCGCACTCCTTCATGTG
GGAGCAGAGCTTTATGTCCGCGCAGCCGAACCCCATTTCCCAGCCTCCGA
CCTTGACGGTTATGTCCCCCATGTACAACGAAAACGTGGCGGCGCACTCC
TTCATGTGGGAGCAGAGCTTTATGTCCGCGCAGCCGAACCCCATTTCCCA
GCCTCCGACCTTGACGGTTATGTCCCCCATGTACAACGAAAACGTGGCGG
TGCGAGGCCGGACTACGGTCGAGCCTACTCCGCCAGATGCAGGTGCTTGT
GCGCATGCTGAAGCTAAACATGGTTCCGTACCTGTCCGAGATTCTCGACT
TGGTGACTCACTGCTGGACGGCGGTGCGAGGCCGGACTACGGTCGAGCCT
ACTCCGCCAGATGCAGGTGCTTGTGCGCATGCTGAAGCTAAACATGGTTC
CGTACCTGTCCGAGATTCTCGACTTGGTGACTCACTGCTGGACGGAGCAT
ATGGAGGAAGTGGTTCCGTTGTTGCAGGAGATGACCGGTTGCATTCCGGA
CGACTTTGCTTCCCACGTCCACGACATTATGCCCTTGTTGCTGTCATCCC
TCACCTGGCCGGAGAGCATATGGAGGAAGTGGTTCCGTTGTTGCAGGAGA
TGACCGGTTGCATTCCGGACGACTTTGCTTCCCACGTCCACGACATTATG
CCCTTGTTGCTGTCATCCCTCACCTGGCCGGAGCACTTGCGCATGAAGAC
GCTGAGGCTAGACACGGCCGTTCGGCGGACGGATATTCGGCTGTCGATGG
TACTTGGCCTGATAGGCGGAATGCGGTCGCTGCTTGAGCACTTGCGCATG
AAGACGCTGAGGCTAGACACGGCCGTTCGGCGGACGGATATTCGGCTGTC
GATGGTACTTGGCCTGATAGGCGGAATGCGGTCGCTGCTTGA