mRNA_H-elongata_contig6149.13705.1 (mRNA) Himanthalia elongata Himel1 dioecious

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Overview
NamemRNA_H-elongata_contig6149.13705.1
Unique NamemRNA_H-elongata_contig6149.13705.1
TypemRNA
OrganismHimanthalia elongata Himel1 dioecious (Himanthalia elongata Himel1 dioecious)
Homology
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BLAST of mRNA_H-elongata_contig6149.13705.1 vs. uniprot
Match: D7G264_ECTSI (Non-specific serine/threonine protein kinase n=1 Tax=Ectocarpus siliculosus TaxID=2880 RepID=D7G264_ECTSI)

HSP 1 Score: 146 bits (368), Expect = 7.880e-39
Identity = 71/85 (83.53%), Postives = 80/85 (94.12%), Query Frame = 1 
Query:    4 DILQTLLNLIEFMEHEVEGEALPIDIRILADLAEKCHAYAKALHYKELEFQTNPTRCIESLIAINKKVGQPQAALGILTHAKNNL 258
            DILQTLLNL EFM+HEVEGEALPIDIR+L++LAE+CHAYAKALHYKELEF TNP  CIESLIAINKKVGQP+AA+GILT+A+N L
Sbjct: 1469 DILQTLLNLAEFMDHEVEGEALPIDIRLLSNLAERCHAYAKALHYKELEFATNPAICIESLIAINKKVGQPEAAMGILTYAQNRL 1553
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BLAST of mRNA_H-elongata_contig6149.13705.1 vs. uniprot
Match: W7TTX4_9STRA (Serine/threonine-protein kinase TOR n=3 Tax=Monodopsidaceae TaxID=425072 RepID=W7TTX4_9STRA)

HSP 1 Score: 126 bits (317), Expect = 5.990e-32
Identity = 64/85 (75.29%), Postives = 73/85 (85.88%), Query Frame = 1 
Query:    4 DILQTLLNLIEFMEHEVEGEALPIDIRILADLAEKCHAYAKALHYKELEFQTNPTRCIESLIAINKKVGQPQAALGILTHAKNNL 258
            DI+QTLLNL EFMEH+VE  ALPIDI ILA+LA+KCHAYAKALHYKELEF T P  C+ESLI INKK+GQP+AALGIL +A+  L
Sbjct: 1292 DIVQTLLNLAEFMEHDVE--ALPIDIHILAELAQKCHAYAKALHYKELEFPTAPAACVESLITINKKLGQPEAALGILKYAQKKL 1374
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BLAST of mRNA_H-elongata_contig6149.13705.1 vs. uniprot
Match: A0A397B801_9STRA (FAT domain-containing protein (Fragment) n=4 Tax=Aphanomyces astaci TaxID=112090 RepID=A0A397B801_9STRA)

HSP 1 Score: 120 bits (301), Expect = 4.590e-30
Identity = 60/82 (73.17%), Postives = 73/82 (89.02%), Query Frame = 1 
Query:    4 DILQTLLNLIEFMEHEVEGEALPIDIRILADLAEKCHAYAKALHYKELEFQTNPTRCIESLIAINKKVGQPQAALGILTHAK 249
            +ILQTLLNL EFMEH+VE  ALPIDIR L +LA+KCHAYAKALHYKELEF T+P+ CIE+LI+IN +VGQP+AA+GIL +A+
Sbjct:  126 EILQTLLNLAEFMEHDVE--ALPIDIRELGELAQKCHAYAKALHYKELEFHTSPSTCIEALISINNQVGQPEAAVGILKYAQ 205
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BLAST of mRNA_H-elongata_contig6149.13705.1 vs. uniprot
Match: A0A6G0W5V6_9STRA (FAT domain-containing protein (Fragment) n=2 Tax=Aphanomyces euteiches TaxID=100861 RepID=A0A6G0W5V6_9STRA)

HSP 1 Score: 120 bits (301), Expect = 8.510e-30
Identity = 60/82 (73.17%), Postives = 73/82 (89.02%), Query Frame = 1 
Query:    4 DILQTLLNLIEFMEHEVEGEALPIDIRILADLAEKCHAYAKALHYKELEFQTNPTRCIESLIAINKKVGQPQAALGILTHAK 249
            +ILQTLLNL EFMEH+VE  ALPIDIR L +LA+KCHAYAKALHYKELEF T+P+ CIE+LI+IN +VGQP+AA+GIL +A+
Sbjct:  428 EILQTLLNLAEFMEHDVE--ALPIDIRELGELAQKCHAYAKALHYKELEFHTSPSTCIEALISINNQVGQPEAAVGILKYAQ 507
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BLAST of mRNA_H-elongata_contig6149.13705.1 vs. uniprot
Match: A0A3R6YXP0_9STRA (Serine/threonine-protein kinase TOR (Fragment) n=1 Tax=Aphanomyces invadans TaxID=157072 RepID=A0A3R6YXP0_9STRA)

HSP 1 Score: 120 bits (301), Expect = 8.640e-30
Identity = 60/82 (73.17%), Postives = 73/82 (89.02%), Query Frame = 1 
Query:    4 DILQTLLNLIEFMEHEVEGEALPIDIRILADLAEKCHAYAKALHYKELEFQTNPTRCIESLIAINKKVGQPQAALGILTHAK 249
            +ILQTLLNL EFMEH+VE  ALPIDIR L +LA+KCHAYAKALHYKELEF T+P+ CIE+LI+IN +VGQP+AA+GIL +A+
Sbjct: 1205 EILQTLLNLAEFMEHDVE--ALPIDIRELGELAQKCHAYAKALHYKELEFHTSPSTCIEALISINNQVGQPEAAVGILKYAQ 1284
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BLAST of mRNA_H-elongata_contig6149.13705.1 vs. uniprot
Match: A0A6G0WIT3_9STRA (Serine/threonine-protein kinase TOR n=2 Tax=Aphanomyces euteiches TaxID=100861 RepID=A0A6G0WIT3_9STRA)

HSP 1 Score: 120 bits (301), Expect = 8.650e-30
Identity = 60/82 (73.17%), Postives = 73/82 (89.02%), Query Frame = 1 
Query:    4 DILQTLLNLIEFMEHEVEGEALPIDIRILADLAEKCHAYAKALHYKELEFQTNPTRCIESLIAINKKVGQPQAALGILTHAK 249
            +ILQTLLNL EFMEH+VE  ALPIDIR L +LA+KCHAYAKALHYKELEF T+P+ CIE+LI+IN +VGQP+AA+GIL +A+
Sbjct: 1301 EILQTLLNLAEFMEHDVE--ALPIDIRELGELAQKCHAYAKALHYKELEFHTSPSTCIEALISINNQVGQPEAAVGILKYAQ 1380
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BLAST of mRNA_H-elongata_contig6149.13705.1 vs. uniprot
Match: A0A6G0WIQ7_9STRA (Serine/threonine-protein kinase TOR n=1 Tax=Aphanomyces euteiches TaxID=100861 RepID=A0A6G0WIQ7_9STRA)

HSP 1 Score: 120 bits (301), Expect = 8.650e-30
Identity = 60/82 (73.17%), Postives = 73/82 (89.02%), Query Frame = 1 
Query:    4 DILQTLLNLIEFMEHEVEGEALPIDIRILADLAEKCHAYAKALHYKELEFQTNPTRCIESLIAINKKVGQPQAALGILTHAK 249
            +ILQTLLNL EFMEH+VE  ALPIDIR L +LA+KCHAYAKALHYKELEF T+P+ CIE+LI+IN +VGQP+AA+GIL +A+
Sbjct: 1331 EILQTLLNLAEFMEHDVE--ALPIDIRELGELAQKCHAYAKALHYKELEFHTSPSTCIEALISINNQVGQPEAAVGILKYAQ 1410
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BLAST of mRNA_H-elongata_contig6149.13705.1 vs. uniprot
Match: A0A485L8R6_9STRA (Serine/threonine-protein kinase TOR n=1 Tax=Aphanomyces stellatus TaxID=120398 RepID=A0A485L8R6_9STRA)

HSP 1 Score: 120 bits (301), Expect = 8.650e-30
Identity = 60/82 (73.17%), Postives = 73/82 (89.02%), Query Frame = 1 
Query:    4 DILQTLLNLIEFMEHEVEGEALPIDIRILADLAEKCHAYAKALHYKELEFQTNPTRCIESLIAINKKVGQPQAALGILTHAK 249
            +ILQTLLNL EFMEH+VE  ALPIDIR L +LA+KCHAYAKALHYKELEF T+P+ CIE+LI+IN +VGQP+AA+GIL +A+
Sbjct: 1331 EILQTLLNLAEFMEHDVE--ALPIDIRELGELAQKCHAYAKALHYKELEFHTSPSTCIEALISINNQVGQPEAAVGILKYAQ 1410
[Close]
BLAST of mRNA_H-elongata_contig6149.13705.1 vs. uniprot
Match: W4FQI3_9STRA (Serine/threonine-protein kinase TOR n=4 Tax=Aphanomyces astaci TaxID=112090 RepID=W4FQI3_9STRA)

HSP 1 Score: 120 bits (301), Expect = 8.650e-30
Identity = 60/82 (73.17%), Postives = 73/82 (89.02%), Query Frame = 1 
Query:    4 DILQTLLNLIEFMEHEVEGEALPIDIRILADLAEKCHAYAKALHYKELEFQTNPTRCIESLIAINKKVGQPQAALGILTHAK 249
            +ILQTLLNL EFMEH+VE  ALPIDIR L +LA+KCHAYAKALHYKELEF T+P+ CIE+LI+IN +VGQP+AA+GIL +A+
Sbjct: 1366 EILQTLLNLAEFMEHDVE--ALPIDIRELGELAQKCHAYAKALHYKELEFHTSPSTCIEALISINNQVGQPEAAVGILKYAQ 1445
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BLAST of mRNA_H-elongata_contig6149.13705.1 vs. uniprot
Match: A0A024TJB8_9STRA (Serine/threonine-protein kinase TOR n=11 Tax=Aphanomyces invadans TaxID=157072 RepID=A0A024TJB8_9STRA)

HSP 1 Score: 120 bits (301), Expect = 8.660e-30
Identity = 60/82 (73.17%), Postives = 73/82 (89.02%), Query Frame = 1 
Query:    4 DILQTLLNLIEFMEHEVEGEALPIDIRILADLAEKCHAYAKALHYKELEFQTNPTRCIESLIAINKKVGQPQAALGILTHAK 249
            +ILQTLLNL EFMEH+VE  ALPIDIR L +LA+KCHAYAKALHYKELEF T+P+ CIE+LI+IN +VGQP+AA+GIL +A+
Sbjct: 1431 EILQTLLNLAEFMEHDVE--ALPIDIRELGELAQKCHAYAKALHYKELEFHTSPSTCIEALISINNQVGQPEAAVGILKYAQ 1510
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of mRNA_H-elongata_contig6149.13705.1 vs. uniprot
Analysis Date: 2022-09-19 (Diamond blastx: OGS1.0 vs UniRef90)
Total hits: 25
Match NameE-valueIdentityDescription
D7G264_ECTSI7.880e-3983.53Non-specific serine/threonine protein kinase n=1 T... [more]
W7TTX4_9STRA5.990e-3275.29Serine/threonine-protein kinase TOR n=3 Tax=Monodo... [more]
A0A397B801_9STRA4.590e-3073.17FAT domain-containing protein (Fragment) n=4 Tax=A... [more]
A0A6G0W5V6_9STRA8.510e-3073.17FAT domain-containing protein (Fragment) n=2 Tax=A... [more]
A0A3R6YXP0_9STRA8.640e-3073.17Serine/threonine-protein kinase TOR (Fragment) n=1... [more]
A0A6G0WIT3_9STRA8.650e-3073.17Serine/threonine-protein kinase TOR n=2 Tax=Aphano... [more]
A0A6G0WIQ7_9STRA8.650e-3073.17Serine/threonine-protein kinase TOR n=1 Tax=Aphano... [more]
A0A485L8R6_9STRA8.650e-3073.17Serine/threonine-protein kinase TOR n=1 Tax=Aphano... [more]
W4FQI3_9STRA8.650e-3073.17Serine/threonine-protein kinase TOR n=4 Tax=Aphano... [more]
A0A024TJB8_9STRA8.660e-3073.17Serine/threonine-protein kinase TOR n=11 Tax=Aphan... [more]

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Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
H-elongata_contig6149contigH-elongata_contig6149:2969..4432 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Diamond blastx: OGS1.0 vs UniRef902022-09-19
OGS1.0 of Himanthalia elongata Himel1 dioecious2021-02-24
Properties
Property NameValue
Taxonomic scopeEukaryota
Seed ortholog score146.7
Seed ortholog evalue4.9e-33
Seed eggNOG ortholog2880.D7G264
Preferred nameMTOR
KEGG koko:K07203
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EggNOG free text desc.phosphatidylinositol kinase activity
EggNOG OGsCOG5032@1,KOG0891@2759
EC2.7.11.1
COG Functional cat.BDLTU
BiGG ReactioniMM904.YKL203C,iND750.YKL203C
Best tax levelEukaryota
Best eggNOG OGNA|NA|NA
BRITEko00000,ko00001,ko01000,ko01001,ko04131
Hectar predicted targeting categoryother localisation
Exons3
Model size264
Cds size264
Stop0
Start0
Relationships

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
mRNA_H-elongata_contig6149.13705.1prot_H-elongata_contig6149.13705.1Himanthalia elongata Himel1 dioeciouspolypeptideH-elongata_contig6149 2969..4432 +


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
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1691679653.9577365-CDS-H-elongata_contig6149:2968..30251691679653.9577365-CDS-H-elongata_contig6149:2968..3025Himanthalia elongata Himel1 dioeciousCDSH-elongata_contig6149 2969..3025 +
1622930992.7026434-CDS-H-elongata_contig6149:3728..38121622930992.7026434-CDS-H-elongata_contig6149:3728..3812Himanthalia elongata Himel1 dioeciousCDSH-elongata_contig6149 3729..3812 +
1691679653.9688878-CDS-H-elongata_contig6149:3728..38121691679653.9688878-CDS-H-elongata_contig6149:3728..3812Himanthalia elongata Himel1 dioeciousCDSH-elongata_contig6149 3729..3812 +
1622930992.7203116-CDS-H-elongata_contig6149:4309..44321622930992.7203116-CDS-H-elongata_contig6149:4309..4432Himanthalia elongata Himel1 dioeciousCDSH-elongata_contig6149 4310..4432 +
1691679653.978817-CDS-H-elongata_contig6149:4309..44321691679653.978817-CDS-H-elongata_contig6149:4309..4432Himanthalia elongata Himel1 dioeciousCDSH-elongata_contig6149 4310..4432 +


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of mRNA_H-elongata_contig6149.13705.1

>prot_H-elongata_contig6149.13705.1 ID=prot_H-elongata_contig6149.13705.1|Name=mRNA_H-elongata_contig6149.13705.1|organism=Himanthalia elongata Himel1 dioecious|type=polypeptide|length=88bp
LDILQTLLNLIEFMEHEVEGEALPIDIRILADLAEKCHAYAKALHYKELE
FQTNPTRCIESLIAINKKVGQPQAALGILTHAKNNLPV
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mRNA from alignment at H-elongata_contig6149:2969..4432+

Legend: polypeptideCDS
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>mRNA_H-elongata_contig6149.13705.1 ID=mRNA_H-elongata_contig6149.13705.1|Name=mRNA_H-elongata_contig6149.13705.1|organism=Himanthalia elongata Himel1 dioecious|type=mRNA|length=1464bp|location=Sequence derived from alignment at H-elongata_contig6149:2969..4432+ (Himanthalia elongata Himel1 dioecious)
CTCGATATCTTGCAGACCCTTCTTAATCTGATCGAGTTCATGGAGCATGA
GGTCGAGGTGAGGCTTTATATAGCCTTTATATACCTTTTATATAGCATCG
AGATTCGAGATTCCTCGTAGCTTCTCTATGTTCGTGGCATAGTATTTAGG
TCTTCAGTCTTTAGGCAAGGTATTTAGTATTTAGTACTGTATTTAGTATT
GTATTTAGGATGTATTTCGTCTTACGGCGCCTTCGGTCGGCCGGTCAATG
GCCTTGCTCTTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGCTTTATATAGCACACTA
TACTACTATTATAGTTCGAATATATTACGATATAGTCATAGTCTCGGACG
ATTTATTTCGGCACGCTGCGAAACCGCCTGCCATTTCCCTTTGCTCTATG
TAATTGGCACAGTACAGTACGCCCTCCTTGCTTTCGGTAGTATGGCTTCA
TTAAGGGTTAGGGTTAGTGGTTTAGCTATTATATACTTCGTAGTGATAGT
AGATTATATATTGATTTGGTAACAGAGCTTTGCTTGTCTGCACCTGTACC
TGCCTCCCGCGTCCTCCATTGCCTCTCATGATCATATAATGACAACTAAT
GACAATTGCTGCTCTTACTTCTCTTACTTTTGGCAATCTCATACAGTTCG
GTACAGTTCGGTACAGTTCGGTACAGTACAATACAACGATGTGTTATGAT
GCTATGTCATGATCTTTTATACGCTATGCTATGTCATCATCTTTTATATG
CTTCGAGTAGGGGGAAGCTTTGCCAATCGACATCCGGATTCTGGCGGATC
TTGCAGAAAAGTGTCACGCCTACGCCAAGGCCCTGCACTACAAGGTGAAG
AAGAAACAAAAGGCACCAAATCTCTTGAAGGGCCAATGTTGCGCTTGCCC
TCATCTTAGTTGATCTGGTTGAGTTACTATACTATACTATAATATACTAT
ACTATATACCTACTATACTGTACTATACTATACCATACTATACTATAGTT
CACATTCGAACCTGACGGTAGTTGATCCCCTGGACTACACATCTCATGGT
GCTAAGAAGGTGTGAATGTTCAGAGGGTTGGAATGAGTTAATATGCTTTT
AAATAATAATATACGATACTACACTGAAGAATATTGTAGATGTAACTGAA
GAATATAATATATGATATTTCTTCGCTTTCATTACTTGTTGGCTCTTCGC
GGTAAACCCTAACCCTAACGCTAACCATAATATAGCAATGCCGACAGTGG
TACCGTCAATGGTGACAATTATGACAATCTCGCCCCGGTAAGCCATAACC
CTAACCCTAACCCAATAGTGCCTCCAAACGAAACAAACCAGGAGCTGGAG
TTCCAGACCAACCCGACAAGGTGCATCGAGTCACTCATCGCTATTAACAA
GAAAGTCGGACAGCCTCAGGCGGCACTGGGGATCCTCACCCATGCAAAAA
ACAATCTCCCGGTC
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Coding sequence (CDS) from alignment at H-elongata_contig6149:2969..4432+

>mRNA_H-elongata_contig6149.13705.1 ID=mRNA_H-elongata_contig6149.13705.1|Name=mRNA_H-elongata_contig6149.13705.1|organism=Himanthalia elongata Himel1 dioecious|type=CDS|length=528bp|location=Sequence derived from alignment at H-elongata_contig6149:2969..4432+ (Himanthalia elongata Himel1 dioecious)
CTCGATATCTTGCAGACCCTTCTTAATCTGATCGAGTTCATGGAGCATGA
GGTCGAGCTCGATATCTTGCAGACCCTTCTTAATCTGATCGAGTTCATGG
AGCATGAGGTCGAGGGGGAAGCTTTGCCAATCGACATCCGGATTCTGGCG
GATCTTGCAGAAAAGTGTCACGCCTACGCCAAGGCCCTGCACTACAAGGG
GGAAGCTTTGCCAATCGACATCCGGATTCTGGCGGATCTTGCAGAAAAGT
GTCACGCCTACGCCAAGGCCCTGCACTACAAGGAGCTGGAGTTCCAGACC
AACCCGACAAGGTGCATCGAGTCACTCATCGCTATTAACAAGAAAGTCGG
ACAGCCTCAGGCGGCACTGGGGATCCTCACCCATGCAAAAAACAATCTCC
CGGTCGAGCTGGAGTTCCAGACCAACCCGACAAGGTGCATCGAGTCACTC
ATCGCTATTAACAAGAAAGTCGGACAGCCTCAGGCGGCACTGGGGATCCT
CACCCATGCAAAAAACAATCTCCCGGTC
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