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Homology
BLAST of mRNA_H-elongata_contig14324.2985.1 vs. uniprot
Match: A0A6H5JST0_9PHAE (Protein kinase domain-containing protein n=2 Tax=Ectocarpus TaxID=2879 RepID=A0A6H5JST0_9PHAE) HSP 1 Score: 333 bits (855), Expect = 5.510e-108 Identity = 161/170 (94.71%), Postives = 170/170 (100.00%), Query Frame = 1
Query: 1 MENMPVIIGRYRLSKTLGIGAFGKVKLGEHTLTGHKVAVKILNRGKVQALDMEDKVKREINILKLCRHPHIVRLHEIIDTPSDIFMVMEYAPNGELFDYIVSKGRPSTDEAQRLFQQIVTAVEYCHYHNIVHRDLKPENLLLDENNNLKIADFGLSNIMRDGEFLRTSCG 510
MENMPV+IGRYRLSKTLGIGAFGKVKLGEHTLTGH+VAVKILNRGK+QALDMEDKVKREINILKLCRHPHIVRLHEIIDTPSDIFMVMEYAPNGELFDYIVSKGRP+T+EAQRLFQQIVTAVEYCH+HNIVHRDLKPENLLLD++NNLKIADFGLSN+MRDGEFLRTSCG
Sbjct: 1 MENMPVVIGRYRLSKTLGIGAFGKVKLGEHTLTGHRVAVKILNRGKIQALDMEDKVKREINILKLCRHPHIVRLHEIIDTPSDIFMVMEYAPNGELFDYIVSKGRPTTEEAQRLFQQIVTAVEYCHFHNIVHRDLKPENLLLDQDNNLKIADFGLSNMMRDGEFLRTSCG 170
BLAST of mRNA_H-elongata_contig14324.2985.1 vs. uniprot
Match: A0A836C9Y0_9STRA (Non-specific serine/threonine protein kinase n=1 Tax=Tribonema minus TaxID=303371 RepID=A0A836C9Y0_9STRA) HSP 1 Score: 296 bits (758), Expect = 1.050e-94 Identity = 141/170 (82.94%), Postives = 160/170 (94.12%), Query Frame = 1
Query: 1 MENMPVIIGRYRLSKTLGIGAFGKVKLGEHTLTGHKVAVKILNRGKVQALDMEDKVKREINILKLCRHPHIVRLHEIIDTPSDIFMVMEYAPNGELFDYIVSKGRPSTDEAQRLFQQIVTAVEYCHYHNIVHRDLKPENLLLDENNNLKIADFGLSNIMRDGEFLRTSCG 510
MEN PV IG+YRLSKTLGIGAFGKVKLGEH +TG+KVAVKILN+GK+ ALDM +KV+REINIL+LC+HPHI RL+E+IDTP+DIFMVMEYAP GELFDYIVSKGRPS D+AQRLFQQ+V+AVEYCHYH+IVHRDLKPENLLLD++ NLKIADFGLSNI +DGEFLRTSCG
Sbjct: 1 MENAPVTIGQYRLSKTLGIGAFGKVKLGEHVITGNKVAVKILNKGKIAALDMVEKVRREINILRLCKHPHITRLYEVIDTPTDIFMVMEYAPGGELFDYIVSKGRPSPDDAQRLFQQLVSAVEYCHYHHIVHRDLKPENLLLDKDTNLKIADFGLSNITQDGEFLRTSCG 170
BLAST of mRNA_H-elongata_contig14324.2985.1 vs. uniprot
Match: A0A7S4DHN6_HETAK (Hypothetical protein (Fragment) n=1 Tax=Heterosigma akashiwo TaxID=2829 RepID=A0A7S4DHN6_HETAK) HSP 1 Score: 273 bits (697), Expect = 9.010e-89 Identity = 129/170 (75.88%), Postives = 151/170 (88.82%), Query Frame = 1
Query: 1 MENMPVIIGRYRLSKTLGIGAFGKVKLGEHTLTGHKVAVKILNRGKVQALDMEDKVKREINILKLCRHPHIVRLHEIIDTPSDIFMVMEYAPNGELFDYIVSKGRPSTDEAQRLFQQIVTAVEYCHYHNIVHRDLKPENLLLDENNNLKIADFGLSNIMRDGEFLRTSCG 510
++N+PV IG YRL KTLGIGAFGKVKLGEH +TGHKVA+KILNR K++ LDM +KV+REI ILK+C HPHI+RL E+IDTP+DIF+VMEY GELFDYIVSKGR +EAQ LFQQIV+ +EYCH++ IVHRDLKPENLLLDE+NN+KIADFGLSN+MRDGEFLRTSCG
Sbjct: 12 VDNVPVQIGHYRLGKTLGIGAFGKVKLGEHVITGHKVAIKILNRKKIKMLDMGEKVRREIKILKMCTHPHIIRLFEVIDTPTDIFVVMEYVSGGELFDYIVSKGRLPKEEAQSLFQQIVSGLEYCHHYGIVHRDLKPENLLLDEHNNIKIADFGLSNLMRDGEFLRTSCG 181
BLAST of mRNA_H-elongata_contig14324.2985.1 vs. uniprot
Match: A0A7S3ZZ19_9STRA (Non-specific serine/threonine protein kinase n=2 Tax=Pelagomonas calceolata TaxID=35677 RepID=A0A7S3ZZ19_9STRA) HSP 1 Score: 277 bits (708), Expect = 1.060e-87 Identity = 134/170 (78.82%), Postives = 151/170 (88.82%), Query Frame = 1
Query: 1 MENMPVIIGRYRLSKTLGIGAFGKVKLGEHTLTGHKVAVKILNRGKVQALDMEDKVKREINILKLCRHPHIVRLHEIIDTPSDIFMVMEYAPNGELFDYIVSKGRPSTDEAQRLFQQIVTAVEYCHYHNIVHRDLKPENLLLDENNNLKIADFGLSNIMRDGEFLRTSCG 510
M+N PV+IG YRLSKTLGIGAFGKVKL EH TGHKVAVKILNR K+ ALDM +KVKREINIL+ C HPHI+RL+E+IDTP+DIF+VMEY NGELFDYIVSKGR + DEA+ F QIV+ VEYCHYH+IVHRDLKPENLLLD +NN+KIADFGLSN+MRDGEFLRTSCG
Sbjct: 1 MDN-PVVIGTYRLSKTLGIGAFGKVKLAEHVTTGHKVAVKILNRAKIVALDMTEKVKREINILQRCTHPHIIRLYEVIDTPTDIFVVMEYVSNGELFDYIVSKGRLAPDEARHFFHQIVSGVEYCHYHHIVHRDLKPENLLLDADNNIKIADFGLSNVMRDGEFLRTSCG 169
BLAST of mRNA_H-elongata_contig14324.2985.1 vs. uniprot
Match: A0A7S3JSI0_9STRA (Non-specific serine/threonine protein kinase n=1 Tax=Aureoumbra lagunensis TaxID=44058 RepID=A0A7S3JSI0_9STRA) HSP 1 Score: 275 bits (702), Expect = 1.140e-85 Identity = 133/170 (78.24%), Postives = 151/170 (88.82%), Query Frame = 1
Query: 1 MENMPVIIGRYRLSKTLGIGAFGKVKLGEHTLTGHKVAVKILNRGKVQALDMEDKVKREINILKLCRHPHIVRLHEIIDTPSDIFMVMEYAPNGELFDYIVSKGRPSTDEAQRLFQQIVTAVEYCHYHNIVHRDLKPENLLLDENNNLKIADFGLSNIMRDGEFLRTSCG 510
MEN PV IG YRLSKTLGIGAFGKVKL EH TGHKVAVKILNR K+ ALDM +KVKREINIL+ C HPHI+RL+E+IDTP+DIF+VMEY NGELFDYIVSKGR + DEA+ F QI++ VEYCH+H+IVHRDLKPENLLLD++NN+KIADFGLSN+MRDGEFLRTSCG
Sbjct: 1 MEN-PVQIGAYRLSKTLGIGAFGKVKLAEHVSTGHKVAVKILNRAKIVALDMSEKVKREINILQRCTHPHIIRLYEVIDTPTDIFVVMEYVSNGELFDYIVSKGRLAPDEARHFFHQIISGVEYCHFHDIVHRDLKPENLLLDKDNNIKIADFGLSNVMRDGEFLRTSCG 169
BLAST of mRNA_H-elongata_contig14324.2985.1 vs. uniprot
Match: A0A7S3M5D2_9STRA (Hypothetical protein (Fragment) n=1 Tax=Spumella elongata TaxID=89044 RepID=A0A7S3M5D2_9STRA) HSP 1 Score: 258 bits (660), Expect = 1.650e-85 Identity = 118/170 (69.41%), Postives = 146/170 (85.88%), Query Frame = 1
Query: 1 MENMPVIIGRYRLSKTLGIGAFGKVKLGEHTLTGHKVAVKILNRGKVQALDMEDKVKREINILKLCRHPHIVRLHEIIDTPSDIFMVMEYAPNGELFDYIVSKGRPSTDEAQRLFQQIVTAVEYCHYHNIVHRDLKPENLLLDENNNLKIADFGLSNIMRDGEFLRTSCG 510
M+N P+++ +YRL KTLGIGAFGKVKL H +TG KVAVKILN+GK++ L+M +KV+REINILK+C HPHI+RL+E+IDTPSDIF++MEY GELFDYIVS+GR DEA+ F QIV+ +EYCH++ IVHRDLKPENLLLD +NN+KIADFGLSN+ DG+FLRTSCG
Sbjct: 1 MDNAPIVLAQYRLGKTLGIGAFGKVKLAHHVVTGLKVAVKILNKGKIKHLEMAEKVRREINILKMCTHPHIIRLYEVIDTPSDIFVIMEYVSGGELFDYIVSRGRLPPDEARHFFHQIVSGIEYCHHYKIVHRDLKPENLLLDSDNNIKIADFGLSNVAHDGDFLRTSCG 170
BLAST of mRNA_H-elongata_contig14324.2985.1 vs. uniprot
Match: W7TMX0_9STRA (Non-specific serine/threonine protein kinase (Fragment) n=2 Tax=Monodopsidaceae TaxID=425072 RepID=W7TMX0_9STRA) HSP 1 Score: 271 bits (692), Expect = 8.110e-84 Identity = 124/170 (72.94%), Postives = 152/170 (89.41%), Query Frame = 1
Query: 1 MENMPVIIGRYRLSKTLGIGAFGKVKLGEHTLTGHKVAVKILNRGKVQALDMEDKVKREINILKLCRHPHIVRLHEIIDTPSDIFMVMEYAPNGELFDYIVSKGRPSTDEAQRLFQQIVTAVEYCHYHNIVHRDLKPENLLLDENNNLKIADFGLSNIMRDGEFLRTSCG 510
M + P+ +G YRL KTLGIGAFGKVKLG+H +TGH VA+KILNR +++ LDM +KV+REINILK+C HPHI+RL+E+IDTP+DIF+VMEY PNGELFDYIVSKGR + DEA+R F QI++ VEYCH+H+IVHRDLKPENLLLD +NN+K+ADFGLSNIM+DG+FLRTSCG
Sbjct: 1 MADNPLQVGHYRLLKTLGIGAFGKVKLGKHIITGHLVAIKILNRNRIKQLDMGEKVRREINILKMCTHPHIIRLYEVIDTPTDIFVVMEYVPNGELFDYIVSKGRLNADEARRFFHQIISGVEYCHFHHIVHRDLKPENLLLDADNNIKLADFGLSNIMKDGDFLRTSCG 170
BLAST of mRNA_H-elongata_contig14324.2985.1 vs. uniprot
Match: A0A2P4XJT5_9STRA (SNF1-related protein Kinase catalytic subunit alpha n=1 Tax=Phytophthora palmivora var. palmivora TaxID=611791 RepID=A0A2P4XJT5_9STRA) HSP 1 Score: 258 bits (658), Expect = 6.770e-83 Identity = 118/170 (69.41%), Postives = 146/170 (85.88%), Query Frame = 1
Query: 1 MENMPVIIGRYRLSKTLGIGAFGKVKLGEHTLTGHKVAVKILNRGKVQALDMEDKVKREINILKLCRHPHIVRLHEIIDTPSDIFMVMEYAPNGELFDYIVSKGRPSTDEAQRLFQQIVTAVEYCHYHNIVHRDLKPENLLLDENNNLKIADFGLSNIMRDGEFLRTSCG 510
M ++P+ +G YRL KTLGIG+FGKVKL EH +TGHKVA+KILNR K+++LDM +KV+REI +L+ RHPHI+RL+E+IDTP+DIFMV+EY GELFDYIVSKGR + +EA+ F QI++ VEYCH+H IVHRDLKPENLLLD +NN+KIADFGLSN M DG+FLRTSCG
Sbjct: 1 MSDIPIQLGHYRLGKTLGIGSFGKVKLAEHDITGHKVAIKILNRNKIRSLDMSEKVRREITLLRKMRHPHIIRLYEVIDTPTDIFMVLEYIAGGELFDYIVSKGRLAPEEARHFFHQIISGVEYCHFHRIVHRDLKPENLLLDADNNIKIADFGLSNSMEDGDFLRTSCG 170
BLAST of mRNA_H-elongata_contig14324.2985.1 vs. uniprot
Match: A0A7S2W5U8_9STRA (Non-specific serine/threonine protein kinase n=1 Tax=Rhizochromulina marina TaxID=1034831 RepID=A0A7S2W5U8_9STRA) HSP 1 Score: 265 bits (676), Expect = 1.670e-82 Identity = 126/170 (74.12%), Postives = 142/170 (83.53%), Query Frame = 1
Query: 1 MENMPVIIGRYRLSKTLGIGAFGKVKLGEHTLTGHKVAVKILNRGKVQALDMEDKVKREINILKLCRHPHIVRLHEIIDTPSDIFMVMEYAPNGELFDYIVSKGRPSTDEAQRLFQQIVTAVEYCHYHNIVHRDLKPENLLLDENNNLKIADFGLSNIMRDGEFLRTSCG 510
M+ +PV+IG YRL K LGIGAFGKVK + +TGH VA+KILNR ++Q LDM +KVKREINILK C H HI+RL+E+IDTPSDIF+VMEY P+GELFDYIV KGR S DEA+ F QI+ VEYCHYHNIVHRDLKPENLLLD NLKIADFGLSN MRDGEFLRTSCG
Sbjct: 1 MDQVPVVIGNYRLGKNLGIGAFGKVKHATNVITGHHVAIKILNRNRIQQLDMTEKVKREINILKQCTHAHIIRLYEVIDTPSDIFVVMEYVPHGELFDYIVMKGRLSPDEARHFFHQIIAGVEYCHYHNIVHRDLKPENLLLDAEQNLKIADFGLSNTMRDGEFLRTSCG 170
BLAST of mRNA_H-elongata_contig14324.2985.1 vs. uniprot
Match: A0A7S2FAW3_9STRA (Hypothetical protein (Fragment) n=1 Tax=Dictyocha speculum TaxID=35687 RepID=A0A7S2FAW3_9STRA) HSP 1 Score: 253 bits (645), Expect = 2.100e-82 Identity = 122/163 (74.85%), Postives = 136/163 (83.44%), Query Frame = 1
Query: 22 IGRYRLSKTLGIGAFGKVKLGEHTLTGHKVAVKILNRGKVQALDMEDKVKREINILKLCRHPHIVRLHEIIDTPSDIFMVMEYAPNGELFDYIVSKGRPSTDEAQRLFQQIVTAVEYCHYHNIVHRDLKPENLLLDENNNLKIADFGLSNIMRDGEFLRTSCG 510
IG YRL K LGIGAFGKVK H +TGH VA+KILNR ++ LDM DKVKREINILK C HPHI+RL+E+IDTP+DIF+VMEY NGELFDYIVSKGR DEA+ F QIV VEYCH+H+IVHRDLKPENLLLD +N LKIADFGLSN MRDG+FLRTSCG
Sbjct: 10 IGNYRLGKNLGIGAFGKVKHATHVITGHHVAIKILNRKRIGDLDMADKVKREINILKKCSHPHIIRLYEVIDTPTDIFVVMEYVSNGELFDYIVSKGRLVPDEARHFFHQIVAGVEYCHFHSIVHRDLKPENLLLDADNTLKIADFGLSNTMRDGDFLRTSCG 172
The following BLAST results are available for this feature:
Alignments
The following features are aligned
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Properties
| Property Name | Value |
| Taxonomic scope | Eukaryota |
| Seed ortholog score | 334.7 |
| Seed ortholog evalue | 2.6e-89 |
| Seed eggNOG ortholog | 2880.D7G746 |
| Preferred name | PRKAA2 |
| KEGG ko | ko:K07198,ko:K12761,ko:K21989 |
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2556,GO:0042557,GO:0042592,GO:0042593,GO:0042594,GO:0042595,GO:0042710,GO:0042752,GO:0042770,GO:0042981,GO:0042995,GO:0043005,GO:0043025,GO:0043066,GO:0043067,GO:0043069,GO:0043085,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043233,GO:0043255,GO:0043279,GO:0043405,GO:0043406,GO:0043408,GO:0043410,GO:0043412,GO:0043436,GO:0043467,GO:0043470,GO:0043549,GO:0043562,GO:0043900,GO:0043933,GO:0044010,GO:0044057,GO:0044058,GO:0044085,GO:0044087,GO:0044093,GO:0044182,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044275,GO:0044281,GO:0044297,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044428,GO:0044430,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044451,GO:0044459,GO:0044463,GO:0044464,GO:0044764,GO:0044770,GO:0044772,GO:0044773,GO:0044774,GO:0044783,GO:0044819,GO:0044839,GO:0044843,GO:0045137,GO:0045177,GO:0045178,GO:0045197,GO:0045229,GO:0045471,GO:0045540,GO:0045542,GO:0045595,GO:0045597,GO:0045664,GO:0045666,GO:0045722,GO:0045786,GO:0045787,GO:0045792,GO:0045821,GO:0045833,GO:0045834,GO:0045844,GO:0045859,GO:0045860,GO:0045893,GO:0045913,GO:0045923,GO:0045927,GO:0045930,GO:0045935,GO:0045937,GO:0045940,GO:0045981,GO:0046015,GO:0046034,GO:0046317,GO:0046318,GO:0046320,GO:0046321,GO:0046324,GO:0046325,GO:0046326,GO:0046352,GO:0046390,GO:0046483,GO:0046677,GO:0046777,GO:0046822,GO:0046824,GO:0046825,GO:0046827,GO:0046889,GO:0046890,GO:0046956,GO:0048364,GO:0048366,GO:0048367,GO:0048468,GO:0048513,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0048580,GO:0048582,GO:0048583,GO:0048584,GO:0048585,GO:0048608,GO:0048634,GO:0048636,GO:0048641,GO:0048643,GO:0048666,GO:0048667,GO:0048699,GO:0048731,GO:0048812,GO:0048813,GO:0048827,GO:0048856,GO:0048858,GO:0048869,GO:0048871,GO:0048878,GO:0050708,GO:0050709,GO:0050714,GO:0050767,GO:0050769,GO:0050770,GO:0050772,GO:0050789,GO:0050790,GO:0050793,GO:0050794,GO:0050801,GO:0050810,GO:0050896,GO:0050920,GO:0050921,GO:0050994,GO:0050995,GO:0051020,GO:0051046,GO:0051047,GO:0051048,GO:0051049,GO:0051050,GO:0051051,GO:0051055,GO:0051094,GO:0051128,GO:0051130,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051173,GO:0051174,GO:0051179,GO:0051193,GO:0051194,GO:0051196,GO:0051197,GO:0051222,GO:0051223,GO:0051224,GO:0051235,GO:0051239,GO:0051240,GO:0051246,GO:0051247,GO:0051248,GO:0051252,GO:0051254,GO:0051259,GO:0051270,GO:0051272,GO:0051276,GO:0051291,GO:0051298,GO:0051321,GO:0051338,GO:0051347,GO:0051493,GO:0051592,GO:0051606,GO:0051704,GO:0051716,GO:0051726,GO:0051960,GO:0051962,GO:0052128,GO:0055081,GO:0055082,GO:0055086,GO:0055088,GO:0055089,GO:0055114,GO:0060090,GO:0060176,GO:0060249,GO:0060255,GO:0060284,GO:0060341,GO:0060548,GO:0060627,GO:0060968,GO:0061062,GO:0061063,GO:0061065,GO:0061066,GO:0061245,GO:0061458,GO:0061695,GO:0061744,GO:0061762,GO:0061919,GO:0062012,GO:0062013,GO:0065003,GO:0065007,GO:0065008,GO:0065009,GO:0070013,GO:0070050,GO:0070201,GO:0070301,GO:0070482,GO:0070507,GO:0070542,GO:0070726,GO:0070783,GO:0070887,GO:0070925,GO:0071156,GO:0071158,GO:0071215,GO:0071229,GO:0071236,GO:0071241,GO:0071248,GO:0071277,GO:0071310,GO:0071322,GO:0071326,GO:0071331,GO:0071333,GO:0071361,GO:0071379,GO:0071380,GO:0071396,GO:0071398,GO:0071417,GO:0071453,GO:0071456,GO:0071495,GO:0071496,GO:0071554,GO:0071555,GO:0071704,GO:0071731,GO:0071732,GO:0071840,GO:0071852,GO:0071900,GO:0071902,GO:0071940,GO:0071944,GO:0072331,GO:0072395,GO:0072401,GO:0072413,GO:0072422,GO:0072431,GO:0072521,GO:0072522,GO:0080022,GO:0080090,GO:0080134,GO:0080135,GO:0090033,GO:0090043,GO:0090066,GO:0090068,GO:0090087,GO:0090153,GO:0090155,GO:0090181,GO:0090205,GO:0090304,GO:0090311,GO:0090316,GO:0090407,GO:0090604,GO:0090606,GO:0090693,GO:0097009,GO:0097124,GO:0097159,GO:0097237,GO:0097305,GO:0097306,GO:0097327,GO:0097366,GO:0097367,GO:0097447,GO:0097458,GO:0097472,GO:0097574,GO:0097708,GO:0098534,GO:0098590,GO:0098772,GO:0099004,GO:0099402,GO:0106118,GO:0106120,GO:0120025,GO:0120035,GO:0120036,GO:0120038,GO:0120039,GO:0140030,GO:0140096,GO:1900060,GO:1900076,GO:1900077,GO:1900371,GO:1900373,GO:1900428,GO:1900430,GO:1900434,GO:1900436,GO:1900542,GO:1900544,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901261,GO:1901265,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901563,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901575,GO:1901576,GO:1901654,GO:1901655,GO:1901698,GO:1901699,GO:1901700,GO:1901701,GO:1901796,GO:1901861,GO:1901863,GO:1901983,GO:1901985,GO:1901987,GO:1901988,GO:1901990,GO:1901991,GO:1902170,GO:1902400,GO:1902402,GO:1902403,GO:1902494,GO:1902531,GO:1902532,GO:1902533,GO:1902554,GO:1902667,GO:1902669,GO:1902680,GO:1902749,GO:1902806,GO:1902807,GO:1902911,GO:1902930,GO:1902932,GO:1903047,GO:1903108,GO:1903109,GO:1903214,GO:1903432,GO:1903506,GO:1903508,GO:1903530,GO:1903531,GO:1903532,GO:1903533,GO:1903578,GO:1903580,GO:1903664,GO:1903665,GO:1903747,GO:1903749,GO:1903827,GO:1903829,GO:1903955,GO:1904262,GO:1904428,GO:1904950,GO:1904951,GO:1905038,GO:1990234,GO:1990794,GO:1990904,GO:2000026,GO:2000045,GO:2000112,GO:2000113,GO:2000134,GO:2000241,GO:2000303,GO:2000756,GO:2000758,GO:2000765,GO:2000766,GO:2001141,GO:2001169,GO:2001171,GO:2001273,GO:2001274 |
| EggNOG free text desc. | protein serine/threonine kinase activity |
| EggNOG OGs | KOG0583@1,KOG0583@2759 |
| EC | 2.7.11.1,2.7.11.11 |
| COG Functional cat. | G |
| Best tax level | Eukaryota |
| Best eggNOG OG | NA|NA|NA |
| BRITE | ko00000,ko00001,ko01000,ko01001,ko02000,ko03029,ko04131 |
| Hectar predicted targeting category | other localisation |
| Exons | 4 |
| Model size | 534 |
| Cds size | 534 |
| Stop | 1 |
| Start | 1 |
Relationships
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type | Position |
| 1622929850.0813663-CDS-H-elongata_contig14324:858..937 | 1622929850.0813663-CDS-H-elongata_contig14324:858..937 | Himanthalia elongata Himel1 dioecious | CDS | H-elongata_contig14324 859..937 + |
| 1691679182.6248343-CDS-H-elongata_contig14324:858..937 | 1691679182.6248343-CDS-H-elongata_contig14324:858..937 | Himanthalia elongata Himel1 dioecious | CDS | H-elongata_contig14324 859..937 + |
| 1622929850.0984898-CDS-H-elongata_contig14324:2228..2413 | 1622929850.0984898-CDS-H-elongata_contig14324:2228..2413 | Himanthalia elongata Himel1 dioecious | CDS | H-elongata_contig14324 2229..2413 + |
| 1691679182.6380582-CDS-H-elongata_contig14324:2228..2413 | 1691679182.6380582-CDS-H-elongata_contig14324:2228..2413 | Himanthalia elongata Himel1 dioecious | CDS | H-elongata_contig14324 2229..2413 + |
| 1622929850.1137497-CDS-H-elongata_contig14324:5310..5444 | 1622929850.1137497-CDS-H-elongata_contig14324:5310..5444 | Himanthalia elongata Himel1 dioecious | CDS | H-elongata_contig14324 5311..5444 + |
| 1691679182.6465447-CDS-H-elongata_contig14324:5310..5444 | 1691679182.6465447-CDS-H-elongata_contig14324:5310..5444 | Himanthalia elongata Himel1 dioecious | CDS | H-elongata_contig14324 5311..5444 + |
| 1622929850.1265182-CDS-H-elongata_contig14324:7767..7903 | 1622929850.1265182-CDS-H-elongata_contig14324:7767..7903 | Himanthalia elongata Himel1 dioecious | CDS | H-elongata_contig14324 7768..7903 + |
| 1691679182.655413-CDS-H-elongata_contig14324:7767..7903 | 1691679182.655413-CDS-H-elongata_contig14324:7767..7903 | Himanthalia elongata Himel1 dioecious | CDS | H-elongata_contig14324 7768..7903 + |
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of mRNA_H-elongata_contig14324.2985.1 >prot_H-elongata_contig14324.2985.1 ID=prot_H-elongata_contig14324.2985.1|Name=mRNA_H-elongata_contig14324.2985.1|organism=Himanthalia elongata Himel1 dioecious|type=polypeptide|length=178bp
MENMPVIIGRYRLSKTLGIGAFGKVKLGEHTLTGHKVAVKILNRGKVQAL DMEDKVKREINILKLCRHPHIVRLHEIIDTPSDIFMVMEYAPNGELFDYI VSKGRPSTDEAQRLFQQIVTAVEYCHYHNIVHRDLKPENLLLDENNNLKI ADFGLSNIMRDGEFLRTSCGKTTKDLI* back to topmRNA from alignment at H-elongata_contig14324:859..7903+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >mRNA_H-elongata_contig14324.2985.1 ID=mRNA_H-elongata_contig14324.2985.1|Name=mRNA_H-elongata_contig14324.2985.1|organism=Himanthalia elongata Himel1 dioecious|type=mRNA|length=7045bp|location=Sequence derived from alignment at H-elongata_contig14324:859..7903+ (Himanthalia elongata Himel1 dioecious) ATGGAGAACATGCCGGTCATAATTGGTCGGTATCGGCTGAGCAAGACCCT
GGGGATAGGAGCGTTCGGAAAAGTCAAACGTGAGCCGTGCTCGAGCTCGA
GCTCGAGCTCGACCCTCTAAAGTCGAAATCGTAGAAAGGGAGGGCCTTTC
ACGTAGAAAGCGGGCGAGCTAAAGAACAGTCAAGCTCGACATGAGCTGTG
TACCCAGAGCACTGGAGTAGCTGGGGTTTTCATTATCCACGCTTTGACTT
TGTACTTTCCTTGCTCTTGATGTCGATCAAATAATGCTTGTGAGTATAAT
CGACCTGATACCATGCTGGACACCACATTTCACTGATTCTTCCCTGTCGC
TATCGGCAAGCAGGGACACGCTGGCTCGTTGGTAGCTCCAACTAGAGCGC
GGCGCAACTTATGCGGCGAACGATTGTGTTCTCGTCTATTGCTGACCTGT
CCCCAGTAGTTTAAAATCCCCTCTCGGCATCCATCGACCCCTACCTAGAG
ATGTTTCCGCTGCCCCACTCGACTACCGAGCATATCAACAACTCGCGAAA
AAACAAAAGAGATTGTATGTTTTTTCGCCGCCCGACGCTCGGAGTCCTCT
TGTAGGCCCTGTTCTATTTTTTATTTTATTTTTTTCTTTCTAAAAAACAT
AAGAAACATCCTGTACCGAATTGTGTTTTGCCTGATAATCGAAAGACAAC
CCAAAAGCACAAAGCACAGCTGCTCCGCTCTTTGATCGTCGCCCGAGTGG
GCCTGTCGTAGTGATGGCCACAAAGGCCATTGGTTTGCGATTATACTGAG
GTTCGTTCGTTTTATGTAGGCACTGTAATGTATACTGTATTGTCTGCTGT
ACTCTATATGAAAGGAGAACGAGAGAACGGGACGTACCAGCGTTCAACCA
TTGAGTCAGGGGGTGAATCCTGGGAGTGCTGAATTTTCATCGACAGCAAT
AAAAATTCGTAGGCGTGAACCTAGGCGAGGTCAATAGATACATCAATTGG
GACGATAGGCATGATGGCAATGTTGCAATACTATAATACTCTTAAGGGAG
GTTGGTACCAAACTAGCTCGTTGGAAGTGATCACAAAATGGTGTACTGTA
CCAAGTACATTACTATTACTAATAATAAGACATGACAGCTGGGTGAAGGG
ACGCGGTCAAAATCTACCTTTTAAAAAAAAGAAGGATGCGCTCCCAAAAA
GAGAGGCTAATACATACCGTACCAGGTATAGCTTTCTAATCGGGATACAT
ACATACATACATACATACGTTGTGATTATTTCATGTGCAGTAGTTACCTT
TCTAGAGATTATACTAAGCGTAGTATATCCTTTCTCCTTACTTAACGCTT
TCGTTTTGCTGTGGACAAAGTTGGAGAGCACACGTTGACTGGACACAAGG
TGGCGGTCAAAATTCTAAACCGGGGCAAGGTCCAAGCCTTGGACATGGAA
GACAAGGTCAAGAGGGAGATCAATATCCTCAAGCTCTGCCGACATCCACA
CATCGTGAGGCTGCACGAGATCATCGACACACCAAGCGACATCTTCATGG
TCATGGTGAGGGAACGACCCTGTCCATTTTTTTCTTCTTTTTCCAATCGC
CCTTACCTACCGTAGCAGCTCTAGGGTACACATCACATCACATCACATTA
CTAATAATACTACTAATGTTAAACTACGTAGTAATTTTGTGTCACGCTGC
TATGTATATTTTTATTTTTTAAAAACTTGAACTCATCCCAACCCTCCGAA
CATCCTCGCTATATGTATGCTGTTCTTGTTTTCCTTTTTCGAATGTTCAG
CATACCACAAGCTGAAGGGATTGGCCACCGTGTACCTACAGCAGATACTG
TACTGTAACTCAGTCTATTCGTGTTAAGCATTAATAGCATTAATAGTTGC
GAAACATCGACAACAACTGCAGGACAGTGTTCCGTGTGTTCCTTCGAAAC
TACAGCGCAAAAATTTCAAAATAATACTATACGTGCGTATTGAGACACGA
GTCCGAGGCCTACGTTCAAAAAATTACTATACGTGCGTATTAAGACACGA
GTCCGAGGCCTACGTTTATTGAACACTGGGCTGGACTTGCTTCGTGTTTC
AGGGCTAATGACGCACGATGAGCCCCCCTGCTTCCCCCTCCTTGTACACA
ATAATAGTATTAATATTAATATTAGTATTGCCTCATCACCTCGCAGTGTG
AGGATCGATGGTGCCTTTGACTTCAGTAATTTTTTGTTAAGAAGGAAGGA
AGTCTCCCGTTGACGCCGCTAACGTCGAGCCCTTGTCGTTTGAGATCTCG
TTTGAGGCACCCTTGTCGTTTCAGAGATCGCCCAGGATAAGTGTCGATTG
ACCGCGGCGCATCCGTTTCCTACAAACACTGGAGATAGGGCTGAACCCAC
ACCACCACTTTTGCTGGATGCTCTCCGCCCTTTACTCTTACATAGTATAG
TATAATATAGTATAGAAATAGTATAGTATAGTATAATATAGTAAAGTACA
GTATAGTATAGTAGAGTATAGTATAGTATAGTACCGGTATGATTTTTATG
CAGTAGAATAGTTTCCATCTCCCCATTGCATCGTCTAGTAATGCCATGTC
GATGTCGATGTTGTGTATAGCATACTTGGTATATTATGATTATTGGTAAT
ATTTTTTCTGTATCGTGCGAGCAAGCAATTTTCGGAGACTCAATTTTACC
TCCACCAAGGTGAAACCCGCATTACTATCTGACTATCTACCTATTAACAC
CGTTACCGTTATACACACATCAGTTGCAAGAGCGAGTGACTGTAGAGGCA
AATCTCATTTTGGCGGATTATATTTACTAGTAATAATCAACTACAAGTCA
CTGTACTGTGCAGGGGTCAAACGACATATTCTAACAAAATAGAAAGTACT
GTAGACAGTATTATTATCCTATTAGTAGTATTAATAGTATTAATAGTAGT
ACTTGAGATTATGCTATTTTCACCCTAAGTGTAGCTCTAATGGCGCCGCA
GAACGTGAGGGTAGCTAATCACAGCACCCCGAGAGGGCTAGGGCTGGAGC
TGAGCTCATGTTTCAACGACTTTCCTTGGAAGTGTCGTATTCATAATTAT
TGGGGCCAGACTAGGTTCTCTAGACTTTGCTGCGCCTGAATTGTGTGTGT
GTGTTTTTTATTAAGAACTGAACAACGAGTGAGCATTGCTTGGCAATCCG
TGTTAGTGCGATCACACCACGCGAGGACTGTTCGCGGTCGAGAACGGTCC
AGGAGAAAATTCGGAAAGTTAAGTTGATTCCGTGAAATTTTACACCCGTC
ATTGTCGCTTGTGTGGTAAAGCGGTGGAGGGGTTTACGTGGAGGGGTCTG
CGACATGCATTGAAAGTCAACACCCTGCGGTCATCGCGTTAATGTATTCC
GTTATTTCGTTATTCTGTCTAAAAAGCGGCGTCCTATGCGCGGTGTCAAT
CGATTTGCGCGTGTTTTGACCCTTTTTCTTAATAAATTGACCGCATTCTC
GTCAGCAGTCAAGTCAGTAACCCAGTCAGCCAGTTCCTCGGCAGCAGTTA
ATGTAGTTCCTCTTAACTGGCACCACATAACGGGCAACGTGGGCTATTTT
CATTAAAAAAAAGTTGAACTCATTCCAACCCTCAGAACATCCAGACCTTC
TTAGCGCCGGGAGAGGTACCCTCCGGGGGACCAACTATCGTCGGGTTCAA
ATGTGTACATTACTCTACCTTTGAGCACAAAATCGTCACATATGAGTATA
TATTTTTAAAGAGGATATAGGTCAGTAAAGCACATGGTTGCATTATGCAT
ACATCGATTGATTTCGGGCTGTATTACATATAAACTCATTTTAACCCTCT
GAACATCCACGCCTTCTTAGCACACTACATTATACATTCCGAGCAGTTTT
GGTGCCGAGTTCGCTGTTGCATTTAGGACACGTTCCGACGTCGATTGTTA
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TTTCTGCGAACTTCCTGTGGTAAGACAACGAAGGATCTTATTTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at H-elongata_contig14324:859..7903+ >mRNA_H-elongata_contig14324.2985.1 ID=mRNA_H-elongata_contig14324.2985.1|Name=mRNA_H-elongata_contig14324.2985.1|organism=Himanthalia elongata Himel1 dioecious|type=CDS|length=1068bp|location=Sequence derived from alignment at H-elongata_contig14324:859..7903+ (Himanthalia elongata Himel1 dioecious) ATGGAGAACATGCCGGTCATAATTGGTCGGTATCGGCTGAGCAAGACCCT GGGGATAGGAGCGTTCGGAAAAGTCAAACATGGAGAACATGCCGGTCATA ATTGGTCGGTATCGGCTGAGCAAGACCCTGGGGATAGGAGCGTTCGGAAA AGTCAAACTTGGAGAGCACACGTTGACTGGACACAAGGTGGCGGTCAAAA TTCTAAACCGGGGCAAGGTCCAAGCCTTGGACATGGAAGACAAGGTCAAG AGGGAGATCAATATCCTCAAGCTCTGCCGACATCCACACATCGTGAGGCT GCACGAGATCATCGACACACCAAGCGACATCTTCATGGTCATGTTGGAGA GCACACGTTGACTGGACACAAGGTGGCGGTCAAAATTCTAAACCGGGGCA AGGTCCAAGCCTTGGACATGGAAGACAAGGTCAAGAGGGAGATCAATATC CTCAAGCTCTGCCGACATCCACACATCGTGAGGCTGCACGAGATCATCGA CACACCAAGCGACATCTTCATGGTCATGGAGTACGCGCCGAACGGGGAAC TTTTCGATTATATCGTGTCAAAGGGGCGCCCATCGACGGACGAGGCGCAG CGATTATTTCAGCAGATCGTGACCGCGGTGGAGTATTGCCACTACCACAA CATCGTGCACCGGAGTACGCGCCGAACGGGGAACTTTTCGATTATATCGT GTCAAAGGGGCGCCCATCGACGGACGAGGCGCAGCGATTATTTCAGCAGA TCGTGACCGCGGTGGAGTATTGCCACTACCACAACATCGTGCACCGAGAT CTCAAGCCGGAGAATCTCCTGCTCGATGAGAACAACAACCTCAAGATTGC AGACTTTGGTCTCTCAAACATCATGCGCGATGGAGAATTTCTGCGAACTT CCTGTGGTAAGACAACGAAGGATCTTATTTAAAGATCTCAAGCCGGAGAA TCTCCTGCTCGATGAGAACAACAACCTCAAGATTGCAGACTTTGGTCTCT CAAACATCATGCGCGATGGAGAATTTCTGCGAACTTCCTGTGGTAAGACA ACGAAGGATCTTATTTAA back to top
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