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Homology
BLAST of mRNA_H-paniculata_contig1452.2707.1 vs. uniprot
Match: A0A6H5KI56_9PHAE (Uncharacterized protein (Fragment) n=1 Tax=Ectocarpus sp. CCAP 1310/34 TaxID=867726 RepID=A0A6H5KI56_9PHAE) HSP 1 Score: 182 bits (461), Expect = 7.540e-47 Identity = 144/297 (48.48%), Postives = 172/297 (57.91%), Query Frame = 1
Query: 199 CRRRLLRPFLVETDQPPCPTTATEAAGVVDGGGQKGGDXXXXXXXEDSPVADGVWGGVLDNVGPCRRWRGGGRSSDSGVQSGRRRGWAAAVSEEVWGFGAGGVCGSEASCNFPAYVGFVDRALKACKPLREKTRGSVSLIPTPAENSTTKNDAVASGGNXXXXXXXXXXGSNMVSRDDTAGMHGMIARWLRGESERLVVYIAADSTALPAADRARAVRALLHSVGILAVFFS----HACEVGVDQPELESTLWATTTSVVDALKHAAAAADYQTLCEGLARLHRIVGCLLRAAANAS 1077
CRRR PFL+ET PCP +AAGV D XXXXXXX + +ADGVWGG LD++GP RR G R+GWAAA + VWG G CGS+A PAYV F+ LK C ++ +P T+ V G XXXXXXX SNMVSR+DTA MH +IARWLR E RL A L +RAR VRALLHS+G+LAVFF HACE GVD EL+S LW + T+ V+AL+H A A+Y TLCEGLARL+R++ LL AA S
Sbjct: 616 CRRR---PFLIETGDTPCPLI--DAAGVADREATAAXXXXXXXXXXXA-IADGVWGGALDDLGPFRRRHG---XXXXXXXXXARKGWAAATAVAVWGHGRR--CGSDAE--LPAYVDFMASTLKEC---------ALQAEASPLCGRTSLETGVLGG-----XXXXXXXXSNMVSREDTAAMHRLIARWLRPEVARLARRAAEPMLPL---ERARVVRALLHSLGVLAVFFRWEWCHACETGVDHLELQSALWVSVTASVEALEHTARVAEYTTLCEGLARLNRVIRSLLHRAAGCS 882
BLAST of mRNA_H-paniculata_contig1452.2707.1 vs. uniprot
Match: D8LNB7_ECTSI (Non-specific serine/threonine protein kinase n=1 Tax=Ectocarpus siliculosus TaxID=2880 RepID=D8LNB7_ECTSI) HSP 1 Score: 170 bits (430), Expect = 9.830e-43 Identity = 143/334 (42.81%), Postives = 173/334 (51.80%), Query Frame = 1
Query: 217 RPFLVETDQPPCPTTATEAAGVVDGGGQKGGDXXXXXXXEDSP------------VADGVWGGVLDNVGPCRRWRGGGRSSDSGVQSGRRRGWAAAVSEEVWGFGAGGVCGSEASCNFPAYVGFVDRALKACKPLRE-KTRGSVSLIPTPAENSTTKNDAVASGGNXXXXXXXXXXGSNMVSRDDTAGMHGMIARWLRGESERLVVYIAADSTALPAADRARAVRALLHSVGILAVFFSHACEVGVDQPELESTLWATTTSVVDALKHAAAAADYQTLCEGLARLHRIVGCLLRAAANASPAQHDNSEEADQ----------SAAALAEVLRFC 1149
RPFL+ET PCP ++D GG G D XX +ADGVWGG LD++GP RR R GG G GG PAYV F+ LK C+P E + ++ +P T+ V G XXXXXXX SNMVSR+DTA MH +IARWLR E RL A LP +RAR VRALLHS+G+ AVFFSHACE GVD +L+S LWA+ + V AL+H A A+Y TLCEGLARL+R+V LL AA S + D SE+ + SA+AL EVLRFC
Sbjct: 696 RPFLIETGDTPCP--------LLDAGG--GADREAPAXXXXXXXXXXVXXXXXXAIADGVWGGALDDLGPFRR-RHGGEXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXHGRRGGGD-----DAELPAYVDFMTSTLKECEPRVEASSAAALQAEASPLSGRTSLETGVLGG-----XXXXXXXXSNMVSREDTAAMHRLIARWLRAEVARLARRAAEPM--LPV-ERARVVRALLHSLGVFAVFFSHACEAGVDHLDLQSALWASVAASVKALEHTARVAEYATLCEGLARLNRVVRSLLHRAAGCSSS--DLSEQRCELQGGGGDDYGSASALGEVLRFC 1003
The following BLAST results are available for this feature:
Alignments
The following features are aligned
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Properties
Property Name | Value |
Taxonomic scope | Eukaryota |
Seed ortholog score | 174.9 |
Seed ortholog evalue | 7.4e-41 |
Seed eggNOG ortholog | 2880.D8LNB7 |
Preferred name | ATM |
KEGG ko | ko:K04728 |
KEGG Pathway | ko01524,ko03440,ko04064,ko04068,ko04110,ko04115,ko04210,ko04214,ko04218,ko05165,ko05166,ko05202,ko05206,map01524,map03440,map04064,map04068,map04110,map04115,map04210,map04214,map04218,map05165,map05166,map05202,map05206 |
KEGG Module | M00295,M00691 |
Hectar predicted targeting category | other localisation |
GOs | GO:0000003,GO:0000075,GO:0000077,GO:0000278,GO:0000280,GO:0000706,GO:0000723,GO:0000724,GO:0000725,GO:0000726,GO:0000729,GO:0000956,GO:0001541,GO:0001666,GO:0001756,GO:0001775,GO:0001894,GO:0001895,GO:0001932,GO:0001934,GO:0002200,GO:0002327,GO:0002329,GO:0002331,GO:0002376,GO:0002377,GO:0002440,GO:0002520,GO:0002521,GO:0002562,GO:0002682,GO:0002683,GO:0002694,GO:0002695,GO:0003002,GO:0003006,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004672,GO:0004674,GO:0004677,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005730,GO:0005737,GO:0005819,GO:0005856,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006260,GO:0006281,GO:0006302,GO:0006303,GO:0006310,GO:0006325,GO:0006342,GO:0006348,GO:0006355,GO:0006401,GO:0006402,GO:0006403,GO:0006464,GO:0006468,GO:0006629,GO:0006644,GO:0006650,GO:0006661,GO:0006725,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006915,GO:0006950,GO:0006974,GO:0006975,GO:0006977,GO:0006996,GO:0007049,GO:0007050,GO:0007059,GO:0007088,GO:0007093,GO:0007094,GO:0007095,GO:0007127,GO:0007131,GO:0007140,GO:0007143,GO:0007154,GO:0007165,GO:0007275,GO:0007276,GO:0007281,GO:0007292,GO:0007346,GO:0007389,GO:0007399,GO:0007417,GO:0007420,GO:0007507,GO:0007548,GO:0007568,GO:0007569,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008219,GO:0008285,GO:0008334,GO:0008340,GO:0008406,GO:0008585,GO:0008610,GO:0008630,GO:0008654,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009314,GO:0009410,GO:0009628,GO:0009653,GO:0009790,GO:0009791,GO:0009792,GO:0009888,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009891,GO:0009892,GO:0009893,GO:0009894,GO:0009896,GO:0009952,GO:0009966,GO:0009967,GO:0009968,GO:0009987,GO:0009994,GO:0010033,GO:0010165,GO:0010212,GO:0010243,GO:0010259,GO:0010332,GO:0010389,GO:0010468,GO:0010506,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010558,GO:0010562,GO:0010564,GO:0010604,GO:0010605,GO:0010629,GO:0010638,GO:0010639,GO:0010646,GO:0010647,GO:0010648,GO:0010941,GO:0010942,GO:0010948,GO:0010965,GO:0010972,GO:0012501,GO:0014070,GO:0014074,GO:0015630,GO:0016043,GO:0016070,GO:0016071,GO:0016233,GO:0016301,GO:0016303,GO:0016310,GO:0016444,GO:0016458,GO:0016569,GO:0016570,GO:0016572,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0018105,GO:0018193,GO:0018209,GO:0019219,GO:0019220,GO:0019222,GO:0019439,GO:0019538,GO:0019637,GO:0019953,GO:0022402,GO:0022412,GO:0022414,GO:0023051,GO:0023052,GO:0023056,GO:0023057,GO:0030071,GO:0030097,GO:0030098,GO:0030154,GO:0030163,GO:0030183,GO:0030258,GO:0030330,GO:0030717,GO:0030888,GO:0030889,GO:0031000,GO:0031056,GO:0031058,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031328,GO:0031329,GO:0031331,GO:0031334,GO:0031347,GO:0031348,GO:0031399,GO:0031401,GO:0031503,GO:0031570,GO:0031571,GO:0031572,GO:0031577,GO:0031974,GO:0031981,GO:0032006,GO:0032007,GO:0032200,GO:0032204,GO:0032205,GO:0032206,GO:0032210,GO:0032212,GO:0032268,GO:0032270,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032504,GO:0032944,GO:0032945,GO:0032991,GO:0033036,GO:0033043,GO:0033044,GO:0033045,GO:0033046,GO:0033047,GO:0033048,GO:0033127,GO:0033129,GO:0033151,GO:0033554,GO:0034350,GO:0034351,GO:0034397,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034655,GO:0035004,GO:0035173,GO:0035264,GO:0035282,GO:0035556,GO:0035825,GO:0036092,GO:0036211,GO:0036270,GO:0036289,GO:0036293,GO:0040007,GO:0040029,GO:0042113,GO:0042127,GO:0042157,GO:0042159,GO:0042221,GO:0042325,GO:0042327,GO:0042493,GO:0042592,GO:0042770,GO:0042981,GO:0043009,GO:0043030,GO:0043065,GO:0043066,GO:0043067,GO:0043068,GO:0043069,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043233,GO:0043254,GO:0043279,GO:0043412,GO:0043516,GO:0043517,GO:0043523,GO:0043525,GO:0044087,GO:0044089,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044267,GO:0044270,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044428,GO:0044430,GO:0044446,GO:0044464,GO:0044703,GO:0044773,GO:0044774,GO:0044783,GO:0044818,GO:0044819,GO:0044877,GO:0045017,GO:0045088,GO:0045132,GO:0045137,GO:0045141,GO:0045143,GO:0045321,GO:0045494,GO:0045786,GO:0045787,GO:0045814,GO:0045824,GO:0045839,GO:0045841,GO:0045892,GO:0045930,GO:0045934,GO:0045935,GO:0045937,GO:0046474,GO:0046483,GO:0046486,GO:0046488,GO:0046545,GO:0046649,GO:0046660,GO:0046700,GO:0046777,GO:0046834,GO:0046854,GO:0046983,GO:0047485,GO:0048232,GO:0048285,GO:0048468,GO:0048477,GO:0048513,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0048534,GO:0048538,GO:0048583,GO:0048584,GO:0048585,GO:0048589,GO:0048599,GO:0048608,GO:0048609,GO:0048646,GO:0048731,GO:0048732,GO:0048856,GO:0048869,GO:0048871,GO:0050000,GO:0050670,GO:0050672,GO:0050776,GO:0050777,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050864,GO:0050865,GO:0050866,GO:0050869,GO:0050896,GO:0051052,GO:0051053,GO:0051054,GO:0051128,GO:0051129,GO:0051130,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051173,GO:0051174,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051236,GO:0051246,GO:0051247,GO:0051249,GO:0051250,GO:0051252,GO:0051253,GO:0051276,GO:0051303,GO:0051321,GO:0051402,GO:0051409,GO:0051640,GO:0051641,GO:0051649,GO:0051656,GO:0051704,GO:0051716,GO:0051726,GO:0051783,GO:0051784,GO:0051983,GO:0051985,GO:0052742,GO:0060249,GO:0060255,GO:0060322,GO:0060429,GO:0060548,GO:0061053,GO:0061458,GO:0061982,GO:0061988,GO:0065007,GO:0065008,GO:0070013,GO:0070192,GO:0070482,GO:0070663,GO:0070664,GO:0070727,GO:0070997,GO:0071044,GO:0071156,GO:0071158,GO:0071173,GO:0071174,GO:0071214,GO:0071478,GO:0071479,GO:0071480,GO:0071481,GO:0071500,GO:0071704,GO:0071840,GO:0072331,GO:0072359,GO:0072395,GO:0072401,GO:0072413,GO:0072422,GO:0072425,GO:0072431,GO:0072434,GO:0080090,GO:0080134,GO:0080135,GO:0090068,GO:0090220,GO:0090304,GO:0090399,GO:0090407,GO:0097190,GO:0097193,GO:0097694,GO:0097695,GO:0098813,GO:0104004,GO:0140013,GO:0140096,GO:1900034,GO:1901214,GO:1901215,GO:1901216,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575,GO:1901576,GO:1901698,GO:1901796,GO:1901798,GO:1901987,GO:1901988,GO:1901990,GO:1901991,GO:1902099,GO:1902100,GO:1902275,GO:1902400,GO:1902402,GO:1902403,GO:1902531,GO:1902532,GO:1902533,GO:1902679,GO:1902749,GO:1902750,GO:1902806,GO:1902807,GO:1903046,GO:1903047,GO:1903432,GO:1903506,GO:1903507,GO:1903624,GO:1903626,GO:1903978,GO:1904262,GO:1904353,GO:1904354,GO:1904356,GO:1904358,GO:1904882,GO:1904884,GO:1905269,GO:1905818,GO:1905819,GO:1905843,GO:1990164,GO:1990391,GO:2000045,GO:2000112,GO:2000113,GO:2000134,GO:2000278,GO:2000573,GO:2000816,GO:2001020,GO:2001022,GO:2001141,GO:2001228,GO:2001251,GO:2001252 |
EggNOG free text desc. | protein serine/threonine kinase activity |
EggNOG OGs | KOG0892@1,KOG0892@2759 |
EC | 2.7.11.1 |
COG Functional cat. | T |
Best tax level | Eukaryota |
Best eggNOG OG | NA|NA|NA |
BRITE | ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01001,ko03032,ko03400 |
Exons | 3 |
Model size | 1149 |
Cds size | 1149 |
Stop | 0 |
Start | 0 |
Relationships
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of mRNA_H-paniculata_contig1452.2707.1 >prot_H-paniculata_contig1452.2707.1 ID=prot_H-paniculata_contig1452.2707.1|Name=mRNA_H-paniculata_contig1452.2707.1|organism=Halopteris paniculata Hal_grac_a_UBK monoicous|type=polypeptide|length=383bp
GGGLALIEGEEALSAAVVALVAVTCQGPPPVVQGEFGVGPCAAGTSVAEA GFFHTGVSSDGGNRRSCRRRLLRPFLVETDQPPCPTTATEAAGVVDGGGQ KGGDGGDGGDDEDSPVADGVWGGVLDNVGPCRRWRGGGRSSDSGVQSGRR RGWAAAVSEEVWGFGAGGVCGSEASCNFPAYVGFVDRALKACKPLREKTR GSVSLIPTPAENSTTKNDAVASGGNDGGGGTGGSSGSNMVSRDDTAGMHG MIARWLRGESERLVVYIAADSTALPAADRARAVRALLHSVGILAVFFSHA CEVGVDQPELESTLWATTTSVVDALKHAAAAADYQTLCEGLARLHRIVGC LLRAAANASPAQHDNSEEADQSAAALAEVLRFC back to topmRNA from alignment at H-paniculata_contig1452:13347..19337+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >mRNA_H-paniculata_contig1452.2707.1 ID=mRNA_H-paniculata_contig1452.2707.1|Name=mRNA_H-paniculata_contig1452.2707.1|organism=Halopteris paniculata Hal_grac_a_UBK monoicous|type=mRNA|length=5991bp|location=Sequence derived from alignment at H-paniculata_contig1452:13347..19337+ (Halopteris paniculata Hal_grac_a_UBK monoicous) GGTGGAGGTCTAGCTTTGATAGAAGGAGAGGAAGCTCTGAGCGCAGCGGT
GGTTGCTCTGGTAGCCGTGACGTGTCAGGGGCCGCCGCCGGTAGTGCAAG
GCGAGTTCGGCGTTGGTCCTTGTGCTGCTGGCACTAGTGTCGCCGAGGCC
GGTTTCTTTCACACGGGTGTCTCAAGCGATGGGGGCAACCGCCGCAGCTG
CCGCCGCCGATTGCTTCGTCCATTTCTCGTGGAGACTGACCAACCTCCGT
GCCCGACGACGGCGACGGAGGCCGCGGGGGTGGTCGACGGCGGCGGGCAG
AAGGGTGGTGATGGTGGTGATGGTGGTGATGACGAGGACTCACCTGTCGC
CGACGGGGTGTGGGGTGGAGTTCTCGACAATGTGGGGCCTTGCCGGCGGT
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ACCAGTCGGCTGCGGCGTTGGCTGAAGTTCTGCGATTTTGT back to topCoding sequence (CDS) from alignment at H-paniculata_contig1452:13347..19337+ >mRNA_H-paniculata_contig1452.2707.1 ID=mRNA_H-paniculata_contig1452.2707.1|Name=mRNA_H-paniculata_contig1452.2707.1|organism=Halopteris paniculata Hal_grac_a_UBK monoicous|type=CDS|length=2298bp|location=Sequence derived from alignment at H-paniculata_contig1452:13347..19337+ (Halopteris paniculata Hal_grac_a_UBK monoicous) GGTGGAGGTCTAGCTTTGATAGAAGGAGAGGAAGCTCTGAGCGCAGCGGT GGTTGCTCTGGTAGCCGTGACGTGTCAGGGGCCGCCGCCGGTAGTGCAAG GCGAGTTCGGCGTTGGTCCTTGTGCTGCTGGCACTAGTGTCGCCGAGGCC GGTTTCTTTCACACGGGTGTCTCAAGCGATGGGGGCAACCGCCGCAGCTG CCGCCGCCGATTGCTTCGTCCATTTCTCGTGGAGACTGACCAACCTCCGT GCCCGACGACGGCGACGGAGGCCGCGGGGGTGGTCGACGGCGGCGGGCAG AAGGGTGGTGATGGTGGTGATGGTGGTGATGACGAGGACTCACCTGTCGC CGACGGGGTGTGGGGTGGAGTTCTCGACAATGTGGGGCCTTGCCGGCGGT GGCGTGGCGGTGGAAGGAGTAGTGATAGTGGGGTGCAATCAGGAAGGAGG CGGGGCTGGGCGGCCGCCGTGTCTGAAGAGGTGTGGGGGTTCGGCGCTGG CGGGGTCTGCGGGAGCGAGGCCAGCTGTAACTTTCCCGCGTACGTTGGGT TTGTCGATCGGGCTCTGAAGGCATGCAGGTGGAGGTCTAGCTTTGATAGA AGGAGAGGAAGCTCTGAGCGCAGCGGTGGTTGCTCTGGTAGCCGTGACGT GTCAGGGGCCGCCGCCGGTAGTGCAAGGCGAGTTCGGCGTTGGTCCTTGT GCTGCTGGCACTAGTGTCGCCGAGGCCGGTTTCTTTCACACGGGTGTCTC AAGCGATGGGGGCAACCGCCGCAGCTGCCGCCGCCGATTGCTTCGTCCAT TTCTCGTGGAGACTGACCAACCTCCGTGCCCGACGACGGCGACGGAGGCC GCGGGGGTGGTCGACGGCGGCGGGCAGAAGGGTGGTGATGGTGGTGATGG TGGTGATGACGAGGACTCACCTGTCGCCGACGGGGTGTGGGGTGGAGTTC TCGACAATGTGGGGCCTTGCCGGCGGTGGCGTGGCGGTGGAAGGAGTAGT GATAGTGGGGTGCAATCAGGAAGGAGGCGGGGCTGGGCGGCCGCCGTGTC TGAAGAGGTGTGGGGGTTCGGCGCTGGCGGGGTCTGCGGGAGCGAGGCCA GCTGTAACTTTCCCGCGTACGTTGGGTTTGTCGATCGGGCTCTGAAGGCA TGCAAGCCGCTTCGGGAGAAAACACGTGGCAGCGTCAGCCTTATTCCTAC CCCCGCCGAAAATTCAACAACCAAGAACGATGCTGTCGCCAGTGGTGGCA ACGACGGTGGCGGTGGAACCGGTGGAAGCAGCGGAAGCAATATGGTCTCC CGCGACGACACCGCCGGCATGCACGGCATGATCGCACGTTGGCTACGGGG TGAGTCGGAAAGGCTGGTGGTCTACATAGCGGCCGATTCTACCGCCCTTC CTGCAGCAGATAGGGCTAGGGCGGTGCGGGCACTTCTGCACTCTGTCGGC ATCCTCGCCGTCTTTTTCAGAGCCGCTTCGGGAGAAAACACGTGGCAGCG TCAGCCTTATTCCTACCCCCGCCGAAAATTCAACAACCAAGAACGATGCT GTCGCCAGTGGTGGCAACGACGGTGGCGGTGGAACCGGTGGAAGCAGCGG AAGCAATATGGTCTCCCGCGACGACACCGCCGGCATGCACGGCATGATCG CACGTTGGCTACGGGGTGAGTCGGAAAGGCTGGTGGTCTACATAGCGGCC GATTCTACCGCCCTTCCTGCAGCAGATAGGGCTAGGGCGGTGCGGGCACT TCTGCACTCTGTCGGCATCCTCGCCGTCTTTTTCAGCCACGCGTGCGAGG TGGGGGTGGATCAGCCGGAGCTAGAGTCGACGTTGTGGGCAACAACGACT TCCGTTGTGGATGCGCTAAAACACGCCGCGGCAGCTGCCGACTACCAGAC GCTTTGCGAGGGCCTGGCCAGGCTGCACCGCATTGTGGGCTGTCTATTGC GTGCGGCAGCGAACGCCTCGCCAGCTCAACATGATAACAGCGAAGAAGCT GACCAGTCGGCTGCGGCGTTGGCTGAAGTTCTGCGATTTTGTCCACGCGT GCGAGGTGGGGGTGGATCAGCCGGAGCTAGAGTCGACGTTGTGGGCAACA ACGACTTCCGTTGTGGATGCGCTAAAACACGCCGCGGCAGCTGCCGACTA CCAGACGCTTTGCGAGGGCCTGGCCAGGCTGCACCGCATTGTGGGCTGTC TATTGCGTGCGGCAGCGAACGCCTCGCCAGCTCAACATGATAACAGCGAA GAAGCTGACCAGTCGGCTGCGGCGTTGGCTGAAGTTCTGCGATTTTGT back to top
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