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Homology
BLAST of mRNA_H-paniculata_contig1452.2705.1 vs. uniprot
Match: A0A6H5KI56_9PHAE (Uncharacterized protein (Fragment) n=1 Tax=Ectocarpus sp. CCAP 1310/34 TaxID=867726 RepID=A0A6H5KI56_9PHAE) HSP 1 Score: 156 bits (394), Expect = 1.100e-38 Identity = 83/124 (66.94%), Postives = 95/124 (76.61%), Query Frame = 1
Query: 1 MLRKDGLGVLSFILRTLKQAQRTQREYILEYLRLHLRIAGASKEGCVDGHQDPIFDKVPNLYSLLVNEQQTAEAIGSTALFRIGAGSGQQRVGRSGTGLWLSLERRGRMHLLLCADLIRFYRQD 372
MLR DG GVL F+LR +AQRTQREYI+EYLRLHLRIA A++EGC +G +DPIFD VP LY LLVNEQ+ A A+GS AL QQR R G GLWLSLERRGR HLLLCADL+R YR++
Sbjct: 37 MLRSDGSGVLDFVLRRFSKAQRTQREYIVEYLRLHLRIARAAREGCAEGDRDPIFDAVPTLYRLLVNEQEIAGAVGSAALQL------QQRR-RGGPGLWLSLERRGRAHLLLCADLVRCYREE 153
BLAST of mRNA_H-paniculata_contig1452.2705.1 vs. uniprot
Match: D8LNB7_ECTSI (Non-specific serine/threonine protein kinase n=1 Tax=Ectocarpus siliculosus TaxID=2880 RepID=D8LNB7_ECTSI) HSP 1 Score: 132 bits (333), Expect = 1.330e-30 Identity = 71/107 (66.36%), Postives = 82/107 (76.64%), Query Frame = 1
Query: 52 KQAQRTQREYILEYLRLHLRIAGASKEGCVDGHQDPIFDKVPNLYSLLVNEQQTAEAIGSTALFRIGAGSGQQRVGRSGTGLWLSLERRGRMHLLLCADLIRFYRQD 372
K +RTQREYI+EYLRLHLRIA A++EGC +G +DPIFD VP LY LLVNEQ+ A A+GS AL QQR R G GLWLSLERRGR HLLLCADL+R YR++
Sbjct: 134 KILERTQREYIVEYLRLHLRIARAAREGCAEGDRDPIFDAVPTLYRLLVNEQEIAGAVGSAALQL------QQRR-RGGPGLWLSLERRGRAHLLLCADLVRCYREE 233
The following BLAST results are available for this feature:
Alignments
The following features are aligned
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Properties
Property Name | Value |
Taxonomic scope | Eukaryota |
Seed ortholog score | 151.0 |
Seed ortholog evalue | 9.7e-34 |
Seed eggNOG ortholog | 2880.D8LNB7 |
Preferred name | ATM |
KEGG ko | ko:K04728 |
KEGG Pathway | ko01524,ko03440,ko04064,ko04068,ko04110,ko04115,ko04210,ko04214,ko04218,ko05165,ko05166,ko05202,ko05206,map01524,map03440,map04064,map04068,map04110,map04115,map04210,map04214,map04218,map05165,map05166,map05202,map05206 |
KEGG Module | M00295,M00691 |
Hectar predicted targeting category | other localisation |
GOs | GO:0000003,GO:0000075,GO:0000077,GO:0000278,GO:0000280,GO:0000706,GO:0000723,GO:0000724,GO:0000725,GO:0000726,GO:0000729,GO:0000956,GO:0001541,GO:0001666,GO:0001756,GO:0001775,GO:0001894,GO:0001895,GO:0001932,GO:0001934,GO:0002200,GO:0002327,GO:0002329,GO:0002331,GO:0002376,GO:0002377,GO:0002440,GO:0002520,GO:0002521,GO:0002562,GO:0002682,GO:0002683,GO:0002694,GO:0002695,GO:0003002,GO:0003006,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004672,GO:0004674,GO:0004677,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005730,GO:0005737,GO:0005819,GO:0005856,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006260,GO:0006281,GO:0006302,GO:0006303,GO:0006310,GO:0006325,GO:0006342,GO:0006348,GO:0006355,GO:0006401,GO:0006402,GO:0006403,GO:0006464,GO:0006468,GO:0006629,GO:0006644,GO:0006650,GO:0006661,GO:0006725,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006915,GO:0006950,GO:0006974,GO:0006975,GO:0006977,GO:0006996,GO:0007049,GO:0007050,GO:0007059,GO:0007088,GO:0007093,GO:0007094,GO:0007095,GO:0007127,GO:0007131,GO:0007140,GO:0007143,GO:0007154,GO:0007165,GO:0007275,GO:0007276,GO:0007281,GO:0007292,GO:0007346,GO:0007389,GO:0007399,GO:0007417,GO:0007420,GO:0007507,GO:0007548,GO:0007568,GO:0007569,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008219,GO:0008285,GO:0008334,GO:0008340,GO:0008406,GO:0008585,GO:0008610,GO:0008630,GO:0008654,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009314,GO:0009410,GO:0009628,GO:0009653,GO:0009790,GO:0009791,GO:0009792,GO:0009888,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009891,GO:0009892,GO:0009893,GO:0009894,GO:0009896,GO:0009952,GO:0009966,GO:0009967,GO:0009968,GO:0009987,GO:0009994,GO:0010033,GO:0010165,GO:0010212,GO:0010243,GO:0010259,GO:0010332,GO:0010389,GO:0010468,GO:0010506,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010558,GO:0010562,GO:0010564,GO:0010604,GO:0010605,GO:0010629,GO:0010638,GO:0010639,GO:0010646,GO:0010647,GO:0010648,GO:0010941,GO:0010942,GO:0010948,GO:0010965,GO:0010972,GO:0012501,GO:0014070,GO:0014074,GO:0015630,GO:0016043,GO:0016070,GO:0016071,GO:0016233,GO:0016301,GO:0016303,GO:0016310,GO:0016444,GO:0016458,GO:0016569,GO:0016570,GO:0016572,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0018105,GO:0018193,GO:0018209,GO:0019219,GO:0019220,GO:0019222,GO:0019439,GO:0019538,GO:0019637,GO:0019953,GO:0022402,GO:0022412,GO:0022414,GO:0023051,GO:0023052,GO:0023056,GO:0023057,GO:0030071,GO:0030097,GO:0030098,GO:0030154,GO:0030163,GO:0030183,GO:0030258,GO:0030330,GO:0030717,GO:0030888,GO:0030889,GO:0031000,GO:0031056,GO:0031058,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031328,GO:0031329,GO:0031331,GO:0031334,GO:0031347,GO:0031348,GO:0031399,GO:0031401,GO:0031503,GO:0031570,GO:0031571,GO:0031572,GO:0031577,GO:0031974,GO:0031981,GO:0032006,GO:0032007,GO:0032200,GO:0032204,GO:0032205,GO:0032206,GO:0032210,GO:0032212,GO:0032268,GO:0032270,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032504,GO:0032944,GO:0032945,GO:0032991,GO:0033036,GO:0033043,GO:0033044,GO:0033045,GO:0033046,GO:0033047,GO:0033048,GO:0033127,GO:0033129,GO:0033151,GO:0033554,GO:0034350,GO:0034351,GO:0034397,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034655,GO:0035004,GO:0035173,GO:0035264,GO:0035282,GO:0035556,GO:0035825,GO:0036092,GO:0036211,GO:0036270,GO:0036289,GO:0036293,GO:0040007,GO:0040029,GO:0042113,GO:0042127,GO:0042157,GO:0042159,GO:0042221,GO:0042325,GO:0042327,GO:0042493,GO:0042592,GO:0042770,GO:0042981,GO:0043009,GO:0043030,GO:0043065,GO:0043066,GO:0043067,GO:0043068,GO:0043069,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043233,GO:0043254,GO:0043279,GO:0043412,GO:0043516,GO:0043517,GO:0043523,GO:0043525,GO:0044087,GO:0044089,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044267,GO:0044270,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044428,GO:0044430,GO:0044446,GO:0044464,GO:0044703,GO:0044773,GO:0044774,GO:0044783,GO:0044818,GO:0044819,GO:0044877,GO:0045017,GO:0045088,GO:0045132,GO:0045137,GO:0045141,GO:0045143,GO:0045321,GO:0045494,GO:0045786,GO:0045787,GO:0045814,GO:0045824,GO:0045839,GO:0045841,GO:0045892,GO:0045930,GO:0045934,GO:0045935,GO:0045937,GO:0046474,GO:0046483,GO:0046486,GO:0046488,GO:0046545,GO:0046649,GO:0046660,GO:0046700,GO:0046777,GO:0046834,GO:0046854,GO:0046983,GO:0047485,GO:0048232,GO:0048285,GO:0048468,GO:0048477,GO:0048513,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0048534,GO:0048538,GO:0048583,GO:0048584,GO:0048585,GO:0048589,GO:0048599,GO:0048608,GO:0048609,GO:0048646,GO:0048731,GO:0048732,GO:0048856,GO:0048869,GO:0048871,GO:0050000,GO:0050670,GO:0050672,GO:0050776,GO:0050777,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050864,GO:0050865,GO:0050866,GO:0050869,GO:0050896,GO:0051052,GO:0051053,GO:0051054,GO:0051128,GO:0051129,GO:0051130,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051173,GO:0051174,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051236,GO:0051246,GO:0051247,GO:0051249,GO:0051250,GO:0051252,GO:0051253,GO:0051276,GO:0051303,GO:0051321,GO:0051402,GO:0051409,GO:0051640,GO:0051641,GO:0051649,GO:0051656,GO:0051704,GO:0051716,GO:0051726,GO:0051783,GO:0051784,GO:0051983,GO:0051985,GO:0052742,GO:0060249,GO:0060255,GO:0060322,GO:0060429,GO:0060548,GO:0061053,GO:0061458,GO:0061982,GO:0061988,GO:0065007,GO:0065008,GO:0070013,GO:0070192,GO:0070482,GO:0070663,GO:0070664,GO:0070727,GO:0070997,GO:0071044,GO:0071156,GO:0071158,GO:0071173,GO:0071174,GO:0071214,GO:0071478,GO:0071479,GO:0071480,GO:0071481,GO:0071500,GO:0071704,GO:0071840,GO:0072331,GO:0072359,GO:0072395,GO:0072401,GO:0072413,GO:0072422,GO:0072425,GO:0072431,GO:0072434,GO:0080090,GO:0080134,GO:0080135,GO:0090068,GO:0090220,GO:0090304,GO:0090399,GO:0090407,GO:0097190,GO:0097193,GO:0097694,GO:0097695,GO:0098813,GO:0104004,GO:0140013,GO:0140096,GO:1900034,GO:1901214,GO:1901215,GO:1901216,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575,GO:1901576,GO:1901698,GO:1901796,GO:1901798,GO:1901987,GO:1901988,GO:1901990,GO:1901991,GO:1902099,GO:1902100,GO:1902275,GO:1902400,GO:1902402,GO:1902403,GO:1902531,GO:1902532,GO:1902533,GO:1902679,GO:1902749,GO:1902750,GO:1902806,GO:1902807,GO:1903046,GO:1903047,GO:1903432,GO:1903506,GO:1903507,GO:1903624,GO:1903626,GO:1903978,GO:1904262,GO:1904353,GO:1904354,GO:1904356,GO:1904358,GO:1904882,GO:1904884,GO:1905269,GO:1905818,GO:1905819,GO:1905843,GO:1990164,GO:1990391,GO:2000045,GO:2000112,GO:2000113,GO:2000134,GO:2000278,GO:2000573,GO:2000816,GO:2001020,GO:2001022,GO:2001141,GO:2001228,GO:2001251,GO:2001252 |
EggNOG free text desc. | protein serine/threonine kinase activity |
EggNOG OGs | KOG0892@1,KOG0892@2759 |
EC | 2.7.11.1 |
COG Functional cat. | T |
Best tax level | Eukaryota |
Best eggNOG OG | NA|NA|NA |
BRITE | ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01001,ko03032,ko03400 |
Exons | 4 |
Model size | 975 |
Cds size | 975 |
Stop | 0 |
Start | 1 |
Relationships
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of mRNA_H-paniculata_contig1452.2705.1 >prot_H-paniculata_contig1452.2705.1 ID=prot_H-paniculata_contig1452.2705.1|Name=mRNA_H-paniculata_contig1452.2705.1|organism=Halopteris paniculata Hal_grac_a_UBK monoicous|type=polypeptide|length=325bp
MLRKDGLGVLSFILRTLKQAQRTQREYILEYLRLHLRIAGASKEGCVDGH QDPIFDKVPNLYSLLVNEQQTAEAIGSTALFRIGAGSGQQRVGRSGTGLW LSLERRGRMHLLLCADLIRFYRQDHTDATSSEKNAGGGGGGGCLDKENSG GWTEREDGGALDNNGTDDCESGVDDGDGDDDAGNVAAFAVGGCGARGGKR KNRARKAGERRGGGEGGGAHYSGGGGEGRRRGTGSRGGHCSGGERKRTRV TDPWEDILGALHAGAPVTLTPQGSGHLPSISQDSCGRRSPTNAAGSGAGA TGGGSGAGGGAASAAQTLPWLQLLA back to topmRNA from alignment at H-paniculata_contig1452:6753..10589+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >mRNA_H-paniculata_contig1452.2705.1 ID=mRNA_H-paniculata_contig1452.2705.1|Name=mRNA_H-paniculata_contig1452.2705.1|organism=Halopteris paniculata Hal_grac_a_UBK monoicous|type=mRNA|length=3837bp|location=Sequence derived from alignment at H-paniculata_contig1452:6753..10589+ (Halopteris paniculata Hal_grac_a_UBK monoicous) ATGCTACGTAAGGACGGGTTGGGTGTTCTCAGTTTCATCTTACGGACGCT
GAAGCAGGCACAGGTCCGTTTCTTACTAATTATTCCGAGTCATTTTTTCA
AGTTGATTACCTTGGAGACGTGAGGTCATGTACCATCGAAAACAACAAGC
CTAGCGAGGGAGATCGATGGCACCTTTCCTATTGACACGATCGGGGTGTG
AACTTACAGTTAGAATAGGGGAGGGGGGGAGTCAAACGTGGAAAATGATC
AAATTATGTAATGTAGAAACAGTAGAATGACCGTGTATGTAAAAACGTTT
TGAGACTCATTTGGCAACGTGGGAGAGAGCGATTGGTCATCGAAAATTGT
TCCGATAGGAACAAAACTCCGTTCTCCTGAGTACGCGTGATCAATGATCT
AACAACTACCCCATGCAAAACATGACTACCCCCCCGCCCCCCCCGCGCGC
ACACACTCCATATCGCTTCGTCCTGGCATTGCAGGGAGACCAGGTAGATG
GATGATCTCTGAGTATGGGTGAACTAGAAGAGCTGCATATATATATCTAT
AAGGGTGTTGCGAGTTCATAAGATGCATCCATGTTTATGCTGGAGTCCAG
GTTTATCACGTGCATATCTGTTTTCATCACGTCAACCCACTTCTCCCTCT
TTGTTATACATGCGAATGACGGAGAAGTACCCCCCCCCCCCCTCCCCCCT
TCCCCCCGCCGCCTCCCCCCGTCCCCCGACCGTTTCTGTTATACTACTGC
GTAATAGCGCACACAGCGGGAGTATATCTTGGAATACCTCCGCTTGCACC
TGCGCATCGCGGGGGCCAGCAAGGAGGGGTGTGTCGACGGCCATCAGGAC
CCCATTTTTGACAAGGTTCCGAATCTGTACAGGTGCGCGAGCTATCGGGG
CACGCGAAAGCCAGGCTGTGTGATGAGTTGGTTGCAGGGTATATATATAT
ATAGATGTATTTCTTGTTTTGGCAAAACAACTCAAGATAAAAATAATATG
AAAGCGCAACTCGAAAAAAGGGTTCGAGTCGTAGTGCGATGGTGTCCCCG
CCCCCCCCCGCACACAGAACCATATTTGGTAACGTAGGAAAGAGCGATCG
CCCATCGGAAATCGCTCTGATAGGAAAACGATGTTCCGTCCTCTCGAGGA
CGCATGGATACTGGTCTAATAAATACGGCATACAAAATATGAGTACGTCC
TCCTCCCCCCCGAGCGCGTACGACGTTCTTGTTCGTCATGAATATTCTTC
GCAGCATTAGTTATATAGCAGCAAAAGCGCCCCGGCACCTCGAAACGGGA
AATACTATCCGTTCAATGGTGCCCAACAAGCTCGAGTTGCTGTGGTGACA
TCATGTTTTCGTGGGTGTTCTTGCTCGAGTTTCTTCTCTGATTTACCCCG
GCGCATATTTGTTCTTGTTGATACTACCAATGCCTTTTATTAGCCACTCC
TCTCCCCCTCCCCCTCCCCCATCCTCAAAGTTGCTTCAAGTGCAAGCAAG
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TGCCGCGCAAACCCTCCCCTGGCTGCAACTCTTGGCG back to topCoding sequence (CDS) from alignment at H-paniculata_contig1452:6753..10589+ >mRNA_H-paniculata_contig1452.2705.1 ID=mRNA_H-paniculata_contig1452.2705.1|Name=mRNA_H-paniculata_contig1452.2705.1|organism=Halopteris paniculata Hal_grac_a_UBK monoicous|type=CDS|length=1950bp|location=Sequence derived from alignment at H-paniculata_contig1452:6753..10589+ (Halopteris paniculata Hal_grac_a_UBK monoicous) ATGCTACGTAAGGACGGGTTGGGTGTTCTCAGTTTCATCTTACGGACGCT GAAGCAGGCACAGATGCTACGTAAGGACGGGTTGGGTGTTCTCAGTTTCA TCTTACGGACGCTGAAGCAGGCACAGCGCACACAGCGGGAGTATATCTTG GAATACCTCCGCTTGCACCTGCGCATCGCGGGGGCCAGCAAGGAGGGGTG TGTCGACGGCCATCAGGACCCCATTTTTGACAAGGTTCCGAATCTGTACA GCGCACACAGCGGGAGTATATCTTGGAATACCTCCGCTTGCACCTGCGCA TCGCGGGGGCCAGCAAGGAGGGGTGTGTCGACGGCCATCAGGACCCCATT TTTGACAAGGTTCCGAATCTGTACAGTCTTCTCGTGAACGAGCAACAGAC AGCCGAGGCCATTGGGTCCACCGCTCTGTTTCGCATCGGCGCCGGGAGTG GGCAGCAGCGGGTGGGCCGGAGCGGCACCGGGCTTTGGCTCTCGCTCGAG CGCCGCGGCCGCATGCACCTCTTGCTGTGCGCCGACCTGATACGGTTCTA TAGACAAGACCACACCGACGCTACTTCCTCGGAAAAGAACGCAGGTGGCG GCGGCGGTGGCGGTTGTTTAGATAAGGAAAACAGCGGAGGCTGGACGGAG CGTGAAGACGGAGGCGCGTTAGACAACAATGGCACAGACGATTGCGAAAG CGGTGTTGATGATGGTGATGGTGATGATGATGCGGGAAATGTTGCCGCCT TTGCGGTGGGAGGCTGTGGCGCCAGAGGTGGAAAGAGAAAAAATCGCGCT CGAAAAGCGGGAGAACGGAGAGGAGGAGGAGAAGGAGGGGGCGCCCATTA TAGTGGTGGCGGAGGGGAAGGTAGGCGGAGAGGAACGGGTAGCCGAGGCG GACACTGTAGTGGCGGCGAGAGGAAAAGGACCCGAGTGACGGATCCTTGG GAAGACATCCTTGGGGCGCTGCATGCCGGAGCACCGGTCACGCTTACTCC CCAGGGCAGTGGACACCTGCCGAGTATTTCTCAGGATTCATGTGGCAGTC TTCTCGTGAACGAGCAACAGACAGCCGAGGCCATTGGGTCCACCGCTCTG TTTCGCATCGGCGCCGGGAGTGGGCAGCAGCGGGTGGGCCGGAGCGGCAC CGGGCTTTGGCTCTCGCTCGAGCGCCGCGGCCGCATGCACCTCTTGCTGT GCGCCGACCTGATACGGTTCTATAGACAAGACCACACCGACGCTACTTCC TCGGAAAAGAACGCAGGTGGCGGCGGCGGTGGCGGTTGTTTAGATAAGGA AAACAGCGGAGGCTGGACGGAGCGTGAAGACGGAGGCGCGTTAGACAACA ATGGCACAGACGATTGCGAAAGCGGTGTTGATGATGGTGATGGTGATGAT GATGCGGGAAATGTTGCCGCCTTTGCGGTGGGAGGCTGTGGCGCCAGAGG TGGAAAGAGAAAAAATCGCGCTCGAAAAGCGGGAGAACGGAGAGGAGGAG GAGAAGGAGGGGGCGCCCATTATAGTGGTGGCGGAGGGGAAGGTAGGCGG AGAGGAACGGGTAGCCGAGGCGGACACTGTAGTGGCGGCGAGAGGAAAAG GACCCGAGTGACGGATCCTTGGGAAGACATCCTTGGGGCGCTGCATGCCG GAGCACCGGTCACGCTTACTCCCCAGGGCAGTGGACACCTGCCGAGTATT TCTCAGGATTCATGTGGCAGGCGATCTCCGACGAATGCGGCGGGATCTGG TGCCGGCGCTACCGGTGGTGGCAGCGGAGCTGGCGGAGGCGCCGCAAGTG CCGCGCAAACCCTCCCCTGGCTGCAACTCTTGGCGGCGATCTCCGACGAA TGCGGCGGGATCTGGTGCCGGCGCTACCGGTGGTGGCAGCGGAGCTGGCG GAGGCGCCGCAAGTGCCGCGCAAACCCTCCCCTGGCTGCAACTCTTGGCG back to top
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