|
|
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Alignments
The following features are aligned
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Properties
| Property Name | Value |
| Hectar predicted targeting category | other localisation |
| Exons | 2 |
| Model size | 2443 |
| Cds size | 2442 |
| Stop | 0 |
| Start | 0 |
Relationships
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of mRNA_H-paniculata_contig3903.10172.1 >prot_H-paniculata_contig3903.10172.1 ID=prot_H-paniculata_contig3903.10172.1|Name=mRNA_H-paniculata_contig3903.10172.1|organism=Halopteris paniculata Hal_grac_a_UBK monoicous|type=polypeptide|length=814bp
SCENERCNKSPCFGYPGDKGVCCLAHKLDGMINVRRAKCQKDGCSKAPTQ GYANTQKAQFCPEHRLPGMYNVSKGRDCRHPQGCGRLATHAFVPVARRSP DAGWQPSGSVGTSADAVETPSGSLDKPSNVLETSADTMETPSCSMDKPSN AVETPSGSLDKPSNVLEMSADTMETPSCSMDKPSNAVETPSGSLDKPSNV LETPTDTMETPSCSMDKPSNAVETPADTMETPSFSRDKPSNAVETSADAV ETPSGFMKKSFDAVETSNDASETLSGSTEKPSDAVETPSDAKETFSAAVE ISSTAAETSAAAVETSTGATEIPADTVKNLPGAVETSSDPMETSSVVVET PSGAVETSSNPMETSSFAAKMSTGAMEISSNPMETSFFAAEMSAGVVEMS ADVVKMPSGAVETSSDRMETSSFAAETSTGVVEMSADVVKMSSGAVETSS DRMETSSVAAETSTGVVEMSADVKMPSVAVETSSDPMETSSVAAETSTGV VEMSADVVKMPSGAVETSSDPMETSSVAAETSCDAMETSSVAAGMSADVV EMSANAMERPSDAVRMSSDAMETSSVAAETSADDVEMSANAVERPSDAVR MSCDAMETSSVAVEISADAEGKASDAVELSVDATGKPFDVVELSVDAVEQ LSDAVETPPNSMEKPSGAVGKPCNATEKPSDAMGKPSSVMETLSGAVERP SDASRGKSATIAKTPAAATGSPWTVVQPSKDDNDDGGGGNGYHGDDGAGA CIDWMNVDGDHIRVNRVPNGDGGQVESVTNGDINDHDTFGGGKGGGRGGG GQGGDSRDGEQSSG back to topmRNA from alignment at H-paniculata_contig3903:1388..5391+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >mRNA_H-paniculata_contig3903.10172.1 ID=mRNA_H-paniculata_contig3903.10172.1|Name=mRNA_H-paniculata_contig3903.10172.1|organism=Halopteris paniculata Hal_grac_a_UBK monoicous|type=mRNA|length=4004bp|location=Sequence derived from alignment at H-paniculata_contig3903:1388..5391+ (Halopteris paniculata Hal_grac_a_UBK monoicous) AGCTGCGAGAACGAGAGGTGTAACAAGAGTCCTTGCTTCGGATACCCTGG
AGACAAAGGCGTGTGCTGCCTCGCGCACAAGCTGGACGGGATGATCAATG
TTCGCAGGGCCAAATGTCAAAAGGATGGCTGCAGCAAGGTACAAATAAGT
CTCAAGTACAACGAGAATCACTCCTAAGGGGACGCGTATCTCCCAGTTTC
GATCCCCTCCCCCAAACCTTTTTTGAGGTTGAACGTTGTTTCATCCCCCT
TTTGACTGCATGTAAATATATATGCTGAGATTCATTTAGCTGACAATCCA
ACCATGGATCATACCACGGCCTACAGTTTCTCATCACCGCGTTTAGTGTG
AAACACCGCAAGGGAGGAGGTACCTTCTACGAAGTTTAAGGTACCTAGCT
GTTTCGTTGCGCTCCCGCACAGAAAGAGGCGTTCATTTGTGCAACGTGCC
TCCCGGCTTCACTTACTCTCTCTCAGCAAAGTGCTAGCAGCACCTCCACA
TTGCGCATCACAATCTCTACTAGAACAAACAACTCGAGGGAAAACACAAG
TATACTTATTCATCAATACTGTACTGATGATATTTTTCTCGGAACAACAT
CCATTCTCTATTTTATCCAGGGGCGTCCTCGGTAATATATATATATTTAA
AAGACAAAATTAAAACCGCGTATAAAACGGGTATAATTGAGGAAAGCAAT
ATCCTTAGAGTACTACGATAAAGGTACACTTCGTGGGAACAATATCTCAG
TGTTTTTTTTTTCGAAGGCCAACTGGCCATAGTGTTCTTCCCGAATACCG
AATACCGAATACCGAATATCGTTTGGGTTAAAAACAAAACCGCCGAGATA
TAGTTGCCGCGGAATGTAGCTTTATCGTGGTACATTAAGAATATTGCTTT
TCTCAATGATCCCCGTTTTATACGCGGTTCAAAAAAGTAATAAAAACAAG
AAAAAAATAGCGAAATCACGCCTAATTTTATCGAAGCGTTTTTTTTCAAA
GTGTCACGTGACACGGAACAGTCTAAGGGGACCTGTCTGAGTTAGGTGAG
GCACGCCACTGGCCTATTCATTGTCAATAGCTGTAGCTGTAGTCGTAGCA
GTACTAGTACTAGTACAGGTAGTAGTAGTCGTGGCCTGCCTACTACTTTT
ATTGCTACTATTTTTAATGAAACGTTGAAAAAAACAAGACCGCAAAAGTT
CACTCCTAACTTGCCCAACGTTGTAAGCTGACTCCCAGGAACGGTTCTTA
TCCGGTCATTCAAATGTTTATATTTCACACATGGCGTTTTAGCTGTTCTG
ATCGTACCTGTTGTATTGCAAGGCATAGGCGTGTAGTTTGGAAGCTTTGT
TGGAGCCGTGATTCTTCAAGGTCTGTGCGTTTTGCTAGTTTTTGTTGGTG
GGATGCATGGTTATAGTATGGCATAACCAATCCCTGTGACATACGCAGGT
ACAACAACAGTCAACGGGAATAGGTGATATACATGAGGAGCAATCGTACC
GATTTCATCACCTTAAGTCGCAAAGAGAATGGATGAAGACAGATCCCTCC
AGGTTATCTTGTAATTCCAGAGTGTGAGATGTTCAAGTAAACTGTTCATT
GTTGTCGTGCATATACTCAGTACTAGAGGCGCTCTGACTTTCCCTTGTAC
GTCCCCTGCCCACCCCACCAACTGCTTTGCCGACGCGGTCGATACGCCAG
GCTCCAACGCAGGGTTACGCGAACACACAGAAGGCTCAGTTCTGCCCGGA
GCATCGCCTTCCCGGGATGTACAACGTCTCTAAGGGTAGGGACTGCAGGC
ATCCACAAGGATGTGGCCGCTTAGCCACGCACGCTTTTGTCCCCGTCGCG
AGGAGATCGCCGGACGCCGGGTGGCAGCCTTCCGGTTCTGTAGGAACGTC
TGCCGATGCTGTGGAAACGCCTTCCGGTTCTTTGGACAAACCTTCCAATG
TCTTGGAAACGTCTGCTGATACCATGGAAACGCCTTCGTGTTCTATGGAT
AAACCTTCCAATGCTGTGGAAACGCCTTCCGGTTCTTTGGACAAACCTTC
CAATGTCTTGGAAATGTCTGCTGATACCATGGAAACGCCTTCCTGTTCTA
TGGATAAACCTTCCAATGCTGTGGAAACACCTTCCGGTTCTTTGGACAAA
CCTTCCAATGTCTTGGAAACGCCTACTGATACCATGGAAACGCCTTCCTG
TTCTATGGATAAACCTTCCAATGCTGTGGAAACGCCTGCTGATACCATGG
AAACGCCTTCCTTTTCTAGGGATAAACCTTCCAATGCTGTGGAAACGTCT
GCCGATGCCGTTGAAACGCCTTCTGGTTTTATGAAAAAGTCTTTCGATGC
GGTGGAAACGTCTAATGATGCCTCAGAAACGCTTTCCGGTTCTACGGAAA
AGCCATCCGATGCCGTGGAAACGCCTTCTGATGCCAAGGAAACCTTTTCC
GCTGCTGTAGAAATCTCTTCCACTGCTGCGGAAACGTCTGCTGCTGCCGT
GGAAACGTCTACCGGTGCTACGGAAATACCTGCCGATACCGTGAAGAATC
TCCCCGGTGCTGTGGAAACCTCTTCTGATCCTATGGAAACGTCTTCCGTT
GTTGTGGAAACGCCTTCCGGTGCTGTGGAAACTTCTTCCAATCCTATGGA
AACCTCTTCTTTTGCTGCGAAAATGTCTACCGGTGCTATGGAAATTTCTT
CCAATCCTATGGAAACCTCTTTTTTTGCTGCCGAAATGTCTGCTGGTGTT
GTGGAAATGTCTGCCGATGTCGTGAAAATGCCTTCTGGTGCTGTGGAAAC
CTCTTCTGATCGTATGGAAACCTCTTCCTTTGCTGCAGAAACGTCTACCG
GTGTTGTGGAAATGTCTGCCGATGTCGTGAAAATGTCTTCCGGTGCTGTG
GAAACCTCTTCTGATCGTATGGAAACCTCCTCCGTTGCTGCGGAAACGTC
TACCGGTGTTGTGGAAATGTCTGCCGATGTAAAAATGCCTTCCGTTGCTG
TGGAGACCTCTTCTGATCCTATGGAAACCTCCTCCGTTGCTGCAGAAACG
TCTACCGGTGTTGTGGAAATGTCTGCCGATGTCGTGAAAATGCCTTCCGG
TGCTGTGGAAACCTCTTCTGATCCTATGGAAACCTCCTCCGTTGCTGCGG
AAACGTCTTGCGATGCTATGGAAACCTCTTCCGTTGCTGCAGGAATGTCT
GCCGATGTCGTGGAAATGTCTGCCAATGCCATGGAACGACCTTCCGATGC
CGTGAGAATGTCTTCCGATGCTATGGAAACCTCTTCTGTTGCTGCGGAAA
CATCTGCCGATGATGTGGAAATGTCTGCCAATGCCGTGGAACGACCTTCC
GATGCCGTGAGAATGTCTTGCGATGCTATGGAAACCTCTTCTGTTGCTGT
GGAAATATCTGCCGATGCCGAGGGAAAGGCTTCCGATGCTGTGGAACTGT
CTGTCGATGCTACGGGAAAGCCTTTCGATGTTGTGGAACTGTCTGTCGAT
GCTGTGGAACAGCTTTCGGATGCCGTGGAAACGCCTCCCAATTCCATGGA
GAAACCATCCGGTGCTGTGGGAAAGCCTTGCAATGCTACGGAAAAGCCTT
CTGATGCTATGGGAAAACCTTCCAGTGTTATGGAAACGCTTTCTGGTGCT
GTGGAAAGGCCTTCCGATGCTTCAAGGGGAAAGTCTGCCACCATTGCGAA
AACCCCTGCTGCGGCAACCGGAAGTCCTTGGACGGTAGTACAGCCCAGTA
AAGATGACAATGATGATGGTGGCGGTGGTAATGGTTATCATGGCGATGAT
GGTGCTGGTGCATGCATAGACTGGATGAATGTCGATGGCGATCACATTAG
AGTTAATCGTGTCCCCAATGGCGATGGCGGTCAAGTAGAAAGTGTTACTA
ATGGCGATATCAACGATCATGATACTTTTGGGGGCGGCAAGGGCGGCGGC
AGGGGTGGTGGAGGTCAAGGTGGAGATAGTCGCGACGGAGAACAGAGTAG
TGGG back to topCoding sequence (CDS) from alignment at H-paniculata_contig3903:1388..5391+ >mRNA_H-paniculata_contig3903.10172.1 ID=mRNA_H-paniculata_contig3903.10172.1|Name=mRNA_H-paniculata_contig3903.10172.1|organism=Halopteris paniculata Hal_grac_a_UBK monoicous|type=CDS|length=4884bp|location=Sequence derived from alignment at H-paniculata_contig3903:1388..5391+ (Halopteris paniculata Hal_grac_a_UBK monoicous) AGCTGCGAGAACGAGAGGTGTAACAAGAGTCCTTGCTTCGGATACCCTGG AGACAAAGGCGTGTGCTGCCTCGCGCACAAGCTGGACGGGATGATCAATG TTCGCAGGGCCAAATGTCAAAAGGATGGCTGCAGCAAGAGCTGCGAGAAC GAGAGGTGTAACAAGAGTCCTTGCTTCGGATACCCTGGAGACAAAGGCGT GTGCTGCCTCGCGCACAAGCTGGACGGGATGATCAATGTTCGCAGGGCCA AATGTCAAAAGGATGGCTGCAGCAAGGCTCCAACGCAGGGTTACGCGAAC ACACAGAAGGCTCAGTTCTGCCCGGAGCATCGCCTTCCCGGGATGTACAA CGTCTCTAAGGGTAGGGACTGCAGGCATCCACAAGGATGTGGCCGCTTAG CCACGCACGCTTTTGTCCCCGTCGCGAGGAGATCGCCGGACGCCGGGTGG CAGCCTTCCGGTTCTGTAGGAACGTCTGCCGATGCTGTGGAAACGCCTTC CGGTTCTTTGGACAAACCTTCCAATGTCTTGGAAACGTCTGCTGATACCA TGGAAACGCCTTCGTGTTCTATGGATAAACCTTCCAATGCTGTGGAAACG CCTTCCGGTTCTTTGGACAAACCTTCCAATGTCTTGGAAATGTCTGCTGA TACCATGGAAACGCCTTCCTGTTCTATGGATAAACCTTCCAATGCTGTGG AAACACCTTCCGGTTCTTTGGACAAACCTTCCAATGTCTTGGAAACGCCT ACTGATACCATGGAAACGCCTTCCTGTTCTATGGATAAACCTTCCAATGC TGTGGAAACGCCTGCTGATACCATGGAAACGCCTTCCTTTTCTAGGGATA AACCTTCCAATGCTGTGGAAACGTCTGCCGATGCCGTTGAAACGCCTTCT GGTTTTATGAAAAAGTCTTTCGATGCGGTGGAAACGTCTAATGATGCCTC AGAAACGCTTTCCGGTTCTACGGAAAAGCCATCCGATGCCGTGGAAACGC CTTCTGATGCCAAGGAAACCTTTTCCGCTGCTGTAGAAATCTCTTCCACT GCTGCGGAAACGTCTGCTGCTGCCGTGGAAACGTCTACCGGTGCTACGGA AATACCTGCCGATACCGTGAAGAATCTCCCCGGTGCTGTGGAAACCTCTT CTGATCCTATGGAAACGTCTTCCGTTGTTGTGGAAACGCCTTCCGGTGCT GTGGAAACTTCTTCCAATCCTATGGAAACCTCTTCTTTTGCTGCGAAAAT GTCTACCGGTGCTATGGAAATTTCTTCCAATCCTATGGAAACCTCTTTTT TTGCTGCCGAAATGTCTGCTGGTGTTGTGGAAATGTCTGCCGATGTCGTG AAAATGCCTTCTGGTGCTGTGGAAACCTCTTCTGATCGTATGGAAACCTC TTCCTTTGCTGCAGAAACGTCTACCGGTGTTGTGGAAATGTCTGCCGATG TCGTGAAAATGTCTTCCGGTGCTGTGGAAACCTCTTCTGATCGTATGGAA ACCTCCTCCGTTGCTGCGGAAACGTCTACCGGTGTTGTGGAAATGTCTGC CGATGTAAAAATGCCTTCCGTTGCTGTGGAGACCTCTTCTGATCCTATGG AAACCTCCTCCGTTGCTGCAGAAACGTCTACCGGTGTTGTGGAAATGTCT GCCGATGTCGTGAAAATGCCTTCCGGTGCTGTGGAAACCTCTTCTGATCC TATGGAAACCTCCTCCGTTGCTGCGGAAACGTCTTGCGATGCTATGGAAA CCTCTTCCGTTGCTGCAGGAATGTCTGCCGATGTCGTGGAAATGTCTGCC AATGCCATGGAACGACCTTCCGATGCCGTGAGAATGTCTTCCGATGCTAT GGAAACCTCTTCTGTTGCTGCGGAAACATCTGCCGATGATGTGGAAATGT CTGCCAATGCCGTGGAACGACCTTCCGATGCCGTGAGAATGTCTTGCGAT GCTATGGAAACCTCTTCTGTTGCTGTGGAAATATCTGCCGATGCCGAGGG AAAGGCTTCCGATGCTGTGGAACTGTCTGTCGATGCTACGGGAAAGCCTT TCGATGTTGTGGAACTGTCTGTCGATGCTGTGGAACAGCTTTCGGATGCC GTGGAAACGCCTCCCAATTCCATGGAGAAACCATCCGGTGCTGTGGGAAA GCCTTGCAATGCTACGGAAAAGCCTTCTGATGCTATGGGAAAACCTTCCA GTGTTATGGAAACGCTTTCTGGTGCTGTGGAAAGGCCTTCCGATGCTTCA AGGGGAAAGTCTGCCACCATTGCGAAAACCCCTGCTGCGGCAACCGGAAG TCCTTGGACGGTAGTACAGCCCAGTAAAGATGACAATGATGATGGTGGCG GTGGTAATGGTTATCATGGCGATGATGGTGCTGGTGCATGCATAGACTGG ATGAATGTCGATGGCGATCACATTAGAGTTAATCGTGTCCCCAATGGCGA TGGCGGTCAAGTAGAAAGTGTTACTAATGGCGATATCAACGATCATGATA CTTTTGGGGGCGGCAAGGGCGGCGGCAGGGGTGGTGGAGGTCAAGGTGGA GATAGTCGCGACGGAGAACAGAGTAGTGGGGCTCCAACGCAGGGTTACGC GAACACACAGAAGGCTCAGTTCTGCCCGGAGCATCGCCTTCCCGGGATGT ACAACGTCTCTAAGGGTAGGGACTGCAGGCATCCACAAGGATGTGGCCGC TTAGCCACGCACGCTTTTGTCCCCGTCGCGAGGAGATCGCCGGACGCCGG GTGGCAGCCTTCCGGTTCTGTAGGAACGTCTGCCGATGCTGTGGAAACGC CTTCCGGTTCTTTGGACAAACCTTCCAATGTCTTGGAAACGTCTGCTGAT ACCATGGAAACGCCTTCGTGTTCTATGGATAAACCTTCCAATGCTGTGGA AACGCCTTCCGGTTCTTTGGACAAACCTTCCAATGTCTTGGAAATGTCTG CTGATACCATGGAAACGCCTTCCTGTTCTATGGATAAACCTTCCAATGCT GTGGAAACACCTTCCGGTTCTTTGGACAAACCTTCCAATGTCTTGGAAAC GCCTACTGATACCATGGAAACGCCTTCCTGTTCTATGGATAAACCTTCCA ATGCTGTGGAAACGCCTGCTGATACCATGGAAACGCCTTCCTTTTCTAGG GATAAACCTTCCAATGCTGTGGAAACGTCTGCCGATGCCGTTGAAACGCC TTCTGGTTTTATGAAAAAGTCTTTCGATGCGGTGGAAACGTCTAATGATG CCTCAGAAACGCTTTCCGGTTCTACGGAAAAGCCATCCGATGCCGTGGAA ACGCCTTCTGATGCCAAGGAAACCTTTTCCGCTGCTGTAGAAATCTCTTC CACTGCTGCGGAAACGTCTGCTGCTGCCGTGGAAACGTCTACCGGTGCTA CGGAAATACCTGCCGATACCGTGAAGAATCTCCCCGGTGCTGTGGAAACC TCTTCTGATCCTATGGAAACGTCTTCCGTTGTTGTGGAAACGCCTTCCGG TGCTGTGGAAACTTCTTCCAATCCTATGGAAACCTCTTCTTTTGCTGCGA AAATGTCTACCGGTGCTATGGAAATTTCTTCCAATCCTATGGAAACCTCT TTTTTTGCTGCCGAAATGTCTGCTGGTGTTGTGGAAATGTCTGCCGATGT CGTGAAAATGCCTTCTGGTGCTGTGGAAACCTCTTCTGATCGTATGGAAA CCTCTTCCTTTGCTGCAGAAACGTCTACCGGTGTTGTGGAAATGTCTGCC GATGTCGTGAAAATGTCTTCCGGTGCTGTGGAAACCTCTTCTGATCGTAT GGAAACCTCCTCCGTTGCTGCGGAAACGTCTACCGGTGTTGTGGAAATGT CTGCCGATGTAAAAATGCCTTCCGTTGCTGTGGAGACCTCTTCTGATCCT ATGGAAACCTCCTCCGTTGCTGCAGAAACGTCTACCGGTGTTGTGGAAAT GTCTGCCGATGTCGTGAAAATGCCTTCCGGTGCTGTGGAAACCTCTTCTG ATCCTATGGAAACCTCCTCCGTTGCTGCGGAAACGTCTTGCGATGCTATG GAAACCTCTTCCGTTGCTGCAGGAATGTCTGCCGATGTCGTGGAAATGTC TGCCAATGCCATGGAACGACCTTCCGATGCCGTGAGAATGTCTTCCGATG CTATGGAAACCTCTTCTGTTGCTGCGGAAACATCTGCCGATGATGTGGAA ATGTCTGCCAATGCCGTGGAACGACCTTCCGATGCCGTGAGAATGTCTTG CGATGCTATGGAAACCTCTTCTGTTGCTGTGGAAATATCTGCCGATGCCG AGGGAAAGGCTTCCGATGCTGTGGAACTGTCTGTCGATGCTACGGGAAAG CCTTTCGATGTTGTGGAACTGTCTGTCGATGCTGTGGAACAGCTTTCGGA TGCCGTGGAAACGCCTCCCAATTCCATGGAGAAACCATCCGGTGCTGTGG GAAAGCCTTGCAATGCTACGGAAAAGCCTTCTGATGCTATGGGAAAACCT TCCAGTGTTATGGAAACGCTTTCTGGTGCTGTGGAAAGGCCTTCCGATGC TTCAAGGGGAAAGTCTGCCACCATTGCGAAAACCCCTGCTGCGGCAACCG GAAGTCCTTGGACGGTAGTACAGCCCAGTAAAGATGACAATGATGATGGT GGCGGTGGTAATGGTTATCATGGCGATGATGGTGCTGGTGCATGCATAGA CTGGATGAATGTCGATGGCGATCACATTAGAGTTAATCGTGTCCCCAATG GCGATGGCGGTCAAGTAGAAAGTGTTACTAATGGCGATATCAACGATCAT GATACTTTTGGGGGCGGCAAGGGCGGCGGCAGGGGTGGTGGAGGTCAAGG TGGAGATAGTCGCGACGGAGAACAGAGTAGTGGG back to top
|