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Homology
BLAST of mRNA_H-paniculata_contig2006.5158.1 vs. uniprot
Match: D7FR52_ECTSI (Myosin motor domain-containing protein n=2 Tax=Ectocarpus TaxID=2879 RepID=D7FR52_ECTSI) HSP 1 Score: 568 bits (1463), Expect = 2.880e-182 Identity = 314/386 (81.35%), Postives = 331/386 (85.75%), Query Frame = 3
Query: 420 RGAEHEHLEAIMAFYERRCSRKIIRHWRARWLRIRKAQAEEQKRLRALAREKARLEQVLHVDVDRDVSVDDMDKDADENASSDAAPVSPVRTQPDEESEVYXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXGASPSDARVGANLSAPRTEPFTIATMRAFLNEPVEPHTGVIECMIRRKKGVMTTVYQAYYEPSMKLLMTAKKDKGRYIISMNPAYLKRGEPSTLGKVKAVAQRRQYIVYDNGFKANKTLPEKYTIKPARKEIAAVSIDLTRHDDFQGPRKLEVLVADSDDEVVDHASLLNSFGNDNTNIITPVPRMHSIKPEWDEDAGYFVLEFYKDRIKKQSVKNFMLHNNRGQFIMQFGRSKEDNVFALDFTGPFSPLAAFGVALSGCDSSV 1577
RGAEHEHLE +MAFYERR SRKIIRHWRAR RIRKA+ E L V VD D +++ SSDAAPVSP+R + D+ XXXXXXXXXXXXXXX ASPSDARVGANLSAPRTEPFT ATMRAFLN+PVEP TGVIECMIRRKKGVM+T+YQAYYEPSMKLLMTAKKDKGRYII+MNP Y+K+GEPSTLGKVKAVAQRRQYIVYDNGFKANKTLPEKYTIKP RKEIAAVSIDLTRHDDFQGPRKLEVLVADSDD++VDHASLLNSFGNDNTNIITPVPRMHSIKPEWDEDAGYFVLEFYKDRIKKQSVKNFMLHN+RGQFIMQFGRSKEDNVFALDFTGPFSPLAAFGVALSGCDSSV
Sbjct: 735 RGAEHEHLEEVMAFYERRSSRKIIRHWRARRARIRKAEXXXXXXXXXXXXXXXXXESALRVTVDED----------EDDRSSDAAPVSPIRAEMDDXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXQGGQ---ASPSDARVGANLSAPRTEPFTKATMRAFLNQPVEPQTGVIECMIRRKKGVMSTIYQAYYEPSMKLLMTAKKDKGRYIIAMNPEYMKKGEPSTLGKVKAVAQRRQYIVYDNGFKANKTLPEKYTIKPERKEIAAVSIDLTRHDDFQGPRKLEVLVADSDDDLVDHASLLNSFGNDNTNIITPVPRMHSIKPEWDEDAGYFVLEFYKDRIKKQSVKNFMLHNSRGQFIMQFGRSKEDNVFALDFTGPFSPLAAFGVALSGCDSSV 1107
BLAST of mRNA_H-paniculata_contig2006.5158.1 vs. uniprot
Match: A0A7S0XDB5_9STRA (Hypothetical protein n=1 Tax=Chromulina nebulosa TaxID=96789 RepID=A0A7S0XDB5_9STRA) HSP 1 Score: 108 bits (270), Expect = 1.180e-20 Identity = 84/281 (29.89%), Postives = 138/281 (49.11%), Query Frame = 3
Query: 801 DARVGANLSAP-----RTEPFTIATMRAFLNEPVEPHTGVIECMIRRKKGVMTT---VYQAYYEPSMKLLMTAKK----DKGRYIISMNPAYLKRGEPSTLGKVKAVAQRRQYIVYDNGFKANKTLPEKYTIKPARKEIAAVSIDLTRHDDFQGPRKLEVLV--ADSDDEVV------DHASLLNSFGNDNTNIITPVPRMHSIKPEWDEDAGYFVLEFYKDRIKKQSVKNFML--HNNRGQFIMQFGRSKEDNVFALDFTGPFSPLAAFGVALSGCDSSV 1577
D+ + N+ AP + P ++ M+ FL PV GV++C IRR KGV + VY Y + + LMT+KK Y+ISM L R + LGK+++ ++ VYDNG ++ ++ RKE+A++ +GPRK++V + D +D ++ + +LN + N + + + P W+E G +VL F R+ SVKNF L + + ++QFG+ ++ F++D P SPL AF + LS DS +
Sbjct: 318 DSNITVNVPAPLDPPQQVTPLNLSNMKHFLTSPVPRTAGVVQCYIRRIKGVSSMFPPVYNLYLKDGDRFLMTSKKRPNNKTSNYLISMAENDLNRESGNYLGKLRSNFVGTEFQVYDNGVSPKESATAGDSV--IRKELASIMYAANLLGS-RGPRKMQVCIPTVDENDRIIAWRSGTERDDILNRMKDRNYRDLV---YLINKPPRWNEVVGAYVLNF-NGRVTMASVKNFQLVSPDEQNTVVLQFGKVAKEE-FSMDLQWPCSPLQAFAITLSSFDSKI 590
BLAST of mRNA_H-paniculata_contig2006.5158.1 vs. uniprot
Match: A0A7S4S614_9STRA (Hypothetical protein n=1 Tax=Ditylum brightwellii TaxID=49249 RepID=A0A7S4S614_9STRA) HSP 1 Score: 105 bits (262), Expect = 6.980e-20 Identity = 79/261 (30.27%), Postives = 123/261 (47.13%), Query Frame = 3
Query: 861 MRAFLNEPVEPHTGVIECMIRRKKGVMTTV---YQAYYEPSMKLLMT----AKKDKGRYIISMNPAYLKRGEPSTLGKVKAVAQRRQYIVYDNGFKANKTLP--EKYTIKPARKEIAAVSIDLTRHDDFQGPRKLEVLVADSDDE---------VVDHASLLNSFGNDNTNIITPVPRMHSIKPEWDEDAGYFVLEFYKDRIKKQSVKNFML----HNNRGQFIMQFGRSKEDNVFALDFTGPFSPLAAFGVALSGCDSSV 1577
MR FL +P + G ++C I+R KG + Y+ Y + +MT AKK Y+ISM+ + + P +GK+++ +Y +YD G P ++ R EI AV + +GPR+++V + DD +L+ F + I + M + P W+E+ +VL+F R+ SVKNF L N+ + I+QFGR +D F +DF P SPL AF + LS CDS +
Sbjct: 253 MRKFLTKPCPKNAGTMQCYIKRNKGKKNKLFPEYRVYAKDGDVFMMTSKKRAKKKTSNYLISMHRNLIDKNSPYVIGKLRSNFFGTEYQLYDAGINPRDIDPYYDENNDTSVRSEIGAVLYE-NNVAGSRGPRRMQVCINKVDDAGDSTRQWQPAHKDEEMLSCFKHCVKPAIHHLISMENKVPSWNEELEAYVLDF-NGRVTLASVKNFQLTEMNSENQDRIILQFGRVAKDE-FTMDFQWPMSPLQAFAIVLSSCDSKI 510
BLAST of mRNA_H-paniculata_contig2006.5158.1 vs. uniprot
Match: A0A4D9DBN3_9STRA (Tub domain-containing protein n=1 Tax=Nannochloropsis salina CCMP1776 TaxID=1027361 RepID=A0A4D9DBN3_9STRA) HSP 1 Score: 82.8 bits (203), Expect = 5.860e-13 Identity = 78/272 (28.68%), Postives = 122/272 (44.85%), Query Frame = 3
Query: 849 TIATMRAFLNEPVEPHTGVIECMIRRKK---GVMTTVYQAYYEPSMKLLMTAKKDKGR----YIISMNPAYLKRGEPSTLGKVKAVAQRRQYIVYDNGFKANKTLPEKYT----IKPARKEIAAVSIDLTRHDDFQGPRKLEV------LVADS-------DDEVVDHASLLNSFGNDNTNIITPVPRMHSI---KPEWDEDAGYFVLEFYKDRIKKQSVKNFML--HNNRGQFIMQFGRSKEDNVFALDFTGPFSPLAAFGVALSGCDSSV 1577
T A + +FL PV TGV+EC ++R+ G + Y Y LM AKK + Y ++M+ + P LGKV+A ++ ++D G + + + I +R+E+ V + +GPRK++V +V D +D + A L D V + H + P W++ +VL F R+ SVKNF L + ++QFGR + + F +D PF+PL AFGVALS DS +
Sbjct: 123 TRAGLLSFLTRPVARSTGVVECYVKRRNMGAGKLFPEYYLYTRNGDHFLMAAKKQGNKRTSNYYVTMHNRDFAKDSPDYLGKVRANFVGTEFQLFDRGGSSKEKPTDGAASFRDIGASREELGVV-VYAANVLGARGPRKMQVYLPRVNMVDDKVEEWKGKEDMALPDAMLERVRRGD-------VSKFHHLINKPPRWNDQVKAYVLNF-NGRVTMASVKNFQLIAPEDHEIVLLQFGRV-DKHEFTMDVRWPFTPLQAFGVALSSFDSKI 384
The following BLAST results are available for this feature:
Alignments
The following features are aligned
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Taxonomic scope | Eukaryota |
| Seed ortholog score | 549.7 |
| Seed ortholog evalue | 1.1e-153 |
| Seed eggNOG ortholog | 2880.D7FR52 |
| Preferred name | MYO19 |
| KEGG ko | ko:K10352,ko:K10356,ko:K10357,ko:K22366 |
| KEGG Pathway | ko04530,map04530 |
| Hectar predicted targeting category | mitochondrion |
| GOs | 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2759,GO:0042802,GO:0042803,GO:0042886,GO:0042995,GO:0043005,GO:0043008,GO:0043025,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043197,GO:0043200,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043254,GO:0043269,GO:0043325,GO:0043332,GO:0043434,GO:0043436,GO:0043473,GO:0043531,GO:0043588,GO:0043900,GO:0043902,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044087,GO:0044089,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044297,GO:0044309,GO:0044380,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044428,GO:0044429,GO:0044430,GO:0044433,GO:0044441,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044448,GO:0044456,GO:0044459,GO:0044463,GO:0044464,GO:0044550,GO:0044703,GO:0044706,GO:0044764,GO:0044837,GO:0044877,GO:0045033,GO:0045111,GO:0045165,GO:0045177,GO:0045179,GO:0045184,GO:0045202,GO:0045335,GO:0045595,GO:0045597,GO:0045664,GO:0045666,GO:0045773,GO:0045856,GO:0045921,GO:0045927,GO:0045995,GO:0046148,GO:0046189,GO:0046394,GO:0046530,GO:0046677,GO:0046683,GO:0046847,GO:0046872,GO:0046879,GO:0046903,GO:0046907,GO:0046982,GO:0046983,GO:0047497,GO:0048066,GO:0048193,GO:0048232,GO:0048278,GO:0048306,GO:0048308,GO:0048309,GO:0048311,GO:0048313,GO:0048364,GO:0048366,GO:0048367,GO:0048438,GO:0048467,GO:0048468,GO:0048469,GO:0048471,GO:0048513,GO:0048515,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0048583,GO:0048584,GO:0048588,GO:0048589,GO:0048592,GO:0048608,GO:0048609,GO:0048638,GO:0048639,GO:0048646,GO:0048666,GO:0048667,GO:0048699,GO:0048731,GO:0048749,GO:0048764,GO:0048765,GO:0048767,GO:0048768,GO:0048770,GO:0048812,GO:0048813,GO:0048814,GO:0048820,GO:0048827,GO:0048856,GO:0048858,GO:0048868,GO:0048869,GO:0048870,GO:0048871,GO:0048878,GO:0050767,GO:0050769,GO:0050770,GO:0050772,GO:0050773,GO:0050775,GO:0050776,GO:0050778,GO:0050789,GO:0050793,GO:0050794,GO:0050808,GO:0050848,GO:0050877,GO:0050878,GO:0050891,GO:0050896,GO:0050900,GO:0050931,GO:0050953,GO:0050982,GO:0051015,GO:0051017,GO:0051020,GO:0051046,GO:0051047,GO:0051049,GO:0051050,GO:0051094,GO:0051128,GO:0051129,GO:0051130,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051239,GO:0051240,GO:0051270,GO:0051272,GO:0051279,GO:0051282,GO:0051285,GO:0051286,GO:0051293,GO:0051294,GO:0051301,GO:0051302,GO:0051493,GO:0051494,GO:0051591,GO:0051606,GO:0051640,GO:0051641,GO:0051643,GO:0051645,GO:0051646,GO:0051647,GO:0051648,GO:0051649,GO:0051650,GO:0051653,GO:0051654,GO:0051656,GO:0051674,GO:0051686,GO:0051703,GO:0051704,GO:0051716,GO:0051726,GO:0051875,GO:0051904,GO:0051905,GO:0051924,GO:0051960,GO:0051962,GO:0055037,GO:0055044,GO:0060001,GO:0060002,GO:0060151,GO:0060281,GO:0060282,GO:0060284,GO:0060327,GO:0060328,GO:0060341,GO:0060429,GO:0060560,GO:0060627,GO:0060996,GO:0060997,GO:0061024,GO:0061387,GO:0061458,GO:0061572,GO:0061573,GO:0061640,GO:0061645,GO:0065003,GO:0065007,GO:0065008,GO:0065009,GO:0070252,GO:0070382,GO:0070648,GO:0070649,GO:0070650,GO:0070727,GO:0070887,GO:0070938,GO:0071229,GO:0071230,GO:0071310,GO:0071375,GO:0071417,GO:0071495,GO:0071496,GO:0071520,GO:0071563,GO:0071695,GO:0071702,GO:0071704,GO:0071705,GO:0071840,GO:0071889,GO:0071944,GO:0071963,GO:0071976,GO:0072330,GO:0072384,GO:0072657,GO:0072659,GO:0072676,GO:0072678,GO:0072697,GO:0080147,GO:0090066,GO:0090140,GO:0090426,GO:0090436,GO:0090558,GO:0090567,GO:0090596,GO:0090626,GO:0090627,GO:0090702,GO:0090726,GO:0097061,GO:0097159,GO:0097204,GO:0097367,GO:0097435,GO:0097447,GO:0097458,GO:0097518,GO:0097574,GO:0097575,GO:0097708,GO:0097718,GO:0097730,GO:0097731,GO:0097733,GO:0098588,GO:0098630,GO:0098657,GO:0098743,GO:0098773,GO:0098793,GO:0098794,GO:0098805,GO:0098840,GO:0098858,GO:0098862,GO:0098916,GO:0099080,GO:0099081,GO:0099089,GO:0099111,GO:0099118,GO:0099120,GO:0099173,GO:0099402,GO:0099503,GO:0099512,GO:0099513,GO:0099515,GO:0099518,GO:0099536,GO:0099537,GO:0099568,GO:0099640,GO:0099738,GO:0106027,GO:0110009,GO:0110053,GO:0120025,GO:0120031,GO:0120035,GO:0120036,GO:0120038,GO:0120039,GO:0120104,GO:0120117,GO:0140027,GO:0140029,GO:0140056,GO:0150034,GO:1900006,GO:1900076,GO:1900078,GO:1901019,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576,GO:1901615,GO:1901617,GO:1901652,GO:1901653,GO:1901698,GO:1901699,GO:1901700,GO:1901701,GO:1901981,GO:1902407,GO:1902410,GO:1902531,GO:1902716,GO:1902850,GO:1902875,GO:1902877,GO:1902903,GO:1902904,GO:1902936,GO:1903047,GO:1903076,GO:1903078,GO:1903119,GO:1903169,GO:1903260,GO:1903429,GO:1903431,GO:1903475,GO:1903478,GO:1903479,GO:1903530,GO:1903532,GO:1903541,GO:1903543,GO:1903827,GO:1903829,GO:1904062,GO:1904375,GO:1904377,GO:1904580,GO:1904582,GO:1904601,GO:1904752,GO:1904754,GO:1905392,GO:1905429,GO:1905430,GO:1905475,GO:1905477,GO:1905879,GO:1905881,GO:1990151,GO:1990753,GO:1990778,GO:1990819,GO:1990896,GO:1990904,GO:2000026,GO:2000145,GO:2000147,GO:2000241,GO:2000243,GO:2000689,GO:2000769,GO:2001257 |
| EggNOG free text desc. | translation initiation factor activity |
| EggNOG OGs | COG5022@1,KOG0160@2759,KOG2502@1,KOG2502@2759 |
| Ec32 ortholog description | Myosin head, motor domain |
| Ec32 ortholog | Ec-09_003470.1 |
| COG Functional cat. | Z |
| Best tax level | Eukaryota |
| Best eggNOG OG | NA|NA|NA |
| BRITE | ko00000,ko00001,ko01009,ko03019,ko03029,ko03036,ko04131,ko04147,ko04812 |
| Exons | 7 |
| Model size | 2992 |
| Cds size | 1128 |
| Stop | 1 |
| Start | 1 |
Relationships
The following UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of mRNA_H-paniculata_contig2006.5158.1 >prot_H-paniculata_contig2006.5158.1 ID=prot_H-paniculata_contig2006.5158.1|Name=mRNA_H-paniculata_contig2006.5158.1|organism=Halopteris paniculata Hal_grac_a_UBK monoicous|type=polypeptide|length=376bp
MAFYERRCSRKIIRHWRARWLRIRKAQAEEQKRLRALAREKARLEQVLHV
DVDRDVSVDDMDKDADENASSDAAPVSPVRTQPDEESEVYEGEEEQEEQE
EQEQQEQQEQQGASPSDARVGANLSAPRTEPFTIATMRAFLNEPVEPHTG
VIECMIRRKKGVMTTVYQAYYEPSMKLLMTAKKDKGRYIISMNPAYLKRG
EPSTLGKVKAVAQRRQYIVYDNGFKANKTLPEKYTIKPARKEIAAVSIDL
TRHDDFQGPRKLEVLVADSDDEVVDHASLLNSFGNDNTNIITPVPRMHSI
KPEWDEDAGYFVLEFYKDRIKKQSVKNFMLHNNRGQFIMQFGRSKEDNVF
ALDFTGPFSPLAAFGVALSGCDSSV* back to topmRNA from alignment at H-paniculata_contig2006:24..5093+ Legend: UTRpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >mRNA_H-paniculata_contig2006.5158.1 ID=mRNA_H-paniculata_contig2006.5158.1|Name=mRNA_H-paniculata_contig2006.5158.1|organism=Halopteris paniculata Hal_grac_a_UBK monoicous|type=mRNA|length=5070bp|location=Sequence derived from alignment at H-paniculata_contig2006:24..5093+ (Halopteris paniculata Hal_grac_a_UBK monoicous)
CCAAGTACCAAGCCCCGATTTCCGATCCCCGCAAAACGCGGGTTATATAA
TCGTATCGGTCCTCTTTCGGTTCATCACTTATAAACCGAGGGAACAATGT
GGGATAGCCGTTGTACGTGACTTGGCCGTTTTGACATTCGGTTTTAGACT
GCATTAGACAGTACAGAATCCTCACACGTTAAAGCCCTTGATCACACTTC
CGTCCTGGTCACGGGCAAAGGTTGCCCTCTAGCCGTGCCTTACCCGTTAG
GGCTTAGACTCGTTATTTGTAGCTTTAGCCTTCGGTTGTGTTGCTTGCCT
GCTGCAAGTTAGCAGACCCAGGGACATGAGAAGACCGCCCAGTAACCTCA
AAGGTATACGTCGCCAATCTCTCAGTTCTCAATCGAGTTTGTCAACAATA
TCCGTTACTGGCCCTACCCAGGGGAGCGGAGCATGAACACCTGGAGGCAA
TCATGGCGTTCTACGAGCGGAGGTGCTCCCGGAAAATCATTCGCCACTGG
AGAGCGCGGTGGCTAAGAATTAGGAAAGCCCAGGCCGAGGAGCAAAAACG
ATTGCGTGCGCTCGCGAGGGAGAAAGCGCGACTAGAGCAAGTGCTTCACG
TTGACGTCGATCGGGACGTGTCGGTGGATGATATGGATAAGGATGCGGAT
GAGAACGCCAGTTCAGACGCTGCCCCCGTCTCGCCCGTTCGCACCCAGCC
GGACGAGGAGTCAGAAGTTTATGAGGGGGAAGAAGAACAAGAAGAACAAG
AAGAACAAGAACAGCAAGAACAGCAAGAACAGCAGGGGGCCTCACCCAGT
GATGCACGTGTGGGTGCTAACCTGAGGTGAGTGTGACAGCCGATATCTTT
TGCACGACTTCCCCCTCGGTGGTATCGTTACATTGATGCATGAGATACAC
CTGGTTCTTTAAGATACTGCCGGTGATGTCGAAACGCGTGCCTCTTGTTC
ACTACAACTGTCTCGAGAACAAAGAAAGACACTTGACTTAACTCCCAGAA
GATCGCGTGATGTGCAGATTTCAACGAGATCTTTCCAACAGCACAAATGA
CAGCATCACGAGAAAAACCATGTTGGAGGAAAAATAGACATCTCACATGA
CCAGCATTTCACACAACTAATACATGTGACGTGACCGGAACCGGGTATGG
TTTAATCGGTCCTATCATATTTTCTGGGTCACTTGAAGAGCCGTGGAAAC
AACGATCATTTTGGCGAAATGTGAAGTCACTTTCCGCCAGATGGCACAGG
TTAGCCTGCAGATTATTTTATTGATTTTATTGTCGTAATAGTGTACTATT
TGTACATAACATGAGTGCGATGCATCTGCTAGGTTTATTAGTACGAGAAA
CTGTATCCGACATGGGCAGCTTCTCCCCCTCCCCGCGGGCTTAGCAGTGC
TCTGTGTAATGTCACTCATGACACCTGAACGCCCAGAAGTTAAATGGTAA
GTCGTACGTTGCGTTTCACGTGCAAATTGTCGTAAATTTCGCTATAGTGT
TCTTGTGAGTCCATCTCATGGCGCTTGTACTTCATGTCGCGATACTTATG
GCAGTGCGCCGCGAACGGAGCCGTTCACCATTGCCACTATGCGGGCGTTC
CTCAACGAGCCGGTGGAGCCGCATACAGGCGTTATCGAGTGCATGATTCG
CCGCAAAAAGGGAGTAATGACTACCGTGTATCAGGCTTATTACGAGGTAA
GCGCGCTGGAGCCTTCGTGGGACCCGTACCACATGGCGAATGTGTAGCGC
ATACATTTAATCTGGTACATGATTCAAGGGCACACTTCTTTTGACTTTTC
GGATGCTCAAATTATCTCTTTTCGTTCGTTGTGGTTCGGTAGCCATCGAT
GAAGCTACTGATGACTGCAAAGAAGGACAAGGGGCGATACATCATCAGTA
TGAACCCGGCCTATCTCAAGCGAGGAGAGCCGAGTACGTTGGGGAAAGTA
AAGGCCGTTGCGCAGCGACGACAGTACATCGTATACGATAATGGATTCAA
GGCCAACAAGACCTTGTGAGTATCTGTGTTTTGCAAGACCAATCGAACGA
TTATATGGTAACGCCTTTAGATACTCATGTGCTGTGTCTCTTGTTCACGA
CAACTGGCGCTGCCGATGCTTGCAAGCGCCAACGTTAAAAAGAGGTTGAA
ACACTGCTGCAATCCATTTTGACAGTGGTGGCTGCTATAGCGGTGGAATG
TCACTGGGAAAGCTCTTACCCTGAACCATTTGTGGTGATCCTTCGTACGT
ATATTGATCTCTACAGACCAGAAAAGTACACGATCAAGCCCGCGCGTAAA
GAAATCGCAGCGGTGAGCATTGATCTCACTCGTCATGATGACTTCCAGGG
TCCACGAAAGCTTGAGGTAACTAGACTTGAGCTTACCGATAGGGGGGGGG
GGAGGGGTCACGTAGTATGTAGTGATGCGCATTTGTAAAACCCTGTCTAT
CGCGATTCGAGACAGTACGATTCTCGTTGTAGTGAAGGGCCTCTCTTCTT
AGTTTTGACGTCAGAATTTTTTTGTCGGCGTTAAGATGGAGGTGTGGAGG
TGTGCTCATCGTTCTTGGAAGCAATCATGGTCGGGGGTTGTACAAGGAGC
GGTGTGGATGGAGTTTGACGCGCAGCTCAGCCGTGAATAATTCTCCCCGT
TCCTATGGCAGGTTCTCGTGGCGGACAGTGACGACGAAGTTGTTGACCAT
GCATCTCTACTCAATAGCTTCGGCAACGACAACACCAACATCATCACTCC
AGTACCTCGCATGCACAGCATCAAGCCCGAGTGGGATGAGGACGTGAGTG
AAAATTCAAGCAAGTTGTCGGCGATTAGACCCGAAATATATTTACATTCA
AGCATATACTTCTTCCATTGAGTAAGTGTCGTCGAGTATATGGGAAAGAA
AGACCGGTATATACTTTCATCAAGATCCAATTCTTTGGGGTAATTTCCTT
TTCATACCAAGTTATATGTCGCGAAACAGAAGTCGGCTACAGTAAGATTA
TATTTTACTAATAGAACCCGATTAAAAGTTGAACCGAAATGTTAGGATAA
TGAGAAAATGTAATAAAATCGTTTATCATGGATGTGTAGTATGAACCGAA
TGGAAAACAGTCATGGGAGCGAGAAAAACCATGTACACACGTATAGTGCT
CATCGAAATGTCATCATGGTACATGCGTATTCGTTAGAAATGGACAAAAT
CCAGCTTGGCCCGAAATAATCACTTTAATCAATACGCACCCCAAGAAATG
AGCGAAAAGTAACGCAAGACAAAATCGTGTCGATCAATTTCGGTTCTACA
CAGGCGGGATACTTCGTGCTGGAGTTTTACAAAGACCGGATCAAGAAGCA
ATCGGTGAAAAACTTCATGTTGCACAACAATCGAGGTCAATTCATCATGC
AGTTTGGTCGCTCGAAGGAGGACAACGTATTCGCGCTGGACTTCACCGGA
CCTTTCAGTCCATTGGCAGCATTCGGAGTGGCTTTGGTGCGTTGGCTTCT
CGACTGTAACCGCAGTGGCCGTTCAGGTAGTGCGTGGAGCAAATTGTGTG
CGACTGACTGGTGAAGCCTCGAAATAGAACTAACTCCACCTCCTCCCTTC
TCTTTTTTTCCCCCTTTCTATGGCTGTCGTACAGTCTGGCTGCGACTCGT
CAGTGTGAGGAAAACCCCAGATGAATATTGGGAGAACTGCAGCCGGGGTA
TATGGCGATACGACCGAACCAGCTTGGCACCTAATGGTCCAGTTGTGTAT
TGTTGGAGAAAAGCCACGATGGGCGTCACTGCTGGTTTCGTGGTAGTTGG
TTCATTCACTGATGGATTTATTGTTTGATTCATGTATTTGTGCCCTAGGA
CGTTCTATATGAAAGAGCGCGTGTACCTCGAAACCGACTGATGAACTGTT
GATGCATGAGGGCTTTCTCCGCGAGATGCCTCGGTTCCCAGTTTTATTGT
TGTATCCCGTGAAGAGCATGGGGATAGTTTTGGCACTTGCCCACATTTAT
ACTGTGTGTAAAAGTCCATTCCGGTTTTTACATTCCCATAATCTAATGCA
GTGCAGAACGTAGAAGACGCAAGGAAAATGTACACTGAGTATGGAAGATT
GTTGGCGCGAAGACGTCATCTTGTTCTTGTGTGCGTCGCCGGGGTAGAGC
ACAAATAATAACGTCCTGCCAACAGAGACGCATGAGCAAGAAACGAAGTG
TAAAACGGTCAGTCTGTTTCCCTTGCAGGTTTACGAGCCATCGTGCGGAA
GCACGGTGTTTACGCACACTCAACAATAGTTTGGTACTATCAATATGTGC
ATGCACACATTCTCCTGTGAACATGCCTTTTTTTTAAGGGTCTCGGGGAA
GGAGAGTATCAGGAAAAGTGTGGAAGAAATATGGGGCAGACACAAACTAT
TTGAATATCTCGAGATGAAGGCTTGCGTTGTATTATTATATTGAAGAGTA
AAGTAGACCCTCTCTTCGTTTTGGTTACAACGACCTGGGAACCGGTTCCG
CCCACCCGAGATGCCATTGTTCATTTTTCCCGACATATCACGTGGTTTTA
TGTGATCAGTTTGTGGAAAACCTGTTGTAATTGTACGATTTCGAGTAGTT
TTCCCGGTATAGTTATGGTACTAAATACGCTTAGATGGATGGGTGTGAAG
GCTTTTCATTGTTGCGAGCGTGGAGGAGGAAAGCTGGTAGACAAAGGGGG
CATCAATGTCGCGAAATAAGAGTTTTGAGTAGTACCTTGTCCAGTGTTGG
TACTTCGTTTGATTTATGCTGTAAAACAAATGTGGCGTCACGATAAAGGC
GTTTTCTAAGGAGTGAATTAATATATGTGATATTCGTTGCCGGGGTTGGG
GTGGATAGGACAGACGCGGTAAGGAGAGAGTGGGGTTTAGGTCATTTATG
AGCGTAGCGAAGGGTGGTTACGCTAAATGCGTGTATGTTACACCACATAA
ATAACATTTTTTCCCTGAATGTTTCACTTGATCGACGCAAGATGCGCACT
ACATCAAGCGATGTCACACTCTGCGAAGTTACAAATCGGGCAGCAGCCGA
TGAGGCAACCTACTTTTTCC back to topCoding sequence (CDS) from alignment at H-paniculata_contig2006:24..5093+ >mRNA_H-paniculata_contig2006.5158.1 ID=mRNA_H-paniculata_contig2006.5158.1|Name=mRNA_H-paniculata_contig2006.5158.1|organism=Halopteris paniculata Hal_grac_a_UBK monoicous|type=CDS|length=2256bp|location=Sequence derived from alignment at H-paniculata_contig2006:24..5093+ (Halopteris paniculata Hal_grac_a_UBK monoicous)
ATGGCGTTCTACGAGCGGAGGTGCTCCCGGAAAATCATTCGCCACTGGAG
AGCGCGGTGGCTAAGAATTAGGAAAGCCCAGGCCGAGGAGCAAAAACGAT
TGCGTGCGCTCGCGAGGGAGAAAGCGCGACTAGAGCAAGTGCTTCACGTT
GACGTCGATCGGGACGTGTCGGTGGATGATATGGATAAGGATGCGGATGA
GAACGCCAGTTCAGACGCTGCCCCCGTCTCGCCCGTTCGCACCCAGCCGG
ACGAGGAGTCAGAAGTTTATGAGGGGGAAGAAGAACAAGAAGAACAAGAA
GAACAAGAACAGCAAGAACAGCAAGAACAGCAGGGGGCCTCACCCAGTGA
TGCACGTGTGGGTGCTAACCTGAGATGGCGTTCTACGAGCGGAGGTGCTC
CCGGAAAATCATTCGCCACTGGAGAGCGCGGTGGCTAAGAATTAGGAAAG
CCCAGGCCGAGGAGCAAAAACGATTGCGTGCGCTCGCGAGGGAGAAAGCG
CGACTAGAGCAAGTGCTTCACGTTGACGTCGATCGGGACGTGTCGGTGGA
TGATATGGATAAGGATGCGGATGAGAACGCCAGTTCAGACGCTGCCCCCG
TCTCGCCCGTTCGCACCCAGCCGGACGAGGAGTCAGAAGTTTATGAGGGG
GAAGAAGAACAAGAAGAACAAGAAGAACAAGAACAGCAAGAACAGCAAGA
ACAGCAGGGGGCCTCACCCAGTGATGCACGTGTGGGTGCTAACCTGAGTG
CGCCGCGAACGGAGCCGTTCACCATTGCCACTATGCGGGCGTTCCTCAAC
GAGCCGGTGGAGCCGCATACAGGCGTTATCGAGTGCATGATTCGCCGCAA
AAAGGGAGTAATGACTACCGTGTATCAGGCTTATTACGAGTGCGCCGCGA
ACGGAGCCGTTCACCATTGCCACTATGCGGGCGTTCCTCAACGAGCCGGT
GGAGCCGCATACAGGCGTTATCGAGTGCATGATTCGCCGCAAAAAGGGAG
TAATGACTACCGTGTATCAGGCTTATTACGAGCCATCGATGAAGCTACTG
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