Ggra9545.t1 (mRNA) Gracilaria gracilis GNS1m male

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Overview


Name	Ggra9545.t1
Unique Name	Ggra9545.t1
Type	mRNA
Organism	Gracilaria gracilis GNS1m male (Gracilaria gracilis GNS1m male (Slender Wart Weed))
Sequence length	1182

Alignments

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
tig00000150_pilon	contig	tig00000150_pilon:21334..24879 +

Analyses

This mRNA is derived from or has results from the following analyses


Analysis Name	Date Performed
Gracilaria gracilis GNS1m male OGS1.0	2022-05-09

Properties


Property Name	Value
Seed ortholog	121225.PHUM361900-PA
Preferred name	ATP1A1
PFAMs	Cation_ATPase,Cation_ATPase_C,Cation_ATPase_N,E1-E2_ATPase,Hydrolase
Max annot lvl	33208\|Metazoa
KEGG ko	ko:K01539
KEGG TC	3.A.3.1
KEGG Pathway	ko04022,ko04024,ko04260,ko04261,ko04911,ko04918,ko04919,ko04925,ko04960,ko04961,ko04964,ko04970,ko04971,ko04972,ko04973,ko04974,ko04976,ko04978,map04022,map04024,map04260,map04261,map04911,map04918,map04919,map04925,map04960,map04961,map04964,map04970,map04971,map04972,map04973,map04974,map04976,map04978
GOs	GO:0000003,GO:0000166,GO:0001101,GO:0001504,GO:0001505,GO:0001508,GO:0001540,GO:0001664,GO:0002026,GO:0002028,GO:0002036,GO:0002087,GO:0003008,GO:0003012,GO:0003013,GO:0003015,GO:0003018,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005102,GO:0005215,GO:0005391,GO:0005488,GO:0005496,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005768,GO:0005783,GO:0005794,GO:0005886,GO:0005887,GO:0005890,GO:0005901,GO:0005911,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006813,GO:0006814,GO:0006836,GO:0006873,GO:0006874,GO:0006875,GO:0006883,GO:0006928,GO:0006936,GO:0006937,GO:0006940,GO:0006941,GO:0006942,GO:0007154,GO:0007165,GO:0007166,GO:0007215,GO:0007275,GO:0007399,GO:0007417,GO:0007420,GO:0007610,GO:0007611,GO:0007612,GO:0007613,GO:0007626,GO:0007632,GO:0008015,GO:0008016,GO:0008092,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008217,GO:0008289,GO:0008306,GO:0008324,GO:0008344,GO:0008542,GO:0008556,GO:0009117,GO:0009123,GO:0009126,GO:0009141,GO:0009144,GO:0009150,GO:0009161,GO:0009167,GO:0009199,GO:0009205,GO:0009259,GO:0009314,GO:0009416,GO:0009605,GO:0009612,GO:0009628,GO:0009636,GO:0009719,GO:0009725,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010033,GO:0010107,GO:0010243,GO:0010248,GO:0010522,GO:0010644,GO:0010646,GO:0010766,GO:0010817,GO:0010880,GO:0010881,GO:0010882,GO:0010894,GO:0010958,GO:0010959,GO:0012505,GO:0014069,GO:0014070,GO:0014704,GO:0015075,GO:0015077,GO:0015079,GO:0015081,GO:0015318,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015662,GO:0015672,GO:0015988,GO:0015991,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016043,GO:0016311,GO:0016323,GO:0016324,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016791,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017076,GO:0017111,GO:0017144,GO:0019216,GO:0019218,GO:0019222,GO:0019229,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019722,GO:0019725,GO:0019829,GO:0019899,GO:0019900,GO:0019901,GO:0019904,GO:0019932,GO:0021537,GO:0021543,GO:0021987,GO:0022804,GO:0022853,GO:0022857,GO:0022890,GO:0022898,GO:0023051,GO:0023052,GO:0030001,GO:0030003,GO:0030004,GO:0030007,GO:0030029,GO:0030030,GO:0030048,GO:0030054,GO:0030315,GO:0030424,GO:0030425,GO:0030506,GO:0030534,GO:0030554,GO:0030900,GO:0030955,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031402,GO:0031410,GO:0031420,GO:0031748,GO:0031943,GO:0031944,GO:0031946,GO:0031947,GO:0031982,GO:0032279,GO:0032350,GO:0032351,GO:0032353,GO:0032409,GO:0032410,GO:0032412,GO:0032413,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032526,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032809,GO:0032870,GO:0032879,GO:0032890,GO:0032970,GO:0032991,GO:0033218,GO:0033993,GO:0034220,GO:0034641,GO:0034762,GO:0034763,GO:0034765,GO:0034766,GO:0035094,GO:0035150,GO:0035235,GO:0035296,GO:0035556,GO:0035637,GO:0035639,GO:0035725,GO:0036094,GO:0036376,GO:0036477,GO:0040011,GO:0042221,GO:0042277,GO:0042383,GO:0042391,GO:0042493,GO:0042562,GO:0042578,GO:0042592,GO:0042623,GO:0042625,GO:0042626,GO:0042995,GO:0043005,GO:0043025,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043197,GO:0043209,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043269,GO:0043271,GO:0043394,GO:0043395,GO:0043492,GO:0043531,GO:0043548,GO:0043576,GO:0044057,GO:0044065,GO:0044070,GO:0044092,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044291,GO:0044297,GO:0044298,GO:0044309,GO:0044326,GO:0044327,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044444,GO:0044456,GO:0044459,GO:0044463,GO:0044464,GO:0044853,GO:0045121,GO:0045177,GO:0045178,GO:0045202,GO:0045822,GO:0045823,GO:0045833,GO:0045932,GO:0045933,GO:0045939,GO:0045988,GO:0045989,GO:0046034,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046873,GO:0046885,GO:0046890,GO:0048513,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048523,GO:0048545,GO:0048583,GO:0048731,GO:0048856,GO:0048878,GO:0050780,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050801,GO:0050804,GO:0050810,GO:0050877,GO:0050880,GO:0050890,GO:0050896,GO:0050998,GO:0051049,GO:0051051,GO:0051055,GO:0051087,GO:0051117,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051239,GO:0051240,GO:0051241,GO:0051270,GO:0051279,GO:0051282,GO:0051480,GO:0051481,GO:0051580,GO:0051588,GO:0051716,GO:0051899,GO:0051924,GO:0051926,GO:0051941,GO:0051946,GO:0051952,GO:0051955,GO:0051966,GO:0055065,GO:0055067,GO:0055074,GO:0055075,GO:0055078,GO:0055080,GO:0055082,GO:0055085,GO:0055086,GO:0055117,GO:0055119,GO:0060047,GO:0060048,GO:0060075,GO:0060081,GO:0060322,GO:0060341,GO:0061337,GO:0065007,GO:0065008,GO:0065009,GO:0070252,GO:0070887,GO:0071214,GO:0071229,GO:0071260,GO:0071300,GO:0071310,GO:0071383,GO:0071396,GO:0071407,GO:0071417,GO:0071495,GO:0071496,GO:0071704,GO:0071804,GO:0071805,GO:0071840,GO:0071944,GO:0072503,GO:0072507,GO:0072521,GO:0080090,GO:0086001,GO:0086002,GO:0086003,GO:0086004,GO:0086009,GO:0086010,GO:0086011,GO:0086012,GO:0086013,GO:0086036,GO:0086037,GO:0086064,GO:0086065,GO:0090030,GO:0090032,GO:0090066,GO:0090075,GO:0090257,GO:0090533,GO:0090662,GO:0097066,GO:0097067,GO:0097159,GO:0097367,GO:0097447,GO:0097458,GO:0097574,GO:0097708,GO:0097746,GO:0098533,GO:0098589,GO:0098590,GO:0098655,GO:0098657,GO:0098659,GO:0098660,GO:0098662,GO:0098739,GO:0098771,GO:0098794,GO:0098796,GO:0098797,GO:0098805,GO:0098857,GO:0098984,GO:0099131,GO:0099132,GO:0099177,GO:0099572,GO:0099587,GO:0099622,GO:0104004,GO:0106027,GO:0120025,GO:0120036,GO:0120038,GO:0140115,GO:1901019,GO:1901020,GO:1901135,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901652,GO:1901653,GO:1901681,GO:1901698,GO:1901699,GO:1901700,GO:1901701,GO:1902305,GO:1902306,GO:1902494,GO:1902495,GO:1902600,GO:1903115,GO:1903169,GO:1903170,GO:1903279,GO:1903280,GO:1903416,GO:1903522,GO:1903523,GO:1903524,GO:1903789,GO:1903959,GO:1904062,GO:1904063,GO:1904645,GO:1904646,GO:1904949,GO:1990239,GO:1990351,GO:1990535,GO:1990573,GO:1990794,GO:2000649,GO:2000650,GO:2001023
Evalue	0.0
EggNOG OGs	COG0474@1\|root,KOG0203@2759\|Eukaryota,38BIP@33154\|Opisthokonta,3BAR6@33208\|Metazoa,3CTGX@33213\|Bilateria,41TXW@6656\|Arthropoda,3SITZ@50557\|Insecta,3E7XT@33342\|Paraneoptera
EC	3.6.3.9
Description	Cation transporter/ATPase, N-terminus
COG category	P
BRITE	ko00000,ko00001,ko01000,ko04147

Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
Ggra9545	Ggra9545	Gracilaria gracilis GNS1m male	gene	tig00000150_pilon 21334..24879 +

The following start_codon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
Ggra9545.t1.start1	Ggra9545.t1.start1	Gracilaria gracilis GNS1m male	start_codon	tig00000150_pilon 21334..21336 +

The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
Ggra9545.t1.CDS1	Ggra9545.t1.CDS1	Gracilaria gracilis GNS1m male	CDS	tig00000150_pilon 21334..24879 +

The following exon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
Ggra9545.t1.exon1	Ggra9545.t1.exon1	Gracilaria gracilis GNS1m male	exon	tig00000150_pilon 21334..24879 +

The following stop_codon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
Ggra9545.t1.stop1	Ggra9545.t1.stop1	Gracilaria gracilis GNS1m male	stop_codon	tig00000150_pilon 24877..24879 +

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
Ggra9545.t1	Ggra9545.t1	Gracilaria gracilis GNS1m male	polypeptide	tig00000150_pilon 21334..24879 +

Sequences

The following sequences are available for this feature:

mRNA sequence
mRNA - spliced transcript sequence
protein sequence
mRNA from alignment at tig00000150_pilon:21334..24879+
coding sequence from alignment at tig00000150_pilon:21334..24879+

mRNA sequence

>Ggra9545.t1 ID=Ggra9545.t1|Name=Ggra9545.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=mRNA|length=1182bp
MGTDTLTPGQPRRLSHNELEMARQYSETSARISEIIERRNAGKKDKADKQ
EELKKELEMWEHKVTVQELCTKLQTDAEKGLSESEAKIRLERDGPNQLSP
PKVTPWYIKLLSQFINFFAILLQVASILCFVGYGLDKEAVDNLYLGIVLY
IVVIITAVFTFFQEFKSEKTMEKFKNFLPPKSVARRGGKIVEIDASTLVV
GDVIEVKLGDKLPADIRLASNQKLKVDNSPLTGESEPIGRTVDCTDENPL
ETKNLAFFGTLAVDGTCTGIVVNTGDDTVFGRIAGLAAGSVSEVTTLQVD
IHHFVIIISSVAIFLGVLFFIIGLIKGTPVITNVVFCIGIIVANVPEGLL
ATVTVSLTLSAKRMAKKQVLVKKLEAVETLGSTTCICSDKTGTLTQNRMT
IVHVAYDKQLHTTKTAATEATFDLEDPCFKELFYIGAVCGKAVFDAKDMD
ENPDRSIDERKVNGDASEAGILKFSEKIRSVGDMRTRNKQVCTIPFNSAN
KFMITINKVADQGERLRLCMKGAPERVIDRCTSILTKDGIQLFDAAAKSV
INEQLAFMMERGERCLGFARMDLDPSEYPVNFMFDTEDINFPMTGLTFVG
LMALLDPPREAVPHAVETCQSAGVKVIMVTGDHPATAKSIAKQVNIIQSP
TAEDVAKERGISVAEVDRSDIKAIVVPGSQIKDLEQDDWDRVLAHEQIVF
ARTSPQQKLIIVENNQRLGNIVAVTGDGVNDSPALKKANIGIAMGIAGSD
VSKEAADMILLDDNFASIVNGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLTSNIPEITPF
LAFIIFQIPLPLTTVLILCIDLGTDLLPAISLAYENPESDIMRRPPRDSR
VDRLVNRRLISFSYFQIGVIQALAGFYCYLVVLGDFGLTAHVLPFLDEDA
YIASPQSDEKRWLYAVRERPFGESIDAGFFDETGDFERFFSSPAQNGFKV
QNDTGDAPVGVVFKQLLKPGNVEQLQNMYKILGSVLETPPCLAFTCDRTG
PAGGSVSNDYECIENAGAFEGVNIPRAALTNSDRSNSELFNTEVEEGSGP
GQGCYDLYTNSQQQEALKTAQTAFFVCIVIVQMGGLLVCKTRLLSFFKQG
MKNLILNIGLLTEVALCALLCYVPFIQTAFQTRSLRFVHWLPAIPFSVFI
FCYDEARKFLIRLGDNKGNKLGVWLRENTYW*

spliced messenger RNA

>Ggra9545.t1 ID=Ggra9545.t1|Name=Ggra9545.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=mRNA|length=3546bp|location=Sequence derived from alignment at tig00000150_pilon:21334..24879+ (Gracilaria gracilis GNS1m male)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.  
ATGGGTACCGACACTCTGACGCCGGGACAGCCGCGCCGCCTGTCCCACAA
TGAGCTCGAAATGGCGCGCCAATATTCCGAGACCAGCGCCAGGATCTCTG
AGATCATCGAGCGCAGAAACGCCGGGAAGAAGGACAAGGCTGACAAGCAG
GAAGAGCTCAAGAAGGAGCTCGAAATGTGGGAGCACAAGGTCACCGTTCA
GGAGCTTTGCACCAAGTTGCAGACTGATGCCGAAAAGGGTCTCTCGGAGA
GCGAGGCTAAGATTCGTCTTGAGAGAGATGGACCCAACCAGCTTTCGCCG
CCAAAGGTCACACCGTGGTACATCAAGCTTCTCAGTCAGTTTATCAACTT
CTTTGCTATTCTGTTGCAGGTTGCTTCTATCCTCTGTTTTGTGGGCTATG
GTCTTGATAAGGAGGCCGTGGACAATCTTTATCTCGGTATTGTGTTGTAC
ATTGTCGTTATTATCACCGCCGTCTTCACCTTCTTCCAGGAGTTCAAGAG
CGAGAAGACCATGGAGAAATTCAAGAACTTTTTGCCCCCCAAGTCTGTGG
CCCGCCGTGGTGGCAAGATTGTCGAGATCGATGCCTCCACTCTTGTGGTA
GGTGACGTCATCGAAGTGAAGCTTGGTGATAAGCTCCCGGCTGATATTCG
TCTTGCCTCCAACCAGAAGCTCAAGGTCGACAACTCTCCTCTCACTGGTG
AGTCCGAACCCATCGGCCGTACAGTTGACTGCACTGATGAGAACCCGCTT
GAGACCAAGAATCTTGCTTTCTTCGGAACTCTTGCCGTCGATGGTACTTG
CACTGGTATCGTTGTCAACACTGGTGATGACACTGTGTTCGGTCGTATCG
CTGGTCTTGCTGCCGGTTCCGTCTCCGAGGTCACCACCCTGCAGGTCGAT
ATCCATCATTTTGTTATTATCATTTCGTCCGTCGCTATCTTCCTCGGTGT
ACTCTTCTTCATCATCGGTCTCATCAAGGGAACCCCAGTCATCACTAACG
TTGTGTTCTGCATTGGTATCATTGTGGCCAACGTGCCTGAGGGACTGCTC
GCCACTGTGACAGTGTCTCTCACTTTGTCCGCCAAGCGTATGGCCAAGAA
GCAAGTGCTTGTGAAGAAGCTGGAGGCTGTTGAGACCCTCGGATCCACTA
CATGCATTTGCTCTGACAAGACTGGTACCTTGACCCAGAACCGAATGACT
ATTGTCCATGTTGCCTATGACAAGCAGCTGCACACCACCAAGACTGCCGC
CACCGAGGCCACCTTCGACCTGGAGGACCCATGCTTCAAGGAATTGTTCT
ACATTGGTGCCGTCTGTGGTAAGGCCGTGTTCGACGCCAAAGACATGGAT
GAGAACCCAGACAGGTCTATTGACGAGCGCAAGGTCAACGGTGATGCTTC
CGAAGCCGGTATCCTTAAGTTCTCTGAGAAGATTCGCTCCGTCGGCGACA
TGCGCACCAGGAACAAGCAGGTGTGCACTATTCCTTTCAACTCCGCCAAC
AAGTTCATGATTACCATCAACAAGGTTGCCGACCAGGGAGAACGCCTTCG
TCTCTGCATGAAGGGTGCCCCGGAGCGTGTCATTGACCGTTGCACATCAA
TCCTCACCAAAGATGGTATTCAGCTGTTCGACGCTGCGGCCAAATCGGTC
ATCAATGAGCAGTTGGCTTTCATGATGGAACGTGGTGAACGTTGCCTTGG
CTTCGCCAGGATGGATCTTGACCCGAGTGAGTACCCTGTGAATTTCATGT
TCGACACTGAAGACATCAACTTCCCGATGACCGGTCTTACCTTCGTTGGT
CTGATGGCTCTTCTTGACCCGCCTCGTGAGGCCGTGCCCCATGCCGTGGA
AACATGCCAGTCTGCCGGTGTCAAGGTTATCATGGTTACTGGTGACCATC
CGGCTACCGCCAAGTCCATCGCCAAGCAGGTGAACATTATCCAAAGTCCG
ACTGCTGAAGACGTTGCCAAGGAGCGTGGTATTTCCGTCGCTGAGGTTGA
CCGTTCCGACATCAAAGCCATTGTCGTCCCTGGTTCCCAGATCAAGGATC
TCGAACAAGACGATTGGGATCGTGTCCTGGCCCACGAACAGATTGTGTTT
GCCCGTACCTCCCCCCAGCAGAAGCTCATCATTGTCGAGAACAACCAGCG
CCTTGGTAACATTGTGGCTGTGACTGGTGATGGTGTGAATGACTCCCCTG
CTTTGAAGAAGGCTAACATTGGTATTGCTATGGGTATTGCCGGTTCTGAT
GTGTCCAAGGAAGCTGCGGATATGATCTTGCTCGATGACAACTTCGCGTC
CATTGTGAACGGTGTCGAGGAGGGTCGTCTTATCTTCGACAACCTGAAGA
AGTCGATTGCCTACACTCTCACGAGTAACATTCCTGAAATTACTCCTTTC
CTGGCTTTCATCATTTTCCAGATTCCGCTTCCGTTGACCACAGTGCTTAT
CCTTTGCATTGATTTGGGTACTGATCTTCTGCCAGCCATCTCTCTCGCCT
ACGAGAACCCCGAGTCAGATATCATGCGTCGTCCTCCGCGTGACTCTCGT
GTGGATCGATTGGTGAATCGTCGTCTCATCTCGTTCTCATATTTCCAGAT
CGGTGTCATCCAGGCTTTGGCTGGCTTCTACTGCTACCTTGTTGTGCTTG
GAGACTTTGGTCTCACTGCCCATGTGTTGCCATTCCTTGACGAAGATGCC
TACATCGCTTCGCCCCAGAGTGATGAGAAACGCTGGTTGTACGCCGTCCG
TGAACGACCGTTCGGTGAATCTATTGACGCTGGCTTTTTCGATGAGACTG
GTGACTTTGAGCGATTCTTCAGTTCTCCTGCACAGAATGGATTCAAGGTT
CAGAATGATACCGGAGATGCCCCGGTTGGTGTCGTGTTCAAGCAGCTCCT
GAAGCCGGGGAACGTGGAGCAATTGCAAAACATGTACAAGATTCTCGGCA
GTGTGTTGGAAACGCCACCGTGCTTGGCTTTCACTTGTGACAGGACTGGC
CCTGCTGGTGGATCTGTTTCCAATGACTACGAATGTATCGAAAACGCTGG
TGCATTTGAAGGAGTTAACATCCCTCGGGCAGCACTGACCAACAGTGACC
GCTCAAACTCGGAACTGTTCAACACCGAAGTGGAAGAAGGCAGTGGCCCA
GGTCAAGGTTGCTACGATTTGTATACCAACAGCCAACAACAGGAAGCGTT
GAAGACTGCCCAAACTGCCTTCTTCGTGTGCATTGTCATTGTACAGATGG
GTGGTCTCCTTGTTTGCAAGACAAGGTTGCTTTCTTTCTTCAAGCAGGGA
ATGAAGAATCTGATTCTGAACATTGGTCTACTGACTGAAGTGGCTCTGTG
CGCGCTTCTGTGCTATGTTCCATTCATTCAGACTGCATTCCAGACGCGCA
GCCTTCGTTTCGTTCATTGGTTGCCGGCTATTCCGTTCTCTGTGTTCATC
TTCTGCTATGACGAAGCTCGTAAGTTCTTAATCAGACTTGGAGACAATAA
GGGTAACAAATTGGGAGTATGGCTGCGTGAGAACACATATTGGTAA

protein sequence of Ggra9545.t1

>Ggra9545.t1 ID=Ggra9545.t1|Name=Ggra9545.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=polypeptide|length=1182bp
MGTDTLTPGQPRRLSHNELEMARQYSETSARISEIIERRNAGKKDKADKQ
EELKKELEMWEHKVTVQELCTKLQTDAEKGLSESEAKIRLERDGPNQLSP
PKVTPWYIKLLSQFINFFAILLQVASILCFVGYGLDKEAVDNLYLGIVLY
IVVIITAVFTFFQEFKSEKTMEKFKNFLPPKSVARRGGKIVEIDASTLVV
GDVIEVKLGDKLPADIRLASNQKLKVDNSPLTGESEPIGRTVDCTDENPL
ETKNLAFFGTLAVDGTCTGIVVNTGDDTVFGRIAGLAAGSVSEVTTLQVD
IHHFVIIISSVAIFLGVLFFIIGLIKGTPVITNVVFCIGIIVANVPEGLL
ATVTVSLTLSAKRMAKKQVLVKKLEAVETLGSTTCICSDKTGTLTQNRMT
IVHVAYDKQLHTTKTAATEATFDLEDPCFKELFYIGAVCGKAVFDAKDMD
ENPDRSIDERKVNGDASEAGILKFSEKIRSVGDMRTRNKQVCTIPFNSAN
KFMITINKVADQGERLRLCMKGAPERVIDRCTSILTKDGIQLFDAAAKSV
INEQLAFMMERGERCLGFARMDLDPSEYPVNFMFDTEDINFPMTGLTFVG
LMALLDPPREAVPHAVETCQSAGVKVIMVTGDHPATAKSIAKQVNIIQSP
TAEDVAKERGISVAEVDRSDIKAIVVPGSQIKDLEQDDWDRVLAHEQIVF
ARTSPQQKLIIVENNQRLGNIVAVTGDGVNDSPALKKANIGIAMGIAGSD
VSKEAADMILLDDNFASIVNGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLTSNIPEITPF
LAFIIFQIPLPLTTVLILCIDLGTDLLPAISLAYENPESDIMRRPPRDSR
VDRLVNRRLISFSYFQIGVIQALAGFYCYLVVLGDFGLTAHVLPFLDEDA
YIASPQSDEKRWLYAVRERPFGESIDAGFFDETGDFERFFSSPAQNGFKV
QNDTGDAPVGVVFKQLLKPGNVEQLQNMYKILGSVLETPPCLAFTCDRTG
PAGGSVSNDYECIENAGAFEGVNIPRAALTNSDRSNSELFNTEVEEGSGP
GQGCYDLYTNSQQQEALKTAQTAFFVCIVIVQMGGLLVCKTRLLSFFKQG
MKNLILNIGLLTEVALCALLCYVPFIQTAFQTRSLRFVHWLPAIPFSVFI
FCYDEARKFLIRLGDNKGNKLGVWLRENTYW*

mRNA from alignment at tig00000150_pilon:21334..24879+

Legend: start_codonpolypeptideCDSexonstop_codon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>Ggra9545.t1 ID=Ggra9545.t1|Name=Ggra9545.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=mRNA|length=3546bp|location=Sequence derived from alignment at tig00000150_pilon:21334..24879+ (Gracilaria gracilis GNS1m male)
ATGGGTACCGACACTCTGACGCCGGGACAGCCGCGCCGCCTGTCCCACAA
TGAGCTCGAAATGGCGCGCCAATATTCCGAGACCAGCGCCAGGATCTCTG
AGATCATCGAGCGCAGAAACGCCGGGAAGAAGGACAAGGCTGACAAGCAG
GAAGAGCTCAAGAAGGAGCTCGAAATGTGGGAGCACAAGGTCACCGTTCA
GGAGCTTTGCACCAAGTTGCAGACTGATGCCGAAAAGGGTCTCTCGGAGA
GCGAGGCTAAGATTCGTCTTGAGAGAGATGGACCCAACCAGCTTTCGCCG
CCAAAGGTCACACCGTGGTACATCAAGCTTCTCAGTCAGTTTATCAACTT
CTTTGCTATTCTGTTGCAGGTTGCTTCTATCCTCTGTTTTGTGGGCTATG
GTCTTGATAAGGAGGCCGTGGACAATCTTTATCTCGGTATTGTGTTGTAC
ATTGTCGTTATTATCACCGCCGTCTTCACCTTCTTCCAGGAGTTCAAGAG
CGAGAAGACCATGGAGAAATTCAAGAACTTTTTGCCCCCCAAGTCTGTGG
CCCGCCGTGGTGGCAAGATTGTCGAGATCGATGCCTCCACTCTTGTGGTA
GGTGACGTCATCGAAGTGAAGCTTGGTGATAAGCTCCCGGCTGATATTCG
TCTTGCCTCCAACCAGAAGCTCAAGGTCGACAACTCTCCTCTCACTGGTG
AGTCCGAACCCATCGGCCGTACAGTTGACTGCACTGATGAGAACCCGCTT
GAGACCAAGAATCTTGCTTTCTTCGGAACTCTTGCCGTCGATGGTACTTG
CACTGGTATCGTTGTCAACACTGGTGATGACACTGTGTTCGGTCGTATCG
CTGGTCTTGCTGCCGGTTCCGTCTCCGAGGTCACCACCCTGCAGGTCGAT
ATCCATCATTTTGTTATTATCATTTCGTCCGTCGCTATCTTCCTCGGTGT
ACTCTTCTTCATCATCGGTCTCATCAAGGGAACCCCAGTCATCACTAACG
TTGTGTTCTGCATTGGTATCATTGTGGCCAACGTGCCTGAGGGACTGCTC
GCCACTGTGACAGTGTCTCTCACTTTGTCCGCCAAGCGTATGGCCAAGAA
GCAAGTGCTTGTGAAGAAGCTGGAGGCTGTTGAGACCCTCGGATCCACTA
CATGCATTTGCTCTGACAAGACTGGTACCTTGACCCAGAACCGAATGACT
ATTGTCCATGTTGCCTATGACAAGCAGCTGCACACCACCAAGACTGCCGC
CACCGAGGCCACCTTCGACCTGGAGGACCCATGCTTCAAGGAATTGTTCT
ACATTGGTGCCGTCTGTGGTAAGGCCGTGTTCGACGCCAAAGACATGGAT
GAGAACCCAGACAGGTCTATTGACGAGCGCAAGGTCAACGGTGATGCTTC
CGAAGCCGGTATCCTTAAGTTCTCTGAGAAGATTCGCTCCGTCGGCGACA
TGCGCACCAGGAACAAGCAGGTGTGCACTATTCCTTTCAACTCCGCCAAC
AAGTTCATGATTACCATCAACAAGGTTGCCGACCAGGGAGAACGCCTTCG
TCTCTGCATGAAGGGTGCCCCGGAGCGTGTCATTGACCGTTGCACATCAA
TCCTCACCAAAGATGGTATTCAGCTGTTCGACGCTGCGGCCAAATCGGTC
ATCAATGAGCAGTTGGCTTTCATGATGGAACGTGGTGAACGTTGCCTTGG
CTTCGCCAGGATGGATCTTGACCCGAGTGAGTACCCTGTGAATTTCATGT
TCGACACTGAAGACATCAACTTCCCGATGACCGGTCTTACCTTCGTTGGT
CTGATGGCTCTTCTTGACCCGCCTCGTGAGGCCGTGCCCCATGCCGTGGA
AACATGCCAGTCTGCCGGTGTCAAGGTTATCATGGTTACTGGTGACCATC
CGGCTACCGCCAAGTCCATCGCCAAGCAGGTGAACATTATCCAAAGTCCG
ACTGCTGAAGACGTTGCCAAGGAGCGTGGTATTTCCGTCGCTGAGGTTGA
CCGTTCCGACATCAAAGCCATTGTCGTCCCTGGTTCCCAGATCAAGGATC
TCGAACAAGACGATTGGGATCGTGTCCTGGCCCACGAACAGATTGTGTTT
GCCCGTACCTCCCCCCAGCAGAAGCTCATCATTGTCGAGAACAACCAGCG
CCTTGGTAACATTGTGGCTGTGACTGGTGATGGTGTGAATGACTCCCCTG
CTTTGAAGAAGGCTAACATTGGTATTGCTATGGGTATTGCCGGTTCTGAT
GTGTCCAAGGAAGCTGCGGATATGATCTTGCTCGATGACAACTTCGCGTC
CATTGTGAACGGTGTCGAGGAGGGTCGTCTTATCTTCGACAACCTGAAGA
AGTCGATTGCCTACACTCTCACGAGTAACATTCCTGAAATTACTCCTTTC
CTGGCTTTCATCATTTTCCAGATTCCGCTTCCGTTGACCACAGTGCTTAT
CCTTTGCATTGATTTGGGTACTGATCTTCTGCCAGCCATCTCTCTCGCCT
ACGAGAACCCCGAGTCAGATATCATGCGTCGTCCTCCGCGTGACTCTCGT
GTGGATCGATTGGTGAATCGTCGTCTCATCTCGTTCTCATATTTCCAGAT
CGGTGTCATCCAGGCTTTGGCTGGCTTCTACTGCTACCTTGTTGTGCTTG
GAGACTTTGGTCTCACTGCCCATGTGTTGCCATTCCTTGACGAAGATGCC
TACATCGCTTCGCCCCAGAGTGATGAGAAACGCTGGTTGTACGCCGTCCG
TGAACGACCGTTCGGTGAATCTATTGACGCTGGCTTTTTCGATGAGACTG
GTGACTTTGAGCGATTCTTCAGTTCTCCTGCACAGAATGGATTCAAGGTT
CAGAATGATACCGGAGATGCCCCGGTTGGTGTCGTGTTCAAGCAGCTCCT
GAAGCCGGGGAACGTGGAGCAATTGCAAAACATGTACAAGATTCTCGGCA
GTGTGTTGGAAACGCCACCGTGCTTGGCTTTCACTTGTGACAGGACTGGC
CCTGCTGGTGGATCTGTTTCCAATGACTACGAATGTATCGAAAACGCTGG
TGCATTTGAAGGAGTTAACATCCCTCGGGCAGCACTGACCAACAGTGACC
GCTCAAACTCGGAACTGTTCAACACCGAAGTGGAAGAAGGCAGTGGCCCA
GGTCAAGGTTGCTACGATTTGTATACCAACAGCCAACAACAGGAAGCGTT
GAAGACTGCCCAAACTGCCTTCTTCGTGTGCATTGTCATTGTACAGATGG
GTGGTCTCCTTGTTTGCAAGACAAGGTTGCTTTCTTTCTTCAAGCAGGGA
ATGAAGAATCTGATTCTGAACATTGGTCTACTGACTGAAGTGGCTCTGTG
CGCGCTTCTGTGCTATGTTCCATTCATTCAGACTGCATTCCAGACGCGCA
GCCTTCGTTTCGTTCATTGGTTGCCGGCTATTCCGTTCTCTGTGTTCATC
TTCTGCTATGACGAAGCTCGTAAGTTCTTAATCAGACTTGGAGACAATAA
GGGTAACAAATTGGGAGTATGGCTGCGTGAGAACACATATTGGTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at tig00000150_pilon:21334..24879+

>Ggra9545.t1 ID=Ggra9545.t1|Name=Ggra9545.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=CDS|length=3546bp|location=Sequence derived from alignment at tig00000150_pilon:21334..24879+ (Gracilaria gracilis GNS1m male)
ATGGGTACCGACACTCTGACGCCGGGACAGCCGCGCCGCCTGTCCCACAA
TGAGCTCGAAATGGCGCGCCAATATTCCGAGACCAGCGCCAGGATCTCTG
AGATCATCGAGCGCAGAAACGCCGGGAAGAAGGACAAGGCTGACAAGCAG
GAAGAGCTCAAGAAGGAGCTCGAAATGTGGGAGCACAAGGTCACCGTTCA
GGAGCTTTGCACCAAGTTGCAGACTGATGCCGAAAAGGGTCTCTCGGAGA
GCGAGGCTAAGATTCGTCTTGAGAGAGATGGACCCAACCAGCTTTCGCCG
CCAAAGGTCACACCGTGGTACATCAAGCTTCTCAGTCAGTTTATCAACTT
CTTTGCTATTCTGTTGCAGGTTGCTTCTATCCTCTGTTTTGTGGGCTATG
GTCTTGATAAGGAGGCCGTGGACAATCTTTATCTCGGTATTGTGTTGTAC
ATTGTCGTTATTATCACCGCCGTCTTCACCTTCTTCCAGGAGTTCAAGAG
CGAGAAGACCATGGAGAAATTCAAGAACTTTTTGCCCCCCAAGTCTGTGG
CCCGCCGTGGTGGCAAGATTGTCGAGATCGATGCCTCCACTCTTGTGGTA
GGTGACGTCATCGAAGTGAAGCTTGGTGATAAGCTCCCGGCTGATATTCG
TCTTGCCTCCAACCAGAAGCTCAAGGTCGACAACTCTCCTCTCACTGGTG
AGTCCGAACCCATCGGCCGTACAGTTGACTGCACTGATGAGAACCCGCTT
GAGACCAAGAATCTTGCTTTCTTCGGAACTCTTGCCGTCGATGGTACTTG
CACTGGTATCGTTGTCAACACTGGTGATGACACTGTGTTCGGTCGTATCG
CTGGTCTTGCTGCCGGTTCCGTCTCCGAGGTCACCACCCTGCAGGTCGAT
ATCCATCATTTTGTTATTATCATTTCGTCCGTCGCTATCTTCCTCGGTGT
ACTCTTCTTCATCATCGGTCTCATCAAGGGAACCCCAGTCATCACTAACG
TTGTGTTCTGCATTGGTATCATTGTGGCCAACGTGCCTGAGGGACTGCTC
GCCACTGTGACAGTGTCTCTCACTTTGTCCGCCAAGCGTATGGCCAAGAA
GCAAGTGCTTGTGAAGAAGCTGGAGGCTGTTGAGACCCTCGGATCCACTA
CATGCATTTGCTCTGACAAGACTGGTACCTTGACCCAGAACCGAATGACT
ATTGTCCATGTTGCCTATGACAAGCAGCTGCACACCACCAAGACTGCCGC
CACCGAGGCCACCTTCGACCTGGAGGACCCATGCTTCAAGGAATTGTTCT
ACATTGGTGCCGTCTGTGGTAAGGCCGTGTTCGACGCCAAAGACATGGAT
GAGAACCCAGACAGGTCTATTGACGAGCGCAAGGTCAACGGTGATGCTTC
CGAAGCCGGTATCCTTAAGTTCTCTGAGAAGATTCGCTCCGTCGGCGACA
TGCGCACCAGGAACAAGCAGGTGTGCACTATTCCTTTCAACTCCGCCAAC
AAGTTCATGATTACCATCAACAAGGTTGCCGACCAGGGAGAACGCCTTCG
TCTCTGCATGAAGGGTGCCCCGGAGCGTGTCATTGACCGTTGCACATCAA
TCCTCACCAAAGATGGTATTCAGCTGTTCGACGCTGCGGCCAAATCGGTC
ATCAATGAGCAGTTGGCTTTCATGATGGAACGTGGTGAACGTTGCCTTGG
CTTCGCCAGGATGGATCTTGACCCGAGTGAGTACCCTGTGAATTTCATGT
TCGACACTGAAGACATCAACTTCCCGATGACCGGTCTTACCTTCGTTGGT
CTGATGGCTCTTCTTGACCCGCCTCGTGAGGCCGTGCCCCATGCCGTGGA
AACATGCCAGTCTGCCGGTGTCAAGGTTATCATGGTTACTGGTGACCATC
CGGCTACCGCCAAGTCCATCGCCAAGCAGGTGAACATTATCCAAAGTCCG
ACTGCTGAAGACGTTGCCAAGGAGCGTGGTATTTCCGTCGCTGAGGTTGA
CCGTTCCGACATCAAAGCCATTGTCGTCCCTGGTTCCCAGATCAAGGATC
TCGAACAAGACGATTGGGATCGTGTCCTGGCCCACGAACAGATTGTGTTT
GCCCGTACCTCCCCCCAGCAGAAGCTCATCATTGTCGAGAACAACCAGCG
CCTTGGTAACATTGTGGCTGTGACTGGTGATGGTGTGAATGACTCCCCTG
CTTTGAAGAAGGCTAACATTGGTATTGCTATGGGTATTGCCGGTTCTGAT
GTGTCCAAGGAAGCTGCGGATATGATCTTGCTCGATGACAACTTCGCGTC
CATTGTGAACGGTGTCGAGGAGGGTCGTCTTATCTTCGACAACCTGAAGA
AGTCGATTGCCTACACTCTCACGAGTAACATTCCTGAAATTACTCCTTTC
CTGGCTTTCATCATTTTCCAGATTCCGCTTCCGTTGACCACAGTGCTTAT
CCTTTGCATTGATTTGGGTACTGATCTTCTGCCAGCCATCTCTCTCGCCT
ACGAGAACCCCGAGTCAGATATCATGCGTCGTCCTCCGCGTGACTCTCGT
GTGGATCGATTGGTGAATCGTCGTCTCATCTCGTTCTCATATTTCCAGAT
CGGTGTCATCCAGGCTTTGGCTGGCTTCTACTGCTACCTTGTTGTGCTTG
GAGACTTTGGTCTCACTGCCCATGTGTTGCCATTCCTTGACGAAGATGCC
TACATCGCTTCGCCCCAGAGTGATGAGAAACGCTGGTTGTACGCCGTCCG
TGAACGACCGTTCGGTGAATCTATTGACGCTGGCTTTTTCGATGAGACTG
GTGACTTTGAGCGATTCTTCAGTTCTCCTGCACAGAATGGATTCAAGGTT
CAGAATGATACCGGAGATGCCCCGGTTGGTGTCGTGTTCAAGCAGCTCCT
GAAGCCGGGGAACGTGGAGCAATTGCAAAACATGTACAAGATTCTCGGCA
GTGTGTTGGAAACGCCACCGTGCTTGGCTTTCACTTGTGACAGGACTGGC
CCTGCTGGTGGATCTGTTTCCAATGACTACGAATGTATCGAAAACGCTGG
TGCATTTGAAGGAGTTAACATCCCTCGGGCAGCACTGACCAACAGTGACC
GCTCAAACTCGGAACTGTTCAACACCGAAGTGGAAGAAGGCAGTGGCCCA
GGTCAAGGTTGCTACGATTTGTATACCAACAGCCAACAACAGGAAGCGTT
GAAGACTGCCCAAACTGCCTTCTTCGTGTGCATTGTCATTGTACAGATGG
GTGGTCTCCTTGTTTGCAAGACAAGGTTGCTTTCTTTCTTCAAGCAGGGA
ATGAAGAATCTGATTCTGAACATTGGTCTACTGACTGAAGTGGCTCTGTG
CGCGCTTCTGTGCTATGTTCCATTCATTCAGACTGCATTCCAGACGCGCA
GCCTTCGTTTCGTTCATTGGTTGCCGGCTATTCCGTTCTCTGTGTTCATC
TTCTGCTATGACGAAGCTCGTAAGTTCTTAATCAGACTTGGAGACAATAA
GGGTAACAAATTGGGAGTATGGCTGCGTGAGAACACATATTGGTAA