Ggra10210.t1 (mRNA) Gracilaria gracilis GNS1m male

You are viewing an mRNA, more information available on the corresponding polypeptide page

Overview
NameGgra10210.t1
Unique NameGgra10210.t1
TypemRNA
OrganismGracilaria gracilis GNS1m male (Gracilaria gracilis GNS1m male (Slender Wart Weed))
Sequence length595
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
tig00000016_piloncontigtig00000016_pilon:97041..98825 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Gracilaria gracilis GNS1m male OGS1.02022-05-09
Properties
Property NameValue
Seed ortholog103372.F4WZN0
Preferred nameSHH
PFAMsHH_signal,Hint
Max annot lvl33208|Metazoa
KEGG koko:K06224,ko:K11988,ko:K11989,ko:K11990
KEGG Pathwayko04340,ko04341,ko04360,ko05200,ko05205,ko05217,ko05226,map04340,map04341,map04360,map05200,map05205,map05217,map05226
KEGG ModuleM00678
GOsGO:0000003,GO:0000122,GO:0000578,GO:0000902,GO:0000904,GO:0001101,GO:0001501,GO:0001503,GO:0001525,GO:0001558,GO:0001568,GO:0001569,GO:0001570,GO:0001649,GO:0001654,GO:0001655,GO:0001656,GO:0001657,GO:0001658,GO:0001664,GO:0001666,GO:0001667,GO:0001701,GO:0001708,GO:0001709,GO:0001745,GO:0001746,GO:0001751,GO:0001752,GO:0001754,GO:0001755,GO:0001756,GO:0001763,GO:0001775,GO:0001816,GO:0001822,GO:0001823,GO:0001838,GO:0001839,GO:0001840,GO:0001841,GO:0001889,GO:0001894,GO:0001895,GO:0001942,GO:0001944,GO:0001947,GO:0002009,GO:0002052,GO:0002053,GO:0002062,GO:0002063,GO:0002064,GO:0002065,GO:0002066,GO:0002072,GO:0002076,GO:0002164,GO:0002165,GO:0002168,GO:0002244,GO:0002251,GO:0002320,GO:0002360,GO:0002376,GO:0002385,GO:0002520,GO:0002521,GO:0002682,GO:0002683,GO:0002684,GO:0002694,GO:0002695,GO:0002696,GO:0003002,GO:0003006,GO:0003007,GO:0003008,GO:0003013,GO:0003140,GO:0003143,GO:0003156,GO:0003157,GO:0003158,GO:0003348,GO:0003382,GO:0003399,GO:0003401,GO:0003406,GO:0003407,GO:0003408,GO:0003413,GO:0003415,GO:0003416,GO:0003417,GO:0003418,GO:0003420,GO:0003430,GO:0003431,GO:0003433,GO:0003674,GO:0005102,GO:0005113,GO:0005119,GO:0005488,GO:0005509,GO:0005515,GO:0005539,GO:0005575,GO:0005576,GO:0005615,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005768,GO:0005783,GO:0005788,GO:0005794,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006029,GO:0006355,GO:0006357,GO:0006508,GO:0006629,GO:0006807,GO:0006810,GO:0006897,GO:0006915,GO:0006928,GO:0006935,GO:0006950,GO:0006955,GO:0006996,GO:0007010,GO:0007154,GO:0007155,GO:0007162,GO:0007163,GO:0007165,GO:0007166,GO:0007224,GO:0007227,GO:0007228,GO:0007267,GO:0007275,GO:0007276,GO:0007280,GO:0007281,GO:0007283,GO:0007286,GO:0007292,GO:0007346,GO:0007350,GO:0007351,GO:0007365,GO:0007367,GO:0007368,GO:0007386,GO:0007389,GO:0007398,GO:0007399,GO:0007405,GO:0007409,GO:0007411,GO:0007417,GO:0007418,GO:0007420,GO:0007423,GO:0007424,GO:0007427,GO:0007431,GO:0007435,GO:0007440,GO:0007442,GO:0007444,GO:0007446,GO:0007447,GO:0007448,GO:0007449,GO:0007458,GO:0007460,GO:0007472,GO:0007473,GO:0007474,GO:0007476,GO:0007478,GO:0007487,GO:0007498,GO:0007502,GO:0007506,GO:0007507,GO:0007517,GO:0007519,GO:0007530,GO:0007548,GO:0007552,GO:0007560,GO:0007596,GO:0007599,GO:0008015,GO:0008021,GO:0008104,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008202,GO:0008209,GO:0008219,GO:0008270,GO:0008283,GO:0008284,GO:0008285,GO:0008347,GO:0008354,GO:0008406,GO:0008544,GO:0008584,GO:0008589,GO:0008595,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009100,GO:0009101,GO:0009605,GO:0009611,GO:0009628,GO:0009636,GO:0009653,GO:0009719,GO:0009725,GO:0009790,GO:0009791,GO:0009792,GO:0009798,GO:0009799,GO:0009855,GO:0009880,GO:0009886,GO:0009887,GO:0009888,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009891,GO:0009892,GO:0009893,GO:0009894,GO:0009895,GO:0009948,GO:0009949,GO:0009950,GO:0009951,GO:0009952,GO:0009953,GO:0009954,GO:0009966,GO:0009967,GO:0009968,GO:0009986,GO:0009987,GO:0010001,GO:0010002,GO:0010033,GO:0010035,GO:0010038,GO:0010171,GO:0010226,GO:0010243,GO:0010463,GO:0010464,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010469,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010558,GO:0010562,GO:0010594,GO:0010595,GO:0010604,GO:0010605,GO:0010628,GO:0010629,GO:0010631,GO:0010632,GO:0010634,GO:0010646,GO:0010647,GO:0010648,GO:0010692,GO:0010694,GO:0010712,GO:0010714,GO:0010720,GO:0010721,GO:0010769,GO:0010770,GO:0010817,GO:0010874,GO:0010921,GO:0010922,GO:0010927,GO:0010941,GO:0012501,GO:0012505,GO:0014003,GO:0014013,GO:0014015,GO:0014031,GO:0014032,GO:0014033,GO:0014070,GO:0014706,GO:0014857,GO:0014858,GO:0014902,GO:0014904,GO:0016015,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016049,GO:0016055,GO:0016192,GO:0016202,GO:0016331,GO:0016335,GO:0016477,GO:0016485,GO:0016540,GO:0017145,GO:0019216,GO:0019218,GO:0019219,GO:0019220,GO:0019222,GO:0019538,GO:0019953,GO:0021508,GO:0021510,GO:0021511,GO:0021513,GO:0021514,GO:0021515,GO:0021517,GO:0021520,GO:0021521,GO:0021522,GO:0021532,GO:0021534,GO:0021536,GO:0021537,GO:0021545,GO:0021554,GO:0021602,GO:0021631,GO:0021675,GO:0021700,GO:0021782,GO:0021794,GO:0021871,GO:0021903,GO:0021904,GO:0021915,GO:0021924,GO:0021930,GO:0021936,GO:0021937,GO:0021938,GO:0021940,GO:0021952,GO:0021953,GO:0021954,GO:0021955,GO:0021960,GO:0021978,GO:0021983,GO:0021984,GO:0022006,GO:0022008,GO:0022404,GO:0022405,GO:0022407,GO:0022408,GO:0022409,GO:0022412,GO:0022414,GO:0022603,GO:0022604,GO:0022607,GO:0022610,GO:0022612,GO:0023051,GO:0023052,GO:0023056,GO:0023057,GO:0030010,GO:0030030,GO:0030031,GO:0030097,GO:0030098,GO:0030111,GO:0030133,GO:0030139,GO:0030154,GO:0030155,GO:0030162,GO:0030166,GO:0030177,GO:0030178,GO:0030182,GO:0030198,GO:0030217,GO:0030238,GO:0030278,GO:0030308,GO:0030323,GO:0030324,GO:0030326,GO:0030334,GO:0030335,GO:0030336,GO:0030424,GO:0030425,GO:0030510,GO:0030514,GO:0030539,GO:0030545,GO:0030704,GO:0030707,GO:0030713,GO:0030850,GO:0030855,GO:0030856,GO:0030878,GO:0030900,GO:0030901,GO:0030902,GO:0030917,GO:0030947,GO:0031012,GO:0031016,GO:0031018,GO:0031069,GO:0031076,GO:0031099,GO:0031100,GO:0031175,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031328,GO:0031329,GO:0031330,GO:0031396,GO:0031397,GO:0031399,GO:0031400,GO:0031410,GO:0031974,GO:0031982,GO:0032101,GO:0032103,GO:0032268,GO:0032269,GO:0032330,GO:0032331,GO:0032355,GO:0032368,GO:0032369,GO:0032371,GO:0032372,GO:0032374,GO:0032375,GO:0032386,GO:0032388,GO:0032434,GO:0032435,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032504,GO:0032526,GO:0032784,GO:0032785,GO:0032835,GO:0032879,GO:0032880,GO:0032899,GO:0032901,GO:0032925,GO:0032944,GO:0032945,GO:0032946,GO:0032965,GO:0032967,GO:0032989,GO:0032990,GO:0033036,GO:0033077,GO:0033081,GO:0033083,GO:0033084,GO:0033085,GO:0033087,GO:0033088,GO:0033089,GO:0033091,GO:0033092,GO:0033157,GO:0033327,GO:0033333,GO:0033334,GO:0033336,GO:0033338,GO:0033339,GO:0033365,GO:0033504,GO:0033505,GO:0033993,GO:0034243,GO:0034244,GO:0034504,GO:0034613,GO:0034645,GO:0034754,GO:0035050,GO:0035051,GO:0035107,GO:0035108,GO:0035112,GO:0035113,GO:0035114,GO:0035115,GO:0035116,GO:0035120,GO:0035136,GO:0035137,GO:0035141,GO:0035143,GO:0035148,GO:0035161,GO:0035215,GO:0035217,GO:0035218,GO:0035220,GO:0035221,GO:0035222,GO:0035224,GO:0035231,GO:0035232,GO:0035239,GO:0035264,GO:0035265,GO:0035270,GO:0035272,GO:0035277,GO:0035282,GO:0035287,GO:0035288,GO:0035289,GO:0035290,GO:0035295,GO:0035303,GO:0035306,GO:0035556,GO:0035803,GO:0035988,GO:0036293,GO:0036477,GO:0040007,GO:0040008,GO:0040011,GO:0040012,GO:0040013,GO:0040017,GO:0040019,GO:0040036,GO:0042060,GO:0042063,GO:0042078,GO:0042102,GO:0042110,GO:0042127,GO:0042129,GO:0042130,GO:0042176,GO:0042177,GO:0042221,GO:0042303,GO:0042306,GO:0042307,GO:0042330,GO:0042445,GO:0042461,GO:0042462,GO:0042475,GO:0042476,GO:0042481,GO:0042493,GO:0042592,GO:0042633,GO:0042692,GO:0042693,GO:0042694,GO:0042706,GO:0042733,GO:0042981,GO:0042995,GO:0043005,GO:0043009,GO:0043010,GO:0043025,GO:0043062,GO:0043066,GO:0043067,GO:0043069,GO:0043085,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043233,GO:0043236,GO:0043237,GO:0043368,GO:0043369,GO:0043383,GO:0043473,GO:0043583,GO:0043586,GO:0043587,GO:0043588,GO:0043704,GO:0043900,GO:0043902,GO:0044085,GO:0044093,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044297,GO:0044421,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044432,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044456,GO:0044463,GO:0044464,GO:0044703,GO:0045058,GO:0045059,GO:0045060,GO:0045061,GO:0045103,GO:0045104,GO:0045109,GO:0045121,GO:0045137,GO:0045165,GO:0045168,GO:0045202,GO:0045321,GO:0045445,GO:0045446,GO:0045453,GO:0045464,GO:0045465,GO:0045471,GO:0045494,GO:0045580,GO:0045581,GO:0045582,GO:0045595,GO:0045596,GO:0045597,GO:0045619,GO:0045620,GO:0045621,GO:0045664,GO:0045665,GO:0045666,GO:0045667,GO:0045669,GO:0045685,GO:0045687,GO:0045743,GO:0045765,GO:0045766,GO:0045778,GO:0045785,GO:0045844,GO:0045861,GO:0045880,GO:0045892,GO:0045893,GO:0045926,GO:0045934,GO:0045935,GO:0045937,GO:0045944,GO:0045995,GO:0046530,GO:0046532,GO:0046534,GO:0046546,GO:0046552,GO:0046620,GO:0046634,GO:0046635,GO:0046636,GO:0046637,GO:0046638,GO:0046639,GO:0046649,GO:0046661,GO:0046677,GO:0046822,GO:0046824,GO:0046849,GO:0046872,GO:0046890,GO:0046914,GO:0048018,GO:0048048,GO:0048066,GO:0048070,GO:0048073,GO:0048074,GO:0048086,GO:0048099,GO:0048100,GO:0048103,GO:0048232,GO:0048368,GO:0048468,GO:0048469,GO:0048477,GO:0048513,GO:0048514,GO:0048515,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0048534,GO:0048538,GO:0048546,GO:0048557,GO:0048562,GO:0048563,GO:0048565,GO:0048566,GO:0048568,GO:0048569,GO:0048583,GO:0048584,GO:0048585,GO:0048588,GO:0048589,GO:0048592,GO:0048593,GO:0048596,GO:0048598,GO:0048608,GO:0048609,GO:0048617,GO:0048618,GO:0048634,GO:0048636,GO:0048638,GO:0048640,GO:0048641,GO:0048643,GO:0048645,GO:0048646,GO:0048663,GO:0048665,GO:0048666,GO:0048667,GO:0048678,GO:0048699,GO:0048701,GO:0048702,GO:0048703,GO:0048704,GO:0048705,GO:0048706,GO:0048707,GO:0048708,GO:0048709,GO:0048713,GO:0048714,GO:0048729,GO:0048730,GO:0048731,GO:0048732,GO:0048736,GO:0048737,GO:0048741,GO:0048745,GO:0048747,GO:0048749,GO:0048754,GO:0048762,GO:0048771,GO:0048793,GO:0048794,GO:0048795,GO:0048806,GO:0048808,GO:0048812,GO:0048839,GO:0048856,GO:0048858,GO:0048859,GO:0048863,GO:0048864,GO:0048869,GO:0048870,GO:0048871,GO:0048872,GO:0048873,GO:0048877,GO:0050670,GO:0050671,GO:0050672,GO:0050673,GO:0050678,GO:0050679,GO:0050767,GO:0050768,GO:0050769,GO:0050789,GO:0050790,GO:0050793,GO:0050794,GO:0050810,GO:0050817,GO:0050840,GO:0050863,GO:0050865,GO:0050866,GO:0050867,GO:0050868,GO:0050870,GO:0050878,GO:0050896,GO:0050918,GO:0050920,GO:0050921,GO:0051049,GO:0051050,GO:0051051,GO:0051090,GO:0051091,GO:0051093,GO:0051094,GO:0051128,GO:0051130,GO:0051146,GO:0051147,GO:0051148,GO:0051149,GO:0051150,GO:0051151,GO:0051152,GO:0051153,GO:0051155,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051173,GO:0051174,GO:0051179,GO:0051216,GO:0051222,GO:0051223,GO:0051234,GO:0051239,GO:0051240,GO:0051241,GO:0051246,GO:0051248,GO:0051249,GO:0051250,GO:0051251,GO:0051252,GO:0051253,GO:0051254,GO:0051270,GO:0051271,GO:0051272,GO:0051301,GO:0051302,GO:0051336,GO:0051345,GO:0051604,GO:0051641,GO:0051674,GO:0051704,GO:0051716,GO:0051726,GO:0051781,GO:0051960,GO:0051961,GO:0051962,GO:0055001,GO:0055002,GO:0055034,GO:0055123,GO:0060020,GO:0060021,GO:0060041,GO:0060042,GO:0060059,GO:0060070,GO:0060173,GO:0060174,GO:0060219,GO:0060220,GO:0060249,GO:0060255,GO:0060284,GO:0060322,GO:0060323,GO:0060326,GO:0060341,GO:0060348,GO:0060349,GO:0060350,GO:0060351,GO:0060405,GO:0060406,GO:0060425,GO:0060428,GO:0060429,GO:0060438,GO:0060439,GO:0060441,GO:0060442,GO:0060445,GO:0060447,GO:0060458,GO:0060459,GO:0060462,GO:0060463,GO:0060484,GO:0060485,GO:0060512,GO:0060516,GO:0060523,GO:0060537,GO:0060538,GO:0060541,GO:0060548,GO:0060560,GO:0060562,GO:0060573,GO:0060579,GO:0060581,GO:0060591,GO:0060602,GO:0060605,GO:0060662,GO:0060664,GO:0060675,GO:0060684,GO:0060685,GO:0060688,GO:0060736,GO:0060737,GO:0060738,GO:0060740,GO:0060768,GO:0060769,GO:0060782,GO:0060783,GO:0060785,GO:0060786,GO:0060828,GO:0060840,GO:0060900,GO:0060914,GO:0060916,GO:0060956,GO:0060976,GO:0060977,GO:0060979,GO:0060993,GO:0061008,GO:0061035,GO:0061037,GO:0061041,GO:0061053,GO:0061061,GO:0061074,GO:0061075,GO:0061136,GO:0061138,GO:0061181,GO:0061182,GO:0061189,GO:0061190,GO:0061196,GO:0061197,GO:0061198,GO:0061326,GO:0061333,GO:0061351,GO:0061371,GO:0061448,GO:0061458,GO:0061525,GO:0061564,GO:0065001,GO:0065007,GO:0065008,GO:0065009,GO:0070013,GO:0070201,GO:0070382,GO:0070444,GO:0070445,GO:0070447,GO:0070482,GO:0070663,GO:0070664,GO:0070665,GO:0070727,GO:0070887,GO:0071241,GO:0071248,GO:0071285,GO:0071542,GO:0071679,GO:0071704,GO:0071840,GO:0071944,GO:0072001,GO:0072006,GO:0072009,GO:0072028,GO:0072073,GO:0072074,GO:0072075,GO:0072078,GO:0072080,GO:0072088,GO:0072089,GO:0072091,GO:0072111,GO:0072135,GO:0072136,GO:0072163,GO:0072164,GO:0072171,GO:0072175,GO:0072199,GO:0072203,GO:0072358,GO:0072359,GO:0072498,GO:0080090,GO:0080134,GO:0085029,GO:0090087,GO:0090090,GO:0090092,GO:0090101,GO:0090130,GO:0090132,GO:0090136,GO:0090183,GO:0090184,GO:0090185,GO:0090269,GO:0090287,GO:0090288,GO:0090316,GO:0090370,GO:0090596,GO:0090598,GO:0097065,GO:0097190,GO:0097264,GO:0097305,GO:0097367,GO:0097421,GO:0097435,GO:0097447,GO:0097458,GO:0097485,GO:0097708,GO:0098589,GO:0098609,GO:0098657,GO:0098772,GO:0098773,GO:0098793,GO:0098805,GO:0098857,GO:0098868,GO:0099503,GO:0120025,GO:0120031,GO:0120036,GO:0120038,GO:0120039,GO:0198738,GO:1900107,GO:1900145,GO:1900175,GO:1900180,GO:1900182,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901214,GO:1901215,GO:1901342,GO:1901360,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901698,GO:1901700,GO:1901799,GO:1901861,GO:1901862,GO:1901863,GO:1902105,GO:1902106,GO:1902107,GO:1902679,GO:1902680,GO:1902692,GO:1902733,GO:1902738,GO:1902866,GO:1902868,GO:1903010,GO:1903034,GO:1903037,GO:1903038,GO:1903039,GO:1903041,GO:1903042,GO:1903050,GO:1903051,GO:1903320,GO:1903321,GO:1903362,GO:1903363,GO:1903506,GO:1903507,GO:1903508,GO:1903670,GO:1903672,GO:1903706,GO:1903707,GO:1903708,GO:1903827,GO:1903829,GO:1904018,GO:1904338,GO:1904339,GO:1904589,GO:1904591,GO:1904888,GO:1904951,GO:1905114,GO:1905178,GO:1905327,GO:1905330,GO:1905899,GO:1905900,GO:1905901,GO:1905952,GO:1905953,GO:2000008,GO:2000010,GO:2000026,GO:2000027,GO:2000058,GO:2000059,GO:2000061,GO:2000062,GO:2000063,GO:2000112,GO:2000113,GO:2000145,GO:2000146,GO:2000147,GO:2000177,GO:2000179,GO:2000223,GO:2000241,GO:2000243,GO:2000274,GO:2000356,GO:2000357,GO:2000358,GO:2000380,GO:2000648,GO:2000729,GO:2000826,GO:2001026,GO:2001028,GO:2001053,GO:2001054,GO:2001141
Evalue6.48e-13
EggNOG OGsKOG3638@1|root,KOG3638@2759|Eukaryota,38EJM@33154|Opisthokonta,3BA86@33208|Metazoa,3CRIQ@33213|Bilateria,41UYV@6656|Arthropoda,3SHUU@50557|Insecta,46EDB@7399|Hymenoptera
Descriptionhedgehog protein
COG categoryT
BRITEko00000,ko00001,ko00002,ko00536,ko01002
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra10210Ggra10210Gracilaria gracilis GNS1m malegenetig00000016_pilon 97041..98825 +


The following start_codon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra10210.t1.start1Ggra10210.t1.start1Gracilaria gracilis GNS1m malestart_codontig00000016_pilon 97041..97043 +


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra10210.t1.CDS1Ggra10210.t1.CDS1Gracilaria gracilis GNS1m maleCDStig00000016_pilon 97041..98825 +


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra10210.t1.exon1Ggra10210.t1.exon1Gracilaria gracilis GNS1m maleexontig00000016_pilon 97041..98825 +


The following stop_codon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra10210.t1.stop1Ggra10210.t1.stop1Gracilaria gracilis GNS1m malestop_codontig00000016_pilon 98823..98825 +


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra10210.t1Ggra10210.t1Gracilaria gracilis GNS1m malepolypeptidetig00000016_pilon 97041..98825 +


Sequences
The following sequences are available for this feature:

mRNA sequence

>Ggra10210.t1 ID=Ggra10210.t1|Name=Ggra10210.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=mRNA|length=595bp
MPIATACLLVLVLSCALVSPALCVPPLSRARTTLPVTGRIATYDDISHTF
NLVYAVTDSCPSSVTFGEFTNDERQFPILPAEDITEDGSECSGDGPLNFV
TELTVNEPGLLEALQLQPFRDAISENGNADALINSPVTNDLLVGWHSGTR
TCASLSYPTQTIYFIIREDRDYKITFRRSDSTNRVTIPPDLRTLLIVAPQ
NQICLLVDKTTNPEQDVTLLTTFSNGTETSSQLTTAGVVALTPPSQSTSG
DDDGEDGGDASGGEDTSGGEDTSGGEDISGGEDTGSAAGSADDDSDESDT
VAAPASAAPSAEPSASPSASALPSASAVPSVASVLAPVAPSPSDFGSLVA
SPSDFGTLVASPSGAISPAPSFSPFTSVVPVASAVPPGAIGGISVEEDVD
GTSDEDDGSACFPASAVVRSERGDVAMHEIEIGDRVRTGEGLSDVVLFTH
RRRFGRFEFVRLTVKSGRELTVSAGHYVYKQNGDLTAASSVVVGDVLRMA
ERSEDGSVVRIEKVHESGLYNPQTEDGSIVVNGFVASTYTTAVEPKLAHM
ALLLPVRSMYKVWRWPVEQLSFMLQEGSRFARWMPRGPCVIGAV*
back to top

spliced messenger RNA

>Ggra10210.t1 ID=Ggra10210.t1|Name=Ggra10210.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=mRNA|length=1785bp|location=Sequence derived from alignment at tig00000016_pilon:97041..98825+ (Gracilaria gracilis GNS1m male)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.  
ATGCCCATCGCAACCGCTTGTCTGCTTGTTCTCGTGCTCAGTTGCGCGCT
TGTCTCCCCCGCATTGTGCGTACCGCCACTTTCACGTGCTCGCACTACAC
TTCCCGTCACTGGTCGCATCGCCACGTACGATGATATCAGCCACACCTTC
AACCTGGTGTACGCCGTCACAGACTCCTGCCCGTCCTCAGTAACCTTTGG
TGAGTTCACCAATGATGAACGTCAATTCCCCATCTTGCCCGCGGAAGACA
TCACGGAAGATGGCTCAGAATGTTCTGGCGACGGTCCACTCAACTTTGTC
ACCGAGCTCACAGTCAACGAACCAGGCTTGTTGGAAGCTCTTCAGCTACA
ACCATTCCGAGATGCCATCAGCGAAAACGGAAACGCAGACGCCTTGATCA
ACAGCCCAGTCACCAATGATTTACTTGTCGGGTGGCATAGTGGAACACGC
ACTTGTGCATCTCTTTCGTACCCCACGCAAACCATCTACTTCATCATTCG
GGAAGACAGAGACTACAAGATTACCTTCAGAAGATCGGATTCGACAAATC
GGGTTACCATTCCACCGGATCTTCGTACCTTACTTATTGTGGCGCCTCAG
AATCAAATCTGTCTCCTGGTGGACAAGACCACCAATCCGGAGCAGGATGT
CACTCTGCTCACAACATTTTCGAATGGCACCGAGACCAGTTCGCAGCTCA
CAACGGCCGGCGTTGTCGCACTCACACCACCAAGCCAGTCCACATCCGGT
GATGATGATGGTGAAGACGGAGGAGACGCCAGCGGAGGAGAAGACACCAG
CGGAGGAGAAGACACCAGCGGAGGAGAAGACATCAGCGGAGGAGAGGACA
CGGGTTCCGCCGCAGGCAGTGCCGACGATGATTCGGATGAAAGCGACACC
GTAGCTGCGCCCGCATCTGCGGCACCATCGGCGGAACCAAGTGCGAGTCC
AAGCGCTTCAGCTCTGCCGAGCGCCAGTGCAGTTCCTTCGGTAGCATCCG
TATTAGCGCCAGTGGCGCCGTCGCCCAGTGACTTTGGCAGTCTGGTGGCG
TCGCCAAGTGACTTTGGCACTCTGGTGGCGTCGCCCAGCGGAGCCATATC
TCCGGCGCCGTCGTTCTCGCCGTTCACCAGCGTTGTTCCGGTGGCAAGTG
CGGTTCCGCCGGGCGCGATTGGGGGCATTTCCGTTGAGGAAGATGTGGAC
GGTACGTCGGATGAAGACGATGGTTCGGCTTGTTTCCCGGCTTCGGCTGT
GGTGCGCTCGGAACGCGGCGATGTTGCGATGCATGAGATTGAGATTGGCG
ATCGCGTGAGGACGGGTGAGGGATTGTCTGATGTGGTGCTGTTCACGCAT
CGGCGGAGATTTGGAAGATTCGAGTTTGTGAGATTGACGGTGAAGAGCGG
ACGGGAGCTGACGGTGTCGGCAGGCCATTATGTGTATAAGCAGAACGGAG
ATCTGACGGCTGCGTCTTCCGTGGTGGTCGGGGACGTTCTGCGCATGGCT
GAGCGCTCTGAGGATGGAAGCGTGGTGAGGATTGAAAAGGTGCACGAGAG
CGGATTGTACAACCCGCAGACTGAGGATGGAAGTATTGTGGTGAACGGGT
TCGTGGCATCGACTTACACAACGGCGGTGGAGCCGAAGCTGGCGCACATG
GCGCTGTTGCTGCCCGTGCGTTCGATGTACAAGGTTTGGAGGTGGCCTGT
GGAACAACTGAGCTTCATGTTGCAGGAGGGGAGCCGATTTGCACGATGGA
TGCCGAGGGGGCCGTGTGTGATTGGCGCGGTGTAG
back to top

protein sequence of Ggra10210.t1

>Ggra10210.t1 ID=Ggra10210.t1|Name=Ggra10210.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=polypeptide|length=595bp
MPIATACLLVLVLSCALVSPALCVPPLSRARTTLPVTGRIATYDDISHTF
NLVYAVTDSCPSSVTFGEFTNDERQFPILPAEDITEDGSECSGDGPLNFV
TELTVNEPGLLEALQLQPFRDAISENGNADALINSPVTNDLLVGWHSGTR
TCASLSYPTQTIYFIIREDRDYKITFRRSDSTNRVTIPPDLRTLLIVAPQ
NQICLLVDKTTNPEQDVTLLTTFSNGTETSSQLTTAGVVALTPPSQSTSG
DDDGEDGGDASGGEDTSGGEDTSGGEDISGGEDTGSAAGSADDDSDESDT
VAAPASAAPSAEPSASPSASALPSASAVPSVASVLAPVAPSPSDFGSLVA
SPSDFGTLVASPSGAISPAPSFSPFTSVVPVASAVPPGAIGGISVEEDVD
GTSDEDDGSACFPASAVVRSERGDVAMHEIEIGDRVRTGEGLSDVVLFTH
RRRFGRFEFVRLTVKSGRELTVSAGHYVYKQNGDLTAASSVVVGDVLRMA
ERSEDGSVVRIEKVHESGLYNPQTEDGSIVVNGFVASTYTTAVEPKLAHM
ALLLPVRSMYKVWRWPVEQLSFMLQEGSRFARWMPRGPCVIGAV*
back to top

mRNA from alignment at tig00000016_pilon:97041..98825+

Legend: start_codonpolypeptideCDSexonstop_codon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Ggra10210.t1 ID=Ggra10210.t1|Name=Ggra10210.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=mRNA|length=1785bp|location=Sequence derived from alignment at tig00000016_pilon:97041..98825+ (Gracilaria gracilis GNS1m male)
ATGCCCATCGCAACCGCTTGTCTGCTTGTTCTCGTGCTCAGTTGCGCGCT
TGTCTCCCCCGCATTGTGCGTACCGCCACTTTCACGTGCTCGCACTACAC
TTCCCGTCACTGGTCGCATCGCCACGTACGATGATATCAGCCACACCTTC
AACCTGGTGTACGCCGTCACAGACTCCTGCCCGTCCTCAGTAACCTTTGG
TGAGTTCACCAATGATGAACGTCAATTCCCCATCTTGCCCGCGGAAGACA
TCACGGAAGATGGCTCAGAATGTTCTGGCGACGGTCCACTCAACTTTGTC
ACCGAGCTCACAGTCAACGAACCAGGCTTGTTGGAAGCTCTTCAGCTACA
ACCATTCCGAGATGCCATCAGCGAAAACGGAAACGCAGACGCCTTGATCA
ACAGCCCAGTCACCAATGATTTACTTGTCGGGTGGCATAGTGGAACACGC
ACTTGTGCATCTCTTTCGTACCCCACGCAAACCATCTACTTCATCATTCG
GGAAGACAGAGACTACAAGATTACCTTCAGAAGATCGGATTCGACAAATC
GGGTTACCATTCCACCGGATCTTCGTACCTTACTTATTGTGGCGCCTCAG
AATCAAATCTGTCTCCTGGTGGACAAGACCACCAATCCGGAGCAGGATGT
CACTCTGCTCACAACATTTTCGAATGGCACCGAGACCAGTTCGCAGCTCA
CAACGGCCGGCGTTGTCGCACTCACACCACCAAGCCAGTCCACATCCGGT
GATGATGATGGTGAAGACGGAGGAGACGCCAGCGGAGGAGAAGACACCAG
CGGAGGAGAAGACACCAGCGGAGGAGAAGACATCAGCGGAGGAGAGGACA
CGGGTTCCGCCGCAGGCAGTGCCGACGATGATTCGGATGAAAGCGACACC
GTAGCTGCGCCCGCATCTGCGGCACCATCGGCGGAACCAAGTGCGAGTCC
AAGCGCTTCAGCTCTGCCGAGCGCCAGTGCAGTTCCTTCGGTAGCATCCG
TATTAGCGCCAGTGGCGCCGTCGCCCAGTGACTTTGGCAGTCTGGTGGCG
TCGCCAAGTGACTTTGGCACTCTGGTGGCGTCGCCCAGCGGAGCCATATC
TCCGGCGCCGTCGTTCTCGCCGTTCACCAGCGTTGTTCCGGTGGCAAGTG
CGGTTCCGCCGGGCGCGATTGGGGGCATTTCCGTTGAGGAAGATGTGGAC
GGTACGTCGGATGAAGACGATGGTTCGGCTTGTTTCCCGGCTTCGGCTGT
GGTGCGCTCGGAACGCGGCGATGTTGCGATGCATGAGATTGAGATTGGCG
ATCGCGTGAGGACGGGTGAGGGATTGTCTGATGTGGTGCTGTTCACGCAT
CGGCGGAGATTTGGAAGATTCGAGTTTGTGAGATTGACGGTGAAGAGCGG
ACGGGAGCTGACGGTGTCGGCAGGCCATTATGTGTATAAGCAGAACGGAG
ATCTGACGGCTGCGTCTTCCGTGGTGGTCGGGGACGTTCTGCGCATGGCT
GAGCGCTCTGAGGATGGAAGCGTGGTGAGGATTGAAAAGGTGCACGAGAG
CGGATTGTACAACCCGCAGACTGAGGATGGAAGTATTGTGGTGAACGGGT
TCGTGGCATCGACTTACACAACGGCGGTGGAGCCGAAGCTGGCGCACATG
GCGCTGTTGCTGCCCGTGCGTTCGATGTACAAGGTTTGGAGGTGGCCTGT
GGAACAACTGAGCTTCATGTTGCAGGAGGGGAGCCGATTTGCACGATGGA
TGCCGAGGGGGCCGTGTGTGATTGGCGCGGTGTAG
back to top

Coding sequence (CDS) from alignment at tig00000016_pilon:97041..98825+

>Ggra10210.t1 ID=Ggra10210.t1|Name=Ggra10210.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=CDS|length=1785bp|location=Sequence derived from alignment at tig00000016_pilon:97041..98825+ (Gracilaria gracilis GNS1m male)
ATGCCCATCGCAACCGCTTGTCTGCTTGTTCTCGTGCTCAGTTGCGCGCT
TGTCTCCCCCGCATTGTGCGTACCGCCACTTTCACGTGCTCGCACTACAC
TTCCCGTCACTGGTCGCATCGCCACGTACGATGATATCAGCCACACCTTC
AACCTGGTGTACGCCGTCACAGACTCCTGCCCGTCCTCAGTAACCTTTGG
TGAGTTCACCAATGATGAACGTCAATTCCCCATCTTGCCCGCGGAAGACA
TCACGGAAGATGGCTCAGAATGTTCTGGCGACGGTCCACTCAACTTTGTC
ACCGAGCTCACAGTCAACGAACCAGGCTTGTTGGAAGCTCTTCAGCTACA
ACCATTCCGAGATGCCATCAGCGAAAACGGAAACGCAGACGCCTTGATCA
ACAGCCCAGTCACCAATGATTTACTTGTCGGGTGGCATAGTGGAACACGC
ACTTGTGCATCTCTTTCGTACCCCACGCAAACCATCTACTTCATCATTCG
GGAAGACAGAGACTACAAGATTACCTTCAGAAGATCGGATTCGACAAATC
GGGTTACCATTCCACCGGATCTTCGTACCTTACTTATTGTGGCGCCTCAG
AATCAAATCTGTCTCCTGGTGGACAAGACCACCAATCCGGAGCAGGATGT
CACTCTGCTCACAACATTTTCGAATGGCACCGAGACCAGTTCGCAGCTCA
CAACGGCCGGCGTTGTCGCACTCACACCACCAAGCCAGTCCACATCCGGT
GATGATGATGGTGAAGACGGAGGAGACGCCAGCGGAGGAGAAGACACCAG
CGGAGGAGAAGACACCAGCGGAGGAGAAGACATCAGCGGAGGAGAGGACA
CGGGTTCCGCCGCAGGCAGTGCCGACGATGATTCGGATGAAAGCGACACC
GTAGCTGCGCCCGCATCTGCGGCACCATCGGCGGAACCAAGTGCGAGTCC
AAGCGCTTCAGCTCTGCCGAGCGCCAGTGCAGTTCCTTCGGTAGCATCCG
TATTAGCGCCAGTGGCGCCGTCGCCCAGTGACTTTGGCAGTCTGGTGGCG
TCGCCAAGTGACTTTGGCACTCTGGTGGCGTCGCCCAGCGGAGCCATATC
TCCGGCGCCGTCGTTCTCGCCGTTCACCAGCGTTGTTCCGGTGGCAAGTG
CGGTTCCGCCGGGCGCGATTGGGGGCATTTCCGTTGAGGAAGATGTGGAC
GGTACGTCGGATGAAGACGATGGTTCGGCTTGTTTCCCGGCTTCGGCTGT
GGTGCGCTCGGAACGCGGCGATGTTGCGATGCATGAGATTGAGATTGGCG
ATCGCGTGAGGACGGGTGAGGGATTGTCTGATGTGGTGCTGTTCACGCAT
CGGCGGAGATTTGGAAGATTCGAGTTTGTGAGATTGACGGTGAAGAGCGG
ACGGGAGCTGACGGTGTCGGCAGGCCATTATGTGTATAAGCAGAACGGAG
ATCTGACGGCTGCGTCTTCCGTGGTGGTCGGGGACGTTCTGCGCATGGCT
GAGCGCTCTGAGGATGGAAGCGTGGTGAGGATTGAAAAGGTGCACGAGAG
CGGATTGTACAACCCGCAGACTGAGGATGGAAGTATTGTGGTGAACGGGT
TCGTGGCATCGACTTACACAACGGCGGTGGAGCCGAAGCTGGCGCACATG
GCGCTGTTGCTGCCCGTGCGTTCGATGTACAAGGTTTGGAGGTGGCCTGT
GGAACAACTGAGCTTCATGTTGCAGGAGGGGAGCCGATTTGCACGATGGA
TGCCGAGGGGGCCGTGTGTGATTGGCGCGGTGTAG
back to top