Gchil1426.t1 (mRNA) Gracilaria chilensis NLEC103_M9 male

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Overview


Name	Gchil1426.t1
Unique Name	Gchil1426.t1
Type	mRNA
Organism	Gracilaria chilensis NLEC103_M9 male (Gracilaria chilensis NLEC103_M9 male)
Sequence length	285

Alignments

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
tig00004414_pilon	contig	tig00004414_pilon:999927..1000781 -

Analyses

This mRNA is derived from or has results from the following analyses


Analysis Name	Date Performed
Gracilaria chilensis NLEC103_M9 male OGS1.0	2022-05-09

Properties


Property Name	Value
Seed ortholog	5762.XP_002681449.1
Preferred name	CSNK1E
PFAMs	Pkinase
Max annot lvl	2759\|Eukaryota
KEGG ko	ko:K02218,ko:K08959,ko:K08960,ko:K14758
KEGG Pathway	ko03008,ko04011,ko04068,ko04310,ko04340,ko04341,ko04390,ko04391,ko04392,ko04540,ko04710,ko04711,map03008,map04011,map04068,map04310,map04340,map04341,map04390,map04391,map04392,map04540,map04710,map04711
GOs	GO:0000003,GO:0000018,GO:0000045,GO:0000086,GO:0000139,GO:0000166,GO:0000226,GO:0000228,GO:0000278,GO:0000280,GO:0000407,GO:0000775,GO:0000776,GO:0000777,GO:0000779,GO:0000793,GO:0001558,GO:0001654,GO:0001736,GO:0001737,GO:0001738,GO:0001745,GO:0001932,GO:0001933,GO:0001934,GO:0002009,GO:0002097,GO:0002098,GO:0002165,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004672,GO:0004674,GO:0004713,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005694,GO:0005737,GO:0005793,GO:0005794,GO:0005813,GO:0005815,GO:0005816,GO:0005819,GO:0005829,GO:0005856,GO:0005874,GO:0005876,GO:0005886,GO:0005933,GO:0005934,GO:0005935,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006282,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006464,GO:0006468,GO:0006725,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006810,GO:0006888,GO:0006897,GO:0006900,GO:0006901,GO:0006903,GO:0006906,GO:0006914,GO:0006950,GO:0006974,GO:0006996,GO:0007010,GO:0007017,GO:0007020,GO:0007030,GO:0007033,GO:0007049,GO:0007051,GO:0007059,GO:0007127,GO:0007129,GO:0007154,GO:0007163,GO:0007164,GO:0007165,GO:0007166,GO:0007267,GO:0007275,GO:0007346,GO:0007399,GO:0007423,GO:0007444,GO:0007446,GO:0007472,GO:0007476,GO:0007552,GO:0007555,GO:0007560,GO:0007562,GO:0007610,GO:0007622,GO:0007623,GO:0007626,GO:0008033,GO:0008062,GO:0008064,GO:0008104,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008360,GO:0008544,GO:0008608,GO:0009056,GO:0009314,GO:0009410,GO:0009416,GO:0009451,GO:0009628,GO:0009653,GO:0009719,GO:0009791,GO:0009886,GO:0009887,GO:0009888,GO:0009892,GO:0009893,GO:0009894,GO:0009896,GO:0009913,GO:0009966,GO:0009967,GO:0009968,GO:0009987,GO:0010033,GO:0010243,GO:0010256,GO:0010389,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010520,GO:0010562,GO:0010563,GO:0010564,GO:0010604,GO:0010605,GO:0010638,GO:0010646,GO:0010647,GO:0010648,GO:0010720,GO:0010817,GO:0010845,GO:0010941,GO:0012505,GO:0014070,GO:0015630,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016050,GO:0016055,GO:0016070,GO:0016192,GO:0016236,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0017076,GO:0018105,GO:0018108,GO:0018193,GO:0018209,GO:0018212,GO:0019219,GO:0019220,GO:0019222,GO:0019538,GO:0022008,GO:0022402,GO:0022406,GO:0022414,GO:0022603,GO:0022604,GO:0022607,GO:0022613,GO:0023051,GO:0023052,GO:0023056,GO:0023057,GO:0030030,GO:0030031,GO:0030100,GO:0030111,GO:0030154,GO:0030162,GO:0030177,GO:0030178,GO:0030182,GO:0030242,GO:0030307,GO:0030424,GO:0030426,GO:0030427,GO:0030431,GO:0030534,GO:0030554,GO:0030832,GO:0030833,GO:0030838,GO:0030855,GO:0030999,GO:0031090,GO:0031109,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031325,GO:0031329,GO:0031331,GO:0031334,GO:0031399,GO:0031400,GO:0031401,GO:0031974,GO:0031981,GO:0031984,GO:0032091,GO:0032268,GO:0032269,GO:0032270,GO:0032271,GO:0032273,GO:0032368,GO:0032386,GO:0032434,GO:0032436,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032535,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032879,GO:0032880,GO:0032922,GO:0032956,GO:0032970,GO:0032991,GO:0033036,GO:0033043,GO:0033116,GO:0033157,GO:0033218,GO:0033267,GO:0033365,GO:0033551,GO:0033554,GO:0034067,GO:0034248,GO:0034250,GO:0034470,GO:0034613,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034660,GO:0035107,GO:0035114,GO:0035120,GO:0035220,GO:0035239,GO:0035265,GO:0035295,GO:0035315,GO:0035316,GO:0035317,GO:0035639,GO:0036094,GO:0036211,GO:0036477,GO:0038083,GO:0040007,GO:0040008,GO:0040020,GO:0042067,GO:0042176,GO:0042220,GO:0042221,GO:0042254,GO:0042273,GO:0042274,GO:0042277,GO:0042306,GO:0042325,GO:0042326,GO:0042327,GO:0042493,GO:0042752,GO:0042981,GO:0042995,GO:0043005,GO:0043025,GO:0043066,GO:0043067,GO:0043069,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043233,GO:0043254,GO:0043279,GO:0043393,GO:0043412,GO:0043933,GO:0044057,GO:0044060,GO:0044085,GO:0044087,GO:0044089,GO:0044092,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044297,GO:0044380,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044427,GO:0044428,GO:0044430,GO:0044431,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044463,GO:0044464,GO:0044770,GO:0044772,GO:0044782,GO:0044839,GO:0045132,GO:0045143,GO:0045475,GO:0045595,GO:0045597,GO:0045664,GO:0045666,GO:0045732,GO:0045787,GO:0045807,GO:0045836,GO:0045862,GO:0045911,GO:0045927,GO:0045935,GO:0045936,GO:0045937,GO:0046483,GO:0046777,GO:0046785,GO:0046822,GO:0046883,GO:0046907,GO:0048148,GO:0048193,GO:0048194,GO:0048199,GO:0048207,GO:0048208,GO:0048259,GO:0048260,GO:0048280,GO:0048284,GO:0048285,GO:0048471,GO:0048511,GO:0048512,GO:0048513,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0048563,GO:0048569,GO:0048583,GO:0048584,GO:0048585,GO:0048589,GO:0048592,GO:0048699,GO:0048707,GO:0048729,GO:0048731,GO:0048736,GO:0048737,GO:0048749,GO:0048856,GO:0048869,GO:0050767,GO:0050769,GO:0050789,GO:0050793,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051046,GO:0051049,GO:0051050,GO:0051052,GO:0051054,GO:0051094,GO:0051098,GO:0051100,GO:0051128,GO:0051130,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051173,GO:0051174,GO:0051179,GO:0051223,GO:0051225,GO:0051234,GO:0051239,GO:0051240,GO:0051246,GO:0051247,GO:0051248,GO:0051258,GO:0051276,GO:0051302,GO:0051316,GO:0051321,GO:0051445,GO:0051446,GO:0051455,GO:0051493,GO:0051495,GO:0051640,GO:0051641,GO:0051648,GO:0051649,GO:0051650,GO:0051656,GO:0051716,GO:0051726,GO:0051781,GO:0051783,GO:0051785,GO:0051960,GO:0051962,GO:0060070,GO:0060255,GO:0060271,GO:0060284,GO:0060341,GO:0060359,GO:0060429,GO:0060548,GO:0060562,GO:0060627,GO:0060628,GO:0060631,GO:0060828,GO:0060903,GO:0061024,GO:0061025,GO:0061136,GO:0061512,GO:0061919,GO:0061982,GO:0065003,GO:0065007,GO:0065008,GO:0065009,GO:0070013,GO:0070192,GO:0070201,GO:0070727,GO:0070848,GO:0070887,GO:0070925,GO:0071214,GO:0071310,GO:0071363,GO:0071478,GO:0071482,GO:0071495,GO:0071539,GO:0071684,GO:0071704,GO:0071840,GO:0071944,GO:0072347,GO:0072698,GO:0080090,GO:0080134,GO:0080135,GO:0090066,GO:0090068,GO:0090087,GO:0090114,GO:0090174,GO:0090263,GO:0090304,GO:0090596,GO:0097159,GO:0097367,GO:0097435,GO:0097458,GO:0097711,GO:0098588,GO:0098657,GO:0098687,GO:0098791,GO:0098813,GO:0099080,GO:0099081,GO:0099512,GO:0099513,GO:0104004,GO:0110053,GO:0120025,GO:0120031,GO:0120036,GO:0120038,GO:0140013,GO:0140056,GO:0140096,GO:0150034,GO:0198738,GO:1900180,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901698,GO:1901700,GO:1901800,GO:1901987,GO:1901990,GO:1902003,GO:1902004,GO:1902749,GO:1902903,GO:1902905,GO:1902991,GO:1902993,GO:1903046,GO:1903047,GO:1903050,GO:1903052,GO:1903362,GO:1903364,GO:1903530,GO:1903827,GO:1904338,GO:1904340,GO:1904589,GO:1904956,GO:1904958,GO:1905037,GO:1905114,GO:1905424,GO:1905426,GO:1905508,GO:1905515,GO:1905952,GO:1990089,GO:1990090,GO:1990904,GO:2000026,GO:2000050,GO:2000052,GO:2000058,GO:2000060,GO:2000241,GO:2000243,GO:2000369,GO:2000370,GO:2000831,GO:2001020,GO:2001159
Evalue	1.49e-13
EggNOG OGs	KOG1164@1\|root,KOG1164@2759\|Eukaryota
EC	2.7.11.1
Description	protein kinase activity
COG category	T
BRITE	ko00000,ko00001,ko01000,ko01001,ko03009,ko03016,ko03036

Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
Gchil1426	Gchil1426	Gracilaria chilensis NLEC103_M9 male	gene	tig00004414_pilon 999927..1000781 -

The following stop_codon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
Gchil1426.t1.stop1	Gchil1426.t1.stop1	Gracilaria chilensis NLEC103_M9 male	stop_codon	tig00004414_pilon 999927..999929 -

The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
Gchil1426.t1.CDS1	Gchil1426.t1.CDS1	Gracilaria chilensis NLEC103_M9 male	CDS	tig00004414_pilon 999927..1000781 -

The following exon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
Gchil1426.t1.exon1	Gchil1426.t1.exon1	Gracilaria chilensis NLEC103_M9 male	exon	tig00004414_pilon 999927..1000781 -

The following start_codon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
Gchil1426.t1.start1	Gchil1426.t1.start1	Gracilaria chilensis NLEC103_M9 male	start_codon	tig00004414_pilon 1000779..1000781 -

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
Gchil1426.t1	Gchil1426.t1	Gracilaria chilensis NLEC103_M9 male	polypeptide	tig00004414_pilon 999927..1000781 -

Sequences

The following sequences are available for this feature:

mRNA sequence
mRNA - spliced transcript sequence
protein sequence
mRNA from alignment at tig00004414_pilon:999927..1000781-
coding sequence from alignment at tig00004414_pilon:999927..1000781-

mRNA sequence

>Gchil1426.t1 ID=Gchil1426.t1|Name=Gchil1426.t1|organism=Gracilaria chilensis NLEC103_M9 male|type=mRNA|length=285bp
MSDSSDYYDYNGETVNGRWKVGAFIGGGSFGSVYAARDNFGRHSSIVVKF
AGGEPGEEEDTIGCLQTEWRVLRYLNNASPHLRVPIVYEHGSHNGIEYIV
MKRLGKSLEEWFDTRDGPVSNIRILQMCFEIFNIVRRLHEKNVLHGDISE
GNIVFGRGGSDGDNLYLIDFGNSSVYTSQASLYDLGDICHIMIKMFRNEV
DGIISHCELGGTFWDSLTDSQIRGMWDNVEKAFNKRRRLHTPIPPIVREL
LHELLNRDGANYNTIGNLFRQAIHAQGGRPRRSH*

spliced messenger RNA

>Gchil1426.t1 ID=Gchil1426.t1|Name=Gchil1426.t1|organism=Gracilaria chilensis NLEC103_M9 male|type=mRNA|length=855bp|location=Sequence derived from alignment at tig00004414_pilon:999927..1000781- (Gracilaria chilensis NLEC103_M9 male)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.  
ATGTCGGACAGTTCTGACTACTACGACTATAATGGTGAAACTGTAAATGG
GCGATGGAAGGTGGGAGCTTTTATAGGTGGCGGTTCCTTTGGTTCGGTCT
ACGCAGCTAGAGATAATTTCGGAAGGCATTCCTCCATAGTTGTCAAATTT
GCCGGAGGTGAACCAGGAGAAGAAGAAGATACTATAGGATGTTTACAAAC
AGAGTGGAGAGTTTTGCGCTATCTCAACAATGCGAGTCCTCATCTACGAG
TGCCTATTGTATACGAGCATGGAAGTCACAATGGCATTGAATATATTGTA
ATGAAGAGACTCGGTAAATCTCTCGAGGAATGGTTCGATACTCGAGACGG
ACCTGTTTCTAATATTAGAATTCTTCAAATGTGCTTCGAGATATTCAATA
TCGTCCGTCGCTTGCACGAGAAAAATGTTCTGCATGGAGATATCAGCGAA
GGAAACATAGTATTCGGAAGAGGCGGAAGTGATGGGGATAACTTGTACCT
TATTGATTTTGGAAACTCATCCGTATACACCAGTCAGGCAAGCCTCTATG
ACCTTGGAGATATATGTCACATCATGATAAAAATGTTTAGGAATGAAGTA
GATGGAATTATTTCACATTGTGAGCTAGGTGGGACTTTCTGGGACTCTTT
GACCGATAGTCAGATACGAGGGATGTGGGATAACGTTGAGAAGGCATTTA
ACAAGCGCCGCAGACTTCATACGCCAATTCCACCCATAGTTCGGGAGCTT
TTGCATGAACTATTGAATAGAGATGGAGCCAATTACAATACAATAGGGAA
TCTGTTCAGGCAGGCCATCCATGCGCAGGGAGGGCGACCTCGGAGATCAC
ATTAA

protein sequence of Gchil1426.t1

>Gchil1426.t1 ID=Gchil1426.t1|Name=Gchil1426.t1|organism=Gracilaria chilensis NLEC103_M9 male|type=polypeptide|length=285bp
MSDSSDYYDYNGETVNGRWKVGAFIGGGSFGSVYAARDNFGRHSSIVVKF
AGGEPGEEEDTIGCLQTEWRVLRYLNNASPHLRVPIVYEHGSHNGIEYIV
MKRLGKSLEEWFDTRDGPVSNIRILQMCFEIFNIVRRLHEKNVLHGDISE
GNIVFGRGGSDGDNLYLIDFGNSSVYTSQASLYDLGDICHIMIKMFRNEV
DGIISHCELGGTFWDSLTDSQIRGMWDNVEKAFNKRRRLHTPIPPIVREL
LHELLNRDGANYNTIGNLFRQAIHAQGGRPRRSH*

mRNA from alignment at tig00004414_pilon:999927..1000781-

Legend: polypeptideCDSexonstart_codonstop_codon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>Gchil1426.t1 ID=Gchil1426.t1|Name=Gchil1426.t1|organism=Gracilaria chilensis NLEC103_M9 male|type=mRNA|length=855bp|location=Sequence derived from alignment at tig00004414_pilon:999927..1000781- (Gracilaria chilensis NLEC103_M9 male)
ATGTCGGACAGTTCTGACTACTACGACTATAATGGTGAAACTGTAAATGG
GCGATGGAAGGTGGGAGCTTTTATAGGTGGCGGTTCCTTTGGTTCGGTCT
ACGCAGCTAGAGATAATTTCGGAAGGCATTCCTCCATAGTTGTCAAATTT
GCCGGAGGTGAACCAGGAGAAGAAGAAGATACTATAGGATGTTTACAAAC
AGAGTGGAGAGTTTTGCGCTATCTCAACAATGCGAGTCCTCATCTACGAG
TGCCTATTGTATACGAGCATGGAAGTCACAATGGCATTGAATATATTGTA
ATGAAGAGACTCGGTAAATCTCTCGAGGAATGGTTCGATACTCGAGACGG
ACCTGTTTCTAATATTAGAATTCTTCAAATGTGCTTCGAGATATTCAATA
TCGTCCGTCGCTTGCACGAGAAAAATGTTCTGCATGGAGATATCAGCGAA
GGAAACATAGTATTCGGAAGAGGCGGAAGTGATGGGGATAACTTGTACCT
TATTGATTTTGGAAACTCATCCGTATACACCAGTCAGGCAAGCCTCTATG
ACCTTGGAGATATATGTCACATCATGATAAAAATGTTTAGGAATGAAGTA
GATGGAATTATTTCACATTGTGAGCTAGGTGGGACTTTCTGGGACTCTTT
GACCGATAGTCAGATACGAGGGATGTGGGATAACGTTGAGAAGGCATTTA
ACAAGCGCCGCAGACTTCATACGCCAATTCCACCCATAGTTCGGGAGCTT
TTGCATGAACTATTGAATAGAGATGGAGCCAATTACAATACAATAGGGAA
TCTGTTCAGGCAGGCCATCCATGCGCAGGGAGGGCGACCTCGGAGATCAC
ATTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at tig00004414_pilon:999927..1000781-

>Gchil1426.t1 ID=Gchil1426.t1|Name=Gchil1426.t1|organism=Gracilaria chilensis NLEC103_M9 male|type=CDS|length=855bp|location=Sequence derived from alignment at tig00004414_pilon:999927..1000781- (Gracilaria chilensis NLEC103_M9 male)
ATGTCGGACAGTTCTGACTACTACGACTATAATGGTGAAACTGTAAATGG
GCGATGGAAGGTGGGAGCTTTTATAGGTGGCGGTTCCTTTGGTTCGGTCT
ACGCAGCTAGAGATAATTTCGGAAGGCATTCCTCCATAGTTGTCAAATTT
GCCGGAGGTGAACCAGGAGAAGAAGAAGATACTATAGGATGTTTACAAAC
AGAGTGGAGAGTTTTGCGCTATCTCAACAATGCGAGTCCTCATCTACGAG
TGCCTATTGTATACGAGCATGGAAGTCACAATGGCATTGAATATATTGTA
ATGAAGAGACTCGGTAAATCTCTCGAGGAATGGTTCGATACTCGAGACGG
ACCTGTTTCTAATATTAGAATTCTTCAAATGTGCTTCGAGATATTCAATA
TCGTCCGTCGCTTGCACGAGAAAAATGTTCTGCATGGAGATATCAGCGAA
GGAAACATAGTATTCGGAAGAGGCGGAAGTGATGGGGATAACTTGTACCT
TATTGATTTTGGAAACTCATCCGTATACACCAGTCAGGCAAGCCTCTATG
ACCTTGGAGATATATGTCACATCATGATAAAAATGTTTAGGAATGAAGTA
GATGGAATTATTTCACATTGTGAGCTAGGTGGGACTTTCTGGGACTCTTT
GACCGATAGTCAGATACGAGGGATGTGGGATAACGTTGAGAAGGCATTTA
ACAAGCGCCGCAGACTTCATACGCCAATTCCACCCATAGTTCGGGAGCTT
TTGCATGAACTATTGAATAGAGATGGAGCCAATTACAATACAATAGGGAA
TCTGTTCAGGCAGGCCATCCATGCGCAGGGAGGGCGACCTCGGAGATCAC
ATTAA