Gcaud2283.t1 (mRNA) Gracilaria caudata M_176_S67 male

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Overview
NameGcaud2283.t1
Unique NameGcaud2283.t1
TypemRNA
OrganismGracilaria caudata M_176_S67 male (Gracilaria caudata M_176_S67 male)
Sequence length358
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
NODE_220_length_36054_cov_4.510163contigNODE_220_length_36054_cov_4.510163:1017..2088 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Gracilaria caudata M_176_S67 male OGS1.02022-05-09
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Gcaud2283Gcaud2283Gracilaria caudata M_176_S67 malegeneNODE_220_length_36054_cov_4.510163 1017..2088 -


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Gcaud2283.t1.CDS1Gcaud2283.t1.CDS1Gracilaria caudata M_176_S67 maleCDSNODE_220_length_36054_cov_4.510163 1017..2088 -


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Gcaud2283.t1.exon1Gcaud2283.t1.exon1Gracilaria caudata M_176_S67 maleexonNODE_220_length_36054_cov_4.510163 1017..2088 -


The following start_codon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Gcaud2283.t1.start1Gcaud2283.t1.start1Gracilaria caudata M_176_S67 malestart_codonNODE_220_length_36054_cov_4.510163 2086..2088 -


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Gcaud2283.t1Gcaud2283.t1Gracilaria caudata M_176_S67 malepolypeptideNODE_220_length_36054_cov_4.510163 1017..2088 -


Sequences
The following sequences are available for this feature:

mRNA sequence

>Gcaud2283.t1 ID=Gcaud2283.t1|Name=Gcaud2283.t1|organism=Gracilaria caudata M_176_S67 male|type=mRNA|length=358bp
MKAVTFLALLGVALAAAPTPCPDGYTAPETTGTYAAPSAAPTYTAPSGDY
SAPAGGEAPMKTPCPTGAGGDYTAPAGGDYTAPAGGDYTAPSTAPSGGDY
TAPAGGDYATPTTAPTATPCADKGAGYTAPSGGDYAGAAPAYPAGESATS
PATAPAAAPAAAPAAAPAAAPAAPAAETPVATPMPEPTPMPGSAAVAADG
SAVIADGDNTVSVAADKESGSASANGEGGALALAAPGGAVGLGTSRMYAT
PCPKPSAGYTAPAGGDYAAPSTAPSYTAPSGGDYAAPSTAPSGGDYTAPS
GGDYTAPSGGDYTAPSGGDYAAPTTAPAATPCAKDKGAGYTAPSGGDYAG
AAPAYPAX
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spliced messenger RNA

>Gcaud2283.t1 ID=Gcaud2283.t1|Name=Gcaud2283.t1|organism=Gracilaria caudata M_176_S67 male|type=mRNA|length=1072bp|location=Sequence derived from alignment at NODE_220_length_36054_cov_4.510163:1017..2088- (Gracilaria caudata M_176_S67 male)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.  
ATGAAGGCCGTCACTTTCCTCGCCCTCCTTGGTGTGGCTCTTGCTGCCGC
TCCCACACCGTGCCCTGATGGCTACACGGCTCCGGAAACTACCGGCACCT
ATGCCGCTCCGAGCGCCGCTCCGACCTATACCGCTCCGTCTGGTGACTAC
TCAGCTCCGGCCGGTGGTGAGGCTCCCATGAAGACTCCGTGCCCGACTGG
CGCTGGCGGAGACTACACTGCTCCGGCTGGTGGTGACTACACTGCTCCGG
CTGGTGGCGACTACACTGCTCCGTCCACTGCCCCGTCCGGTGGTGACTAC
ACTGCTCCGGCTGGTGGTGACTACGCCACCCCGACCACTGCCCCGACCGC
CACTCCGTGCGCGGATAAGGGTGCCGGTTACACTGCTCCGTCTGGTGGTG
ACTATGCTGGTGCTGCCCCGGCCTACCCGGCTGGTGAGTCCGCTACCTCT
CCGGCTACCGCCCCGGCTGCTGCTCCGGCCGCCGCTCCGGCCGCCGCTCC
GGCTGCTGCTCCGGCTGCCCCGGCCGCTGAGACCCCTGTCGCTACCCCGA
TGCCGGAACCGACCCCGATGCCGGGATCCGCTGCCGTTGCCGCTGATGGC
TCTGCCGTGATTGCTGATGGTGACAACACTGTTTCCGTTGCTGCTGACAA
GGAATCTGGCTCTGCTTCCGCCAACGGTGAGGGTGGTGCTCTCGCTCTTG
CCGCTCCGGGTGGTGCTGTTGGTCTTGGTACCTCCCGCATGTACGCCACC
CCGTGCCCGAAGCCCTCTGCTGGTTACACTGCTCCGGCTGGTGGTGACTA
CGCTGCTCCGTCCACTGCTCCGTCCTACACTGCTCCGTCCGGTGGTGACT
ACGCTGCTCCGTCCACTGCCCCGTCCGGTGGTGACTACACTGCTCCGTCC
GGTGGTGACTACACTGCTCCGTCCGGTGGTGACTACACTGCTCCGTCCGG
TGGTGACTACGCCGCCCCGACCACTGCCCCGGCCGCCACTCCGTGTGCTA
AGGATAAGGGTGCCGGTTACACTGCTCCGTCCGGCGGTGACTACGCTGGT
GCTGCCCCGGCCTACCCGGCTG
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protein sequence of Gcaud2283.t1

>Gcaud2283.t1 ID=Gcaud2283.t1|Name=Gcaud2283.t1|organism=Gracilaria caudata M_176_S67 male|type=polypeptide|length=358bp
MKAVTFLALLGVALAAAPTPCPDGYTAPETTGTYAAPSAAPTYTAPSGDY
SAPAGGEAPMKTPCPTGAGGDYTAPAGGDYTAPAGGDYTAPSTAPSGGDY
TAPAGGDYATPTTAPTATPCADKGAGYTAPSGGDYAGAAPAYPAGESATS
PATAPAAAPAAAPAAAPAAAPAAPAAETPVATPMPEPTPMPGSAAVAADG
SAVIADGDNTVSVAADKESGSASANGEGGALALAAPGGAVGLGTSRMYAT
PCPKPSAGYTAPAGGDYAAPSTAPSYTAPSGGDYAAPSTAPSGGDYTAPS
GGDYTAPSGGDYTAPSGGDYAAPTTAPAATPCAKDKGAGYTAPSGGDYAG
AAPAYPAX
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mRNA from alignment at NODE_220_length_36054_cov_4.510163:1017..2088-

Legend: CDSpolypeptideexonstart_codon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Gcaud2283.t1 ID=Gcaud2283.t1|Name=Gcaud2283.t1|organism=Gracilaria caudata M_176_S67 male|type=mRNA|length=1072bp|location=Sequence derived from alignment at NODE_220_length_36054_cov_4.510163:1017..2088- (Gracilaria caudata M_176_S67 male)
ATGAAGGCCGTCACTTTCCTCGCCCTCCTTGGTGTGGCTCTTGCTGCCGC
TCCCACACCGTGCCCTGATGGCTACACGGCTCCGGAAACTACCGGCACCT
ATGCCGCTCCGAGCGCCGCTCCGACCTATACCGCTCCGTCTGGTGACTAC
TCAGCTCCGGCCGGTGGTGAGGCTCCCATGAAGACTCCGTGCCCGACTGG
CGCTGGCGGAGACTACACTGCTCCGGCTGGTGGTGACTACACTGCTCCGG
CTGGTGGCGACTACACTGCTCCGTCCACTGCCCCGTCCGGTGGTGACTAC
ACTGCTCCGGCTGGTGGTGACTACGCCACCCCGACCACTGCCCCGACCGC
CACTCCGTGCGCGGATAAGGGTGCCGGTTACACTGCTCCGTCTGGTGGTG
ACTATGCTGGTGCTGCCCCGGCCTACCCGGCTGGTGAGTCCGCTACCTCT
CCGGCTACCGCCCCGGCTGCTGCTCCGGCCGCCGCTCCGGCCGCCGCTCC
GGCTGCTGCTCCGGCTGCCCCGGCCGCTGAGACCCCTGTCGCTACCCCGA
TGCCGGAACCGACCCCGATGCCGGGATCCGCTGCCGTTGCCGCTGATGGC
TCTGCCGTGATTGCTGATGGTGACAACACTGTTTCCGTTGCTGCTGACAA
GGAATCTGGCTCTGCTTCCGCCAACGGTGAGGGTGGTGCTCTCGCTCTTG
CCGCTCCGGGTGGTGCTGTTGGTCTTGGTACCTCCCGCATGTACGCCACC
CCGTGCCCGAAGCCCTCTGCTGGTTACACTGCTCCGGCTGGTGGTGACTA
CGCTGCTCCGTCCACTGCTCCGTCCTACACTGCTCCGTCCGGTGGTGACT
ACGCTGCTCCGTCCACTGCCCCGTCCGGTGGTGACTACACTGCTCCGTCC
GGTGGTGACTACACTGCTCCGTCCGGTGGTGACTACACTGCTCCGTCCGG
TGGTGACTACGCCGCCCCGACCACTGCCCCGGCCGCCACTCCGTGTGCTA
AGGATAAGGGTGCCGGTTACACTGCTCCGTCCGGCGGTGACTACGCTGGT
GCTGCCCCGGCCTACCCGGCTG
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Coding sequence (CDS) from alignment at NODE_220_length_36054_cov_4.510163:1017..2088-

>Gcaud2283.t1 ID=Gcaud2283.t1|Name=Gcaud2283.t1|organism=Gracilaria caudata M_176_S67 male|type=CDS|length=1072bp|location=Sequence derived from alignment at NODE_220_length_36054_cov_4.510163:1017..2088- (Gracilaria caudata M_176_S67 male)
ATGAAGGCCGTCACTTTCCTCGCCCTCCTTGGTGTGGCTCTTGCTGCCGC
TCCCACACCGTGCCCTGATGGCTACACGGCTCCGGAAACTACCGGCACCT
ATGCCGCTCCGAGCGCCGCTCCGACCTATACCGCTCCGTCTGGTGACTAC
TCAGCTCCGGCCGGTGGTGAGGCTCCCATGAAGACTCCGTGCCCGACTGG
CGCTGGCGGAGACTACACTGCTCCGGCTGGTGGTGACTACACTGCTCCGG
CTGGTGGCGACTACACTGCTCCGTCCACTGCCCCGTCCGGTGGTGACTAC
ACTGCTCCGGCTGGTGGTGACTACGCCACCCCGACCACTGCCCCGACCGC
CACTCCGTGCGCGGATAAGGGTGCCGGTTACACTGCTCCGTCTGGTGGTG
ACTATGCTGGTGCTGCCCCGGCCTACCCGGCTGGTGAGTCCGCTACCTCT
CCGGCTACCGCCCCGGCTGCTGCTCCGGCCGCCGCTCCGGCCGCCGCTCC
GGCTGCTGCTCCGGCTGCCCCGGCCGCTGAGACCCCTGTCGCTACCCCGA
TGCCGGAACCGACCCCGATGCCGGGATCCGCTGCCGTTGCCGCTGATGGC
TCTGCCGTGATTGCTGATGGTGACAACACTGTTTCCGTTGCTGCTGACAA
GGAATCTGGCTCTGCTTCCGCCAACGGTGAGGGTGGTGCTCTCGCTCTTG
CCGCTCCGGGTGGTGCTGTTGGTCTTGGTACCTCCCGCATGTACGCCACC
CCGTGCCCGAAGCCCTCTGCTGGTTACACTGCTCCGGCTGGTGGTGACTA
CGCTGCTCCGTCCACTGCTCCGTCCTACACTGCTCCGTCCGGTGGTGACT
ACGCTGCTCCGTCCACTGCCCCGTCCGGTGGTGACTACACTGCTCCGTCC
GGTGGTGACTACACTGCTCCGTCCGGTGGTGACTACACTGCTCCGTCCGG
TGGTGACTACGCCGCCCCGACCACTGCCCCGGCCGCCACTCCGTGTGCTA
AGGATAAGGGTGCCGGTTACACTGCTCCGTCCGGCGGTGACTACGCTGGT
GCTGCCCCGGCCTACCCGGCTG
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