Gcaud2145.t1 (mRNA) Gracilaria caudata M_176_S67 male

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Overview


Name	Gcaud2145.t1
Unique Name	Gcaud2145.t1
Type	mRNA
Organism	Gracilaria caudata M_176_S67 male (Gracilaria caudata M_176_S67 male)
Sequence length	1181

Alignments

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
NODE_116_length_48691_cov_4.274671	contig	NODE_116_length_48691_cov_4.274671:41556..45098 +

Analyses

This mRNA is derived from or has results from the following analyses


Analysis Name	Date Performed
Gracilaria caudata M_176_S67 male OGS1.0	2022-05-09

Properties


Property Name	Value
Seed ortholog	7159.AAEL012062-PB
Preferred name	ATP1A1
PFAMs	Cation_ATPase,Cation_ATPase_C,Cation_ATPase_N,E1-E2_ATPase,Hydrolase
Max annot lvl	33208\|Metazoa
KEGG ko	ko:K01539
KEGG TC	3.A.3.1
KEGG Pathway	ko04022,ko04024,ko04260,ko04261,ko04911,ko04918,ko04919,ko04925,ko04960,ko04961,ko04964,ko04970,ko04971,ko04972,ko04973,ko04974,ko04976,ko04978,map04022,map04024,map04260,map04261,map04911,map04918,map04919,map04925,map04960,map04961,map04964,map04970,map04971,map04972,map04973,map04974,map04976,map04978
GOs	GO:0000003,GO:0000166,GO:0001101,GO:0001504,GO:0001505,GO:0001508,GO:0001540,GO:0001664,GO:0001700,GO:0001894,GO:0002026,GO:0002028,GO:0002036,GO:0002087,GO:0003008,GO:0003012,GO:0003013,GO:0003015,GO:0003018,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005102,GO:0005215,GO:0005391,GO:0005488,GO:0005496,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005768,GO:0005783,GO:0005794,GO:0005886,GO:0005887,GO:0005890,GO:0005901,GO:0005911,GO:0005918,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006813,GO:0006814,GO:0006836,GO:0006873,GO:0006874,GO:0006875,GO:0006883,GO:0006928,GO:0006936,GO:0006937,GO:0006940,GO:0006941,GO:0006942,GO:0007043,GO:0007154,GO:0007165,GO:0007166,GO:0007215,GO:0007267,GO:0007268,GO:0007275,GO:0007399,GO:0007416,GO:0007417,GO:0007420,GO:0007424,GO:0007528,GO:0007568,GO:0007600,GO:0007605,GO:0007610,GO:0007611,GO:0007612,GO:0007613,GO:0007626,GO:0007630,GO:0007632,GO:0008015,GO:0008016,GO:0008092,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008217,GO:0008289,GO:0008306,GO:0008324,GO:0008340,GO:0008344,GO:0008360,GO:0008542,GO:0008556,GO:0009117,GO:0009123,GO:0009126,GO:0009141,GO:0009144,GO:0009150,GO:0009161,GO:0009167,GO:0009199,GO:0009205,GO:0009259,GO:0009266,GO:0009314,GO:0009416,GO:0009605,GO:0009612,GO:0009628,GO:0009636,GO:0009653,GO:0009719,GO:0009725,GO:0009790,GO:0009792,GO:0009887,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010033,GO:0010107,GO:0010243,GO:0010248,GO:0010259,GO:0010522,GO:0010644,GO:0010646,GO:0010766,GO:0010817,GO:0010880,GO:0010881,GO:0010882,GO:0010894,GO:0010958,GO:0010959,GO:0012505,GO:0014069,GO:0014070,GO:0014704,GO:0015075,GO:0015077,GO:0015079,GO:0015081,GO:0015318,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015662,GO:0015672,GO:0015988,GO:0015991,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016043,GO:0016311,GO:0016323,GO:0016324,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016791,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017076,GO:0017111,GO:0017144,GO:0019216,GO:0019218,GO:0019222,GO:0019229,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019722,GO:0019725,GO:0019829,GO:0019899,GO:0019900,GO:0019901,GO:0019904,GO:0019932,GO:0019991,GO:0021537,GO:0021543,GO:0021987,GO:0022603,GO:0022604,GO:0022607,GO:0022804,GO:0022853,GO:0022857,GO:0022890,GO:0022898,GO:0023051,GO:0023052,GO:0030001,GO:0030003,GO:0030004,GO:0030007,GO:0030029,GO:0030030,GO:0030048,GO:0030054,GO:0030315,GO:0030424,GO:0030425,GO:0030506,GO:0030534,GO:0030554,GO:0030900,GO:0030955,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031402,GO:0031410,GO:0031420,GO:0031748,GO:0031943,GO:0031944,GO:0031946,GO:0031947,GO:0031982,GO:0032279,GO:0032350,GO:0032351,GO:0032353,GO:0032409,GO:0032410,GO:0032412,GO:0032413,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032526,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032809,GO:0032870,GO:0032879,GO:0032890,GO:0032970,GO:0032991,GO:0033218,GO:0033993,GO:0034220,GO:0034329,GO:0034330,GO:0034641,GO:0034762,GO:0034763,GO:0034765,GO:0034766,GO:0035094,GO:0035150,GO:0035151,GO:0035152,GO:0035158,GO:0035159,GO:0035235,GO:0035296,GO:0035556,GO:0035637,GO:0035639,GO:0035725,GO:0036094,GO:0036376,GO:0036477,GO:0040007,GO:0040011,GO:0042221,GO:0042277,GO:0042383,GO:0042391,GO:0042493,GO:0042562,GO:0042578,GO:0042592,GO:0042623,GO:0042625,GO:0042626,GO:0042995,GO:0043005,GO:0043025,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043197,GO:0043209,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043269,GO:0043271,GO:0043296,GO:0043297,GO:0043394,GO:0043395,GO:0043492,GO:0043531,GO:0043548,GO:0043576,GO:0044057,GO:0044065,GO:0044070,GO:0044085,GO:0044092,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044291,GO:0044297,GO:0044298,GO:0044309,GO:0044326,GO:0044327,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044444,GO:0044456,GO:0044459,GO:0044463,GO:0044464,GO:0044853,GO:0045121,GO:0045177,GO:0045178,GO:0045202,GO:0045216,GO:0045822,GO:0045823,GO:0045833,GO:0045932,GO:0045933,GO:0045939,GO:0045988,GO:0045989,GO:0046034,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046873,GO:0046885,GO:0046890,GO:0048513,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048523,GO:0048545,GO:0048583,GO:0048589,GO:0048731,GO:0048856,GO:0048871,GO:0048878,GO:0050780,GO:0050789,GO:0050793,GO:0050794,GO:0050801,GO:0050804,GO:0050808,GO:0050810,GO:0050877,GO:0050880,GO:0050890,GO:0050896,GO:0050905,GO:0050954,GO:0050998,GO:0051049,GO:0051051,GO:0051055,GO:0051087,GO:0051117,GO:0051124,GO:0051128,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051239,GO:0051240,GO:0051241,GO:0051270,GO:0051279,GO:0051282,GO:0051480,GO:0051481,GO:0051580,GO:0051588,GO:0051716,GO:0051899,GO:0051924,GO:0051926,GO:0051941,GO:0051946,GO:0051952,GO:0051955,GO:0051966,GO:0055065,GO:0055067,GO:0055074,GO:0055075,GO:0055078,GO:0055080,GO:0055082,GO:0055085,GO:0055086,GO:0055117,GO:0055119,GO:0060047,GO:0060048,GO:0060075,GO:0060081,GO:0060249,GO:0060322,GO:0060341,GO:0060438,GO:0060439,GO:0060541,GO:0061337,GO:0065007,GO:0065008,GO:0065009,GO:0070160,GO:0070252,GO:0070887,GO:0071214,GO:0071229,GO:0071260,GO:0071300,GO:0071310,GO:0071383,GO:0071396,GO:0071407,GO:0071417,GO:0071495,GO:0071496,GO:0071704,GO:0071804,GO:0071805,GO:0071840,GO:0071944,GO:0072503,GO:0072507,GO:0072521,GO:0080090,GO:0086001,GO:0086002,GO:0086003,GO:0086004,GO:0086009,GO:0086010,GO:0086011,GO:0086012,GO:0086013,GO:0086036,GO:0086037,GO:0086064,GO:0086065,GO:0090030,GO:0090032,GO:0090066,GO:0090075,GO:0090257,GO:0090533,GO:0090662,GO:0097066,GO:0097067,GO:0097159,GO:0097367,GO:0097447,GO:0097458,GO:0097574,GO:0097708,GO:0097746,GO:0098533,GO:0098589,GO:0098590,GO:0098655,GO:0098657,GO:0098659,GO:0098660,GO:0098662,GO:0098739,GO:0098771,GO:0098794,GO:0098796,GO:0098797,GO:0098805,GO:0098857,GO:0098916,GO:0098984,GO:0099131,GO:0099132,GO:0099177,GO:0099536,GO:0099537,GO:0099572,GO:0099587,GO:0099622,GO:0104004,GO:0106027,GO:0120025,GO:0120036,GO:0120038,GO:0140115,GO:1901019,GO:1901020,GO:1901135,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901652,GO:1901653,GO:1901681,GO:1901698,GO:1901699,GO:1901700,GO:1901701,GO:1902305,GO:1902306,GO:1902494,GO:1902495,GO:1902600,GO:1903115,GO:1903169,GO:1903170,GO:1903279,GO:1903280,GO:1903416,GO:1903522,GO:1903523,GO:1903524,GO:1903789,GO:1903959,GO:1904062,GO:1904063,GO:1904645,GO:1904646,GO:1904949,GO:1990239,GO:1990351,GO:1990535,GO:1990573,GO:1990794,GO:2000649,GO:2000650,GO:2001023
Evalue	0.0
EggNOG OGs	COG0474@1\|root,KOG0203@2759\|Eukaryota,38BIP@33154\|Opisthokonta,3BAR6@33208\|Metazoa,3CTGX@33213\|Bilateria,41TXW@6656\|Arthropoda,3SITZ@50557\|Insecta,4523P@7147\|Diptera,45EBQ@7148\|Nematocera
EC	3.6.3.9
Description	atpase alpha
COG category	P
BRITE	ko00000,ko00001,ko01000,ko04147

Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
Gcaud2145	Gcaud2145	Gracilaria caudata M_176_S67 male	gene	NODE_116_length_48691_cov_4.274671 41556..45098 +

The following start_codon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
Gcaud2145.t1.start1	Gcaud2145.t1.start1	Gracilaria caudata M_176_S67 male	start_codon	NODE_116_length_48691_cov_4.274671 41556..41558 +

The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
Gcaud2145.t1.CDS1	Gcaud2145.t1.CDS1	Gracilaria caudata M_176_S67 male	CDS	NODE_116_length_48691_cov_4.274671 41556..45098 +

The following exon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
Gcaud2145.t1.exon1	Gcaud2145.t1.exon1	Gracilaria caudata M_176_S67 male	exon	NODE_116_length_48691_cov_4.274671 41556..45098 +

The following stop_codon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
Gcaud2145.t1.stop1	Gcaud2145.t1.stop1	Gracilaria caudata M_176_S67 male	stop_codon	NODE_116_length_48691_cov_4.274671 45096..45098 +

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
Gcaud2145.t1	Gcaud2145.t1	Gracilaria caudata M_176_S67 male	polypeptide	NODE_116_length_48691_cov_4.274671 41556..45098 +

Sequences

The following sequences are available for this feature:

mRNA sequence
mRNA - spliced transcript sequence
protein sequence
mRNA from alignment at NODE_116_length_48691_cov_4.274671:41556..45098+
coding sequence from alignment at NODE_116_length_48691_cov_4.274671:41556..45098+

mRNA sequence

>Gcaud2145.t1 ID=Gcaud2145.t1|Name=Gcaud2145.t1|organism=Gracilaria caudata M_176_S67 male|type=mRNA|length=1181bp
MGKDTITPGQPRRLSHNELEMARQYSETSARISEIIERKKAGKKDKGDKQ
EELKKELEMWEHKVTVQELCSKLQTDPEKGLSDNEAKVRLERDGPNQLSP
PKVTPWYVKLLSQFINFFALLLQVASILCFVGYGLDNEAVDNLYLGIVLY
IVVIITAVFTFFQEFKSEKTMEKFKNFLPPQSVARRSGKIVEVDASTLVV
GDVIEVKLGDKIPADIRIVSNQKLKVDNSPLTGESEPIGRTVDCTDENPL
ETKNLAFFGTLAVDGTCTGVVVNTGDDTVFGRIAGLAAGSVSEVTTLQID
IHHFVIIISSVAIFLGVLFFIIGLIKGTPVITNVVFCIGIIVANVPEGLL
ATVTVSLTLSAKRMAKKQVLVKKLEAVETLGSTTCICSDKTGTLTQNRMT
IVHVAYDKQLHTTKTAASEATFDLEDPCFKELFFIGAVCGKAVFDAKDMD
DNPDKSIDERKVNGDASEAGILKFSEKIRSVIDMRNRNKQVCTIPFNSAN
KFMLTINKVADQGDRLRLCMKGAPERVMDRCTTILTKDGIQPFDAAAKSV
INEQLAFMMERGERCLGFARLDLDPTEYPVNFQFDTEEINFPMNGLTFVG
LMALLDPPREAVPAAVSTCQSAGVKVIMVTGDHPATAKSIAKQVNIIQSP
TAEDVAKERGISVDEVDRSDIKSIVIPGSQIKDLEQDDWDRILAHEQIVF
ARTSPQQKLIIVENNQRLGNVVAVTGDGVNDSPALKKANIGIAMGIAGSD
VSKEAADMILLDDNFASIVNGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLTSNIPEITPF
LAFIIVQIPLPLTTVLILCIDLGTDLLPAISLAYENPESDIMRRPPRDSR
VDRLVNRRLISFSYFQIGVIQALAGFYCYLVVLGDFGLTAHILPFLDEDA
YIASPQSDDKRWLYVERDRPFGESVDAGWFDENGDTERFFRAPEVPGFIV
QNDEEPDQVGLVYKQLLRPENIDQLQNMYKIIGSVTQRPPCLAFSCTNVN
DGTVENNNYVCISDPTSFGGIDIREEALTNTDRSVTSLFNTEVTDGSGEG
QGCYDLYSKNQQEEALKTAQTAFFVCIVIVQMGGLLVCKTRVLSFFKQGM
KNMILNIGLLTEVALCALLCYVPFIQTAFQTRNLRFVHWLPAIPFSLFIF
CYDEIRKFLIRQGDTKGNKLGVWLRENTYW*

spliced messenger RNA

>Gcaud2145.t1 ID=Gcaud2145.t1|Name=Gcaud2145.t1|organism=Gracilaria caudata M_176_S67 male|type=mRNA|length=3543bp|location=Sequence derived from alignment at NODE_116_length_48691_cov_4.274671:41556..45098+ (Gracilaria caudata M_176_S67 male)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.  
ATGGGTAAGGACACAATCACGCCGGGGCAGCCGCGCCGTCTGTCCCATAA
TGAGCTCGAAATGGCGCGTCAGTACTCCGAGACCAGCGCCAGGATTTCCG
AGATCATCGAGCGCAAGAAGGCCGGAAAGAAGGACAAGGGTGACAAGCAG
GAAGAGCTCAAGAAGGAGCTCGAGATGTGGGAACACAAGGTCACCGTACA
GGAACTCTGCAGCAAGTTGCAGACCGACCCGGAGAAGGGTCTTTCTGACA
ACGAGGCTAAGGTTCGTTTAGAACGAGATGGTCCCAACCAGCTCTCACCC
CCTAAGGTCACCCCGTGGTATGTCAAGCTTCTCAGCCAGTTTATCAATTT
CTTTGCCCTCCTGTTGCAAGTTGCTTCTATTCTTTGCTTCGTTGGCTATG
GACTTGACAATGAGGCTGTGGACAATCTTTACCTCGGTATCGTGTTGTAC
ATTGTCGTCATTATCACCGCCGTCTTTACTTTCTTCCAGGAGTTTAAGAG
TGAGAAGACCATGGAGAAGTTCAAGAACTTCCTGCCGCCGCAGTCTGTGG
CCCGTCGTAGTGGGAAGATTGTCGAGGTCGACGCGTCCACCCTCGTGGTA
GGAGATGTCATCGAAGTCAAGCTGGGTGATAAGATTCCCGCAGATATTCG
TATCGTTTCCAACCAGAAGCTCAAGGTGGACAATTCCCCTCTCACTGGTG
AGTCCGAACCAATTGGTCGAACTGTTGATTGCACCGATGAGAACCCGCTC
GAGACCAAGAATCTTGCTTTCTTCGGAACTCTTGCCGTCGATGGTACTTG
CACTGGTGTTGTCGTCAACACTGGTGATGACACTGTGTTCGGTCGTATCG
CGGGTCTGGCTGCCGGTTCTGTGTCTGAGGTTACAACCCTGCAGATCGAT
ATCCATCACTTCGTTATTATCATTTCTTCCGTCGCTATCTTCCTCGGTGT
GCTCTTTTTCATCATTGGTCTCATCAAGGGTACCCCGGTTATCACCAATG
TCGTGTTCTGTATCGGTATCATTGTCGCCAATGTGCCTGAAGGACTGCTT
GCAACTGTGACGGTGTCACTCACCTTGTCTGCCAAGCGTATGGCTAAGAA
GCAAGTGCTCGTGAAGAAGCTGGAGGCTGTCGAGACCCTCGGATCCACCA
CCTGCATCTGCTCCGACAAGACTGGTACTCTGACTCAGAACCGTATGACC
ATTGTCCATGTCGCTTACGACAAGCAGCTTCACACCACCAAGACTGCCGC
CTCTGAAGCCACCTTCGATCTCGAGGACCCGTGCTTCAAGGAACTGTTCT
TCATTGGTGCCGTGTGCGGTAAGGCCGTGTTCGATGCCAAAGACATGGAC
GATAACCCAGACAAGTCTATTGACGAACGTAAGGTCAACGGTGATGCCTC
CGAAGCGGGTATCCTTAAGTTCTCTGAGAAGATCCGCTCCGTAATTGATA
TGCGCAACAGGAATAAGCAAGTTTGCACTATTCCTTTCAACTCTGCCAAC
AAGTTCATGCTTACGATTAACAAGGTTGCCGACCAAGGAGATCGCCTTCG
CCTTTGCATGAAGGGAGCCCCTGAGCGTGTCATGGACCGTTGCACTACCA
TCCTCACCAAGGATGGCATCCAGCCGTTTGATGCCGCCGCGAAGTCTGTT
ATCAATGAACAACTTGCATTCATGATGGAGCGCGGTGAACGCTGCCTCGG
GTTTGCCAGGTTGGACCTTGACCCAACTGAGTATCCTGTCAACTTCCAGT
TCGATACCGAGGAAATTAACTTCCCAATGAATGGTCTTACCTTCGTTGGC
CTCATGGCTCTCCTTGACCCGCCACGTGAAGCCGTGCCCGCCGCTGTGTC
GACTTGTCAATCCGCTGGTGTTAAGGTCATCATGGTTACCGGTGATCATC
CGGCTACTGCAAAGTCTATCGCCAAGCAGGTGAACATTATCCAGAGCCCT
ACTGCTGAAGACGTTGCGAAGGAGCGTGGTATTTCTGTGGATGAGGTTGA
TCGCTCTGACATCAAGTCTATTGTCATCCCTGGTTCCCAGATCAAGGATC
TTGAACAAGATGACTGGGATCGTATTCTTGCCCACGAGCAGATTGTGTTT
GCACGTACCTCTCCCCAGCAGAAGCTCATCATTGTCGAGAACAACCAGCG
TCTCGGAAACGTTGTGGCTGTCACAGGTGATGGTGTGAATGACTCTCCAG
CGTTGAAGAAGGCTAACATCGGTATTGCTATGGGTATTGCCGGCTCAGAT
GTGTCCAAGGAGGCCGCGGATATGATCTTGCTCGATGACAACTTCGCGTC
TATTGTGAACGGTGTAGAGGAAGGTCGTCTCATCTTCGACAACTTGAAGA
AGTCTATTGCCTACACGCTGACGAGTAACATCCCGGAAATTACCCCCTTC
CTGGCTTTCATCATCGTGCAGATCCCGCTTCCATTGACTACTGTGCTCAT
CCTCTGCATTGATTTGGGTACCGATCTTCTACCGGCTATCTCCCTTGCCT
ATGAGAATCCCGAGTCTGACATCATGCGTCGCCCCCCGCGTGATTCCCGC
GTGGATCGACTTGTGAACCGCCGTCTCATTTCCTTCTCGTACTTCCAGAT
TGGTGTCATTCAGGCCTTGGCTGGTTTCTATTGCTATCTTGTTGTGCTCG
GAGACTTTGGTCTAACTGCTCATATCTTGCCATTCCTTGACGAAGATGCG
TACATTGCCTCCCCGCAGAGTGATGACAAGCGCTGGTTGTATGTCGAGCG
TGACCGTCCGTTCGGAGAGTCTGTGGACGCCGGCTGGTTCGATGAGAATG
GGGACACTGAGCGTTTCTTCCGTGCCCCCGAAGTTCCTGGCTTCATTGTT
CAGAATGACGAGGAACCCGATCAGGTCGGTCTTGTCTACAAACAGCTTCT
GCGGCCGGAGAACATTGATCAGTTGCAGAACATGTACAAGATCATTGGCA
GCGTTACTCAGAGACCGCCATGCTTGGCTTTCAGTTGCACCAACGTCAAT
GATGGCACTGTTGAGAACAACAACTATGTCTGTATCAGTGATCCTACGAG
CTTTGGAGGGATTGACATCCGGGAAGAGGCGCTGACGAATACGGACCGCT
CTGTTACAAGCTTATTCAATACTGAGGTGACCGACGGTAGTGGTGAGGGT
CAGGGTTGCTACGATTTGTACAGCAAGAACCAGCAAGAGGAAGCGCTGAA
GACTGCTCAAACTGCCTTCTTCGTGTGCATTGTCATTGTACAGATGGGTG
GTCTTCTTGTTTGCAAGACTCGAGTGCTTTCGTTCTTCAAGCAGGGAATG
AAGAACATGATTTTGAACATTGGTCTGCTAACTGAGGTGGCCTTGTGTGC
GCTACTCTGCTATGTGCCGTTCATTCAGACGGCGTTCCAAACTCGTAACC
TTCGCTTCGTGCATTGGTTGCCCGCTATTCCGTTCTCTTTGTTTATCTTC
TGCTACGATGAAATTCGGAAGTTCCTTATCCGACAGGGAGACACGAAGGG
TAACAAGTTGGGAGTGTGGCTGCGTGAGAACACATATTGGTAA

protein sequence of Gcaud2145.t1

>Gcaud2145.t1 ID=Gcaud2145.t1|Name=Gcaud2145.t1|organism=Gracilaria caudata M_176_S67 male|type=polypeptide|length=1181bp
MGKDTITPGQPRRLSHNELEMARQYSETSARISEIIERKKAGKKDKGDKQ
EELKKELEMWEHKVTVQELCSKLQTDPEKGLSDNEAKVRLERDGPNQLSP
PKVTPWYVKLLSQFINFFALLLQVASILCFVGYGLDNEAVDNLYLGIVLY
IVVIITAVFTFFQEFKSEKTMEKFKNFLPPQSVARRSGKIVEVDASTLVV
GDVIEVKLGDKIPADIRIVSNQKLKVDNSPLTGESEPIGRTVDCTDENPL
ETKNLAFFGTLAVDGTCTGVVVNTGDDTVFGRIAGLAAGSVSEVTTLQID
IHHFVIIISSVAIFLGVLFFIIGLIKGTPVITNVVFCIGIIVANVPEGLL
ATVTVSLTLSAKRMAKKQVLVKKLEAVETLGSTTCICSDKTGTLTQNRMT
IVHVAYDKQLHTTKTAASEATFDLEDPCFKELFFIGAVCGKAVFDAKDMD
DNPDKSIDERKVNGDASEAGILKFSEKIRSVIDMRNRNKQVCTIPFNSAN
KFMLTINKVADQGDRLRLCMKGAPERVMDRCTTILTKDGIQPFDAAAKSV
INEQLAFMMERGERCLGFARLDLDPTEYPVNFQFDTEEINFPMNGLTFVG
LMALLDPPREAVPAAVSTCQSAGVKVIMVTGDHPATAKSIAKQVNIIQSP
TAEDVAKERGISVDEVDRSDIKSIVIPGSQIKDLEQDDWDRILAHEQIVF
ARTSPQQKLIIVENNQRLGNVVAVTGDGVNDSPALKKANIGIAMGIAGSD
VSKEAADMILLDDNFASIVNGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLTSNIPEITPF
LAFIIVQIPLPLTTVLILCIDLGTDLLPAISLAYENPESDIMRRPPRDSR
VDRLVNRRLISFSYFQIGVIQALAGFYCYLVVLGDFGLTAHILPFLDEDA
YIASPQSDDKRWLYVERDRPFGESVDAGWFDENGDTERFFRAPEVPGFIV
QNDEEPDQVGLVYKQLLRPENIDQLQNMYKIIGSVTQRPPCLAFSCTNVN
DGTVENNNYVCISDPTSFGGIDIREEALTNTDRSVTSLFNTEVTDGSGEG
QGCYDLYSKNQQEEALKTAQTAFFVCIVIVQMGGLLVCKTRVLSFFKQGM
KNMILNIGLLTEVALCALLCYVPFIQTAFQTRNLRFVHWLPAIPFSLFIF
CYDEIRKFLIRQGDTKGNKLGVWLRENTYW*

mRNA from alignment at NODE_116_length_48691_cov_4.274671:41556..45098+

Legend: start_codonpolypeptideCDSexonstop_codon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>Gcaud2145.t1 ID=Gcaud2145.t1|Name=Gcaud2145.t1|organism=Gracilaria caudata M_176_S67 male|type=mRNA|length=3543bp|location=Sequence derived from alignment at NODE_116_length_48691_cov_4.274671:41556..45098+ (Gracilaria caudata M_176_S67 male)
ATGGGTAAGGACACAATCACGCCGGGGCAGCCGCGCCGTCTGTCCCATAA
TGAGCTCGAAATGGCGCGTCAGTACTCCGAGACCAGCGCCAGGATTTCCG
AGATCATCGAGCGCAAGAAGGCCGGAAAGAAGGACAAGGGTGACAAGCAG
GAAGAGCTCAAGAAGGAGCTCGAGATGTGGGAACACAAGGTCACCGTACA
GGAACTCTGCAGCAAGTTGCAGACCGACCCGGAGAAGGGTCTTTCTGACA
ACGAGGCTAAGGTTCGTTTAGAACGAGATGGTCCCAACCAGCTCTCACCC
CCTAAGGTCACCCCGTGGTATGTCAAGCTTCTCAGCCAGTTTATCAATTT
CTTTGCCCTCCTGTTGCAAGTTGCTTCTATTCTTTGCTTCGTTGGCTATG
GACTTGACAATGAGGCTGTGGACAATCTTTACCTCGGTATCGTGTTGTAC
ATTGTCGTCATTATCACCGCCGTCTTTACTTTCTTCCAGGAGTTTAAGAG
TGAGAAGACCATGGAGAAGTTCAAGAACTTCCTGCCGCCGCAGTCTGTGG
CCCGTCGTAGTGGGAAGATTGTCGAGGTCGACGCGTCCACCCTCGTGGTA
GGAGATGTCATCGAAGTCAAGCTGGGTGATAAGATTCCCGCAGATATTCG
TATCGTTTCCAACCAGAAGCTCAAGGTGGACAATTCCCCTCTCACTGGTG
AGTCCGAACCAATTGGTCGAACTGTTGATTGCACCGATGAGAACCCGCTC
GAGACCAAGAATCTTGCTTTCTTCGGAACTCTTGCCGTCGATGGTACTTG
CACTGGTGTTGTCGTCAACACTGGTGATGACACTGTGTTCGGTCGTATCG
CGGGTCTGGCTGCCGGTTCTGTGTCTGAGGTTACAACCCTGCAGATCGAT
ATCCATCACTTCGTTATTATCATTTCTTCCGTCGCTATCTTCCTCGGTGT
GCTCTTTTTCATCATTGGTCTCATCAAGGGTACCCCGGTTATCACCAATG
TCGTGTTCTGTATCGGTATCATTGTCGCCAATGTGCCTGAAGGACTGCTT
GCAACTGTGACGGTGTCACTCACCTTGTCTGCCAAGCGTATGGCTAAGAA
GCAAGTGCTCGTGAAGAAGCTGGAGGCTGTCGAGACCCTCGGATCCACCA
CCTGCATCTGCTCCGACAAGACTGGTACTCTGACTCAGAACCGTATGACC
ATTGTCCATGTCGCTTACGACAAGCAGCTTCACACCACCAAGACTGCCGC
CTCTGAAGCCACCTTCGATCTCGAGGACCCGTGCTTCAAGGAACTGTTCT
TCATTGGTGCCGTGTGCGGTAAGGCCGTGTTCGATGCCAAAGACATGGAC
GATAACCCAGACAAGTCTATTGACGAACGTAAGGTCAACGGTGATGCCTC
CGAAGCGGGTATCCTTAAGTTCTCTGAGAAGATCCGCTCCGTAATTGATA
TGCGCAACAGGAATAAGCAAGTTTGCACTATTCCTTTCAACTCTGCCAAC
AAGTTCATGCTTACGATTAACAAGGTTGCCGACCAAGGAGATCGCCTTCG
CCTTTGCATGAAGGGAGCCCCTGAGCGTGTCATGGACCGTTGCACTACCA
TCCTCACCAAGGATGGCATCCAGCCGTTTGATGCCGCCGCGAAGTCTGTT
ATCAATGAACAACTTGCATTCATGATGGAGCGCGGTGAACGCTGCCTCGG
GTTTGCCAGGTTGGACCTTGACCCAACTGAGTATCCTGTCAACTTCCAGT
TCGATACCGAGGAAATTAACTTCCCAATGAATGGTCTTACCTTCGTTGGC
CTCATGGCTCTCCTTGACCCGCCACGTGAAGCCGTGCCCGCCGCTGTGTC
GACTTGTCAATCCGCTGGTGTTAAGGTCATCATGGTTACCGGTGATCATC
CGGCTACTGCAAAGTCTATCGCCAAGCAGGTGAACATTATCCAGAGCCCT
ACTGCTGAAGACGTTGCGAAGGAGCGTGGTATTTCTGTGGATGAGGTTGA
TCGCTCTGACATCAAGTCTATTGTCATCCCTGGTTCCCAGATCAAGGATC
TTGAACAAGATGACTGGGATCGTATTCTTGCCCACGAGCAGATTGTGTTT
GCACGTACCTCTCCCCAGCAGAAGCTCATCATTGTCGAGAACAACCAGCG
TCTCGGAAACGTTGTGGCTGTCACAGGTGATGGTGTGAATGACTCTCCAG
CGTTGAAGAAGGCTAACATCGGTATTGCTATGGGTATTGCCGGCTCAGAT
GTGTCCAAGGAGGCCGCGGATATGATCTTGCTCGATGACAACTTCGCGTC
TATTGTGAACGGTGTAGAGGAAGGTCGTCTCATCTTCGACAACTTGAAGA
AGTCTATTGCCTACACGCTGACGAGTAACATCCCGGAAATTACCCCCTTC
CTGGCTTTCATCATCGTGCAGATCCCGCTTCCATTGACTACTGTGCTCAT
CCTCTGCATTGATTTGGGTACCGATCTTCTACCGGCTATCTCCCTTGCCT
ATGAGAATCCCGAGTCTGACATCATGCGTCGCCCCCCGCGTGATTCCCGC
GTGGATCGACTTGTGAACCGCCGTCTCATTTCCTTCTCGTACTTCCAGAT
TGGTGTCATTCAGGCCTTGGCTGGTTTCTATTGCTATCTTGTTGTGCTCG
GAGACTTTGGTCTAACTGCTCATATCTTGCCATTCCTTGACGAAGATGCG
TACATTGCCTCCCCGCAGAGTGATGACAAGCGCTGGTTGTATGTCGAGCG
TGACCGTCCGTTCGGAGAGTCTGTGGACGCCGGCTGGTTCGATGAGAATG
GGGACACTGAGCGTTTCTTCCGTGCCCCCGAAGTTCCTGGCTTCATTGTT
CAGAATGACGAGGAACCCGATCAGGTCGGTCTTGTCTACAAACAGCTTCT
GCGGCCGGAGAACATTGATCAGTTGCAGAACATGTACAAGATCATTGGCA
GCGTTACTCAGAGACCGCCATGCTTGGCTTTCAGTTGCACCAACGTCAAT
GATGGCACTGTTGAGAACAACAACTATGTCTGTATCAGTGATCCTACGAG
CTTTGGAGGGATTGACATCCGGGAAGAGGCGCTGACGAATACGGACCGCT
CTGTTACAAGCTTATTCAATACTGAGGTGACCGACGGTAGTGGTGAGGGT
CAGGGTTGCTACGATTTGTACAGCAAGAACCAGCAAGAGGAAGCGCTGAA
GACTGCTCAAACTGCCTTCTTCGTGTGCATTGTCATTGTACAGATGGGTG
GTCTTCTTGTTTGCAAGACTCGAGTGCTTTCGTTCTTCAAGCAGGGAATG
AAGAACATGATTTTGAACATTGGTCTGCTAACTGAGGTGGCCTTGTGTGC
GCTACTCTGCTATGTGCCGTTCATTCAGACGGCGTTCCAAACTCGTAACC
TTCGCTTCGTGCATTGGTTGCCCGCTATTCCGTTCTCTTTGTTTATCTTC
TGCTACGATGAAATTCGGAAGTTCCTTATCCGACAGGGAGACACGAAGGG
TAACAAGTTGGGAGTGTGGCTGCGTGAGAACACATATTGGTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at NODE_116_length_48691_cov_4.274671:41556..45098+

>Gcaud2145.t1 ID=Gcaud2145.t1|Name=Gcaud2145.t1|organism=Gracilaria caudata M_176_S67 male|type=CDS|length=3543bp|location=Sequence derived from alignment at NODE_116_length_48691_cov_4.274671:41556..45098+ (Gracilaria caudata M_176_S67 male)
ATGGGTAAGGACACAATCACGCCGGGGCAGCCGCGCCGTCTGTCCCATAA
TGAGCTCGAAATGGCGCGTCAGTACTCCGAGACCAGCGCCAGGATTTCCG
AGATCATCGAGCGCAAGAAGGCCGGAAAGAAGGACAAGGGTGACAAGCAG
GAAGAGCTCAAGAAGGAGCTCGAGATGTGGGAACACAAGGTCACCGTACA
GGAACTCTGCAGCAAGTTGCAGACCGACCCGGAGAAGGGTCTTTCTGACA
ACGAGGCTAAGGTTCGTTTAGAACGAGATGGTCCCAACCAGCTCTCACCC
CCTAAGGTCACCCCGTGGTATGTCAAGCTTCTCAGCCAGTTTATCAATTT
CTTTGCCCTCCTGTTGCAAGTTGCTTCTATTCTTTGCTTCGTTGGCTATG
GACTTGACAATGAGGCTGTGGACAATCTTTACCTCGGTATCGTGTTGTAC
ATTGTCGTCATTATCACCGCCGTCTTTACTTTCTTCCAGGAGTTTAAGAG
TGAGAAGACCATGGAGAAGTTCAAGAACTTCCTGCCGCCGCAGTCTGTGG
CCCGTCGTAGTGGGAAGATTGTCGAGGTCGACGCGTCCACCCTCGTGGTA
GGAGATGTCATCGAAGTCAAGCTGGGTGATAAGATTCCCGCAGATATTCG
TATCGTTTCCAACCAGAAGCTCAAGGTGGACAATTCCCCTCTCACTGGTG
AGTCCGAACCAATTGGTCGAACTGTTGATTGCACCGATGAGAACCCGCTC
GAGACCAAGAATCTTGCTTTCTTCGGAACTCTTGCCGTCGATGGTACTTG
CACTGGTGTTGTCGTCAACACTGGTGATGACACTGTGTTCGGTCGTATCG
CGGGTCTGGCTGCCGGTTCTGTGTCTGAGGTTACAACCCTGCAGATCGAT
ATCCATCACTTCGTTATTATCATTTCTTCCGTCGCTATCTTCCTCGGTGT
GCTCTTTTTCATCATTGGTCTCATCAAGGGTACCCCGGTTATCACCAATG
TCGTGTTCTGTATCGGTATCATTGTCGCCAATGTGCCTGAAGGACTGCTT
GCAACTGTGACGGTGTCACTCACCTTGTCTGCCAAGCGTATGGCTAAGAA
GCAAGTGCTCGTGAAGAAGCTGGAGGCTGTCGAGACCCTCGGATCCACCA
CCTGCATCTGCTCCGACAAGACTGGTACTCTGACTCAGAACCGTATGACC
ATTGTCCATGTCGCTTACGACAAGCAGCTTCACACCACCAAGACTGCCGC
CTCTGAAGCCACCTTCGATCTCGAGGACCCGTGCTTCAAGGAACTGTTCT
TCATTGGTGCCGTGTGCGGTAAGGCCGTGTTCGATGCCAAAGACATGGAC
GATAACCCAGACAAGTCTATTGACGAACGTAAGGTCAACGGTGATGCCTC
CGAAGCGGGTATCCTTAAGTTCTCTGAGAAGATCCGCTCCGTAATTGATA
TGCGCAACAGGAATAAGCAAGTTTGCACTATTCCTTTCAACTCTGCCAAC
AAGTTCATGCTTACGATTAACAAGGTTGCCGACCAAGGAGATCGCCTTCG
CCTTTGCATGAAGGGAGCCCCTGAGCGTGTCATGGACCGTTGCACTACCA
TCCTCACCAAGGATGGCATCCAGCCGTTTGATGCCGCCGCGAAGTCTGTT
ATCAATGAACAACTTGCATTCATGATGGAGCGCGGTGAACGCTGCCTCGG
GTTTGCCAGGTTGGACCTTGACCCAACTGAGTATCCTGTCAACTTCCAGT
TCGATACCGAGGAAATTAACTTCCCAATGAATGGTCTTACCTTCGTTGGC
CTCATGGCTCTCCTTGACCCGCCACGTGAAGCCGTGCCCGCCGCTGTGTC
GACTTGTCAATCCGCTGGTGTTAAGGTCATCATGGTTACCGGTGATCATC
CGGCTACTGCAAAGTCTATCGCCAAGCAGGTGAACATTATCCAGAGCCCT
ACTGCTGAAGACGTTGCGAAGGAGCGTGGTATTTCTGTGGATGAGGTTGA
TCGCTCTGACATCAAGTCTATTGTCATCCCTGGTTCCCAGATCAAGGATC
TTGAACAAGATGACTGGGATCGTATTCTTGCCCACGAGCAGATTGTGTTT
GCACGTACCTCTCCCCAGCAGAAGCTCATCATTGTCGAGAACAACCAGCG
TCTCGGAAACGTTGTGGCTGTCACAGGTGATGGTGTGAATGACTCTCCAG
CGTTGAAGAAGGCTAACATCGGTATTGCTATGGGTATTGCCGGCTCAGAT
GTGTCCAAGGAGGCCGCGGATATGATCTTGCTCGATGACAACTTCGCGTC
TATTGTGAACGGTGTAGAGGAAGGTCGTCTCATCTTCGACAACTTGAAGA
AGTCTATTGCCTACACGCTGACGAGTAACATCCCGGAAATTACCCCCTTC
CTGGCTTTCATCATCGTGCAGATCCCGCTTCCATTGACTACTGTGCTCAT
CCTCTGCATTGATTTGGGTACCGATCTTCTACCGGCTATCTCCCTTGCCT
ATGAGAATCCCGAGTCTGACATCATGCGTCGCCCCCCGCGTGATTCCCGC
GTGGATCGACTTGTGAACCGCCGTCTCATTTCCTTCTCGTACTTCCAGAT
TGGTGTCATTCAGGCCTTGGCTGGTTTCTATTGCTATCTTGTTGTGCTCG
GAGACTTTGGTCTAACTGCTCATATCTTGCCATTCCTTGACGAAGATGCG
TACATTGCCTCCCCGCAGAGTGATGACAAGCGCTGGTTGTATGTCGAGCG
TGACCGTCCGTTCGGAGAGTCTGTGGACGCCGGCTGGTTCGATGAGAATG
GGGACACTGAGCGTTTCTTCCGTGCCCCCGAAGTTCCTGGCTTCATTGTT
CAGAATGACGAGGAACCCGATCAGGTCGGTCTTGTCTACAAACAGCTTCT
GCGGCCGGAGAACATTGATCAGTTGCAGAACATGTACAAGATCATTGGCA
GCGTTACTCAGAGACCGCCATGCTTGGCTTTCAGTTGCACCAACGTCAAT
GATGGCACTGTTGAGAACAACAACTATGTCTGTATCAGTGATCCTACGAG
CTTTGGAGGGATTGACATCCGGGAAGAGGCGCTGACGAATACGGACCGCT
CTGTTACAAGCTTATTCAATACTGAGGTGACCGACGGTAGTGGTGAGGGT
CAGGGTTGCTACGATTTGTACAGCAAGAACCAGCAAGAGGAAGCGCTGAA
GACTGCTCAAACTGCCTTCTTCGTGTGCATTGTCATTGTACAGATGGGTG
GTCTTCTTGTTTGCAAGACTCGAGTGCTTTCGTTCTTCAAGCAGGGAATG
AAGAACATGATTTTGAACATTGGTCTGCTAACTGAGGTGGCCTTGTGTGC
GCTACTCTGCTATGTGCCGTTCATTCAGACGGCGTTCCAAACTCGTAACC
TTCGCTTCGTGCATTGGTTGCCCGCTATTCCGTTCTCTTTGTTTATCTTC
TGCTACGATGAAATTCGGAAGTTCCTTATCCGACAGGGAGACACGAAGGG
TAACAAGTTGGGAGTGTGGCTGCGTGAGAACACATATTGGTAA