EsuBft499_19a-0001 (mRNA) Ectocarpus subulatus male Bft15b

You are viewing an mRNA, more information available on the corresponding polypeptide page

Sequences
The following sequences are available for this feature:

spliced messenger RNA

>EsuBft499_19a-0001 ID=EsuBft499_19a-0001|Name=EsuBft499_19a-0001|organism=Ectocarpus subulatus male Bft15b|type=mRNA|length=3013bp|location=Sequence derived from alignment at Scaffold_30:143952..146964+ (Ectocarpus subulatus male Bft15b)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.  
ATGATGGGCATGCTGCCATCGCTACTGCAGGCCGAGTCGGAAGGGCAAGG
CCAGGAGGGGTCGGCGGCGCTGCAAGAGGGCGCCGCTTGTGCGGCGGAAT
TGGGGGTTCCGCCGAGCAGCCACCGAGAGCTGTGTCCTGCGATGGTCGTC
AGGGAGGGCGACACTGCTGGAGGAGAGAGAAGCAGTAGGTCGGGCGTGGA
AGGCGCCCTGGTGCGGGATGTGGAGGTCCCTGCTGCAGGTGGGTTTGGTG
CATTCCAAGACACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAAGCGGGCATCCTTTGGAGA
ATCGAGTTTGATTGGTTTTTCAGTTGGAAACAGGTCATGATTTTGAGTTC
GTGTAGGATTGCAGATGGTTGAACCGAAGGCAGGGAGAACGTACCTGTTC
GATGCAGTTTTCGTGTGGAATGCAGATAGTCAGGGAGGGCATTGCCTGTA
TGTGTGTGACACCTGAAAAGTCAGTTGGTGCTGCACAGCAAGGAGTTCGT
TCCGTCATGTCGGGAGGATTTGTCAGAGGCGTTGCTCGAGGTAGTAGAGC
GTTGCCTAGAATTTGTAATCCGAGCGTCTGGAGTGGTTTTATCTTTGTCT
TCTTGCAGTACGGCCGCTGGAATCATTGGTGATATGGACGGCTATTGGCT
TTTGTTTGAGCCGTTGGAATCTTGCGTGATATGATCGGCGTGAGGCGTTG
AATTTCTGAGGGGTTTTGATCCGGTGGCCGAGTTTCCCCTTTACTTTTGG
TTTGTCGTTGTGTTTCGGTTTTTCGGACGTATTTTCGACGCACTAGAGGT
TCTTCACTGGCGTAAAGAACCAGGGAGGGTGTTCGTGCGTAGAAGTAGAT
AGTCGAAAAGTAGCCGTTACGTAGGACGCAGCTGGGACAACTTGAAGGGT
ATGTGCTGAGAGGCTTTGGATGATAGTGCGGAGTCCCCGTGTTCTCTCGA
GAATTGGGGCCCTCTCCTCCTTCTCCCTCTCTCCTCTCTCATGCGAGCTA
ATACACACAGTTAAACAGCAGCCCCAAGTCCGCCGGCCCTCAACAGGGCT
AGGGCTCACAAAC
back to top

protein sequence of EsuBft499_19a-0001

>EsuBft499_19 ID=EsuBft499_19|Name=EsuBft499_19a-0001|organism=Ectocarpus subulatus male Bft15b|type=polypeptide|length=89bp
MMGMLPSLLQAESEGQGQEGSAALQEGAACAAELGVPPSSHRELCPAMVV
REGDTAGGERSSRSGVEGALVRDVEVPAAGGFGAFQDTX
back to top

mRNA from alignment at Scaffold_30:143952..146964+

Legend: exonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EsuBft499_19a-0001 ID=EsuBft499_19a-0001|Name=EsuBft499_19a-0001|organism=Ectocarpus subulatus male Bft15b|type=mRNA|length=3013bp|location=Sequence derived from alignment at Scaffold_30:143952..146964+ (Ectocarpus subulatus male Bft15b)
ATGATGGGCATGCTGCCATCGCTACTGCAGGCCGAGTCGGAAGGGCAAGG
CCAGGAGGGGTCGGCGGCGCTGCAAGAGGGCGCCGCTTGTGCGGCGGAAT
TGGGGGTTCCGCCGAGCAGCCACCGAGAGCTGTGTCCTGCGATGGTCGTC
AGGGAGGGCGACACTGCTGGAGGAGAGAGAAGCAGTAGGTCGGGCGTGGA
AGGCGCCCTGGTGCGGGATGTGGAGGTCCCTGCTGCAGGTGGGTTTGGTG
CATTCCAAGACACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAAGCGGGCATCCTTTGGAGA
ATCGAGTTTGATTGGTTTTTCAGTTGGAAACAGGTCATGATTTTGAGTTC
GTGTAGGATTGCAGATGGTTGAACCGAAGGCAGGGAGAACGTACCTGTTC
GATGCAGTTTTCGTGTGGAATGCAGATAGTCAGGGAGGGCATTGCCTGTA
TGTGTGTGACACCTGAAAAGTCAGTTGGTGCTGCACAGCAAGGAGTTCGT
TCCGTCATGTCGGGAGGATTTGTCAGAGGCGTTGCTCGAGGTAGTAGAGC
GTTGCCTAGAATTTGTAATCCGAGCGTCTGGAGTGGTTTTATCTTTGTCT
TCTTGCAGTACGGCCGCTGGAATCATTGGTGATATGGACGGCTATTGGCT
TTTGTTTGAGCCGTTGGAATCTTGCGTGATATGATCGGCGTGAGGCGTTG
AATTTCTGAGGGGTTTTGATCCGGTGGCCGAGTTTCCCCTTTACTTTTGG
TTTGTCGTTGTGTTTCGGTTTTTCGGACGTATTTTCGACGCACTAGAGGT
TCTTCACTGGCGTAAAGAACCAGGGAGGGTGTTCGTGCGTAGAAGTAGAT
AGTCGAAAAGTAGCCGTTACGTAGGACGCAGCTGGGACAACTTGAAGGGT
ATGTGCTGAGAGGCTTTGGATGATAGTGCGGAGTCCCCGTGTTCTCTCGA
GAATTGGGGCCCTCTCCTCCTTCTCCCTCTCTCCTCTCTCATGCGAGCTA
ATACACACAGTTAAACAGCAGCCCCAAGTCCGCCGGCCCTCAACAGGGCT
AGGGCTCACAAAC
back to top

Coding sequence (CDS) from alignment at Scaffold_30:143952..146964+

>EsuBft499_19a-0001 ID=EsuBft499_19a-0001|Name=EsuBft499_19a-0001|organism=Ectocarpus subulatus male Bft15b|type=CDS|length=267bp|location=Sequence derived from alignment at Scaffold_30:143952..146964+ (Ectocarpus subulatus male Bft15b)
ATGATGGGCATGCTGCCATCGCTACTGCAGGCCGAGTCGGAAGGGCAAGG
CCAGGAGGGGTCGGCGGCGCTGCAAGAGGGCGCCGCTTGTGCGGCGGAAT
TGGGGGTTCCGCCGAGCAGCCACCGAGAGCTGTGTCCTGCGATGGTCGTC
AGGGAGGGCGACACTGCTGGAGGAGAGAGAAGCAGTAGGTCGGGCGTGGA
AGGCGCCCTGGTGCGGGATGTGGAGGTCCCTGCTGCAGGTGGGTTTGGTG
CATTCCAAGACACNNNN
back to top