Alignments
The following features are aligned
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| ProteomeId | EsuBft1015_4 |
| Owner | apollo_admin@sb-roscoff.fr |
| Nb exon | 2 |
| Length | 59 |
| Hectar predicted targeting category | other localisation |
| Date last modified | 2016-06-14 |
| Date creation | 2016-06-14 |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
spliced messenger RNA >EsuBft1015_4a-0001 ID=EsuBft1015_4a-0001|Name=EsuBft1015_4a-0001|organism=Ectocarpus subulatus male Bft15b|type=mRNA|length=593bp|location=Sequence derived from alignment at Scaffold_544:307279..317058- (Ectocarpus subulatus male Bft15b)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.
GCTCGCGAGCGACCTCCTCGTGGGCAGGCATCGCTCGATCTTTGGCGACA
GGAGAGGGGCGACTCGTGGAGGGATAGGTGGACACGCGGGGGCGTTTCAT
CAACCTTTGTTCCCCTGATGAACGCCTTCTGCGGGAGTTCTCCGCGCCAC
GCGCCAGCGCCTAGCTACCAGCGCCACACGTCCAACCACAATTTTTTCCA
TCCTCTGTCCCGTCCTTTCCTTCGTTCACCTTCATCATGTCCCATAACCA
GCACCGTCTCACTCCTTCGTCGTCCAACTCGCAAAGGAGGCCCGCCAGCA
ACAGCTCTTCTTCTGGGGGGGGGTCGTCCTCCAGCGGCGGTTCGAGCGGT
TCTTCCAGCAATAAGCGCCGCCACACCAACGGGTCCGGCATCGGCAAGAA
CAGATCCCGGCATGCGGGTATCTTCGACGTCATGGGAGAGGGGGACAACA
ACGTCGACCTCCGACAGGCCGTCGCGGATTTAGTGGAGGCGACATCGAAG
CAAGCAGTTGCCTCTTGTATCCCTGAGGCCGCCGACGCCATGTTGGACGC
CATGCACGTCATGGAGTGGTGACCGGCGCTACGTTCGGCAGTG back to topprotein sequence of EsuBft1015_4a-0001 >EsuBft1015_4 ID=EsuBft1015_4|Name=EsuBft1015_4a-0001|organism=Ectocarpus subulatus male Bft15b|type=polypeptide|length=111bp
MSHNQHRLTPSSSNSQRRPASNSSSSGGGSSSSGGSSGSSSNKRRHTNGS
GIGKNRSRHAGIFDVMGEGDNNVDLRQAVADLVEATSKQAVASCIPEAAD
AMLDAMHVMEW back to topmRNA from alignment at Scaffold_544:307279..317058- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EsuBft1015_4a-0001 ID=EsuBft1015_4a-0001|Name=EsuBft1015_4a-0001|organism=Ectocarpus subulatus male Bft15b|type=mRNA|length=9780bp|location=Sequence derived from alignment at Scaffold_544:307279..317058- (Ectocarpus subulatus male Bft15b)
GCTCGCGAGCGACCTCCTCGTGGGCAGGCATCGCTCGATCTTTGGCGACA
GGAGAGGGGCGACTCGTGGAGGGATAGGTGGACACGCGGGGGCGTTTCAT
CAACCTTTGTTCCCCTGATGAACGCCTTCTGCGGGAGTTCTCCGCGCCAC
GCGCCAGCGCCTAGCTACCAGCGCCACACGTCCAACCACAATTTTTTCCA
TCCTCTGTCCCGTCCTTTCCTTCGTTCACCTTCATCATGTCCCATAACCA
GCACCGTCTCACTCCTTCGTCGTCCAACTCGCAAAGGAGGCCCGCCAGCA
ACAGCTCTTCTTCTGGGGGGGGGTCGTCCTCCAGCGGCGGTTCGAGCGGT
TCTTCCAGCAATAAGCGCCGCCACACCAACGGGTCCGGCATCGGCAAGAA
CAGATCCCGGCATGCGGGTATCTTCGACGTCATGGGAGAGGGGGACAACA
ACGTCGACCTCCGACAGGCCGTCGCGGATTTAGTGGAGGTGAGACCCTAT
GTGTTGGAGCACACATCTCGCACATTGTCTCCGATGACTGTACAACAGTT
AGTCAAGTGCATGTCGTGCTCTTGTCCCAGTAGCATGCGTGGCTTGCTGC
AGGTCACACGCTGAACTGTTCGTCAGCCAGACCTGGAGTCTGAAACCCCG
ACCTTCTCGTCCTGCTGTGGCCCACCGATCCCCTGATGCATGTAGCATGA
TGTGCTACTGCCAGCCTTTCCTGTGTTCATTCTCCTATCTTAACCGCTGG
CATCTGCGCCTCCTGTCCACACAACCCTTGTTGGAAAAAGGCCCGAGAGA
CTCATATTCGTAAAAGCAACGATTCAAATTCCAAGGTAGCAGCGGAAGTA
GCATACACAGCTGATGTGTATATGCATACAACACCTGCGGAGAATGTTAG
ATTTTTGATCCGTATAGTGTGACACCTGTTGTGCATTGTTGTCACCTGTT
TGCCTGCCGATGCACGCGCGCGGCGGGGGGGGGGAGGTGCAAGCACGGCT
CCACATTTTAGTCGCCGACACTTCTCTCCTCTCCGTATTTCTCATCGCAC
AAGCCTCTGCTCGGCGACATTCCGGTTCTCACGCGATCAACAGGACCACT
TCGACCCTAAGTAGCAGTGCACAACCTGCAAGTACCTCGTTATTGGTTTG
CTGTTGCATGGCGTATCAGCCGCAAATTCCATTCTACACCTACAAGCATT
CTCAAGAGCCTCGTTCCTGATGCTCTTCTGCGTGGTGGGCGATGACCCTC
AAGCAGCCGGACTTTCGCCCTTTCACCTCGACGACGTTTCCACTGCGTCT
CATCCATTTATCTGCCGCGCCGTGGTCGTGAAACGAAGTACGTCGGAAAC
CTTGCCTACTGCTGTTCATAGCATGACTGTGGAGGCGATACGCTGTGTCA
TGTACTGCTATGTAACACCTGCGTGTTGTGTGCCTCTCCTGGGCCCCTCT
GACTTGCTGTACACAATCCCCAAGCCGCGGGTCCCTTGTTCGTAAAACTG
CTCCTGTGCATGCATACTTAGTACACATAGCATACAGCAGTAGTACTGCT
AAAGTTTGGCTGATTGGCTTCAGCAACAGTTTCCACACTGGAGCCATGTC
AGCCTTGGGCCCTCAGGACTGTACAGAGTCTCCCCAGTGAGCGGACGTGA
TTTATTGTTGACCCATGACCTGGCACTGACTGCCTACTAGGGTTTATCTT
TACCATTCTGTTACACAGAAAGCTTTTTTGTCGCATTTTCCGTTCTCTAC
TGCCTTGACACTTGAGACCGCTCCATGTCTCTCGCCCCCCTCCCTTCGAG
CTTATCCACCGGACGGGGAAGGTATGACCTACAATATAAACTAGCATGCG
AGTACCGCGGCTTACTTCGTGCGTGGGACGCAGGTCAATCGGCCTCCCCC
CCTTCATCCACAGCACACGCATCTGACATCCACGTGCCTGCCTCGACGTG
TCTGCTTGTTGTCAAACTCGCGGAAGGCGACATCGAAGCAAGCAGTTGCC
TCTTGTATCCCTGAGGCCGCCGACGCCATGTTGGACGCCATGCACGTCAT
GGAGTGGTGACCGGCGCTACGTTCGGCAGTGCTTTGCCGCCTGGCCAAAG
CCGAAGGCCTGATGGTGAGAGACTACACGTCAAAGCATCCAACCAATCCG
AAGCGTTTGACGGAGAAAGGAGCCACAAGCAATTTACGGTCCTGAGACGT
GTACATCTCTAGGTGGTTGGACGAGGGTATCTTCGAACGTAGATGTCGGA
TACGAAAGCCCCCCGCACGTGGGCGTCGGGAATTCATTTCCAAACCTTTG
ATTGAATCACCGTACACACACAAGCCACTCTCAGGTTGGAAGTTCGTGAT
CCCTGCGCGTTCGATTCATATCTCTCGACGAAATATTTGACAGCTTTGTC
GGAGTTACCCGCGACCAAGAGTTTGTATTGTACACAAGCGTGCACCTACA
GATTTTATTGCTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAGACAGCCATGGCTAAATT
TTCACGCCCCTGTGCATGAAAATTATTCTTTTTCTCGTGTGTACATACTC
CACACACGATCCCTCTAAACAGCGTTTTTTTTGCAAAACAAAACAAAAAG
CGCACCCACCCCTAACGGGCCCCACTTTTTCAAAAAAAAAACTATTTTAA
ACTAGCATGTTTACTTCGTGCGTGGGACACAGGTCAAACGGCCTCCCCCC
CTTCATCCACAGCACACGCATCTGACATCCACGTGCCTGCCCCGACGTGT
CTGCTTGTTGTCAAACTCGCGGAAGGCGACATCGAAGCAAGCAGTTGCCT
CTTGTATCCCTGAGGCCGCCGACGCCATGTTGGACGCCATGCACGTCATG
GAGTGGTGACCGGCGCTACGTTCGGCAGTG back to topCoding sequence (CDS) from alignment at Scaffold_544:307279..317058- >EsuBft1015_4a-0001 ID=EsuBft1015_4a-0001|Name=EsuBft1015_4a-0001|organism=Ectocarpus subulatus male Bft15b|type=CDS|length=336bp|location=Sequence derived from alignment at Scaffold_544:307279..317058- (Ectocarpus subulatus male Bft15b)
ATGTCCCATAACCAGCACCGTCTCACTCCTTCGTCGTCCAACTCGCAAAG
GAGGCCCGCCAGCAACAGCTCTTCTTCTGGGGGGGGGTCGTCCTCCAGCG
GCGGTTCGAGCGGTTCTTCCAGCAATAAGCGCCGCCACACCAACGGGTCC
GGCATCGGCAAGAACAGATCCCGGCATGCGGGTATCTTCGACGTCATGGG
AGAGGGGGACAACAACGTCGACCTCCGACAGGCCGTCGCGGATTTAGTGG
AGGCGACATCGAAGCAAGCAGTTGCCTCTTGTATCCCTGAGGCCGCCGAC
GCCATGTTGGACGCCATGCACGTCATGGAGTGGTGA back to top
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