EsuBft1004_5a-0001 (mRNA) Ectocarpus subulatus male Bft15b

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Properties


Property Name	Value
ProteomeId	EsuBft1004_5
Owner	apollo_admin@sb-roscoff.fr
Nb exon	1
Length	280
Date last modified	2016-06-13
Date creation	2016-06-13

Sequences

The following sequences are available for this feature:

mRNA - spliced transcript sequence
protein sequence
mRNA from alignment at Scaffold_442:22316..25124-
coding sequence from alignment at Scaffold_442:22316..25124-

spliced messenger RNA

>EsuBft1004_5a-0001 ID=EsuBft1004_5a-0001|Name=EsuBft1004_5a-0001|organism=Ectocarpus subulatus male Bft15b|type=mRNA|length=2809bp|location=Sequence derived from alignment at Scaffold_442:22316..25124- (Ectocarpus subulatus male Bft15b)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.  
ATGAACTCTTCGAAGCGGTTTCTGTTTTTCAGCTGTACTGAGACNNNNNN
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AGATTGGGAGCCCGTGGTCTCAAAACCCGGCATACACGACCCCACGAAGA
AACAGAAAAAAATAGGGTACAAAAACCACTCGGAAGAGAAACAAAAAGAA
AGAAAGACCAGCTACCGCACCAAACGAGAAAGAGCGTCGAGGAGACCGAT
CAAAATAAAATAAAAGGAGAACGGGGAACGCTTCCCACACCCGCCTACAA
TATATATGTATGTCGCTTCTTTGTGACCTGGGCTGCGGGAGGTGCGTCCC
CGGAAACCAAAACGCCTTTACAACACTTGAGCAGCAGCAAGCAGCAAGCA
GCAGCAGCAAGCAACACAGCAGCAGCACGAACACACAAACAGCCAATAGG
CACCAGCCTGCTCACCTGCATGGCTATTACTACTTGGTGTCATCCACCAC
AGACGCTTCCTACGTCACCTCTAGCATGGAACTTGAAGGACCCACGCACT
GCCAGCAGCAAACATGGTATCATAGCGTAGCAGCTACATATATTTGTATT
ACCGCAGCA

protein sequence of EsuBft1004_5a-0001

>EsuBft1004_5 ID=EsuBft1004_5|Name=EsuBft1004_5a-0001|organism=Ectocarpus subulatus male Bft15b|type=polypeptide|length=50bp
MNSSKRFLFFSCTETXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

mRNA from alignment at Scaffold_442:22316..25124-

Legend: exonpolypeptideCDSthree_prime_UTR

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>EsuBft1004_5a-0001 ID=EsuBft1004_5a-0001|Name=EsuBft1004_5a-0001|organism=Ectocarpus subulatus male Bft15b|type=mRNA|length=2809bp|location=Sequence derived from alignment at Scaffold_442:22316..25124- (Ectocarpus subulatus male Bft15b)
ATGAACTCTTCGAAGCGGTTTCTGTTTTTCAGCTGTACTGAGACNNNNNN
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AGATTGGGAGCCCGTGGTCTCAAAACCCGGCATACACGACCCCACGAAGA
AACAGAAAAAAATAGGGTACAAAAACCACTCGGAAGAGAAACAAAAAGAA
AGAAAGACCAGCTACCGCACCAAACGAGAAAGAGCGTCGAGGAGACCGAT
CAAAATAAAATAAAAGGAGAACGGGGAACGCTTCCCACACCCGCCTACAA
TATATATGTATGTCGCTTCTTTGTGACCTGGGCTGCGGGAGGTGCGTCCC
CGGAAACCAAAACGCCTTTACAACACTTGAGCAGCAGCAAGCAGCAAGCA
GCAGCAGCAAGCAACACAGCAGCAGCACGAACACACAAACAGCCAATAGG
CACCAGCCTGCTCACCTGCATGGCTATTACTACTTGGTGTCATCCACCAC
AGACGCTTCCTACGTCACCTCTAGCATGGAACTTGAAGGACCCACGCACT
GCCAGCAGCAAACATGGTATCATAGCGTAGCAGCTACATATATTTGTATT
ACCGCAGCA

Coding sequence (CDS) from alignment at Scaffold_442:22316..25124-

>EsuBft1004_5a-0001 ID=EsuBft1004_5a-0001|Name=EsuBft1004_5a-0001|organism=Ectocarpus subulatus male Bft15b|type=CDS|length=150bp|location=Sequence derived from alignment at Scaffold_442:22316..25124- (Ectocarpus subulatus male Bft15b)
ATGAACTCTTCGAAGCGGTTTCTGTTTTTCAGCTGTACTGAGACNNNNNN
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