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Alignments
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Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Properties
| Property Name | Value |
| Seed ortholog | 2880.D8LGZ6 |
| ProteomeId | EsuBft451_26 |
| Protein domains | SSF51735 |
| Protein domains | PTHR24322 |
| Protein domains | IPR020904 |
| Protein domains | IPR002347 |
| Protein domains | TMhelix |
| Protein domains | IPR002198 |
| Protein domains | SignalP-TM |
| Protein domains | SIGNAL_PEPTIDE_N_REGION |
| Protein domains | NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN |
| Protein domains | IPR016040 |
| Protein domains | SIGNAL_PEPTIDE |
| Protein domains | SIGNAL_PEPTIDE_C_REGION |
| Protein domains | SIGNAL_PEPTIDE_H_REGION |
| Owner | apollo_admin@sb-roscoff.fr |
| Note | dehydrogenase reductase sdr family protein 7-like os:drosophila melanogaster gn:cg7601 pe:2 sv: [Automatic annotation] |
| Nb exon | 6 |
| Max annot lvl | 2759|Eukaryota |
| Length | 1192 |
| Hectar predicted targeting category | signal peptide |
| Evalue | 1.65e-210 |
| EggNOG OGs | COG1028@1|root,KOG1205@2759|Eukaryota |
| Ec32 ortholog description | NAD(P)-binding domain |
| Ec32 ortholog | Ec-14_001330.1 |
| Date last modified | 2016-06-14 |
| Date creation | 2016-06-14 |
| Preferred name | DHRS7B |
| KEGG ko | ko:K11166,ko:K11167 |
| GOs | GO:0000140,GO:0002376,GO:0002520,GO:0002521,GO:0002573,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004745,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005783,GO:0005789,GO:0006629,GO:0006662,GO:0007275,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0008611,GO:0009058,GO:0009987,GO:0010522,GO:0010880,GO:0010959,GO:0012505,GO:0014801,GO:0016020,GO:0016491,GO:0016528,GO:0016529,GO:0016614,GO:0016616,GO:0018904,GO:0030097,GO:0030099,GO:0030154,GO:0030223,GO:0030851,GO:0031090,GO:0031984,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032879,GO:0033017,GO:0034762,GO:0034765,GO:0042175,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043269,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044432,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0046485,GO:0046504,GO:0048513,GO:0048534,GO:0048731,GO:0048856,GO:0048869,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051049,GO:0051279,GO:0051282,GO:0051924,GO:0055114,GO:0060341,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071704,GO:0097384,GO:0098588,GO:0098827,GO:1901503,GO:1901576,GO:1903169,GO:1904062 |
| Description | oxidation-reduction process |
| COG category | IQ |
| BRITE | ko00000,ko01000 |
Cross References
External references for this mRNA
| Database | Accession |
| GO | 0016614 |
| GO | 0044432 |
| GO | 0005794 |
| GO | 0098588 |
| GO | 0044425 |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
spliced messenger RNA >EsuBft451_26a-0001 ID=EsuBft451_26a-0001|Name=EsuBft451_26a-0001|organism=Ectocarpus subulatus male Bft15b|type=mRNA|length=1192bp|location=Sequence derived from alignment at Scaffold_284:556697..569055- (Ectocarpus subulatus male Bft15b)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.
GCCGAGCTGCCATTGCGTCCGGCGTCCGCTGCTACTTCTTTACTTGCCTG GTGCCTCGAGGCACAATGCTGAATGCCATGGTTGCGACATCGCTGACTAC GGTCTTCCTAGTCGTAAGCCTTCCTTCCGCACTGATGCTGGTGCTGACGA GGGTGACAGGGAAAAGAAGAATAGCCTACCTGCCCGGCAAGGTGGTTTGG ATTACCGGCGCTTCCTCCGGGCTAGGCGAGCAGCTTGCGATATCGGCGGC GGCCGGAGGCGCGGAAGGGCTGATCCTCAGCGGGCGGCGCGAGGACGCCC TCGAGAGGGTGAAAGGGGCGTGCGAAGCAACCGTCAAGGACAGGGCGGTA CGAGTCCGGTTGCTCCCGTTCGACGTCGCGGACTTGGAGTTCGCGGAGAA GGAGGCGGCAGCGAGGGCCTTGGGAATGTTCGGGCGGGTAGACGCGCTTG TGCTCAACGCCGGGATTTCCACTCGAGGAAGCGTAGCAGAAACACCCCTC GAGGTGGATAGGCGCGTCATGGCTGTCAACTACTTTGGCCCGGTCGGCCT GGCGAAGGGCCTGCTGGAGGCGACCCGGGATCTCCCGCCGCCGGAAACAC GGACAACCGCAAGGTCGACTGGGGCAACAGCGGTGCTAACAACACCGGCG ACACCACCCGAGGTGACGGCAACAGATACGCCCGCTAAAGGGAGTGGTAG CGGGCCAACAACGATGGCAGCCGGAGGGCCGGGTGCAGGTTCGGGATCGG AGGGTGTCCGGTTCGTGGTGATCAACAGCGTCCAGGGCAAGTTCGGCATG GCCAATCGGTCGAGTTACGCGGCCTCAAAGCATGCTCTGGTGGGGTTCTT CGACAGCTTGAGAGCGGAGCAAGCACGCAGGGGAGTCGGCGTTCTCAACA TCTTCCCGGGATACGTCCGCACTAGCTTGTCGGTGAACGCGCTCACTGCG GACGGCACCAAGCATGCTCAAATGGACGCCCCCACTGCGCAAGGCCGTGA CCCGAGGGAGGTCGCCGATGAGATCTGGCAGGCGGTGTCTCAGGGACAAG ACGAGGTGGTGATTGCCGACCTGAAGACGAAAGTGGCGGTGCTGCTAAGA GCGCTCGCGCCCCGAGTGCTGTTCGGGATCATGGCCAAGCGAGCTCTCAA GGCCAAAGAGGGGGCACAATGAACAGAGGAAAAGAAAGAAGG back to topprotein sequence of EsuBft451_26a-0001 >EsuBft451_26 ID=EsuBft451_26|Name=EsuBft451_26a-0001|organism=Ectocarpus subulatus male Bft15b|type=polypeptide|length=368bp
MLNAMVATSLTTVFLVVSLPSALMLVLTRVTGKRRIAYLPGKVVWITGAS SGLGEQLAISAAAGGAEGLILSGRREDALERVKGACEATVKDRAVRVRLL PFDVADLEFAEKEAAARALGMFGRVDALVLNAGISTRGSVAETPLEVDRR VMAVNYFGPVGLAKGLLEATRDLPPPETRTTARSTGATAVLTTPATPPEV TATDTPAKGSGSGPTTMAAGGPGAGSGSEGVRFVVINSVQGKFGMANRSS YAASKHALVGFFDSLRAEQARRGVGVLNIFPGYVRTSLSVNALTADGTKH AQMDAPTAQGRDPREVADEIWQAVSQGQDEVVIADLKTKVAVLLRALAPR VLFGIMAKRALKAKEGAQ back to topmRNA from alignment at Scaffold_284:556697..569055- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EsuBft451_26a-0001 ID=EsuBft451_26a-0001|Name=EsuBft451_26a-0001|organism=Ectocarpus subulatus male Bft15b|type=mRNA|length=12359bp|location=Sequence derived from alignment at Scaffold_284:556697..569055- (Ectocarpus subulatus male Bft15b) GCCGAGCTGCCATTGCGTCCGGCGTCCGCTGCTACTTCTTTACTTGCCTG
GTGCCTCGAGGCACAATGCTGAATGCCATGGTTGCGACATCGCTGACTAC
GGTCTTCCTAGTCGTAAGCCTTCCTTCCGCACTGATGCTGGTGCTGACGA
GGGTGACAGGGAAAAGGTGTGCGTGTTTCCGGCAAAACTCCCAACTCAAA
CACGAGATCACTCCACTACTTGCCTAGACACACATACATGTGTATGCATA
GGTTGCGCAGTCGATTCCCGTTTATTTTCTATTTTCCCGCTCGAGAATTA
TTTTGTGCTTGTTGGCTACAATGCTGGCCCTTACTGTGAGAAGAGTCGCG
GACTCCTGCTGGACGTGCGAATGGATGGATCCACAGATCGTCTATTTATC
GTCGATCTGCTGTTCATCCGCACGACGATTGGTAATCACGCCGCATTTGG
TTGATCGGGGGTGCGGAGTGCGGAGTGCGAGTGTGGAAATGTGGATCAGC
ATGTAGTGCACTCTGCTGGATGCCGAACTTAGTTGAGTGTGTTTAAGTGA
AGTATAGTCACTTATTAGAAAGAAGTGATGTCAGCATTGTTGTTGTAGGT
GTGTTTTGTTTGTTTTCAACTACTTCAGATGGAGAACAAACATATGAAGT
ATTTGTTGCTTCTCTGATATCTCTAAATACTAGATTATGGTAGTCTAGAC
CAATGTGTCGGAGTTCATTTGAGAAGTACAAGGTTCCATGTGTTCATGAG
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CGAGCTGTACATCACGATGGGTGCCTTTTGCCAACAGCAGTTTCCAAGCG
AAGGGTGATTTTCAAACATAGCCACTACACATTCAACCTGTTTTTTATCC
CACCCACCACAACATTCTCCCGCAATAATTGATCCCCCGCTCTCTCGAAC
GCCCCGCCCCCCCCGCCGTTTGCAGAAGAATAGCCTACCTGCCCGGCAAG
GTGGTTTGGATTACCGGCGCTTCCTCCGGGCTAGGCGAGCAGCTTGCGAT
ATCGGCGGCGGCCGGAGGCGCGGAAGGGCTGATCCTCAGCGGGCGGCGCG
AGGACGCCCTCGAGAGGGTGAAAGGGGCGTGCGAAGCAACCGTCAAGGAC
AGGGCGGTACGAGTCCGGTTGCTCCCGTTCGACGTCGCGGACTTGGAGTT
CGCGGAGAAGGAGGCGGCAGCGAGGGCCTTGGGAATGTTCGGGCGGGTAG
ACGCGCTTGTGCTCAACGCCGGGGTAAGCAAAAATATTTTGCGAACGAAT
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CGATATCCCTTGCCACCTTTTCAACCCACCTCCTATGCCCCAGTACAGCT
ACCGTCCTTTCCTCTCTATCCCATGCCTCAACCATCTCCCTGTATGTTCC
ATTTTTTTTCCCAGCTCAGTCACGTACACTTCCCTCTCCTTCTTGTACAA
CGGACATTCCGCGACTACATGAACACGGTCTTCGCATTCGAAGCCGCAAT
CACATTTGAACTCGTCGTCTTCCTCGTCTACCGTCCTATGTCTTCGTCGA
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GACGCTAAATAGCGCCTCCAACATAGGCTCGTAGTCTAGATCCAAGTTCA
CACCTCCTGACACAAGTACCCCTAGTCTTGTGCCGGGCGCTCTGCTTAGT
TAACACCCAGGCGTCTCCCGACCACCCAATTTATCATCTCCGAAGTCCCG
CGATACAGGCTACTTTCCTCCTGGGAGGTCATTTTCACCACAATAAGTTC
AGGGACGACTTGCATAGCCTAAGATCCTACTCACACGCCGGGATGGGGCG
TACACCAACGTCCAGCTTCTCATGTACGCTCCACCATGGGTTGCTACCCC
ACTTACGCTCCCGAGTAGACCTATCTGCCGAAAGTTTGGCCAACAATTCC
TTACTGCTTTGAACTCGCTTCTCTCCAATCGAAAACAATGCATTGTGCGT
GCCGCACATCTAGCTCCGCAGTTTTTGCGTGTTTGGCCTGGTCGTCCAGC
TTGCTCGACGTGAGTAGTAAGCTTTGCTTTGATGGCTCTATGTTTTATTG
ATCCACTTCAAGCAACGAACACACACCCCCTCTCCACCGTTCGATCCATT
TTGGATCTCACGCCGGAGAGTTTTGGGGTGTCTTAGCTCTAAGTCCTCCA
CAGCCCAATGGGGGACTTTAGTATTTTTTGATGCCGTACCAATAGGCATT
AACCTTGGTAAGCTTGTGCTTACTTTGGACTGTACCCTCCTCATCCTCTC
GGGGAGGTAGAGTTCTATGTGTACTGCATCCTCGAATTGTCCCCTCACTA
TTGCTACTGTGGATTTTCAGCATACAGCTATCCTCACTCAACGCATCTAT
GTGTCCGGAAATCTCAAATACAAATCAACCTGAGCTTTCCGTATGCAGGT
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GAGGTTTCAGTATGCAGCTATCCTCGCTCAGCACGTCTAGGTGTCTCGCA
ATCTCCAATACAAATCACCTGCGAGGTTCAATGTGTCTATCCTCATTCAA
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TATGTGTCTGGCAATCTCAAACCTCACTCAACCCGTGGGGTTTCAGTATG
CAGCTATCCCCACTCAACCCGTCTATGTGTCTGGCAATCTCAAACCTCAC
TCAACCCGTGGGGTTTCAGTATGCAGCTATCCCCACTCAACCCGTCTATG
TGTCTGGCAATCTCAAACCTCACTCAACCCGTGGGGTTTCAGCATTCAGC
TATAATCACTCAACACGTCTCTATGTGTCCGGCAATCTCCTGCATCACTC
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TCTTCTTTTTGGGCCCATGCGTCCACCTCCTTCTTCAACGCTTGATCAAA
AGCTTCATTCCATGAGGGCACTCCAAGTCTCTTGTAGTGTCCTGCTAGAA
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ACCAAGCGCGAAGCGCCGTGAGATATTCGGCGAGCAGCATGAAGGGTGCG
CTGCATCCTGCTAAGGGTTTTCGACGTCTTGTGCTTACTTCCTTGCGTAG
ATGACAGCTGCGCATGACTCAATTTATTTTCTGGTGCTTTCACTTCCAGA
GACAGTTGTAAGAATTGTGTAACTGCCTCGAGGGTGCTTGACCAATTTAA
TACAACGTGGTGCGATCATCCCCCTTGCGCGGAGTGAGGCTTATCCGCCC
CGCACAACATGATCCACTCGACCACCATTCATGGTTACCGCCAAAAAAAA
AAACGGAGGTAAAAAAAATAACGGTAACCTGGTTGCCGAGTTCACGAAGT
GAATTGGCTCGTTTTACAACGTCGTTGCCAAGCGACGAAAACCCAATCCC
TATGGCAAACACCGGGGGGGACGGTACGGCGGGGATCTATCTATTGACCG
ACATGATATTTTCTGCGGTGTAGGGTGGAGCAAATCGTTATTTCCACCTG
CGACGCTAACTTTCACAATCAAGAACAGATGTGTCCTTCTGTCGTAAAAA
CAGAGTGGTACACACTCAGCGCGCCGGCGACTCAGCCGGGTCAATATATG
TGTGTCTCTGCAGAGTTGTCACTTCGCCCCACCTTGGAGCTTGCATAGCT
ATTGTACATGGCTCATTCAAGCTGGGTGGTGCCTTGATCCGGTCGAATCG
TCGCTCCAATTGTAGTACGAAGGAGCTCAACGTTAACTATTTTTTCTTTC
CATGTTTCCCACCTCCTTACACACCTTACACTGGCTGACCGATCACGTAC
AATCGTGCTTGAATCAAACGTGGACATCGACTCATTCTCAGATTTCCACT
CGAGGAAGCGTAGCAGAAACACCCCTCGAGGTGGATAGGCGCGTCATGGC
TGTCAACTACTTTGGCCCGGTCGGCCTGGCGAAGGGCCTGCTGGAGGCGA
CCCGGGATCTCCCGCCGCCGGAAACACGGACAACCGCAAGGTCGACTGGG
GCAACAGCGGTGCTAACAACACCGGCGACACCACCCGAGGTGACGGCAAC
AGATACGCCCGCTAAAGGGAGTGGTAGCGGGCCAACAACGATGGCAGCCG
GAGGGCCGGGTGCAGGTTCGGGATCGGAGGGTGTCCGGTTCGTGGTGATC
AACAGCGTCCAGGTACTCTACCCGAACCTAGAGCAAAAAGCCTCCTAAGA
ATTACCCTGATCAACATGTCTCACACGGCAACGCTTGTTCTGTAGACACG
AGAGGAAGTTCCGAATATTCTGAGCGTAGCAGCTCGTACCTCTAGATGAA
GCGTCATCCGGGCAGACGTAGGTACAGTAGGTCCCTTTACGCCCATGTGT
TGGCCTTGAATAGACGAGCTATTTTTGTTTTGTTTCTGCAGGGCAAGTTC
GGCATGGCCAATCGGTCGAGTTACGCGGCCTCAAAGCATGCTCTGGTGGG
GTTCTTCGACAGCTTGAGAGCGGAGCAAGCACGCAGGGGAGTCGGCGTTC
TCAACATCTTCCCGGGATACGTCCGCACTAGGTTCGTCAACGCATGTGGC
GAGAGGAAAATTGGCATTTTGAACAGCTCCAAGTAGACGCTCAGAAAGTG
CGCCCCTAGCACCCCCACCCACCCCCCAATTAGTTGAGTTGGTTGGTCGG
GGTCATGGATGGCTTTCGTTGAGTTGTTGCACAGCAGCCGCCGAGCCCGG
GCTGGAAGCTGAAGCCGCCTTTGTTTACCCCTTTTTCTGGTGTTCCGAAC
ACGATGAAGAGCTTCCTTGGTCCCTTTCCGAACAAGTTACGCCGTGGATG
GTTGACCTTTGCAACCTCCTTCTGGGAATGTTTTGTCTGTCTGCGTTCGT
TCGCTCTTTGTAGCTTGTCGGTGAACGCGCTCACTGCGGACGGCACCAAG
CATGCTCAAATGGACGCCCCCACTGCGCAAGGCCGTGACCCGAGGGAGGT
GGGAAACGTTAACCGGGGCTTGCTTGTGCTCTGCCTGATACCGCTGCTGC
TGCTGTTGCGTGAACGCTGTGGTGCCGACGTGCGACAACCTAGACAATAC
GGGTGGAGATTTTTGAATCGAGGCTTGTGTACTACTGCAGGCGTAAGAGC
CGCTCCTGTGCCGGAATTGATTTCCAGACCGCATGGTCAGTGTCGAGGTC
TCGAAAGAGAGCGAAGTGGCTCGCCACACTCCTCTCTTGCACCGCAGCCG
ACCTTTCTTACGCTCTACATTTCGGTTCGACGACATTTTCGCCTGCGCGT
TCCTTCTTTCGTTGCGTTGCTTCGAAGGTCGCCGATGAGATCTGGCAGGC
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TGGCGGTGCTGCTAAGAGCGCTCGCGCCCCGAGTGCTGTTCGGGATCATG
GCCAAGCGAGCTCTCAAGGCCAAAGAGGGGGCACAATGAACAGAGGAAAA
GAAAGAAGG back to topCoding sequence (CDS) from alignment at Scaffold_284:556697..569055- >EsuBft451_26a-0001 ID=EsuBft451_26a-0001|Name=EsuBft451_26a-0001|organism=Ectocarpus subulatus male Bft15b|type=CDS|length=1107bp|location=Sequence derived from alignment at Scaffold_284:556697..569055- (Ectocarpus subulatus male Bft15b) ATGCTGAATGCCATGGTTGCGACATCGCTGACTACGGTCTTCCTAGTCGT AAGCCTTCCTTCCGCACTGATGCTGGTGCTGACGAGGGTGACAGGGAAAA GAAGAATAGCCTACCTGCCCGGCAAGGTGGTTTGGATTACCGGCGCTTCC TCCGGGCTAGGCGAGCAGCTTGCGATATCGGCGGCGGCCGGAGGCGCGGA AGGGCTGATCCTCAGCGGGCGGCGCGAGGACGCCCTCGAGAGGGTGAAAG GGGCGTGCGAAGCAACCGTCAAGGACAGGGCGGTACGAGTCCGGTTGCTC CCGTTCGACGTCGCGGACTTGGAGTTCGCGGAGAAGGAGGCGGCAGCGAG GGCCTTGGGAATGTTCGGGCGGGTAGACGCGCTTGTGCTCAACGCCGGGA TTTCCACTCGAGGAAGCGTAGCAGAAACACCCCTCGAGGTGGATAGGCGC GTCATGGCTGTCAACTACTTTGGCCCGGTCGGCCTGGCGAAGGGCCTGCT GGAGGCGACCCGGGATCTCCCGCCGCCGGAAACACGGACAACCGCAAGGT CGACTGGGGCAACAGCGGTGCTAACAACACCGGCGACACCACCCGAGGTG ACGGCAACAGATACGCCCGCTAAAGGGAGTGGTAGCGGGCCAACAACGAT GGCAGCCGGAGGGCCGGGTGCAGGTTCGGGATCGGAGGGTGTCCGGTTCG TGGTGATCAACAGCGTCCAGGGCAAGTTCGGCATGGCCAATCGGTCGAGT TACGCGGCCTCAAAGCATGCTCTGGTGGGGTTCTTCGACAGCTTGAGAGC GGAGCAAGCACGCAGGGGAGTCGGCGTTCTCAACATCTTCCCGGGATACG TCCGCACTAGCTTGTCGGTGAACGCGCTCACTGCGGACGGCACCAAGCAT GCTCAAATGGACGCCCCCACTGCGCAAGGCCGTGACCCGAGGGAGGTCGC CGATGAGATCTGGCAGGCGGTGTCTCAGGGACAAGACGAGGTGGTGATTG CCGACCTGAAGACGAAAGTGGCGGTGCTGCTAAGAGCGCTCGCGCCCCGA GTGCTGTTCGGGATCATGGCCAAGCGAGCTCTCAAGGCCAAAGAGGGGGC ACAATGA back to top
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