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Homology
BLAST of Ec-sdr_f_000150.1 vs. uniprot
Match: D7G5V7_ECTSI (Uncharacterized protein n=2 Tax=Ectocarpus TaxID=2879 RepID=D7G5V7_ECTSI) HSP 1 Score: 320 bits (820), Expect = 2.130e-106 Identity = 151/225 (67.11%), Postives = 187/225 (83.11%), Query Frame = 1
Query: 1 MDPAGIATIFVLGPSHHVRLRGCAVSKASCLETPLGDLPVNHDITQALLASGQFEALTQHIDEEEHSIEMHLPFIKKVMEQRTVSVVPILVGALSERREEFYGRVLAPYMDDSSNFFVISSDFCHWGSRFRFQAHDPTHGAIHDHIHWLDHQGMMLIQAQNAVGFGQYLAKHGNTICGRHPIAVFVNAINMSSTNFSVAWVKYAQSSKVVSPQESSVSYASAVVT 675
MDP+ +A +FVLGPSHHV +R CAVS AS LETP+GDL ++ D+T+ LLA+G F+A+T +DE+EHSIEMHLPFIKKVME R +VV I++GALS EE YGR+LAPY++D +NFF+IS+DFCHWGSRFR+Q H AIH+HI WLDH+GM LIQ+Q+AVGF +YLA+HGNTICGRHPIA F+NAI S+ V WV+YAQS+KVVSPQ+SSVSYASAV+T
Sbjct: 122 MDPSKLARVFVLGPSHHVHMRRCAVSTASRLETPIGDLAIDQDVTRQLLATGDFDAMTARMDEDEHSIEMHLPFIKKVMEGRPCTVVAIMIGALSAELEEHYGRILAPYLEDLTNFFIISTDFCHWGSRFRYQPLGAAHSAIHEHISWLDHEGMKLIQSQDAVGFHRYLAEHGNTICGRHPIATFINAIEASTVCICVTWVEYAQSTKVVSPQDSSVSYASAVLT 346
BLAST of Ec-sdr_f_000150.1 vs. uniprot
Match: A0A835YR11_9STRA (MEMO1 family (Fragment) n=1 Tax=Tribonema minus TaxID=303371 RepID=A0A835YR11_9STRA) HSP 1 Score: 265 bits (677), Expect = 1.150e-84 Identity = 127/229 (55.46%), Postives = 167/229 (72.93%), Query Frame = 1
Query: 1 MDPAGIATIFVLGPSHHVRLRGCAVSKASCLETPLGDLPVNHDITQALLASGQFEALTQHIDEEEHSIEMHLPFIKKVMEQRTVSVVPILVGALSERREEFYGRVLAPYMDDSSNFFVISSDFCHWGSRFRFQAHDPTHGAIHDHIHWLDHQGMMLIQAQNAVGFGQYLAKHGNTICGRHPIAVFVNAINMSSTNFSVAW----VKYAQSSKVVSPQESSVSYASAVVT 675
+DP +F+LGPSHHV L GCA+S A+ L+TPLG L V+ D+ L+ +G+FEA+TQ +DE+EHSIEMHLP++KK M SVV I+VGA SE E YG +LAPY+ D +NFF++SSDFCHWG+RFR+Q HD GA+H++I WLDH GM L++AQ+ GF YL +H NTICGRHPI F++A+ ++ S W V+YAQSS S ++SSVSYASAVV+
Sbjct: 129 LDPRVTKRVFILGPSHHVHLSGCAISLATHLDTPLGQLAVDKDVVAQLMRTGKFEAMTQDVDEDEHSIEMHLPYVKKRMGDAPCSVVAIMVGATSEAAEARYGALLAPYLRDPANFFIVSSDFCHWGARFRYQPHDAARGAVHEYIRWLDHAGMALLEAQDLGGFYAYLREHRNTICGRHPICAFMHAVRALTSGGSALWSVLFVRYAQSSACTSHRDSSVSYASAVVS 357
BLAST of Ec-sdr_f_000150.1 vs. uniprot
Match: A0A7S3XLT3_HETAK (Hypothetical protein n=1 Tax=Heterosigma akashiwo TaxID=2829 RepID=A0A7S3XLT3_HETAK) HSP 1 Score: 255 bits (651), Expect = 2.760e-81 Identity = 125/226 (55.31%), Postives = 169/226 (74.78%), Query Frame = 1
Query: 1 MDPAGIATIFVLGPSHHVRLRGCAVSKASCLETPLGDLPVNHDITQALLASGQFEALTQHIDEEEHSIEMHLPFIKKVMEQRT--VSVVPILVGALSERREEFYGRVLAPYMDDSSNFFVISSDFCHWGSRFRFQAHDPTHGAIHDHIHWLDHQGMMLIQAQNAVGFGQYLAKHGNTICGRHPIAVFVNAINMSSTNFSVAWVKYAQSSKVVSPQESSVSYASAVV 672
++ + TIFVLGPSHHV L+G A+S A+ LETP+GDL N +I Q L+ SG FEA+ Q DE+EHSIEMHLP++ K++ ++ V VV I++GA S +EE YGR+LAPY+DD + FF+ISSDFCHWG RFR+Q ++ HG IH +I WLDH+GM LI++ + GF YL+++ NTICGRHPI V + AI S++ +S+ +V+YAQSS + +SSVSYASAVV
Sbjct: 88 LNTEAVQTIFVLGPSHHVYLQGAAISMANKLETPVGDLVPNKEIIQELMGSGLFEAMDQQTDEDEHSIEMHLPYVAKIIGEQANDVKVVCIMIGATSPNQEEQYGRLLAPYLDDPNCFFIISSDFCHWGQRFRYQPYEEDHGEIHQYIEWLDHKGMELIESLDPEGFIAYLSQYHNTICGRHPITVLLFAIKASNSQYSIEFVRYAQSSACKTRHDSSVSYASAVV 313
BLAST of Ec-sdr_f_000150.1 vs. uniprot
Match: A0A8K1C4Y3_PYTOL (Uncharacterized protein n=1 Tax=Pythium oligandrum TaxID=41045 RepID=A0A8K1C4Y3_PYTOL) HSP 1 Score: 246 bits (629), Expect = 3.140e-78 Identity = 120/220 (54.55%), Postives = 160/220 (72.73%), Query Frame = 1
Query: 16 IATIFVLGPSHHVRLRGCAVSKASCLETPLGDLPVNHDITQALLASGQFEALTQHIDEEEHSIEMHLPFIKKVMEQRTVSVVPILVGALSERREEFYGRVLAPYMDDSSNFFVISSDFCHWGSRFRFQAHDPTHGAIHDHIHWLDHQGMMLIQAQNAVGFGQYLAKHGNTICGRHPIAVFVNAINMSST-NFSVAWVKYAQSSKVVSPQESSVSYASAVV 672
I +F+LGPSHH LRGCAVS A+ ETPLG++P++ ++ + L+ SG+F +T +DE+EHSIEMHLPFI KVM R + VPILVG R + YGR+LAPY++D N FVISSDFCHWGSRFR+Q HD T+G IH++I +LD +GM I+ + VGF +YL K NTICGRHPI+V ++ + +S ++ +V+YAQSS +SSVSYASA+V
Sbjct: 73 IKRVFILGPSHHFYLRGCAVSSATEYETPLGNIPIDQEVNEQLINSGKFARMTLDVDEDEHSIEMHLPFIYKVMNGRKFTAVPILVGDTKSRADAEYGRILAPYIEDEGNLFVISSDFCHWGSRFRYQPHDSTYGEIHEYIKYLDREGMTHIERLDTVGFAEYLEKTENTICGRHPISVLLHTLQAASNLKCTLKFVQYAQSSACKRHSDSSVSYASAIV 292
BLAST of Ec-sdr_f_000150.1 vs. uniprot
Match: A0A7R9UE30_9STRA (Hypothetical protein n=1 Tax=Pinguiococcus pyrenoidosus TaxID=172671 RepID=A0A7R9UE30_9STRA) HSP 1 Score: 243 bits (621), Expect = 1.070e-76 Identity = 115/219 (52.51%), Postives = 164/219 (74.89%), Query Frame = 1
Query: 25 IFVLGPSHHVRLRGCAVSKASCLETPLGDLPVNHDITQALLASGQFEALTQHIDEEEHSIEMHLPFIKKVM-EQRTVSVVPILVGALSERREEFYGRVLAPYMDDSSNFFVISSDFCHWGSRFRFQAHDPTHGAI-HDHIHWLDHQGMMLIQAQNAVGFGQYLAKHGNTICGRHPIAVFVNAINMSSTNFSVAWVKYAQSSKVVSPQESSVSYASAVVT 675
IF+LGPSHHV L G A+S A +TP+GDLPV+ ++ + LLA+G+FE +TQH+DE EHS+EMH+PF++ + E V+VVPI++GA + EE YGR+LAPY++D +NFFV+SSDFCHWGSRFR+Q +D + G ++ I +D +GM LI+ ++ + YL + GNTICGRHPI V + ++++ F + +VKYAQSS V+ P +SSVSYASA++T
Sbjct: 100 IFILGPSHHVYLAGAALSGARSCQTPVGDLPVDQEVLEELLATGEFEVMTQHVDEAEHSLEMHMPFVRLCLAENSDVTVVPIMIGATEPQAEEKYGRILAPYLEDEANFFVVSSDFCHWGSRFRYQPYDSSSGLQRYEFIEAMDRRGMQLIEQKDTQAYYDYLEETGNTICGRHPIGVLLQMLHIAEAEFDIEFVKYAQSSPVMKPGDSSVSYASALLT 318
BLAST of Ec-sdr_f_000150.1 vs. uniprot
Match: W2JHV0_PHYPR (Uncharacterized protein n=7 Tax=Phytophthora TaxID=4783 RepID=W2JHV0_PHYPR) HSP 1 Score: 240 bits (612), Expect = 3.410e-76 Identity = 118/225 (52.44%), Postives = 161/225 (71.56%), Query Frame = 1
Query: 1 MDPAGIATIFVLGPSHHVRLRGCAVSKASCLETPLGDLPVNHDITQALLASGQFEALTQHIDEEEHSIEMHLPFIKKVMEQRTVSVVPILVGALSERREEFYGRVLAPYMDDSSNFFVISSDFCHWGSRFRFQAHDPTHGAIHDHIHWLDHQGMMLIQAQNAVGFGQYLAKHGNTICGRHPIAVFVNAINMSST-NFSVAWVKYAQSSKVVSPQESSVSYASAVV 672
+D I +F+LGPSHH LRGCAVS A ETPLG++ ++ ++ + L+ SG+F ++ +DE+EHSIEMHLPFI KVM R + VPILVG + +E YG++LAPY+++ N FVISSDFCHWG RFR+Q HD T+G IH++I +LDHQGM I+ +A GF +YL + NTICGRHPI++ ++ I S ++ +VKYAQSS + +SSVSYASA+V
Sbjct: 29 LDLDRIKRVFILGPSHHFYLRGCAVSTAHEYETPLGNITIDREVNEKLVDSGKFATMSMDVDEDEHSIEMHLPFIYKVMNGRKFTAVPILVGNTKTKLDEEYGKILAPYLENDENLFVISSDFCHWGPRFRYQPHDSTYGEIHEYIKYLDHQGMGFIERLDAAGFTRYLDETNNTICGRHPISLLLHTILASKKLKCTLKFVKYAQSSACMRHGDSSVSYASAIV 253
BLAST of Ec-sdr_f_000150.1 vs. uniprot
Match: A0A0W8C3E4_PHYNI (50S ribosomal protein L9 n=9 Tax=Peronosporaceae TaxID=4777 RepID=A0A0W8C3E4_PHYNI) HSP 1 Score: 240 bits (612), Expect = 6.050e-76 Identity = 118/225 (52.44%), Postives = 161/225 (71.56%), Query Frame = 1
Query: 1 MDPAGIATIFVLGPSHHVRLRGCAVSKASCLETPLGDLPVNHDITQALLASGQFEALTQHIDEEEHSIEMHLPFIKKVMEQRTVSVVPILVGALSERREEFYGRVLAPYMDDSSNFFVISSDFCHWGSRFRFQAHDPTHGAIHDHIHWLDHQGMMLIQAQNAVGFGQYLAKHGNTICGRHPIAVFVNAINMSST-NFSVAWVKYAQSSKVVSPQESSVSYASAVV 672
+D I +F+LGPSHH LRGCAVS A ETPLG++ ++ ++ + L+ SG+F ++ +DE+EHSIEMHLPFI KVM R + VPILVG + +E YG++LAPY+++ N FVISSDFCHWG RFR+Q HD T+G IH++I +LDHQGM I+ +A GF +YL + NTICGRHPI++ ++ I S ++ +VKYAQSS + +SSVSYASA+V
Sbjct: 47 LDLDRIKRVFILGPSHHFYLRGCAVSTAHEYETPLGNITIDREVNEKLVDSGKFATMSMDVDEDEHSIEMHLPFIYKVMNGRKFTAVPILVGNTKTKLDEEYGKILAPYLENDENLFVISSDFCHWGPRFRYQPHDSTYGEIHEYIKYLDHQGMGFIERLDAAGFTRYLDETNNTICGRHPISLLLHTILASKKLKCTLKFVKYAQSSACMRHGDSSVSYASAIV 271
BLAST of Ec-sdr_f_000150.1 vs. uniprot
Match: A0A6M2CWZ9_RHIMP (Putative dioxygenase ovary overexpressed n=3 Tax=Ixodidae TaxID=6939 RepID=A0A6M2CWZ9_RHIMP) HSP 1 Score: 241 bits (614), Expect = 6.210e-76 Identity = 116/229 (50.66%), Postives = 161/229 (70.31%), Query Frame = 1
Query: 1 MDPAGIATIFVLGPSHHVRLRGCAVSKASCLETPLGDLPVNHDITQALLASGQFEALTQHIDEEEHSIEMHLPFIKKVMEQRTVSVVPILVGALSERREEFYGRVLAPYMDDSSNFFVISSDFCHWGSRFRFQAHDPTHGAIHDHIHWLDHQGMMLIQAQNAVGFGQYLAKHGNTICGRHPIAVFVNAIN--MSSTN---FSVAWVKYAQSSKVVSPQESSVSYASAVV 672
+DP + +F+LGPSHH R+ GC +S A TPL DL +NH++ + L +G FE ++ H+DE EHS+EMHLP+I KVME + ++VPI+VG+LS E FYGR+L+ Y+ D+ N FVISSDFCHWG+RF +Q +D + G IH I LD QGM +I+ + F YL K+GNTICGRHPI V +NA++ +S N ++ ++KYAQSS+ +S +SSVSYASA +
Sbjct: 67 VDPTAVRRVFILGPSHHARIGGCGLSPAKTYRTPLYDLTINHEVYEELYETGAFEEVSIHVDENEHSLEMHLPYIAKVMENQEFTIVPIIVGSLSPENEAFYGRLLSKYLADADNLFVISSDFCHWGARFHYQFYDKSWGNIHQSIEKLDKQGMSIIEGLSPTAFTAYLKKYGNTICGRHPIGVLLNAVDTLQNSGNGHRMALKFLKYAQSSQCMSMSDSSVSYASAAL 295
BLAST of Ec-sdr_f_000150.1 vs. uniprot
Match: A0A5D6Y2S4_9STRA (Uncharacterized protein n=1 Tax=Pythium brassicum TaxID=1485010 RepID=A0A5D6Y2S4_9STRA) HSP 1 Score: 241 bits (614), Expect = 7.040e-76 Identity = 115/220 (52.27%), Postives = 161/220 (73.18%), Query Frame = 1
Query: 16 IATIFVLGPSHHVRLRGCAVSKASCLETPLGDLPVNHDITQALLASGQFEALTQHIDEEEHSIEMHLPFIKKVMEQRTVSVVPILVGALSERREEFYGRVLAPYMDDSSNFFVISSDFCHWGSRFRFQAHDPTHGAIHDHIHWLDHQGMMLIQAQNAVGFGQYLAKHGNTICGRHPIAVFVNAINMS-STNFSVAWVKYAQSSKVVSPQESSVSYASAVV 672
+ +F+LGPSHH LRGCAVS A+ ETPLG++ ++ ++ + L+ +G+F ++ +DE+EHSIEMHLPF+ KVM R + VPILVG + ++ YG++LAPY++D N FVISSDFCHWGSRFR+Q HD +G IH++I +LDH+GM LI+ +A GF +YL K NTICGRHPI++ ++ I S S+ +V+YAQSS + +SSVSYASA+V
Sbjct: 79 VKRVFILGPSHHFYLRGCAVSTAAEYETPLGNIAIDSEVNEQLINTGKFVTMSLDVDEDEHSIEMHLPFVFKVMNGRKFAAVPILVGNTKTKADQEYGKILAPYLEDEENLFVISSDFCHWGSRFRYQPHDSAYGEIHEYITYLDHEGMKLIERIDATGFAEYLEKTRNTICGRHPISLLLHTILASMKLRCSLKFVQYAQSSACMRHSDSSVSYASAIV 298
BLAST of Ec-sdr_f_000150.1 vs. uniprot
Match: UPI00125E1DF5 (protein MEMO1-like n=3 Tax=Ipomoea TaxID=4119 RepID=UPI00125E1DF5) HSP 1 Score: 240 bits (612), Expect = 1.030e-75 Identity = 116/225 (51.56%), Postives = 159/225 (70.67%), Query Frame = 1
Query: 1 MDPAGIATIFVLGPSHHVRLRGCAVSKASCLETPLGDLPVNHDITQALLASGQFEALTQHIDEEEHSIEMHLPFIKKVMEQRTVSVVPILVGALSERREEFYGRVLAPYMDDSSNFFVISSDFCHWGSRFRFQAHDPTHGAIHDHIHWLDHQGMMLIQAQNAVGFGQYLAKHGNTICGRHPIAVFVNAINMSSTNFSVAWVKYAQSSKVVSPQESSVSYASAVVT 675
+DPA I+ +F+LGPSHH CA+S+A+ +TP+GDLP++ ++ + L A+G+FE++ H+DE EHS+EMHLP++ KV V VVPILVGALS E YG++LA Y+DD NFF +SSDFCHWGSRFR+ +D THGAI+ I LD GM +I+ + F QYL + NTICGRHPI+VF++ ST + +V+Y QSS+ + ++SSVSYASA T
Sbjct: 64 IDPANISRVFLLGPSHHYYTPKCALSRATVYKTPIGDLPIDMEVIEELKATGKFESMDLHVDEAEHSMEMHLPYLAKVFRGYEVKVVPILVGALSAENEAMYGQLLAKYVDDPKNFFSVSSDFCHWGSRFRYTYYDKTHGAIYKSIEALDKMGMDIIETGDPDAFKQYLLETDNTICGRHPISVFLHMSKNCSTKIKIRFVRYEQSSQCKNMRDSSVSYASAAAT 288
The following BLAST results are available for this feature:
Alignments
The following features are aligned
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Properties
Property Name | Value |
Taxonomic scope | Eukaryota |
Seed ortholog score | 324.3 |
Seed ortholog evalue | 4.8e-86 |
Seed eggNOG ortholog | 2880.D7G5V7 |
Preferred name | MEMO1 |
Length | 735 |
KEGG ko | ko:K06990 |
Hectar predicted targeting category | other localisation |
Gene id | Ec-sdr_f_000150.1 |
GOs | GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005829,GO:0008150,GO:0032879,GO:0032886,GO:0033218,GO:0040012,GO:0042277,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051270,GO:0065007,GO:2000145 |
EggNOG free text desc. | regulation of microtubule-based process |
EggNOG OGs | COG1355@1,KOG3086@2759 |
COG Functional cat. | C |
Best tax level | Eukaryota |
Best eggNOG OG | NA|NA|NA |
BRITE | ko00000,ko04812 |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA sequence >Ec-sdr_f_000150.1 ID=Ec-sdr_f_000150.1|Name=Ec-sdr_f_000150.1|organism=Ectocarpus species7 Ec32 male_plus_femaleSDR|type=mRNA|length=245bp MDPAGIATIFVLGPSHHVRLRGCAVSKASCLETPLGDLPVNHDITQALLA SGQFEALTQHIDEEEHSIEMHLPFIKKVMEQRTVSVVPILVGALSERREE FYGRVLAPYMDDSSNFFVISSDFCHWGSRFRFQAHDPTHGAIHDHIHWLD HQGMMLIQAQNAVGFGQYLAKHGNTICGRHPIAVFVNAINMSSTNFSVAW VKYAQSSKVVSPQESSVSYASAVVTDFVSSQHVSKSPQPEPASI* back to topspliced messenger RNA >Ec-sdr_f_000150.1 ID=Ec-sdr_f_000150.1|Name=Ec-sdr_f_000150.1|organism=Ectocarpus species7 Ec32 male_plus_femaleSDR|type=mRNA|length=735bp|location=Sequence derived from alignment at sdr_f:550729..592965+ (Ectocarpus species7 Ec32 male_plus_femaleSDR)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.
ATGGATCCGGCGGGGATCGCGACGATATTCGTTCTTGGGCCGTCGCACCA TGTTCGCCTCCGGGGCTGCGCCGTGTCGAAAGCCTCCTGCCTCGAGACGC CACTTGGTGACCTACCTGTCAATCATGACATCACACAAGCGTTGCTTGCC TCTGGGCAGTTTGAAGCATTGACACAACACATCGACGAGGAGGAGCACTC CATCGAGATGCATTTGCCCTTTATTAAGAAGGTTATGGAACAGCGAACTG TCAGCGTTGTGCCCATTCTGGTCGGGGCTCTTTCTGAACGGAGGGAGGAG TTCTACGGCAGGGTTCTGGCCCCGTACATGGATGACTCTTCCAACTTCTT CGTAATCAGCTCGGACTTTTGCCACTGGGGATCACGTTTTCGTTTCCAGG CGCATGACCCCACACACGGCGCCATCCATGATCACATTCACTGGCTGGAC CACCAGGGTATGATGCTCATCCAGGCCCAGAACGCGGTGGGGTTTGGTCA ATATCTTGCAAAGCACGGGAACACAATATGCGGAAGGCATCCAATTGCGG TGTTCGTGAACGCTATCAACATGTCGTCGACAAACTTCTCAGTGGCATGG GTGAAATACGCACAGAGCAGCAAAGTCGTTTCTCCTCAGGAATCTTCTGT CAGCTACGCGTCTGCCGTTGTTACCGACTTCGTGAGCTCACAACATGTTT CCAAAAGCCCGCAGCCGGAACCTGCTTCGATATAG back to topprotein sequence of Ec-sdr_f_000150.1 >Ec-sdr_f_000150.1 ID=Ec-sdr_f_000150.1|Name=Ec-sdr_f_000150.1|organism=Ectocarpus species7 Ec32 male_plus_femaleSDR|type=polypeptide|length=245bp
MDPAGIATIFVLGPSHHVRLRGCAVSKASCLETPLGDLPVNHDITQALLA SGQFEALTQHIDEEEHSIEMHLPFIKKVMEQRTVSVVPILVGALSERREE FYGRVLAPYMDDSSNFFVISSDFCHWGSRFRFQAHDPTHGAIHDHIHWLD HQGMMLIQAQNAVGFGQYLAKHGNTICGRHPIAVFVNAINMSSTNFSVAW VKYAQSSKVVSPQESSVSYASAVVTDFVSSQHVSKSPQPEPASI* back to topmRNA from alignment at sdr_f:550729..592965+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >Ec-sdr_f_000150.1 ID=Ec-sdr_f_000150.1|Name=Ec-sdr_f_000150.1|organism=Ectocarpus species7 Ec32 male_plus_femaleSDR|type=mRNA|length=42237bp|location=Sequence derived from alignment at sdr_f:550729..592965+ (Ectocarpus species7 Ec32 male_plus_femaleSDR) ATGGATCCGGCGGGGATCGCGACGATATTCGTTCTTGGGCCGTCGCACCA
TGTTCGCCTCCGGTACGTTGTATCAACCCGAGGCTCCGTACAAACATGTT
TTCCTGTTGATTTTGATGCCCTAGTTGCTGATTTGCAGTTGATAGGGCGC
GCTTCGAACTGCTCCAGTCTCTCAGTACAGTACTCCGTTTGTGTTTGGGG
TCAACTTGAGCACAATGTGCTGTGGTCGTTAATCGGAGGTATACCTCGTG
AGCTACCCTTCTCTGAATGCTCTTACGTTTCTCTGTGCACGCCGCAGGGG
CTGCGCCGTGTCGAAAGCCTCCTGCCTCGAGACGCCACTTGGTGACCTAC
CTGTCAATCATGTGAGACTTTTCACACGGAGGCTCGCGTGTTGTTAAGCT
TGCGGTTGATCTACCCGCTGGATCCATACTAGGCAACGTGGAACTCCTGG
AACACTTGCATCATGCGCTCCTCTAAACCTCTTTTCTATACCGATGCATC
GATTTGCTGCATCGATGTGCTATTGCGGAACAGGACATCACACAAGCGTT
GCTTGCCTCTGGGCAGTTTGAAGCATTGACACAACACATCGACGAGGAGG
AGCACTCCATCGAGATGCATTTGCCCTTTATTAAGAAGGTGACGACGACT
TGGCAGACATGCAGGATTTCGTTTCAGTTTTGCAACACTGTCACAAGAGA
GACCGCTGCCGCAACGCATCTCAGGTTGCATCGAAACCATGCTTTGTACT
GACTTTCGGAAACGATGTCGTCGCTACATCTGTGCCTCGCCAATGCACAT
TCGACACAACGTTGTCCACAAGGCCTCGATTCCCTGCGCTTTACGTGCAC
CGCATCTGATGTATTGACTTTGCTTCTTTGGTGCCATGATGACGTGTCAA
ACTGATTGAGCGTGCGCCGACACGTGACGAGGGCAATCGCAGGTCCCGGA
TTCACATATTGAGAGTGAGCAAGATTAGCGAATCGTGTGGATGTTGTATG
AGCAAATACCGTTTCCTAGTCGATTGTAGAAGATAACAACAAGCAGCTGC
ACCTCTGCTGATTTAAGGGGCCACCAGCTCTGCTCCTGAAAGCTCTTGTC
AATCCACTTATTAAGTACTGGTTTGTTGTCTACAGTATGGGGATTCACCG
TAAGACTCGTCATTCATGACATTTTTCACTTTCGTTGGGTGTGCTAAGAC
CTTGATAAGTTGAGCAGTGGGGCTACAACACCTCTTGCCGCTTCCAGTGG
AACCAACGCTAGGAAGGCAGGATTTTCCTACTCGTATGGATATTTGTACG
ATTTGATCACACGACCCAGTACCGCCGGGTTTGCAATTAACTAAATGATA
ACAGCATCTGTGGCGGAATTACCTTCTGTTGGCGTTTGCTCTCTAGGTTA
TGGAACAGCGAACTGTCAGCGTTGTGCCCATTCTGGTCGGGGCTCTTTCT
GAACGGAGGGAGGAGTTCTACGGCAGGTCGGTTAGGCACAATATTGTTTC
GCTGTTTCGTCGTGTGACAAACCACCGAGGAATTGTTCTCTGTGGGTCTT
CTTCGTTCTCCATCAACCTAGCGCGGAAGTTTTTGCTTGAAGTGCGTGTA
CAAAGTTTGCCTCTGGATCAAGCACTCATTCCGGACAGGGACAGGGGCAC
AGGATACGTCATGCGCAAAATCTGTGACCACCACAAATCCCGGAGGTCAG
GGTATGCCAACCATTGATCAGTGGCATGGGCTACTCTAGGTCAGATTGTA
ACCTATTGTCCAGCGGGTGAGTCTTTTTGAAACCTGGCCTAGCATACGGG
CATTTCCTTTGATCATCCTGTCCTACTCGAACAGCCCACCCAACCGGTAC
GAGATATGGGTGCGCATGTGGTGTTAGCTGGACACAACCATGTCTCTAAA
TTGTCTTTCCTCTCTCTTCTCTGCTCTGAAAGCCTTTTTTGATACGTTGT
GTCTCCTGGTGCCTGCGCTGCGTCTGCATGTGCAGGGTTCTGGCCCCGTA
CATGGATGACTCTTCCAACTTCTTCGTAATCAGGTCAGCCGCTTTCGACT
GCAGTTGATGCTGAAACTAGTTTCGGTTGAAGATATATTCGAATGTCCCC
CGGCATCAGCTTCAGTGTTGTTTTAGAAACACGCACAGCTTGTTAAGGCG
GTCGGGCCAAGGGCGGTCATTTGTTTTTCTATTCGAAATCCATGATGTTT
GGAGGCCAAAAATTGAGATGGCCTTCCGACCTGCGGACGCCCAGGACAAA
CATCTCTTGTTGTAAAAGACATGGTGAAACAGTGGCAGGCGCGTTTGCAT
GCCCCAGATCAGTTGCTGGGGTCGCACGATCAAGGTTGCGGCTGCGGTAC
GCAAGGTCGGTCAATCTCGGTCTATGCCTACACGGTTCACTGGTGTACAC
ACCGCTACACACGCAATCTTCGGAACTGCGGGCGTACACCACTGGCTGCC
TCGGGCGGCCAGCGGTTTCGGGGATCGGGTCTGTGACGGTGCGCAGCAGT
GCATCATGAATGGTATGGACCCAGATTTGTGAACGTTTCAGACCGCAGCG
GCAACCTTGATAGTTCTGGGGAGTGCCAACCATGCCGCTGGTCCATGATG
TCCTCTAATGGAAGATGTACCCCGATGGGGACTCCACCACCCCAAGGCCT
AATTTCATCCGGCGCATCTCCTGTTTTTTGTTGAATCTTGGCTGGTTGAA
AGGTTTGCCTTGAGTTGAGAGACGGTGGGTCGGGGTAGACTCCGCGATAT
GGAATTGGAGATAGGTCCCATCCGCTCATCTGTGAGACGACGAACGAACT
GTTTCTGGATCAACACTACCTGCTCTTTATGTGCGTATATGATGTGCTGG
GTACTACCTCCGTTGCTTTCAAATTGCAAATCAGCCAACATCATGATCGA
GTGGCCTTCTGTGCGTCTCCGTCTCATCTGTTCTGGCGCCAATCTACACA
CTTTTCGCTGAATATGGTTGATGTATCAGCCGGGGACACACAGGAAGGTC
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GAGCTGAAATGCCAACGAGGCAAGATTGTAGCAAAAAAGAACTTTACGGC
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ACCCTTCGTCCACACACCTATTTTTTAGTTGTTGAGTCTCGAGTCGTGTT
TTGCGATATTGCCTATCGGTGGATACCCTCCGCCACGCTTATCGTTGATG
GGTACCAGGCATTTAGCAATCGGTATTCCATTGTCGCCTCAATTTTTCCG
TTCTGTTGTCAAACACAGTGCCCATCAAGTTGCTGTCTATGGTAAGAGAT
GCGTACGTGTGGAGCTCTGGGTACATAACAGAGAGGGTCGATATTTTCTC
GAGTTGTTTGTTTGCTGAAGTCAGATTCCAGGCATACCGCATGTGTTTGA
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CTATCAACATGTCGTCGACAAACTTCTCAGTGGCATGGGTGAAATACGCA
CAGAGCAGCAAAGTCGTTTCTCCTCAGGTATCCGTCTGCCAAGAAGATCA
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GTTGCCACACGTCACCATTGTTCCCGTTTTTTGCACGTGTTGCGATGGAC
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GAACGGGCCCTTTAGCCGATGCCTTCGTAAAGATGCTATTGGCTGAATTG
CTGTGGGCCTTAATGATCCAGACTTACAAAGTTATGTTCGCGTTTTTCTT
AAAATGATAATATCTCGATTACGTAGTCGATGTTACTGCGAACGCATGTA
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TTCCAAAAGCCCGCAGCCGGAACCTGCTTCGATATAG back to topCoding sequence (CDS) from alignment at sdr_f:550729..592965+ >Ec-sdr_f_000150.1 ID=Ec-sdr_f_000150.1|Name=Ec-sdr_f_000150.1|organism=Ectocarpus species7 Ec32 male_plus_femaleSDR|type=CDS|length=735bp|location=Sequence derived from alignment at sdr_f:550729..592965+ (Ectocarpus species7 Ec32 male_plus_femaleSDR) ATGGATCCGGCGGGGATCGCGACGATATTCGTTCTTGGGCCGTCGCACCA TGTTCGCCTCCGGGGCTGCGCCGTGTCGAAAGCCTCCTGCCTCGAGACGC CACTTGGTGACCTACCTGTCAATCATGACATCACACAAGCGTTGCTTGCC TCTGGGCAGTTTGAAGCATTGACACAACACATCGACGAGGAGGAGCACTC CATCGAGATGCATTTGCCCTTTATTAAGAAGGTTATGGAACAGCGAACTG TCAGCGTTGTGCCCATTCTGGTCGGGGCTCTTTCTGAACGGAGGGAGGAG TTCTACGGCAGGGTTCTGGCCCCGTACATGGATGACTCTTCCAACTTCTT CGTAATCAGCTCGGACTTTTGCCACTGGGGATCACGTTTTCGTTTCCAGG CGCATGACCCCACACACGGCGCCATCCATGATCACATTCACTGGCTGGAC CACCAGGGTATGATGCTCATCCAGGCCCAGAACGCGGTGGGGTTTGGTCA ATATCTTGCAAAGCACGGGAACACAATATGCGGAAGGCATCCAATTGCGG TGTTCGTGAACGCTATCAACATGTCGTCGACAAACTTCTCAGTGGCATGG GTGAAATACGCACAGAGCAGCAAAGTCGTTTCTCCTCAGGAATCTTCTGT CAGCTACGCGTCTGCCGTTGTTACCGACTTCGTGAGCTCACAACATGTTT CCAAAAGCCCGCAGCCGGAACCTGCTTCGATATAG back to top
Synonyms
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