mRNA_E-siliculosus-1a_F_contig104.309.1 (mRNA) Ectocarpus siliculosus Ec863f_EcPH12_90f female

You are viewing an mRNA, more information available on the corresponding polypeptide page

Properties
Property NameValue
Start1
Stop1
Cds size3570
Model size5436
Exons17
Ec32 orthologEc-05_006110.1
Ec32 ortholog descriptionTATA element modulatory factor 1 TATA binding
Hectar predicted targeting categoryother localisation
BRITEko00000,ko00001,ko01000,ko04131
Best eggNOG OGNA|NA|NA
Best tax levelEukaryota
CAZyGH1
COG Functional cat.S
EC3.2.1.21
EggNOG OGsKOG4673@1,KOG4673@2759
EggNOG free text desc.positive regulation of testosterone secretion
GOsGO:0000003,GO:0000139,GO:0001675,GO:0001817,GO:0001819,GO:0003006,GO:0003008,GO:0003674,GO:0003712,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005783,GO:0005794,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006355,GO:0006366,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006810,GO:0006928,GO:0006950,GO:0006952,GO:0006996,GO:0006997,GO:0007154,GO:0007267,GO:0007275,GO:0007276,GO:0007281,GO:0007283,GO:0007286,GO:0007289,GO:0007548,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008406,GO:0008584,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009605,GO:0009607,GO:0009617,GO:0009653,GO:0009889,GO:0009892,GO:0009894,GO:0009914,GO:0009987,GO:0010033,GO:0010256,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010605,GO:0010629,GO:0010646,GO:0010647,GO:0010817,GO:0010927,GO:0010941,GO:0012505,GO:0014070,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016050,GO:0016070,GO:0017016,GO:0017137,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0019899,GO:0019953,GO:0022412,GO:0022414,GO:0022607,GO:0023051,GO:0023052,GO:0023056,GO:0023061,GO:0030154,GO:0030162,GO:0030317,GO:0031090,GO:0031267,GO:0031323,GO:0031326,GO:0031329,GO:0031984,GO:0032268,GO:0032274,GO:0032275,GO:0032368,GO:0032370,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032504,GO:0032774,GO:0032879,GO:0032940,GO:0032989,GO:0033327,GO:0033363,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0040011,GO:0042176,GO:0042221,GO:0042742,GO:0042981,GO:0043066,GO:0043067,GO:0043069,GO:0043170,GO:0043207,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044431,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0044703,GO:0045137,GO:0046483,GO:0046546,GO:0046661,GO:0046879,GO:0046883,GO:0046887,GO:0046903,GO:0048232,GO:0048468,GO:0048513,GO:0048515,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0048608,GO:0048609,GO:0048646,GO:0048731,GO:0048856,GO:0048869,GO:0048870,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050886,GO:0050896,GO:0051020,GO:0051046,GO:0051047,GO:0051049,GO:0051050,GO:0051171,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051239,GO:0051240,GO:0051246,GO:0051252,GO:0051674,GO:0051704,GO:0051707,GO:0051716,GO:0060255,GO:0060548,GO:0060986,GO:0061136,GO:0061458,GO:0065007,GO:0065008,GO:0070887,GO:0070925,GO:0071310,GO:0071407,GO:0071704,GO:0071840,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097659,GO:0097722,GO:0098542,GO:0098588,GO:0098791,GO:0140110,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901576,GO:1903050,GO:1903362,GO:1903506,GO:1903530,GO:1903532,GO:1905952,GO:1905954,GO:2000112,GO:2000843,GO:2000845,GO:2001141
KEGG Pathwayko00460,ko00500,ko00940,ko01100,ko01110,map00460,map00500,map00940,map01100,map01110
KEGG ReactionR00026,R02558,R02887,R02985,R03527,R04949,R04998,R10035,R10039,R10040
KEGG koko:K01188,ko:K20286
KEGG rclassRC00049,RC00059,RC00171,RC00262,RC00397,RC00451,RC00714,RC00746,RC01248
Preferred nameTMF1
Seed eggNOG ortholog2880.D7G6G4
Seed ortholog evalue0.0
Seed ortholog score1501.5
Taxonomic scopeEukaryota