mRNA_E-siliculosus-1a_F_contig1034.273.1 (mRNA) Ectocarpus siliculosus Ec863f_EcPH12_90f female

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Properties
Property NameValue
Start1
Stop1
Cds size1521
Model size1706
Exons10
Ec32 orthologEc-01_000760.1
Ec32 ortholog descriptiontRNA-splicing ligase, RtcB
Hectar predicted targeting categoryother localisation
BRITEko00000,ko01000,ko03016
Best eggNOG OGNA|NA|NA
Best tax levelEukaryota
COG Functional cat.J
EC6.5.1.3
EggNOG OGsCOG1690@1,KOG3833@2759
EggNOG free text desc.RNA ligase (ATP) activity
GOsGO:0000003,GO:0000378,GO:0000394,GO:0000968,GO:0000971,GO:0001701,GO:0001890,GO:0002119,GO:0002164,GO:0003006,GO:0003674,GO:0003824,GO:0003972,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005635,GO:0005654,GO:0005737,GO:0005783,GO:0005789,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006388,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006725,GO:0006807,GO:0007275,GO:0007276,GO:0007281,GO:0008033,GO:0008092,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008380,GO:0008452,GO:0009790,GO:0009791,GO:0009792,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010604,GO:0010628,GO:0012505,GO:0016020,GO:0016070,GO:0016874,GO:0016886,GO:0017166,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019953,GO:0022412,GO:0022414,GO:0030154,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031967,GO:0031974,GO:0031975,GO:0031981,GO:0031984,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032504,GO:0032991,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0040025,GO:0042175,GO:0043009,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043233,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044428,GO:0044432,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0044703,GO:0045935,GO:0046483,GO:0048468,GO:0048513,GO:0048518,GO:0048522,GO:0048569,GO:0048608,GO:0048609,GO:0048731,GO:0048856,GO:0048869,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051254,GO:0051704,GO:0060255,GO:0061458,GO:0065007,GO:0070013,GO:0071704,GO:0072669,GO:0080090,GO:0090304,GO:0098827,GO:0140098,GO:1901360,GO:1903326,GO:1903328,GO:2000235,GO:2000237
KEGG koko:K14415
Preferred nameRTCB
Seed eggNOG ortholog2880.D7FS68
Seed ortholog evalue1.9e-286
Seed ortholog score991.1
Taxonomic scopeEukaryota