mRNA_E-fasciculatus_F_contig13963.2903.1 (mRNA) Ectocarpus fasciculatus Ec846f_Ec191_B4_f female

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Overview
NamemRNA_E-fasciculatus_F_contig13963.2903.1
Unique NamemRNA_E-fasciculatus_F_contig13963.2903.1
TypemRNA
OrganismEctocarpus fasciculatus Ec846f_Ec191_B4_f female (Ectocarpus fasciculatus Ec846f_Ec191_B4_f female)
Homology
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BLAST of mRNA_E-fasciculatus_F_contig13963.2903.1 vs. uniprot
Match: D7G264_ECTSI (Non-specific serine/threonine protein kinase n=1 Tax=Ectocarpus siliculosus TaxID=2880 RepID=D7G264_ECTSI)

HSP 1 Score: 167 bits (424), Expect = 1.860e-46
Identity = 80/84 (95.24%), Postives = 83/84 (98.81%), Query Frame = 1 
Query:    1 EALPIDIRLLSNLAERCHAYAKALHYKELEFATSPAICIESLIAINKKVGQPEAAMGILTYAQNKLGSEVSVKDDWLAKLGHWD 252
            EALPIDIRLLSNLAERCHAYAKALHYKELEFAT+PAICIESLIAINKKVGQPEAAMGILTYAQN+LG EVSV+DDWLAKLGHWD
Sbjct: 1488 EALPIDIRLLSNLAERCHAYAKALHYKELEFATNPAICIESLIAINKKVGQPEAAMGILTYAQNRLGGEVSVEDDWLAKLGHWD 1571
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BLAST of mRNA_E-fasciculatus_F_contig13963.2903.1 vs. uniprot
Match: W7TTX4_9STRA (Serine/threonine-protein kinase TOR n=3 Tax=Monodopsidaceae TaxID=425072 RepID=W7TTX4_9STRA)

HSP 1 Score: 139 bits (350), Expect = 1.780e-36
Identity = 63/83 (75.90%), Postives = 74/83 (89.16%), Query Frame = 1 
Query:    1 EALPIDIRLLSNLAERCHAYAKALHYKELEFATSPAICIESLIAINKKVGQPEAAMGILTYAQNKLGSEVSVKDDWLAKLGHW 249
            EALPIDI +L+ LA++CHAYAKALHYKELEF T+PA C+ESLI INKK+GQPEAA+GIL YAQ KLGSE+ VK+ WLAKLG+W
Sbjct: 1309 EALPIDIHILAELAQKCHAYAKALHYKELEFPTAPAACVESLITINKKLGQPEAALGILKYAQKKLGSEIVVKESWLAKLGNW 1391
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BLAST of mRNA_E-fasciculatus_F_contig13963.2903.1 vs. uniprot
Match: A0A835YM18_9STRA (Serine/threonine-protein kinase TOR n=1 Tax=Tribonema minus TaxID=303371 RepID=A0A835YM18_9STRA)

HSP 1 Score: 126 bits (317), Expect = 5.020e-32
Identity = 55/84 (65.48%), Postives = 74/84 (88.10%), Query Frame = 1 
Query:    1 EALPIDIRLLSNLAERCHAYAKALHYKELEFATSPAICIESLIAINKKVGQPEAAMGILTYAQNKLGSEVSVKDDWLAKLGHWD 252
            EALPI   +L++LA++CHAYAKALHYKE++F  +PA  +E+LIAINKK+GQPEAA+G+LTYAQ +LGS ++V++ WLAKLGHW+
Sbjct:  959 EALPIRTSVLADLAQKCHAYAKALHYKEVDFQVAPAESVEALIAINKKLGQPEAALGVLTYAQKRLGSVIAVQESWLAKLGHWE 1042
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BLAST of mRNA_E-fasciculatus_F_contig13963.2903.1 vs. uniprot
Match: A0A1V9Z7W7_9STRA (Serine/threonine-protein kinase TOR (Fragment) n=1 Tax=Achlya hypogyna TaxID=1202772 RepID=A0A1V9Z7W7_9STRA)

HSP 1 Score: 120 bits (301), Expect = 7.320e-30
Identity = 57/83 (68.67%), Postives = 67/83 (80.72%), Query Frame = 1 
Query:    1 EALPIDIRLLSNLAERCHAYAKALHYKELEFATSPAICIESLIAINKKVGQPEAAMGILTYAQNKLGSEVSVKDDWLAKLGHW 249
            EALPIDIR L  LA++CHAYAKALHYKELEF TSP+ CIE+LI+IN +VGQPEAA+GIL YAQ   GS + VK+ W  KL +W
Sbjct: 1438 EALPIDIRELGELAQKCHAYAKALHYKELEFHTSPSTCIEALISINNQVGQPEAAVGILKYAQLHHGSAIQVKETWYEKLQNW 1520
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BLAST of mRNA_E-fasciculatus_F_contig13963.2903.1 vs. uniprot
Match: A0A397B801_9STRA (FAT domain-containing protein (Fragment) n=4 Tax=Aphanomyces astaci TaxID=112090 RepID=A0A397B801_9STRA)

HSP 1 Score: 119 bits (297), Expect = 1.420e-29
Identity = 57/84 (67.86%), Postives = 66/84 (78.57%), Query Frame = 1 
Query:    1 EALPIDIRLLSNLAERCHAYAKALHYKELEFATSPAICIESLIAINKKVGQPEAAMGILTYAQNKLGSEVSVKDDWLAKLGHWD 252
            EALPIDIR L  LA++CHAYAKALHYKELEF TSP+ CIE+LI+IN +VGQPEAA+GIL YAQ    S + VK+ W  KL  WD
Sbjct:  143 EALPIDIRELGELAQKCHAYAKALHYKELEFHTSPSTCIEALISINNQVGQPEAAVGILKYAQLHHKSVIHVKESWFEKLQDWD 226
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BLAST of mRNA_E-fasciculatus_F_contig13963.2903.1 vs. uniprot
Match: W4FQI3_9STRA (Serine/threonine-protein kinase TOR n=4 Tax=Aphanomyces astaci TaxID=112090 RepID=W4FQI3_9STRA)

HSP 1 Score: 119 bits (297), Expect = 2.540e-29
Identity = 57/84 (67.86%), Postives = 66/84 (78.57%), Query Frame = 1 
Query:    1 EALPIDIRLLSNLAERCHAYAKALHYKELEFATSPAICIESLIAINKKVGQPEAAMGILTYAQNKLGSEVSVKDDWLAKLGHWD 252
            EALPIDIR L  LA++CHAYAKALHYKELEF TSP+ CIE+LI+IN +VGQPEAA+GIL YAQ    S + VK+ W  KL  WD
Sbjct: 1383 EALPIDIRELGELAQKCHAYAKALHYKELEFHTSPSTCIEALISINNQVGQPEAAVGILKYAQLHHKSVIHVKESWFEKLQDWD 1466
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BLAST of mRNA_E-fasciculatus_F_contig13963.2903.1 vs. uniprot
Match: A0A3R6YXP0_9STRA (Serine/threonine-protein kinase TOR (Fragment) n=1 Tax=Aphanomyces invadans TaxID=157072 RepID=A0A3R6YXP0_9STRA)

HSP 1 Score: 117 bits (293), Expect = 8.790e-29
Identity = 56/84 (66.67%), Postives = 66/84 (78.57%), Query Frame = 1 
Query:    1 EALPIDIRLLSNLAERCHAYAKALHYKELEFATSPAICIESLIAINKKVGQPEAAMGILTYAQNKLGSEVSVKDDWLAKLGHWD 252
            EALPIDIR L  LA++CHAYAKALHYKELEF TSP+ CIE+LI+IN +VGQPEAA+GIL YAQ    S + VK+ W  KL  W+
Sbjct: 1222 EALPIDIRELGELAQKCHAYAKALHYKELEFHTSPSTCIEALISINNQVGQPEAAVGILKYAQWHHRSVIQVKESWFEKLQDWE 1305
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BLAST of mRNA_E-fasciculatus_F_contig13963.2903.1 vs. uniprot
Match: A0A024TJB8_9STRA (Serine/threonine-protein kinase TOR n=11 Tax=Aphanomyces invadans TaxID=157072 RepID=A0A024TJB8_9STRA)

HSP 1 Score: 117 bits (293), Expect = 8.800e-29
Identity = 56/84 (66.67%), Postives = 66/84 (78.57%), Query Frame = 1 
Query:    1 EALPIDIRLLSNLAERCHAYAKALHYKELEFATSPAICIESLIAINKKVGQPEAAMGILTYAQNKLGSEVSVKDDWLAKLGHWD 252
            EALPIDIR L  LA++CHAYAKALHYKELEF TSP+ CIE+LI+IN +VGQPEAA+GIL YAQ    S + VK+ W  KL  W+
Sbjct: 1448 EALPIDIRELGELAQKCHAYAKALHYKELEFHTSPSTCIEALISINNQVGQPEAAVGILKYAQWHHRSVIQVKESWFEKLQDWE 1531
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BLAST of mRNA_E-fasciculatus_F_contig13963.2903.1 vs. uniprot
Match: A0A067C8E6_SAPPC (Serine/threonine-protein kinase TOR n=2 Tax=Saprolegnia TaxID=4769 RepID=A0A067C8E6_SAPPC)

HSP 1 Score: 117 bits (293), Expect = 8.810e-29
Identity = 56/83 (67.47%), Postives = 66/83 (79.52%), Query Frame = 1 
Query:    1 EALPIDIRLLSNLAERCHAYAKALHYKELEFATSPAICIESLIAINKKVGQPEAAMGILTYAQNKLGSEVSVKDDWLAKLGHW 249
            EALPIDIR L  LA++CHAYAKALHYKELEF TSP+ CIE+LI+IN +VGQPEAA+GIL YAQ    S + VK+ W  KL +W
Sbjct: 1443 EALPIDIRELGELAQKCHAYAKALHYKELEFHTSPSTCIEALISINNQVGQPEAAVGILKYAQLHHRSVIQVKESWYEKLQNW 1525
[Close]
BLAST of mRNA_E-fasciculatus_F_contig13963.2903.1 vs. uniprot
Match: A0A485L8R6_9STRA (Serine/threonine-protein kinase TOR n=1 Tax=Aphanomyces stellatus TaxID=120398 RepID=A0A485L8R6_9STRA)

HSP 1 Score: 117 bits (292), Expect = 1.200e-28
Identity = 56/83 (67.47%), Postives = 66/83 (79.52%), Query Frame = 1 
Query:    1 EALPIDIRLLSNLAERCHAYAKALHYKELEFATSPAICIESLIAINKKVGQPEAAMGILTYAQNKLGSEVSVKDDWLAKLGHW 249
            EALPIDIR L  LA++CHAYAKALHYKELEF TSP+ CIE+LI+IN +VGQPEAA+GIL YAQ    S + VK+ W  KL +W
Sbjct: 1348 EALPIDIRELGELAQKCHAYAKALHYKELEFHTSPSTCIEALISINNQVGQPEAAVGILKYAQLHHRSVIQVKETWYEKLQNW 1430
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of mRNA_E-fasciculatus_F_contig13963.2903.1 vs. uniprot
Analysis Date: 2022-09-19 (Diamond blastx: OGS1.0 of Ectocarpus fasciculatus Ec846f_Ec191_B4_f female vs UniRef90)
Total hits: 25
Match NameE-valueIdentityDescription
D7G264_ECTSI1.860e-4695.24Non-specific serine/threonine protein kinase n=1 T... [more]
W7TTX4_9STRA1.780e-3675.90Serine/threonine-protein kinase TOR n=3 Tax=Monodo... [more]
A0A835YM18_9STRA5.020e-3265.48Serine/threonine-protein kinase TOR n=1 Tax=Tribon... [more]
A0A1V9Z7W7_9STRA7.320e-3068.67Serine/threonine-protein kinase TOR (Fragment) n=1... [more]
A0A397B801_9STRA1.420e-2967.86FAT domain-containing protein (Fragment) n=4 Tax=A... [more]
W4FQI3_9STRA2.540e-2967.86Serine/threonine-protein kinase TOR n=4 Tax=Aphano... [more]
A0A3R6YXP0_9STRA8.790e-2966.67Serine/threonine-protein kinase TOR (Fragment) n=1... [more]
A0A024TJB8_9STRA8.800e-2966.67Serine/threonine-protein kinase TOR n=11 Tax=Aphan... [more]
A0A067C8E6_SAPPC8.810e-2967.47Serine/threonine-protein kinase TOR n=2 Tax=Saprol... [more]
A0A485L8R6_9STRA1.200e-2867.47Serine/threonine-protein kinase TOR n=1 Tax=Aphano... [more]

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Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
E-fasciculatus_F_contig13963contigE-fasciculatus_F_contig13963:77..1036 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Diamond blastx: OGS1.0 of Ectocarpus fasciculatus Ec846f_Ec191_B4_f female vs UniRef902022-09-19
OGS1.0 of Ectocarpus fasciculatus Ec846f_Ec191_B4_f female2021-02-24
Properties
Property NameValue
Taxonomic scopeEukaryota
Seed ortholog score168.3
Seed ortholog evalue1.5e-39
Seed eggNOG ortholog2880.D7G264
Preferred nameMTOR
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EggNOG free text desc.phosphatidylinositol kinase activity
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EC2.7.11.1
COG Functional cat.BDLTU
BiGG ReactioniMM904.YKL203C,iND750.YKL203C
Best tax levelEukaryota
Best eggNOG OGNA|NA|NA
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Hectar predicted targeting categoryother localisation
Exons2
Model size252
Cds size252
Stop0
Start0
Relationships

The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
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1622927887.0659761-CDS-E-fasciculatus_F_contig13963:955..10361622927887.0659761-CDS-E-fasciculatus_F_contig13963:955..1036Ectocarpus fasciculatus Ec846f_Ec191_B4_f femaleCDSE-fasciculatus_F_contig13963 956..1036 -
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The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
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Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of mRNA_E-fasciculatus_F_contig13963.2903.1

>prot_E-fasciculatus_F_contig13963.2903.1 ID=prot_E-fasciculatus_F_contig13963.2903.1|Name=mRNA_E-fasciculatus_F_contig13963.2903.1|organism=Ectocarpus fasciculatus Ec846f_Ec191_B4_f female|type=polypeptide|length=84bp
EALPIDIRLLSNLAERCHAYAKALHYKELEFATSPAICIESLIAINKKVG
QPEAAMGILTYAQNKLGSEVSVKDDWLAKLGHWD
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mRNA from alignment at E-fasciculatus_F_contig13963:77..1036-

Legend: polypeptideCDS
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>mRNA_E-fasciculatus_F_contig13963.2903.1 ID=mRNA_E-fasciculatus_F_contig13963.2903.1|Name=mRNA_E-fasciculatus_F_contig13963.2903.1|organism=Ectocarpus fasciculatus Ec846f_Ec191_B4_f female|type=mRNA|length=960bp|location=Sequence derived from alignment at E-fasciculatus_F_contig13963:77..1036- (Ectocarpus fasciculatus Ec846f_Ec191_B4_f female)
GAAGCACTGCCAATCGACATCAGGTTGCTGTCCAACCTCGCGGAGCGATG
CCACGCCTACGCGAAGGCTCTCCACTACAAGGTGAGGTCCTGAAGTGCGG
TCACGGTTGCCTATGAAAGGCGTTGAACCGGCTCGATTTATTTGGGTGTA
CCTTCTTGAGGGTAAGGTAGCCTGTGACCAGGGGGTTCATCGACCGCGTC
GAGTGTTAGACTAAATAGTGTACCTCTTTTAGGGTAAGTTAGCCTGTGAC
CACGGGAATCGACCGCGTCAAGTGTTAGACCAGTACGGACAGAAGAAGGT
ACTGGGTAGAGAGAGATCAGAACGGTTTTTACTGTGAAGACAACAACAAC
AACAACAACAACAACAACAACATAGAGCGTTCACTCTCCCAACATTCGGC
AGTGACGTTCCCTGACATGTAGCGATGAAGGTCCCGATAGAAATAGCGGT
GACGGTTCCGATATAAAGCGGTGCCGGCCTAACGAACGGCGATAAAGCTC
CCGATATGGAGCGGCCACTACTGTCCCGACATTCAAGGCTGGCACTCCCC
TTACGAGCCCCGCGTTTCAACCGAGGAAGCGGTAGATGGAAATGCCTATT
TTATTGCCTCACGCTGCTGCCGTGTTTCCCTCCATGTCCCATGCCTTCTG
CGAACACCTCGACTCCCAAGGTTCATATCCTGTGCCTTCTGCTGAATATC
TCGCCTTTTCCGCGCGCATCCTGTGCTTTTTACTGAAATGCCTCGACTCC
GTACGTGTCCTATGATTTACGCTGAATACCTCGGGTCAGGAGCTGGAGTT
CGCTACGAGCCCGGCTATATGCATCGAGTCCCTGATAGCTATTAACAAGA
AGGTCGGGCAGCCAGAGGCTGCCATGGGCATCCTCACGTATGCCCAGAAT
AAGCTGGGGAGTGAGGTGTCGGTGAAGGACGACTGGCTGGCCAAACTTGG
ACACTGGGAT
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Coding sequence (CDS) from alignment at E-fasciculatus_F_contig13963:77..1036-

>mRNA_E-fasciculatus_F_contig13963.2903.1 ID=mRNA_E-fasciculatus_F_contig13963.2903.1|Name=mRNA_E-fasciculatus_F_contig13963.2903.1|organism=Ectocarpus fasciculatus Ec846f_Ec191_B4_f female|type=CDS|length=504bp|location=Sequence derived from alignment at E-fasciculatus_F_contig13963:77..1036- (Ectocarpus fasciculatus Ec846f_Ec191_B4_f female)
GAAGCACTGCCAATCGACATCAGGTTGCTGTCCAACCTCGCGGAGCGATG
CCACGCCTACGCGAAGGCTCTCCACTACAAGGAAGCACTGCCAATCGACA
TCAGGTTGCTGTCCAACCTCGCGGAGCGATGCCACGCCTACGCGAAGGCT
CTCCACTACAAGGAGCTGGAGTTCGCTACGAGCCCGGCTATATGCATCGA
GTCCCTGATAGCTATTAACAAGAAGGTCGGGCAGCCAGAGGCTGCCATGG
GCATCCTCACGTATGCCCAGAATAAGCTGGGGAGTGAGGTGTCGGTGAAG
GACGACTGGCTGGCCAAACTTGGACACTGGGATGAGCTGGAGTTCGCTAC
GAGCCCGGCTATATGCATCGAGTCCCTGATAGCTATTAACAAGAAGGTCG
GGCAGCCAGAGGCTGCCATGGGCATCCTCACGTATGCCCAGAATAAGCTG
GGGAGTGAGGTGTCGGTGAAGGACGACTGGCTGGCCAAACTTGGACACTG
GGAT
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