mRNA_C-tenellus_contig10463.1.1 (mRNA) Choristocarpus tenellus KU2346

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Overview
NamemRNA_C-tenellus_contig10463.1.1
Unique NamemRNA_C-tenellus_contig10463.1.1
TypemRNA
OrganismChoristocarpus tenellus KU2346 (Choristocarpus tenellus KU2346)
Homology
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BLAST of mRNA_C-tenellus_contig10463.1.1 vs. uniprot
Match: A0A835YK41_9STRA (Armadillo-type protein n=1 Tax=Tribonema minus TaxID=303371 RepID=A0A835YK41_9STRA)

HSP 1 Score: 64.7 bits (156), Expect = 9.530e-11
Identity = 29/55 (52.73%), Postives = 39/55 (70.91%), Query Frame = 1 
Query:    4 IYDHLLLGMKSGNEADAHGAILLVGSLLRHSGNFLMPRFIEVCDAVMSLKESSSR 168
            IYD L  G+  G EAD HGA+L+ G++L +  +F++PRF EVCDAVM L+   SR
Sbjct:  283 IYDALQAGLAKGGEADIHGALLIAGAMLDNCSDFMVPRFREVCDAVMQLRGHKSR 337
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BLAST of mRNA_C-tenellus_contig10463.1.1 vs. uniprot
Match: D7G264_ECTSI (Non-specific serine/threonine protein kinase n=1 Tax=Ectocarpus siliculosus TaxID=2880 RepID=D7G264_ECTSI)

HSP 1 Score: 64.3 bits (155), Expect = 1.310e-10
Identity = 27/56 (48.21%), Postives = 38/56 (67.86%), Query Frame = 1 
Query:    1 LIYDHLLLGMKSGNEADAHGAILLVGSLLRHSGNFLMPRFIEVCDAVMSLKESSSR 168
            +++  L  G     EA+ HG+IL+ G +L H GNF+MPRF E+C AVM LK++ SR
Sbjct:  227 IVFQQLREGFSKPTEANVHGSILMAGPMLEHGGNFMMPRFDEICAAVMGLKDNRSR 282
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BLAST of mRNA_C-tenellus_contig10463.1.1 vs. uniprot
Match: A0A482SYQ0_9ARCH (DUF3385 domain-containing protein n=1 Tax=archaeon TaxID=1906665 RepID=A0A482SYQ0_9ARCH)

HSP 1 Score: 61.2 bits (147), Expect = 1.600e-9
Identity = 23/55 (41.82%), Postives = 41/55 (74.55%), Query Frame = 1 
Query:    4 IYDHLLLGMKSGNEADAHGAILLVGSLLRHSGNFLMPRFIEVCDAVMSLKESSSR 168
            IYD L  G +SG+E   HG+++++  +L+++G+F++PRF EVC ++M LK+  S+
Sbjct:  131 IYDQLQEGFRSGSEESVHGSLIVIAEVLKYTGDFMIPRFKEVCKSIMQLKDHKSK 185
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BLAST of mRNA_C-tenellus_contig10463.1.1 vs. uniprot
Match: A0A7S3ZRC1_9STRA (Non-specific serine/threonine protein kinase n=2 Tax=Pelagomonas calceolata TaxID=35677 RepID=A0A7S3ZRC1_9STRA)

HSP 1 Score: 54.3 bits (129), Expect = 4.480e-7
Identity = 23/41 (56.10%), Postives = 32/41 (78.05%), Query Frame = 1 
Query:   43 EADAHGAILLVGSLLRHSGNFLMPRFIEVCDAVMSLKESSS 165
            EA AHGA+L +G+LL H+G F+ PRF E CDA ++L++ SS
Sbjct:  350 EAAAHGALLSIGALLDHAGEFMTPRFREACDAALALRDHSS 390
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BLAST of mRNA_C-tenellus_contig10463.1.1 vs. uniprot
Match: A0A6G0WIT3_9STRA (Serine/threonine-protein kinase TOR n=2 Tax=Aphanomyces euteiches TaxID=100861 RepID=A0A6G0WIT3_9STRA)

HSP 1 Score: 52.8 bits (125), Expect = 1.570e-6
Identity = 21/46 (45.65%), Postives = 34/46 (73.91%), Query Frame = 1 
Query:   31 KSGNEADAHGAILLVGSLLRHSGNFLMPRFIEVCDAVMSLKESSSR 168
            KS    + HG++L++G LL+++G F+MPRF EVCD V+S K++  +
Sbjct:  229 KSTPWENIHGSLLIIGELLKYTGGFVMPRFREVCDVVLSFKDAKDK 274
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BLAST of mRNA_C-tenellus_contig10463.1.1 vs. uniprot
Match: A0A1V9Z7W7_9STRA (Serine/threonine-protein kinase TOR (Fragment) n=1 Tax=Achlya hypogyna TaxID=1202772 RepID=A0A1V9Z7W7_9STRA)

HSP 1 Score: 50.4 bits (119), Expect = 1.030e-5
Identity = 22/50 (44.00%), Postives = 34/50 (68.00%), Query Frame = 1 
Query:   19 LLGMKSGNEADAHGAILLVGSLLRHSGNFLMPRFIEVCDAVMSLKESSSR 168
            LL  K+      HG++L+V  LL+++GNF++PRF EVCD V+  K+S  +
Sbjct:  264 LLSTKTPARDSIHGSLLVVMQLLKNTGNFMVPRFREVCDIVLCYKDSKDK 313
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BLAST of mRNA_C-tenellus_contig10463.1.1 vs. uniprot
Match: A0A059LI43_9CHLO (Uncharacterized protein (Fragment) n=1 Tax=Helicosporidium sp. ATCC 50920 TaxID=1291522 RepID=A0A059LI43_9CHLO)

HSP 1 Score: 49.7 bits (117), Expect = 1.830e-5
Identity = 20/56 (35.71%), Postives = 35/56 (62.50%), Query Frame = 1 
Query:    4 IYDHLLLGMKSGNEADA-HGAILLVGSLLRHSGNFLMPRFIEVCDAVMSLKESSSR 168
            +++    G+  G   +  HG++L +G LLRH+G F++ R+ EVC+ V+  K+S  R
Sbjct:  185 LFEETTRGLSRGTTVEVVHGSLLALGELLRHTGEFMLARYREVCETVLRFKDSKER 240
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of mRNA_C-tenellus_contig10463.1.1 vs. uniprot
Analysis Date: 2022-09-19 (Diamond blastx: OGS1.0 vs UniRef90)
Total hits: 7
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A835YK41_9STRA9.530e-1152.73Armadillo-type protein n=1 Tax=Tribonema minus Tax... [more]
D7G264_ECTSI1.310e-1048.21Non-specific serine/threonine protein kinase n=1 T... [more]
A0A482SYQ0_9ARCH1.600e-941.82DUF3385 domain-containing protein n=1 Tax=archaeon... [more]
A0A7S3ZRC1_9STRA4.480e-756.10Non-specific serine/threonine protein kinase n=2 T... [more]
A0A6G0WIT3_9STRA1.570e-645.65Serine/threonine-protein kinase TOR n=2 Tax=Aphano... [more]
A0A1V9Z7W7_9STRA1.030e-544.00Serine/threonine-protein kinase TOR (Fragment) n=1... [more]
A0A059LI43_9CHLO1.830e-535.71Uncharacterized protein (Fragment) n=1 Tax=Helicos... [more]
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Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
C-tenellus_contig10463contigC-tenellus_contig10463:4385..4555 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Diamond blastx: OGS1.0 vs UniRef902022-09-19
Choristocarpus tenellus KU2346 OGS1.02022-07-08
Properties
Property NameValue
Stop1
Start1
Seed ortholog2880.D7G264
Preferred nameMTOR
PFAMsBolA,DUF3385,FAT,FATC,FRB_dom,HEAT,PI3_PI4_kinase
Model size171
Max annot lvl2759|Eukaryota
KEGG koko:K07203
KEGG Pathwayko01521,ko01522,ko04012,ko04066,ko04072,ko04136,ko04138,ko04139,ko04140,ko04150,ko04151,ko04152,ko04211,ko04212,ko04213,ko04218,ko04371,ko04630,ko04659,ko04714,ko04910,ko04919,ko04920,ko04930,ko04931,ko05165,ko05167,ko05200,ko05205,ko05206,ko05210,ko05212,ko05214,ko05215,ko05221,ko05224,ko05225,ko05226,ko05230,ko05231,map01521,map01522,map04012,map04066,map04072,map04136,map04138,map04139,map04140,map04150,map04151,map04152,map04211,map04212,map04213,map04218,map04371,map04630,map04659,map04714,map04910,map04919,map04920,map04930,map04931,map05165,map05167,map05200,map05205,map05206,map05210,map05212,map05214,map05215,map05221,map05224,map05225,map05226,map05230,map05231
Hectar predicted targeting categoryno signal peptide or anchor
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Exons1
Evalue8.37e-10
EggNOG OGsCOG5032@1|root,KOG0891@2759|Eukaryota
EC2.7.11.1
Descriptionprotein serine/threonine kinase activity
Cds size144
COG categoryBDLTU
BiGG ReactioniMM904.YKL203C,iND750.YKL203C
BRITEko00000,ko00001,ko01000,ko01001,ko04131
Relationships

The following UTR feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
1680789132.886275-UTR-C-tenellus_contig10463:4384..44111680789132.886275-UTR-C-tenellus_contig10463:4384..4411Choristocarpus tenellus KU2346UTRC-tenellus_contig10463 4385..4411 +


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
1680789132.9055443-CDS-C-tenellus_contig10463:4411..45551680789132.9055443-CDS-C-tenellus_contig10463:4411..4555Choristocarpus tenellus KU2346CDSC-tenellus_contig10463 4412..4555 +


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
mRNA_C-tenellus_contig10463.1.1prot_C-tenellus_contig10463.1.1Choristocarpus tenellus KU2346polypeptideC-tenellus_contig10463 4412..4555 +


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of mRNA_C-tenellus_contig10463.1.1

>prot_C-tenellus_contig10463.1.1 ID=prot_C-tenellus_contig10463.1.1|Name=mRNA_C-tenellus_contig10463.1.1|organism=Choristocarpus tenellus KU2346|type=polypeptide|length=48bp
MKSGNEADAHGAILLVGSLLRHSGNFLMPRFIEVCDAVMSLKESSSR*
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mRNA from alignment at C-tenellus_contig10463:4385..4555+

Legend: UTRpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>mRNA_C-tenellus_contig10463.1.1 ID=mRNA_C-tenellus_contig10463.1.1|Name=mRNA_C-tenellus_contig10463.1.1|organism=Choristocarpus tenellus KU2346|type=mRNA|length=171bp|location=Sequence derived from alignment at C-tenellus_contig10463:4385..4555+ (Choristocarpus tenellus KU2346)
TTGATATATGACCACCTCCTGCTGGGCATGAAGAGTGGGAACGAGGCCGA
TGCTCACGGCGCAATCCTATTGGTCGGATCGCTCCTCCGACACAGTGGTA
ACTTTCTGATGCCCAGGTTCATTGAAGTGTGCGATGCAGTCATGTCTCTC
AAGGAAAGCAGCAGCAGGTAG
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Coding sequence (CDS) from alignment at C-tenellus_contig10463:4385..4555+

>mRNA_C-tenellus_contig10463.1.1 ID=mRNA_C-tenellus_contig10463.1.1|Name=mRNA_C-tenellus_contig10463.1.1|organism=Choristocarpus tenellus KU2346|type=CDS|length=144bp|location=Sequence derived from alignment at C-tenellus_contig10463:4385..4555+ (Choristocarpus tenellus KU2346)
ATGAAGAGTGGGAACGAGGCCGATGCTCACGGCGCAATCCTATTGGTCGG
ATCGCTCCTCCGACACAGTGGTAACTTTCTGATGCCCAGGTTCATTGAAG
TGTGCGATGCAGTCATGTCTCTCAAGGAAAGCAGCAGCAGGTAG
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