mRNA_S-dermatodea_contig10232.168.1 (mRNA) Saccorhiza dermatodea SderLu1190fm monoicous

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Overview
NamemRNA_S-dermatodea_contig10232.168.1
Unique NamemRNA_S-dermatodea_contig10232.168.1
TypemRNA
OrganismSaccorhiza dermatodea SderLu1190fm monoicous (Saccorhiza dermatodea SderLu1190fm monoicous)
Homology
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BLAST of mRNA_S-dermatodea_contig10232.168.1 vs. uniprot
Match: A0A6H5K2T8_9PHAE (Non-specific serine/threonine protein kinase n=1 Tax=Ectocarpus sp. CCAP 1310/34 TaxID=867726 RepID=A0A6H5K2T8_9PHAE)

HSP 1 Score: 128 bits (322), Expect = 1.970e-31
Identity = 73/115 (63.48%), Postives = 84/115 (73.04%), Query Frame = 3 
Query:    6 LSQRAPGESIMYGIGGPSAG--------GGVDNDSAAKGGNGWSAGLDNTHD----KLNERAVAVVQRIQTKLTGRDFSDAAGVLSVSEQVDRLILQASDMENLCQLFVGWCPFW 314
            L+QR  GES+MYGIGG SAG        GG++  +    G G S+G     +    K+NERA+AVVQRIQTKLTGRDFSD+AGVLSVSEQVDRLI  AS+ ENLCQLFVGWCPFW
Sbjct: 1680 LTQRITGESVMYGIGGASAGXXXXXXPPGGLETFARGLTGVGGSSGFATEAELETNKVNERALAVVQRIQTKLTGRDFSDSAGVLSVSEQVDRLIQLASNNENLCQLFVGWCPFW 1794
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BLAST of mRNA_S-dermatodea_contig10232.168.1 vs. uniprot
Match: A0A5D6Y0W7_9STRA (Serine/threonine-protein kinase TOR n=1 Tax=Pythium brassicum TaxID=1485010 RepID=A0A5D6Y0W7_9STRA)

HSP 1 Score: 92.0 bits (227), Expect = 1.180e-18
Identity = 44/76 (57.89%), Postives = 56/76 (73.68%), Query Frame = 3 
Query:   87 AAKGGNGWSAGLDNTHDKLNERAVAVVQRIQTKLTGRDFSDAAGVLSVSEQVDRLILQASDMENLCQLFVGWCPFW 314
            AA GG+G S        +LNE+A++V++R++ KL GRDF D A VLSV  QVDRLI+QA+  ENLCQL+ GWCPFW
Sbjct: 2548 AAAGGSGQSVATPEL-PQLNEKALSVIERVKKKLVGRDFDDGAKVLSVDAQVDRLIMQATSHENLCQLYYGWCPFW 2622
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BLAST of mRNA_S-dermatodea_contig10232.168.1 vs. uniprot
Match: A0A067C8E6_SAPPC (Serine/threonine-protein kinase TOR n=2 Tax=Saprolegnia TaxID=4769 RepID=A0A067C8E6_SAPPC)

HSP 1 Score: 90.9 bits (224), Expect = 3.000e-18
Identity = 39/60 (65.00%), Postives = 48/60 (80.00%), Query Frame = 3 
Query:  135 DKLNERAVAVVQRIQTKLTGRDFSDAAGVLSVSEQVDRLILQASDMENLCQLFVGWCPFW 314
            + LNE+AVAV++R+Q KLTGRDF D    LSVS+QV RLI QA+  ENLCQ ++GWCPFW
Sbjct: 2739 EALNEKAVAVIRRVQAKLTGRDFDDCREPLSVSDQVQRLITQAASHENLCQCYIGWCPFW 2798
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BLAST of mRNA_S-dermatodea_contig10232.168.1 vs. uniprot
Match: A0A8K1CQ93_PYTOL (Uncharacterized protein n=1 Tax=Pythium oligandrum TaxID=41045 RepID=A0A8K1CQ93_PYTOL)

HSP 1 Score: 90.5 bits (223), Expect = 4.080e-18
Identity = 39/59 (66.10%), Postives = 48/59 (81.36%), Query Frame = 3 
Query:  138 KLNERAVAVVQRIQTKLTGRDFSDAAGVLSVSEQVDRLILQASDMENLCQLFVGWCPFW 314
            +LNE+A++VV R++ KL GRDF D   VLSV EQVDRLI+QA+  ENLCQL+ GWCPFW
Sbjct: 2592 QLNEKALSVVDRVKKKLAGRDFDDGEKVLSVDEQVDRLIIQATSHENLCQLYYGWCPFW 2650
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BLAST of mRNA_S-dermatodea_contig10232.168.1 vs. uniprot
Match: F0XZH7_AURAN (Serine/threonine-protein kinase TOR n=1 Tax=Aureococcus anophagefferens TaxID=44056 RepID=F0XZH7_AURAN)

HSP 1 Score: 88.6 bits (218), Expect = 1.910e-17
Identity = 39/66 (59.09%), Postives = 52/66 (78.79%), Query Frame = 3 
Query:  117 GLDNTHDKLNERAVAVVQRIQTKLTGRDFSDAAGVLSVSEQVDRLILQASDMENLCQLFVGWCPFW 314
            G D   + LNE+A+AV+ R+Q KL+G DF D  G L+V++QVDRLI Q++D++NLCQ FVGWCPFW
Sbjct: 2419 GADAPIEALNEKALAVMARVQDKLSGCDFRDHQGPLAVADQVDRLIAQSTDVQNLCQSFVGWCPFW 2484
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BLAST of mRNA_S-dermatodea_contig10232.168.1 vs. uniprot
Match: K3WYM4_GLOUD (Serine/threonine-protein kinase TOR n=1 Tax=Globisporangium ultimum (strain ATCC 200006 / CBS 805.95 / DAOM BR144) TaxID=431595 RepID=K3WYM4_GLOUD)

HSP 1 Score: 88.6 bits (218), Expect = 1.910e-17
Identity = 37/59 (62.71%), Postives = 48/59 (81.36%), Query Frame = 3 
Query:  138 KLNERAVAVVQRIQTKLTGRDFSDAAGVLSVSEQVDRLILQASDMENLCQLFVGWCPFW 314
            +LNE+A++V+ R++ KL GRDF D + VLSV  QVDRLI+QA+  ENLCQL+ GWCPFW
Sbjct: 2593 QLNEKALSVIDRVKKKLVGRDFDDGSKVLSVDAQVDRLIMQATSHENLCQLYYGWCPFW 2651
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BLAST of mRNA_S-dermatodea_contig10232.168.1 vs. uniprot
Match: A0A7S1EJJ0_HEMAN (Hypothetical protein n=1 Tax=Hemiselmis andersenii TaxID=464988 RepID=A0A7S1EJJ0_HEMAN)

HSP 1 Score: 82.8 bits (203), Expect = 4.230e-17
Identity = 37/58 (63.79%), Postives = 46/58 (79.31%), Query Frame = 3 
Query:  141 LNERAVAVVQRIQTKLTGRDFSDAAGVLSVSEQVDRLILQASDMENLCQLFVGWCPFW 314
            LN +AV V+ R+Q KLTGRDF D A VL+V +QVD+LI QA+  ENLCQ ++GWCPFW
Sbjct:  102 LNSKAVKVITRVQHKLTGRDF-DVAHVLTVPDQVDKLIKQATSRENLCQCYIGWCPFW 158
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BLAST of mRNA_S-dermatodea_contig10232.168.1 vs. uniprot
Match: A0A2D4BPN7_PYTIN (Non-specific serine/threonine protein kinase n=1 Tax=Pythium insidiosum TaxID=114742 RepID=A0A2D4BPN7_PYTIN)

HSP 1 Score: 87.4 bits (215), Expect = 4.710e-17
Identity = 37/59 (62.71%), Postives = 48/59 (81.36%), Query Frame = 3 
Query:  138 KLNERAVAVVQRIQTKLTGRDFSDAAGVLSVSEQVDRLILQASDMENLCQLFVGWCPFW 314
            +LNE+A++VV R++ KL GRDF +   VL+V EQVDRLI+QA+  ENLCQL+ GWCPFW
Sbjct: 1510 QLNEKALSVVDRVKKKLAGRDFDNGERVLTVDEQVDRLIMQATSHENLCQLYYGWCPFW 1568
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BLAST of mRNA_S-dermatodea_contig10232.168.1 vs. uniprot
Match: A0A0L0FQU7_9EUKA (Uncharacterized protein n=1 Tax=Sphaeroforma arctica JP610 TaxID=667725 RepID=A0A0L0FQU7_9EUKA)

HSP 1 Score: 81.6 bits (200), Expect = 4.950e-17
Identity = 37/58 (63.79%), Postives = 45/58 (77.59%), Query Frame = 3 
Query:  141 LNERAVAVVQRIQTKLTGRDFSDAAGVLSVSEQVDRLILQASDMENLCQLFVGWCPFW 314
            ++ERAV V+ R+Q KLTGRDF  A   LSV  QV+RL+ QA+  ENLCQL+VGWCPFW
Sbjct:   67 VSERAVQVINRVQAKLTGRDFK-ATETLSVELQVERLLAQATSQENLCQLYVGWCPFW 123
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BLAST of mRNA_S-dermatodea_contig10232.168.1 vs. uniprot
Match: A0A7S4NAN0_GUITH (Hypothetical protein n=1 Tax=Guillardia theta TaxID=55529 RepID=A0A7S4NAN0_GUITH)

HSP 1 Score: 80.5 bits (197), Expect = 8.020e-17
Identity = 37/58 (63.79%), Postives = 45/58 (77.59%), Query Frame = 3 
Query:  141 LNERAVAVVQRIQTKLTGRDFSDAAGVLSVSEQVDRLILQASDMENLCQLFVGWCPFW 314
            LNE+AV V+ R+Q KLTGRDF+    VLS+ EQVD+LI QA+  ENL Q +VGWCPFW
Sbjct:   46 LNEKAVKVINRVQNKLTGRDFNPDT-VLSIEEQVDKLIRQATSKENLSQSYVGWCPFW 102
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of mRNA_S-dermatodea_contig10232.168.1 vs. uniprot
Analysis Date: 2022-09-19 (Diamond blastx: OGS1.0 vs UniRef90)
Total hits: 25
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A6H5K2T8_9PHAE1.970e-3163.48Non-specific serine/threonine protein kinase n=1 T... [more]
A0A5D6Y0W7_9STRA1.180e-1857.89Serine/threonine-protein kinase TOR n=1 Tax=Pythiu... [more]
A0A067C8E6_SAPPC3.000e-1865.00Serine/threonine-protein kinase TOR n=2 Tax=Saprol... [more]
A0A8K1CQ93_PYTOL4.080e-1866.10Uncharacterized protein n=1 Tax=Pythium oligandrum... [more]
F0XZH7_AURAN1.910e-1759.09Serine/threonine-protein kinase TOR n=1 Tax=Aureoc... [more]
K3WYM4_GLOUD1.910e-1762.71Serine/threonine-protein kinase TOR n=1 Tax=Globis... [more]
A0A7S1EJJ0_HEMAN4.230e-1763.79Hypothetical protein n=1 Tax=Hemiselmis andersenii... [more]
A0A2D4BPN7_PYTIN4.710e-1762.71Non-specific serine/threonine protein kinase n=1 T... [more]
A0A0L0FQU7_9EUKA4.950e-1763.79Uncharacterized protein n=1 Tax=Sphaeroforma arcti... [more]
A0A7S4NAN0_GUITH8.020e-1763.79Hypothetical protein n=1 Tax=Guillardia theta TaxI... [more]

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Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
S-dermatodea_contig10232contigS-dermatodea_contig10232:3621..4445 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Diamond blastx: OGS1.0 vs UniRef902022-09-19
OGS1.0 of Saccorhiza dermatodea SderLu1190fm monoicous2021-02-24
Properties
Property NameValue
Taxonomic scopeEukaryota
Seed ortholog score91.7
Seed ortholog evalue2e-16
Seed eggNOG ortholog112098.XP_008619195.1
Preferred nameMTOR
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EggNOG free text desc.phosphatidylinositol kinase activity
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Best tax levelEukaryota
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Hectar predicted targeting categoryother localisation
Exons2
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Stop1
Start1
Relationships

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
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The following UTR feature(s) are a part of this mRNA:

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The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
1622924146.463148-CDS-S-dermatodea_contig10232:3655..38591622924146.463148-CDS-S-dermatodea_contig10232:3655..3859Saccorhiza dermatodea SderLu1190fm monoicousCDSS-dermatodea_contig10232 3656..3859 +
1694079049.4332345-CDS-S-dermatodea_contig10232:3655..38591694079049.4332345-CDS-S-dermatodea_contig10232:3655..3859Saccorhiza dermatodea SderLu1190fm monoicousCDSS-dermatodea_contig10232 3656..3859 +
1622924146.4732223-CDS-S-dermatodea_contig10232:4206..42841622924146.4732223-CDS-S-dermatodea_contig10232:4206..4284Saccorhiza dermatodea SderLu1190fm monoicousCDSS-dermatodea_contig10232 4207..4284 +
1694079049.441947-CDS-S-dermatodea_contig10232:4206..42841694079049.441947-CDS-S-dermatodea_contig10232:4206..4284Saccorhiza dermatodea SderLu1190fm monoicousCDSS-dermatodea_contig10232 4207..4284 +


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of mRNA_S-dermatodea_contig10232.168.1

>prot_S-dermatodea_contig10232.168.1 ID=prot_S-dermatodea_contig10232.168.1|Name=mRNA_S-dermatodea_contig10232.168.1|organism=Saccorhiza dermatodea SderLu1190fm monoicous|type=polypeptide|length=94bp
MYGIGGPSAGGGVDNDSAAKGGNGWSAGLDNTHDKLNERAVAVVQRIQTK
LTGRDFSDAAGVLSVSEQVDRLILQASDMENLCQLFVGWCPFW*
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mRNA from alignment at S-dermatodea_contig10232:3621..4445+

Legend: UTRpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>mRNA_S-dermatodea_contig10232.168.1 ID=mRNA_S-dermatodea_contig10232.168.1|Name=mRNA_S-dermatodea_contig10232.168.1|organism=Saccorhiza dermatodea SderLu1190fm monoicous|type=mRNA|length=825bp|location=Sequence derived from alignment at S-dermatodea_contig10232:3621..4445+ (Saccorhiza dermatodea SderLu1190fm monoicous)
AGTTGCTCTCGCAGCGAGCGCCCGGAGAGTCCATCATGTACGGCATTGGG
GGGCCGTCCGCCGGTGGTGGTGTCGACAACGACTCAGCGGCGAAGGGAGG
TAATGGGTGGTCGGCCGGGCTCGATAACACGCACGATAAGCTCAACGAGC
GAGCGGTGGCGGTGGTGCAGCGCATCCAGACCAAGCTGACGGGGCGGGAT
TTCAGCGACGCGGCCGGTGTGCTGTCCGTCAGCGAGCAGGTTTGTTCGGG
AGCTCGTTCATTCGTTCGCTCGTTCTGACTGTTGAGGCAGTCCTTCGGTA
GGGGGGTGGGGGCTGCACTGGAGCCGCCACAACACAAAGCGGTTTGTGGT
GGGCCGACCTGCGTTTGATCATGGTCAGCAAGAGTAGGGCCTGGTCGTTA
TCCCACTCAAACCGTTACTTGCCAACCCAAACAATAATGTATATAGCAAA
CCCCGGGACTGCCATCCCAGGCTGTACCCCCAGACTACCACACATAAGCA
CACACACACACGCGCGCGCGCCCCATTCCTCCCTGTACTTCTCGCTCGCC
AAACCGCCCCGTCGCTTGCCTGCCTCGACCACTCAGGTCGACCGACTGAT
TTTGCAAGCGTCGGACATGGAGAACCTGTGCCAGCTGTTTGTGGGGTGGT
GCCCCTTTTGGTGACATAATTTATGCTCTTCTATGTTTCACGGTGGCGTC
CATCCCTAGCGACGGCGGGTTTGCCGCTTGAAAGCATCCCACCTAAATTG
GAGACACGACCTGGTTTTCGTGGGGCTGGTTTGGTTTCAATCTTTTGTGC
GCTGGTTTTTTGCTTATTTTCCGGA
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Coding sequence (CDS) from alignment at S-dermatodea_contig10232:3621..4445+

>mRNA_S-dermatodea_contig10232.168.1 ID=mRNA_S-dermatodea_contig10232.168.1|Name=mRNA_S-dermatodea_contig10232.168.1|organism=Saccorhiza dermatodea SderLu1190fm monoicous|type=CDS|length=564bp|location=Sequence derived from alignment at S-dermatodea_contig10232:3621..4445+ (Saccorhiza dermatodea SderLu1190fm monoicous)
ATGTACGGCATTGGGGGGCCGTCCGCCGGTGGTGGTGTCGACAACGACTC
AGCGGCGAAGGGAGGTAATGGGTGGTCGGCCGGGCTCGATAACACGCACG
ATAAGCTCAACGAGCGAGCGGTGGCGGTGGTGCAGCGCATCCAGACCAAG
CTGACGGGGCGGGATTTCAGCGACGCGGCCGGTGTGCTGTCCGTCAGCGA
GCAGATGTACGGCATTGGGGGGCCGTCCGCCGGTGGTGGTGTCGACAACG
ACTCAGCGGCGAAGGGAGGTAATGGGTGGTCGGCCGGGCTCGATAACACG
CACGATAAGCTCAACGAGCGAGCGGTGGCGGTGGTGCAGCGCATCCAGAC
CAAGCTGACGGGGCGGGATTTCAGCGACGCGGCCGGTGTGCTGTCCGTCA
GCGAGCAGGTCGACCGACTGATTTTGCAAGCGTCGGACATGGAGAACCTG
TGCCAGCTGTTTGTGGGGTGGTGCCCCTTTTGGTGAGTCGACCGACTGAT
TTTGCAAGCGTCGGACATGGAGAACCTGTGCCAGCTGTTTGTGGGGTGGT
GCCCCTTTTGGTGA
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