mRNA_P-littoralis_Contig199.47.2 (mRNA) Pylaiella littoralis U1_48

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Overview


Name	mRNA_P-littoralis_Contig199.47.2
Unique Name	mRNA_P-littoralis_Contig199.47.2
Type	mRNA
Organism	Pylaiella littoralis U1_48 (Pylaiella littoralis U1_48 (Mung))

Homology

[Close]

BLAST of mRNA_P-littoralis_Contig199.47.2 vs. uniprot
Match: A0A6H5JKE3_9PHAE (Uncharacterized protein n=1 Tax=Ectocarpus sp. CCAP 1310/34 TaxID=867726 RepID=A0A6H5JKE3_9PHAE)

HSP 1 Score: 251 bits (640), Expect = 2.110e-76
Identity = 134/217 (61.75%), Postives = 158/217 (72.81%), Query Frame = 3

Query:  159 MPSAAEWRLFLPNENGCGRPPPYPEARTLLAIVDDVPPVARTDVYLKADANVGVKRRGGRGLEIKALKQRQTLGGGVGPGAADIFAKVKLDDDASPADVLEQLRKEAASGXXXXAGVSEELGALMTNPLEVRVEKSVRKVDVGVGEGTVSFEVTDVTVDFAEIPEGHPKNWITFCAEGTLESMERFLEGKGRPLVALFSLREALQAGYPRFVQIMST 809
            M   AEWRLF+P  +    P    EAR + ++VD V P ARTDVY+KADA+VGVKRRGG GLE KALKQRQTLGGGVGPGAA+ F K+KL D A+P +V+E LRK+A  G      VSE L ALM+ PLEV V+KSVRK  V   EG  SFEVT+V+V F E+PE +PKNW TFC EG + S+E FL  KG+PLVAL SLR ALQ GYP FVQ++ST
Sbjct:    1 MAPKAEWRLFVPTVDFHRVPA---EAREMSSLVDHVDPDARTDVYIKADADVGVKRRGGGGLEFKALKQRQTLGGGVGPGAAETFQKIKLGDGATPTEVIEHLRKQAGKGE---GAVSEGLEALMSTPLEVTVKKSVRKTTVTTREGKASFEVTEVSVSFPEMPETYPKNWTTFCVEGKMTSIEAFLGSKGKPLVALLSLRGALQVGYPHFVQMIST 211

[Close]

BLAST of mRNA_P-littoralis_Contig199.47.2 vs. uniprot
Match: D7FLJ5_ECTSI (Uncharacterized protein n=1 Tax=Ectocarpus siliculosus TaxID=2880 RepID=D7FLJ5_ECTSI)

HSP 1 Score: 175 bits (444), Expect = 3.060e-48
Identity = 99/154 (64.29%), Postives = 112/154 (72.73%), Query Frame = 3

Query:  159 MPSAAEWRLFLPNENGCGRPPPYPEARTLLAIVDDVPPVARTDVYLKADANVGVKRRGGRGLEIKALKQRQTLGGGVGPGAADIFAKVKLDDDASPADVLEQLRKEAASGXXXXAGVSEELGALMTNPLEVRVEKSVRKVDVGVGEGTVSFEVT 620
            M   AEWRLF+P  +    P    EAR + ++VD V P ARTDVY+KADA+VGVKRRGG GLE KALKQRQTLGGGVGPGAA+ F KV L DDA+PA+V+E LRKEA  G     GVSEEL ALM+ PLEV V+KSVRK  V  GE   SFEVT
Sbjct:    1 MAPKAEWRLFVPIVDSHRAPA---EARNMSSLVDHVHPDARTDVYIKADADVGVKRRGGGGLEFKALKQRQTLGGGVGPGAAETFQKVMLGDDATPAEVIEHLRKEAGEGE---GGVSEELEALMSTPLEVAVKKSVRKTTVTAGERKASFEVT 148

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of mRNA_P-littoralis_Contig199.47.2 vs. uniprot

BLAST of mRNA_P-littoralis_Contig199.47.2 vs. uniprot
Analysis Date: 2022-09-19 (Diamond blastx: OGS1.0 vs UniRef90)
Total hits: 2


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A6H5JKE3_9PHAE	2.110e-76	61.75	Uncharacterized protein n=1 Tax=Ectocarpus sp. CCA...	[more]
D7FLJ5_ECTSI	3.060e-48	64.29	Uncharacterized protein n=1 Tax=Ectocarpus silicul...	[more]

Alignments

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
P-littoralis_Contig199	contig	P-littoralis_Contig199:241035..257853 -

Analyses

This mRNA is derived from or has results from the following analyses


Analysis Name	Date Performed
Diamond blastx: OGS1.0 vs UniRef90	2022-09-19
Pylaiella littoralis U1_48 OGS1.0	2022-07-08

Properties


Property Name	Value
Stop	1
Start	1
Model size	1804
Hectar predicted targeting category	other localisation
Exons	5
Ec32 ortholog description	hypothetical protein
Ec32 ortholog	Ec-17_000950.1
Cds size	657

Relationships

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
mRNA_P-littoralis_Contig199.47.2	prot_P-littoralis_Contig199.47.2	Pylaiella littoralis U1_48	polypeptide	P-littoralis_Contig199 242095..257695 -

The following UTR feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
1680789951.7118802-UTR-P-littoralis_Contig199:241034..241774	1680789951.7118802-UTR-P-littoralis_Contig199:241034..241774	Pylaiella littoralis U1_48	UTR	P-littoralis_Contig199 241035..241774 -
1680789951.7240684-UTR-P-littoralis_Contig199:241845..242094	1680789951.7240684-UTR-P-littoralis_Contig199:241845..242094	Pylaiella littoralis U1_48	UTR	P-littoralis_Contig199 241846..242094 -
1680789951.7773035-UTR-P-littoralis_Contig199:257695..257853	1680789951.7773035-UTR-P-littoralis_Contig199:257695..257853	Pylaiella littoralis U1_48	UTR	P-littoralis_Contig199 257696..257853 -

The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
1680789951.7325768-CDS-P-littoralis_Contig199:242094..242288	1680789951.7325768-CDS-P-littoralis_Contig199:242094..242288	Pylaiella littoralis U1_48	CDS	P-littoralis_Contig199 242095..242288 -
1680789951.7444623-CDS-P-littoralis_Contig199:242890..243092	1680789951.7444623-CDS-P-littoralis_Contig199:242890..243092	Pylaiella littoralis U1_48	CDS	P-littoralis_Contig199 242891..243092 -
1680789951.7550628-CDS-P-littoralis_Contig199:253940..254030	1680789951.7550628-CDS-P-littoralis_Contig199:253940..254030	Pylaiella littoralis U1_48	CDS	P-littoralis_Contig199 253941..254030 -
1680789951.7651196-CDS-P-littoralis_Contig199:257524..257695	1680789951.7651196-CDS-P-littoralis_Contig199:257524..257695	Pylaiella littoralis U1_48	CDS	P-littoralis_Contig199 257525..257695 -

Sequences

The following sequences are available for this feature:

protein sequence
mRNA from alignment at P-littoralis_Contig199:241035..257853-
coding sequence from alignment at P-littoralis_Contig199:241035..257853-

protein sequence of mRNA_P-littoralis_Contig199.47.2

>prot_P-littoralis_Contig199.47.2 ID=prot_P-littoralis_Contig199.47.2|Name=mRNA_P-littoralis_Contig199.47.2|organism=Pylaiella littoralis U1_48|type=polypeptide|length=219bp
MPSAAEWRLFLPNENGCGRPPPYPEARTLLAIVDDVPPVARTDVYLKADA
NVGVKRRGGRGLEIKALKQRQTLGGGVGPGAADIFAKVKLDDDASPADVL
EQLRKEAASGGGGGAGVSEELGALMTNPLEVRVEKSVRKVDVGVGEGTVS
FEVTDVTVDFAEIPEGHPKNWITFCAEGTLESMERFLEGKGRPLVALFSL
REALQAGYPRFVQIMSTA*

mRNA from alignment at P-littoralis_Contig199:241035..257853-

Legend: UTRpolypeptideCDS

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>mRNA_P-littoralis_Contig199.47.2 ID=mRNA_P-littoralis_Contig199.47.2|Name=mRNA_P-littoralis_Contig199.47.2|organism=Pylaiella littoralis U1_48|type=mRNA|length=16819bp|location=Sequence derived from alignment at P-littoralis_Contig199:241035..257853- (Pylaiella littoralis U1_48)
CATGATAATCCATCCGCCCGCGCCCGGTACAGCACTCCGACCGTACTCTC
TGTCCTTCGTAGTCCCGCCCCCCTTCTGTCCCGTGCCGTACAGCAAAAGC
ATCTCGATCGATCAACACTGTACCCGACAACAAGGGCACAAAATAACCTC
TATCTATCATGCCGAGCGCGGCAGAGTGGAGGCTCTTCCTTCCCAACGAG
AACGGCTGCGGCCGACCTCCCCCCTACCCCGAAGCGCGGACTCTCCTCGC
CATCGTCGATGATGTGCCTCCTGTTGCAAGAACGGATGTCTACCTCAAGG
CCGATGCTAATGTTGGTGTTAAGCGAAGGGTGAGCATCAACACTTGCAGT
CGCGAGCTGGTTGCTTTGACCCAGGCTCTATGGTGAAGGGCATAGGTAGA
TCCAGGGAATGCAGAGAGAAATGCGGTGCTGTACTTGACCAACTCATCTA
GTCTATGCTGCAGCTTCATATACTGCTGTGTGCACAGCAGGTCCAACAGC
CCGTTGGATCCAGAGGCCACGACTTGTATATCTCATCGCAAATGATAAGC
GTTTTCTGGAACCCAAACCGGGTACACTGCTGTACAGCAGTACGTGATTG
TTATGGTACAGGATAAGAACAGCTGTCTGTAGTGACGCCAGTAGTATGAT
ATAATGGCTAGACTTCGATTTAACCAGACTCGTACAGCAGTAGTGATGTA
CTCCCGCGTAGTCGTTCAGGAGGATCTACTTGTAGACAAATTGAGAGCGA
ACATGAGAGGTATAAACCTGTGGACACGACAGCAGTGTTTCGTAACTCGC
ATCGTAAGGAGACTGAGCAACTTCCCTGATGTTGCACAGTTACGGACTTG
TGTTTCAATTGATACTACTTCGAGTACTTCGCATGACGTTTCATATTTTT
CATATTTCGGCCTGTTTGAGACCCCGATCCTCGGAATGGTCCTCAGAACG
GGGGTGTAAAAGGCCTAATCTACTCGACACCGTCCAATAATCCGAGCAAC
ATAATTTTCCTCGAAAAAGGGTCGCGATTTCGGTTTTCAGCAACCGCAGA
GGGGCTGGTGCACAAATGTGGGGAAAAACAAAAAATGCACTTGCTTGACG
ATACCAGACAGACAGGTCCCGGAGGCCTCGTAAGTTCTGATTATTTCGAA
ATTGAGGCCTGGATTTCACTGACCTCCGGAGCCGCTCCCTCTACGCAATT
GTTCCAGCTTGTGCGCTGGCCAGGAAAAAGTTGCAAAAAGAGCTGTGTTG
GTCGAGGTGGTGAACATTCCGTGCACAGTAGAGTTTTGCGTCGGAGTCAC
AAGCTATACAAATCACGGCATCTGACAGAAACAGAGCTTGAAGGCCTCGG
AATTCCTGGTTCTTCTGAAATGAAGACTTCCATTGCATGAGCCCTCGTTG
GCGCCGCTGCTTCTAGGCAGATGTTACAGCGTGTGTGTAGGCCAATAAAG
GGCTGCAAGATGGGCGGACTGATAAGCGCAAAGAGGGCTCTGCGGATTCT
GACTCGTCTTCTTCGCATTCTCTTTACCGATCTCTGGCCACGCCCGCGCT
GAAAATGCGCAAAGCAGGGATGAATACGCTTGCCAGCGTGTACTCTTCTC
TGTATTTTTTCTGCTGCTACAGTTTGCAATGCTGCTGCTGCTGCTGCTGT
TAGGCGGGTTCCCGCTTATTTTCAAGGTTTTTCCGATGGTGTCGGGAGGA
AGACTTCACTGGAGAGAGTTTGGTCGGTTTCATCTTTTCGCAGGAAAAAT
CTGGTTTGTGGTATTTGGACTGCTTCAGTTTGGTTTGGACGGACTATCCG
TAAAGAAGCGCCCCCGATAGGGCTTCCCGCCCGTTTTTTTCAAAGTTTTC
ATATTCCAGAAGATATATGGCTTCGCAACAACGGACTTAGAGGATAGAGG
GAATGCAAGAAGCTTACGGTTCCATCTGAGGGCCCCCAGGCTGCTGGCTC
GTGAGTACCAATGGTAGATGACGTAAGAGCCGAAGGCTTGGAGGGCAACT
CTAGTTAGACCGCAACTCTAGGGTGTTGCGGGGTTTCAAAGTATGGAAGG
GTTAGGTACGAGTGCGGGGGCGTTTGGATCGGCCCCTTCTTCACGCTGCT
GACAAGCACACTCAACACAGGAGCACCGACAGCTGGGCTCAGACTGGCGT
GCAATTCTCTTTCATAGCCTCACACTATCCCTAGCAAGGAAGGAGTCGAA
GAAGGAAGGGAAATCCGTGGACGATGAGTTAAAATCGCGTCATGCTGTCA
TCAGTTGCAACCCGGGGCTGCTTCGTCAAAATTCCGTTTGCCCTCCATGC
CAACAGCGTCTGTTCCTCACACAGCATGCATAGGTTGAGGTGCACCCACA
GTGGCGGCTACTGTGTATATCTGGCTATCCCAAGCAACAATCCCCATTCA
ATTACATGACCTGTACGCTGAGCGTGATAAAATTCGGACTCGGAAAATGT
CCTGACCCGCGGTCGTACGGATGTATGTGACACTACTTGCGCTGTCTTTG
CGAAGGATCCTTGCTTTTTTTTTTTCAAAACGTATTTTGTTTTTTTTTGT
AGGAAAAAAAAACCCAGCCGAAACAACAGCAGTATTTTCCCTGCTTCGTC
CGCATTATGCTCAGGTGAAATTTCTCTTCCTCCTCCATATCAAACCCATG
CAGTTGGTCTAGTCGATGCCAGAAGGGACTCACTCTTCTTTTGCTGGCTG
TTGTTGCTTCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTTGCTGCTGGACCACTCGACAA
CAGAGAATAAGAGGGTTGCACTGCAGGATAAAGATGCTGCTGCAAGGAAG
AGCTGTGCATTTGCACTGCCGCTGAAACCGTTGTGTAGGTTAGTGACTGC
TGTCTTGGGAGAATGTTGTAACAGAGAGACTCATCACAAGAAGGGACGCC
GCCACGTATGATGTGGCCCTGCTCATTGCAGGCATCAATATAGTCGCCTC
GATATCTTCCTTGGGTTATCCACGGTCCCCTCCTGCTTCCCGGCATAAGA
GCGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCCCTCCCACTCCAGAGGAGAGATCT
TCCTTCTGCTGTTTTTAAGACAGAGGGCGGAGGCTGCAGGCAGCGTGCTA
CTGAACGGCTGCTGAAAAAACGTTTTTTGTGCAAATCACGTCATTTCTCA
GTCATATTGACGAGTTCGAAGTACTCCGTAGTTCGGAGTAAATTTTCTAG
AGAACGTTCTCGGTCCTTAGATCCAAATACGGAAACTAAAATAGTGTGTT
GTCCGCGTGCGAGTCTGAACCTGTCTAACTACACCTTTATTTTGATTTCT
GGTACCTGGAAACCCTTGGCTTCTTGATACCATGATGTCCCTGTGCTCTT
CTGACAGTTATAATGTATTTTTGTTTTTCCTCCCGAAGACAGAATAGATA
CATGGACCTCTGTCAGGACGAGGATCCGCTGCAAGAATGTGTACTTGCAC
TAAAGAAATGAACGCTGTCCTCTGGCCGGAACTTTTCCCCTCTGACCTGG
AGACTTTCACGAACAAATTTTTTCAAGGTTATACAGACAGACAGAAGTTT
TCGTTGTATCCGGTCGGGAATAACGGAACCCTCTCTTGTAAAAGTTCATG
ACGTATCCCTCCAATAATTTGTCTCGACGGGGCGTTTCTTCTTGGCGAGG
CGCGTGTCCAGTTAAGAGTTCCCCCAACTAGAATACAGGGGGGTATCTAC
TGTGCTCTCCCCCGCTACTCTGTAGATACGAGTTATGCTATGATACTTGG
CACTTGCTCCATGTACATTTCCACCCATCTTTGCTAAAAGCTGTTGGAAC
GACACCATTACACAATCATCTAGGGGGGGCGAGGCCTGGAGATCAAAGCT
TTGAAGCAGCGGCAAACTCTCGGCGGCGGCGTTGGTCCTGGGGCAGCGGA
TATCTTCGCGAAGGTACCTATCTCCAGCAGTATTGGTTTAGGGTTCTCTT
TCTCTCTGAGGTTTTGTTCTCAACAGACATCAGCGTATTCGCCGCTCTAT
TTTGTTTTGGGCAAAAATACTACTGGTATAAATCTATTTTGTGATAAAAC
ATTCCACCACGGGGCCTCTGGGGGGGGTTGGGGTGTTGGGTTCTGTTGGG
TTGAGTTGGGTTGGGTTGGGTGGGGTTGCACCCCCCCTTCTGGGAGGGGT
TGGGGGGGGGTACCGTATGGTTGGGTTGGGTTGGGTAGGGTAGGGGGGGG
GTACCGTATGGTTGGGTTGGGTTGGGTTGGGTTGTGTAGGATTGCGCCCT
GGGGGGGGTTGGGAGGGGTGCCGTAGGGTTGGGTTGGGTTGAGTTGTGTA
GGGTTGCGCCCCCCCCTGTGGGGGGGGGTTGGTGGGGGTACCGTACGGTT
GGGTTGGGTTATGTTGGGTAGGGTTGGGTTCGGTTGAATTGGGTCGGTTG
GGTTGATTTGAGTTAGGGGGTATTGTAAGGGTGGCTTGGGTTGGGGTAGT
TTCGTTGGGTTGGCGTTTGGGTTTCGTCGGGATATCGTTCGAAAACCTCT
CTATCTCTCTTACTGTGTAGTCTCAAGGGTCAATTTGCTGTGTGTGGTGT
GTCCTTTTCTCGTCCTGGCACTGCTGTGTGTGGTCACCTACTCGTGGAGT
CAGCGGTACTAATCGTACTTCATACTACACTGCTGTACTACTGCCGTATG
CAGTAACAACAACCAGCATTGAGCCCCTAGCGATATGCAGAGCACCCACA
GCCCTCTCCCGTCCTCTTCCTGGAACTAATACTGGCGCTGGCTGCTGCTA
CTCTGACATCAGACTATAGCACACAGCTGGGTTGTGAGCGTTCGCTGCGT
GGGAGTGACAATTAATGGATTGGGTTGGGTTCGAGGGGTAGTACGAGGAT
GGGTCGGTGCGTGCTTTTGGGCGTGCTTTCTGCAGCAAGCAACACTCTCT
GCTTTTACCGAAAAAAATGGCTTTTCCCGAAAAAAGAGGGGTTCAGTGAA
TGCCGGTTATCCTCGATTCCCAGATATATCTACTTTAGCGGGTAGGGGGA
GGATCTCGCCCATGTCAGGGACATATATCTCCACTAGCGCGTGACATCAA
AAATGTCGCCGGGGATACGAACAGCAAAAACCGAGAATACCGGTGTTATG
TAGGCGCCTATGTGGGAATCCCTCTAATCTTCGGATGTGTCTCGGGCCTG
CTCCGGCCTGGTGTGCTGGGTGCTCGTGCTACTTACAGCAGCAGCAGCAG
CAGCGTACAGCAGACTAAAATTCGTAGCTAGTGTCAACTGCGAAGCAAAA
CCAGCACACACAGGGACTCCTAGGCAGTGCATGCACAGCCCTTCGTCCTG
CTCCTGTTACTTCTGGATGCTTTTCCTGCTAGCTGCTGTCGGTGCCGCTG
CTTCTACATCATCACATGATTCCTGCTCCGAGCTCATCTGTACAATTGCG
GTATTCTTTCGACGTGTTCCTCGACGACCAACTTTTCCGAAATATCCTCG
GCGGTCCCGAAGGACACAAACACGTCCTCGTTCACCCTTCCACGTAGAGG
GGCCAGCGTGCCGAAATTTACCACCTCCTCGGTCGAATTCCCGTAAATAA
AGCACGATTCGGGACACACATACTGTAACCCTACAGCTTTTCTTCTCGAT
CGAATTCCCGTGAAGTACCTTTCGGGACCCACACACTGTAACACAGCAAT
CCTCCTCGGTCGAACCCCCGTTAAGTACCTTTCGGGACATCCACTTCTGT
GGCACAACTCCAACCAACAACTGTGACTACTGTGGCACAACTCCAGCCAA
CAACTGTGATTCAGCAATCCGCTATGTGTTATTTTTTGCGACGTATAATA
GCATGCACCGATATCGTGTTCGCCTTTCAATCGAAGAGGATCCAGAAACG
TGTGAAATGAGAAAATTCGTGGAAATTTCCGACATTCAAGGACCCAGCTA
ATAATTCGCACACCGTTAAGCGGGAAGTTTCCGCGCGGTTACTACAGGGC
TCAAAGAGACGGTATCACGTATCGGTAAGTCAAACTTTAACACTGCTGCT
GTCTGTTTCAGGGGTGATGGCTATGAGAAGATCCTGCAAGCTCCGGTCCA
CAGGAGTCCCGTGCGTGCCATCTACCGTAGAAAAATGTGCACAAAGTCTA
AGGGGGCTCGGCGTGGGGTTGGCCCACTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTG
TTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTT
GTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGT
TGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTG
TTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTT
GTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGT
TGTTGTTGTCGTTGTTGTTGTCAACACCGCTGGTTTGAAACGCACTTGTC
CTTCTTCAAGCTCACACGTCATGCTCGACAAGACGAAATTTCCTCTCTCC
CTGTTTCCGTCTTTCCCTCTCTCTGTCTCTCTCCCTCTCTCTCCCTCTCT
CTCTCTTTGTTACCTGTCAATCTATTTTGATGCTTGCATTCAACAGCTAA
CGCAGCTTGGGTGGAACTCGAGGCTTGTGTGGGATTTTTGTCTCCCTCAC
GTCGTACATACCGTCCACCGATATAGGCGCTGGTCCCATAACGACGACGA
CACGAAAAAACATCACCCGGTGCAACACCGTTCGATTAACCTACTTCACG
GTAGCCCCAAAACGTGAACAACTCCCGAATGTCAGTGGTGATTCTACAAG
GACTCGTCGGGACGGCGCTTCTTCTCGAAAGGGACGCATACATGCGCTGT
CAGAAGTCAAATTACTGCTTGTACGGCAGAGCAAAAATAGATTACACTCC
CCCCTTCCTCTAGCCCTTTGGGATTCCTTCGGGTCTCTACTCGTATGATA
CCAGTTTACTAAGCCATAAACCGACAGAAATATATATTTTGACCACCCTG
GCGGAAGAGAGGCGCGCTCCTTCGTCTTCTTCGTGTTTCGCCCCACCTAT
ACCTCTTTTTCCCTATGTATTCGTTCCTGCGATCTCAACAACTGTGGACC
TGAAAGGTCAAGCTGGACGACGACGCCTCCCCGGCGGATGTCCTCGAGCA
ATTACGCAAGGAGGCGGCATCGGGAGGGGGAGGAGGAGCTGGTGTGTCGG
AGGAGTTGGGGGCGCTGATGACGAACCCGCTTGAGGTTCGCGTGGAGAAG
TCTGTGCGGAAGGTGGATGTGGGTGTTGGGGAGGGAACCGTGAGCTTCGA
AGTGACAGGTATGCTAGGTGCAAAGTAGGTTCCCTCTTGTGACAAGGGTG
AACCTCTCCCTCATTTTTGACGGTTTTGGTTGTCCTAAAGGTTGTTGTTG
TTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTATTGTTGTT
GTTATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGT
TGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTG
TTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTT
GTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGT
TGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTG
TTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTT
GTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGT
TGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTG
TTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTT
GTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGT
TGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTG
TTGTTGTTGTTGTTGTCGTTGTTGTTGTCAACACCGCTGGTTTGAAACGC
ACTTGTCCTTCTTCAAGCTCACACGTCATGCTCGACAAGACGAAATTTCC
TCTCTCCCTGTTTCCGTCTTTCCCTCTCTCTGTCTCTCTCCCTCTCTCTC
CCTCTCTCTCTTTGTTACCTGTCAATCTATTTTGATGCTTGCATTCAACA
GCTAACGCAGCTTGGGTGGAACTCGAGGCTTGTGTGGGATTTTTGTCTCC
CTCACGTCGTACATACCGTCCACCGATATAGGCGCTGGTCCCATAACGAC
GACGACACGAAAAAAACATCACCCGGTGCAACACCGTTCGATTAACCTAC
TTCACGGTAGCCCCAAAACGTGAACAACTCCCGAATGTCAGTGGTGATTC
TACAAGGACTCGTCGGGACGGCGCTTCTTCTCGAAAGGGACGCATACATG
CGCTGTCAGAAGTCAAATTACTGCTTGTACGGCAGAGCAAAAATAGATTA
CACTCCCCCTTCCTCTAGCCCTTTGGGATTCCTTCGGGTCTCTACTCGTA
TGATACCAGTTTACTAAGCCATAAACCGACAGAAATATATATTTTGACCA
CCCTGGCGGAAGAGAGGCGCGCTCCTTCGTCTTCTTCGTGTTTCGCCCCA
CCTATACCTCTTTTTCCCTATGTATTCGTTCCTGCGATCTCAACAACTGT
GGACCTGAAAGGTCAAGCTGGACGACGACGCCTCCCCGGCGGATGTCCTC
GAGCAATTACGCAAGGAGGCGGCATCGGGAGGGGGAGGAGGAGCTGGTGT
GTCGGAGGAGTTGGGGGCGCTGATGACGAACCCGCTTGAGGTTCGCGTGG
AGAAGTCTGTGCGGAAGGTGGATGTGGGTGTTGGGGAGGGAACCGTGAGC
TTCGAAGTGACAGGTATGCTAGGTGCAAAGTAGGTTCCCTCTTGTGACAA
GGGTGAACCTCTCCCTCATTTTTGACGGTTTTGGTTGTCCTAAAGGTTGT
TGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTATTGTTG
TTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTT
GTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGT
TGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTG
TTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTT
GTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGT
TGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTG
TTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTT
GTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGT
TGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTG
TTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTT
GTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTCGTTGTTGT
TGTCAACAATGTTGTTACGTCAACACCGCTGGTTTGAAACGCACTTGTCC
TTCTTCAAGCTCACACGTCATGCTCGACAAGACGAAATTTCCTCTCTCCC
TGTTTCCGTCTTTCCCTCTCTCTGTCTCTCTCCCTCTCTCTCCCTCTCTC
TCTTTGTTACCTGTCAATCTATTTTGATGCTTGCATTCAACAGCTAACGC
AGCTTGGGTGGAACTCGAGGCTTGTGTGGGATTTTTTGTCTCCCTCACGT
CGTACATACCGTCCACCGATATAGGCGCTGGTCCCATAACGACGACGACA
CGAAAAAACATCACCCGGTGCAACACCGTTCGATTAACCTACTTCACGGT
AGCCCCAAAACGTGAACAACTCCCGAATGTCAGTGGTGATTCTACAAGGA
CTCGTCGGGACGGCGCTTCTTCTCGAAAGGGACGCATACATGCGCTGTCA
GAAGTCAAATTACTGCTTGTACGGCAGAGCAAAAATAGATTACACTCCCC
CTTCCTCTAGTCCTTTGGGATTCCTTCGGGTCTCTACTCGTATGATACCA
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TCTTTTTCCCTATGTATTCGTTCCTGCGATCTCAACAACTGTGGACCTGA
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CGCAAGGAGGCGGCATCGGGAGGGGGAGGAGGAGCTGGTGTGTCGGAGGA
GTTGGGGGCGCTGATGACGAACCCGCTTGAGGTTCGCGTGGAGAAGTCTG
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GTCGGGACGGCGCTTCTTCTCGAAAGGGACGCATACATGCGCTGTCAGAA
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GGTCAAGCTGGACGACGACGCCTCCCCGGCGGATGTCCTCGAGCAATTAC
GCAAGGAGGCGGCATCGGGAGGGGGAGGAGGAGCTGGTGTGTCAGAGGAG
TTGGGGGCGCTGATGACGAACCCGCTTGAGGTTCGCGTGGAGAAGTCTGT
GCGGAAGGTGGATGTGGGTGTTGGGGAGGGAACCGTGAGCTTCGAAGTGA
CAGGTATGCTAGGTGCAAAGTAGGTTCCCTCTTGTGACAAGGGTGAACCT
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CAAGCTCACACGTCATGCTCGACAAGACGAAATTTCCTCTCTCCCTGTTT
CCGTCTTTCCCTCTCTCTGTCTCTCTCTGTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCT
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CCAAAACGTGAACAACTCCCGAATGTCAGTGGTGATTCTACAAGGACTCG
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GAGAGGCGCGCTCCTTCGTCTTCTTCGTGTTTCGCCCCACCTATACCTCT
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GTCAAGCTGGACGACGACGCCTCCCCGGCGGATGTCCTCGAGCAATTACG
CAAGGAGGCGGCATCGGGAGGGGAGGAGGAGCTGGTGTGTCGGAGGAGTT
GGGGGCGCTGATGACGAACCCGCTTGAGGTTCGCGTGGAGAAGTCTGTGC
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CTCTCTCTCTTTGTTACCTGTCAATCTATTTTGATGCTTGCATTCAACAG
CTAACGCAGCTTGGGTGGAACTCGAGGCTTGTGTGGGATTTTTGTCTCCC
TCACGTCGTACATACCGTCCACCGATATAGGCGCTGGTCCCATAACGACG
ACGACACGAAAAAAACATCACCCGGTGCAACACCGTTCGATTAACCTACT
TCACGGTAGCCCCAAAACGTGAACAACTCCCGAATGTCAGTGGTGATTCT
ACAAGGACTCGTCGGGACGGCGCTTCTTCTCGAAAGGGACGCATACATGC
GCTGTCAGAAGTCAAATTACTGCTTGTACGGCAGAGCAAAAATAGATTAC
ACTCCCCCCTTCCTCTAGCCCTTTGGGATTCCTTCGGGTCTCTACTCGTA
TGATACCAGTTTACTAAGCCATAAACCGACAGAAATATATATTTTGACCA
CCCTGGCGGAAGAGAGGCGCGCTCCTTCGTCTTCTTCGTGTTTCGCCCCA
CCTATACCTCTTTTTCCCTATGTATTCGTTCCTGCGATCTCAACAACTGT
GGACCTGAAAGGTCAAGCTGGACGACGACGCCTCCCCGGCGGATGTCCTC
GAGCAATTACGCAAGGAGGCGGCATCGGGAGGGGGAGGAGGAGCTGGTGT
GTCGGAGGAGTTGGGGGCGCTGATGACGAACCCGCTTGAGGTTCGCGTGG
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GGGTGAACCTCTCCCTCATTTTTGACGGATTTGGTTGTCCTAAAGGTTGT
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CAGTACGTGTGATACGTTGTACGAAGTTTTTTTTTCGTGCAATCCGAGGA
ACACGGAGATATTTGCCTCGCGCGCGTCTGTGTACGTTTGGGTTCGCTCG
CCATGCGCTTCATGCACCTCCCCCCCGTAAGCGCTATTATGGTGTGCGGA
CTGATTTGCATTTGAACGATTTCCACTATATCACAACGTACCAAACGAGG
GCATAAAGCAGTGAGCTGTCCCAGAACGAACCCAGGCTAGCAACCCCCCC
GCATTGTCGGCATGATAAACCGAGACCTGATGGAATGGACTGATCGACGG
ACCCCCCCCCCCCTCCCCCCCCCAAATTCATCCGCAATCAATACCTGGTA
TATGGCCTAACATATGATGCGTATATCTCCCCGCCCCAAACCAAACTAAT
TTCGGTTTTTGACAGATGTTACGGTGGATTTCGCTGAAATCCCGGAGGGT
CATCCGAAGAACTGGATCACCTTTTGCGCGGAAGGTACTTTGGAAAGCAT
GGAGAGATTTCTGGAGGGGAAGGGGAGACCCCTGGTCGCGCTCTTCTCTC
TAAGGGAGGCCCTTCAAGCCGGGTACCCTCGATTCGTGCAGATAATGTCG
ACCGCATGAGCTTGTTTTGCTTGCTTTAATTTTTGCGGGCCGAAACTTTT
TTTCGGAAGAGGATTATCTCTCACGAGTTGGATCAGTGCGCAGTACGGAG
GGCATTGGGCAGAGGAAACAAATCCCGGCAACGCGGCAGCGGTAACAGCG
AAGCTCGCCTATTGTTTTGTTCTTGTTGGGGTGACTAACTGCGAAGTCTG
CCCGCCTGTGGTTTTGCTCTACTACCGGTAATTGCTAAGCCTGCTTATGT
CCATACTACCCCGCATGTAGCTCCACCAGAACTTGCGTTGGAATATATAT
TTATTTTTTACTCGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGCGTG
TGTGTGCGTGTGGAGTATTTGCTTTCTTTTATTGGTCGTAGGGGATGCAC
AACTGCTAGAGTGTGTTGAAGAAAAGGCGTCGAGGTGTCATTACGAAGGT
CTAATCACTCGCATTTGTGTGCGTGCGTTCTTGCGTGTGTGTGCGTGTGC
GTGTGCGTATGTGTGTCAAGGTGTCGCTTTCACGTTATCCGCGAATCATT
TGGTGCCTTACGAGCAACGGCTGTACCATGACTTGGGGATAAGAGCCCAC
ATGTTTGCATCGTCTTCTATGTAAGTGTGGGGTGAGGAATAATGTACGAG
GGGTAGGTGGTATCTTGAATCCCCGCAGGAATCAGGGAGTATCGTGACCC
CCAGGTGGTGTGTTGGATCCTTACCTTGATCCCTTTCCTTTCCACTGTTT
GATACTCTCGTGTATGGGGTCTGGAGTGATGCCTGCTCCTGAGGTTCAGC
ACCAAAAGCTTGGGGGGCGGCCCAGAGGCGCGTTCTAGAGCACCGACAAA
TGGCTTTCCAAAGGCCACTTATCATTGAGGCATTACGAAGAGAGAGGGGG
GAGACAGCAGGAGTGGGACTCGAACAATGTCCTGTTCGTTTTGGCATGTC
ATATGTGTAGCTTTGTTGATACTCGTCGTACTTGTATCCAAAATTGCACT
CTGTCAATAGGCTTTTTCTGTATGTTCGCTCAAGATGGGGGTGGGGGGTG
GCGGCCGCATGTGTGCTCA

Coding sequence (CDS) from alignment at P-littoralis_Contig199:241035..257853-

>mRNA_P-littoralis_Contig199.47.2 ID=mRNA_P-littoralis_Contig199.47.2|Name=mRNA_P-littoralis_Contig199.47.2|organism=Pylaiella littoralis U1_48|type=CDS|length=657bp|location=Sequence derived from alignment at P-littoralis_Contig199:241035..257853- (Pylaiella littoralis U1_48)
ATGCCGAGCGCGGCAGAGTGGAGGCTCTTCCTTCCCAACGAGAACGGCTG
CGGCCGACCTCCCCCCTACCCCGAAGCGCGGACTCTCCTCGCCATCGTCG
ATGATGTGCCTCCTGTTGCAAGAACGGATGTCTACCTCAAGGCCGATGCT
AATGTTGGTGTTAAGCGAAGGGGGGGGCGAGGCCTGGAGATCAAAGCTTT
GAAGCAGCGGCAAACTCTCGGCGGCGGCGTTGGTCCTGGGGCAGCGGATA
TCTTCGCGAAGGTCAAGCTGGACGACGACGCCTCCCCGGCGGATGTCCTC
GAGCAATTACGCAAGGAGGCGGCATCGGGAGGGGGAGGAGGAGCTGGTGT
GTCGGAGGAGTTGGGGGCGCTGATGACGAACCCGCTTGAGGTTCGCGTGG
AGAAGTCTGTGCGGAAGGTGGATGTGGGTGTTGGGGAGGGAACCGTGAGC
TTCGAAGTGACAGATGTTACGGTGGATTTCGCTGAAATCCCGGAGGGTCA
TCCGAAGAACTGGATCACCTTTTGCGCGGAAGGTACTTTGGAAAGCATGG
AGAGATTTCTGGAGGGGAAGGGGAGACCCCTGGTCGCGCTCTTCTCTCTA
AGGGAGGCCCTTCAAGCCGGGTACCCTCGATTCGTGCAGATAATGTCGAC
CGCATGA