mRNA_P-wetherbeei_contig8659.1.1 (mRNA) Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79

You are viewing an mRNA, more information available on the corresponding polypeptide page

Overview
NamemRNA_P-wetherbeei_contig8659.1.1
Unique NamemRNA_P-wetherbeei_contig8659.1.1
TypemRNA
OrganismPhaeothamnion wetherbeei SAG_119_79 (Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79)
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of mRNA_P-wetherbeei_contig8659.1.1 vs. uniprot
Analysis Date: 2022-09-19 (Diamond blastx: OGS1.0 vs UniRef90)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
P-wetherbeei_contig8659contigP-wetherbeei_contig8659:34..789 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Diamond blastx: OGS1.0 vs UniRef902022-09-19
Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79 OGS1.02022-07-08
Properties
Property NameValue
Stop1
Start1
Seed ortholog67593.Physo141622
Preferred namePNP
PFAMsPNP_UDP_1
Model size744
Max annot lvl2759|Eukaryota
KEGG rclassRC00033,RC00063,RC00122
KEGG koko:K03783
KEGG ReactionR01561,R01863,R01969,R02147,R02294,R02295,R02297,R02484,R02557,R02748,R08368,R10244
KEGG Pathwayko00230,ko00240,ko00760,ko01100,ko01110,map00230,map00240,map00760,map01100,map01110
Hectar predicted targeting categoryother localisation
GOsGO:0001775,GO:0001816,GO:0001882,GO:0001910,GO:0001912,GO:0001914,GO:0001916,GO:0002054,GO:0002060,GO:0002252,GO:0002263,GO:0002274,GO:0002275,GO:0002283,GO:0002366,GO:0002376,GO:0002443,GO:0002444,GO:0002446,GO:0002682,GO:0002684,GO:0002694,GO:0002696,GO:0002697,GO:0002699,GO:0002703,GO:0002705,GO:0002706,GO:0002708,GO:0002709,GO:0002711,GO:0002790,GO:0002819,GO:0002821,GO:0002822,GO:0002824,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004731,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005576,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006148,GO:0006149,GO:0006152,GO:0006161,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006183,GO:0006195,GO:0006282,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006738,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006810,GO:0006887,GO:0006915,GO:0006950,GO:0006955,GO:0006974,GO:0006996,GO:0007005,GO:0007154,GO:0007165,GO:0008104,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008219,GO:0008284,GO:0008617,GO:0008630,GO:0008637,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009116,GO:0009117,GO:0009119,GO:0009120,GO:0009141,GO:0009142,GO:0009144,GO:0009145,GO:0009150,GO:0009151,GO:0009152,GO:0009163,GO:0009164,GO:0009165,GO:0009166,GO:0009199,GO:0009200,GO:0009201,GO:0009205,GO:0009206,GO:0009215,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009262,GO:0009306,GO:0009314,GO:0009394,GO:0009435,GO:0009628,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010212,GO:0010332,GO:0010604,GO:0010941,GO:0012501,GO:0012505,GO:0015031,GO:0015833,GO:0016043,GO:0016192,GO:0016740,GO:0016757,GO:0016763,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019359,GO:0019362,GO:0019363,GO:0019438,GO:0019439,GO:0019637,GO:0019674,GO:0019692,GO:0019693,GO:0022407,GO:0022409,GO:0023052,GO:0030141,GO:0030155,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031341,GO:0031343,GO:0031410,GO:0031974,GO:0031982,GO:0031983,GO:0032501,GO:0032623,GO:0032940,GO:0032944,GO:0032946,GO:0033036,GO:0033554,GO:0034356,GO:0034404,GO:0034418,GO:0034641,GO:0034654,GO:0034655,GO:0034656,GO:0034774,GO:0035556,GO:0036094,GO:0036230,GO:0042102,GO:0042119,GO:0042127,GO:0042129,GO:0042221,GO:0042278,GO:0042301,GO:0042451,GO:0042453,GO:0042454,GO:0042455,GO:0042493,GO:0042886,GO:0042981,GO:0043066,GO:0043067,GO:0043069,GO:0043094,GO:0043101,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043233,GO:0043299,GO:0043312,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044270,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044283,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044433,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0045055,GO:0045184,GO:0045321,GO:0045577,GO:0045579,GO:0045580,GO:0045582,GO:0045595,GO:0045597,GO:0045619,GO:0045621,GO:0045739,GO:0045785,GO:0045935,GO:0046039,GO:0046070,GO:0046094,GO:0046102,GO:0046115,GO:0046121,GO:0046122,GO:0046124,GO:0046128,GO:0046129,GO:0046130,GO:0046390,GO:0046415,GO:0046434,GO:0046483,GO:0046495,GO:0046496,GO:0046634,GO:0046635,GO:0046637,GO:0046638,GO:0046700,GO:0046903,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0048583,GO:0048584,GO:0050663,GO:0050670,GO:0050671,GO:0050776,GO:0050778,GO:0050789,GO:0050793,GO:0050794,GO:0050863,GO:0050864,GO:0050865,GO:0050867,GO:0050870,GO:0050871,GO:0050896,GO:0051052,GO:0051054,GO:0051094,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051179,GO:0051186,GO:0051188,GO:0051234,GO:0051239,GO:0051240,GO:0051249,GO:0051251,GO:0051716,GO:0055086,GO:0060205,GO:0060255,GO:0060548,GO:0065007,GO:0070013,GO:0070228,GO:0070229,GO:0070232,GO:0070233,GO:0070637,GO:0070638,GO:0070663,GO:0070665,GO:0070970,GO:0071702,GO:0071704,GO:0071705,GO:0071840,GO:0072521,GO:0072522,GO:0072523,GO:0072524,GO:0072525,GO:0072526,GO:0080090,GO:0080134,GO:0080135,GO:0090407,GO:0097159,GO:0097190,GO:0097193,GO:0097367,GO:0097708,GO:0099503,GO:0101002,GO:1901068,GO:1901069,GO:1901070,GO:1901135,GO:1901136,GO:1901137,GO:1901292,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901566,GO:1901575,GO:1901576,GO:1901657,GO:1901658,GO:1901659,GO:1902105,GO:1902107,GO:1903037,GO:1903039,GO:1903706,GO:1903708,GO:1904813,GO:2000026,GO:2000106,GO:2000107,GO:2001020,GO:2001022
Exons2
Evalue6.72e-09
EggNOG OGsCOG0005@1|root,COG2801@1|root,KOG0017@2759|Eukaryota,KOG3984@2759|Eukaryota
EC2.4.2.1
Descriptionnicotinamide riboside catabolic process
Cds size744
COG categoryF
BRITEko00000,ko00001,ko01000
Relationships

The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
1683187052.5898435-CDS-P-wetherbeei_contig8659:33..2571683187052.5898435-CDS-P-wetherbeei_contig8659:33..257Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79CDSP-wetherbeei_contig8659 34..257 -
1683187052.6044674-CDS-P-wetherbeei_contig8659:269..7891683187052.6044674-CDS-P-wetherbeei_contig8659:269..789Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79CDSP-wetherbeei_contig8659 270..789 -


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
mRNA_P-wetherbeei_contig8659.1.1prot_P-wetherbeei_contig8659.1.1Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79polypeptideP-wetherbeei_contig8659 34..789 -


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of mRNA_P-wetherbeei_contig8659.1.1

>prot_P-wetherbeei_contig8659.1.1 ID=prot_P-wetherbeei_contig8659.1.1|Name=mRNA_P-wetherbeei_contig8659.1.1|organism=Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79|type=polypeptide|length=248bp
MKRDSSDFVRPAGAQKASPNQNHPNAPAHSPDSENSFTWVIDTAATHHCT
DNFSMLSEFTSDYLEIKGVGNSPRLISTLGGTYHSLTISEEGDITRITIS
DIHYFPHFGWNLLSIPYTVDIGVTLHIRPENDLQEASITLPTFGLWAPLR
YERDSWVLDTESYPAKGHARATNPTLKAKATASRRIWHKRLAHLNDADLA
AMASCGLIHPSPDNSRDLSYCKACHMGKMRHKNRNKHPGSRQPMWHA*
back to top

mRNA from alignment at P-wetherbeei_contig8659:34..789-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>mRNA_P-wetherbeei_contig8659.1.1 ID=mRNA_P-wetherbeei_contig8659.1.1|Name=mRNA_P-wetherbeei_contig8659.1.1|organism=Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79|type=mRNA|length=756bp|location=Sequence derived from alignment at P-wetherbeei_contig8659:34..789- (Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79)
ATGAAGCGAGACAGTTCTGACTTTGTGAGACCCGCCGGCGCACAGAAAGC
GTCTCCCAACCAAAACCATCCGAATGCTCCTGCCCACAGCCCCGACTCAG
AAAATTCATTCACATGGGTAATAGACACAGCGGCTACCCACCATTGCACC
GACAACTTCTCGATGCTCTCCGAATTTACCTCCGACTACCTTGAAATAAA
AGGCGTCGGAAACTCGCCGCGGCTGATTTCAACCCTCGGCGGCACATACC
ACAGTCTCACCATCTCAGAGGAAGGAGACATTACCCGGATAACCATCTCC
GACATCCACTATTTTCCGCATTTCGGCTGGAACCTCCTCTCAATCCCTTA
CACGGTAGATATTGGCGTAACCCTCCACATAAGACCCGAAAACGACCTCC
AAGAGGCCTCTATCACCTTGCCAACTTTTGGCCTTTGGGCTCCCCTCCGC
TATGAGCGCGACTCATGGGTGCTCGACACAGAATCCTACCCCGCCAAAGG
CCACGCTCGAGCCACAAATCGTCCCCCTGGAGCGACCCTAAAAGCAAAAG
CCACTGCCAGCCGCCGCATCTGGCATAAACGGCTAGCCCACCTAAATGAC
GCTGACCTTGCTGCCATGGCAAGTTGCGGCCTCATCCACCCATCTCCCGA
CAACAGCCGTGACCTCTCCTACTGCAAAGCATGCCACATGGGGAAAATGC
GCCATAAAAACAGAAATAAACACCCGGGGAGCCGGCAACCCATGTGGCAT
GCTTAG
back to top

Coding sequence (CDS) from alignment at P-wetherbeei_contig8659:34..789-

>mRNA_P-wetherbeei_contig8659.1.1 ID=mRNA_P-wetherbeei_contig8659.1.1|Name=mRNA_P-wetherbeei_contig8659.1.1|organism=Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79|type=CDS|length=744bp|location=Sequence derived from alignment at P-wetherbeei_contig8659:34..789- (Phaeothamnion wetherbeei SAG_119_79)
ATGAAGCGAGACAGTTCTGACTTTGTGAGACCCGCCGGCGCACAGAAAGC
GTCTCCCAACCAAAACCATCCGAATGCTCCTGCCCACAGCCCCGACTCAG
AAAATTCATTCACATGGGTAATAGACACAGCGGCTACCCACCATTGCACC
GACAACTTCTCGATGCTCTCCGAATTTACCTCCGACTACCTTGAAATAAA
AGGCGTCGGAAACTCGCCGCGGCTGATTTCAACCCTCGGCGGCACATACC
ACAGTCTCACCATCTCAGAGGAAGGAGACATTACCCGGATAACCATCTCC
GACATCCACTATTTTCCGCATTTCGGCTGGAACCTCCTCTCAATCCCTTA
CACGGTAGATATTGGCGTAACCCTCCACATAAGACCCGAAAACGACCTCC
AAGAGGCCTCTATCACCTTGCCAACTTTTGGCCTTTGGGCTCCCCTCCGC
TATGAGCGCGACTCATGGGTGCTCGACACAGAATCCTACCCCGCCAAAGG
CCACGCTCGAGCCACAAATCCGACCCTAAAAGCAAAAGCCACTGCCAGCC
GCCGCATCTGGCATAAACGGCTAGCCCACCTAAATGACGCTGACCTTGCT
GCCATGGCAAGTTGCGGCCTCATCCACCCATCTCCCGACAACAGCCGTGA
CCTCTCCTACTGCAAAGCATGCCACATGGGGAAAATGCGCCATAAAAACA
GAAATAAACACCCGGGGAGCCGGCAACCCATGTGGCATGCTTAG
back to top