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Homology
BLAST of mRNA_H-paniculata_contig3274.8787.1 vs. uniprot
Match: D7G8I4_ECTSI (Uncharacterized protein n=2 Tax=Ectocarpus TaxID=2879 RepID=D7G8I4_ECTSI) HSP 1 Score: 308 bits (788), Expect = 1.510e-96 Identity = 162/313 (51.76%), Postives = 218/313 (69.65%), Query Frame = 3
Query: 60 LPRVKMDESPLPEYLVDMLREAGHVDKDGKPLNDPFNPWDDEEMEGSRTERERLIKEQEADYFDVPYGEMLFED--GKMNLDDQYGLMDTTISEAAQFYNFPLEFFHDSLTRWGVLPPIDENVRLGNLINAEQAFSLGEALTGLDPADVRDNYINESLEDLAVELQMPLPDIFHACAATKINLPQGADTHLGIEDYRELLNAVMDDGESSDTRRLFELSLASNRWAGQKELKLSAAEQILDENRLAKHTRGIGWKNGPPVVGMREGQILPDEIHISGNIFAEEFLKFAAQDG---GGSGAGVGEDDDFGSLFD 983
+PR+KMD+SP+PEYL+DML+E+G VD+DGKP+ND F+P D+++ G++ ER+RL KE+E Y DVP+G+MLFE G N D LMDT+I+ A Y FP+EFF D L RWGV PI+++ RLG++I+AEQA +L EALTGLD ADVRDNY+++SLEDL+ +L +PLPD+F ACAA KINLP+G DTH+ I++Y+ LL+ V+D GE+S R+LF+ S +NRW GQKE Q + K+ G GW+ GPP++G EG++ ++ HI G IF EE D GG G ED D G FD
Sbjct: 95 MPRLKMDDSPIPEYLIDMLKESGDVDEDGKPVNDFFDP-DEDDTFGTQRERDRL-KEEELYYNDVPFGDMLFEGKAGGENAQDTGSLMDTSINNAVFEYGFPVEFFLDMLCRWGVTLPINQDRRLGDMIDAEQAAALCEALTGLDAADVRDNYLDDSLEDLSFDLDIPLPDLFQACAAQKINLPKGGDTHITIDEYKLLLDTVVDGGETSRARKLFDESRVTNRWTGQKEANSRELNQEDIAREIQKNNAGFGWREGPPILGDGEGELPLEQAHIGGRIFGEEIFASGYADSQHPGGWEEGEDEDGDDGFFFD 405
BLAST of mRNA_H-paniculata_contig3274.8787.1 vs. uniprot
Match: A0A7S2SBT4_9STRA (Hypothetical protein n=2 Tax=Rhizochromulina marina TaxID=1034831 RepID=A0A7S2SBT4_9STRA) HSP 1 Score: 93.6 bits (231), Expect = 1.610e-17 Identity = 45/119 (37.82%), Postives = 74/119 (62.18%), Query Frame = 3
Query: 306 YGLMDTTISEAAQFYNFPLEFFHDSLTRWGVLPPIDENVRLGNLINAEQAFSLGEALTGLDPADVRDNYINESLEDLAVELQMPLPDIFHACAATKINLPQGADTHLGIEDYRELLNAV 662
YG T+ E A+ Y+FPLEF +S+ GV+PPID + ++ +L++ E+ ++L EALT +DPA+ + + + +L ++A ++PL IF CA NLP G THL ++Y L+ +
Sbjct: 159 YGAAGCTLKEIAKDYDFPLEFLVNSVCDLGVVPPIDPDKKISDLLSGERIYALVEALTTIDPAEAYERFTDHTLGEIADYQEVPLSHIFQICADYGFNLPLGVRTHLKNDEYSVLMKEI 277
BLAST of mRNA_H-paniculata_contig3274.8787.1 vs. uniprot
Match: F0YKG5_AURAN (Uncharacterized protein n=1 Tax=Aureococcus anophagefferens TaxID=44056 RepID=F0YKG5_AURAN) HSP 1 Score: 89.7 bits (221), Expect = 3.660e-15 Identity = 42/111 (37.84%), Postives = 69/111 (62.16%), Query Frame = 3
Query: 318 DTTISEAAQFYNFPLEFFHDSLTRWGVLPPIDENVRLGNLINAEQAFSLGEALTGLDPADVRDNYINESLEDLAVELQMPLPDIFHACAATKINLPQGADTHLGIEDYREL 650
D+T+++ A Y FP+ + D++ +G+ PPI ++ R+ ++++A+QAF+L EA+T LD A+V D Y+ L +A L+ PL ++F AC LP G +T L E Y L
Sbjct: 167 DSTVADVADDYRFPISYVADAILGFGIPPPIRDDARIADILDADQAFALLEAVTSLDAAEVEDAYVAFDLARVAGLLEAPLAEVFAACVDEGFGLPHGVETQLRREQYEAL 277
BLAST of mRNA_H-paniculata_contig3274.8787.1 vs. uniprot
Match: A0A7S4A635_9STRA (Hypothetical protein n=1 Tax=Pelagomonas calceolata TaxID=35677 RepID=A0A7S4A635_9STRA) HSP 1 Score: 80.1 bits (196), Expect = 4.630e-13 Identity = 43/127 (33.86%), Postives = 70/127 (55.12%), Query Frame = 3
Query: 318 DTTISEAAQFYNFPLEFFHDSLTRWGVLPPIDENVRLGNLINAEQAFSLGEALTGLDPADVRDNYINESLEDLAVELQMPLPDIFHACAATKINLPQGADTHLGIEDYRELLNAVMDDGESSDTRRL 698
D T+ + A Y FP+ + D +T +GV PPI + + +L++A+QAF+L EA+T LD ++V D Y++ L+ A L+ L ++F C LP G +T L + + + + G SD RL
Sbjct: 107 DLTVEQVAVDYRFPVAYVADVITGFGVQPPISDAAVIRDLLDADQAFALLEAVTSLDASEVDDAYVSFGLDGCARRLEADLAEVFALCVDNNFALPHGVETRLRRDQFDTIARTL---GWRSDEARL 230
BLAST of mRNA_H-paniculata_contig3274.8787.1 vs. uniprot
Match: A0A7S2L468_9STRA (Hypothetical protein n=1 Tax=Leptocylindrus danicus TaxID=163516 RepID=A0A7S2L468_9STRA) HSP 1 Score: 77.4 bits (189), Expect = 9.530e-12 Identity = 44/130 (33.85%), Postives = 70/130 (53.85%), Query Frame = 3
Query: 279 DGKMNLDDQYGLMDTTISEAAQFYNFPLEFFHDSLTRWGVLPPIDENVRLGNLINAEQAFSLGEALTGLDPADVRDNYINESLEDLAVELQMPLPDIFHACAATKINLPQGADTHLGIEDYRELLNAVMD 668
D + N ++ L D+T++E A Y+ P + D + WGV PPID +++LG+++ EQAF+L EAL DP+D+ D Y L A E + + ++F +LP G + L +D E+L D
Sbjct: 200 DKQQNAREEGYLGDSTLNEIASDYSIPSFYLADIVCSWGVSPPIDMDMKLGDVLLGEQAFALLEALNSFDPSDLYDLYSRYDLRSFAGEYDVEMKNVFEFAVKEGFSLPFGVHSRLR-KDQVEMLERYFD 328
The following BLAST results are available for this feature:
Alignments
The following features are aligned
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Taxonomic scope | Eukaryota |
| Seed ortholog score | 90.5 |
| Seed ortholog evalue | 1.6e-15 |
| Seed eggNOG ortholog | 44056.XP_009040959.1 |
| Preferred name | PSEN1 |
| KEGG ko | ko:K04505,ko:K04522,ko:K06060 |
| KEGG Pathway | ko04310,ko04330,ko04722,ko05010,ko05165,map04310,map04330,map04722,map05010,map05165 |
| KEGG Module | M00682 |
| Hectar predicted targeting category | other localisation |
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2221,GO:0042303,GO:0042306,GO:0042307,GO:0042325,GO:0042326,GO:0042327,GO:0042391,GO:0042461,GO:0042462,GO:0042500,GO:0042582,GO:0042592,GO:0042633,GO:0042659,GO:0042802,GO:0042803,GO:0042886,GO:0042981,GO:0042982,GO:0042987,GO:0042995,GO:0043005,GO:0043009,GO:0043010,GO:0043011,GO:0043025,GO:0043065,GO:0043066,GO:0043067,GO:0043068,GO:0043069,GO:0043085,GO:0043086,GO:0043170,GO:0043198,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043254,GO:0043269,GO:0043270,GO:0043292,GO:0043299,GO:0043312,GO:0043392,GO:0043393,GO:0043405,GO:0043406,GO:0043408,GO:0043410,GO:0043412,GO:0043413,GO:0043473,GO:0043523,GO:0043524,GO:0043549,GO:0043588,GO:0043589,GO:0043603,GO:0043949,GO:0044057,GO:0044070,GO:0044085,GO:0044087,GO:0044092,GO:0044093,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044297,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044427,GO:0044428,GO:0044429,GO:0044430,GO:0044433,GO:0044437,GO:0044441,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044449,GO:0044459,GO:0044463,GO:0044464,GO:0044671,GO:0045055,GO:0045121,GO:0045137,GO:0045165,GO:0045176,GO:0045177,GO:0045184,GO:0045202,GO:0045296,GO:0045321,GO:0045595,GO:0045596,GO:0045597,GO:0045664,GO:0045665,GO:0045666,GO:0045732,GO:0045747,GO:0045859,GO:0045860,GO:0045861,GO:0045862,GO:0045892,GO:0045893,GO:0045934,GO:0045935,GO:0045936,GO:0045937,GO:0046530,GO:0046649,GO:0046822,GO:0046824,GO:0046873,GO:0046903,GO:0046907,GO:0046983,GO:0048066,GO:0048143,GO:0048167,GO:0048190,GO:0048286,GO:0048468,GO:0048471,GO:0048489,GO:0048513,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0048534,GO:0048538,GO:0048562,GO:0048563,GO:0048568,GO:0048569,GO:0048580,GO:0048583,GO:0048584,GO:0048585,GO:0048592,GO:0048598,GO:0048608,GO:0048609,GO:0048646,GO:0048666,GO:0048699,GO:0048705,GO:0048708,GO:0048729,GO:0048731,GO:0048732,GO:0048736,GO:0048837,GO:0048854,GO:0048856,GO:0048869,GO:0048870,GO:0048878,GO:0050435,GO:0050673,GO:0050730,GO:0050732,GO:0050767,GO:0050768,GO:0050769,GO:0050770,GO:0050771,GO:0050773,GO:0050776,GO:0050778,GO:0050789,GO:0050790,GO:0050793,GO:0050794,GO:0050801,GO:0050804,GO:0050806,GO:0050808,GO:0050818,GO:0050820,GO:0050839,GO:0050851,GO:0050852,GO:0050877,GO:0050890,GO:0050896,GO:0050931,GO:0051049,GO:0051050,GO:0051093,GO:0051094,GO:0051098,GO:0051099,GO:0051100,GO:0051101,GO:0051128,GO:0051129,GO:0051130,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051173,GO:0051174,GO:0051179,GO:0051222,GO:0051223,GO:0051234,GO:0051239,GO:0051240,GO:0051241,GO:0051246,GO:0051247,GO:0051248,GO:0051252,GO:0051253,GO:0051254,GO:0051336,GO:0051338,GO:0051340,GO:0051347,GO:0051348,GO:0051352,GO:0051402,GO:0051438,GO:0051444,GO:0051563,GO:0051580,GO:0051582,GO:0051588,GO:0051590,GO:0051604,GO:0051606,GO:0051640,GO:0051641,GO:0051648,GO:0051649,GO:0051650,GO:0051656,GO:0051674,GO:0051703,GO:0051704,GO:0051716,GO:0051952,GO:0051954,GO:0051955,GO:0051957,GO:0051960,GO:0051961,GO:0051962,GO:0051966,GO:0052547,GO:0052548,GO:0055037,GO:0055065,GO:0055074,GO:0055080,GO:0055082,GO:0055085,GO:0060041,GO:0060047,GO:0060048,GO:0060070,GO:0060075,GO:0060173,GO:0060249,GO:0060255,GO:0060284,GO:0060291,GO:0060322,GO:0060341,GO:0060429,GO:0060541,GO:0060548,GO:0060562,GO:0060828,GO:0060998,GO:0060999,GO:0061053,GO:0061062,GO:0061097,GO:0061099,GO:0061136,GO:0061371,GO:0061458,GO:0061900,GO:0061919,GO:0065007,GO:0065008,GO:0065009,GO:0070001,GO:0070011,GO:0070050,GO:0070085,GO:0070201,GO:0070482,GO:0070588,GO:0070765,GO:0070838,GO:0070887,GO:0070925,GO:0070997,GO:0071310,GO:0071417,GO:0071495,GO:0071702,GO:0071704,GO:0071705,GO:0071840,GO:0071900,GO:0071902,GO:0071944,GO:0072358,GO:0072359,GO:0072503,GO:0072507,GO:0072511,GO:0080090,GO:0090087,GO:0090092,GO:0090287,GO:0090316,GO:0090596,GO:0090647,GO:0090702,GO:0097028,GO:0097447,GO:0097458,GO:0097479,GO:0097480,GO:0097708,GO:0098588,GO:0098589,GO:0098590,GO:0098609,GO:0098655,GO:0098657,GO:0098660,GO:0098662,GO:0098687,GO:0098771,GO:0098773,GO:0098796,GO:0098797,GO:0098805,GO:0098852,GO:0098857,GO:0098916,GO:0099003,GO:0099080,GO:0099081,GO:0099120,GO:0099177,GO:0099503,GO:0099504,GO:0099512,GO:0099536,GO:0099537,GO:0099568,GO:0099643,GO:0106027,GO:0120025,GO:0120035,GO:0120036,GO:0120038,GO:0140029,GO:0140096,GO:0150034,GO:0198738,GO:1900006,GO:1900180,GO:1900182,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901184,GO:1901185,GO:1901214,GO:1901215,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901652,GO:1901653,GO:1901698,GO:1901699,GO:1901700,GO:1901701,GO:1901800,GO:1902041,GO:1902042,GO:1902043,GO:1902531,GO:1902533,GO:1902679,GO:1902680,GO:1902903,GO:1902905,GO:1903050,GO:1903051,GO:1903052,GO:1903320,GO:1903321,GO:1903362,GO:1903363,GO:1903364,GO:1903506,GO:1903507,GO:1903508,GO:1903522,GO:1903789,GO:1903793,GO:1903827,GO:1903829,GO:1903844,GO:1903959,GO:1903961,GO:1904589,GO:1904591,GO:1904645,GO:1904646,GO:1904796,GO:1904797,GO:1904951,GO:1905037,GO:1905114,GO:1905906,GO:1905908,GO:1990535,GO:2000026,GO:2000058,GO:2000059,GO:2000060,GO:2000112,GO:2000113,GO:2000272,GO:2000677,GO:2000678,GO:2001023,GO:2001025,GO:2001141,GO:2001233,GO:2001234,GO:2001235,GO:2001236,GO:2001237,GO:2001238 |
| EggNOG free text desc. | subunit of the gamma-secretase complex, an endoprotease complex that catalyzes the intramembrane cleavage of integral membrane proteins such as Notch receptors |
| EggNOG OGs | KOG2736@1,KOG2736@2759 |
| Ec32 ortholog description | conserved unknown protein |
| Ec32 ortholog | Ec-14_003130.1 |
| COG Functional cat. | O |
| Best tax level | Eukaryota |
| Best eggNOG OG | NA|NA|NA |
| BRITE | ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01002 |
| Exons | 6 |
| Model size | 1590 |
| Cds size | 996 |
| Stop | 1 |
| Start | 1 |
Relationships
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of mRNA_H-paniculata_contig3274.8787.1 >prot_H-paniculata_contig3274.8787.1 ID=prot_H-paniculata_contig3274.8787.1|Name=mRNA_H-paniculata_contig3274.8787.1|organism=Halopteris paniculata Hal_grac_a_UBK monoicous|type=polypeptide|length=332bp
MFPDELPRVKMDESPLPEYLVDMLREAGHVDKDGKPLNDPFNPWDDEEME
GSRTERERLIKEQEADYFDVPYGEMLFEDGKMNLDDQYGLMDTTISEAAQ
FYNFPLEFFHDSLTRWGVLPPIDENVRLGNLINAEQAFSLGEALTGLDPA
DVRDNYINESLEDLAVELQMPLPDIFHACAATKINLPQGADTHLGIEDYR
ELLNAVMDDGESSDTRRLFELSLASNRWAGQKELKLSAAEQILDENRLAK
HTRGIGWKNGPPVVGMREGQILPDEIHISGNIFAEEFLKFAAQDGGGSGA
GVGEDDDFGSLFDLDVGQAAEDGFLDVNYDM* back to topmRNA from alignment at H-paniculata_contig3274:12336..18540+ Legend: UTRpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >mRNA_H-paniculata_contig3274.8787.1 ID=mRNA_H-paniculata_contig3274.8787.1|Name=mRNA_H-paniculata_contig3274.8787.1|organism=Halopteris paniculata Hal_grac_a_UBK monoicous|type=mRNA|length=6205bp|location=Sequence derived from alignment at H-paniculata_contig3274:12336..18540+ (Halopteris paniculata Hal_grac_a_UBK monoicous)
AGGAGGCGGAGATAGTGGAAGACGAGAGCTGGGATCCGGACTCCATGTTT
CCTGATGAATTGCCGCGGTGAGAGATGGTCAAAGATTATGCTTTGGAGCT
TGGCGAAATATACATCGTGTAGCGTGATGAGATGAGCAAGATGGATCGCA
TTGATTTAATTTCAGTTATACACTCTTGTGCCGCCTTGATTTTTGTTGAT
GACAATGCCCGTGAAGTGAATGGAATTCGCCAAGAGCAAGTGTGCTGTTG
TGTCGGCCTATTATGTGTATGTCAGCAACTGATGAAGACACCTCTTATTT
TGCTAGTTCTGATGGTGCTAATTACCTCGTCTATCCAAGTGTATCTGTAT
CTATTCGTGGCGAGGATCGCTTCTAAAAGGCTTGTCATAGTTGTCAGATA
TTGATATATTTTAACAGCGACCCGACACGCAAAATGTACTTGCTGCAAGT
ACCCTTCTCTGTCCACCAGTACACCGTCAAGCGTTACCCCGTGATCGGAA
TATTCGAACATTCCACACGTCGGACGGATCAGATCGTTCACGAATCATAC
CCGCCATTTTTACGTGTAAATCGTGTGATCCGTACATCGTATTTTATCTG
GAGATGTTTCTGCACTGGTGTTCCGTACCGTATGGATCGGTAGTACACGG
TTGCCACAAGTCATCCGTACACTGTGTTCTATTCCTACATATTTCTGCAC
TGTGATCCGAATCCTCAAATATCAGCAGTACTTTTTTGCCACAAGCCATC
CACACACCGTGTTTGACCCGACCATGTTTCGCATCGGTGATCTGTACCCT
GCGGATCGTTTGCCTACAATCCGTACAACTGATCCGTACACTACAGATCG
TCATCGTGTACGGATTGTCGAGTAAAAAATTCCTCTTCGCAGCATTTCTG
TTACCGTTGGGCATAGATATGGTGCGGGTTCGGAAAAAAATATTACCGTT
AGGGATATTGTGATTGTTAATCAAGACGTTGAGTTACTTGTTCCCTATTT
AAGAGAGTAAAATCTCTAATCATATGCGCCTATTTTCTTGCACGCGTATT
TTCCAAATGAAGCAATATGTGCAATTTGCACCTTGATGCGCTGCTGTAGT
TAAATACCCGGGAGTATTATGTTACCCCCAAGAGAACCGATTCCGAACGG
TAAATCCACACCAGTTTTTGCAGCTGTCCATTGTGGGCACAGTGGTCAGT
GCTACTGCTATAGTTTGTATTTCTTTTATTTGCCTTTCGATAATAAGGTG
CGCACGCGAAAGTGACGATGCGGAAACAAAATAAAACACACATAACCACA
ACTAACCCAAAGTAAAATATTCGCGCTACAGTACAGCAGATAAAATAACA
GTACTTGTAAACAACTTGAAGTCCCATCCAGTATCCGTTTCTTCATACCC
CTGGGGCTTTTTGAGGAATACTTGAATTCTATTTGTCGTTCGCAGCGACA
TGTTGCGCGGGCTCTATCTCCCTATTTTTATTTATACTTTTGAAAAGCAT
TTGCTAATCACCTCATCATGTTAGCTGTCATCAGGTATCTTCACCGATCG
TCAAAATGGCTTGACTATATATATATAAAAAAAATTGCGTGAGAGGTGCC
TTGAGCATTTCTTAATACCCATATTTTCGTCTATAGCTATTTCAACATGC
AAAACGCGCCGCACGTCGACCTCACAACTGCGTTGCTGATAGACATTTCG
CTAGTTACCATCTTACCAACAAACATAATACAACCTGTAGCATTTTTTTT
ACAACGTGTGGCCCTTCCTATTAGAGTAAAGATGGACGAATCCCCACTTC
CAGAGTACCTGGTCGATATGCTTCGCGAGGCCGGACACGTGGACAAGGAT
GGCAAGCCGCTCAACGACCCTTTTAACCCGTGGGACGACGAGGAGATGGA
AGGTTCCAGGACAGAGAGGGAGAGGCTGATCAAAGAGCAGGAGGTGGGGC
GGGGTTTATCGGTGTGCGTCGTTTATGTTTGATGTGTTGTTGGTGCTGGT
GCTAGTGTTCATGTGGGATGGTGTTGCGGTTGAGTTTGTCTATGTTGTCC
TGGTTCCTGGACTTCTCTATATAATTACGGTGGTTCGCGGTTGAATATGC
CCCCTCTTTGGTTTGGATTTGAATTTCTGTCTGCCCAAGTATGGTTCTGT
ACTGCACAGTTGGCAACTGCCATTTACTTCGTTTTTGCGTGTGATTTTGT
TTTGGCTTGGCTGTAAACTTCGCAAAAAAAACAAAACAGGTTGAAGCCTT
CCCATCCTGCCGTGTCCAATGCGTCACCGTGTCACTAGTGCATCCAGTTA
GTGGTGTTTGCACGTGACATTATTGGCGTCGTCTTTCTTGTGCCCTGTCT
TTTCCTCCACCCGGGCCAAAAAAAAAATCATCTCAAGGCTGACTACTTCG
ACGTGCCTTACGGCGAGATGCTGTTCGAAGACGGCAAAATGAACCTGGAC
GACCAGTACGGCCTTATGGACACGACCATCTCGGAGGCTGCGCAATTCTA
CAACTTTCCTCTTGAGTTCTTCCATGACTCGCTCACGAGGTGAAGTTGAG
AATGAATGACGTGTGCGCGGGACCACCTCCATATATATATATATATATAT
ATATATATATATTACCCCCCCCCTCCCCCTATAGTTGAGACGTTTCCTCA
CCCCCGTCGCCTCCAGGTTTTTGGATTTCAGGAAAGGATGTTGGGACTGC
CTTTGAAGCATTTGTGTTTTCGGCAGGTGATGGTTTGCCCAATACACGCT
AGAAGATATGGCTTCACAAACGGTCCAATATTTTTTGCCATGGATTAAAG
TACGTTGTTTTGTGTCCCTGCGGAAAACGCGTGTGGACCGGACACGTCGA
GCTACAGCAGTTTCATGTCTGACGGACTTCGGCTTCCATGGAATCAGAAC
CGGCTTTTCCGTTTTTTCGAAACACTTGCTAAGCATAGACCATCCTTGAG
CTATGGGAACCTCCAACTCGTTCGTTCTTGGGTGGATACACATAAGTATC
TATTTGATGGCTATATTTGGCAGCAAGGGGCCTTCTCGCTGTTGGTTGTT
GTCGCTTACTGCGCTGGGTTCGGGGGTATTCTCCATAACGTAGGTAACTC
GATCCCCCCCCTCCCCTCCTCCTCCCGGCCTTGCGCTGCGTTTACCTTTC
CGTTATTCATGCCGTGCGCTTGTGTTCCGCTGTCCTAGATGGGGGGTGCT
GCCGCCTATTGACGAGAATGTCCGATTAGGGAACTTGATCAACGCGGAGC
AGGCTTTTTCTCTCGGCGAGGCACTCACCGGTCTGGATCCCGCCGACGTG
AGCAAGATATTTTCAAGGCATTTCATATGACTGGCAAAGTCTGATAGAGT
CGATCGCGAACCGGCTTGAATCTGACAGAACCAACCGCGAACCGGTTGTA
AAAACGAAAATATCACAGAACCGACCACCGACCGACTTGAATCACATAGA
AACGACCGTGAACTGACTGTACAGATATATTTTTTCGCAGAACACTACCG
AGAACCAGTTCTGTTCTGTCCATGCGTAAAAGTCATGTGCAATGCCGTTC
ATGTGAAAAGCCTTGTATATTTTAAGCCGCAGCGGGGAGTGATTTTGTAA
CATCCTTTGCTCAGTTTCCGAGAGTAGGAAAGTCGCCAACAGCTTACGCA
AAAAGTAGAATGGGCAAAAAGAGTCGTGGTGCGACTATTCGTTGTCGGTC
CCATCTTGTTTTTTATGATACGATGCAGTATTTTTTTTATTTAGCCCCTT
ATTTTTTCCGGCCGTTGATGCCTCCACGCGTGTATCGTTTTTTTTTTGTT
TTTTTTCTCTCTATTTTCTCATCAATAGACAGTAAATAATGCACACCTTT
GTCGGCGCTGTATGACCGAAGCTATTGCACCCACCCAATCCACCTGGGTC
ATTGTCAAACCTTGATGTTTTTCACATTGAAACATGGACTGTATACTTTG
GATTTTTTTCACGTGACACCCTTCTGCTGTAACACTGTCCGGGATGTAAC
GGGCCTCTTGTGTGAAGTTGTCCTATCAATATAAACAATTGTATGCAGCT
ATGTTGCGCAATTTTCATGCACCGTTCTGTGGCAGGTCCGGGATAACTAC
ATCAACGAGTCACTGGAGGACCTCGCTGTAGAGCTGCAGATGCCTTTGCC
CGACATTTTCCATGCATGCGCGGCGACAAAGTGAGGCACACTGATTTCGG
ATACGCATTTTCACTTCTTTGTGATGACTTATCGCTCGTTCTCCATGGAG
AATGGAGCTCTTGCTCGTTTGTCGTCGCCTCATGCACCTTGTATCTGAAC
ATGATTTGGCTTTTTCTGGGCTTGCCCGTTCCTGCCCTCCCTCCCTCCCT
CCCATTGGCGTACTTCTCATACGCAATTTGAGATGAACCTTTCTAGTGTT
TTTGATGTACTCATAATACCCGAGGCACGCCTCAATGTTACTTGCTCTTG
TGCGAAAATGGCCGAAACCTATTCGATATCTACTCGGTGTATCCCTCCCC
TTTGGGCATGGGGGAATTCATGCGGTATATCCTTTGACCCTCTTGACCAT
GGTCTGGTAGCTGTAACGCGCTAGAGCAAATATACTTATGACCATACTCC
ATTACTCGTCAGAAGTACATGGGAAGATTATACTCCAAGTTTACCACACA
CAAAGCGACTTACTATCTGTGTGTGTGGCGTGACGTTGTTTATACGTACG
CGCCAAGATCGACGTTCCGTGCAGTACTTGTGGTATAGTCACGCGTGCCG
AATGCATAACGTTTGGTTACCCGGTATGCCTAAAACCCCACGGCAGAGTC
CGGTTGGCGTAGCAACTTATGGATGATGGCTAGTGGTTAGTATCACCCCT
GTCAAACGTAGCCTTGATGGCGAAAACTCGGTATGCTCCTTCCTAATGTT
GTAGGGATACGAGGTCAACGGTCGAGAGACTACGGCGTTCATTTTCATGA
GTATACTACCCACCCCCTCCACTCTCCCACGCTAGTTGTATTAATTTGAA
GAGCCCCTTGAGATGTTGTTGATAAATAGGACCTCAATGCGACTCAAAGG
CCCCTCTTCTCCCTCATTTGATATATTTGTGCTGATGAGTATGCACAACT
GAAACCCCTTCCTTCCTCTCCCCTGAGTATCATACTGCTATAGATGATGA
CACGTGCTAAGATGCCTAGTTTATCGTGACGCAATTCTCCTGTTGCTCCC
TCCCAAGGATAAATCTTCCGCAGGGCGCCGACACACACCTCGGAATTGAA
GATTACAGGGAACTGCTCAACGCGGTCATGGATGACGGGGAGTCCAGCGA
TACCCGACGGCTGTTCGAACTGAGCCTCGCCAGCAATCGGTGGGCAGGCC
AGAAGGAGCTCAAGCTCAGCGCCGCCGAGCAGATTTTGGATGAAAATAGG
CTCGCAAAGCACACTCGAGGGATAGGGTGGAAGAACGGCCCGCCCGTCGT
CGGCATGCGTGAGGGCCAGATCCTTCCTGATGAGATCCACATTTCGGGAA
ATATTTTCGCAGAAGAATTTTTGAAATTCGCCGCGCAGGACGGGGGGGGT
AGTGGTGCTGGTGTTGGTGAGGATGATGATTTCGGGAGTTTATTTGATCT
CGACGTCGGCCAGGCAGCGGAAGATGGGTTTCTTGATGTGAACTACGACA
TGTGAATGAGGTAGCGATATTTGTCGTGGAGACGTCTTTGTGCGGATCTG
TTCGTTCTTGTATATGTTTATGTGTGGTTACTTTGTCGTGTTATGTGTGT
ATTTGTGTTTTTGGCTATAATCTGTGCTTGTTTTAGCTTATGGGTTTTTG
CCTGTTTGGTTGGTGTATAAATGTATTGTCTGTGGTACGTTTTGTCTTCG
TCGCAATACGGGCGTTGGTTGTTACATACCACTGGCGGAAAAATTGCAGC
TCGACTGCTGGACATGGATGTCCTCCTCTTGATTTAATAGATTGAGTTTG
TTTTGCGCAATGTGTTTCTATTATTGTAAAATTGGGGAAACATGGAATAT
TTTTGAGTGTTGCATGCATGTTGTTCAAGTCGTCTATTCTGTCGTTTGCG
ACGTTGCGCGTCAGCAACTTCATGGTTGGGGAAATAGCCCCGCATTGTGA
TCCTCTGCTTCTTGATGCGTGATGTATTTTTGTTTTTTTTAACCCCCAGA
AGACTGAGGCAAAAACCTTTACCGATGCTTCCATACATTAGTATTTTACC
AAAGT back to topCoding sequence (CDS) from alignment at H-paniculata_contig3274:12336..18540+ >mRNA_H-paniculata_contig3274.8787.1 ID=mRNA_H-paniculata_contig3274.8787.1|Name=mRNA_H-paniculata_contig3274.8787.1|organism=Halopteris paniculata Hal_grac_a_UBK monoicous|type=CDS|length=1992bp|location=Sequence derived from alignment at H-paniculata_contig3274:12336..18540+ (Halopteris paniculata Hal_grac_a_UBK monoicous)
ATGTTTCCTGATGAATTGCCGCGATGTTTCCTGATGAATTGCCGCGAGTA
AAGATGGACGAATCCCCACTTCCAGAGTACCTGGTCGATATGCTTCGCGA
GGCCGGACACGTGGACAAGGATGGCAAGCCGCTCAACGACCCTTTTAACC
CGTGGGACGACGAGGAGATGGAAGGTTCCAGGACAGAGAGGGAGAGGCTG
ATCAAAGAGCAGGAGAGTAAAGATGGACGAATCCCCACTTCCAGAGTACC
TGGTCGATATGCTTCGCGAGGCCGGACACGTGGACAAGGATGGCAAGCCG
CTCAACGACCCTTTTAACCCGTGGGACGACGAGGAGATGGAAGGTTCCAG
GACAGAGAGGGAGAGGCTGATCAAAGAGCAGGAGGCTGACTACTTCGACG
TGCCTTACGGCGAGATGCTGTTCGAAGACGGCAAAATGAACCTGGACGAC
CAGTACGGCCTTATGGACACGACCATCTCGGAGGCTGCGCAATTCTACAA
CTTTCCTCTTGAGTTCTTCCATGACTCGCTCACGAGGCTGACTACTTCGA
CGTGCCTTACGGCGAGATGCTGTTCGAAGACGGCAAAATGAACCTGGACG
ACCAGTACGGCCTTATGGACACGACCATCTCGGAGGCTGCGCAATTCTAC
AACTTTCCTCTTGAGTTCTTCCATGACTCGCTCACGAGATGGGGGGTGCT
GCCGCCTATTGACGAGAATGTCCGATTAGGGAACTTGATCAACGCGGAGC
AGGCTTTTTCTCTCGGCGAGGCACTCACCGGTCTGGATCCCGCCGACATG
GGGGGTGCTGCCGCCTATTGACGAGAATGTCCGATTAGGGAACTTGATCA
ACGCGGAGCAGGCTTTTTCTCTCGGCGAGGCACTCACCGGTCTGGATCCC
GCCGACGTCCGGGATAACTACATCAACGAGTCACTGGAGGACCTCGCTGT
AGAGCTGCAGATGCCTTTGCCCGACATTTTCCATGCATGCGCGGCGACAA
AGTCCGGGATAACTACATCAACGAGTCACTGGAGGACCTCGCTGTAGAGC
TGCAGATGCCTTTGCCCGACATTTTCCATGCATGCGCGGCGACAAAGATA
AATCTTCCGCAGGGCGCCGACACACACCTCGGAATTGAAGATTACAGGGA
ACTGCTCAACGCGGTCATGGATGACGGGGAGTCCAGCGATACCCGACGGC
TGTTCGAACTGAGCCTCGCCAGCAATCGGTGGGCAGGCCAGAAGGAGCTC
AAGCTCAGCGCCGCCGAGCAGATTTTGGATGAAAATAGGCTCGCAAAGCA
CACTCGAGGGATAGGGTGGAAGAACGGCCCGCCCGTCGTCGGCATGCGTG
AGGGCCAGATCCTTCCTGATGAGATCCACATTTCGGGAAATATTTTCGCA
GAAGAATTTTTGAAATTCGCCGCGCAGGACGGGGGGGGTAGTGGTGCTGG
TGTTGGTGAGGATGATGATTTCGGGAGTTTATTTGATCTCGACGTCGGCC
AGGCAGCGGAAGATGGGTTTCTTGATGTGAACTACGACATGTGAGATAAA
TCTTCCGCAGGGCGCCGACACACACCTCGGAATTGAAGATTACAGGGAAC
TGCTCAACGCGGTCATGGATGACGGGGAGTCCAGCGATACCCGACGGCTG
TTCGAACTGAGCCTCGCCAGCAATCGGTGGGCAGGCCAGAAGGAGCTCAA
GCTCAGCGCCGCCGAGCAGATTTTGGATGAAAATAGGCTCGCAAAGCACA
CTCGAGGGATAGGGTGGAAGAACGGCCCGCCCGTCGTCGGCATGCGTGAG
GGCCAGATCCTTCCTGATGAGATCCACATTTCGGGAAATATTTTCGCAGA
AGAATTTTTGAAATTCGCCGCGCAGGACGGGGGGGGTAGTGGTGCTGGTG
TTGGTGAGGATGATGATTTCGGGAGTTTATTTGATCTCGACGTCGGCCAG
GCAGCGGAAGATGGGTTTCTTGATGTGAACTACGACATGTGA back to top
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