Ggra9037.t1 (mRNA) Gracilaria gracilis GNS1m male

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Overview
NameGgra9037.t1
Unique NameGgra9037.t1
TypemRNA
OrganismGracilaria gracilis GNS1m male (Gracilaria gracilis GNS1m male (Slender Wart Weed))
Sequence length478
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
tig00000860_piloncontigtig00000860_pilon:1386369..1387802 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Gracilaria gracilis GNS1m male OGS1.02022-05-09
Properties
Property NameValue
Seed ortholog8364.ENSXETP00000053817
Preferred nameRUVBL2
PFAMsTIP49
Max annot lvl33208|Metazoa
KEGG koko:K11338
GOsGO:0000123,GO:0000166,GO:0000226,GO:0000228,GO:0000491,GO:0000492,GO:0000785,GO:0000790,GO:0000791,GO:0000812,GO:0000976,GO:0000977,GO:0000979,GO:0000980,GO:0001012,GO:0001046,GO:0001047,GO:0001067,GO:0001085,GO:0001091,GO:0001094,GO:0001098,GO:0001099,GO:0001158,GO:0001578,GO:0002009,GO:0002165,GO:0003341,GO:0003351,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003678,GO:0003682,GO:0003690,GO:0003712,GO:0003714,GO:0003824,GO:0004003,GO:0004386,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005694,GO:0005719,GO:0005737,GO:0005813,GO:0005815,GO:0005829,GO:0005856,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006310,GO:0006325,GO:0006338,GO:0006342,GO:0006355,GO:0006356,GO:0006357,GO:0006457,GO:0006464,GO:0006473,GO:0006475,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006928,GO:0006950,GO:0006974,GO:0006996,GO:0007010,GO:0007017,GO:0007018,GO:0007275,GO:0007431,GO:0007435,GO:0007444,GO:0007478,GO:0007480,GO:0007507,GO:0007552,GO:0007560,GO:0008013,GO:0008026,GO:0008094,GO:0008104,GO:0008134,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008219,GO:0009314,GO:0009411,GO:0009416,GO:0009628,GO:0009653,GO:0009719,GO:0009725,GO:0009791,GO:0009886,GO:0009887,GO:0009888,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009891,GO:0009892,GO:0009893,GO:0009966,GO:0009968,GO:0009987,GO:0010033,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010558,GO:0010604,GO:0010605,GO:0010623,GO:0010628,GO:0010629,GO:0010638,GO:0010646,GO:0010648,GO:0010941,GO:0010942,GO:0012501,GO:0012502,GO:0014070,GO:0015630,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016363,GO:0016458,GO:0016462,GO:0016569,GO:0016570,GO:0016573,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017025,GO:0017076,GO:0017111,GO:0018193,GO:0018205,GO:0018393,GO:0018394,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019538,GO:0019899,GO:0022607,GO:0022612,GO:0022613,GO:0022618,GO:0023051,GO:0023057,GO:0030030,GO:0030031,GO:0030111,GO:0030154,GO:0030178,GO:0030554,GO:0031011,GO:0031056,GO:0031058,GO:0031248,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031328,GO:0031399,GO:0031401,GO:0031490,GO:0031974,GO:0031981,GO:0032091,GO:0032268,GO:0032270,GO:0032355,GO:0032392,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032508,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032870,GO:0032991,GO:0033036,GO:0033043,GO:0033044,GO:0033202,GO:0033365,GO:0033554,GO:0033993,GO:0034399,GO:0034502,GO:0034613,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034644,GO:0034708,GO:0034728,GO:0035065,GO:0035066,GO:0035070,GO:0035071,GO:0035072,GO:0035075,GO:0035078,GO:0035081,GO:0035082,GO:0035097,GO:0035107,GO:0035114,GO:0035120,GO:0035218,GO:0035239,GO:0035267,GO:0035272,GO:0035295,GO:0035326,GO:0035639,GO:0036094,GO:0036211,GO:0036314,GO:0040008,GO:0040029,GO:0042127,GO:0042221,GO:0042623,GO:0042802,GO:0042803,GO:0043044,GO:0043067,GO:0043068,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043189,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043233,GO:0043393,GO:0043412,GO:0043486,GO:0043531,GO:0043543,GO:0043565,GO:0043933,GO:0043967,GO:0043968,GO:0044085,GO:0044092,GO:0044212,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044427,GO:0044428,GO:0044430,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044451,GO:0044454,GO:0044458,GO:0044464,GO:0044665,GO:0044782,GO:0045184,GO:0045814,GO:0045892,GO:0045893,GO:0045934,GO:0045935,GO:0045943,GO:0045944,GO:0046483,GO:0046620,GO:0046983,GO:0048102,GO:0048468,GO:0048513,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0048563,GO:0048565,GO:0048569,GO:0048583,GO:0048585,GO:0048638,GO:0048707,GO:0048729,GO:0048731,GO:0048732,GO:0048736,GO:0048737,GO:0048856,GO:0048869,GO:0050789,GO:0050793,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051082,GO:0051098,GO:0051100,GO:0051117,GO:0051128,GO:0051130,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051173,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051239,GO:0051246,GO:0051247,GO:0051252,GO:0051253,GO:0051254,GO:0051276,GO:0051641,GO:0051716,GO:0055123,GO:0060033,GO:0060255,GO:0060271,GO:0060420,GO:0060429,GO:0060562,GO:0060828,GO:0065003,GO:0065007,GO:0065009,GO:0070013,GO:0070035,GO:0070199,GO:0070286,GO:0070603,GO:0070727,GO:0070887,GO:0070925,GO:0071103,GO:0071168,GO:0071169,GO:0071214,GO:0071310,GO:0071339,GO:0071392,GO:0071396,GO:0071407,GO:0071478,GO:0071482,GO:0071495,GO:0071704,GO:0071733,GO:0071824,GO:0071826,GO:0071840,GO:0071898,GO:0071899,GO:0072359,GO:0072594,GO:0080090,GO:0090090,GO:0090202,GO:0090304,GO:0090579,GO:0097159,GO:0097255,GO:0097305,GO:0097346,GO:0097367,GO:0104004,GO:0120031,GO:0120036,GO:0140097,GO:0140110,GO:1900120,GO:1900121,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901654,GO:1901700,GO:1901701,GO:1901836,GO:1901838,GO:1901983,GO:1901985,GO:1902275,GO:1902493,GO:1902494,GO:1902562,GO:1902679,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903507,GO:1903508,GO:1904949,GO:1905269,GO:1990234,GO:1990837,GO:1990904,GO:2000026,GO:2000112,GO:2000113,GO:2000756,GO:2000758,GO:2001141,GO:2001252
Evalue1e-225
EggNOG OGsCOG1224@1|root,KOG2680@2759|Eukaryota,38DYY@33154|Opisthokonta,3BCRH@33208|Metazoa,3CVB4@33213|Bilateria,48618@7711|Chordata,48W5C@7742|Vertebrata
EC3.6.4.12
DescriptionATP-dependent 5'-3' DNA helicase activity
COG categoryL
BRITEko00000,ko01000,ko03036
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra9037Ggra9037Gracilaria gracilis GNS1m malegenetig00000860_pilon 1386369..1387802 +


The following start_codon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra9037.t1.start1Ggra9037.t1.start1Gracilaria gracilis GNS1m malestart_codontig00000860_pilon 1386369..1386371 +


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra9037.t1.CDS1Ggra9037.t1.CDS1Gracilaria gracilis GNS1m maleCDStig00000860_pilon 1386369..1387802 +


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra9037.t1.exon1Ggra9037.t1.exon1Gracilaria gracilis GNS1m maleexontig00000860_pilon 1386369..1387802 +


The following stop_codon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra9037.t1.stop1Ggra9037.t1.stop1Gracilaria gracilis GNS1m malestop_codontig00000860_pilon 1387800..1387802 +


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra9037.t1Ggra9037.t1Gracilaria gracilis GNS1m malepolypeptidetig00000860_pilon 1386369..1387802 +


Sequences
The following sequences are available for this feature:

mRNA sequence

>Ggra9037.t1 ID=Ggra9037.t1|Name=Ggra9037.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=mRNA|length=478bp
MLNSRFEETVKRPGMERIGAHSHIRGLGLDEQLNPAHIGQGLVGQMEARK
AAGLIVRMIQAGKLAGRAILIAGQPGTGKTALAMAMAQALGPDTPFTKIT
ASEVFSLGMSKTEALTQALRRSIGVKIHEETDIIEGEVVELQIDRPLSSQ
SSEITHSGKLTLKTTEMETVYDLGVKMIKSLQKEKVTSGDVVTIDKATGK
ITKLGRSFARSRDFDATGSNIRFVQTPDGELQRRKEVVHVVSIHEIDVIN
SRQQGFLALFSGDTGEIKSEVREQIDIKVAEWREEGKAELVPGVLFIDEV
HMLDIECFSFINKAIESDLAPVLIMASNRGITYIRGTKYKAPHGLPLDLL
DRLLIISTKPYEAKEVDEILRLRCEEEDIAVSENARALLTRIGTETSLRY
AMYLITSSALVCAKRNGTEVDVEDIKRTYALFSDVKRSTQTLAEHQGEFM
FSSIENNQDANAQSGGDPMQSIVPAQS*
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spliced messenger RNA

>Ggra9037.t1 ID=Ggra9037.t1|Name=Ggra9037.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=mRNA|length=1434bp|location=Sequence derived from alignment at tig00000860_pilon:1386369..1387802+ (Gracilaria gracilis GNS1m male)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.  
ATGTTGAATTCCCGTTTTGAGGAGACGGTTAAGCGACCCGGCATGGAGAG
AATAGGTGCCCACTCTCATATCCGTGGGCTTGGCCTGGACGAACAACTCA
ATCCAGCGCACATTGGGCAAGGTCTCGTTGGTCAAATGGAGGCTAGAAAA
GCAGCCGGTTTAATCGTACGCATGATACAAGCGGGAAAGTTGGCAGGACG
CGCGATTCTCATCGCCGGCCAGCCTGGTACAGGCAAAACCGCCCTGGCCA
TGGCCATGGCACAGGCCCTCGGTCCTGATACTCCGTTTACGAAGATCACC
GCGAGTGAAGTTTTTTCGTTGGGCATGTCGAAGACCGAGGCGCTTACGCA
GGCTTTGAGACGCAGTATTGGTGTTAAGATTCACGAGGAGACTGATATTA
TTGAAGGCGAGGTTGTGGAACTGCAAATTGACCGACCGCTCTCTTCACAG
TCTTCAGAGATAACGCACAGTGGAAAGCTTACATTGAAGACAACCGAGAT
GGAGACGGTTTATGATCTTGGAGTTAAGATGATCAAATCTTTGCAAAAAG
AAAAGGTCACGAGTGGTGATGTCGTCACTATTGACAAGGCCACCGGAAAG
ATTACAAAGCTTGGTCGATCTTTTGCGAGGTCGCGTGATTTTGATGCCAC
GGGCTCAAACATCCGTTTTGTGCAGACGCCTGACGGCGAACTTCAACGAC
GGAAGGAAGTTGTTCATGTCGTGTCCATTCATGAGATCGATGTTATCAAT
TCTCGACAGCAGGGATTTCTAGCGTTGTTTTCAGGTGATACAGGAGAAAT
CAAGAGCGAAGTCCGCGAACAGATCGATATTAAGGTTGCTGAGTGGCGGG
AAGAGGGGAAGGCCGAACTTGTACCGGGAGTGCTTTTTATTGACGAGGTG
CATATGTTGGACATTGAATGCTTTTCTTTCATTAACAAGGCGATTGAATC
CGATCTGGCCCCTGTACTTATTATGGCCTCGAATAGAGGTATTACATACA
TTCGTGGTACAAAGTACAAGGCACCACATGGCTTGCCCTTGGATCTTCTC
GACAGATTGCTCATCATCAGCACCAAGCCATACGAAGCAAAAGAAGTTGA
TGAGATTTTAAGACTACGATGCGAGGAAGAAGATATCGCTGTTTCTGAAA
ACGCAAGGGCACTATTGACTCGCATTGGCACGGAAACCTCATTGAGATAC
GCTATGTACCTCATAACATCCTCTGCTCTCGTCTGTGCTAAGAGGAACGG
AACTGAAGTGGATGTCGAGGATATAAAACGGACATATGCGTTGTTCTCAG
ATGTGAAGAGGAGCACCCAAACTTTGGCGGAGCATCAAGGCGAGTTCATG
TTCAGTAGTATTGAAAACAATCAAGACGCGAATGCTCAATCTGGTGGAGA
TCCCATGCAGAGTATTGTCCCAGCTCAGTCATAA
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protein sequence of Ggra9037.t1

>Ggra9037.t1 ID=Ggra9037.t1|Name=Ggra9037.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=polypeptide|length=478bp
MLNSRFEETVKRPGMERIGAHSHIRGLGLDEQLNPAHIGQGLVGQMEARK
AAGLIVRMIQAGKLAGRAILIAGQPGTGKTALAMAMAQALGPDTPFTKIT
ASEVFSLGMSKTEALTQALRRSIGVKIHEETDIIEGEVVELQIDRPLSSQ
SSEITHSGKLTLKTTEMETVYDLGVKMIKSLQKEKVTSGDVVTIDKATGK
ITKLGRSFARSRDFDATGSNIRFVQTPDGELQRRKEVVHVVSIHEIDVIN
SRQQGFLALFSGDTGEIKSEVREQIDIKVAEWREEGKAELVPGVLFIDEV
HMLDIECFSFINKAIESDLAPVLIMASNRGITYIRGTKYKAPHGLPLDLL
DRLLIISTKPYEAKEVDEILRLRCEEEDIAVSENARALLTRIGTETSLRY
AMYLITSSALVCAKRNGTEVDVEDIKRTYALFSDVKRSTQTLAEHQGEFM
FSSIENNQDANAQSGGDPMQSIVPAQS*
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mRNA from alignment at tig00000860_pilon:1386369..1387802+

Legend: start_codonpolypeptideCDSexonstop_codon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Ggra9037.t1 ID=Ggra9037.t1|Name=Ggra9037.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=mRNA|length=1434bp|location=Sequence derived from alignment at tig00000860_pilon:1386369..1387802+ (Gracilaria gracilis GNS1m male)
ATGTTGAATTCCCGTTTTGAGGAGACGGTTAAGCGACCCGGCATGGAGAG
AATAGGTGCCCACTCTCATATCCGTGGGCTTGGCCTGGACGAACAACTCA
ATCCAGCGCACATTGGGCAAGGTCTCGTTGGTCAAATGGAGGCTAGAAAA
GCAGCCGGTTTAATCGTACGCATGATACAAGCGGGAAAGTTGGCAGGACG
CGCGATTCTCATCGCCGGCCAGCCTGGTACAGGCAAAACCGCCCTGGCCA
TGGCCATGGCACAGGCCCTCGGTCCTGATACTCCGTTTACGAAGATCACC
GCGAGTGAAGTTTTTTCGTTGGGCATGTCGAAGACCGAGGCGCTTACGCA
GGCTTTGAGACGCAGTATTGGTGTTAAGATTCACGAGGAGACTGATATTA
TTGAAGGCGAGGTTGTGGAACTGCAAATTGACCGACCGCTCTCTTCACAG
TCTTCAGAGATAACGCACAGTGGAAAGCTTACATTGAAGACAACCGAGAT
GGAGACGGTTTATGATCTTGGAGTTAAGATGATCAAATCTTTGCAAAAAG
AAAAGGTCACGAGTGGTGATGTCGTCACTATTGACAAGGCCACCGGAAAG
ATTACAAAGCTTGGTCGATCTTTTGCGAGGTCGCGTGATTTTGATGCCAC
GGGCTCAAACATCCGTTTTGTGCAGACGCCTGACGGCGAACTTCAACGAC
GGAAGGAAGTTGTTCATGTCGTGTCCATTCATGAGATCGATGTTATCAAT
TCTCGACAGCAGGGATTTCTAGCGTTGTTTTCAGGTGATACAGGAGAAAT
CAAGAGCGAAGTCCGCGAACAGATCGATATTAAGGTTGCTGAGTGGCGGG
AAGAGGGGAAGGCCGAACTTGTACCGGGAGTGCTTTTTATTGACGAGGTG
CATATGTTGGACATTGAATGCTTTTCTTTCATTAACAAGGCGATTGAATC
CGATCTGGCCCCTGTACTTATTATGGCCTCGAATAGAGGTATTACATACA
TTCGTGGTACAAAGTACAAGGCACCACATGGCTTGCCCTTGGATCTTCTC
GACAGATTGCTCATCATCAGCACCAAGCCATACGAAGCAAAAGAAGTTGA
TGAGATTTTAAGACTACGATGCGAGGAAGAAGATATCGCTGTTTCTGAAA
ACGCAAGGGCACTATTGACTCGCATTGGCACGGAAACCTCATTGAGATAC
GCTATGTACCTCATAACATCCTCTGCTCTCGTCTGTGCTAAGAGGAACGG
AACTGAAGTGGATGTCGAGGATATAAAACGGACATATGCGTTGTTCTCAG
ATGTGAAGAGGAGCACCCAAACTTTGGCGGAGCATCAAGGCGAGTTCATG
TTCAGTAGTATTGAAAACAATCAAGACGCGAATGCTCAATCTGGTGGAGA
TCCCATGCAGAGTATTGTCCCAGCTCAGTCATAA
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Coding sequence (CDS) from alignment at tig00000860_pilon:1386369..1387802+

>Ggra9037.t1 ID=Ggra9037.t1|Name=Ggra9037.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=CDS|length=1434bp|location=Sequence derived from alignment at tig00000860_pilon:1386369..1387802+ (Gracilaria gracilis GNS1m male)
ATGTTGAATTCCCGTTTTGAGGAGACGGTTAAGCGACCCGGCATGGAGAG
AATAGGTGCCCACTCTCATATCCGTGGGCTTGGCCTGGACGAACAACTCA
ATCCAGCGCACATTGGGCAAGGTCTCGTTGGTCAAATGGAGGCTAGAAAA
GCAGCCGGTTTAATCGTACGCATGATACAAGCGGGAAAGTTGGCAGGACG
CGCGATTCTCATCGCCGGCCAGCCTGGTACAGGCAAAACCGCCCTGGCCA
TGGCCATGGCACAGGCCCTCGGTCCTGATACTCCGTTTACGAAGATCACC
GCGAGTGAAGTTTTTTCGTTGGGCATGTCGAAGACCGAGGCGCTTACGCA
GGCTTTGAGACGCAGTATTGGTGTTAAGATTCACGAGGAGACTGATATTA
TTGAAGGCGAGGTTGTGGAACTGCAAATTGACCGACCGCTCTCTTCACAG
TCTTCAGAGATAACGCACAGTGGAAAGCTTACATTGAAGACAACCGAGAT
GGAGACGGTTTATGATCTTGGAGTTAAGATGATCAAATCTTTGCAAAAAG
AAAAGGTCACGAGTGGTGATGTCGTCACTATTGACAAGGCCACCGGAAAG
ATTACAAAGCTTGGTCGATCTTTTGCGAGGTCGCGTGATTTTGATGCCAC
GGGCTCAAACATCCGTTTTGTGCAGACGCCTGACGGCGAACTTCAACGAC
GGAAGGAAGTTGTTCATGTCGTGTCCATTCATGAGATCGATGTTATCAAT
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