Ggra6274.t1 (mRNA) Gracilaria gracilis GNS1m male

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Overview
NameGgra6274.t1
Unique NameGgra6274.t1
TypemRNA
OrganismGracilaria gracilis GNS1m male (Gracilaria gracilis GNS1m male (Slender Wart Weed))
Sequence length459
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
tig00000879_piloncontigtig00000879_pilon:384843..386219 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Gracilaria gracilis GNS1m male OGS1.02022-05-09
Properties
Property NameValue
Seed ortholog192875.XP_004363465.1
Preferred nameBNA4
PFAMsFAD_binding_3
Max annot lvl33154|Opisthokonta
KEGG rclassRC00046
KEGG koko:K00486
KEGG ReactionR01960
KEGG Pathwayko00380,ko01100,map00380,map01100
KEGG ModuleM00038
GOsGO:0000166,GO:0001505,GO:0001655,GO:0001822,GO:0001878,GO:0001956,GO:0002064,GO:0002237,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004497,GO:0004502,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005739,GO:0005740,GO:0005741,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006520,GO:0006568,GO:0006569,GO:0006576,GO:0006586,GO:0006725,GO:0006726,GO:0006727,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006970,GO:0007154,GO:0007275,GO:0008055,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009063,GO:0009072,GO:0009074,GO:0009108,GO:0009117,GO:0009165,GO:0009267,GO:0009308,GO:0009310,GO:0009435,GO:0009605,GO:0009607,GO:0009617,GO:0009620,GO:0009628,GO:0009651,GO:0009888,GO:0009987,GO:0009991,GO:0010033,GO:0010646,GO:0010647,GO:0010941,GO:0010942,GO:0014048,GO:0014049,GO:0016020,GO:0016054,GO:0016174,GO:0016491,GO:0016651,GO:0016705,GO:0016709,GO:0018130,GO:0019359,GO:0019362,GO:0019363,GO:0019438,GO:0019439,GO:0019637,GO:0019674,GO:0019748,GO:0019752,GO:0019867,GO:0023051,GO:0023056,GO:0030154,GO:0030447,GO:0030855,GO:0031090,GO:0031667,GO:0031668,GO:0031669,GO:0031966,GO:0031967,GO:0031968,GO:0031975,GO:0032496,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032835,GO:0032879,GO:0032890,GO:0032892,GO:0033060,GO:0033554,GO:0033993,GO:0034097,GO:0034354,GO:0034627,GO:0034641,GO:0034654,GO:0035850,GO:0036094,GO:0036170,GO:0036180,GO:0040007,GO:0042180,GO:0042221,GO:0042402,GO:0042430,GO:0042436,GO:0042440,GO:0042441,GO:0042537,GO:0042594,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043207,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043269,GO:0043270,GO:0043324,GO:0043436,GO:0043473,GO:0043474,GO:0044070,GO:0044106,GO:0044182,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044270,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044429,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0044550,GO:0046148,GO:0046152,GO:0046158,GO:0046218,GO:0046395,GO:0046483,GO:0046496,GO:0046700,GO:0046928,GO:0048037,GO:0048066,GO:0048069,GO:0048072,GO:0048468,GO:0048513,GO:0048518,GO:0048522,GO:0048731,GO:0048856,GO:0048869,GO:0050660,GO:0050662,GO:0050664,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050804,GO:0050806,GO:0050896,GO:0051046,GO:0051047,GO:0051049,GO:0051050,GO:0051186,GO:0051188,GO:0051588,GO:0051590,GO:0051704,GO:0051707,GO:0051716,GO:0051952,GO:0051954,GO:0051955,GO:0051957,GO:0051966,GO:0051968,GO:0055086,GO:0055114,GO:0060341,GO:0060429,GO:0061005,GO:0061318,GO:0065007,GO:0065008,GO:0070189,GO:0070555,GO:0070887,GO:0071310,GO:0071345,GO:0071347,GO:0071496,GO:0071704,GO:0071944,GO:0071949,GO:0072001,GO:0072006,GO:0072009,GO:0072010,GO:0072015,GO:0072073,GO:0072112,GO:0072310,GO:0072311,GO:0072524,GO:0072525,GO:0090407,GO:0097052,GO:0097159,GO:0098588,GO:0098805,GO:0099177,GO:1901214,GO:1901216,GO:1901265,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901566,GO:1901575,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901606,GO:1901700,GO:1903294,GO:1903296,GO:1903530,GO:1903532,GO:1903793
Evalue5.52e-110
EggNOG OGsCOG0654@1|root,KOG2614@2759|Eukaryota,38H32@33154|Opisthokonta
EC1.14.13.9
Descriptionkynurenine 3-monooxygenase activity
COG categoryC
BRITEko00000,ko00001,ko00002,ko01000
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra6274Ggra6274Gracilaria gracilis GNS1m malegenetig00000879_pilon 384843..386219 +


The following start_codon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra6274.t1.start1Ggra6274.t1.start1Gracilaria gracilis GNS1m malestart_codontig00000879_pilon 384843..384845 +


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra6274.t1.CDS1Ggra6274.t1.CDS1Gracilaria gracilis GNS1m maleCDStig00000879_pilon 384843..386219 +


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra6274.t1.exon1Ggra6274.t1.exon1Gracilaria gracilis GNS1m maleexontig00000879_pilon 384843..386219 +


The following stop_codon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra6274.t1.stop1Ggra6274.t1.stop1Gracilaria gracilis GNS1m malestop_codontig00000879_pilon 386217..386219 +


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra6274.t1Ggra6274.t1Gracilaria gracilis GNS1m malepolypeptidetig00000879_pilon 384843..386219 +


Sequences
The following sequences are available for this feature:

mRNA sequence

>Ggra6274.t1 ID=Ggra6274.t1|Name=Ggra6274.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=mRNA|length=459bp
MAQDQKPKVAIIGAGPAGCLLAILLSNTGCSIDVYDYRLDPRTAEGASAS
QRSINLALSTRGLTALKRAGVLDHVLEQSIPMHGRCIHPVDGQLQFHPYG
QSHQFLLSISRRVLCNILLDECDTRESIQLHFAHKCVHVDLHNRSVSFER
SRAEGESQESQFTVVSDLIVGADGSFSRVRAAMAREDRFDYSQSYISAAY
KELTMVNTVFSKESVFPCNYLHIWPRHRFMLIALPNNTTSFTCTLFMDKS
EMDKLSSPSKVEDFFNTYFPDAISLMPSLAQDYFKNPSPSLVTIRCEPFN
HDGNAILIGDAAHAIVPFYGQGCNAAFEDCRLLAEAIEKHHWDDMPKVLS
QYANTRKPNTDTIADLAIEHYEDMSSKSAKPLAVLRRRLEIWANRFFPKS
FLPLYSMVSFSNIPYREALLRARWQDKRMEQVLVVTGISVAAVSGLLIRS
GIWSRTTR*
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spliced messenger RNA

>Ggra6274.t1 ID=Ggra6274.t1|Name=Ggra6274.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=mRNA|length=1377bp|location=Sequence derived from alignment at tig00000879_pilon:384843..386219+ (Gracilaria gracilis GNS1m male)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.  
ATGGCTCAAGATCAGAAGCCAAAGGTGGCCATAATTGGAGCGGGTCCAGC
CGGATGTCTACTAGCAATACTGCTATCCAACACTGGCTGCTCCATTGATG
TCTACGACTATCGATTAGACCCGCGAACTGCAGAAGGCGCTTCAGCAAGT
CAACGGTCCATAAACCTGGCCCTCTCGACGCGTGGCCTCACAGCCTTGAA
ACGTGCTGGTGTTCTTGATCATGTCCTTGAGCAATCTATCCCCATGCATG
GACGCTGCATACATCCCGTCGACGGTCAGTTGCAGTTTCATCCATATGGT
CAGTCTCATCAGTTCTTGCTTTCGATATCACGTCGGGTCTTGTGCAACAT
CTTGCTTGACGAATGTGACACGCGTGAGTCAATTCAATTACACTTTGCTC
ACAAATGTGTTCATGTCGATCTTCACAACCGCTCCGTTAGTTTTGAGCGC
TCCCGCGCTGAAGGGGAGAGTCAAGAATCTCAGTTTACCGTTGTTTCTGA
CCTCATCGTGGGGGCAGATGGCTCTTTTTCTCGTGTGCGTGCGGCTATGG
CGAGGGAAGACCGATTCGATTATTCCCAGTCGTATATATCAGCTGCGTAT
AAAGAGTTGACAATGGTGAACACCGTATTCTCTAAAGAATCAGTGTTTCC
CTGCAATTACCTTCATATATGGCCGAGACATCGCTTCATGCTCATTGCGC
TTCCAAACAATACCACCTCCTTTACATGCACTCTCTTCATGGACAAGTCA
GAAATGGACAAGTTATCTTCTCCGAGCAAAGTGGAGGATTTCTTTAACAC
CTACTTTCCAGATGCAATTTCTTTGATGCCTTCCTTAGCTCAAGACTATT
TCAAGAACCCTTCGCCATCCCTCGTGACAATTCGATGCGAGCCGTTCAAC
CATGACGGGAACGCCATTTTAATTGGAGACGCAGCACATGCCATTGTACC
ATTCTATGGGCAAGGATGCAATGCTGCCTTCGAAGATTGCCGCCTTCTCG
CGGAGGCGATCGAAAAACATCATTGGGATGACATGCCAAAAGTGCTATCA
CAGTACGCAAATACTCGGAAGCCGAACACGGACACAATCGCAGATTTGGC
AATTGAGCACTACGAAGATATGTCTTCAAAATCGGCGAAGCCCTTGGCTG
TGCTTCGACGACGACTAGAAATATGGGCTAATCGCTTCTTTCCTAAGAGT
TTTCTACCCCTGTACTCCATGGTGTCGTTTTCAAACATTCCTTACAGGGA
AGCACTGCTACGTGCTAGATGGCAGGATAAACGAATGGAACAAGTTTTGG
TTGTAACAGGGATCAGCGTTGCGGCGGTTTCGGGCCTATTAATAAGAAGT
GGAATATGGAGCAGGACGACACGGTGA
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protein sequence of Ggra6274.t1

>Ggra6274.t1 ID=Ggra6274.t1|Name=Ggra6274.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=polypeptide|length=459bp
MAQDQKPKVAIIGAGPAGCLLAILLSNTGCSIDVYDYRLDPRTAEGASAS
QRSINLALSTRGLTALKRAGVLDHVLEQSIPMHGRCIHPVDGQLQFHPYG
QSHQFLLSISRRVLCNILLDECDTRESIQLHFAHKCVHVDLHNRSVSFER
SRAEGESQESQFTVVSDLIVGADGSFSRVRAAMAREDRFDYSQSYISAAY
KELTMVNTVFSKESVFPCNYLHIWPRHRFMLIALPNNTTSFTCTLFMDKS
EMDKLSSPSKVEDFFNTYFPDAISLMPSLAQDYFKNPSPSLVTIRCEPFN
HDGNAILIGDAAHAIVPFYGQGCNAAFEDCRLLAEAIEKHHWDDMPKVLS
QYANTRKPNTDTIADLAIEHYEDMSSKSAKPLAVLRRRLEIWANRFFPKS
FLPLYSMVSFSNIPYREALLRARWQDKRMEQVLVVTGISVAAVSGLLIRS
GIWSRTTR*
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mRNA from alignment at tig00000879_pilon:384843..386219+

Legend: start_codonpolypeptideCDSexonstop_codon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Ggra6274.t1 ID=Ggra6274.t1|Name=Ggra6274.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=mRNA|length=1377bp|location=Sequence derived from alignment at tig00000879_pilon:384843..386219+ (Gracilaria gracilis GNS1m male)
ATGGCTCAAGATCAGAAGCCAAAGGTGGCCATAATTGGAGCGGGTCCAGC
CGGATGTCTACTAGCAATACTGCTATCCAACACTGGCTGCTCCATTGATG
TCTACGACTATCGATTAGACCCGCGAACTGCAGAAGGCGCTTCAGCAAGT
CAACGGTCCATAAACCTGGCCCTCTCGACGCGTGGCCTCACAGCCTTGAA
ACGTGCTGGTGTTCTTGATCATGTCCTTGAGCAATCTATCCCCATGCATG
GACGCTGCATACATCCCGTCGACGGTCAGTTGCAGTTTCATCCATATGGT
CAGTCTCATCAGTTCTTGCTTTCGATATCACGTCGGGTCTTGTGCAACAT
CTTGCTTGACGAATGTGACACGCGTGAGTCAATTCAATTACACTTTGCTC
ACAAATGTGTTCATGTCGATCTTCACAACCGCTCCGTTAGTTTTGAGCGC
TCCCGCGCTGAAGGGGAGAGTCAAGAATCTCAGTTTACCGTTGTTTCTGA
CCTCATCGTGGGGGCAGATGGCTCTTTTTCTCGTGTGCGTGCGGCTATGG
CGAGGGAAGACCGATTCGATTATTCCCAGTCGTATATATCAGCTGCGTAT
AAAGAGTTGACAATGGTGAACACCGTATTCTCTAAAGAATCAGTGTTTCC
CTGCAATTACCTTCATATATGGCCGAGACATCGCTTCATGCTCATTGCGC
TTCCAAACAATACCACCTCCTTTACATGCACTCTCTTCATGGACAAGTCA
GAAATGGACAAGTTATCTTCTCCGAGCAAAGTGGAGGATTTCTTTAACAC
CTACTTTCCAGATGCAATTTCTTTGATGCCTTCCTTAGCTCAAGACTATT
TCAAGAACCCTTCGCCATCCCTCGTGACAATTCGATGCGAGCCGTTCAAC
CATGACGGGAACGCCATTTTAATTGGAGACGCAGCACATGCCATTGTACC
ATTCTATGGGCAAGGATGCAATGCTGCCTTCGAAGATTGCCGCCTTCTCG
CGGAGGCGATCGAAAAACATCATTGGGATGACATGCCAAAAGTGCTATCA
CAGTACGCAAATACTCGGAAGCCGAACACGGACACAATCGCAGATTTGGC
AATTGAGCACTACGAAGATATGTCTTCAAAATCGGCGAAGCCCTTGGCTG
TGCTTCGACGACGACTAGAAATATGGGCTAATCGCTTCTTTCCTAAGAGT
TTTCTACCCCTGTACTCCATGGTGTCGTTTTCAAACATTCCTTACAGGGA
AGCACTGCTACGTGCTAGATGGCAGGATAAACGAATGGAACAAGTTTTGG
TTGTAACAGGGATCAGCGTTGCGGCGGTTTCGGGCCTATTAATAAGAAGT
GGAATATGGAGCAGGACGACACGGTGA
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Coding sequence (CDS) from alignment at tig00000879_pilon:384843..386219+

>Ggra6274.t1 ID=Ggra6274.t1|Name=Ggra6274.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=CDS|length=1377bp|location=Sequence derived from alignment at tig00000879_pilon:384843..386219+ (Gracilaria gracilis GNS1m male)
ATGGCTCAAGATCAGAAGCCAAAGGTGGCCATAATTGGAGCGGGTCCAGC
CGGATGTCTACTAGCAATACTGCTATCCAACACTGGCTGCTCCATTGATG
TCTACGACTATCGATTAGACCCGCGAACTGCAGAAGGCGCTTCAGCAAGT
CAACGGTCCATAAACCTGGCCCTCTCGACGCGTGGCCTCACAGCCTTGAA
ACGTGCTGGTGTTCTTGATCATGTCCTTGAGCAATCTATCCCCATGCATG
GACGCTGCATACATCCCGTCGACGGTCAGTTGCAGTTTCATCCATATGGT
CAGTCTCATCAGTTCTTGCTTTCGATATCACGTCGGGTCTTGTGCAACAT
CTTGCTTGACGAATGTGACACGCGTGAGTCAATTCAATTACACTTTGCTC
ACAAATGTGTTCATGTCGATCTTCACAACCGCTCCGTTAGTTTTGAGCGC
TCCCGCGCTGAAGGGGAGAGTCAAGAATCTCAGTTTACCGTTGTTTCTGA
CCTCATCGTGGGGGCAGATGGCTCTTTTTCTCGTGTGCGTGCGGCTATGG
CGAGGGAAGACCGATTCGATTATTCCCAGTCGTATATATCAGCTGCGTAT
AAAGAGTTGACAATGGTGAACACCGTATTCTCTAAAGAATCAGTGTTTCC
CTGCAATTACCTTCATATATGGCCGAGACATCGCTTCATGCTCATTGCGC
TTCCAAACAATACCACCTCCTTTACATGCACTCTCTTCATGGACAAGTCA
GAAATGGACAAGTTATCTTCTCCGAGCAAAGTGGAGGATTTCTTTAACAC
CTACTTTCCAGATGCAATTTCTTTGATGCCTTCCTTAGCTCAAGACTATT
TCAAGAACCCTTCGCCATCCCTCGTGACAATTCGATGCGAGCCGTTCAAC
CATGACGGGAACGCCATTTTAATTGGAGACGCAGCACATGCCATTGTACC
ATTCTATGGGCAAGGATGCAATGCTGCCTTCGAAGATTGCCGCCTTCTCG
CGGAGGCGATCGAAAAACATCATTGGGATGACATGCCAAAAGTGCTATCA
CAGTACGCAAATACTCGGAAGCCGAACACGGACACAATCGCAGATTTGGC
AATTGAGCACTACGAAGATATGTCTTCAAAATCGGCGAAGCCCTTGGCTG
TGCTTCGACGACGACTAGAAATATGGGCTAATCGCTTCTTTCCTAAGAGT
TTTCTACCCCTGTACTCCATGGTGTCGTTTTCAAACATTCCTTACAGGGA
AGCACTGCTACGTGCTAGATGGCAGGATAAACGAATGGAACAAGTTTTGG
TTGTAACAGGGATCAGCGTTGCGGCGGTTTCGGGCCTATTAATAAGAAGT
GGAATATGGAGCAGGACGACACGGTGA
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