Ggra6036.t1 (mRNA) Gracilaria gracilis GNS1m male

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Overview
NameGgra6036.t1
Unique NameGgra6036.t1
TypemRNA
OrganismGracilaria gracilis GNS1m male (Gracilaria gracilis GNS1m male (Slender Wart Weed))
Sequence length474
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
tig00000045_piloncontigtig00000045_pilon:184423..185945 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Gracilaria gracilis GNS1m male OGS1.02022-05-09
Properties
Property NameValue
Seed ortholog130081.XP_005708474.1
Preferred nameSTK38
PFAMsPkinase,Pkinase_C
Max annot lvl2759|Eukaryota
KEGG koko:K00870,ko:K08286,ko:K08790,ko:K20069
GOsGO:0000003,GO:0000131,GO:0000166,GO:0000287,GO:0000902,GO:0000904,GO:0000920,GO:0001411,GO:0001558,GO:0001932,GO:0001933,GO:0002009,GO:0002165,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004672,GO:0004674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005628,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005813,GO:0005815,GO:0005819,GO:0005829,GO:0005856,GO:0005886,GO:0005933,GO:0005934,GO:0005935,GO:0005937,GO:0005938,GO:0006355,GO:0006357,GO:0006464,GO:0006468,GO:0006469,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006970,GO:0006996,GO:0007010,GO:0007114,GO:0007117,GO:0007118,GO:0007154,GO:0007163,GO:0007165,GO:0007275,GO:0007399,GO:0007423,GO:0007444,GO:0007455,GO:0007469,GO:0007472,GO:0007476,GO:0007552,GO:0007560,GO:0008037,GO:0008038,GO:0008104,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008360,GO:0008544,GO:0009266,GO:0009267,GO:0009268,GO:0009272,GO:0009408,GO:0009605,GO:0009607,GO:0009628,GO:0009651,GO:0009653,GO:0009791,GO:0009886,GO:0009887,GO:0009888,GO:0009889,GO:0009892,GO:0009913,GO:0009966,GO:0009968,GO:0009987,GO:0009991,GO:0010468,GO:0010494,GO:0010556,GO:0010563,GO:0010570,GO:0010605,GO:0010646,GO:0010648,GO:0010769,GO:0010975,GO:0015629,GO:0015630,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016358,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0017076,GO:0018105,GO:0018193,GO:0018209,GO:0019219,GO:0019220,GO:0019222,GO:0019538,GO:0019899,GO:0019900,GO:0019901,GO:0019954,GO:0022008,GO:0022414,GO:0022416,GO:0022603,GO:0022604,GO:0022607,GO:0023051,GO:0023052,GO:0023057,GO:0030029,GO:0030030,GO:0030031,GO:0030036,GO:0030100,GO:0030154,GO:0030182,GO:0030308,GO:0030424,GO:0030425,GO:0030427,GO:0030428,GO:0030447,GO:0030554,GO:0030855,GO:0030865,GO:0030866,GO:0030950,GO:0030952,GO:0031175,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031344,GO:0031399,GO:0031400,GO:0031435,GO:0031505,GO:0031579,GO:0031667,GO:0031668,GO:0031669,GO:0032065,GO:0032153,GO:0032268,GO:0032269,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032505,GO:0032507,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032878,GO:0032879,GO:0032989,GO:0032990,GO:0032991,GO:0033036,GO:0033554,GO:0033673,GO:0034605,GO:0034613,GO:0035107,GO:0035114,GO:0035120,GO:0035214,GO:0035220,GO:0035239,GO:0035295,GO:0035315,GO:0035316,GO:0035317,GO:0035556,GO:0035639,GO:0035690,GO:0035770,GO:0035838,GO:0036094,GO:0036168,GO:0036170,GO:0036176,GO:0036177,GO:0036178,GO:0036180,GO:0036211,GO:0036244,GO:0036464,GO:0036477,GO:0040007,GO:0040008,GO:0042221,GO:0042325,GO:0042326,GO:0042493,GO:0042546,GO:0042594,GO:0042710,GO:0042763,GO:0042764,GO:0042995,GO:0043005,GO:0043086,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043332,GO:0043405,GO:0043407,GO:0043408,GO:0043409,GO:0043412,GO:0043549,GO:0043900,GO:0043902,GO:0044010,GO:0044011,GO:0044085,GO:0044092,GO:0044182,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044297,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044430,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044448,GO:0044463,GO:0044464,GO:0044764,GO:0045185,GO:0045229,GO:0045595,GO:0045664,GO:0045807,GO:0045859,GO:0045926,GO:0045927,GO:0045936,GO:0046872,GO:0048468,GO:0048513,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0048563,GO:0048569,GO:0048583,GO:0048584,GO:0048585,GO:0048666,GO:0048667,GO:0048699,GO:0048707,GO:0048729,GO:0048731,GO:0048736,GO:0048737,GO:0048800,GO:0048812,GO:0048813,GO:0048814,GO:0048856,GO:0048858,GO:0048869,GO:0050764,GO:0050766,GO:0050767,GO:0050773,GO:0050789,GO:0050790,GO:0050793,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051049,GO:0051050,GO:0051128,GO:0051130,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051174,GO:0051179,GO:0051235,GO:0051239,GO:0051246,GO:0051248,GO:0051252,GO:0051285,GO:0051286,GO:0051301,GO:0051338,GO:0051348,GO:0051641,GO:0051651,GO:0051703,GO:0051704,GO:0051716,GO:0051960,GO:0060099,GO:0060100,GO:0060237,GO:0060255,GO:0060284,GO:0060429,GO:0060562,GO:0060627,GO:0061024,GO:0065007,GO:0065008,GO:0065009,GO:0070451,GO:0070593,GO:0070726,GO:0070727,GO:0070887,GO:0071214,GO:0071467,GO:0071470,GO:0071472,GO:0071496,GO:0071554,GO:0071555,GO:0071704,GO:0071840,GO:0071852,GO:0071900,GO:0071901,GO:0071940,GO:0071944,GO:0072686,GO:0080090,GO:0080134,GO:0090033,GO:0090605,GO:0090609,GO:0097159,GO:0097248,GO:0097367,GO:0097447,GO:0097458,GO:0099568,GO:0099738,GO:0104004,GO:0120025,GO:0120035,GO:0120036,GO:0120038,GO:0120039,GO:0140096,GO:1900190,GO:1900192,GO:1900231,GO:1900233,GO:1900428,GO:1900430,GO:1900431,GO:1900433,GO:1900440,GO:1900442,GO:1900741,GO:1900743,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901564,GO:1902531,GO:1902532,GO:1903338,GO:1903506,GO:1905153,GO:1905155,GO:1990904,GO:2000026,GO:2000099,GO:2000100,GO:2000112,GO:2000247,GO:2000769,GO:2000771,GO:2001141
Evalue3.93e-159
EggNOG OGsKOG0605@1|root,KOG0605@2759|Eukaryota
EC2.7.1.37,2.7.11.1
Descriptionprotein serine/threonine kinase activity
COG categoryT
BRITEko00000,ko01000,ko01001,ko04131
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra6036Ggra6036Gracilaria gracilis GNS1m malegenetig00000045_pilon 184423..185945 +


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra6036.t1Ggra6036.t1Gracilaria gracilis GNS1m malepolypeptidetig00000045_pilon 184423..185945 +


The following start_codon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra6036.t1.start1Ggra6036.t1.start1Gracilaria gracilis GNS1m malestart_codontig00000045_pilon 184423..184425 +


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra6036.t1.CDS1Ggra6036.t1.CDS1Gracilaria gracilis GNS1m maleCDStig00000045_pilon 184423..185270 +
Ggra6036.t1.CDS2Ggra6036.t1.CDS2Gracilaria gracilis GNS1m maleCDStig00000045_pilon 185372..185945 +


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra6036.t1.exon1Ggra6036.t1.exon1Gracilaria gracilis GNS1m maleexontig00000045_pilon 184423..185270 +
Ggra6036.t1.exon2Ggra6036.t1.exon2Gracilaria gracilis GNS1m maleexontig00000045_pilon 185372..185945 +


The following intron feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra6036.t1.intron1Ggra6036.t1.intron1Gracilaria gracilis GNS1m maleintrontig00000045_pilon 185271..185371 +


The following stop_codon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra6036.t1.stop1Ggra6036.t1.stop1Gracilaria gracilis GNS1m malestop_codontig00000045_pilon 185943..185945 +


Sequences
The following sequences are available for this feature:

mRNA sequence

>Ggra6036.t1 ID=Ggra6036.t1|Name=Ggra6036.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=mRNA|length=474bp
MTDAVSGPSALRNASKAELAKRKIEILFSTLTQEREAAKKRAHELEHRLA
TMSIRDADKDRMRKQHAQREMAFLRERRRPMSEADFDMISIIGRGAFGEV
ILVQHKKTANYYAMKKLQKADMLRKEQVNHAWSERHVLVAANHPFICQLC
YAFQNKDYLYLVMEFLPGGDLMTLLIERDTLTEDEARFYVAEMVVAIDTI
HKLGFIHRDVKPDNMLIDKDGHLKLSDFGLCKSFNVDMDALPMSNVDVAS
SDTHSTLNDLSMTERAAAWRRNARKQAFSTVGTPDYISCEVLMKRGYNKE
CDYWSLGVVLYEMLVGYPPFYAEDALKTCRKILNWRETLRFPPEAKLSWS
AINLIQCLVCDAKHRLGARNGIDDFRDHPFFEGIDWDNLSTMKPPFLPEL
RGPTDTRYFEDHKPLPQNGVTQDRSSARPSYIKEPQAEEFIGFTFKRYNP
SEAPAGRRGGLTSSLFEKPDLQE*
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spliced messenger RNA

>Ggra6036.t1 ID=Ggra6036.t1|Name=Ggra6036.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=mRNA|length=1422bp|location=Sequence derived from alignment at tig00000045_pilon:184423..185945+ (Gracilaria gracilis GNS1m male)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.  
ATGACCGACGCCGTGTCCGGCCCGTCCGCGCTGCGCAACGCGAGCAAGGC
CGAGCTTGCCAAGCGCAAGATCGAGATTCTGTTCTCCACGCTCACGCAGG
AGCGTGAGGCCGCCAAGAAGCGCGCACACGAGCTGGAGCACAGGCTGGCT
ACCATGTCCATCCGCGACGCTGACAAGGACCGCATGCGAAAGCAGCACGC
GCAGCGCGAGATGGCCTTCTTGAGGGAGCGCCGCCGCCCCATGTCGGAGG
CCGACTTTGACATGATTAGTATCATTGGCCGTGGCGCCTTTGGCGAAGTT
ATTCTTGTGCAGCACAAGAAGACCGCCAACTATTATGCCATGAAGAAGCT
TCAAAAGGCCGACATGCTGCGCAAGGAACAGGTGAATCACGCCTGGTCGG
AACGCCATGTGCTTGTGGCCGCTAATCACCCATTCATATGCCAGCTTTGT
TACGCCTTCCAAAACAAGGATTACCTGTATCTTGTCATGGAGTTCTTGCC
AGGCGGTGATCTCATGACTCTGCTCATTGAACGGGACACCCTCACGGAAG
ACGAAGCTCGCTTTTACGTCGCTGAGATGGTTGTTGCTATTGACACCATC
CATAAGCTCGGCTTTATTCACCGCGATGTCAAGCCGGATAACATGCTCAT
CGACAAAGACGGACATCTTAAGCTCAGCGATTTTGGACTCTGCAAGAGTT
TCAATGTGGATATGGATGCGTTACCAATGTCCAATGTTGACGTTGCGAGT
AGTGATACTCATTCAACGCTCAACGACCTCTCCATGACCGAAAGAGCGGC
GGCTTGGAGACGAAATGCCAGAAAGCAAGCCTTTTCTACCGTTGGAACTC
CGGATTACATTTCGTGCGAGGTTTTGATGAAGAGAGGGTATAACAAGGAA
TGCGATTATTGGAGTCTTGGAGTTGTTCTATACGAAATGCTTGTGGGCTA
TCCTCCATTTTACGCAGAAGATGCCCTCAAGACCTGTCGTAAGATCCTCA
ACTGGCGCGAGACGCTGCGATTCCCTCCAGAAGCAAAGCTCAGCTGGTCT
GCGATAAATCTCATCCAGTGTTTGGTATGTGACGCCAAACACCGACTTGG
GGCGAGGAACGGCATCGATGACTTTCGGGATCACCCGTTCTTTGAAGGAA
TCGATTGGGATAACCTTTCTACCATGAAACCTCCGTTCTTGCCGGAGCTG
CGCGGACCCACGGATACTCGTTATTTTGAGGATCATAAGCCATTACCGCA
GAACGGTGTTACTCAAGACAGGTCGTCCGCTCGACCGTCTTACATCAAAG
AACCACAGGCTGAGGAGTTCATCGGTTTCACCTTCAAGCGATATAATCCG
AGTGAAGCCCCTGCTGGGCGCCGTGGAGGCTTGACATCCTCCCTGTTTGA
AAAGCCGGACCTTCAAGAGTAG
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protein sequence of Ggra6036.t1

>Ggra6036.t1 ID=Ggra6036.t1|Name=Ggra6036.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=polypeptide|length=474bp
MTDAVSGPSALRNASKAELAKRKIEILFSTLTQEREAAKKRAHELEHRLA
TMSIRDADKDRMRKQHAQREMAFLRERRRPMSEADFDMISIIGRGAFGEV
ILVQHKKTANYYAMKKLQKADMLRKEQVNHAWSERHVLVAANHPFICQLC
YAFQNKDYLYLVMEFLPGGDLMTLLIERDTLTEDEARFYVAEMVVAIDTI
HKLGFIHRDVKPDNMLIDKDGHLKLSDFGLCKSFNVDMDALPMSNVDVAS
SDTHSTLNDLSMTERAAAWRRNARKQAFSTVGTPDYISCEVLMKRGYNKE
CDYWSLGVVLYEMLVGYPPFYAEDALKTCRKILNWRETLRFPPEAKLSWS
AINLIQCLVCDAKHRLGARNGIDDFRDHPFFEGIDWDNLSTMKPPFLPEL
RGPTDTRYFEDHKPLPQNGVTQDRSSARPSYIKEPQAEEFIGFTFKRYNP
SEAPAGRRGGLTSSLFEKPDLQE*
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mRNA from alignment at tig00000045_pilon:184423..185945+

Legend: polypeptidestart_codonCDSexonintronstop_codon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Ggra6036.t1 ID=Ggra6036.t1|Name=Ggra6036.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=mRNA|length=1523bp|location=Sequence derived from alignment at tig00000045_pilon:184423..185945+ (Gracilaria gracilis GNS1m male)
ATGACCGACGCCGTGTCCGGCCCGTCCGCGCTGCGCAACGCGAGCAAGGC
CGAGCTTGCCAAGCGCAAGATCGAGATTCTGTTCTCCACGCTCACGCAGG
AGCGTGAGGCCGCCAAGAAGCGCGCACACGAGCTGGAGCACAGGCTGGCT
ACCATGTCCATCCGCGACGCTGACAAGGACCGCATGCGAAAGCAGCACGC
GCAGCGCGAGATGGCCTTCTTGAGGGAGCGCCGCCGCCCCATGTCGGAGG
CCGACTTTGACATGATTAGTATCATTGGCCGTGGCGCCTTTGGCGAAGTT
ATTCTTGTGCAGCACAAGAAGACCGCCAACTATTATGCCATGAAGAAGCT
TCAAAAGGCCGACATGCTGCGCAAGGAACAGGTGAATCACGCCTGGTCGG
AACGCCATGTGCTTGTGGCCGCTAATCACCCATTCATATGCCAGCTTTGT
TACGCCTTCCAAAACAAGGATTACCTGTATCTTGTCATGGAGTTCTTGCC
AGGCGGTGATCTCATGACTCTGCTCATTGAACGGGACACCCTCACGGAAG
ACGAAGCTCGCTTTTACGTCGCTGAGATGGTTGTTGCTATTGACACCATC
CATAAGCTCGGCTTTATTCACCGCGATGTCAAGCCGGATAACATGCTCAT
CGACAAAGACGGACATCTTAAGCTCAGCGATTTTGGACTCTGCAAGAGTT
TCAATGTGGATATGGATGCGTTACCAATGTCCAATGTTGACGTTGCGAGT
AGTGATACTCATTCAACGCTCAACGACCTCTCCATGACCGAAAGAGCGGC
GGCTTGGAGACGAAATGCCAGAAAGCAAGCCTTTTCTACCGTTGGAACGT
AAGTTTTACTGCTACTTCATCACAGCAAGCGCCCCTGTGACACATTATCG
AAAGAGTACTGACCATAACTTCGATCGTTTATTCTATCAATCATAATAGT
CCGGATTACATTTCGTGCGAGGTTTTGATGAAGAGAGGGTATAACAAGGA
ATGCGATTATTGGAGTCTTGGAGTTGTTCTATACGAAATGCTTGTGGGCT
ATCCTCCATTTTACGCAGAAGATGCCCTCAAGACCTGTCGTAAGATCCTC
AACTGGCGCGAGACGCTGCGATTCCCTCCAGAAGCAAAGCTCAGCTGGTC
TGCGATAAATCTCATCCAGTGTTTGGTATGTGACGCCAAACACCGACTTG
GGGCGAGGAACGGCATCGATGACTTTCGGGATCACCCGTTCTTTGAAGGA
ATCGATTGGGATAACCTTTCTACCATGAAACCTCCGTTCTTGCCGGAGCT
GCGCGGACCCACGGATACTCGTTATTTTGAGGATCATAAGCCATTACCGC
AGAACGGTGTTACTCAAGACAGGTCGTCCGCTCGACCGTCTTACATCAAA
GAACCACAGGCTGAGGAGTTCATCGGTTTCACCTTCAAGCGATATAATCC
GAGTGAAGCCCCTGCTGGGCGCCGTGGAGGCTTGACATCCTCCCTGTTTG
AAAAGCCGGACCTTCAAGAGTAG
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Coding sequence (CDS) from alignment at tig00000045_pilon:184423..185945+

>Ggra6036.t1 ID=Ggra6036.t1|Name=Ggra6036.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=CDS|length=1422bp|location=Sequence derived from alignment at tig00000045_pilon:184423..185945+ (Gracilaria gracilis GNS1m male)
ATGACCGACGCCGTGTCCGGCCCGTCCGCGCTGCGCAACGCGAGCAAGGC
CGAGCTTGCCAAGCGCAAGATCGAGATTCTGTTCTCCACGCTCACGCAGG
AGCGTGAGGCCGCCAAGAAGCGCGCACACGAGCTGGAGCACAGGCTGGCT
ACCATGTCCATCCGCGACGCTGACAAGGACCGCATGCGAAAGCAGCACGC
GCAGCGCGAGATGGCCTTCTTGAGGGAGCGCCGCCGCCCCATGTCGGAGG
CCGACTTTGACATGATTAGTATCATTGGCCGTGGCGCCTTTGGCGAAGTT
ATTCTTGTGCAGCACAAGAAGACCGCCAACTATTATGCCATGAAGAAGCT
TCAAAAGGCCGACATGCTGCGCAAGGAACAGGTGAATCACGCCTGGTCGG
AACGCCATGTGCTTGTGGCCGCTAATCACCCATTCATATGCCAGCTTTGT
TACGCCTTCCAAAACAAGGATTACCTGTATCTTGTCATGGAGTTCTTGCC
AGGCGGTGATCTCATGACTCTGCTCATTGAACGGGACACCCTCACGGAAG
ACGAAGCTCGCTTTTACGTCGCTGAGATGGTTGTTGCTATTGACACCATC
CATAAGCTCGGCTTTATTCACCGCGATGTCAAGCCGGATAACATGCTCAT
CGACAAAGACGGACATCTTAAGCTCAGCGATTTTGGACTCTGCAAGAGTT
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