Ggra5012.t1 (mRNA) Gracilaria gracilis GNS1m male

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Overview
NameGgra5012.t1
Unique NameGgra5012.t1
TypemRNA
OrganismGracilaria gracilis GNS1m male (Gracilaria gracilis GNS1m male (Slender Wart Weed))
Sequence length1105
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
tig00000069_piloncontigtig00000069_pilon:42917..48883 -
Analyses
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Analysis NameDate Performed
Gracilaria gracilis GNS1m male OGS1.02022-05-09
Properties
Property NameValue
Seed ortholog45157.CMM316CT
Preferred nameSMARCA4
PFAMsBRK,Bromodomain,HSA,Helicase_C,QLQ,SNF2_N,SnAC
Max annot lvl2759|Eukaryota
KEGG koko:K11647,ko:K11786
KEGG Pathwayko04714,ko05225,map04714,map05225
GOsGO:0000003,GO:0000086,GO:0000122,GO:0000166,GO:0000182,GO:0000228,GO:0000278,GO:0000785,GO:0000790,GO:0000791,GO:0000792,GO:0000902,GO:0000904,GO:0000976,GO:0000977,GO:0000978,GO:0000987,GO:0000988,GO:0000990,GO:0000991,GO:0001012,GO:0001013,GO:0001046,GO:0001047,GO:0001067,GO:0001085,GO:0001101,GO:0001102,GO:0001163,GO:0001164,GO:0001188,GO:0001221,GO:0001223,GO:0001558,GO:0001568,GO:0001570,GO:0001654,GO:0001701,GO:0001709,GO:0001824,GO:0001832,GO:0001835,GO:0001889,GO:0001944,GO:0002009,GO:0002039,GO:0002064,GO:0002088,GO:0002165,GO:0002262,GO:0002376,GO:0002520,GO:0002682,GO:0003002,GO:0003006,GO:0003007,GO:0003151,GO:0003205,GO:0003206,GO:0003231,GO:0003279,GO:0003281,GO:0003407,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003678,GO:0003682,GO:0003690,GO:0003712,GO:0003713,GO:0003714,GO:0003824,GO:0004003,GO:0004386,GO:0005102,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005694,GO:0005719,GO:0005726,GO:0005730,GO:0005856,GO:0005975,GO:0005984,GO:0005985,GO:0005987,GO:0006066,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006260,GO:0006261,GO:0006281,GO:0006284,GO:0006302,GO:0006304,GO:0006305,GO:0006306,GO:0006310,GO:0006323,GO:0006325,GO:0006333,GO:0006334,GO:0006337,GO:0006338,GO:0006342,GO:0006346,GO:0006351,GO:0006352,GO:0006354,GO:0006355,GO:0006356,GO:0006357,GO:0006360,GO:0006361,GO:0006366,GO:0006368,GO:0006464,GO:0006473,GO:0006475,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006928,GO:0006935,GO:0006950,GO:0006970,GO:0006974,GO:0006996,GO:0007010,GO:0007049,GO:0007059,GO:0007154,GO:0007165,GO:0007166,GO:0007275,GO:0007276,GO:0007281,GO:0007283,GO:0007286,GO:0007292,GO:0007346,GO:0007389,GO:0007399,GO:0007403,GO:0007406,GO:0007409,GO:0007417,GO:0007420,GO:0007423,GO:0007444,GO:0007472,GO:0007474,GO:0007476,GO:0007478,GO:0007480,GO:0007507,GO:0007552,GO:0007560,GO:0008026,GO:0008094,GO:0008134,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008283,GO:0008284,GO:0008285,GO:0008544,GO:0008586,GO:0008587,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009266,GO:0009267,GO:0009311,GO:0009313,GO:0009408,GO:0009414,GO:0009415,GO:0009605,GO:0009628,GO:0009651,GO:0009653,GO:0009790,GO:0009791,GO:0009792,GO:0009826,GO:0009886,GO:0009887,GO:0009888,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009891,GO:0009892,GO:0009893,GO:0009913,GO:0009966,GO:0009967,GO:0009968,GO:0009987,GO:0009991,GO:0010001,GO:0010015,GO:0010033,GO:0010035,GO:0010073,GO:0010074,GO:0010078,GO:0010154,GO:0010162,GO:0010231,GO:0010424,GO:0010431,GO:0010453,GO:0010455,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010492,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010558,GO:0010564,GO:0010570,GO:0010604,GO:0010605,GO:0010628,GO:0010629,GO:0010646,GO:0010647,GO:0010648,GO:0010721,GO:0010810,GO:0010811,GO:0010941,GO:0010948,GO:0010959,GO:0015616,GO:0016043,GO:0016049,GO:0016052,GO:0016070,GO:0016358,GO:0016458,GO:0016462,GO:0016514,GO:0016569,GO:0016570,GO:0016573,GO:0016584,GO:0016586,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017076,GO:0017111,GO:0018130,GO:0018193,GO:0018205,GO:0018393,GO:0018394,GO:0019219,GO:0019221,GO:0019222,GO:0019438,GO:0019538,GO:0019827,GO:0019899,GO:0019953,GO:0021700,GO:0021781,GO:0022008,GO:0022402,GO:0022411,GO:0022412,GO:0022414,GO:0022607,GO:0022611,GO:0022622,GO:0023051,GO:0023052,GO:0023056,GO:0023057,GO:0030030,GO:0030097,GO:0030099,GO:0030111,GO:0030154,GO:0030155,GO:0030177,GO:0030182,GO:0030198,GO:0030216,GO:0030218,GO:0030308,GO:0030326,GO:0030334,GO:0030554,GO:0030855,GO:0030900,GO:0030902,GO:0030957,GO:0031055,GO:0031175,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031328,GO:0031347,GO:0031490,GO:0031491,GO:0031492,GO:0031494,GO:0031496,GO:0031497,GO:0031498,GO:0031667,GO:0031668,GO:0031669,GO:0031974,GO:0031981,GO:0032259,GO:0032392,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032504,GO:0032508,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032774,GO:0032776,GO:0032879,GO:0032984,GO:0032986,GO:0032989,GO:0032990,GO:0032991,GO:0033143,GO:0033144,GO:0033554,GO:0033613,GO:0034097,GO:0034101,GO:0034198,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0034728,GO:0034756,GO:0035060,GO:0035107,GO:0035108,GO:0035113,GO:0035114,GO:0035116,GO:0035120,GO:0035137,GO:0035172,GO:0035188,GO:0035218,GO:0035220,GO:0035239,GO:0035257,GO:0035258,GO:0035295,GO:0035639,GO:0035821,GO:0035886,GO:0035887,GO:0035904,GO:0036003,GO:0036094,GO:0036211,GO:0036335,GO:0038111,GO:0040007,GO:0040008,GO:0040011,GO:0040012,GO:0040029,GO:0042058,GO:0042063,GO:0042127,GO:0042148,GO:0042221,GO:0042330,GO:0042393,GO:0042592,GO:0042594,GO:0042623,GO:0042692,GO:0042766,GO:0042981,GO:0043009,GO:0043010,GO:0043044,GO:0043062,GO:0043066,GO:0043067,GO:0043069,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043233,GO:0043269,GO:0043388,GO:0043412,GO:0043414,GO:0043543,GO:0043565,GO:0043588,GO:0043618,GO:0043620,GO:0043696,GO:0043697,GO:0043900,GO:0043902,GO:0043903,GO:0043921,GO:0043923,GO:0043933,GO:0043966,GO:0043974,GO:0044085,GO:0044093,GO:0044107,GO:0044109,GO:0044212,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044275,GO: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Evalue8.41e-16
EggNOG OGsCOG0553@1|root,KOG0386@2759|Eukaryota
Descriptionaortic smooth muscle cell differentiation
COG categoryKL
BRITEko00000,ko00001,ko01000,ko03021,ko03036
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra5012Ggra5012Gracilaria gracilis GNS1m malegenetig00000069_pilon 42917..48883 -


The following stop_codon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra5012.t1.stop1Ggra5012.t1.stop1Gracilaria gracilis GNS1m malestop_codontig00000069_pilon 42917..42919 -


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
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Ggra5012.t1.CDS2Ggra5012.t1.CDS2Gracilaria gracilis GNS1m maleCDStig00000069_pilon 43263..43279 -
Ggra5012.t1.CDS3Ggra5012.t1.CDS3Gracilaria gracilis GNS1m maleCDStig00000069_pilon 43499..43679 -
Ggra5012.t1.CDS4Ggra5012.t1.CDS4Gracilaria gracilis GNS1m maleCDStig00000069_pilon 44069..44941 -
Ggra5012.t1.CDS5Ggra5012.t1.CDS5Gracilaria gracilis GNS1m maleCDStig00000069_pilon 45296..45599 -
Ggra5012.t1.CDS6Ggra5012.t1.CDS6Gracilaria gracilis GNS1m maleCDStig00000069_pilon 47205..48883 -


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra5012.t1.exon1Ggra5012.t1.exon1Gracilaria gracilis GNS1m maleexontig00000069_pilon 42917..43177 -
Ggra5012.t1.exon2Ggra5012.t1.exon2Gracilaria gracilis GNS1m maleexontig00000069_pilon 43263..43279 -
Ggra5012.t1.exon3Ggra5012.t1.exon3Gracilaria gracilis GNS1m maleexontig00000069_pilon 43499..43679 -
Ggra5012.t1.exon4Ggra5012.t1.exon4Gracilaria gracilis GNS1m maleexontig00000069_pilon 44069..44941 -
Ggra5012.t1.exon5Ggra5012.t1.exon5Gracilaria gracilis GNS1m maleexontig00000069_pilon 45296..45599 -
Ggra5012.t1.exon6Ggra5012.t1.exon6Gracilaria gracilis GNS1m maleexontig00000069_pilon 47205..48883 -


The following intron feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra5012.t1.intron1Ggra5012.t1.intron1Gracilaria gracilis GNS1m maleintrontig00000069_pilon 43178..43262 -
Ggra5012.t1.intron2Ggra5012.t1.intron2Gracilaria gracilis GNS1m maleintrontig00000069_pilon 43280..43498 -
Ggra5012.t1.intron3Ggra5012.t1.intron3Gracilaria gracilis GNS1m maleintrontig00000069_pilon 43680..44068 -
Ggra5012.t1.intron4Ggra5012.t1.intron4Gracilaria gracilis GNS1m maleintrontig00000069_pilon 44942..45295 -
Ggra5012.t1.intron5Ggra5012.t1.intron5Gracilaria gracilis GNS1m maleintrontig00000069_pilon 45600..47204 -


The following start_codon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra5012.t1.start1Ggra5012.t1.start1Gracilaria gracilis GNS1m malestart_codontig00000069_pilon 48881..48883 -


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra5012.t1Ggra5012.t1Gracilaria gracilis GNS1m malepolypeptidetig00000069_pilon 42917..48883 -


Sequences
The following sequences are available for this feature:

mRNA sequence

>Ggra5012.t1 ID=Ggra5012.t1|Name=Ggra5012.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=mRNA|length=1105bp
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LQLVNQARLILLPTSNDAVNTASDLVSSAVHIDVSTATMAAIMGLKNAHT
LRGAAVAEANAFQAAHPTFDLAANRQAPLKLNLLPRLSRTATDALLKLIT
TDTELGLRAHNDVHAKNSVMAQKIQRMKASTRHANLRRRRMSADAHSSDI
ALRAAQLLHSSNPSAFAMKPPSTSNTYQPIPTVPTAVNRSFAPTVSFLKP
PTAPTSTIRVVPPMSQTLDVQGFATFAPSDRRPTQPPQFSRYRKPAPPSE
RVEKHVANDAIVSQKGVMNDTIGTPEHVMEAFLYPPPSRIQQVQHENFDN
QTKIRSVLTERERVILRLLRRRRTELAAMPLGMTEQTRRNAIIEAKQLSL
LEMQRVVRNRVCTEMKKMYSLAVQEDRSVPPDHLSRLFRRRDPPIYSYTN
GYPRITPFDTVPEMPPRHPQTIAKDSIRMAEFDKSRMEALKVQRNKELQA
RLVLHYNDFKNAVSEAKNARARVWKNFERFLIEKRRAEERRRKLERIERL
RLLRSNDEQATIEEKILEQANRKLQIDAQIIQAGQFNNKSTEMDRHQMLK
DILRQRNGEDSTGSVPTVEDLNRLFAQTDNEYEDFVKYDKETAENGLYKP
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KVYLKLRIRPGDELSTQQPEEGKRRPGSFARKRKRSQKVLEMANGVGSSF
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DDEELLTKNWNSQERTNTRKMNGSSQEDGWKANGKMSRKHEQVENLISLK
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YTPPSLRGKGIAGKLVKHALAYARENQYKIIPTCSYVAVYMERHPEEKDV
LKVD*
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spliced messenger RNA

>Ggra5012.t1 ID=Ggra5012.t1|Name=Ggra5012.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=mRNA|length=3315bp|location=Sequence derived from alignment at tig00000069_pilon:42917..48883- (Gracilaria gracilis GNS1m male)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.  
ATGTCCCCAAACAAAGAGCTCGAAATTGCCGCTCTTGCGGCGGGAGTCCC
CACCAGGGTCCCGCAGCTCATTGTTCACCACGCCGCCTCACAGCTTCGTC
GTCTTCTCGACACCGGCGTGTCGCCGTCAGACTCAAGAATTCAGGCCTTG
TTGCAGCTGGTCAACCAAGCTCGACTCATTCTTCTCCCCACTTCCAACGA
TGCCGTCAACACCGCCTCCGACCTCGTCTCCAGCGCCGTTCACATCGATG
TCTCCACCGCAACAATGGCCGCCATCATGGGGCTCAAGAACGCCCACACT
CTCCGCGGAGCCGCCGTAGCCGAAGCAAATGCCTTTCAGGCAGCTCATCC
TACTTTCGATTTAGCAGCCAACCGTCAAGCTCCTCTCAAACTCAACCTGC
TTCCCCGTCTATCGCGCACAGCAACCGATGCACTTCTCAAGCTCATCACC
ACCGATACAGAGCTCGGTCTGCGCGCCCACAACGACGTGCACGCCAAAAA
CTCTGTCATGGCGCAGAAAATCCAGCGCATGAAAGCTTCAACTCGACATG
CTAATTTGCGTCGTCGTCGAATGTCTGCCGATGCTCATTCCTCAGACATT
GCCTTGCGTGCCGCTCAATTATTGCATTCCTCAAACCCTTCTGCCTTTGC
AATGAAGCCCCCATCAACCTCTAATACATACCAGCCCATTCCCACAGTTC
CCACCGCTGTTAACAGGTCATTTGCTCCAACCGTATCGTTTTTGAAACCA
CCAACTGCTCCAACCTCCACTATTCGAGTAGTTCCGCCCATGTCGCAGAC
GCTTGACGTTCAGGGCTTTGCAACTTTTGCTCCGTCCGATCGCCGCCCTA
CCCAGCCTCCCCAGTTTTCCAGGTATCGGAAGCCTGCCCCACCCTCTGAG
CGCGTTGAGAAGCACGTCGCTAACGATGCCATAGTTTCGCAAAAAGGTGT
GATGAATGACACCATCGGCACCCCTGAGCATGTTATGGAAGCGTTCTTGT
ATCCGCCGCCAAGTCGCATTCAACAGGTGCAGCATGAAAATTTCGATAAC
CAGACCAAGATAAGGTCAGTTCTCACGGAACGTGAGCGTGTAATTCTCCG
TCTTCTACGACGTCGCCGCACTGAATTGGCCGCGATGCCGTTGGGTATGA
CTGAGCAAACGCGAAGGAATGCCATAATCGAAGCGAAACAGCTTTCCCTA
CTCGAAATGCAGCGGGTTGTGAGAAACAGAGTGTGCACTGAAATGAAAAA
GATGTATTCTCTAGCCGTTCAAGAAGATCGAAGTGTTCCTCCAGATCACC
TTTCTCGCCTTTTTAGGAGAAGAGACCCGCCGATATACTCATACACGAAT
GGGTATCCTCGTATAACACCATTTGATACTGTTCCGGAAATGCCTCCGAG
ACATCCGCAGACTATCGCGAAGGACAGCATTCGCATGGCGGAATTTGACA
AGTCGCGCATGGAAGCTCTCAAGGTGCAGAGAAACAAAGAACTCCAAGCT
AGGCTTGTGTTGCATTACAATGACTTCAAAAACGCCGTTTCTGAAGCGAA
GAACGCTCGCGCTCGTGTTTGGAAGAACTTTGAACGTTTTCTAATTGAGA
AGAGAAGAGCTGAGGAAAGGCGCAGGAAGCTGGAGAGAATTGAACGACTA
AGACTCCTTCGAAGCAACGATGAGCAGGCCACTATTGAAGAGAAAATATT
GGAGCAAGCAAACCGAAAGCTCCAGATTGACGCTCAGATCATCCAAGCAG
GACAGTTCAACAACAAAAGCACAGAAATGGACAGACACCAGATGCTCAAG
GACATTCTTCGTCAAAGGAATGGCGAAGACAGTACAGGGAGCGTCCCGAC
AGTGGAAGATTTGAATCGACTGTTTGCCCAAACGGACAACGAGTACGAGG
ACTTCGTGAAGTACGACAAAGAAACAGCGGAGAACGGGTTGTACAAACCT
ATATTTGCTGAAGAAGCAGAGCTACCAGAATGGGATGCGAGCAGTTCTGC
TCGCCAAAGAAGTCCTTCAGTAACTGGAAATGGGGTTGTATCGGGCTCAG
ACATCGAGCTTAAGGTTGGTAATGAACCTAAGCACCGTGAGTTAGATACG
GGAAGCACAATTGGCTCTGCTTCAAGGAAGAATAGGTCACGTCGCTTTGA
ATCTCGAAGATCAAAGGAGAATGGAGGTCACGAAAGGCAAATCAAACTTG
AACCCGAAAAGGACATGATAAAGACGAATGTAGGAGAGAGTGATGGAAGT
AAAGTGTACCTGAAGTTGAGAATTCGTCCTGGCGATGAGCTTTCTACCCA
GCAACCAGAAGAGGGTAAGAGACGCCCTGGTTCATTTGCCAGGAAGCGGA
AAAGGTCACAGAAGGTTCTCGAAATGGCGAATGGAGTGGGTTCAAGTTTT
TATGAAAGAGGAAGGAAAAGAATGAAAACGAGCGCGGCAAGTGACTCTTC
TCATGCCGTTGATGTCAGAGAGAAGTCATCAACAAGACTTGTCCCGTCTT
TCAGTCAAGGGAAGAAGTGGAGGAAGCGCAAGTCCGGAGAGAAGGGTAGC
GAGCCAATTGAGGCTGAGCACAGCAGAGCCGCGAAACCCAGTAGCGTGGC
TGACTCAAATCCCAGGAAGCATATCCTCATTCCGCAAGATAGAAGAGCTC
CGGGAAGAGGCAAGGATTCGAACAGTGAATCAGGGACGAGGAATACTAGC
GATGACGAGGAACTTTTGACGAAGAACTGGAATTCTCAGGAAAGGACTAA
TACTCGGAAGATGAATGGGTCATCTCAGGAGGACGGTTGGAAAGCAAATG
GGAAAATGTCAAGAAAGCACGAGCAAGTCGAGAACTTAATTTCACTGAAA
CTGCGCACGACGGCTGATCTTGGGAAGAATATGGCACCGGCAAATGACGG
CGCACCAACTATGCAACCGTTTTCTGCAGCGAATTACGAATTCGTGTCGA
CATGCGCACCGGTGCTCGCAGAAAACAAGCCTTGGGAAAGCCCTATTAGT
CAGAAGAATTCTGCTTTCATCACATCGGTGTCCGAAGAGTACATCGCTTC
AGAGAATCGCTTCGTAATTAAGTACACTGATGTCGAGGAACCCGCTTTCT
TATCATACGTACTGTTTGAAGATGGTACCGTGTACGACATGAATCACACA
TACACGCCGCCTTCTCTGCGTGGAAAAGGTATTGCGGGAAAACTTGTGAA
GCATGCTCTAGCTTACGCCCGAGAGAACCAGTACAAAATTATTCCGACTT
GTTCATATGTTGCGGTGTACATGGAACGCCACCCAGAAGAGAAGGACGTT
CTCAAAGTGGATTGA
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protein sequence of Ggra5012.t1

>Ggra5012.t1 ID=Ggra5012.t1|Name=Ggra5012.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=polypeptide|length=1105bp
MSPNKELEIAALAAGVPTRVPQLIVHHAASQLRRLLDTGVSPSDSRIQAL
LQLVNQARLILLPTSNDAVNTASDLVSSAVHIDVSTATMAAIMGLKNAHT
LRGAAVAEANAFQAAHPTFDLAANRQAPLKLNLLPRLSRTATDALLKLIT
TDTELGLRAHNDVHAKNSVMAQKIQRMKASTRHANLRRRRMSADAHSSDI
ALRAAQLLHSSNPSAFAMKPPSTSNTYQPIPTVPTAVNRSFAPTVSFLKP
PTAPTSTIRVVPPMSQTLDVQGFATFAPSDRRPTQPPQFSRYRKPAPPSE
RVEKHVANDAIVSQKGVMNDTIGTPEHVMEAFLYPPPSRIQQVQHENFDN
QTKIRSVLTERERVILRLLRRRRTELAAMPLGMTEQTRRNAIIEAKQLSL
LEMQRVVRNRVCTEMKKMYSLAVQEDRSVPPDHLSRLFRRRDPPIYSYTN
GYPRITPFDTVPEMPPRHPQTIAKDSIRMAEFDKSRMEALKVQRNKELQA
RLVLHYNDFKNAVSEAKNARARVWKNFERFLIEKRRAEERRRKLERIERL
RLLRSNDEQATIEEKILEQANRKLQIDAQIIQAGQFNNKSTEMDRHQMLK
DILRQRNGEDSTGSVPTVEDLNRLFAQTDNEYEDFVKYDKETAENGLYKP
IFAEEAELPEWDASSSARQRSPSVTGNGVVSGSDIELKVGNEPKHRELDT
GSTIGSASRKNRSRRFESRRSKENGGHERQIKLEPEKDMIKTNVGESDGS
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YERGRKRMKTSAASDSSHAVDVREKSSTRLVPSFSQGKKWRKRKSGEKGS
EPIEAEHSRAAKPSSVADSNPRKHILIPQDRRAPGRGKDSNSESGTRNTS
DDEELLTKNWNSQERTNTRKMNGSSQEDGWKANGKMSRKHEQVENLISLK
LRTTADLGKNMAPANDGAPTMQPFSAANYEFVSTCAPVLAENKPWESPIS
QKNSAFITSVSEEYIASENRFVIKYTDVEEPAFLSYVLFEDGTVYDMNHT
YTPPSLRGKGIAGKLVKHALAYARENQYKIIPTCSYVAVYMERHPEEKDV
LKVD*
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mRNA from alignment at tig00000069_pilon:42917..48883-

Legend: polypeptideCDSexonstart_codonintronstop_codon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Ggra5012.t1 ID=Ggra5012.t1|Name=Ggra5012.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=mRNA|length=5967bp|location=Sequence derived from alignment at tig00000069_pilon:42917..48883- (Gracilaria gracilis GNS1m male)
ATGTCCCCAAACAAAGAGCTCGAAATTGCCGCTCTTGCGGCGGGAGTCCC
CACCAGGGTCCCGCAGCTCATTGTTCACCACGCCGCCTCACAGCTTCGTC
GTCTTCTCGACACCGGCGTGTCGCCGTCAGACTCAAGAATTCAGGCCTTG
TTGCAGCTGGTCAACCAAGCTCGACTCATTCTTCTCCCCACTTCCAACGA
TGCCGTCAACACCGCCTCCGACCTCGTCTCCAGCGCCGTTCACATCGATG
TCTCCACCGCAACAATGGCCGCCATCATGGGGCTCAAGAACGCCCACACT
CTCCGCGGAGCCGCCGTAGCCGAAGCAAATGCCTTTCAGGCAGCTCATCC
TACTTTCGATTTAGCAGCCAACCGTCAAGCTCCTCTCAAACTCAACCTGC
TTCCCCGTCTATCGCGCACAGCAACCGATGCACTTCTCAAGCTCATCACC
ACCGATACAGAGCTCGGTCTGCGCGCCCACAACGACGTGCACGCCAAAAA
CTCTGTCATGGCGCAGAAAATCCAGCGCATGAAAGCTTCAACTCGACATG
CTAATTTGCGTCGTCGTCGAATGTCTGCCGATGCTCATTCCTCAGACATT
GCCTTGCGTGCCGCTCAATTATTGCATTCCTCAAACCCTTCTGCCTTTGC
AATGAAGCCCCCATCAACCTCTAATACATACCAGCCCATTCCCACAGTTC
CCACCGCTGTTAACAGGTCATTTGCTCCAACCGTATCGTTTTTGAAACCA
CCAACTGCTCCAACCTCCACTATTCGAGTAGTTCCGCCCATGTCGCAGAC
GCTTGACGTTCAGGGCTTTGCAACTTTTGCTCCGTCCGATCGCCGCCCTA
CCCAGCCTCCCCAGTTTTCCAGGTATCGGAAGCCTGCCCCACCCTCTGAG
CGCGTTGAGAAGCACGTCGCTAACGATGCCATAGTTTCGCAAAAAGGTGT
GATGAATGACACCATCGGCACCCCTGAGCATGTTATGGAAGCGTTCTTGT
ATCCGCCGCCAAGTCGCATTCAACAGGTGCAGCATGAAAATTTCGATAAC
CAGACCAAGATAAGGTCAGTTCTCACGGAACGTGAGCGTGTAATTCTCCG
TCTTCTACGACGTCGCCGCACTGAATTGGCCGCGATGCCGTTGGGTATGA
CTGAGCAAACGCGAAGGAATGCCATAATCGAAGCGAAACAGCTTTCCCTA
CTCGAAATGCAGCGGGTTGTGAGAAACAGAGTGTGCACTGAAATGAAAAA
GATGTATTCTCTAGCCGTTCAAGAAGATCGAAGTGTTCCTCCAGATCACC
TTTCTCGCCTTTTTAGGAGAAGAGACCCGCCGATATACTCATACACGAAT
GGGTATCCTCGTATAACACCATTTGATACTGTTCCGGAAATGCCTCCGAG
ACATCCGCAGACTATCGCGAAGGACAGCATTCGCATGGCGGAATTTGACA
AGTCGCGCATGGAAGCTCTCAAGGTGCAGAGAAACAAAGAACTCCAAGCT
AGGCTTGTGTTGCATTACAATGACTTCAAAAACGCCGTTTCTGAAGCGAA
GAACGCTCGCGCTCGTGTTTGGAAGAACTTTGAACGTTTTCTAATTGAGA
AGAGAAGAGCTGAGGAAAGGCGCAGGAAGCTGGAGAGAATTGAACGACTA
AGACTCCTTCGAAGCAACGATGAGCAGGCGTATCTGAAGCTGCTGAAGAA
CACCAAAAACGAGCGCTTGCTGCAGCTGGTGCGGCAGACGGACAGCTACC
TCATGCGAATCGGTGCTCAAGTCGAGCGGGAGCGCGAAAGATCCGAAGGT
ACAGATGGTATTGGTGGCTACAACACGTTTAATGAAGAGTTGCGAGACAG
GGACGCAGTTCCTATTGATGCGATGAGGCGGAGGCGCGACTTGTACTATA
CTGTTACACACTCTGTGCAGGAGGAAGTGCGACAACCATCCATAATGGTG
CATGGTACACTGAAGGCTTACCAAGTCGAAGGTCTTAAATGGATGGTGTC
CTTGTACAACAATAATTTGAACGGAATTCTCGCCGACGAAATGGGACTCG
GAAAGACTATCCAGACCATATCTCTTATTACGTATCTAGTCGAGAAGAAG
AAGAACCCCGGTCCATTTCTAGTTATTGTCCCGCTTAGCACAATGGGAAA
CTGGGTTCGTGAACTAGACTTGTGGGCTCCATCCCTGACTAAAGTCGTGT
ACAGGGGGGACAAATCCACTAGAAAGAACATTCAGCAGACCCAAATGGCA
AGCGGTGATTACAACGTGGTCCTCACCACGTATGAGTTCACGGTGAAAGA
CCAGAATATTCTCAGTCCGATATACTGGCAGTACATCGTTATTGACGAGG
GACACCGAATGAAAAACGCCAATTGCAAGCTGGCGATGACCCTTGGTGTC
AAATACAAATCTCGCAATCGACTACTTCTTACTGGTACCCCATTGCAGAA
CAATCTTACTGAACTATGGGCATTGCTCAATTTTCTATTGCCCACTATTT
TTGCCTCCGCTGACACGTTTGAGACATGGTTTAAGAAGCCGTTTGAAACA
ACGGCTCTTGGAGACTCAGCGGAACTAGAAGAAGAGGAGACCTTGTTGGT
TATCAATCGCCTGCACCAGGTTCTGCGACCGTTTCTGCTTCGGAGGCTGA
AGTCAGATGTAGAATCTCAACTTCCGCAAAAAGTTGAACATGTTCTTCAC
TGCGCTATGTCATCATGGCAGAGAGCAATATATCGTCAGGTCATGAATCG
TATCGGGCTAGCAACTGGAAAGTCGAACGGAGTAAGGGCATTTAACAACC
TGCTAATGCAGTGCAAGAAGGTTTGTAATCATCCTTATCTGTTTTACGAC
TTTGAAGCAATTGCAACTCTTCCCCAAGACTATCTAATCAGGGCCAGTGG
GAAGTTCCATCTGCTCCATCATATGCTTCCAAAGTTACGGCTCCATGGAC
ACCGAACTCTTATCTTTTCTCAAATGACTGCAGCCCTGGATTATCTCGAA
TACTTTCTTCACGCGATAGACGTTCAGTACCTACGTCTTGACGGTACGAC
GAAAGCTGATGATCGGCAAGCTTTACTGAACAAGTTCAACGCTAAGGACT
CTCCTTATTTCTGCTTTTTGCTTTCGACACGTGCCGGAGGCTTAGGATTG
AATCTTCAAACTGCAGATACCGTAATCATATTTGACTCTGATTGGAACCC
CATGATGGACCTTCAAGCTCAGGATCGCGCTCATCGCATTGGTCAGACCA
AAGTTGTACGAGTGTTTCGTTTGATTTGTCCAAGCACTATTGAAGAGAAA
ATATTGGAGCAAGCAAACCGAAAGCTCCAGATTGACGCTCAGATCATCCA
AGCAGGACAGTTCAACAACAAAAGCACAGAAATGGACAGACACCAGATGC
TCAAGGACATTCTTCGTCAAAGGAATGGCGAAGACAGTACAGGGAGCGTC
CCGACAGTGGAAGATTTGAATCGACTGTTTGCCCAAACGGACAACGAGTA
CGAGGACTTCGTGAAGTACGACAAAGAAACAGCGGAGAACGGGTTGTACA
AACCTATATTTGCTGAAGAAGCAGAGCTACCAGAATGGGTTCTACAACCA
GAAGTGAACCAGAAGACAGCAGAGGAAAGAGAGCAAGATATTCTCATGTC
TCATGGCCGAGGAAGACGCAAGCGGAAAGTGATGCATGACATTGACAGCC
TGACAGAGGCCGAGTGGCTACGGGTGATGGAAGGGGAAGCTACGGTTGAA
GAAGTGTTTCAGAAAAGGAAAAGGAGAAGGGAAAGCCGTCAGAGCGAAGG
GAAGAAAACCGATTCTGATGACAGAATTGATACAAGTGAAGATATTGATA
ACGAGAAACCCCCATCTCGGCCCAAGGGGAGCAGACGCGTGAAGCCATCG
GAATCTCGATCGGTTAGCGTTCCTTTGTCACCTTCTTCAAAGGATGCGAG
CAGTTCTGCTCGCCAAAGAAGTCCTTCAGTAACTGGAAATGGGGTTGTAT
CGGGCTCAGACATCGAGCTTAAGGTTGGTAATGAACCTAAGCACCGTGAG
TTAGATACGGGAAGCACAATTGGCTCTGCTTCAAGGAAGAATAGGTCACG
TCGCTTTGAATCTCGAAGATCAAAGGAGAATGGAGGTCACGAAAGGCAAA
TCAAACTTGAACCCGAAAAGGACATGATAAAGACGAATGTAGGAGAGAGT
GATGGAAGTAAAGTGTACCTGAAGTTGAGAATTCGTCCTGGCGATGAGCT
TTCTACCCAGCAACCAGAAGAGGGTAAGAGACGCCCTGGTTCATTTGCCA
GGAAGCGGAAAAGGTCACAGAAGGTTCTCGAAATGGCGAATGGAGTGGGT
TCAAGTTTTTATGAAAGAGGAAGGAAAAGAATGAAAACGAGCGCGGCAAG
TGACTCTTCTCATGCCGTTGATGTCAGAGAGAAGTCATCAACAAGACTTG
TCCCGTCTTTCAGTCAAGGGAAGAAGTGGAGGAAGCGCAAGTCCGGAGAG
AAGGGTAGCGAGCCAATTGAGGCTGAGCACAGCAGAGCCGCGAAACCCAG
TAGCGTGGCTGACTCAAATCCCAGGAAGCATATCCTCATTCCGCAAGATA
GAAGAGCTCCGGGAAGAGGCAAGGATTCGAACAGTGAATCAGGGACGAGG
AATACTAGCGATGACGAGGAACTTTTGACGAAGAACTGGAATTCTCAGGA
AAGGACTAATACTCGGAAGATGAATGGGTCATCTCAGGAGGACGGTTGGA
AAGCAAATGGGAAAATGTCAAGAAAGCACGAGCAAGTCGAGAACTTAATT
TCACTGAAACTGCGCGTGCGGGAACCAAACACGGCATTGGGATGAAGCTT
TGACTTGCCGTCCAGCGGCATTATCACGGCTCGAATGAGTTGGCTGCAAC
GATGGTGCCCTTCCTGTTCCAGAGACTTGCCTCTCGAGAAGCATGGGACT
GGAGATCCACTGTTTTTTTCAACCTTTGGAGGGATGGCTTTCCATCCCGG
TTTTGTCTCGAACGTTTCGATCCCCATAAGTCGAACATGGGCATGTACGA
TCACGAAGTCATCCGCAAACCTAACTAAACGTTGTAAAGAATACTATTTG
TTGACATACCCCACTAACTATAAAGTCCAGATCATATTCCCCTGCAGTGG
ACCCTGAAGGATTAGCTAGAGTGTCACTTGACCCGAGTGATCACGGTTTT
CCAGACGACGGCTGATCTTGGGAAGAATATGGCACCGGCAAATGACGGCG
CACCAACTATGCAACCGTTTTCTGCAGCGAATTACGAATTCGTGTCGACA
TGCGCACCGGTGCTCGCAGAAAACAAGCCTTGGGAAAGCCCTATTAGTCA
GAAGAATTCTGCTTTCATCACATCGGTGTCCGAAGGTAGGTGATGCCAGC
GGTAGGAAAGAGTAGCGCCACTGCCGCAGCAACGGTATGGTGAAGTTGTT
CTTCACCCGAGTTTCGACACTTTTTTCGCCTTCCACTAAAGTTCGCCATC
TTGCCACCTGTTCGCTTCTCTTCAGAAGGACATCGGAAAAAAATCAGAAC
CTTTGGAGCCTTGGTAAGAGTGTAAACCCACTGAGATTTTCGTTGTTAAC
CCAGAGTACATCGCTTCAGAGGTTCGTTCAGTCTAGACCAGTTTCCGGAT
CTCCGAGCAATCATATCCCAGCCATGAGCAACGAAGTAACCCATGAACCA
GAACAGAATCGCTTCGTAATTAAGTACACTGATGTCGAGGAACCCGCTTT
CTTATCATACGTACTGTTTGAAGATGGTACCGTGTACGACATGAATCACA
CATACACGCCGCCTTCTCTGCGTGGAAAAGGTATTGCGGGAAAACTTGTG
AAGCATGCTCTAGCTTACGCCCGAGAGAACCAGTACAAAATTATTCCGAC
TTGTTCATATGTTGCGGTGTACATGGAACGCCACCCAGAAGAGAAGGACG
TTCTCAAAGTGGATTGA
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Coding sequence (CDS) from alignment at tig00000069_pilon:42917..48883-

>Ggra5012.t1 ID=Ggra5012.t1|Name=Ggra5012.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=CDS|length=3315bp|location=Sequence derived from alignment at tig00000069_pilon:42917..48883- (Gracilaria gracilis GNS1m male)
ATGTCCCCAAACAAAGAGCTCGAAATTGCCGCTCTTGCGGCGGGAGTCCC
CACCAGGGTCCCGCAGCTCATTGTTCACCACGCCGCCTCACAGCTTCGTC
GTCTTCTCGACACCGGCGTGTCGCCGTCAGACTCAAGAATTCAGGCCTTG
TTGCAGCTGGTCAACCAAGCTCGACTCATTCTTCTCCCCACTTCCAACGA
TGCCGTCAACACCGCCTCCGACCTCGTCTCCAGCGCCGTTCACATCGATG
TCTCCACCGCAACAATGGCCGCCATCATGGGGCTCAAGAACGCCCACACT
CTCCGCGGAGCCGCCGTAGCCGAAGCAAATGCCTTTCAGGCAGCTCATCC
TACTTTCGATTTAGCAGCCAACCGTCAAGCTCCTCTCAAACTCAACCTGC
TTCCCCGTCTATCGCGCACAGCAACCGATGCACTTCTCAAGCTCATCACC
ACCGATACAGAGCTCGGTCTGCGCGCCCACAACGACGTGCACGCCAAAAA
CTCTGTCATGGCGCAGAAAATCCAGCGCATGAAAGCTTCAACTCGACATG
CTAATTTGCGTCGTCGTCGAATGTCTGCCGATGCTCATTCCTCAGACATT
GCCTTGCGTGCCGCTCAATTATTGCATTCCTCAAACCCTTCTGCCTTTGC
AATGAAGCCCCCATCAACCTCTAATACATACCAGCCCATTCCCACAGTTC
CCACCGCTGTTAACAGGTCATTTGCTCCAACCGTATCGTTTTTGAAACCA
CCAACTGCTCCAACCTCCACTATTCGAGTAGTTCCGCCCATGTCGCAGAC
GCTTGACGTTCAGGGCTTTGCAACTTTTGCTCCGTCCGATCGCCGCCCTA
CCCAGCCTCCCCAGTTTTCCAGGTATCGGAAGCCTGCCCCACCCTCTGAG
CGCGTTGAGAAGCACGTCGCTAACGATGCCATAGTTTCGCAAAAAGGTGT
GATGAATGACACCATCGGCACCCCTGAGCATGTTATGGAAGCGTTCTTGT
ATCCGCCGCCAAGTCGCATTCAACAGGTGCAGCATGAAAATTTCGATAAC
CAGACCAAGATAAGGTCAGTTCTCACGGAACGTGAGCGTGTAATTCTCCG
TCTTCTACGACGTCGCCGCACTGAATTGGCCGCGATGCCGTTGGGTATGA
CTGAGCAAACGCGAAGGAATGCCATAATCGAAGCGAAACAGCTTTCCCTA
CTCGAAATGCAGCGGGTTGTGAGAAACAGAGTGTGCACTGAAATGAAAAA
GATGTATTCTCTAGCCGTTCAAGAAGATCGAAGTGTTCCTCCAGATCACC
TTTCTCGCCTTTTTAGGAGAAGAGACCCGCCGATATACTCATACACGAAT
GGGTATCCTCGTATAACACCATTTGATACTGTTCCGGAAATGCCTCCGAG
ACATCCGCAGACTATCGCGAAGGACAGCATTCGCATGGCGGAATTTGACA
AGTCGCGCATGGAAGCTCTCAAGGTGCAGAGAAACAAAGAACTCCAAGCT
AGGCTTGTGTTGCATTACAATGACTTCAAAAACGCCGTTTCTGAAGCGAA
GAACGCTCGCGCTCGTGTTTGGAAGAACTTTGAACGTTTTCTAATTGAGA
AGAGAAGAGCTGAGGAAAGGCGCAGGAAGCTGGAGAGAATTGAACGACTA
AGACTCCTTCGAAGCAACGATGAGCAGGCCACTATTGAAGAGAAAATATT
GGAGCAAGCAAACCGAAAGCTCCAGATTGACGCTCAGATCATCCAAGCAG
GACAGTTCAACAACAAAAGCACAGAAATGGACAGACACCAGATGCTCAAG
GACATTCTTCGTCAAAGGAATGGCGAAGACAGTACAGGGAGCGTCCCGAC
AGTGGAAGATTTGAATCGACTGTTTGCCCAAACGGACAACGAGTACGAGG
ACTTCGTGAAGTACGACAAAGAAACAGCGGAGAACGGGTTGTACAAACCT
ATATTTGCTGAAGAAGCAGAGCTACCAGAATGGGATGCGAGCAGTTCTGC
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