Ggra3715.t1 (mRNA) Gracilaria gracilis GNS1m male

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Overview
NameGgra3715.t1
Unique NameGgra3715.t1
TypemRNA
OrganismGracilaria gracilis GNS1m male (Gracilaria gracilis GNS1m male (Slender Wart Weed))
Sequence length663
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
tig00000850_piloncontigtig00000850_pilon:1181446..1183434 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Gracilaria gracilis GNS1m male OGS1.02022-05-09
Properties
Property NameValue
Seed ortholog130081.XP_005707456.1
Preferred nameHSPA5
PFAMsHSP70
Max annot lvl2759|Eukaryota
KEGG koko:K03283,ko:K09490
KEGG TC1.A.33,1.A.33.1
KEGG Pathwayko03040,ko03060,ko04010,ko04141,ko04144,ko04213,ko04612,ko04915,ko04918,ko05020,ko05134,ko05145,ko05162,ko05164,ko05169,map03040,map03060,map04010,map04141,map04144,map04213,map04612,map04915,map04918,map05020,map05134,map05145,map05162,map05164,map05169
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Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra3715Ggra3715Gracilaria gracilis GNS1m malegenetig00000850_pilon 1181446..1183434 +


The following start_codon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra3715.t1.start1Ggra3715.t1.start1Gracilaria gracilis GNS1m malestart_codontig00000850_pilon 1181446..1181448 +


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra3715.t1.CDS1Ggra3715.t1.CDS1Gracilaria gracilis GNS1m maleCDStig00000850_pilon 1181446..1183434 +


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra3715.t1.exon1Ggra3715.t1.exon1Gracilaria gracilis GNS1m maleexontig00000850_pilon 1181446..1183434 +


The following stop_codon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra3715.t1.stop1Ggra3715.t1.stop1Gracilaria gracilis GNS1m malestop_codontig00000850_pilon 1183432..1183434 +


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra3715.t1Ggra3715.t1Gracilaria gracilis GNS1m malepolypeptidetig00000850_pilon 1181446..1183434 +


Sequences
The following sequences are available for this feature:

mRNA sequence

>Ggra3715.t1 ID=Ggra3715.t1|Name=Ggra3715.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=mRNA|length=663bp
MSVSSYKRQSAFFLLFASLIVACTASTENVGTVIGIDLGTTYSCVGVMQN
GQVEIIANDQGNRITPSYVAFTSEERLIGDAAKNQAAMNPVNTVFDVKRL
IGRKYTDATVQRDKKLLPFKIVSQGDKPMISIDVKGEKKTFSPEQISAMV
LGKMKKTAEEYLGREVKNAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRII
NEPTAAAIAYGLNKKGEKNILVFDLGGGTFDVTLLTIDDGVFEVLATNGD
THLGGEDFDQRVMDYMMKLFKRKYGKDLSKDKRALAKLRRECEKAKRALS
SQTQVRIEIESLYDGQDFSETLTRARFEELNSDLFRRTLKPVEKVLKDAD
MTKGQVHEVVLVGGSTRIPKVQQLVSNFFNGKAPSKGINPDEAVAYGAAV
QAGILSGDGGETTDNIVLVDVAPLSLGIETVGGVMSKIIPRNSKVPASKS
QTFTTYQDNQEVVSIQVYEGERTMTKDCHMLGKFDLSGIRKARRGDPQIL
VTFDVDANGILSVSAEEKGASNKESITITNDKGRLSEEEIERMVREAEEM
KDEDEKIKKKVEAKNNLENFIFTVKGTLEEKDKLEGKLDEEDIEALESAV
KEAQEWMDTEAEDADAEDIESRLNDMKEVVEPIMKKVGGGPGGAGGAPEE
EDDDDDDAHEEL*
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spliced messenger RNA

>Ggra3715.t1 ID=Ggra3715.t1|Name=Ggra3715.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=mRNA|length=1989bp|location=Sequence derived from alignment at tig00000850_pilon:1181446..1183434+ (Gracilaria gracilis GNS1m male)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.  
ATGTCCGTCTCTTCTTACAAACGCCAATCGGCGTTCTTTTTGTTATTCGC
GTCCCTCATCGTCGCCTGCACCGCTAGTACGGAGAATGTGGGCACCGTTA
TTGGAATTGATCTCGGAACCACTTACTCTTGTGTCGGAGTTATGCAAAAC
GGCCAGGTTGAGATAATCGCCAATGATCAGGGAAACCGAATCACTCCTTC
ATACGTGGCCTTCACTTCTGAAGAGCGACTGATTGGAGATGCCGCTAAGA
ATCAAGCCGCCATGAACCCCGTCAACACGGTGTTCGATGTGAAGCGTCTC
ATCGGAAGAAAGTACACTGATGCCACTGTTCAGCGCGATAAGAAGCTCTT
GCCCTTCAAGATCGTCAGCCAGGGTGATAAGCCGATGATTTCCATTGACG
TCAAGGGTGAGAAGAAGACATTCTCTCCGGAACAGATTTCCGCCATGGTT
CTCGGAAAGATGAAGAAGACTGCTGAGGAGTATCTTGGTAGAGAAGTTAA
GAACGCTGTGGTTACCGTCCCGGCCTACTTCAATGACGCCCAGAGACAGG
CTACGAAGGATGCTGGTACTATTGCCGGCCTGAATGTCATGCGTATTATC
AACGAACCTACTGCGGCTGCCATTGCGTACGGCCTCAACAAGAAGGGCGA
GAAGAACATTCTTGTCTTTGACCTCGGTGGTGGTACTTTTGATGTCACTC
TTCTTACTATCGACGATGGAGTATTCGAAGTGCTTGCCACCAACGGAGAT
ACACATCTTGGTGGTGAAGACTTTGACCAGAGAGTCATGGATTACATGAT
GAAGCTGTTCAAACGCAAGTACGGCAAAGACCTTTCCAAGGATAAGCGTG
CTCTTGCCAAGCTTCGCCGAGAATGTGAGAAGGCCAAGCGCGCTCTTTCT
TCTCAGACTCAGGTGCGAATTGAAATCGAGTCTCTGTATGACGGTCAGGA
CTTCTCTGAGACTCTCACTCGTGCGAGGTTTGAGGAACTCAACTCTGATC
TCTTCAGACGTACTCTGAAGCCGGTGGAGAAGGTGCTCAAGGATGCTGAC
ATGACTAAAGGTCAGGTTCATGAAGTTGTGCTTGTTGGTGGATCTACTCG
TATCCCGAAGGTGCAGCAGCTTGTCAGCAACTTCTTTAACGGAAAGGCCC
CCAGCAAGGGTATCAACCCAGATGAGGCTGTTGCATATGGAGCTGCTGTT
CAGGCCGGTATTCTGTCTGGTGATGGTGGTGAGACTACGGACAACATTGT
GTTGGTTGACGTTGCGCCTCTTTCACTTGGTATTGAGACAGTGGGTGGTG
TGATGAGCAAGATCATCCCGCGTAACTCCAAGGTCCCGGCCAGTAAGAGT
CAGACTTTCACCACTTACCAGGATAACCAGGAAGTTGTAAGTATCCAGGT
GTACGAGGGTGAGCGCACGATGACCAAGGACTGCCACATGCTTGGCAAGT
TCGATCTGAGTGGCATCCGAAAGGCGCGACGAGGTGATCCGCAAATTCTT
GTGACATTTGATGTTGATGCGAACGGTATCCTGAGTGTGTCTGCTGAGGA
GAAGGGTGCATCCAACAAGGAAAGTATTACTATCACTAACGATAAGGGTA
GACTTTCTGAGGAAGAAATCGAGCGAATGGTTCGTgaagcagaggagatg
aaggatgaggatgagaagatcaagaagaaggttgaggCGAAGAACAACCT
TGAAAACTTCATCTTCACTGTGAAGGGCACCCTTGAAGAGAAGGACAAGT
TAGAAGGAAAGCTGGACGAGGAAGACATCGAAGCGCTGGAATCTGCGGTG
AAGGAAGCGCAGGAATGGATGGACACGGAGGCTGAGGACGCTGACGCTGA
GGACATCGAGTCGCGGTTGAACGACATGAAGGAGGTGGTTGAACCAATAA
TGAAGAAGGTTGGTGGTGGTCCCGGCGGCGCTGGTGGTGCCCCTgaggaa
gaggacgacgacgatgatgacgcccacgaagaATTGTAG
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protein sequence of Ggra3715.t1

>Ggra3715.t1 ID=Ggra3715.t1|Name=Ggra3715.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=polypeptide|length=663bp
MSVSSYKRQSAFFLLFASLIVACTASTENVGTVIGIDLGTTYSCVGVMQN
GQVEIIANDQGNRITPSYVAFTSEERLIGDAAKNQAAMNPVNTVFDVKRL
IGRKYTDATVQRDKKLLPFKIVSQGDKPMISIDVKGEKKTFSPEQISAMV
LGKMKKTAEEYLGREVKNAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRII
NEPTAAAIAYGLNKKGEKNILVFDLGGGTFDVTLLTIDDGVFEVLATNGD
THLGGEDFDQRVMDYMMKLFKRKYGKDLSKDKRALAKLRRECEKAKRALS
SQTQVRIEIESLYDGQDFSETLTRARFEELNSDLFRRTLKPVEKVLKDAD
MTKGQVHEVVLVGGSTRIPKVQQLVSNFFNGKAPSKGINPDEAVAYGAAV
QAGILSGDGGETTDNIVLVDVAPLSLGIETVGGVMSKIIPRNSKVPASKS
QTFTTYQDNQEVVSIQVYEGERTMTKDCHMLGKFDLSGIRKARRGDPQIL
VTFDVDANGILSVSAEEKGASNKESITITNDKGRLSEEEIERMVREAEEM
KDEDEKIKKKVEAKNNLENFIFTVKGTLEEKDKLEGKLDEEDIEALESAV
KEAQEWMDTEAEDADAEDIESRLNDMKEVVEPIMKKVGGGPGGAGGAPEE
EDDDDDDAHEEL*
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mRNA from alignment at tig00000850_pilon:1181446..1183434+

Legend: start_codonpolypeptideCDSexonstop_codon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Ggra3715.t1 ID=Ggra3715.t1|Name=Ggra3715.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=mRNA|length=1989bp|location=Sequence derived from alignment at tig00000850_pilon:1181446..1183434+ (Gracilaria gracilis GNS1m male)
ATGTCCGTCTCTTCTTACAAACGCCAATCGGCGTTCTTTTTGTTATTCGC
GTCCCTCATCGTCGCCTGCACCGCTAGTACGGAGAATGTGGGCACCGTTA
TTGGAATTGATCTCGGAACCACTTACTCTTGTGTCGGAGTTATGCAAAAC
GGCCAGGTTGAGATAATCGCCAATGATCAGGGAAACCGAATCACTCCTTC
ATACGTGGCCTTCACTTCTGAAGAGCGACTGATTGGAGATGCCGCTAAGA
ATCAAGCCGCCATGAACCCCGTCAACACGGTGTTCGATGTGAAGCGTCTC
ATCGGAAGAAAGTACACTGATGCCACTGTTCAGCGCGATAAGAAGCTCTT
GCCCTTCAAGATCGTCAGCCAGGGTGATAAGCCGATGATTTCCATTGACG
TCAAGGGTGAGAAGAAGACATTCTCTCCGGAACAGATTTCCGCCATGGTT
CTCGGAAAGATGAAGAAGACTGCTGAGGAGTATCTTGGTAGAGAAGTTAA
GAACGCTGTGGTTACCGTCCCGGCCTACTTCAATGACGCCCAGAGACAGG
CTACGAAGGATGCTGGTACTATTGCCGGCCTGAATGTCATGCGTATTATC
AACGAACCTACTGCGGCTGCCATTGCGTACGGCCTCAACAAGAAGGGCGA
GAAGAACATTCTTGTCTTTGACCTCGGTGGTGGTACTTTTGATGTCACTC
TTCTTACTATCGACGATGGAGTATTCGAAGTGCTTGCCACCAACGGAGAT
ACACATCTTGGTGGTGAAGACTTTGACCAGAGAGTCATGGATTACATGAT
GAAGCTGTTCAAACGCAAGTACGGCAAAGACCTTTCCAAGGATAAGCGTG
CTCTTGCCAAGCTTCGCCGAGAATGTGAGAAGGCCAAGCGCGCTCTTTCT
TCTCAGACTCAGGTGCGAATTGAAATCGAGTCTCTGTATGACGGTCAGGA
CTTCTCTGAGACTCTCACTCGTGCGAGGTTTGAGGAACTCAACTCTGATC
TCTTCAGACGTACTCTGAAGCCGGTGGAGAAGGTGCTCAAGGATGCTGAC
ATGACTAAAGGTCAGGTTCATGAAGTTGTGCTTGTTGGTGGATCTACTCG
TATCCCGAAGGTGCAGCAGCTTGTCAGCAACTTCTTTAACGGAAAGGCCC
CCAGCAAGGGTATCAACCCAGATGAGGCTGTTGCATATGGAGCTGCTGTT
CAGGCCGGTATTCTGTCTGGTGATGGTGGTGAGACTACGGACAACATTGT
GTTGGTTGACGTTGCGCCTCTTTCACTTGGTATTGAGACAGTGGGTGGTG
TGATGAGCAAGATCATCCCGCGTAACTCCAAGGTCCCGGCCAGTAAGAGT
CAGACTTTCACCACTTACCAGGATAACCAGGAAGTTGTAAGTATCCAGGT
GTACGAGGGTGAGCGCACGATGACCAAGGACTGCCACATGCTTGGCAAGT
TCGATCTGAGTGGCATCCGAAAGGCGCGACGAGGTGATCCGCAAATTCTT
GTGACATTTGATGTTGATGCGAACGGTATCCTGAGTGTGTCTGCTGAGGA
GAAGGGTGCATCCAACAAGGAAAGTATTACTATCACTAACGATAAGGGTA
GACTTTCTGAGGAAGAAATCGAGCGAATGGTTCGTgaagcagaggagatg
aaggatgaggatgagaagatcaagaagaaggttgaggCGAAGAACAACCT
TGAAAACTTCATCTTCACTGTGAAGGGCACCCTTGAAGAGAAGGACAAGT
TAGAAGGAAAGCTGGACGAGGAAGACATCGAAGCGCTGGAATCTGCGGTG
AAGGAAGCGCAGGAATGGATGGACACGGAGGCTGAGGACGCTGACGCTGA
GGACATCGAGTCGCGGTTGAACGACATGAAGGAGGTGGTTGAACCAATAA
TGAAGAAGGTTGGTGGTGGTCCCGGCGGCGCTGGTGGTGCCCCTgaggaa
gaggacgacgacgatgatgacgcccacgaagaATTGTAG
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Coding sequence (CDS) from alignment at tig00000850_pilon:1181446..1183434+

>Ggra3715.t1 ID=Ggra3715.t1|Name=Ggra3715.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=CDS|length=1989bp|location=Sequence derived from alignment at tig00000850_pilon:1181446..1183434+ (Gracilaria gracilis GNS1m male)
ATGTCCGTCTCTTCTTACAAACGCCAATCGGCGTTCTTTTTGTTATTCGC
GTCCCTCATCGTCGCCTGCACCGCTAGTACGGAGAATGTGGGCACCGTTA
TTGGAATTGATCTCGGAACCACTTACTCTTGTGTCGGAGTTATGCAAAAC
GGCCAGGTTGAGATAATCGCCAATGATCAGGGAAACCGAATCACTCCTTC
ATACGTGGCCTTCACTTCTGAAGAGCGACTGATTGGAGATGCCGCTAAGA
ATCAAGCCGCCATGAACCCCGTCAACACGGTGTTCGATGTGAAGCGTCTC
ATCGGAAGAAAGTACACTGATGCCACTGTTCAGCGCGATAAGAAGCTCTT
GCCCTTCAAGATCGTCAGCCAGGGTGATAAGCCGATGATTTCCATTGACG
TCAAGGGTGAGAAGAAGACATTCTCTCCGGAACAGATTTCCGCCATGGTT
CTCGGAAAGATGAAGAAGACTGCTGAGGAGTATCTTGGTAGAGAAGTTAA
GAACGCTGTGGTTACCGTCCCGGCCTACTTCAATGACGCCCAGAGACAGG
CTACGAAGGATGCTGGTACTATTGCCGGCCTGAATGTCATGCGTATTATC
AACGAACCTACTGCGGCTGCCATTGCGTACGGCCTCAACAAGAAGGGCGA
GAAGAACATTCTTGTCTTTGACCTCGGTGGTGGTACTTTTGATGTCACTC
TTCTTACTATCGACGATGGAGTATTCGAAGTGCTTGCCACCAACGGAGAT
ACACATCTTGGTGGTGAAGACTTTGACCAGAGAGTCATGGATTACATGAT
GAAGCTGTTCAAACGCAAGTACGGCAAAGACCTTTCCAAGGATAAGCGTG
CTCTTGCCAAGCTTCGCCGAGAATGTGAGAAGGCCAAGCGCGCTCTTTCT
TCTCAGACTCAGGTGCGAATTGAAATCGAGTCTCTGTATGACGGTCAGGA
CTTCTCTGAGACTCTCACTCGTGCGAGGTTTGAGGAACTCAACTCTGATC
TCTTCAGACGTACTCTGAAGCCGGTGGAGAAGGTGCTCAAGGATGCTGAC
ATGACTAAAGGTCAGGTTCATGAAGTTGTGCTTGTTGGTGGATCTACTCG
TATCCCGAAGGTGCAGCAGCTTGTCAGCAACTTCTTTAACGGAAAGGCCC
CCAGCAAGGGTATCAACCCAGATGAGGCTGTTGCATATGGAGCTGCTGTT
CAGGCCGGTATTCTGTCTGGTGATGGTGGTGAGACTACGGACAACATTGT
GTTGGTTGACGTTGCGCCTCTTTCACTTGGTATTGAGACAGTGGGTGGTG
TGATGAGCAAGATCATCCCGCGTAACTCCAAGGTCCCGGCCAGTAAGAGT
CAGACTTTCACCACTTACCAGGATAACCAGGAAGTTGTAAGTATCCAGGT
GTACGAGGGTGAGCGCACGATGACCAAGGACTGCCACATGCTTGGCAAGT
TCGATCTGAGTGGCATCCGAAAGGCGCGACGAGGTGATCCGCAAATTCTT
GTGACATTTGATGTTGATGCGAACGGTATCCTGAGTGTGTCTGCTGAGGA
GAAGGGTGCATCCAACAAGGAAAGTATTACTATCACTAACGATAAGGGTA
GACTTTCTGAGGAAGAAATCGAGCGAATGGTTCGTgaagcagaggagatg
aaggatgaggatgagaagatcaagaagaaggttgaggCGAAGAACAACCT
TGAAAACTTCATCTTCACTGTGAAGGGCACCCTTGAAGAGAAGGACAAGT
TAGAAGGAAAGCTGGACGAGGAAGACATCGAAGCGCTGGAATCTGCGGTG
AAGGAAGCGCAGGAATGGATGGACACGGAGGCTGAGGACGCTGACGCTGA
GGACATCGAGTCGCGGTTGAACGACATGAAGGAGGTGGTTGAACCAATAA
TGAAGAAGGTTGGTGGTGGTCCCGGCGGCGCTGGTGGTGCCCCTgaggaa
gaggacgacgacgatgatgacgcccacgaagaATTGTAG
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