Ggra1929.t1 (mRNA) Gracilaria gracilis GNS1m male

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Overview
NameGgra1929.t1
Unique NameGgra1929.t1
TypemRNA
OrganismGracilaria gracilis GNS1m male (Gracilaria gracilis GNS1m male (Slender Wart Weed))
Sequence length328
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
tig00000632_piloncontigtig00000632_pilon:4347..6506 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Gracilaria gracilis GNS1m male OGS1.02022-05-09
Properties
Property NameValue
Seed ortholog6412.HelroP104176
Preferred nameMYO6
PFAMsIQ,Myosin-VI_CBD,Myosin_N,Myosin_head
Max annot lvl33208|Metazoa
KEGG koko:K10358
GOsGO:0000003,GO:0000139,GO:0000146,GO:0000166,GO:0000226,GO:0000278,GO:0000323,GO:0000428,GO:0001667,GO:0001700,GO:0001709,GO:0001726,GO:0002009,GO:0002064,GO:0002065,GO:0002066,GO:0002164,GO:0002165,GO:0002168,GO:0003006,GO:0003008,GO:0003674,GO:0003774,GO:0003779,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005516,GO:0005575,GO:0005576,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005635,GO:0005654,GO:0005737,GO:0005764,GO:0005765,GO:0005773,GO:0005774,GO:0005794,GO:0005802,GO:0005829,GO:0005856,GO:0005875,GO:0005884,GO:0005886,GO:0005902,GO:0005903,GO:0005905,GO:0005938,GO:0006355,GO:0006357,GO:0006605,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006820,GO:0006835,GO:0006865,GO:0006886,GO:0006897,GO:0006928,GO:0006950,GO:0006974,GO:0006996,GO:0006997,GO:0007010,GO:0007015,GO:0007017,GO:0007018,GO:0007049,GO:0007051,GO:0007154,GO:0007165,GO:0007267,GO:0007268,GO:0007275,GO:0007276,GO:0007281,GO:0007283,GO:0007286,GO:0007291,GO:0007292,GO:0007297,GO:0007298,GO:0007300,GO:0007303,GO:0007349,GO:0007391,GO:0007399,GO:0007405,GO:0007416,GO:0007423,GO:0007444,GO:0007552,GO:0007560,GO:0007591,GO:0007600,GO:0007605,GO:0007610,GO:0007626,GO:0008017,GO:0008092,GO:0008104,GO:0008150,GO:0008283,GO:0008356,GO:0008363,GO:0008544,GO:0009628,GO:0009653,GO:0009790,GO:0009791,GO:0009792,GO:0009886,GO:0009887,GO:0009888,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0009913,GO:0009987,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010604,GO:0010628,GO:0010631,GO:0010646,GO:0010970,GO:0012505,GO:0012506,GO:0014047,GO:0015031,GO:0015629,GO:0015630,GO:0015631,GO:0015711,GO:0015800,GO:0015833,GO:0015849,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016192,GO:0016331,GO:0016333,GO:0016358,GO:0016459,GO:0016461,GO:0016462,GO:0016477,GO:0016482,GO:0016591,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017022,GO:0017076,GO:0017111,GO:0017145,GO:0017157,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019749,GO:0019953,GO:0022008,GO:0022402,GO:0022412,GO:0022414,GO:0022607,GO:0023051,GO:0023052,GO:0030029,GO:0030030,GO:0030036,GO:0030048,GO:0030135,GO:0030136,GO:0030139,GO:0030154,GO:0030175,GO:0030182,GO:0030317,GO:0030330,GO:0030424,GO:0030426,GO:0030427,GO:0030554,GO:0030588,GO:0030589,GO:0030659,GO:0030662,GO:0030665,GO:0030705,GO:0030707,GO:0030855,GO:0030880,GO:0031090,GO:0031175,GO:0031252,GO:0031253,GO:0031256,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0031410,GO:0031476,GO:0031941,GO:0031965,GO:0031967,GO:0031974,GO:0031975,GO:0031981,GO:0031982,GO:0031984,GO:0032027,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032504,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032587,GO:0032588,GO:0032879,GO:0032880,GO:0032940,GO:0032956,GO:0032970,GO:0032991,GO:0033036,GO:0033043,GO:0033267,GO:0033554,GO:0034330,GO:0034331,GO:0034613,GO:0034643,GO:0035239,GO:0035295,GO:0035315,GO:0035556,GO:0036094,GO:0036445,GO:0036477,GO:0040001,GO:0040003,GO:0040011,GO:0042221,GO:0042303,GO:0042335,GO:0042337,GO:0042471,GO:0042472,GO:0042490,GO:0042491,GO:0042493,GO:0042623,GO:0042770,GO:0042802,GO:0042886,GO:0042995,GO:0043005,GO:0043025,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043233,GO:0043531,GO:0043583,GO:0043954,GO:0044085,GO:0044297,GO:0044421,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044428,GO:0044430,GO:0044431,GO:0044433,GO:0044437,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044451,GO:0044459,GO:0044463,GO:0044464,GO:0044703,GO:0044877,GO:0045165,GO:0045167,GO:0045171,GO:0045172,GO:0045175,GO:0045177,GO:0045178,GO:0045184,GO:0045202,GO:0045216,GO:0045217,GO:0045893,GO:0045921,GO:0045935,GO:0045944,GO:0046717,GO:0046903,GO:0046907,GO:0046942,GO:0047497,GO:0048103,GO:0048167,GO:0048232,GO:0048468,GO:0048471,GO:0048477,GO:0048513,GO:0048515,GO:0048518,GO:0048522,GO:0048562,GO:0048563,GO:0048568,GO:0048569,GO:0048598,GO:0048609,GO:0048646,GO:0048666,GO:0048699,GO:0048707,GO:0048729,GO:0048731,GO:0048839,GO:0048856,GO:0048869,GO:0048870,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050804,GO:0050808,GO:0050877,GO:0050896,GO:0050954,GO:0051015,GO:0051046,GO:0051047,GO:0051049,GO:0051050,GO:0051128,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051252,GO:0051254,GO:0051293,GO:0051301,GO:0051493,GO:0051602,GO:0051640,GO:0051641,GO:0051646,GO:0051647,GO:0051649,GO:0051653,GO:0051654,GO:0051656,GO:0051674,GO:0051704,GO:0051716,GO:0055029,GO:0055057,GO:0055059,GO:0060001,GO:0060002,GO:0060113,GO:0060255,GO:0060429,GO:0060562,GO:0060563,GO:0060627,GO:0061024,GO:0061351,GO:0061695,GO:0065007,GO:0065008,GO:0070013,GO:0070727,GO:0070853,GO:0070856,GO:0070864,GO:0070865,GO:0071214,GO:0071257,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071840,GO:0071944,GO:0072089,GO:0072331,GO:0072384,GO:0080090,GO:0090130,GO:0090132,GO:0090596,GO:0097159,GO:0097367,GO:0097435,GO:0097458,GO:0097708,GO:0097722,GO:0098588,GO:0098590,GO:0098657,GO:0098722,GO:0098791,GO:0098805,GO:0098852,GO:0098858,GO:0098862,GO:0098916,GO:0099080,GO:0099081,GO:0099111,GO:0099177,GO:0099512,GO:0099513,GO:0099536,GO:0099537,GO:0099568,GO:0104004,GO:0120025,GO:0120036,GO:0120038,GO:0150034,GO:1901265,GO:1901363,GO:1902494,GO:1902680,GO:1902850,GO:1903047,GO:1903506,GO:1903508,GO:1903530,GO:1903532,GO:1990234,GO:2000112,GO:2001141
Evalue1.6e-113
EggNOG OGsCOG5022@1|root,KOG0163@2759|Eukaryota,38FVA@33154|Opisthokonta,3BAMV@33208|Metazoa,3CW69@33213|Bilateria
Descriptionmotor activity
COG categoryZ
BRITEko00000,ko04131,ko04147,ko04812
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra1929Ggra1929Gracilaria gracilis GNS1m malegenetig00000632_pilon 4347..6506 +


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra1929.t1Ggra1929.t1Gracilaria gracilis GNS1m malepolypeptidetig00000632_pilon 4347..6506 +


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra1929.t1.CDS1Ggra1929.t1.CDS1Gracilaria gracilis GNS1m maleCDStig00000632_pilon 4347..4454 +
Ggra1929.t1.CDS2Ggra1929.t1.CDS2Gracilaria gracilis GNS1m maleCDStig00000632_pilon 4549..4659 +
Ggra1929.t1.CDS3Ggra1929.t1.CDS3Gracilaria gracilis GNS1m maleCDStig00000632_pilon 5477..5548 +
Ggra1929.t1.CDS4Ggra1929.t1.CDS4Gracilaria gracilis GNS1m maleCDStig00000632_pilon 5814..6506 +


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra1929.t1.exon1Ggra1929.t1.exon1Gracilaria gracilis GNS1m maleexontig00000632_pilon 4347..4454 +
Ggra1929.t1.exon2Ggra1929.t1.exon2Gracilaria gracilis GNS1m maleexontig00000632_pilon 4549..4659 +
Ggra1929.t1.exon3Ggra1929.t1.exon3Gracilaria gracilis GNS1m maleexontig00000632_pilon 5477..5548 +
Ggra1929.t1.exon4Ggra1929.t1.exon4Gracilaria gracilis GNS1m maleexontig00000632_pilon 5814..6506 +


The following intron feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra1929.t1.intron1Ggra1929.t1.intron1Gracilaria gracilis GNS1m maleintrontig00000632_pilon 4455..4548 +
Ggra1929.t1.intron2Ggra1929.t1.intron2Gracilaria gracilis GNS1m maleintrontig00000632_pilon 4660..5476 +
Ggra1929.t1.intron3Ggra1929.t1.intron3Gracilaria gracilis GNS1m maleintrontig00000632_pilon 5549..5813 +


The following stop_codon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra1929.t1.stop1Ggra1929.t1.stop1Gracilaria gracilis GNS1m malestop_codontig00000632_pilon 6504..6506 +


Sequences
The following sequences are available for this feature:

mRNA sequence

>Ggra1929.t1 ID=Ggra1929.t1|Name=Ggra1929.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=mRNA|length=328bp
DIPAEEYDNKDVEDNCSLMYLNEATLLNNLRIRYKKDAIYTYVANILIAV
NPYKDVSHLYGTKAIKSYQANPLYLNRGNTQFFSTNSNLASNRKSQQFLK
SGSLNDPVMNDITDFAVTDKALSSMGMDDQTRTSIYTVVAGILHLGNVSF
EDDHDDKKGGCKVTAETEHFLQNAAKYLGVDGKDLKSELTSRVMHSAKAG
KTGTVIKVPLRQSEANNARDALAKFVYGKLFDYIVKCVNQALPFQNSQNY
IGVLDIAGFEYFQVNSFEQFCINYCNEKLQQFFNERILKEEQILYEKEGL
NVKKIHYIDNQDCIDLIEKKSIGIFDV*
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spliced messenger RNA

>Ggra1929.t1 ID=Ggra1929.t1|Name=Ggra1929.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=mRNA|length=984bp|location=Sequence derived from alignment at tig00000632_pilon:4347..6506+ (Gracilaria gracilis GNS1m male)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.  
GATATTCCGGCTGAAGAATACGATAACAAGGATGTTGAAGACAATTGCAG
TTTAATGTACCTGAATGAAGCTACACTGCTAAATAATTTACGGATTCGCT
ACAAGAAGGATGCTATCTATACATATGTTGCCAACATATTAATTGCTGTT
AATCCATACAAGGATGTGTCGCACTTGTATGGGACCAAGGCTATTAAGTC
CTATCAGGCAAATCCCTTGTATCTGAATCGTGGGAACACTCAATTCTTTT
CTACAAACTCGAATTTGGCATCGAATAGGAAGAGTCAACAGTTCCTCAAA
TCTGGAAGCTTGAATGATCCTGTGATGAACGATATTACTGATTTTGCAGT
CACTGATAAAGCCTTATCGTCTATGGGTATGGATGATCAAACTAGAACTT
CAATATATACGGTTGTCGCTGGTATTCTTCACCTTGGAAATGTTTCGTTC
GAAGATGATCACGATGATAAGAAAGGTGGTTGTAAAGTTACCGCAGAAAC
TGAACACTTCTTACAAAATGCAGCTAAATATTTGGGCGTCGATGGGAAAG
ATCTTAAATCTGAATTAACGTCAAGAGTTATGCATTCGGCTAAGGCCGGT
AAAACTGGAACTGTGATAAAAGTTCCACTTCGTCAGAGCGAAGCAAACAA
CGCAAGAGATGCTTTGGCTAAGTTTGTTTACGGAAAGTTATTCGATTATA
TCGTAAAATGCGTTAATCAAGCATTACCATTTCAAAATTCTCAAAACTAT
ATTGGTGTTCTGGATATTGCTGGATTTGAATATTTTCAAGTAAACAGTTT
TGAACAGTTTTGTATCAATTATTGTAATGAAAAATTACAACAATTCTTTA
ACGAGAGAATATTGAAAGAAGAGCAAATTTTATACGAAAAAGAAGGTTTA
AATGTGAAGAAAATCCATTATATCGATAATCAGGATTGCATCGATCTCAT
TGAAAAAAAATCGATTGGTATTTTTGATGTTTAG
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protein sequence of Ggra1929.t1

>Ggra1929.t1 ID=Ggra1929.t1|Name=Ggra1929.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=polypeptide|length=328bp
DIPAEEYDNKDVEDNCSLMYLNEATLLNNLRIRYKKDAIYTYVANILIAV
NPYKDVSHLYGTKAIKSYQANPLYLNRGNTQFFSTNSNLASNRKSQQFLK
SGSLNDPVMNDITDFAVTDKALSSMGMDDQTRTSIYTVVAGILHLGNVSF
EDDHDDKKGGCKVTAETEHFLQNAAKYLGVDGKDLKSELTSRVMHSAKAG
KTGTVIKVPLRQSEANNARDALAKFVYGKLFDYIVKCVNQALPFQNSQNY
IGVLDIAGFEYFQVNSFEQFCINYCNEKLQQFFNERILKEEQILYEKEGL
NVKKIHYIDNQDCIDLIEKKSIGIFDV*
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mRNA from alignment at tig00000632_pilon:4347..6506+

Legend: polypeptideCDSexonintronstop_codon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Ggra1929.t1 ID=Ggra1929.t1|Name=Ggra1929.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=mRNA|length=2160bp|location=Sequence derived from alignment at tig00000632_pilon:4347..6506+ (Gracilaria gracilis GNS1m male)
GATATTCCGGCTGAAGAATACGATAACAAGGATGTTGAAGACAATTGCAG
TTTAATGTACCTGAATGAAGCTACACTGCTAAATAATTTACGGATTCGCT
ACAAGAAGGTTTTAAGCCTATAATTGCATTCATTAATATTCCAAACGTTT
CGTTGTAACATATTCTAAAACGAAAATTTTATTTTTTCGCCTTTGCGTAC
AGGATGCTATCTATACATATGTTGCCAACATATTAATTGCTGTTAATCCA
TACAAGGATGTGTCGCACTTGTATGGGACCAAGGCTATTAAGTCCTATCA
GGCAAATCCCTTGGTACTGTGCCGCCTCACGTCTATGCTATTGCCGACAA
AGCTTATCGCGATATGAAAACTTTAAGAGCAAGTCAAGCGATAATTGTAT
CAGGAGAATCAGGTGCGGGAAAAACTGAATCAACAAAATACATATTAAAA
TATCTCACTGAATCATGGGGTACTCACGCCGGACCAATCGAGGATAGAAT
AAATGAATCAAATCCATTGCTAGAAGCTTTTGGTAACGCTAAAACGGTCC
GCAACAATAATTCATCAAGATTTGGAAAATTTGTCGAAATTCACTTTGAT
AAGAAGATGCTTGTAGCTGGCGGTTATATTTCGCATTACCTATTAGAAAA
GAGTAGAATTTGTACACAGGGTCCTGAAGAGAGAAATTATCATATTTTTT
ATAGAATGTGTGCAGGAGCTCCGGAGAATTTATACAATGCTCTTCAATTA
GCTGCACCAGATCAATTTAGGGTAAGTAATAAAGTAAAAAATATACAGCT
TATAGTATATACAATTTACTGatatatatagatatatagatataaatata
tatttatatatatatatatatataGCGTATATTGTATGATAGAACGATGA
ACTTTCCATCAAAAGGAACTAAACTTGATGACAAAAAAAAATTTGAACAA
GCTATTTACTTCTTTTCTTATTTTCTCTTGAACGGTGTTCAAAAAGAAAA
ACGAGAAAAGTTTTTAAATGAAAACACAGCATGATAAAAAAACTATTAGA
TTTTTTGACTTTTTTATCGTCTAAAGCTATATCTTCTCTGCATGATTATT
ATTATTGTTTTGTCGTGATGTGCACAACAGTATCTGAATCGTGGGAACAC
TCAATTCTTTTCTACAAACTCGAATTTGGCATCGAATAGGAAGAGTCAAC
AGGTATGTAAATGGTTTTTCTATTGGATTGAGAGTAAAAAAACAGGGAAC
AAAAGAAAAAAATAATGCTTCTGTTTAACTATTTTTACGATGATAAGCTC
CGAGTTAttctttgttctttgtattctttttttgtacctttttgtttagt
ttgtttttgattttggttttttttttatctgattgAACATTAAAACAGTA
TAATTTTTTAAGAAAACCGGATTGAACAGTTGTACAGTTGTTAATTTAAT
TTCAAATATCCTTTTAGTTCCTCAAATCTGGAAGCTTGAATGATCCTGTG
ATGAACGATATTACTGATTTTGCAGTCACTGATAAAGCCTTATCGTCTAT
GGGTATGGATGATCAAACTAGAACTTCAATATATACGGTTGTCGCTGGTA
TTCTTCACCTTGGAAATGTTTCGTTCGAAGATGATCACGATGATAAGAAA
GGTGGTTGTAAAGTTACCGCAGAAACTGAACACTTCTTACAAAATGCAGC
TAAATATTTGGGCGTCGATGGGAAAGATCTTAAATCTGAATTAACGTCAA
GAGTTATGCATTCGGCTAAGGCCGGTAAAACTGGAACTGTGATAAAAGTT
CCACTTCGTCAGAGCGAAGCAAACAACGCAAGAGATGCTTTGGCTAAGTT
TGTTTACGGAAAGTTATTCGATTATATCGTAAAATGCGTTAATCAAGCAT
TACCATTTCAAAATTCTCAAAACTATATTGGTGTTCTGGATATTGCTGGA
TTTGAATATTTTCAAGTAAACAGTTTTGAACAGTTTTGTATCAATTATTG
TAATGAAAAATTACAACAATTCTTTAACGAGAGAATATTGAAAGAAGAGC
AAATTTTATACGAAAAAGAAGGTTTAAATGTGAAGAAAATCCATTATATC
GATAATCAGGATTGCATCGATCTCATTGAAAAAAAATCGATTGGTATTTT
TGATGTTTAG
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Coding sequence (CDS) from alignment at tig00000632_pilon:4347..6506+

>Ggra1929.t1 ID=Ggra1929.t1|Name=Ggra1929.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=CDS|length=984bp|location=Sequence derived from alignment at tig00000632_pilon:4347..6506+ (Gracilaria gracilis GNS1m male)
GATATTCCGGCTGAAGAATACGATAACAAGGATGTTGAAGACAATTGCAG
TTTAATGTACCTGAATGAAGCTACACTGCTAAATAATTTACGGATTCGCT
ACAAGAAGGATGCTATCTATACATATGTTGCCAACATATTAATTGCTGTT
AATCCATACAAGGATGTGTCGCACTTGTATGGGACCAAGGCTATTAAGTC
CTATCAGGCAAATCCCTTGTATCTGAATCGTGGGAACACTCAATTCTTTT
CTACAAACTCGAATTTGGCATCGAATAGGAAGAGTCAACAGTTCCTCAAA
TCTGGAAGCTTGAATGATCCTGTGATGAACGATATTACTGATTTTGCAGT
CACTGATAAAGCCTTATCGTCTATGGGTATGGATGATCAAACTAGAACTT
CAATATATACGGTTGTCGCTGGTATTCTTCACCTTGGAAATGTTTCGTTC
GAAGATGATCACGATGATAAGAAAGGTGGTTGTAAAGTTACCGCAGAAAC
TGAACACTTCTTACAAAATGCAGCTAAATATTTGGGCGTCGATGGGAAAG
ATCTTAAATCTGAATTAACGTCAAGAGTTATGCATTCGGCTAAGGCCGGT
AAAACTGGAACTGTGATAAAAGTTCCACTTCGTCAGAGCGAAGCAAACAA
CGCAAGAGATGCTTTGGCTAAGTTTGTTTACGGAAAGTTATTCGATTATA
TCGTAAAATGCGTTAATCAAGCATTACCATTTCAAAATTCTCAAAACTAT
ATTGGTGTTCTGGATATTGCTGGATTTGAATATTTTCAAGTAAACAGTTT
TGAACAGTTTTGTATCAATTATTGTAATGAAAAATTACAACAATTCTTTA
ACGAGAGAATATTGAAAGAAGAGCAAATTTTATACGAAAAAGAAGGTTTA
AATGTGAAGAAAATCCATTATATCGATAATCAGGATTGCATCGATCTCAT
TGAAAAAAAATCGATTGGTATTTTTGATGTTTAG
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