Ggra10620.t1 (mRNA) Gracilaria gracilis GNS1m male

You are viewing an mRNA, more information available on the corresponding polypeptide page

Overview
NameGgra10620.t1
Unique NameGgra10620.t1
TypemRNA
OrganismGracilaria gracilis GNS1m male (Gracilaria gracilis GNS1m male (Slender Wart Weed))
Sequence length399
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
tig00000904_piloncontigtig00000904_pilon:402960..404156 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Gracilaria gracilis GNS1m male OGS1.02022-05-09
Properties
Property NameValue
Seed ortholog7994.ENSAMXP00000005621
Preferred nameGSK3B
PFAMsPkinase
Max annot lvl33208|Metazoa
KEGG koko:K03083,ko:K08822
KEGG Pathwayko01521,ko04012,ko04062,ko04110,ko04150,ko04151,ko04310,ko04340,ko04341,ko04360,ko04390,ko04510,ko04550,ko04657,ko04660,ko04662,ko04711,ko04722,ko04728,ko04910,ko04916,ko04917,ko04919,ko04931,ko04932,ko04934,ko05010,ko05160,ko05162,ko05164,ko05165,ko05166,ko05167,ko05169,ko05200,ko05210,ko05213,ko05215,ko05217,ko05224,ko05225,ko05226,map01521,map04012,map04062,map04110,map04150,map04151,map04310,map04340,map04341,map04360,map04390,map04510,map04550,map04657,map04660,map04662,map04711,map04722,map04728,map04910,map04916,map04917,map04919,map04931,map04932,map04934,map05010,map05160,map05162,map05164,map05165,map05166,map05167,map05169,map05200,map05210,map05213,map05215,map05217,map05224,map05225,map05226
KEGG ModuleM00677
GOsGO:0000003,GO:0000132,GO:0000166,GO:0000226,GO:0000278,GO:0000280,GO:0000302,GO:0000320,GO:0000768,GO:0000902,GO:0000904,GO:0001085,GO:0001101,GO:0001558,GO:0001700,GO:0001837,GO:0001932,GO:0001933,GO:0001934,GO:0001952,GO:0001954,GO:0002009,GO:0002020,GO:0002039,GO:0002064,GO:0002065,GO:0002066,GO:0002164,GO:0002165,GO:0002168,GO:0002682,GO:0003002,GO:0003006,GO:0003008,GO:0003382,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004672,GO:0004674,GO:0005102,GO:0005178,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005576,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005737,GO:0005739,GO:0005813,GO:0005815,GO:0005819,GO:0005829,GO:0005856,GO:0005874,GO:0005886,GO:0005975,GO:0005976,GO:0005977,GO:0005979,GO:0006073,GO:0006091,GO:0006109,GO:0006112,GO:0006139,GO:0006349,GO:0006355,GO:0006357,GO:0006464,GO:0006468,GO:0006469,GO:0006611,GO:0006725,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006810,GO:0006839,GO:0006886,GO:0006897,GO:0006909,GO:0006911,GO:0006913,GO:0006915,GO:0006928,GO:0006949,GO:0006950,GO:0006979,GO:0006983,GO:0006984,GO:0006996,GO:0007005,GO:0007006,GO:0007010,GO:0007017,GO:0007049,GO:0007051,GO:0007088,GO:0007143,GO:0007154,GO:0007163,GO:0007165,GO:0007166,GO:0007167,GO:0007169,GO:0007186,GO:0007212,GO:0007267,GO:0007268,GO:0007275,GO:0007276,GO:0007281,GO:0007292,GO:0007346,GO:0007350,GO:0007365,GO:0007367,GO:0007389,GO:0007399,GO:0007409,GO:0007416,GO:0007417,GO:0007420,GO:0007423,GO:0007444,GO:0007472,GO:0007476,GO:0007507,GO:0007520,GO:0007528,GO:0007552,GO:0007560,GO:0007568,GO:0007584,GO:0007591,GO:0007610,GO:0007611,GO:0007612,GO:0007622,GO:0007623,GO:0007626,GO:0007635,GO:0008013,GO:0008092,GO:0008104,GO:0008134,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008219,GO:0008283,GO:0008284,GO:0008286,GO:0008306,GO:0008355,GO:0008361,GO:0008363,GO:0008407,GO:0008582,GO:0008587,GO:0008589,GO:0009605,GO:0009607,GO:0009612,GO:0009628,GO:0009636,GO:0009649,GO:0009653,GO:0009719,GO:0009725,GO:0009790,GO:0009791,GO:0009792,GO:0009798,GO:0009880,GO:0009886,GO:0009887,GO:0009888,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009891,GO:0009892,GO:0009893,GO:0009894,GO:0009896,GO:0009966,GO:0009967,GO:0009968,GO:0009987,GO:0009991,GO:0010033,GO:0010035,GO:0010038,GO:0010039,GO:0010040,GO:0010226,GO:0010243,GO:0010324,GO:0010468,GO:0010506,GO:0010508,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010558,GO:0010562,GO:0010563,GO:0010564,GO:0010604,GO:0010605,GO:0010611,GO:0010614,GO:0010628,GO:0010638,GO:0010646,GO:0010647,GO:0010648,GO:0010656,GO:0010660,GO:0010675,GO:0010677,GO:0010720,GO:0010721,GO:0010769,GO:0010770,GO:0010771,GO:0010799,GO:0010800,GO:0010810,GO:0010811,GO:0010821,GO:0010822,GO:0010906,GO:0010918,GO:0010921,GO:0010923,GO:0010941,GO:0010942,GO:0010962,GO:0010965,GO:0010975,GO:0010976,GO:0010977,GO:0012501,GO:0014041,GO:0014043,GO:0014069,GO:0014070,GO:0014741,GO:0014743,GO:0014823,GO:0014902,GO:0015031,GO:0015630,GO:0015833,GO:0015980,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016055,GO:0016192,GO:0016202,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016477,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0017076,GO:0018105,GO:0018107,GO:0018193,GO:0018209,GO:0018210,GO:0019219,GO:0019220,GO:0019222,GO:0019538,GO:0019827,GO:0019899,GO:0019900,GO:0019901,GO:0019953,GO:0021537,GO:0021543,GO:0021761,GO:0021766,GO:0021987,GO:0022008,GO:0022402,GO:0022411,GO:0022412,GO:0022414,GO:0022416,GO:0022603,GO:0022604,GO:0022607,GO:0023051,GO:0023052,GO:0023056,GO:0023057,GO:0030010,GO:0030011,GO:0030030,GO:0030071,GO:0030100,GO:0030111,GO:0030154,GO:0030155,GO:0030162,GO:0030178,GO:0030182,GO:0030307,GO:0030334,GO:0030335,GO:0030336,GO:0030424,GO:0030425,GO:0030426,GO:0030427,GO:0030516,GO:0030554,GO:0030588,GO:0030589,GO:0030707,GO:0030855,GO:0030856,GO:0030857,GO:0030877,GO:0030900,GO:0031175,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031328,GO:0031329,GO:0031331,GO:0031333,GO:0031334,GO:0031344,GO:0031345,GO:0031346,GO:0031399,GO:0031400,GO:0031401,GO:0031594,GO:0031625,GO:0031644,GO:0031646,GO:0031667,GO:0031974,GO:0031981,GO:0032006,GO:0032007,GO:0032091,GO:0032092,GO:0032268,GO:0032269,GO:0032270,GO:0032279,GO:0032355,GO:0032386,GO:0032388,GO:0032434,GO:0032436,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032504,GO:0032515,GO:0032535,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032768,GO:0032769,GO:0032868,GO:0032869,GO:0032870,GO:0032872,GO:0032873,GO:0032879,GO:0032880,GO:0032881,GO:0032885,GO:0032886,GO:0032984,GO:0032989,GO:0032990,GO:0032991,GO:0033036,GO:0033043,GO:0033044,GO:0033045,GO:0033047,GO:0033135,GO:0033138,GO:0033157,GO:0033267,GO:0033365,GO:0033554,GO:0033673,GO:0033993,GO:0034097,GO:0034236,GO:0034391,GO:0034392,GO:0034452,GO:0034599,GO:0034613,GO:0034614,GO:0034641,GO:0034976,GO:0035017,GO:0035019,GO:0035107,GO:0035114,GO:0035120,GO:0035220,GO:0035239,GO:0035254,GO:0035255,GO:0035282,GO:0035293,GO:0035295,GO:0035303,GO:0035304,GO:0035305,GO:0035308,GO:0035309,GO:0035324,GO:0035372,GO:0035556,GO:0035567,GO:0035639,GO:0035690,GO:0035728,GO:0035729,GO:0036015,GO:0036016,GO:0036017,GO:0036018,GO:0036094,GO:0036211,GO:0036477,GO:0038034,GO:0040001,GO:0040003,GO:0040007,GO:0040008,GO:0040011,GO:0040012,GO:0040013,GO:0040017,GO:0040029,GO:0042048,GO:0042127,GO:0042176,GO:0042221,GO:0042303,GO:0042306,GO:0042325,GO:0042326,GO:0042327,GO:0042335,GO:0042337,GO:0042391,GO:0042493,GO:0042542,GO:0042692,GO:0042752,GO:0042886,GO:0042981,GO:0042995,GO:0043005,GO:0043025,GO:0043065,GO:0043066,GO:0043067,GO:0043068,GO:0043069,GO:0043085,GO:0043086,GO:0043087,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043197,GO:0043198,GO:0043200,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043233,GO:0043254,GO:0043255,GO:0043277,GO:0043393,GO:0043405,GO:0043407,GO:0043408,GO:0043409,GO:0043412,GO:0043434,GO:0043467,GO:0043502,GO:0043506,GO:0043508,GO:0043523,GO:0043525,GO:0043547,GO:0043549,GO:0043652,GO:0043666,GO:0043933,GO:0044026,GO:0044027,GO:0044030,GO:0044042,GO:0044057,GO:0044085,GO:0044087,GO:0044089,GO:0044092,GO:0044093,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0044267,GO:0044297,GO:0044309,GO:0044337,GO:0044380,GO:0044389,GO:0044421,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044428,GO:0044430,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044456,GO:0044463,GO:0044464,GO:0044703,GO:0044877,GO:0045121,GO:0045169,GO:0045171,GO:0045172,GO:0045184,GO:0045202,GO:0045444,GO:0045475,GO:0045595,GO:0045596,GO:0045597,GO:0045610,GO:0045664,GO:0045665,GO:0045666,GO:0045719,GO:0045732,GO:0045773,GO:0045785,GO:0045787,GO:0045807,GO:0045838,GO:0045840,GO:0045842,GO:0045844,GO:0045859,GO:0045862,GO:0045879,GO:0045886,GO:0045893,GO:0045912,GO:0045926,GO:0045927,GO:0045931,GO:0045935,GO:0045936,GO:0045937,GO:0045944,GO:0046328,GO:0046329,GO:0046483,GO:0046626,GO:0046627,GO:0046677,GO:0046777,GO:0046822,GO:0046824,GO:0046825,GO:0046827,GO:0046902,GO:0046907,GO:0046958,GO:0046959,GO:0048156,GO:0048167,GO:0048168,GO:0048285,GO:0048468,GO:0048471,GO:0048477,GO:0048511,GO:0048512,GO:0048513,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0048563,GO:0048569,GO:0048583,GO:0048584,GO:0048585,GO:0048589,GO:0048609,GO:0048634,GO:0048636,GO:0048638,GO:0048639,GO:0048640,GO:0048646,GO:0048660,GO:0048661,GO:0048666,GO:0048667,GO:0048699,GO:0048707,GO:0048729,GO:0048731,GO:0048736,GO:0048737,GO:0048762,GO:0048812,GO:0048814,GO:0048856,GO:0048858,GO:0048869,GO:0048870,GO:0050321,GO:0050764,GO:0050766,GO:0050767,GO:0050768,GO:0050769,GO:0050770,GO:0050772,GO:0050773,GO:0050774,GO:0050789,GO:0050790,GO:0050793,GO:0050794,GO:0050803,GO:0050804,GO:0050806,GO:0050807,GO:0050808,GO:0050839,GO:0050848,GO:0050849,GO:0050877,GO:0050890,GO:0050896,GO:0050999,GO:0051001,GO:0051018,GO:0051049,GO:0051050,GO:0051052,GO:0051054,GO:0051059,GO:0051093,GO:0051094,GO:0051098,GO:0051099,GO:0051100,GO:0051124,GO:0051128,GO:0051129,GO:0051130,GO:0051146,GO:0051147,GO:0051149,GO:0051153,GO:0051155,GO:0051168,GO:0051169,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051173,GO:0051174,GO:0051179,GO:0051222,GO:0051223,GO:0051234,GO:0051239,GO:0051240,GO:0051241,GO:0051246,GO:0051247,GO:0051248,GO:0051252,GO:0051254,GO:0051270,GO:0051271,GO:0051272,GO:0051293,GO:0051294,GO:0051321,GO:0051336,GO:0051338,GO:0051341,GO:0051345,GO:0051346,GO:0051348,GO:0051354,GO:0051493,GO:0051640,GO:0051641,GO:0051649,GO:0051653,GO:0051656,GO:0051674,GO:0051704,GO:0051716,GO:0051726,GO:0051781,GO:0051783,GO:0051785,GO:0051881,GO:0051960,GO:0051961,GO:0051962,GO:0051963,GO:0051964,GO:0051983,GO:0051984,GO:0055024,GO:0055025,GO:0055114,GO:0060069,GO:0060070,GO:0060078,GO:0060079,GO:0060099,GO:0060100,GO:0060255,GO:0060284,GO:0060322,GO:0060341,GO:0060359,GO:0060429,GO:0060485,GO:0060548,GO:0060562,GO:0060627,GO:0060828,GO:0060972,GO:0061024,GO:0061061,GO:0061136,GO:0061387,GO:0061564,GO:0062012,GO:0062033,GO:0065003,GO:0065007,GO:0065008,GO:0065009,GO:0070013,GO:0070059,GO:0070201,GO:0070301,GO:0070302,GO:0070303,GO:0070507,GO:0070727,GO:0070840,GO:0070848,GO:0070873,GO:0070874,GO:0070884,GO:0070885,GO:0070887,GO:0070986,GO:0071109,GO:0071214,GO:0071216,GO:0071236,GO:0071241,GO:0071242,GO:0071248,GO:0071260,GO:0071281,GO:0071282,GO:0071285,GO:0071310,GO:0071345,GO:0071363,GO:0071375,GO:0071407,GO:0071417,GO:0071495,GO:0071496,GO:0071514,GO:0071702,GO:0071704,GO:0071705,GO:0071840,GO:0071867,GO:0071868,GO:0071869,GO:0071870,GO:0071871,GO:0071900,GO:0071901,GO:0071944,GO:0072347,GO:0072359,GO:0072686,GO:0072698,GO:0080090,GO:0080134,GO:0080135,GO:0090066,GO:0090068,GO:0090087,GO:0090090,GO:0090162,GO:0090163,GO:0090257,GO:0090316,GO:0090559,GO:0097159,GO:0097190,GO:0097191,GO:0097192,GO:0097193,GO:0097237,GO:0097367,GO:0097447,GO:0097458,GO:0098589,GO:0098657,GO:0098727,GO:0098794,GO:0098805,GO:0098815,GO:0098857,GO:0098916,GO:0098984,GO:0099024,GO:0099080,GO:0099081,GO:0099177,GO:0099512,GO:0099513,GO:0099536,GO:0099537,GO:0099565,GO:0099572,GO:0104004,GO:0106027,GO:0106028,GO:0106056,GO:0106057,GO:0120025,GO:0120035,GO:0120036,GO:0120038,GO:0120039,GO:0140013,GO:0140096,GO:0150034,GO:0198738,GO:1900034,GO:1900076,GO:1900077,GO:1900180,GO:1900181,GO:1901028,GO:1901030,GO:1901074,GO:1901076,GO:1901214,GO:1901215,GO:1901216,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901652,GO:1901653,GO:1901698,GO:1901699,GO:1901700,GO:1901701,GO:1901800,GO:1901861,GO:1901863,GO:1901970,GO:1901983,GO:1901984,GO:1901987,GO:1901989,GO:1901990,GO:1901992,GO:1902065,GO:1902099,GO:1902101,GO:1902531,GO:1902532,GO:1902680,GO:1902850,GO:1903046,GO:1903047,GO:1903050,GO:1903052,GO:1903350,GO:1903351,GO:1903354,GO:1903356,GO:1903362,GO:1903364,GO:1903429,GO:1903430,GO:1903506,GO:1903508,GO:1903827,GO:1903828,GO:1903829,GO:1904338,GO:1904339,GO:1904396,GO:1904397,GO:1904589,GO:1904645,GO:1904646,GO:1904779,GO:1904780,GO:1904781,GO:1904885,GO:1904886,GO:1904951,GO:1905114,GO:1905153,GO:1905155,GO:1905207,GO:1905209,GO:1905809,GO:1905818,GO:1905820,GO:1990418,GO:1990478,GO:1990776,GO:1990904,GO:1990909,GO:2000026,GO:2000058,GO:2000060,GO:2000074,GO:2000077,GO:2000112,GO:2000113,GO:2000145,GO:2000146,GO:2000147,GO:2000171,GO:2000278,GO:2000425,GO:2000427,GO:2000463,GO:2000465,GO:2000466,GO:2000573,GO:2000725,GO:2000727,GO:2000736,GO:2000738,GO:2001141,GO:2001222,GO:2001223,GO:2001233,GO:2001235,GO:2001252
Evalue5.4e-167
EggNOG OGsCOG0515@1|root,KOG0658@2759|Eukaryota,38D5S@33154|Opisthokonta,3BB60@33208|Metazoa,3CRR9@33213|Bilateria,4827I@7711|Chordata,496S9@7742|Vertebrata,49QQW@7898|Actinopterygii
EC2.7.11.26
DescriptionGlycogen synthase kinase 3 beta
COG categoryT
BRITEko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01001,ko03036
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra10620Ggra10620Gracilaria gracilis GNS1m malegenetig00000904_pilon 402960..404156 +


The following start_codon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra10620.t1.start1Ggra10620.t1.start1Gracilaria gracilis GNS1m malestart_codontig00000904_pilon 402960..402962 +


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra10620.t1.CDS1Ggra10620.t1.CDS1Gracilaria gracilis GNS1m maleCDStig00000904_pilon 402960..404156 +


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra10620.t1.exon1Ggra10620.t1.exon1Gracilaria gracilis GNS1m maleexontig00000904_pilon 402960..404156 +


The following stop_codon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra10620.t1.stop1Ggra10620.t1.stop1Gracilaria gracilis GNS1m malestop_codontig00000904_pilon 404154..404156 +


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Ggra10620.t1Ggra10620.t1Gracilaria gracilis GNS1m malepolypeptidetig00000904_pilon 402960..404156 +


Sequences
The following sequences are available for this feature:

mRNA sequence

>Ggra10620.t1 ID=Ggra10620.t1|Name=Ggra10620.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=mRNA|length=399bp
MQPPPPPPPPPASAANASSTQPSFHAPNAPARTAHQPPSAALRPSASSSA
TPKESISYSAARVIGNGSFGVVFQATVRETGETVAIKKVLQDKRYKNREL
QIMRMIDHTNVCQLKHCFYSSGDKPDEVYLNLVLEFVPETVYRISKHYSK
VKTPIPTIYIKLYIYQLLRALAYIHSLGICHRDIKPQNLLLDPTTQVLKL
CDFGSAKVLVREEPNISYICSRYYRAPELIFGATDYLPAIDVWSTGCVMA
ELMQGHPLFPGESGVDQLVEIIKVLGTPTKEEIMAMNRNYTEFKFPQIKS
LPWTKVFRHRTSADAIDLVSKMLQYSPTMRLKPMQGLAHAYFDELRSSTC
KLPNGKPLPPLFNFSKHEFHHAADLASSILPRSVYDELHKKYGDPVRQ*
back to top

spliced messenger RNA

>Ggra10620.t1 ID=Ggra10620.t1|Name=Ggra10620.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=mRNA|length=1197bp|location=Sequence derived from alignment at tig00000904_pilon:402960..404156+ (Gracilaria gracilis GNS1m male)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.  
ATGCAgccgccgccgccgccgccgccgccgccCGCTTCTGCCGCCAATGC
GTCGTCTACGCAGCCGTCGTTTCACGCGCCCAATGCGCCCGCCAGAACGG
CGCATCAGCCGCCTTCGGCCGCGCTGCGCCCGTCCGCCTCGTCGTCTGCC
ACCCCAAAGGAGTCCATTAGCTACAGCGCCGCGCGCGTCATCGGTAACGG
CTCGTTCGGTGTCGTGTTTCAGGCTACCGTGCGCGAGACCGGCGAGACCG
TCGCCATCAAAAAGGTGCTGCAGGATAAGCGCTACAAGAATCGCGAGTTG
CAAATTATGCGCATGATCGATCACACAAACGTCTGCCAACTCAAGCATTG
CTTCTACTCGTCGGGCGACAAGCCTGACGAGGTCTACCTCAACCTCGTGC
TCGAATTCGTGCCAGAGACCGTCTATAGAATCTCAAAGCACTACTCCAAG
GTCAAGACTCCGATTCCCACCATTTATATCAAGTTGTACATTTATCAGCT
GCTGCGAGCTTTGGCCTACATTCATTCGCTGGGCATCTGTCATCGCGATA
TCAAGCCGCAAAACCTCTTGCTCGATCCTACCACCCAAGTGCTCAAACTG
TGTGACTTTGGATCCGCAAAGGTGCTCGTTCGGGAGGAGCCTAATATCAG
CTACATCTGTTCTCGTTACTACAGAGCGCCCGAACTCATCTTTGGCGCTA
CCGACTACTTGCCCGCAATCGATGTGTGGTCTACTGGTTGTGTCATGGCA
GAACTCATGCAAGGTCACCCGCTCTTCCCTGGAGAGTCTGGTGTGGACCA
ACTGGTGGAGATTATCAAGGTGCTGGGAACGCCTACCAAGGAAGAGATTA
TGGCAATGAACCGCAATTATACAGAGTTTAAGTTTCCGCAGATCAAGTCT
TTACCTTGGACAAAGGTGTTCCGTCATCGCACCAGTGCAGACGCCATTGA
CTTGGTGTCCAAGATGCTGCAATACTCGCCCACCATGAGACTCAAACCTA
TGCAGGGTTTGGCACATGCTTACTTTGATGAACTCCGTTCTTCTACGTGC
AAGTTGCCAAACGGCAAACCGCTTCCGCCGCTGTTTAATTTCTCAAAACA
TGAGTTTCACCATGCGGCCGATCTGGCTTCAAGTATTTTGCCGCGAAGTG
TTTATGACGAGTTGCATAAAAAGTATGGCGATCCTGTCAGACAGTGA
back to top

protein sequence of Ggra10620.t1

>Ggra10620.t1 ID=Ggra10620.t1|Name=Ggra10620.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=polypeptide|length=399bp
MQPPPPPPPPPASAANASSTQPSFHAPNAPARTAHQPPSAALRPSASSSA
TPKESISYSAARVIGNGSFGVVFQATVRETGETVAIKKVLQDKRYKNREL
QIMRMIDHTNVCQLKHCFYSSGDKPDEVYLNLVLEFVPETVYRISKHYSK
VKTPIPTIYIKLYIYQLLRALAYIHSLGICHRDIKPQNLLLDPTTQVLKL
CDFGSAKVLVREEPNISYICSRYYRAPELIFGATDYLPAIDVWSTGCVMA
ELMQGHPLFPGESGVDQLVEIIKVLGTPTKEEIMAMNRNYTEFKFPQIKS
LPWTKVFRHRTSADAIDLVSKMLQYSPTMRLKPMQGLAHAYFDELRSSTC
KLPNGKPLPPLFNFSKHEFHHAADLASSILPRSVYDELHKKYGDPVRQ*
back to top

mRNA from alignment at tig00000904_pilon:402960..404156+

Legend: start_codonpolypeptideCDSexonstop_codon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Ggra10620.t1 ID=Ggra10620.t1|Name=Ggra10620.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=mRNA|length=1197bp|location=Sequence derived from alignment at tig00000904_pilon:402960..404156+ (Gracilaria gracilis GNS1m male)
ATGCAgccgccgccgccgccgccgccgccgccCGCTTCTGCCGCCAATGC
GTCGTCTACGCAGCCGTCGTTTCACGCGCCCAATGCGCCCGCCAGAACGG
CGCATCAGCCGCCTTCGGCCGCGCTGCGCCCGTCCGCCTCGTCGTCTGCC
ACCCCAAAGGAGTCCATTAGCTACAGCGCCGCGCGCGTCATCGGTAACGG
CTCGTTCGGTGTCGTGTTTCAGGCTACCGTGCGCGAGACCGGCGAGACCG
TCGCCATCAAAAAGGTGCTGCAGGATAAGCGCTACAAGAATCGCGAGTTG
CAAATTATGCGCATGATCGATCACACAAACGTCTGCCAACTCAAGCATTG
CTTCTACTCGTCGGGCGACAAGCCTGACGAGGTCTACCTCAACCTCGTGC
TCGAATTCGTGCCAGAGACCGTCTATAGAATCTCAAAGCACTACTCCAAG
GTCAAGACTCCGATTCCCACCATTTATATCAAGTTGTACATTTATCAGCT
GCTGCGAGCTTTGGCCTACATTCATTCGCTGGGCATCTGTCATCGCGATA
TCAAGCCGCAAAACCTCTTGCTCGATCCTACCACCCAAGTGCTCAAACTG
TGTGACTTTGGATCCGCAAAGGTGCTCGTTCGGGAGGAGCCTAATATCAG
CTACATCTGTTCTCGTTACTACAGAGCGCCCGAACTCATCTTTGGCGCTA
CCGACTACTTGCCCGCAATCGATGTGTGGTCTACTGGTTGTGTCATGGCA
GAACTCATGCAAGGTCACCCGCTCTTCCCTGGAGAGTCTGGTGTGGACCA
ACTGGTGGAGATTATCAAGGTGCTGGGAACGCCTACCAAGGAAGAGATTA
TGGCAATGAACCGCAATTATACAGAGTTTAAGTTTCCGCAGATCAAGTCT
TTACCTTGGACAAAGGTGTTCCGTCATCGCACCAGTGCAGACGCCATTGA
CTTGGTGTCCAAGATGCTGCAATACTCGCCCACCATGAGACTCAAACCTA
TGCAGGGTTTGGCACATGCTTACTTTGATGAACTCCGTTCTTCTACGTGC
AAGTTGCCAAACGGCAAACCGCTTCCGCCGCTGTTTAATTTCTCAAAACA
TGAGTTTCACCATGCGGCCGATCTGGCTTCAAGTATTTTGCCGCGAAGTG
TTTATGACGAGTTGCATAAAAAGTATGGCGATCCTGTCAGACAGTGA
back to top

Coding sequence (CDS) from alignment at tig00000904_pilon:402960..404156+

>Ggra10620.t1 ID=Ggra10620.t1|Name=Ggra10620.t1|organism=Gracilaria gracilis GNS1m male|type=CDS|length=1197bp|location=Sequence derived from alignment at tig00000904_pilon:402960..404156+ (Gracilaria gracilis GNS1m male)
ATGCAgccgccgccgccgccgccgccgccgccCGCTTCTGCCGCCAATGC
GTCGTCTACGCAGCCGTCGTTTCACGCGCCCAATGCGCCCGCCAGAACGG
CGCATCAGCCGCCTTCGGCCGCGCTGCGCCCGTCCGCCTCGTCGTCTGCC
ACCCCAAAGGAGTCCATTAGCTACAGCGCCGCGCGCGTCATCGGTAACGG
CTCGTTCGGTGTCGTGTTTCAGGCTACCGTGCGCGAGACCGGCGAGACCG
TCGCCATCAAAAAGGTGCTGCAGGATAAGCGCTACAAGAATCGCGAGTTG
CAAATTATGCGCATGATCGATCACACAAACGTCTGCCAACTCAAGCATTG
CTTCTACTCGTCGGGCGACAAGCCTGACGAGGTCTACCTCAACCTCGTGC
TCGAATTCGTGCCAGAGACCGTCTATAGAATCTCAAAGCACTACTCCAAG
GTCAAGACTCCGATTCCCACCATTTATATCAAGTTGTACATTTATCAGCT
GCTGCGAGCTTTGGCCTACATTCATTCGCTGGGCATCTGTCATCGCGATA
TCAAGCCGCAAAACCTCTTGCTCGATCCTACCACCCAAGTGCTCAAACTG
TGTGACTTTGGATCCGCAAAGGTGCTCGTTCGGGAGGAGCCTAATATCAG
CTACATCTGTTCTCGTTACTACAGAGCGCCCGAACTCATCTTTGGCGCTA
CCGACTACTTGCCCGCAATCGATGTGTGGTCTACTGGTTGTGTCATGGCA
GAACTCATGCAAGGTCACCCGCTCTTCCCTGGAGAGTCTGGTGTGGACCA
ACTGGTGGAGATTATCAAGGTGCTGGGAACGCCTACCAAGGAAGAGATTA
TGGCAATGAACCGCAATTATACAGAGTTTAAGTTTCCGCAGATCAAGTCT
TTACCTTGGACAAAGGTGTTCCGTCATCGCACCAGTGCAGACGCCATTGA
CTTGGTGTCCAAGATGCTGCAATACTCGCCCACCATGAGACTCAAACCTA
TGCAGGGTTTGGCACATGCTTACTTTGATGAACTCCGTTCTTCTACGTGC
AAGTTGCCAAACGGCAAACCGCTTCCGCCGCTGTTTAATTTCTCAAAACA
TGAGTTTCACCATGCGGCCGATCTGGCTTCAAGTATTTTGCCGCGAAGTG
TTTATGACGAGTTGCATAAAAAGTATGGCGATCCTGTCAGACAGTGA
back to top