Gchil4198.t1 (mRNA) Gracilaria chilensis NLEC103_M9 male

You are viewing an mRNA, more information available on the corresponding polypeptide page

Overview
NameGchil4198.t1
Unique NameGchil4198.t1
TypemRNA
OrganismGracilaria chilensis NLEC103_M9 male (Gracilaria chilensis NLEC103_M9 male)
Sequence length1007
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
tig00004373_piloncontigtig00004373_pilon:1356485..1359505 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Gracilaria chilensis NLEC103_M9 male OGS1.02022-05-09
Properties
Property NameValue
Seed ortholog130081.XP_005704597.1
Preferred nameATP2A2
PFAMsCation_ATPase,Cation_ATPase_C,Cation_ATPase_N,E1-E2_ATPase,Hydrolase,Hydrolase_3
Max annot lvl2759|Eukaryota
KEGG koko:K01535,ko:K01537,ko:K05853
KEGG TC3.A.3.2,3.A.3.3
KEGG Pathwayko00190,ko04020,ko04022,ko04972,ko05010,map00190,map04020,map04022,map04972,map05010
GOsGO:0000003,GO:0000041,GO:0000166,GO:0001505,GO:0001664,GO:0002026,GO:0002027,GO:0002064,GO:0002065,GO:0002066,GO:0002119,GO:0002164,GO:0002237,GO:0003006,GO:0003008,GO:0003012,GO:0003013,GO:0003015,GO:0003299,GO:0003300,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003682,GO:0003824,GO:0005102,GO:0005215,GO:0005338,GO:0005384,GO:0005388,GO:0005488,GO:0005509,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005635,GO:0005654,GO:0005737,GO:0005768,GO:0005783,GO:0005789,GO:0005793,GO:0005794,GO:0005802,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006082,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006635,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006816,GO:0006828,GO:0006873,GO:0006874,GO:0006875,GO:0006915,GO:0006937,GO:0006942,GO:0006950,GO:0006952,GO:0006979,GO:0006984,GO:0006986,GO:0006996,GO:0007005,GO:0007009,GO:0007154,GO:0007155,GO:0007165,GO:0007267,GO:0007268,GO:0007274,GO:0007275,GO:0007276,GO:0007281,GO:0007292,GO:0007568,GO:0007610,GO:0007626,GO:0007629,GO:0008015,GO:0008016,GO:0008022,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008219,GO:0008324,GO:0008340,GO:0008344,GO:0008544,GO:0008610,GO:0008637,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009062,GO:0009605,GO:0009607,GO:0009617,GO:0009719,GO:0009725,GO:0009790,GO:0009791,GO:0009792,GO:0009888,GO:0009892,GO:0009898,GO:0009987,GO:0010033,GO:0010243,GO:0010256,GO:0010259,GO:0010460,GO:0010468,GO:0010605,GO:0010629,GO:0010646,GO:0010882,GO:0010883,GO:0010884,GO:0010959,GO:0012501,GO:0012505,GO:0012506,GO:0014724,GO:0014733,GO:0014801,GO:0014819,GO:0014883,GO:0014887,GO:0014888,GO:0014896,GO:0014897,GO:0014898,GO:0015075,GO:0015085,GO:0015318,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015410,GO:0015662,GO:0015931,GO:0015932,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016042,GO:0016043,GO:0016054,GO:0016462,GO:0016528,GO:0016529,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017076,GO:0017111,GO:0017157,GO:0017158,GO:0019222,GO:0019395,GO:0019722,GO:0019725,GO:0019752,GO:0019829,GO:0019897,GO:0019898,GO:0019899,GO:0019932,GO:0019953,GO:0022412,GO:0022414,GO:0022610,GO:0022622,GO:0022804,GO:0022853,GO:0022857,GO:0022890,GO:0022898,GO:0023051,GO:0023052,GO:0030001,GO:0030003,GO:0030016,GO:0030017,GO:0030104,GO:0030154,GO:0030258,GO:0030322,GO:0030534,GO:0030554,GO:0030707,GO:0030855,GO:0030968,GO:0031090,GO:0031094,GO:0031095,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031234,GO:0031410,GO:0031446,GO:0031448,GO:0031490,GO:0031672,GO:0031673,GO:0031674,GO:0031775,GO:0031967,GO:0031974,GO:0031975,GO:0031981,GO:0031982,GO:0031984,GO:0032386,GO:0032409,GO:0032411,GO:0032412,GO:0032414,GO:0032469,GO:0032470,GO:0032471,GO:0032496,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032504,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032781,GO:0032787,GO:0032879,GO:0032970,GO:0032991,GO:0033017,GO:0033292,GO:0033554,GO:0033993,GO:0034220,GO:0034440,GO:0034599,GO:0034620,GO:0034702,GO:0034703,GO:0034704,GO:0034762,GO:0034764,GO:0034765,GO:0034767,GO:0034976,GO:0035556,GO:0035639,GO:0035966,GO:0035967,GO:0036094,GO:0036335,GO:0040024,GO:0042175,GO:0042221,GO:0042391,GO:0042493,GO:0042592,GO:0042623,GO:0042625,GO:0042626,GO:0042692,GO:0042742,GO:0042802,GO:0042803,GO:0043085,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043207,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043233,GO:0043269,GO:0043270,GO:0043292,GO:0043434,GO:0043436,GO:0043462,GO:0043492,GO:0043500,GO:0043502,GO:0044057,GO:0044093,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044242,GO:0044248,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044428,GO:0044431,GO:0044432,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044449,GO:0044459,GO:0044464,GO:0044548,GO:0044703,GO:0045202,GO:0045822,GO:0045823,GO:0045932,GO:0045933,GO:0045988,GO:0045989,GO:0046395,GO:0046872,GO:0046873,GO:0046907,GO:0046915,GO:0046928,GO:0046983,GO:0048364,GO:0048468,GO:0048471,GO:0048477,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048583,GO:0048609,GO:0048731,GO:0048856,GO:0048863,GO:0048869,GO:0048872,GO:0048878,GO:0050789,GO:0050790,GO:0050794,GO:0050801,GO:0050804,GO:0050829,GO:0050896,GO:0051046,GO:0051049,GO:0051050,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051235,GO:0051239,GO:0051240,GO:0051241,GO:0051270,GO:0051282,GO:0051336,GO:0051345,GO:0051560,GO:0051561,GO:0051588,GO:0051640,GO:0051641,GO:0051646,GO:0051649,GO:0051651,GO:0051657,GO:0051659,GO:0051704,GO:0051707,GO:0051716,GO:0051924,GO:0051928,GO:0055001,GO:0055065,GO:0055071,GO:0055074,GO:0055076,GO:0055080,GO:0055082,GO:0055085,GO:0055114,GO:0055117,GO:0055119,GO:0060047,GO:0060255,GO:0060341,GO:0060401,GO:0060429,GO:0060627,GO:0061024,GO:0061061,GO:0065007,GO:0065008,GO:0065009,GO:0070013,GO:0070059,GO:0070296,GO:0070509,GO:0070588,GO:0070838,GO:0070887,GO:0071310,GO:0071421,GO:0071702,GO:0071704,GO:0071705,GO:0071840,GO:0071944,GO:0072329,GO:0072503,GO:0072507,GO:0072511,GO:0086004,GO:0086036,GO:0086039,GO:0090075,GO:0090076,GO:0090257,GO:0090533,GO:0090534,GO:0090662,GO:0097159,GO:0097190,GO:0097193,GO:0097367,GO:0097470,GO:0097708,GO:0098533,GO:0098542,GO:0098552,GO:0098562,GO:0098588,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:0098693,GO:0098771,GO:0098791,GO:0098796,GO:0098827,GO:0098900,GO:0098901,GO:0098909,GO:0098916,GO:0099080,GO:0099081,GO:0099131,GO:0099132,GO:0099177,GO:0099402,GO:0099512,GO:0099536,GO:0099537,GO:1901019,GO:1901021,GO:1901264,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901505,GO:1901575,GO:1901576,GO:1901652,GO:1901698,GO:1901700,GO:1901894,GO:1901896,GO:1902494,GO:1902495,GO:1902803,GO:1903115,GO:1903169,GO:1903233,GO:1903305,GO:1903515,GO:1903522,GO:1903523,GO:1903524,GO:1903530,GO:1903779,GO:1904062,GO:1904064,GO:1904427,GO:1904949,GO:1905952,GO:1905954,GO:1990036,GO:1990351,GO:1990845,GO:2000300
Evalue0.0
EggNOG OGsCOG0474@1|root,KOG0202@2759|Eukaryota
EC3.6.3.6,3.6.3.8
Descriptioncalcium-transporting ATPase activity
COG categoryP
BRITEko00000,ko00001,ko01000
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Gchil4198Gchil4198Gracilaria chilensis NLEC103_M9 malegenetig00004373_pilon 1356485..1359505 +


The following start_codon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Gchil4198.t1.start1Gchil4198.t1.start1Gracilaria chilensis NLEC103_M9 malestart_codontig00004373_pilon 1356485..1356487 +


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Gchil4198.t1.CDS1Gchil4198.t1.CDS1Gracilaria chilensis NLEC103_M9 maleCDStig00004373_pilon 1356485..1359505 +


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Gchil4198.t1.exon1Gchil4198.t1.exon1Gracilaria chilensis NLEC103_M9 maleexontig00004373_pilon 1356485..1359505 +


The following stop_codon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Gchil4198.t1.stop1Gchil4198.t1.stop1Gracilaria chilensis NLEC103_M9 malestop_codontig00004373_pilon 1359503..1359505 +


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Gchil4198.t1Gchil4198.t1Gracilaria chilensis NLEC103_M9 malepolypeptidetig00004373_pilon 1356485..1359505 +


Sequences
The following sequences are available for this feature:

mRNA sequence

>Gchil4198.t1 ID=Gchil4198.t1|Name=Gchil4198.t1|organism=Gracilaria chilensis NLEC103_M9 male|type=mRNA|length=1007bp
MQAVLRAPWSAAPLEVMAALGVEEHTGLSDSEVTSRRTLYGRNTIPPRQG
KSLFKLVLEQFQDQLVIILLLAAVVSFVLAFFEEGHSRLQAFFEPLVILL
ILIANAIVGVLQERNAESAIEALKEYEPETANALRAGVKHVLKAAELVPG
DVVEVAVGEKVPADMRIVSLQSSVLFADQSIVTGESLSVSKTTTKIPSND
GGAVVQDKTCMLFSGSTISRGKCTCVVTTTGVNTEIGAIHSNIIEEEDSP
TPLKIKLDEFGEFLSKVILVICILVWLVNIGNFRSHGGLLNGAVYYFKIA
VALAVAAIPEGLPAVVTTCLALGTKTMAKKNAIVRHLPSVETLGCTTVIC
SDKTGTLTTNMMSVQRVVVADGIDNETGKIRMKEFAVSGNTLEPEGDFTV
PRRSIKIKSPAIESPILAEMAEISTLCNDSSLTYDTEHNHYGRIGEGTEV
ALTVFAEKAGVPDVSVNESRRDATPSEKTSICRKYWLSRSDKLLTFEFTR
DRKSMSVLVAKKGDASRTRLLVKGAPESVMERCAFVRTAEGDKLELSDNM
RMQFDSEITRLSGGSSALRMLAVAVREDAPGLGDYDLKDTSQFSSYESDL
TLVGVVGMLDPPREEVREAIAVCRDAGIRVIVITGDNKATAEAICRRIGV
FDENEYLTGKSYTGREFDALKESEQKAAVQRASLFARVEPQHKQRLVDLL
RSQKEVVAMSGDGVNDAPALKKADIGIAMGSGTAVAKEVSSMVLADDNFA
TIVAAVEEGRSIYANMKQFIRYLISSNIGEVWCIFLTALMGMPEALIPVQ
LLWVNLVTDGLPATALSFNKASKDIMTQKPRGLSDSIIDSWMFFRYMAIG
TYVGIGTVGGFAWWYMFYEDGPKMSWYDMTHFSTCTEQLGRGWSCSVFEQ
RNASTVALTILVLIEMLNAFNSLSENQSLLTMTPLTNPLLIVACFLSIAL
HLVVLYVPFFAQIFSVVPLSKLEWMGVISMSIPVIVLDEILKLVSRTYVS
DDKKRQ*
back to top

spliced messenger RNA

>Gchil4198.t1 ID=Gchil4198.t1|Name=Gchil4198.t1|organism=Gracilaria chilensis NLEC103_M9 male|type=mRNA|length=3021bp|location=Sequence derived from alignment at tig00004373_pilon:1356485..1359505+ (Gracilaria chilensis NLEC103_M9 male)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.  
ATGCAAGCGGTGCTAAGAGCTCCGTGGTCCGCCGCCCCTCTGGAGGTGAT
GGCTGCTCTCGGTGTTGAGGAGCACACCGGTCTCTCTGACTCCGAGGTCA
CCAGTCGTCGCACGCTGTACGGAAGGAACACCATTCCCCCTCGCCAAGGC
AAGTCTCTGTTCAAACTCGTTTTGGAACAGTTTCAGGATCAGCTTGTAAT
TATTCTCCTTTTAGCCGCTGTAGTTTCTTTCGTGCTGGCCTTCTTTGAGG
AAGGTCACAGCCGACTTCAGGCCTTCTTTGAACCGTTGGTCATCTTGCTA
ATTCTCATTGCAAACGCCATTGTTGGTGTCCTCCAGGAAAGGAATGCCGA
GAGTGCCATCGAGGCCTTAAAGGAATATGAACCTGAAACTGCCAATGCCC
TGCGAGCAGGTGTCAAGCATGTCTTGAAAGCAGCCGAATTGGTACCAGGT
GATGTTGTTGAAGTTGCCGTGGGAGAGAAGGTTCCAGCTGATATGCGCAT
AGTTTCATTACAGAGCTCTGTGTTGTTCGCAGATCAAAGCATTGTTACCG
GTGAAAGCCTCAGTGTTTCTAAGACAACAACCAAGATCCCTTCCAATGAT
GGAGGTGCCGTCGTCCAAGACAAAACTTGTATGCTGTTTAGCGGGAGCAC
CATAAGCAGGGGAAAGTGTACATGTGTCGTCACCACAACAGGTGTTAACA
CAGAGATTGGTGCAATCCACAGCAACATTATTGAGGAGGAAGACAGTCCC
ACTCCGCTCAAGATTAAGCTCGATGAATTTGGAGAGTTCTTGTCCAAGGT
TATCCTAGTCATATGCATTCTGGTCTGGTTAGTTAACATTGGAAATTTCC
GCTCGCATGGTGGATTGCTTAATGGAGCAGTGTATTACTTCAAAATTGCA
GTTGCTTTGGCTGTCGCGGCCATTCCAGAAGGCCTTCCTGCTGTTGTTAC
CACTTGCCTTGCACTGGGGACTAAAACCATGGCAAAGAAGAACGCTATCG
TCAGACATCTGCCTTCTGTTGAGACGCTTGGATGTACAACTGTGATCTGT
TCTGACAAGACCGGAACGCTTACCACTAACATGATGAGTGTGCAGCGAGT
CGTGGTGGCTGACGGTATTGACAACGAAACCGGCAAGATACGGATGAAGG
AATTCGCCGTTTCTGGGAACACCTTGGAACCTGAGGGTGATTTCACTGTT
CCCAGAAGGTCTATAAAGATCAAATCACCGGCAATTGAAAGTCCTATCCT
TGCTGAGATGGCTGAGATTTCCACCCTTTGCAATGATTCTTCACTCACTT
ACGACACGGAGCACAATCATTATGGGCGTATCGGGGAAGGTACTGAAGTT
GCTCTGACGGTCTTCGCGGAGAAAGCAGGTGTTCCCGATGTGTCTGTAAA
CGAGTCACGACGAGATGCAACCCCGTCAGAGAAAACTTCTATATGTCGGA
AGTACTGGCTCAGCCGATCGGACAAGCTGCTCACCTTCGAGTTCACTCGT
GACCGTAAGAGCATGTCTGTTCTTGTTGCGAAGAAGGGCGATGCTTCACG
AACTCGTCTTCTTGTCAAGGGTGCTCCGGAATCCGTCATGGAGAGGTGCG
CCTTTGTGCGAACCGCAGAAGGGGACAAGCTTGAGCTCAGTGACAACATG
AGGATGCAGTTTGACTCAGAAATTACGAGGTTGAGCGGTGGGTCCAGTGC
CCTTCGTATGCTGGCTGTGGCAGTGCGAGAAGATGCCCCCGGACTTGGGG
ACTATGACCTCAAAGACACATCACAGTTTTCCTCGTATGAGAGTGATCTT
ACTCTTGTTGGGGTCGTTGGCATGCTCGACCCGCCGCGAGAGGAAGTAAG
AGAAGCGATTGCCGTGTGTAGGGACGCTGGAATTCGAGTTATCGTGATAA
CTGGAGATAACAAAGCGACAGCTGAAGCCATCTGTCGCCGCATTGGTGTG
TTTGATGAAAATGAATATTTGACCGGGAAGTCTTATACTGGTAGAGAATT
TGACGCTCTCAAAGAATCTGAGCAAAAAGCTGCTGTGCAACGTGCATCGC
TTTTTGCGAGAGTTGAGCCGCAACACAAGCAAAGACTGGTAGATTTACTT
CGTAGTCAAAAAGAAGTGGTCGCTATGTCTGGAGATGGTGTGAATGATGC
GCCCGCATTGAAGAAGGCCGATATTGGTATAGCCATGGGATCTGGTACCG
CTGTCGCCAAAGAAGTGTCGTCTATGGTTCTGGCAGATGACAATTTTGCC
ACCATTGTAGCAGCTGTCGAGGAGGGACGTTCGATTTACGCGAACATGAA
GCAGTTCATCCGATATCTCATCAGTTCCAATATTGGAGAAGTGTGGTGCA
TTTTCCTCACCGCGCTGATGGGTATGCCAGAGGCTTTGATTCCTGTGCAG
TTGTTGTGGGTCAACCTAGTGACCGATGGTCTTCCCGCCACAGCTCTGAG
CTTCAACAAAGCCAGCAAGGATATAATGACGCAAAAGCCTCGAGGCTTGA
GTGACAGTATCATAGACTCGTGGATGTTTTTCCGATACATGGCCATTGGA
ACCTATGTGGGAATTGGTACCGTTGGTGGATTCGCCTGGTGGTACATGTT
CTATGAGGATGGTCCAAAGATGTCGTGGTATGATATGACCCATTTCAGTA
CCTGCACGGAGCAGCTGGGAAGAGGCTGGTCATGCAGCGTCTTTGAGCAG
CGAAATGCCAGCACCGTTGCGCTCACCATACTTGTGCTGATTGAGATGTT
GAATGCGTTTAACAGTCTATCGGAGAACCAAAGCTTGTTGACGATGACGC
CGCTTACGAACCCTTTGCTCATCGTTGCATGTTTCCTGAGTATTGCTCTT
CATCTTGTGGTATTGTATGTTCCATTCTTCGCTCAGATTTTCTCTGTTGT
TCCACTGAGCAAATTAGAATGGATGGGGGTAATTTCGATGAGTATTCCTG
TCATTGTTCTGGATGAAATATTGAAGCTTGTGTCAAGGACGTATGTGAGC
GATGACAAGAAGAGACAATAG
back to top

protein sequence of Gchil4198.t1

>Gchil4198.t1 ID=Gchil4198.t1|Name=Gchil4198.t1|organism=Gracilaria chilensis NLEC103_M9 male|type=polypeptide|length=1007bp
MQAVLRAPWSAAPLEVMAALGVEEHTGLSDSEVTSRRTLYGRNTIPPRQG
KSLFKLVLEQFQDQLVIILLLAAVVSFVLAFFEEGHSRLQAFFEPLVILL
ILIANAIVGVLQERNAESAIEALKEYEPETANALRAGVKHVLKAAELVPG
DVVEVAVGEKVPADMRIVSLQSSVLFADQSIVTGESLSVSKTTTKIPSND
GGAVVQDKTCMLFSGSTISRGKCTCVVTTTGVNTEIGAIHSNIIEEEDSP
TPLKIKLDEFGEFLSKVILVICILVWLVNIGNFRSHGGLLNGAVYYFKIA
VALAVAAIPEGLPAVVTTCLALGTKTMAKKNAIVRHLPSVETLGCTTVIC
SDKTGTLTTNMMSVQRVVVADGIDNETGKIRMKEFAVSGNTLEPEGDFTV
PRRSIKIKSPAIESPILAEMAEISTLCNDSSLTYDTEHNHYGRIGEGTEV
ALTVFAEKAGVPDVSVNESRRDATPSEKTSICRKYWLSRSDKLLTFEFTR
DRKSMSVLVAKKGDASRTRLLVKGAPESVMERCAFVRTAEGDKLELSDNM
RMQFDSEITRLSGGSSALRMLAVAVREDAPGLGDYDLKDTSQFSSYESDL
TLVGVVGMLDPPREEVREAIAVCRDAGIRVIVITGDNKATAEAICRRIGV
FDENEYLTGKSYTGREFDALKESEQKAAVQRASLFARVEPQHKQRLVDLL
RSQKEVVAMSGDGVNDAPALKKADIGIAMGSGTAVAKEVSSMVLADDNFA
TIVAAVEEGRSIYANMKQFIRYLISSNIGEVWCIFLTALMGMPEALIPVQ
LLWVNLVTDGLPATALSFNKASKDIMTQKPRGLSDSIIDSWMFFRYMAIG
TYVGIGTVGGFAWWYMFYEDGPKMSWYDMTHFSTCTEQLGRGWSCSVFEQ
RNASTVALTILVLIEMLNAFNSLSENQSLLTMTPLTNPLLIVACFLSIAL
HLVVLYVPFFAQIFSVVPLSKLEWMGVISMSIPVIVLDEILKLVSRTYVS
DDKKRQ*
back to top

mRNA from alignment at tig00004373_pilon:1356485..1359505+

Legend: start_codonpolypeptideCDSexonstop_codon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Gchil4198.t1 ID=Gchil4198.t1|Name=Gchil4198.t1|organism=Gracilaria chilensis NLEC103_M9 male|type=mRNA|length=3021bp|location=Sequence derived from alignment at tig00004373_pilon:1356485..1359505+ (Gracilaria chilensis NLEC103_M9 male)
ATGCAAGCGGTGCTAAGAGCTCCGTGGTCCGCCGCCCCTCTGGAGGTGAT GGCTGCTCTCGGTGTTGAGGAGCACACCGGTCTCTCTGACTCCGAGGTCA CCAGTCGTCGCACGCTGTACGGAAGGAACACCATTCCCCCTCGCCAAGGC AAGTCTCTGTTCAAACTCGTTTTGGAACAGTTTCAGGATCAGCTTGTAAT TATTCTCCTTTTAGCCGCTGTAGTTTCTTTCGTGCTGGCCTTCTTTGAGG AAGGTCACAGCCGACTTCAGGCCTTCTTTGAACCGTTGGTCATCTTGCTA ATTCTCATTGCAAACGCCATTGTTGGTGTCCTCCAGGAAAGGAATGCCGA GAGTGCCATCGAGGCCTTAAAGGAATATGAACCTGAAACTGCCAATGCCC TGCGAGCAGGTGTCAAGCATGTCTTGAAAGCAGCCGAATTGGTACCAGGT GATGTTGTTGAAGTTGCCGTGGGAGAGAAGGTTCCAGCTGATATGCGCAT AGTTTCATTACAGAGCTCTGTGTTGTTCGCAGATCAAAGCATTGTTACCG GTGAAAGCCTCAGTGTTTCTAAGACAACAACCAAGATCCCTTCCAATGAT GGAGGTGCCGTCGTCCAAGACAAAACTTGTATGCTGTTTAGCGGGAGCAC CATAAGCAGGGGAAAGTGTACATGTGTCGTCACCACAACAGGTGTTAACA CAGAGATTGGTGCAATCCACAGCAACATTATTGAGGAGGAAGACAGTCCC ACTCCGCTCAAGATTAAGCTCGATGAATTTGGAGAGTTCTTGTCCAAGGT TATCCTAGTCATATGCATTCTGGTCTGGTTAGTTAACATTGGAAATTTCC GCTCGCATGGTGGATTGCTTAATGGAGCAGTGTATTACTTCAAAATTGCA GTTGCTTTGGCTGTCGCGGCCATTCCAGAAGGCCTTCCTGCTGTTGTTAC CACTTGCCTTGCACTGGGGACTAAAACCATGGCAAAGAAGAACGCTATCG TCAGACATCTGCCTTCTGTTGAGACGCTTGGATGTACAACTGTGATCTGT TCTGACAAGACCGGAACGCTTACCACTAACATGATGAGTGTGCAGCGAGT CGTGGTGGCTGACGGTATTGACAACGAAACCGGCAAGATACGGATGAAGG AATTCGCCGTTTCTGGGAACACCTTGGAACCTGAGGGTGATTTCACTGTT CCCAGAAGGTCTATAAAGATCAAATCACCGGCAATTGAAAGTCCTATCCT TGCTGAGATGGCTGAGATTTCCACCCTTTGCAATGATTCTTCACTCACTT ACGACACGGAGCACAATCATTATGGGCGTATCGGGGAAGGTACTGAAGTT GCTCTGACGGTCTTCGCGGAGAAAGCAGGTGTTCCCGATGTGTCTGTAAA CGAGTCACGACGAGATGCAACCCCGTCAGAGAAAACTTCTATATGTCGGA AGTACTGGCTCAGCCGATCGGACAAGCTGCTCACCTTCGAGTTCACTCGT GACCGTAAGAGCATGTCTGTTCTTGTTGCGAAGAAGGGCGATGCTTCACG AACTCGTCTTCTTGTCAAGGGTGCTCCGGAATCCGTCATGGAGAGGTGCG CCTTTGTGCGAACCGCAGAAGGGGACAAGCTTGAGCTCAGTGACAACATG AGGATGCAGTTTGACTCAGAAATTACGAGGTTGAGCGGTGGGTCCAGTGC CCTTCGTATGCTGGCTGTGGCAGTGCGAGAAGATGCCCCCGGACTTGGGG ACTATGACCTCAAAGACACATCACAGTTTTCCTCGTATGAGAGTGATCTT ACTCTTGTTGGGGTCGTTGGCATGCTCGACCCGCCGCGAGAGGAAGTAAG AGAAGCGATTGCCGTGTGTAGGGACGCTGGAATTCGAGTTATCGTGATAA CTGGAGATAACAAAGCGACAGCTGAAGCCATCTGTCGCCGCATTGGTGTG TTTGATGAAAATGAATATTTGACCGGGAAGTCTTATACTGGTAGAGAATT TGACGCTCTCAAAGAATCTGAGCAAAAAGCTGCTGTGCAACGTGCATCGC TTTTTGCGAGAGTTGAGCCGCAACACAAGCAAAGACTGGTAGATTTACTT CGTAGTCAAAAAGAAGTGGTCGCTATGTCTGGAGATGGTGTGAATGATGC GCCCGCATTGAAGAAGGCCGATATTGGTATAGCCATGGGATCTGGTACCG CTGTCGCCAAAGAAGTGTCGTCTATGGTTCTGGCAGATGACAATTTTGCC ACCATTGTAGCAGCTGTCGAGGAGGGACGTTCGATTTACGCGAACATGAA GCAGTTCATCCGATATCTCATCAGTTCCAATATTGGAGAAGTGTGGTGCA TTTTCCTCACCGCGCTGATGGGTATGCCAGAGGCTTTGATTCCTGTGCAG TTGTTGTGGGTCAACCTAGTGACCGATGGTCTTCCCGCCACAGCTCTGAG CTTCAACAAAGCCAGCAAGGATATAATGACGCAAAAGCCTCGAGGCTTGA GTGACAGTATCATAGACTCGTGGATGTTTTTCCGATACATGGCCATTGGA ACCTATGTGGGAATTGGTACCGTTGGTGGATTCGCCTGGTGGTACATGTT CTATGAGGATGGTCCAAAGATGTCGTGGTATGATATGACCCATTTCAGTA CCTGCACGGAGCAGCTGGGAAGAGGCTGGTCATGCAGCGTCTTTGAGCAG CGAAATGCCAGCACCGTTGCGCTCACCATACTTGTGCTGATTGAGATGTT GAATGCGTTTAACAGTCTATCGGAGAACCAAAGCTTGTTGACGATGACGC CGCTTACGAACCCTTTGCTCATCGTTGCATGTTTCCTGAGTATTGCTCTT CATCTTGTGGTATTGTATGTTCCATTCTTCGCTCAGATTTTCTCTGTTGT TCCACTGAGCAAATTAGAATGGATGGGGGTAATTTCGATGAGTATTCCTG TCATTGTTCTGGATGAAATATTGAAGCTTGTGTCAAGGACGTATGTGAGC GATGACAAGAAGAGACAATAG
back to top

Coding sequence (CDS) from alignment at tig00004373_pilon:1356485..1359505+

>Gchil4198.t1 ID=Gchil4198.t1|Name=Gchil4198.t1|organism=Gracilaria chilensis NLEC103_M9 male|type=CDS|length=3021bp|location=Sequence derived from alignment at tig00004373_pilon:1356485..1359505+ (Gracilaria chilensis NLEC103_M9 male)
ATGCAAGCGGTGCTAAGAGCTCCGTGGTCCGCCGCCCCTCTGGAGGTGAT
GGCTGCTCTCGGTGTTGAGGAGCACACCGGTCTCTCTGACTCCGAGGTCA
CCAGTCGTCGCACGCTGTACGGAAGGAACACCATTCCCCCTCGCCAAGGC
AAGTCTCTGTTCAAACTCGTTTTGGAACAGTTTCAGGATCAGCTTGTAAT
TATTCTCCTTTTAGCCGCTGTAGTTTCTTTCGTGCTGGCCTTCTTTGAGG
AAGGTCACAGCCGACTTCAGGCCTTCTTTGAACCGTTGGTCATCTTGCTA
ATTCTCATTGCAAACGCCATTGTTGGTGTCCTCCAGGAAAGGAATGCCGA
GAGTGCCATCGAGGCCTTAAAGGAATATGAACCTGAAACTGCCAATGCCC
TGCGAGCAGGTGTCAAGCATGTCTTGAAAGCAGCCGAATTGGTACCAGGT
GATGTTGTTGAAGTTGCCGTGGGAGAGAAGGTTCCAGCTGATATGCGCAT
AGTTTCATTACAGAGCTCTGTGTTGTTCGCAGATCAAAGCATTGTTACCG
GTGAAAGCCTCAGTGTTTCTAAGACAACAACCAAGATCCCTTCCAATGAT
GGAGGTGCCGTCGTCCAAGACAAAACTTGTATGCTGTTTAGCGGGAGCAC
CATAAGCAGGGGAAAGTGTACATGTGTCGTCACCACAACAGGTGTTAACA
CAGAGATTGGTGCAATCCACAGCAACATTATTGAGGAGGAAGACAGTCCC
ACTCCGCTCAAGATTAAGCTCGATGAATTTGGAGAGTTCTTGTCCAAGGT
TATCCTAGTCATATGCATTCTGGTCTGGTTAGTTAACATTGGAAATTTCC
GCTCGCATGGTGGATTGCTTAATGGAGCAGTGTATTACTTCAAAATTGCA
GTTGCTTTGGCTGTCGCGGCCATTCCAGAAGGCCTTCCTGCTGTTGTTAC
CACTTGCCTTGCACTGGGGACTAAAACCATGGCAAAGAAGAACGCTATCG
TCAGACATCTGCCTTCTGTTGAGACGCTTGGATGTACAACTGTGATCTGT
TCTGACAAGACCGGAACGCTTACCACTAACATGATGAGTGTGCAGCGAGT
CGTGGTGGCTGACGGTATTGACAACGAAACCGGCAAGATACGGATGAAGG
AATTCGCCGTTTCTGGGAACACCTTGGAACCTGAGGGTGATTTCACTGTT
CCCAGAAGGTCTATAAAGATCAAATCACCGGCAATTGAAAGTCCTATCCT
TGCTGAGATGGCTGAGATTTCCACCCTTTGCAATGATTCTTCACTCACTT
ACGACACGGAGCACAATCATTATGGGCGTATCGGGGAAGGTACTGAAGTT
GCTCTGACGGTCTTCGCGGAGAAAGCAGGTGTTCCCGATGTGTCTGTAAA
CGAGTCACGACGAGATGCAACCCCGTCAGAGAAAACTTCTATATGTCGGA
AGTACTGGCTCAGCCGATCGGACAAGCTGCTCACCTTCGAGTTCACTCGT
GACCGTAAGAGCATGTCTGTTCTTGTTGCGAAGAAGGGCGATGCTTCACG
AACTCGTCTTCTTGTCAAGGGTGCTCCGGAATCCGTCATGGAGAGGTGCG
CCTTTGTGCGAACCGCAGAAGGGGACAAGCTTGAGCTCAGTGACAACATG
AGGATGCAGTTTGACTCAGAAATTACGAGGTTGAGCGGTGGGTCCAGTGC
CCTTCGTATGCTGGCTGTGGCAGTGCGAGAAGATGCCCCCGGACTTGGGG
ACTATGACCTCAAAGACACATCACAGTTTTCCTCGTATGAGAGTGATCTT
ACTCTTGTTGGGGTCGTTGGCATGCTCGACCCGCCGCGAGAGGAAGTAAG
AGAAGCGATTGCCGTGTGTAGGGACGCTGGAATTCGAGTTATCGTGATAA
CTGGAGATAACAAAGCGACAGCTGAAGCCATCTGTCGCCGCATTGGTGTG
TTTGATGAAAATGAATATTTGACCGGGAAGTCTTATACTGGTAGAGAATT
TGACGCTCTCAAAGAATCTGAGCAAAAAGCTGCTGTGCAACGTGCATCGC
TTTTTGCGAGAGTTGAGCCGCAACACAAGCAAAGACTGGTAGATTTACTT
CGTAGTCAAAAAGAAGTGGTCGCTATGTCTGGAGATGGTGTGAATGATGC
GCCCGCATTGAAGAAGGCCGATATTGGTATAGCCATGGGATCTGGTACCG
CTGTCGCCAAAGAAGTGTCGTCTATGGTTCTGGCAGATGACAATTTTGCC
ACCATTGTAGCAGCTGTCGAGGAGGGACGTTCGATTTACGCGAACATGAA
GCAGTTCATCCGATATCTCATCAGTTCCAATATTGGAGAAGTGTGGTGCA
TTTTCCTCACCGCGCTGATGGGTATGCCAGAGGCTTTGATTCCTGTGCAG
TTGTTGTGGGTCAACCTAGTGACCGATGGTCTTCCCGCCACAGCTCTGAG
CTTCAACAAAGCCAGCAAGGATATAATGACGCAAAAGCCTCGAGGCTTGA
GTGACAGTATCATAGACTCGTGGATGTTTTTCCGATACATGGCCATTGGA
ACCTATGTGGGAATTGGTACCGTTGGTGGATTCGCCTGGTGGTACATGTT
CTATGAGGATGGTCCAAAGATGTCGTGGTATGATATGACCCATTTCAGTA
CCTGCACGGAGCAGCTGGGAAGAGGCTGGTCATGCAGCGTCTTTGAGCAG
CGAAATGCCAGCACCGTTGCGCTCACCATACTTGTGCTGATTGAGATGTT
GAATGCGTTTAACAGTCTATCGGAGAACCAAAGCTTGTTGACGATGACGC
CGCTTACGAACCCTTTGCTCATCGTTGCATGTTTCCTGAGTATTGCTCTT
CATCTTGTGGTATTGTATGTTCCATTCTTCGCTCAGATTTTCTCTGTTGT
TCCACTGAGCAAATTAGAATGGATGGGGGTAATTTCGATGAGTATTCCTG
TCATTGTTCTGGATGAAATATTGAAGCTTGTGTCAAGGACGTATGTGAGC
GATGACAAGAAGAGACAATAG
back to top