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Alignments
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Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Properties
| Property Name | Value |
| Seed ortholog | 130081.XP_005706124.1 |
| Preferred name | ENTPD7 |
| PFAMs | GDA1_CD39 |
| Max annot lvl | 2759|Eukaryota |
| KEGG rclass | RC00002 |
| KEGG ko | ko:K01509,ko:K01510,ko:K01511,ko:K12305,ko:K14642,ko:K14643 |
| KEGG Reaction | R00086,R00122,R00155,R00159,R00328,R00335,R00514,R00569,R00719,R00961,R02092,R02095 |
| KEGG Pathway | ko00230,ko00240,ko04142,ko04742,ko05169,map00230,map00240,map04142,map04742,map05169 |
| GOs | 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3578,GO:1903579,GO:2000112,GO:2000145,GO:2001023,GO:2001024,GO:2001169,GO:2001170 |
| Evalue | 2.24e-36 |
| EggNOG OGs | COG5371@1|root,KOG1386@2759|Eukaryota |
| EC | 3.6.1.3,3.6.1.5,3.6.1.6 |
| Description | 8-oxo-dGTP phosphohydrolase activity |
| COG category | GO |
| BRITE | ko00000,ko00001,ko01000,ko04090 |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following start_codon feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type | Position |
| Gcaud3238.t1.start1 | Gcaud3238.t1.start1 | Gracilaria caudata M_176_S67 male | start_codon | NODE_147_length_43555_cov_4.601095 36599..36601 + |
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type | Position |
| Gcaud3238.t1.exon1 | Gcaud3238.t1.exon1 | Gracilaria caudata M_176_S67 male | exon | NODE_147_length_43555_cov_4.601095 36599..38098 + |
The following stop_codon feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type | Position |
| Gcaud3238.t1.stop1 | Gcaud3238.t1.stop1 | Gracilaria caudata M_176_S67 male | stop_codon | NODE_147_length_43555_cov_4.601095 38096..38098 + |
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA sequence >Gcaud3238.t1 ID=Gcaud3238.t1|Name=Gcaud3238.t1|organism=Gracilaria caudata M_176_S67 male|type=mRNA|length=500bp MPQNTVRRRRGNKQSASSQKTVDSTEASTTPQETGSQAKSVPELLEEENA SFKNFMGLAALACLFFIHMLQNTRLPLPGRVYAVMIDAGSTGTRAQVFTF RFNSTEQRMTLQGTAMFTQNKSIDLLASGTSPKHFFRPLFDKVKKAVPGI RRRKRTPIALHATAGLRLIGEEKAEKALDIARSALGSTDFLFQPDWVSVL SESDEANYAWVTTNYLLGNFDPGNDEKQFVGALDLGGGSMQIVFHDNGDI DDYITSPPEPNDSSDAEHTEQKGIFPSSETHIDIFGQRYKLHARNHLGLG LVNFKKTLYGIFDHEGVLEEGNPCFRMGQKFKSAKLRIHKPSLEETKVVS IVGDGDFERCVASAEIAISSVSRLNDKRSHLPDRNNFYAFAYFYDKTVKL GLSSKLSKKEMLEKGKELCEESKGDGPADFDESCAEFSYIFAVLKILTDD FLESKSNVTFEQYVNGHMLGWALGAVLDTLQPDVIAKQIAVESESLLMT* back to topspliced messenger RNA >Gcaud3238.t1 ID=Gcaud3238.t1|Name=Gcaud3238.t1|organism=Gracilaria caudata M_176_S67 male|type=mRNA|length=1500bp|location=Sequence derived from alignment at NODE_147_length_43555_cov_4.601095:36599..38098+ (Gracilaria caudata M_176_S67 male)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.
ATGCCTCAGAACACCGTGCGACGTAGGCGTGGCAACAAGCAGTCCGCTTC ATCACAGAAGACAGTTGACTCAACAGAAGCCTCAACAACCCCTCAGGAGA CTGGAAGTCAAGCTAAATCAGTTCCAGAACTCTTGGAAGAAGAGAATGCC TCCTTCAAGAACTTTATGGGACTAGCTGCCTTGGCTTGCCTTTTCTTCAT TCATATGCTTCAAAATACCAGACTTCCCCTTCCAGGCCGTGTATATGCCG TCATGATCGATGCCGGCTCCACCGGCACCAGAGCGCAAGTCTTTACATTC CGTTTCAATTCTACTGAGCAACGCATGACTCTGCAAGGCACAGCTATGTT TACTCAGAACAAAAGCATTGATCTGCTGGCTTCTGGTACATCACCCAAGC ACTTCTTCAGACCTCTGTTTGATAAAGTTAAAAAGGCCGTTCCGGGAATA AGACGCAGAAAGAGGACCCCAATAGCGCTGCATGCTACTGCTGGGCTGCG TCTGATCGGCGAGGAAAAGGCAGAAAAAGCGCTTGATATCGCTCGTTCTG CCCTAGGCTCTACCGACTTTTTGTTCCAACCGGATTGGGTCTCAGTACTA TCTGAAAGTGACGAAGCGAACTATGCTTGGGTCACGACCAACTATCTCCT CGGAAACTTTGACCCAGGCAATGATGAAAAGCAATTTGTCGGTGCCTTGG ATCTCGGAGGTGGCAGTATGCAAATCGTATTTCATGACAATGGAGACATC GATGACTACATCACAAGCCCTCCTGAACCGAATGATTCATCCGATGCAGA ACACACTGAACAGAAGGGAATATTCCCCTCTTCGGAAACCCATATTGACA TCTTCGGCCAGAGATACAAGCTTCATGCGCGAAATCACCTCGGGCTCGGT TTAGTCAACTTCAAGAAAACCCTATATGGCATCTTTGATCATGAGGGTGT TTTGGAGGAGGGAAACCCGTGCTTCCGGATGGGGCAGAAGTTCAAGAGCG CGAAGCTGCGAATCCATAAACCGAGCTTGGAGGAAACGAAGGTTGTGAGC ATTGTTGGAGACGGTGATTTTGAACGGTGTGTGGCCAGTGCTGAAATTGC CATATCTTCCGTCAGCCGTCTAAATGACAAACGCAGTCATCTCCCAGATC GAAACAATTTCTATGCTTTCGCGTACTTCTATGATAAGACAGTGAAGTTG GGACTAAGTTCGAAGCTGTCGAAGAAGGAAATGCTAGAAAAAGGGAAAGA ATTGTGTGAAGAGAGTAAAGGAGATGGACCAGCAGACTTTGATGAATCCT GTGCAGAGTTTTCCTACATTTTTGCTGTCTTGAAGATTCTCACAGATGAT TTCTTGGAATCAAAATCTAATGTCACTTTTGAGCAATATGTAAATGGACA TATGTTAGGATGGGCTCTAGGTGCTGTTCTTGATACTCTTCAGCCGGACG TCATTGCAAAACAAATCGCTGTGGAATCAGAATCATTACTAATGACATAA back to topprotein sequence of Gcaud3238.t1 >Gcaud3238.t1 ID=Gcaud3238.t1|Name=Gcaud3238.t1|organism=Gracilaria caudata M_176_S67 male|type=polypeptide|length=500bp
MPQNTVRRRRGNKQSASSQKTVDSTEASTTPQETGSQAKSVPELLEEENA SFKNFMGLAALACLFFIHMLQNTRLPLPGRVYAVMIDAGSTGTRAQVFTF RFNSTEQRMTLQGTAMFTQNKSIDLLASGTSPKHFFRPLFDKVKKAVPGI RRRKRTPIALHATAGLRLIGEEKAEKALDIARSALGSTDFLFQPDWVSVL SESDEANYAWVTTNYLLGNFDPGNDEKQFVGALDLGGGSMQIVFHDNGDI DDYITSPPEPNDSSDAEHTEQKGIFPSSETHIDIFGQRYKLHARNHLGLG LVNFKKTLYGIFDHEGVLEEGNPCFRMGQKFKSAKLRIHKPSLEETKVVS IVGDGDFERCVASAEIAISSVSRLNDKRSHLPDRNNFYAFAYFYDKTVKL GLSSKLSKKEMLEKGKELCEESKGDGPADFDESCAEFSYIFAVLKILTDD FLESKSNVTFEQYVNGHMLGWALGAVLDTLQPDVIAKQIAVESESLLMT* back to topmRNA from alignment at NODE_147_length_43555_cov_4.601095:36599..38098+ Legend: start_codonpolypeptideCDSexonstop_codon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >Gcaud3238.t1 ID=Gcaud3238.t1|Name=Gcaud3238.t1|organism=Gracilaria caudata M_176_S67 male|type=mRNA|length=1500bp|location=Sequence derived from alignment at NODE_147_length_43555_cov_4.601095:36599..38098+ (Gracilaria caudata M_176_S67 male) ATGCCTCAGAACACCGTGCGACGTAGGCGTGGCAACAAGCAGTCCGCTTC
ATCACAGAAGACAGTTGACTCAACAGAAGCCTCAACAACCCCTCAGGAGA
CTGGAAGTCAAGCTAAATCAGTTCCAGAACTCTTGGAAGAAGAGAATGCC
TCCTTCAAGAACTTTATGGGACTAGCTGCCTTGGCTTGCCTTTTCTTCAT
TCATATGCTTCAAAATACCAGACTTCCCCTTCCAGGCCGTGTATATGCCG
TCATGATCGATGCCGGCTCCACCGGCACCAGAGCGCAAGTCTTTACATTC
CGTTTCAATTCTACTGAGCAACGCATGACTCTGCAAGGCACAGCTATGTT
TACTCAGAACAAAAGCATTGATCTGCTGGCTTCTGGTACATCACCCAAGC
ACTTCTTCAGACCTCTGTTTGATAAAGTTAAAAAGGCCGTTCCGGGAATA
AGACGCAGAAAGAGGACCCCAATAGCGCTGCATGCTACTGCTGGGCTGCG
TCTGATCGGCGAGGAAAAGGCAGAAAAAGCGCTTGATATCGCTCGTTCTG
CCCTAGGCTCTACCGACTTTTTGTTCCAACCGGATTGGGTCTCAGTACTA
TCTGAAAGTGACGAAGCGAACTATGCTTGGGTCACGACCAACTATCTCCT
CGGAAACTTTGACCCAGGCAATGATGAAAAGCAATTTGTCGGTGCCTTGG
ATCTCGGAGGTGGCAGTATGCAAATCGTATTTCATGACAATGGAGACATC
GATGACTACATCACAAGCCCTCCTGAACCGAATGATTCATCCGATGCAGA
ACACACTGAACAGAAGGGAATATTCCCCTCTTCGGAAACCCATATTGACA
TCTTCGGCCAGAGATACAAGCTTCATGCGCGAAATCACCTCGGGCTCGGT
TTAGTCAACTTCAAGAAAACCCTATATGGCATCTTTGATCATGAGGGTGT
TTTGGAGGAGGGAAACCCGTGCTTCCGGATGGGGCAGAAGTTCAAGAGCG
CGAAGCTGCGAATCCATAAACCGAGCTTGGAGGAAACGAAGGTTGTGAGC
ATTGTTGGAGACGGTGATTTTGAACGGTGTGTGGCCAGTGCTGAAATTGC
CATATCTTCCGTCAGCCGTCTAAATGACAAACGCAGTCATCTCCCAGATC
GAAACAATTTCTATGCTTTCGCGTACTTCTATGATAAGACAGTGAAGTTG
GGACTAAGTTCGAAGCTGTCGAAGAAGGAAATGCTAGAAAAAGGGAAAGA
ATTGTGTGAAGAGAGTAAAGGAGATGGACCAGCAGACTTTGATGAATCCT
GTGCAGAGTTTTCCTACATTTTTGCTGTCTTGAAGATTCTCACAGATGAT
TTCTTGGAATCAAAATCTAATGTCACTTTTGAGCAATATGTAAATGGACA
TATGTTAGGATGGGCTCTAGGTGCTGTTCTTGATACTCTTCAGCCGGACG
TCATTGCAAAACAAATCGCTGTGGAATCAGAATCATTACTAATGACATAA
back to topCoding sequence (CDS) from alignment at NODE_147_length_43555_cov_4.601095:36599..38098+ >Gcaud3238.t1 ID=Gcaud3238.t1|Name=Gcaud3238.t1|organism=Gracilaria caudata M_176_S67 male|type=CDS|length=1500bp|location=Sequence derived from alignment at NODE_147_length_43555_cov_4.601095:36599..38098+ (Gracilaria caudata M_176_S67 male) ATGCCTCAGAACACCGTGCGACGTAGGCGTGGCAACAAGCAGTCCGCTTC ATCACAGAAGACAGTTGACTCAACAGAAGCCTCAACAACCCCTCAGGAGA CTGGAAGTCAAGCTAAATCAGTTCCAGAACTCTTGGAAGAAGAGAATGCC TCCTTCAAGAACTTTATGGGACTAGCTGCCTTGGCTTGCCTTTTCTTCAT TCATATGCTTCAAAATACCAGACTTCCCCTTCCAGGCCGTGTATATGCCG TCATGATCGATGCCGGCTCCACCGGCACCAGAGCGCAAGTCTTTACATTC CGTTTCAATTCTACTGAGCAACGCATGACTCTGCAAGGCACAGCTATGTT TACTCAGAACAAAAGCATTGATCTGCTGGCTTCTGGTACATCACCCAAGC ACTTCTTCAGACCTCTGTTTGATAAAGTTAAAAAGGCCGTTCCGGGAATA AGACGCAGAAAGAGGACCCCAATAGCGCTGCATGCTACTGCTGGGCTGCG TCTGATCGGCGAGGAAAAGGCAGAAAAAGCGCTTGATATCGCTCGTTCTG CCCTAGGCTCTACCGACTTTTTGTTCCAACCGGATTGGGTCTCAGTACTA TCTGAAAGTGACGAAGCGAACTATGCTTGGGTCACGACCAACTATCTCCT CGGAAACTTTGACCCAGGCAATGATGAAAAGCAATTTGTCGGTGCCTTGG ATCTCGGAGGTGGCAGTATGCAAATCGTATTTCATGACAATGGAGACATC GATGACTACATCACAAGCCCTCCTGAACCGAATGATTCATCCGATGCAGA ACACACTGAACAGAAGGGAATATTCCCCTCTTCGGAAACCCATATTGACA TCTTCGGCCAGAGATACAAGCTTCATGCGCGAAATCACCTCGGGCTCGGT TTAGTCAACTTCAAGAAAACCCTATATGGCATCTTTGATCATGAGGGTGT TTTGGAGGAGGGAAACCCGTGCTTCCGGATGGGGCAGAAGTTCAAGAGCG CGAAGCTGCGAATCCATAAACCGAGCTTGGAGGAAACGAAGGTTGTGAGC ATTGTTGGAGACGGTGATTTTGAACGGTGTGTGGCCAGTGCTGAAATTGC CATATCTTCCGTCAGCCGTCTAAATGACAAACGCAGTCATCTCCCAGATC GAAACAATTTCTATGCTTTCGCGTACTTCTATGATAAGACAGTGAAGTTG GGACTAAGTTCGAAGCTGTCGAAGAAGGAAATGCTAGAAAAAGGGAAAGA ATTGTGTGAAGAGAGTAAAGGAGATGGACCAGCAGACTTTGATGAATCCT GTGCAGAGTTTTCCTACATTTTTGCTGTCTTGAAGATTCTCACAGATGAT TTCTTGGAATCAAAATCTAATGTCACTTTTGAGCAATATGTAAATGGACA TATGTTAGGATGGGCTCTAGGTGCTGTTCTTGATACTCTTCAGCCGGACG TCATTGCAAAACAAATCGCTGTGGAATCAGAATCATTACTAATGACATAA back to top
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