Gcaud2473.t1 (mRNA) Gracilaria caudata M_176_S67 male

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Overview


Name	Gcaud2473.t1
Unique Name	Gcaud2473.t1
Type	mRNA
Organism	Gracilaria caudata M_176_S67 male (Gracilaria caudata M_176_S67 male)
Sequence length	1044

Alignments

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
NODE_1056_length_14488_cov_4.591929	contig	NODE_1056_length_14488_cov_4.591929:2484..5732 -

Analyses

This mRNA is derived from or has results from the following analyses


Analysis Name	Date Performed
Gracilaria caudata M_176_S67 male OGS1.0	2022-05-09

Properties


Property Name	Value
Seed ortholog	130081.XP_005704597.1
Preferred name	ATP2A2
PFAMs	Cation_ATPase,Cation_ATPase_C,Cation_ATPase_N,E1-E2_ATPase,Hydrolase,Hydrolase_3
Max annot lvl	2759\|Eukaryota
KEGG ko	ko:K01535,ko:K01537,ko:K05853
KEGG TC	3.A.3.2,3.A.3.3
KEGG Pathway	ko00190,ko04020,ko04022,ko04972,ko05010,map00190,map04020,map04022,map04972,map05010
GOs	GO:0000003,GO:0000041,GO:0000166,GO:0001505,GO:0001664,GO:0002026,GO:0002027,GO:0002064,GO:0002065,GO:0002066,GO:0002119,GO:0002164,GO:0002237,GO:0003006,GO:0003008,GO:0003012,GO:0003013,GO:0003015,GO:0003299,GO:0003300,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003682,GO:0003824,GO:0005102,GO:0005215,GO:0005338,GO:0005384,GO:0005388,GO:0005488,GO:0005509,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005635,GO:0005654,GO:0005737,GO:0005768,GO:0005783,GO:0005789,GO:0005793,GO:0005794,GO:0005802,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006082,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006635,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006816,GO:0006828,GO:0006873,GO:0006874,GO:0006875,GO:0006915,GO:0006937,GO:0006942,GO:0006950,GO:0006952,GO:0006979,GO:0006984,GO:0006986,GO:0006996,GO:0007005,GO:0007009,GO:0007154,GO:0007155,GO:0007165,GO:0007267,GO:0007268,GO:0007274,GO:0007275,GO:0007276,GO:0007281,GO:0007292,GO:0007568,GO:0007610,GO:0007626,GO:0007629,GO:0008015,GO:0008016,GO:0008022,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008219,GO:0008324,GO:0008340,GO:0008344,GO:0008544,GO:0008610,GO:0008637,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009062,GO:0009605,GO:0009607,GO:0009617,GO:0009719,GO:0009725,GO:0009790,GO:0009791,GO:0009792,GO:0009888,GO:0009892,GO:0009898,GO:0009987,GO:0010033,GO:0010243,GO:0010256,GO:0010259,GO:0010460,GO:0010468,GO:0010605,GO:0010629,GO:0010646,GO:0010882,GO:0010883,GO:0010884,GO:0010959,GO:0012501,GO:0012505,GO:0012506,GO:0014724,GO:0014733,GO:0014801,GO:0014819,GO:0014883,GO:0014887,GO:0014888,GO:0014896,GO:0014897,GO:0014898,GO:0015075,GO:0015085,GO:0015318,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015410,GO:0015662,GO:0015931,GO:0015932,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016042,GO:0016043,GO:0016054,GO:0016462,GO:0016528,GO:0016529,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017076,GO:0017111,GO:0017157,GO:0017158,GO:0019222,GO:0019395,GO:0019722,GO:0019725,GO:0019752,GO:0019829,GO:0019897,GO:0019898,GO:0019899,GO:0019932,GO:0019953,GO:0022412,GO:0022414,GO:0022610,GO:0022622,GO:0022804,GO:0022853,GO:0022857,GO:0022890,GO:0022898,GO:0023051,GO:0023052,GO:0030001,GO:0030003,GO:0030016,GO:0030017,GO:0030104,GO:0030154,GO:0030258,GO:0030322,GO:0030534,GO:0030554,GO:0030707,GO:0030855,GO:0030968,GO:0031090,GO:0031094,GO:0031095,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031234,GO:0031410,GO:0031446,GO:0031448,GO:0031490,GO:0031672,GO:0031673,GO:0031674,GO:0031775,GO:0031967,GO:0031974,GO:0031975,GO:0031981,GO:0031982,GO:0031984,GO:0032386,GO:0032409,GO:0032411,GO:0032412,GO:0032414,GO:0032469,GO:0032470,GO:0032471,GO:0032496,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032504,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032781,GO:0032787,GO:0032879,GO:0032970,GO:0032991,GO:0033017,GO:0033292,GO:0033554,GO:0033993,GO:0034220,GO:0034440,GO:0034599,GO:0034620,GO:0034702,GO:0034703,GO:0034704,GO:0034762,GO:0034764,GO:0034765,GO:0034767,GO:0034976,GO:0035556,GO:0035639,GO:0035966,GO:0035967,GO:0036094,GO:0036335,GO:0040024,GO:0042175,GO:0042221,GO:0042391,GO:0042493,GO:0042592,GO:0042623,GO:0042625,GO:0042626,GO:0042692,GO:0042742,GO:0042802,GO:0042803,GO:0043085,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043207,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043233,GO:0043269,GO:0043270,GO:0043292,GO:0043434,GO:0043436,GO:0043462,GO:0043492,GO:0043500,GO:0043502,GO:0044057,GO:0044093,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044242,GO:0044248,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044428,GO:0044431,GO:0044432,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044449,GO:0044459,GO:0044464,GO:0044548,GO:0044703,GO:0045202,GO:0045822,GO:0045823,GO:0045932,GO:0045933,GO:0045988,GO:0045989,GO:0046395,GO:0046872,GO:0046873,GO:0046907,GO:0046915,GO:0046928,GO:0046983,GO:0048364,GO:0048468,GO:0048471,GO:0048477,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048583,GO:0048609,GO:0048731,GO:0048856,GO:0048863,GO:0048869,GO:0048872,GO:0048878,GO:0050789,GO:0050790,GO:0050794,GO:0050801,GO:0050804,GO:0050829,GO:0050896,GO:0051046,GO:0051049,GO:0051050,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051235,GO:0051239,GO:0051240,GO:0051241,GO:0051270,GO:0051282,GO:0051336,GO:0051345,GO:0051560,GO:0051561,GO:0051588,GO:0051640,GO:0051641,GO:0051646,GO:0051649,GO:0051651,GO:0051657,GO:0051659,GO:0051704,GO:0051707,GO:0051716,GO:0051924,GO:0051928,GO:0055001,GO:0055065,GO:0055071,GO:0055074,GO:0055076,GO:0055080,GO:0055082,GO:0055085,GO:0055114,GO:0055117,GO:0055119,GO:0060047,GO:0060255,GO:0060341,GO:0060401,GO:0060429,GO:0060627,GO:0061024,GO:0061061,GO:0065007,GO:0065008,GO:0065009,GO:0070013,GO:0070059,GO:0070296,GO:0070509,GO:0070588,GO:0070838,GO:0070887,GO:0071310,GO:0071421,GO:0071702,GO:0071704,GO:0071705,GO:0071840,GO:0071944,GO:0072329,GO:0072503,GO:0072507,GO:0072511,GO:0086004,GO:0086036,GO:0086039,GO:0090075,GO:0090076,GO:0090257,GO:0090533,GO:0090534,GO:0090662,GO:0097159,GO:0097190,GO:0097193,GO:0097367,GO:0097470,GO:0097708,GO:0098533,GO:0098542,GO:0098552,GO:0098562,GO:0098588,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:0098693,GO:0098771,GO:0098791,GO:0098796,GO:0098827,GO:0098900,GO:0098901,GO:0098909,GO:0098916,GO:0099080,GO:0099081,GO:0099131,GO:0099132,GO:0099177,GO:0099402,GO:0099512,GO:0099536,GO:0099537,GO:1901019,GO:1901021,GO:1901264,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901505,GO:1901575,GO:1901576,GO:1901652,GO:1901698,GO:1901700,GO:1901894,GO:1901896,GO:1902494,GO:1902495,GO:1902803,GO:1903115,GO:1903169,GO:1903233,GO:1903305,GO:1903515,GO:1903522,GO:1903523,GO:1903524,GO:1903530,GO:1903779,GO:1904062,GO:1904064,GO:1904427,GO:1904949,GO:1905952,GO:1905954,GO:1990036,GO:1990351,GO:1990845,GO:2000300
Evalue	0.0
EggNOG OGs	COG0474@1\|root,KOG0202@2759\|Eukaryota
EC	3.6.3.6,3.6.3.8
Description	calcium-transporting ATPase activity
COG category	P
BRITE	ko00000,ko00001,ko01000

Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
Gcaud2473	Gcaud2473	Gracilaria caudata M_176_S67 male	gene	NODE_1056_length_14488_cov_4.591929 2484..5732 -

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
Gcaud2473.t1	Gcaud2473.t1	Gracilaria caudata M_176_S67 male	polypeptide	NODE_1056_length_14488_cov_4.591929 2484..5732 -

The following stop_codon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
Gcaud2473.t1.stop1	Gcaud2473.t1.stop1	Gracilaria caudata M_176_S67 male	stop_codon	NODE_1056_length_14488_cov_4.591929 2484..2486 -

The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
Gcaud2473.t1.CDS1	Gcaud2473.t1.CDS1	Gracilaria caudata M_176_S67 male	CDS	NODE_1056_length_14488_cov_4.591929 2484..2609 -
Gcaud2473.t1.CDS2	Gcaud2473.t1.CDS2	Gracilaria caudata M_176_S67 male	CDS	NODE_1056_length_14488_cov_4.591929 2727..5732 -

The following exon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
Gcaud2473.t1.exon1	Gcaud2473.t1.exon1	Gracilaria caudata M_176_S67 male	exon	NODE_1056_length_14488_cov_4.591929 2484..2609 -
Gcaud2473.t1.exon2	Gcaud2473.t1.exon2	Gracilaria caudata M_176_S67 male	exon	NODE_1056_length_14488_cov_4.591929 2727..5732 -

The following intron feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
Gcaud2473.t1.intron1	Gcaud2473.t1.intron1	Gracilaria caudata M_176_S67 male	intron	NODE_1056_length_14488_cov_4.591929 2610..2726 -

The following start_codon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
Gcaud2473.t1.start1	Gcaud2473.t1.start1	Gracilaria caudata M_176_S67 male	start_codon	NODE_1056_length_14488_cov_4.591929 5730..5732 -

Sequences

The following sequences are available for this feature:

mRNA sequence
mRNA - spliced transcript sequence
protein sequence
mRNA from alignment at NODE_1056_length_14488_cov_4.591929:2484..5732-
coding sequence from alignment at NODE_1056_length_14488_cov_4.591929:2484..5732-

mRNA sequence

>Gcaud2473.t1 ID=Gcaud2473.t1|Name=Gcaud2473.t1|organism=Gracilaria caudata M_176_S67 male|type=mRNA|length=1044bp
MVESMDAVLSAPWAAAPLEVMAALEVEEHAGLAESEVTARRDKHGWNTIP
PRQGKSLFKLVLEQFQDQLVIILLLAAVVSFVLAFFEEGHNRLQAFFEPL
VILLILIANAIVGVLQERNAENAIEALKEYEPETANVLRAGIKSVLKAAE
LVPGDIVEVAVGEKVPADMRIVSLQSSVLLADQSIVTGESLSVSKTTTKL
PSIDGNAVVQDKKCMLFSGSTISRGKCTCVVTTTGVNTEIGMIHSNIIEE
DDSPTPLKIKLDEFGEFLSKVILVICILVWMVNIGNFRSHGGILNGAVYY
FKIAVALAVAAIPEGLPAVVTTCLALGTKTMAKKNAIVRHLPSVETLGCT
TVICSDKTGTLTTNMMSVQRIVVADGIDNETGRVRMKDIAVSGNNLDPEG
VFTDVETSEKTEALAATNSIYAEMAEISTLCNDSSLVYDTENKHYGRIGE
GTEVALTVLAEKAGVPDAATNESRRYASPADKTSICRKYWLDRSEKLVTF
EFTRDRKSMSVLVGEKGNASQTRLLVKGAPESVLERCAYMRTVSGKTVEL
DADMKQQFESEVTRLSGGSSALRVLAVAVRENAPGLGDYDLKDTSQFASY
ESDLTLVGVVGMLDPPREEVRDAIAICRDAGIRVIVITGDNKATAEAICR
RIGVFDENEDLTGKSYTGREFDALKEGEQKSAVQRAALFARVEPQHKQRL
VDLLRSQKEVVAMSGDGVNDAPALKKADIGIAMGSGTAVAKEVSSMVLAD
DNFATIVAAVEEGRSIYANMKQFIRYLISSNIGEVWCIFLTALLRMPEAL
IPVQLLWVNLVTDGLPATALSFNKASKDIMTQKPRGLSDSIIDSWMFFRY
MAIGTYVGIGTVGGFAWWYMFYEDGPKMSWYDMTHFSSCTEQVGRGWSCS
VFEQRNASTVALTILVLIEMLNAFNSLSENQSLLTMTPLTNPLLIVACFM
SIALHFVILYVPFFAQIFSVVPLSKLEWMGVISMSLPVIVLDEILKLVSR
KYVGCGQRRVPYQHVGDVTLQSEHGNRRECFREALNASERLTY*

spliced messenger RNA

>Gcaud2473.t1 ID=Gcaud2473.t1|Name=Gcaud2473.t1|organism=Gracilaria caudata M_176_S67 male|type=mRNA|length=3132bp|location=Sequence derived from alignment at NODE_1056_length_14488_cov_4.591929:2484..5732- (Gracilaria caudata M_176_S67 male)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.  
ATGGTAGAATCCATGGATGCTGTACTAAGTGCTCCCTGGGCCGCAGCGCC
TCTGGAGGTAATGGCTGCGCTGGAAGTCGAAGAACATGCTGGTCTTGCTG
AGTCCGAGGTCACCGCTCGGCGCGACAAACACGGATGGAATACCATTCCA
CCTCGCCAAGGGAAATCCTTGTTCAAACTAGTATTGGAACAGTTTCAGGA
TCAGCTTGTTATCATTCTTTTGTTGGCGGCAGTCGTGTCCTTCGTATTGG
CGTTCTTTGAAGAAGGGCACAATCGCCTCCAGGCGTTTTTTGAACCATTG
GTTATCTTGCTCATTCTCATCGCTAACGCTATCGTGGGAGTGCTGCAGGA
GAGGAATGCTGAGAACGCTATCGAAGCCCTTAAGGAGTATGAACCTGAAA
CTGCTAATGTCTTGCGTGCTGGTATCAAGTCAGTCTTGAAGGCTGCCGAA
TTGGTACCAGGCGATATTGTGGAAGTTGCCGTTGGCGAGAAGGTACCAGC
TGATATGCGTATCGTTTCGTTGCAGAGTTCCGTGTTGCTCGCTGATCAGA
GTATTGTTACAGGTGAGAGTCTTAGTGTTTCAAAGACAACAACCAAGCTT
CCGTCCATCGATGGAAATGCTGTCGTCCAAGATAAGAAGTGCATGCTCTT
CAGTGGGAGCACCATCAGCCGAGGGAAGTGTACCTGTGTTGTCACCACCA
CAGGTGTCAACACTGAGATTGGTATGATCCATTCCAATATCATTGAGGAA
GATGACAGTCCTACTCCTCTAAAGATTAAGCTCGACGAATTTGGAGAGTT
TTTGTCCAAGGTTATTCTTGTTATCTGCATTCTAGTTTGGATGGTTAACA
TCGGGAACTTCCGCTCCCATGGGGGAATCCTCAATGGTGCGGTTTACTAC
TTCAAAATTGCAGTCGCTCTGGCTGTTGCTGCCATTCCGGAAGGTTTGCC
TGCCGTCGTAACTACATGCCTGGCACTTGGCACTAAGACAATGGCCAAGA
AGAACGCCATCGTGAGACATTTACCTTCCGTTGAGACTCTCGGATGCACA
ACTGTGATATGCTCTGACAAAACCGGAACGCTGACGACTAATATGATGAG
TGTGCAGCGAATTGTTGTAGCTGATGGCATCGACAATGAAACTGGACGAG
TTCGCATGAAAGATATTGCTGTTTCAGGGAACAACCTTGATCCGGAGGGT
GTATTTACTGACGTCGAAACATCTGAAAAGACTGAAGCGCTTGCAGCCAC
GAATTCCATCTACGCTGAAATGGCGGAGATCTCTACCCTTTGCAATGATT
CTTCGCTAGTTTATGATACGGAGAACAAGCACTACGGTCGTATTGGAGAA
GGCACTGAAGTTGCCCTCACCGTCCTTGCAGAGAAAGCTGGTGTTCCTGA
TGCAGCCACAAATGAGTCTCGAAGATATGCCAGCCCCGCAGACAAGACTT
CGATATGTCGAAAGTACTGGCTCGATAGATCAGAGAAGCTTGTCACATTC
GAGTTCACCCGTGACCGTAAGAGTATGTCCGTTCTTGTGGGAGAGAAGGG
TAACGCCTCGCAAACTCGTCTGCTCGTCAAAGGTGCCCCAGAATCCGTCT
TGGAGAGGTGTGCGTACATGAGAACTGTGAGCGGGAAAACGGTTGAACTC
GATGCTGACATGAAACAGCAGTTTGAGTCAGAAGTCACAAGGTTGAGCGG
AGGCTCTAGTGCCCTTCGCGTGTTAGCTGTGGCAGTGCGAGAAAATGCCC
CTGGTCTTGGAGACTATGACTTGAAAGACACATCCCAGTTTGCCTCGTAC
GAGAGCGATCTTACCCTTGTGGGTGTGGTTGGTATGCTAGACCCGCCTCG
TGAGGAAGTAAGAGACGCCATTGCGATCTGTCGAGATGCTGGGATTCGAG
TAATCGTAATCACTGGAGACAACAAGGCGACCGCGGAAGCTATCTGCCGC
CGTATTGGTGTGTTTGACGAGAACGAAGATCTCACTGGGAAATCCTACAC
CGGCAGAGAATTTGACGCGCTCAAAGAAGGGGAGCAGAAGTCTGCGGTTC
AGCGCGCGGCTCTATTTGCCAGAGTTGAACCTCAACATAAGCAGAGACTG
GTAGATCTACTTCGTAGTCAGAAGGAAGTGGTAGCCATGTCTGGAGATGG
AGTGAACGATGCCCCTGCCTTGAAGAAGGCCGACATTGGTATAGCTATGG
GATCTGGTACCGCAGTAGCCAAAGAAGTGTCCTCAATGGTTCTCGCAGAT
GACAATTTTGCCACTATTGTGGCTGCTGTTGAAGAGGGTCGCTCCATATA
CGCGAATATGAAGCAATTCATTCGATATCTTATCAGTTCTAACATTGGAG
AAGTATGGTGCATTTTCCTGACGGCCTTGCTTCGTATGCCGGAGGCCCTG
ATTCCCGTACAATTGCTATGGGTCAATCTCGTAACCGATGGACTACCCGC
CACCGCCCTTAGCTTCAACAAGGCTAGCAAAGACATTATGACTCAGAAGC
CTCGAGGTTTGAGCGACAGCATCATCGATTCCTGGATGTTTTTCCGATAC
ATGGCCATCGGAACCTACGTGGGAATTGGTACCGTTGGTGGATTCGCGTG
GTGGTATATGTTTTATGAGGATGGACCAAAGATGTCTTGGTACGATATGA
CCCACTTCAGCTCATGCACAGAGCAAGTGGGAAGAGGCTGGTCCTGCAGC
GTCTTCGAACAGCGAAATGCCAGCACAGTTGCGCTTACGATACTTGTGCT
TATCGAAATGCTGAACGCTTTCAACAGCCTATCTGAGAACCAGAGCTTGT
TAACGATGACGCCGCTTACGAACCCTTTGCTCATCGTTGCTTGTTTCATG
AGTATTGCTCTTCATTTTGTTATATTGTATGTTCCGTTCTTCGCTCAGAT
TTTCTCTGTGGTTCCATTGAGCAAACTGGAATGGATGGGAGTTATCTCCA
TGAGTCTTCCCGTCATTGTCTTGGATGAAATACTGAAGCTTGTGTCAAGG
AAATATGTGGGCTGTGGGCAAAGAAGAGTTCCCTATCAACACGTTGGAGA
CGTTACGCTTCAGAGCGAACACGGGAATAGAAGGGAGTGTTTCAGGGAGG
CTCTAAACGCTTCGGAACGCTTGACTTACTGA

protein sequence of Gcaud2473.t1

>Gcaud2473.t1 ID=Gcaud2473.t1|Name=Gcaud2473.t1|organism=Gracilaria caudata M_176_S67 male|type=polypeptide|length=1044bp
MVESMDAVLSAPWAAAPLEVMAALEVEEHAGLAESEVTARRDKHGWNTIP
PRQGKSLFKLVLEQFQDQLVIILLLAAVVSFVLAFFEEGHNRLQAFFEPL
VILLILIANAIVGVLQERNAENAIEALKEYEPETANVLRAGIKSVLKAAE
LVPGDIVEVAVGEKVPADMRIVSLQSSVLLADQSIVTGESLSVSKTTTKL
PSIDGNAVVQDKKCMLFSGSTISRGKCTCVVTTTGVNTEIGMIHSNIIEE
DDSPTPLKIKLDEFGEFLSKVILVICILVWMVNIGNFRSHGGILNGAVYY
FKIAVALAVAAIPEGLPAVVTTCLALGTKTMAKKNAIVRHLPSVETLGCT
TVICSDKTGTLTTNMMSVQRIVVADGIDNETGRVRMKDIAVSGNNLDPEG
VFTDVETSEKTEALAATNSIYAEMAEISTLCNDSSLVYDTENKHYGRIGE
GTEVALTVLAEKAGVPDAATNESRRYASPADKTSICRKYWLDRSEKLVTF
EFTRDRKSMSVLVGEKGNASQTRLLVKGAPESVLERCAYMRTVSGKTVEL
DADMKQQFESEVTRLSGGSSALRVLAVAVRENAPGLGDYDLKDTSQFASY
ESDLTLVGVVGMLDPPREEVRDAIAICRDAGIRVIVITGDNKATAEAICR
RIGVFDENEDLTGKSYTGREFDALKEGEQKSAVQRAALFARVEPQHKQRL
VDLLRSQKEVVAMSGDGVNDAPALKKADIGIAMGSGTAVAKEVSSMVLAD
DNFATIVAAVEEGRSIYANMKQFIRYLISSNIGEVWCIFLTALLRMPEAL
IPVQLLWVNLVTDGLPATALSFNKASKDIMTQKPRGLSDSIIDSWMFFRY
MAIGTYVGIGTVGGFAWWYMFYEDGPKMSWYDMTHFSSCTEQVGRGWSCS
VFEQRNASTVALTILVLIEMLNAFNSLSENQSLLTMTPLTNPLLIVACFM
SIALHFVILYVPFFAQIFSVVPLSKLEWMGVISMSLPVIVLDEILKLVSR
KYVGCGQRRVPYQHVGDVTLQSEHGNRRECFREALNASERLTY*

mRNA from alignment at NODE_1056_length_14488_cov_4.591929:2484..5732-

Legend: polypeptideCDSexonstart_codonintronstop_codon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>Gcaud2473.t1 ID=Gcaud2473.t1|Name=Gcaud2473.t1|organism=Gracilaria caudata M_176_S67 male|type=mRNA|length=3249bp|location=Sequence derived from alignment at NODE_1056_length_14488_cov_4.591929:2484..5732- (Gracilaria caudata M_176_S67 male)
ATGGTAGAATCCATGGATGCTGTACTAAGTGCTCCCTGGGCCGCAGCGCC
TCTGGAGGTAATGGCTGCGCTGGAAGTCGAAGAACATGCTGGTCTTGCTG
AGTCCGAGGTCACCGCTCGGCGCGACAAACACGGATGGAATACCATTCCA
CCTCGCCAAGGGAAATCCTTGTTCAAACTAGTATTGGAACAGTTTCAGGA
TCAGCTTGTTATCATTCTTTTGTTGGCGGCAGTCGTGTCCTTCGTATTGG
CGTTCTTTGAAGAAGGGCACAATCGCCTCCAGGCGTTTTTTGAACCATTG
GTTATCTTGCTCATTCTCATCGCTAACGCTATCGTGGGAGTGCTGCAGGA
GAGGAATGCTGAGAACGCTATCGAAGCCCTTAAGGAGTATGAACCTGAAA
CTGCTAATGTCTTGCGTGCTGGTATCAAGTCAGTCTTGAAGGCTGCCGAA
TTGGTACCAGGCGATATTGTGGAAGTTGCCGTTGGCGAGAAGGTACCAGC
TGATATGCGTATCGTTTCGTTGCAGAGTTCCGTGTTGCTCGCTGATCAGA
GTATTGTTACAGGTGAGAGTCTTAGTGTTTCAAAGACAACAACCAAGCTT
CCGTCCATCGATGGAAATGCTGTCGTCCAAGATAAGAAGTGCATGCTCTT
CAGTGGGAGCACCATCAGCCGAGGGAAGTGTACCTGTGTTGTCACCACCA
CAGGTGTCAACACTGAGATTGGTATGATCCATTCCAATATCATTGAGGAA
GATGACAGTCCTACTCCTCTAAAGATTAAGCTCGACGAATTTGGAGAGTT
TTTGTCCAAGGTTATTCTTGTTATCTGCATTCTAGTTTGGATGGTTAACA
TCGGGAACTTCCGCTCCCATGGGGGAATCCTCAATGGTGCGGTTTACTAC
TTCAAAATTGCAGTCGCTCTGGCTGTTGCTGCCATTCCGGAAGGTTTGCC
TGCCGTCGTAACTACATGCCTGGCACTTGGCACTAAGACAATGGCCAAGA
AGAACGCCATCGTGAGACATTTACCTTCCGTTGAGACTCTCGGATGCACA
ACTGTGATATGCTCTGACAAAACCGGAACGCTGACGACTAATATGATGAG
TGTGCAGCGAATTGTTGTAGCTGATGGCATCGACAATGAAACTGGACGAG
TTCGCATGAAAGATATTGCTGTTTCAGGGAACAACCTTGATCCGGAGGGT
GTATTTACTGACGTCGAAACATCTGAAAAGACTGAAGCGCTTGCAGCCAC
GAATTCCATCTACGCTGAAATGGCGGAGATCTCTACCCTTTGCAATGATT
CTTCGCTAGTTTATGATACGGAGAACAAGCACTACGGTCGTATTGGAGAA
GGCACTGAAGTTGCCCTCACCGTCCTTGCAGAGAAAGCTGGTGTTCCTGA
TGCAGCCACAAATGAGTCTCGAAGATATGCCAGCCCCGCAGACAAGACTT
CGATATGTCGAAAGTACTGGCTCGATAGATCAGAGAAGCTTGTCACATTC
GAGTTCACCCGTGACCGTAAGAGTATGTCCGTTCTTGTGGGAGAGAAGGG
TAACGCCTCGCAAACTCGTCTGCTCGTCAAAGGTGCCCCAGAATCCGTCT
TGGAGAGGTGTGCGTACATGAGAACTGTGAGCGGGAAAACGGTTGAACTC
GATGCTGACATGAAACAGCAGTTTGAGTCAGAAGTCACAAGGTTGAGCGG
AGGCTCTAGTGCCCTTCGCGTGTTAGCTGTGGCAGTGCGAGAAAATGCCC
CTGGTCTTGGAGACTATGACTTGAAAGACACATCCCAGTTTGCCTCGTAC
GAGAGCGATCTTACCCTTGTGGGTGTGGTTGGTATGCTAGACCCGCCTCG
TGAGGAAGTAAGAGACGCCATTGCGATCTGTCGAGATGCTGGGATTCGAG
TAATCGTAATCACTGGAGACAACAAGGCGACCGCGGAAGCTATCTGCCGC
CGTATTGGTGTGTTTGACGAGAACGAAGATCTCACTGGGAAATCCTACAC
CGGCAGAGAATTTGACGCGCTCAAAGAAGGGGAGCAGAAGTCTGCGGTTC
AGCGCGCGGCTCTATTTGCCAGAGTTGAACCTCAACATAAGCAGAGACTG
GTAGATCTACTTCGTAGTCAGAAGGAAGTGGTAGCCATGTCTGGAGATGG
AGTGAACGATGCCCCTGCCTTGAAGAAGGCCGACATTGGTATAGCTATGG
GATCTGGTACCGCAGTAGCCAAAGAAGTGTCCTCAATGGTTCTCGCAGAT
GACAATTTTGCCACTATTGTGGCTGCTGTTGAAGAGGGTCGCTCCATATA
CGCGAATATGAAGCAATTCATTCGATATCTTATCAGTTCTAACATTGGAG
AAGTATGGTGCATTTTCCTGACGGCCTTGCTTCGTATGCCGGAGGCCCTG
ATTCCCGTACAATTGCTATGGGTCAATCTCGTAACCGATGGACTACCCGC
CACCGCCCTTAGCTTCAACAAGGCTAGCAAAGACATTATGACTCAGAAGC
CTCGAGGTTTGAGCGACAGCATCATCGATTCCTGGATGTTTTTCCGATAC
ATGGCCATCGGAACCTACGTGGGAATTGGTACCGTTGGTGGATTCGCGTG
GTGGTATATGTTTTATGAGGATGGACCAAAGATGTCTTGGTACGATATGA
CCCACTTCAGCTCATGCACAGAGCAAGTGGGAAGAGGCTGGTCCTGCAGC
GTCTTCGAACAGCGAAATGCCAGCACAGTTGCGCTTACGATACTTGTGCT
TATCGAAATGCTGAACGCTTTCAACAGCCTATCTGAGAACCAGAGCTTGT
TAACGATGACGCCGCTTACGAACCCTTTGCTCATCGTTGCTTGTTTCATG
AGTATTGCTCTTCATTTTGTTATATTGTATGTTCCGTTCTTCGCTCAGAT
TTTCTCTGTGGTTCCATTGAGCAAACTGGAATGGATGGGAGTTATCTCCA
TGAGTCTTCCCGTCATTGTCTTGGATGAAATACTGAAGCTTGTGTCAAGG
AAATATGTAAGCGACAATAAGAAGAGACAATAGATTTTTGGTTGAGATTC
CCTGGTTTACTACTACATGTACATCGATTTTGTATGTTCTGTTTATCTTG
GAACTGGTGTTCAAATTTTGCAGGTGGGCTGTGGGCAAAGAAGAGTTCCC
TATCAACACGTTGGAGACGTTACGCTTCAGAGCGAACACGGGAATAGAAG
GGAGTGTTTCAGGGAGGCTCTAAACGCTTCGGAACGCTTGACTTACTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at NODE_1056_length_14488_cov_4.591929:2484..5732-

>Gcaud2473.t1 ID=Gcaud2473.t1|Name=Gcaud2473.t1|organism=Gracilaria caudata M_176_S67 male|type=CDS|length=3132bp|location=Sequence derived from alignment at NODE_1056_length_14488_cov_4.591929:2484..5732- (Gracilaria caudata M_176_S67 male)
ATGGTAGAATCCATGGATGCTGTACTAAGTGCTCCCTGGGCCGCAGCGCC
TCTGGAGGTAATGGCTGCGCTGGAAGTCGAAGAACATGCTGGTCTTGCTG
AGTCCGAGGTCACCGCTCGGCGCGACAAACACGGATGGAATACCATTCCA
CCTCGCCAAGGGAAATCCTTGTTCAAACTAGTATTGGAACAGTTTCAGGA
TCAGCTTGTTATCATTCTTTTGTTGGCGGCAGTCGTGTCCTTCGTATTGG
CGTTCTTTGAAGAAGGGCACAATCGCCTCCAGGCGTTTTTTGAACCATTG
GTTATCTTGCTCATTCTCATCGCTAACGCTATCGTGGGAGTGCTGCAGGA
GAGGAATGCTGAGAACGCTATCGAAGCCCTTAAGGAGTATGAACCTGAAA
CTGCTAATGTCTTGCGTGCTGGTATCAAGTCAGTCTTGAAGGCTGCCGAA
TTGGTACCAGGCGATATTGTGGAAGTTGCCGTTGGCGAGAAGGTACCAGC
TGATATGCGTATCGTTTCGTTGCAGAGTTCCGTGTTGCTCGCTGATCAGA
GTATTGTTACAGGTGAGAGTCTTAGTGTTTCAAAGACAACAACCAAGCTT
CCGTCCATCGATGGAAATGCTGTCGTCCAAGATAAGAAGTGCATGCTCTT
CAGTGGGAGCACCATCAGCCGAGGGAAGTGTACCTGTGTTGTCACCACCA
CAGGTGTCAACACTGAGATTGGTATGATCCATTCCAATATCATTGAGGAA
GATGACAGTCCTACTCCTCTAAAGATTAAGCTCGACGAATTTGGAGAGTT
TTTGTCCAAGGTTATTCTTGTTATCTGCATTCTAGTTTGGATGGTTAACA
TCGGGAACTTCCGCTCCCATGGGGGAATCCTCAATGGTGCGGTTTACTAC
TTCAAAATTGCAGTCGCTCTGGCTGTTGCTGCCATTCCGGAAGGTTTGCC
TGCCGTCGTAACTACATGCCTGGCACTTGGCACTAAGACAATGGCCAAGA
AGAACGCCATCGTGAGACATTTACCTTCCGTTGAGACTCTCGGATGCACA
ACTGTGATATGCTCTGACAAAACCGGAACGCTGACGACTAATATGATGAG
TGTGCAGCGAATTGTTGTAGCTGATGGCATCGACAATGAAACTGGACGAG
TTCGCATGAAAGATATTGCTGTTTCAGGGAACAACCTTGATCCGGAGGGT
GTATTTACTGACGTCGAAACATCTGAAAAGACTGAAGCGCTTGCAGCCAC
GAATTCCATCTACGCTGAAATGGCGGAGATCTCTACCCTTTGCAATGATT
CTTCGCTAGTTTATGATACGGAGAACAAGCACTACGGTCGTATTGGAGAA
GGCACTGAAGTTGCCCTCACCGTCCTTGCAGAGAAAGCTGGTGTTCCTGA
TGCAGCCACAAATGAGTCTCGAAGATATGCCAGCCCCGCAGACAAGACTT
CGATATGTCGAAAGTACTGGCTCGATAGATCAGAGAAGCTTGTCACATTC
GAGTTCACCCGTGACCGTAAGAGTATGTCCGTTCTTGTGGGAGAGAAGGG
TAACGCCTCGCAAACTCGTCTGCTCGTCAAAGGTGCCCCAGAATCCGTCT
TGGAGAGGTGTGCGTACATGAGAACTGTGAGCGGGAAAACGGTTGAACTC
GATGCTGACATGAAACAGCAGTTTGAGTCAGAAGTCACAAGGTTGAGCGG
AGGCTCTAGTGCCCTTCGCGTGTTAGCTGTGGCAGTGCGAGAAAATGCCC
CTGGTCTTGGAGACTATGACTTGAAAGACACATCCCAGTTTGCCTCGTAC
GAGAGCGATCTTACCCTTGTGGGTGTGGTTGGTATGCTAGACCCGCCTCG
TGAGGAAGTAAGAGACGCCATTGCGATCTGTCGAGATGCTGGGATTCGAG
TAATCGTAATCACTGGAGACAACAAGGCGACCGCGGAAGCTATCTGCCGC
CGTATTGGTGTGTTTGACGAGAACGAAGATCTCACTGGGAAATCCTACAC
CGGCAGAGAATTTGACGCGCTCAAAGAAGGGGAGCAGAAGTCTGCGGTTC
AGCGCGCGGCTCTATTTGCCAGAGTTGAACCTCAACATAAGCAGAGACTG
GTAGATCTACTTCGTAGTCAGAAGGAAGTGGTAGCCATGTCTGGAGATGG
AGTGAACGATGCCCCTGCCTTGAAGAAGGCCGACATTGGTATAGCTATGG
GATCTGGTACCGCAGTAGCCAAAGAAGTGTCCTCAATGGTTCTCGCAGAT
GACAATTTTGCCACTATTGTGGCTGCTGTTGAAGAGGGTCGCTCCATATA
CGCGAATATGAAGCAATTCATTCGATATCTTATCAGTTCTAACATTGGAG
AAGTATGGTGCATTTTCCTGACGGCCTTGCTTCGTATGCCGGAGGCCCTG
ATTCCCGTACAATTGCTATGGGTCAATCTCGTAACCGATGGACTACCCGC
CACCGCCCTTAGCTTCAACAAGGCTAGCAAAGACATTATGACTCAGAAGC
CTCGAGGTTTGAGCGACAGCATCATCGATTCCTGGATGTTTTTCCGATAC
ATGGCCATCGGAACCTACGTGGGAATTGGTACCGTTGGTGGATTCGCGTG
GTGGTATATGTTTTATGAGGATGGACCAAAGATGTCTTGGTACGATATGA
CCCACTTCAGCTCATGCACAGAGCAAGTGGGAAGAGGCTGGTCCTGCAGC
GTCTTCGAACAGCGAAATGCCAGCACAGTTGCGCTTACGATACTTGTGCT
TATCGAAATGCTGAACGCTTTCAACAGCCTATCTGAGAACCAGAGCTTGT
TAACGATGACGCCGCTTACGAACCCTTTGCTCATCGTTGCTTGTTTCATG
AGTATTGCTCTTCATTTTGTTATATTGTATGTTCCGTTCTTCGCTCAGAT
TTTCTCTGTGGTTCCATTGAGCAAACTGGAATGGATGGGAGTTATCTCCA
TGAGTCTTCCCGTCATTGTCTTGGATGAAATACTGAAGCTTGTGTCAAGG
AAATATGTGGGCTGTGGGCAAAGAAGAGTTCCCTATCAACACGTTGGAGA
CGTTACGCTTCAGAGCGAACACGGGAATAGAAGGGAGTGTTTCAGGGAGG
CTCTAAACGCTTCGGAACGCTTGACTTACTGA