Gcaud1652.t1 (mRNA) Gracilaria caudata M_176_S67 male

You are viewing an mRNA, more information available on the corresponding polypeptide page

Overview
NameGcaud1652.t1
Unique NameGcaud1652.t1
TypemRNA
OrganismGracilaria caudata M_176_S67 male (Gracilaria caudata M_176_S67 male)
Sequence length663
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
NODE_34_length_72082_cov_4.421108contigNODE_34_length_72082_cov_4.421108:37951..39939 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Gracilaria caudata M_176_S67 male OGS1.02022-05-09
Properties
Property NameValue
Seed ortholog130081.XP_005707456.1
Preferred nameHSPA5
PFAMsHSP70
Max annot lvl2759|Eukaryota
KEGG koko:K03283,ko:K09490
KEGG TC1.A.33,1.A.33.1
KEGG Pathwayko03040,ko03060,ko04010,ko04141,ko04144,ko04213,ko04612,ko04915,ko04918,ko05020,ko05134,ko05145,ko05162,ko05164,ko05169,map03040,map03060,map04010,map04141,map04144,map04213,map04612,map04915,map04918,map05020,map05134,map05145,map05162,map05164,map05169
KEGG ModuleM00353,M00355
GOsGO:0000003,GO:0000082,GO:0000166,GO:0000271,GO:0000278,GO:0000323,GO:0000325,GO:0000741,GO:0000742,GO:0000746,GO:0000747,GO:0000902,GO:0000904,GO:0000974,GO:0001085,GO:0001655,GO:0001664,GO:0001822,GO:0001910,GO:0001912,GO:0001914,GO:0001916,GO:0001917,GO:0002682,GO:0002684,GO:0002697,GO:0002699,GO:0002703,GO:0002705,GO:0002706,GO:0002708,GO:0002709,GO:0002711,GO:0002819,GO:0002821,GO:0002822,GO:0002824,GO:0003006,GO:0003008,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003824,GO:0005102,GO:0005488,GO:0005504,GO:0005509,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005576,GO:0005615,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005635,GO:0005654,GO:0005730,GO:0005737,GO:0005739,GO:0005764,GO:0005765,GO:0005773,GO:0005774,GO:0005775,GO:0005776,GO:0005783,GO:0005788,GO:0005789,GO:0005790,GO:0005791,GO:0005793,GO:0005794,GO:0005829,GO:0005856,GO:0005874,GO:0005882,GO:0005886,GO:0005911,GO:0005938,GO:0005975,GO:0005976,GO:0006073,GO:0006355,GO:0006357,GO:0006457,GO:0006464,GO:0006468,GO:0006508,GO:0006511,GO:0006518,GO:0006605,GO:0006606,GO:0006612,GO:0006613,GO:0006614,GO:0006616,GO:0006620,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006810,GO:0006886,GO:0006897,GO:0006913,GO:0006914,GO:0006915,GO:0006928,GO:0006950,GO:0006983,GO:0006984,GO:0006986,GO:0006996,GO:0006997,GO:0007017,GO:0007018,GO:0007033,GO:0007040,GO:0007049,GO:0007154,GO:0007165,GO:0007275,GO:0007399,GO:0007417,GO:0007420,GO:0007517,GO:0007519,GO:0007568,GO:0007600,GO:0007606,GO:0007608,GO:0008021,GO:0008088,GO:0008104,GO:0008134,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008219,GO:0008289,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009250,GO:0009266,GO:0009267,GO:0009272,GO:0009314,GO:0009408,GO:0009410,GO:0009506,GO:0009507,GO:0009536,GO:0009605,GO:0009607,GO:0009628,GO:0009636,GO:0009653,GO:0009705,GO:0009719,GO:0009725,GO:0009735,GO:0009790,GO:0009792,GO:0009826,GO:0009856,GO:0009860,GO:0009888,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009891,GO:0009892,GO:0009893,GO:0009932,GO:0009966,GO:0009968,GO:0009986,GO:0009987,GO:0009991,GO:0010033,GO:0010035,GO:0010038,GO:0010042,GO:0010045,GO:0010212,GO:0010243,GO:0010332,GO:0010383,GO:0010466,GO:0010468,GO:0010498,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010558,GO:0010604,GO:0010605,GO:0010608,GO:0010628,GO:0010629,GO:0010646,GO:0010648,GO:0010656,GO:0010660,GO:0010662,GO:0010664,GO:0010665,GO:0010667,GO:0010720,GO:0010941,GO:0010951,GO:0010970,GO:0010975,GO:0010976,GO:0012501,GO:0012505,GO:0014069,GO:0014070,GO:0014074,GO:0014706,GO:0014823,GO:0015031,GO:0015630,GO:0015833,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016043,GO:0016049,GO:0016051,GO:0016191,GO:0016192,GO:0016246,GO:0016310,GO:0016441,GO:0016458,GO:0016462,GO:0016592,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017015,GO:0017038,GO:0017076,GO:0017111,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019538,GO:0019899,GO:0019904,GO:0019941,GO:0019953,GO:0021549,GO:0021575,GO:0021577,GO:0021587,GO:0021589,GO:0021680,GO:0021695,GO:0022008,GO:0022037,GO:0022402,GO:0022411,GO:0022414,GO:0023051,GO:0023052,GO:0023057,GO:0030054,GO:0030100,GO:0030133,GO:0030154,GO:0030162,GO:0030163,GO:0030176,GO:0030182,GO:0030312,GO:0030334,GO:0030335,GO:0030424,GO:0030425,GO:0030431,GO:0030433,GO:0030496,GO:0030512,GO:0030554,GO:0030705,GO:0030900,GO:0030902,GO:0030968,GO:0031047,GO:0031090,GO:0031204,GO:0031224,GO:0031227,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031328,GO:0031341,GO:0031343,GO:0031344,GO:0031346,GO:0031396,GO:0031398,GO:0031399,GO:0031401,GO:0031406,GO:0031410,GO:0031625,GO:0031667,GO:0031668,GO:0031669,GO:0031685,GO:0031686,GO:0031965,GO:0031967,GO:0031974,GO:0031975,GO:0031981,GO:0031982,GO:0031984,GO:0032091,GO:0032268,GO:0032269,GO:0032270,GO:0032279,GO:0032355,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032504,GO:0032507,GO:0032541,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032570,GO:0032879,GO:0032940,GO:0032984,GO:0032989,GO:0032991,GO:0033036,GO:0033218,GO:0033267,GO:0033293,GO:0033365,GO:0033554,GO:0033692,GO:0033993,GO:0034097,GO:0034099,GO:0034406,GO:0034504,GO:0034605,GO:0034613,GO:0034620,GO:0034637,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034663,GO:0034975,GO:0034976,GO:0035194,GO:0035437,GO:0035639,GO:0035690,GO:0035966,GO:0035967,GO:0036003,GO:0036094,GO:0036211,GO:0036335,GO:0036465,GO:0036477,GO:0036498,GO:0036499,GO:0036500,GO:0036503,GO:0040007,GO:0040012,GO:0040017,GO:0040019,GO:0040029,GO:0042026,GO:0042149,GO:0042175,GO:0042220,GO:0042221,GO:0042277,GO:0042493,GO:0042546,GO:0042592,GO:0042594,GO:0042623,GO:0042698,GO:0042886,GO:0042981,GO:0042995,GO:0043005,GO:0043021,GO:0043022,GO:0043025,GO:0043066,GO:0043067,GO:0043069,GO:0043085,GO:0043086,GO:0043154,GO:0043161,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043177,GO:0043195,GO:0043197,GO:0043198,GO:0043202,GO:0043204,GO:0043209,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043230,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043233,GO:0043279,GO:0043281,GO:0043393,GO:0043412,GO:0043496,GO:0043531,GO:0043603,GO:0043618,GO:0043620,GO:0043624,GO:0043632,GO:0043679,GO:0043933,GO:0044036,GO:0044038,GO:0044042,GO:0044085,GO:0044092,GO:0044093,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044257,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0044265,GO:0044267,GO:0044297,GO:0044306,GO:0044309,GO:0044389,GO:0044421,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044428,GO:0044430,GO:0044432,GO:0044437,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044448,GO:0044451,GO:0044456,GO:0044463,GO:0044464,GO:0044703,GO:0044706,GO:0044743,GO:0044764,GO:0044770,GO:0044772,GO:0044843,GO:0044849,GO:0044877,GO:0045047,GO:0045111,GO:0045121,GO:0045184,GO:0045185,GO:0045202,GO:0045471,GO:0045595,GO:0045597,GO:0045664,GO:0045666,GO:0045807,GO:0045861,GO:0045862,GO:0045892,GO:0045893,GO:0045934,GO:0045935,GO:0045944,GO:0045995,GO:0046677,GO:0046683,GO:0046686,GO:0046689,GO:0046777,GO:0046872,GO:0046903,GO:0046907,GO:0048284,GO:0048468,GO:0048471,GO:0048488,GO:0048511,GO:0048513,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0048532,GO:0048545,GO:0048583,GO:0048584,GO:0048585,GO:0048588,GO:0048589,GO:0048609,GO:0048699,GO:0048731,GO:0048856,GO:0048868,GO:0048869,GO:0048872,GO:0050542,GO:0050764,GO:0050766,GO:0050767,GO:0050769,GO:0050776,GO:0050778,GO:0050789,GO:0050790,GO:0050793,GO:0050794,GO:0050877,GO:0050896,GO:0051049,GO:0051050,GO:0051082,GO:0051087,GO:0051094,GO:0051098,GO:0051100,GO:0051128,GO:0051130,GO:0051169,GO:0051170,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051173,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051235,GO:0051239,GO:0051240,GO:0051246,GO:0051247,GO:0051248,GO:0051252,GO:0051253,GO:0051254,GO:0051261,GO:0051270,GO:0051272,GO:0051273,GO:0051274,GO:0051278,GO:0051336,GO:0051346,GO:0051402,GO:0051591,GO:0051592,GO:0051603,GO:0051641,GO:0051649,GO:0051651,GO:0051704,GO:0051716,GO:0051787,GO:0051960,GO:0051962,GO:0052547,GO:0052548,GO:0055044,GO:0055085,GO:0060255,GO:0060284,GO:0060322,GO:0060359,GO:0060537,GO:0060538,GO:0060548,GO:0060560,GO:0060627,GO:0060904,GO:0061024,GO:0061061,GO:0061077,GO:0061083,GO:0061635,GO:0061684,GO:0061741,GO:0061919,GO:0065002,GO:0065007,GO:0065008,GO:0065009,GO:0070013,GO:0070062,GO:0070382,GO:0070589,GO:0070592,GO:0070670,GO:0070727,GO:0070848,GO:0070879,GO:0070880,GO:0070887,GO:0070972,GO:0070997,GO:0071214,GO:0071216,GO:0071236,GO:0071241,GO:0071248,GO:0071276,GO:0071277,GO:0071287,GO:0071310,GO:0071320,GO:0071345,GO:0071353,GO:0071363,GO:0071407,GO:0071417,GO:0071478,GO:0071479,GO:0071480,GO:0071495,GO:0071496,GO:0071554,GO:0071702,GO:0071704,GO:0071705,GO:0071782,GO:0071806,GO:0071840,GO:0071852,GO:0071944,GO:0071966,GO:0072001,GO:0072318,GO:0072319,GO:0072321,GO:0072347,GO:0072594,GO:0072595,GO:0072599,GO:0072657,GO:0080090,GO:0080134,GO:0080135,GO:0080171,GO:0090074,GO:0090092,GO:0090101,GO:0090150,GO:0090287,GO:0090288,GO:0090559,GO:0097038,GO:0097159,GO:0097212,GO:0097213,GO:0097214,GO:0097305,GO:0097367,GO:0097447,GO:0097458,GO:0097501,GO:0097708,GO:0098588,GO:0098589,GO:0098657,GO:0098793,GO:0098794,GO:0098805,GO:0098827,GO:0098852,GO:0098857,GO:0098984,GO:0099003,GO:0099020,GO:0099021,GO:0099080,GO:0099081,GO:0099111,GO:0099503,GO:0099504,GO:0099512,GO:0099513,GO:0099522,GO:0099523,GO:0099524,GO:0099568,GO:0099572,GO:0104004,GO:0120025,GO:0120035,GO:0120038,GO:0150034,GO:1900101,GO:1900102,GO:1900407,GO:1900408,GO:1901031,GO:1901032,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901567,GO:1901575,GO:1901576,GO:1901654,GO:1901698,GO:1901699,GO:1901700,GO:1901701,GO:1901998,GO:1902074,GO:1902679,GO:1902680,GO:1902882,GO:1902883,GO:1903047,GO:1903201,GO:1903202,GO:1903205,GO:1903206,GO:1903320,GO:1903322,GO:1903332,GO:1903334,GO:1903506,GO:1903507,GO:1903508,GO:1903561,GO:1903573,GO:1903844,GO:1903845,GO:1903891,GO:1903894,GO:1903895,GO:1903897,GO:1904313,GO:1904592,GO:1904593,GO:1904764,GO:1905710,GO:1905897,GO:1990089,GO:1990090,GO:1990124,GO:1990440,GO:1990832,GO:1990833,GO:1990834,GO:1990836,GO:1990904,GO:2000026,GO:2000112,GO:2000113,GO:2000116,GO:2000117,GO:2000145,GO:2000147,GO:2001023,GO:2001024,GO:2001038,GO:2001039,GO:2001141
Evalue2.64e-306
EggNOG OGsCOG0443@1|root,KOG0100@2759|Eukaryota
DescriptionATP binding
COG categoryO
BRITEko00000,ko00001,ko00002,ko01009,ko03009,ko03029,ko03041,ko03051,ko03110,ko04131,ko04147,ko04516
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Gcaud1652Gcaud1652Gracilaria caudata M_176_S67 malegeneNODE_34_length_72082_cov_4.421108 37951..39939 -


The following stop_codon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Gcaud1652.t1.stop1Gcaud1652.t1.stop1Gracilaria caudata M_176_S67 malestop_codonNODE_34_length_72082_cov_4.421108 37951..37953 -


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Gcaud1652.t1.CDS1Gcaud1652.t1.CDS1Gracilaria caudata M_176_S67 maleCDSNODE_34_length_72082_cov_4.421108 37951..39939 -


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Gcaud1652.t1.exon1Gcaud1652.t1.exon1Gracilaria caudata M_176_S67 maleexonNODE_34_length_72082_cov_4.421108 37951..39939 -


The following start_codon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Gcaud1652.t1.start1Gcaud1652.t1.start1Gracilaria caudata M_176_S67 malestart_codonNODE_34_length_72082_cov_4.421108 39937..39939 -


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
Gcaud1652.t1Gcaud1652.t1Gracilaria caudata M_176_S67 malepolypeptideNODE_34_length_72082_cov_4.421108 37951..39939 -


Sequences
The following sequences are available for this feature:

mRNA sequence

>Gcaud1652.t1 ID=Gcaud1652.t1|Name=Gcaud1652.t1|organism=Gracilaria caudata M_176_S67 male|type=mRNA|length=663bp
MSVPSFKRQTAFFLLFASLIIACTATTENVGTVIGIDLGTTYSCVGVMQN
GQVEIIANDQGNRITPSYVAFTSEERLIGDAAKNQAAMNPVNTVFDVKRL
IGRKYTDATVQRDKKLLPYKIVNQGDKPMISIDVKGEEKTFSPEQISAMV
LGKMKKTAEEYLGKEVKNAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRII
NEPTAAAIAYGLNKKGEKNILVFDLGGGTFDVTLLTIDDGVFEVLATNGD
THLGGEDFDQRVMDYMMKLFKRKYGKDLSKDKRALAKLRRECEKAKRALS
SQTQVRIEIESLFDGQDFSETLTRARFEELNSDLFRRTLKPVEKVLKDAD
MTKGQVHEVVLVGGSTRIPKVQQLVSDFFNGKAPSKGINPDEAVAYGAAV
QAGILSGDGGETTDNIVLVDVAPLSLGIETVGGVMSKIIPRNSKVPASKS
QTFTTYQDNQEVVSIQVYEGERAMTKDCHMLGKFDLSGIRKAPRGDPQIL
VTFDVDANGILSVAAEEKGASNKESITITNDKGRLSEEEIERMVREAEEM
KEEDEKIKKKVEAKNHLENFIFTVKGTLEEKEKLEDKVDDGDIEALESAV
KEAQEWLDTEADDADAEDIESRLNDLKEIAEPIMKKVGGGQGGAGGAPEE
EDDDDDDAHEEL*
back to top

spliced messenger RNA

>Gcaud1652.t1 ID=Gcaud1652.t1|Name=Gcaud1652.t1|organism=Gracilaria caudata M_176_S67 male|type=mRNA|length=1989bp|location=Sequence derived from alignment at NODE_34_length_72082_cov_4.421108:37951..39939- (Gracilaria caudata M_176_S67 male)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.  
ATGTCCGTTCCTTCGTTCAAACGCCAAACGGCGTTCTTTTTGTTGTTCGC
TTCTCTCATTATCGCCTGTACGGCCACTACCGAAAATGTAGGTACCGTCA
TCGGGATTGATCTGGGAACCACCTACTCATGCGTCGGCGTAATGCAAAAT
GGTCAGGTTGAAATCATCGCTAATGACCAGGGCAACCGCATCACCCCTTC
ATATGTAGCCTTCACCTCTGAAGAGCGATTAATCGGAGATGCCGCCAAGA
ACCAGGCCGCCATGAATCCCGTCAACACTGTGTTCGATGTCAAGCGTCTC
ATCGGGCGCAAGTACACTGACGCCACTGTGCAACGCGACAAGAAACTCTT
GCCGTACAAGATCGTTAACCAGGGTGACAAGCCTATGATTTCTATCGACG
TCAAGGGAGAGGAGAAAACTTTCTCTCCGGAACAGATTTCCGCTATGGTT
CTTGGAAAGATGAAGAAGACCGCCGAAGAGTACCTTGGTAAGGAGGTTAA
GAACGCAGTCGTTACCGTCCCGGCCTACTTCAATGATGCCCAGAGACAGG
CCACCAAAGATGCGGGTACAATTGCTGGCCTTAACGTCATGCGTATTATC
AACGAACCCACTGCGGCCGCTATCGCTTACGGCCTCAACAAGAAGGGTGA
GAAGAACATTCTGGTCTTCGATCTCGGTGGCGGTACCTTTGATGTCACTC
TTCTCACCATCGATGACGGAGTGTTCGAAGTGCTTGCTACCAACGGAGAT
ACTCACCTTGGTGGAGAAGATTTCGATCAGAGAGTCATGGACTACATGAT
GAAGCTCTTCAAGCGCAAGTACGGAAAGGACTTGTCCAAGGACAAGCGTG
CTCTTGCCAAGCTTCGCCGTGAATGTGAGAAGGCTAAGCGCGCTCTTTCT
TCCCAGACTCAGGTGCGCATTGAAATTGAGTCTCTCTTCGACGGTCAGGA
CTTCTCCGAGACTCTCACTCGCGCTAGGTTTGAGGAACTCAACTCTGACT
TGTTCAGACGTACGCTGAAGCCCGTCGAAAAGGTGCTCAAGGATGCTGAC
ATGACCAAGGGCCAGGTCCACGAAGTTGTGCTTGTCGGAGGTTCCACTCG
TATCCCGAAGGTGCAGCAGCTTGTCAGTGACTTCTTCAATGGAAAGGCTC
CGAGCAAGGGTATCAATCCCGATGAGGCTGTTGCCTACGGCGCCGCTGTT
CAGGCCGGTATCCTCTCTGGTGATGGCGGTGAGACTACTGACAACATCGT
GTTAGTTGACGTTGCCCCGCTCTCTCTCGGTATTGAGACTGTTGGTGGTG
TCATGAGCAAGATTATTCCGCGTAACTCAAAGGTGCCTGCCAGCAAAAGT
CAGACTTTCACCACTTACCAGGACAACCAGGAAGTCGTCAGTATCCAGGT
GTATGAGGGTGAACGTGCCATGACCAAGGACTGTCATATGCTGGGTAAGT
TTGACCTGAGCGGTATCCGCAAGGCACCACGAGGGGATCCTCAGATCCTT
GTTACCTTTGATGTTGATGCGAATGGTATCCTCAGTGTAGCTGCTGAAGA
GAAGGGCGCATCCAACAAGGAAAGCATCACTATCACAAACGACAAGGGCA
GACTCTCTGAGGAAGAGATCGAACGTATGGTTCGTGAAGCCGAGGAAATG
AAGGAGGAAGACGAAAAGATCAAGAAGAAGGTGGAGGCGAAGAACCACCT
TGAGAACTTCATCTTCACTGTCAAGGGTACTCTGGAAGAGAAGGAAAAGC
TCGAGGACAAGGTCGATGACGGAGATATCGAAGCGCTCGAGTCTGCCGTG
AAGGAAGCGCAGGAATGGTTGGACACCGAAGCTGATGATGCCGATGCTGA
GGACATTGAGTCACGGTTGAACGACCTTAAGGAAATAGCGGAACCTATTA
TGAAGAAGGTTGGTGGTGGTCAAGGAGGCGCTGGTGGCGCTCCTGAAGAA
GAGGACGATGATGATGATGATGCCCATGAGGAATTGTAG
back to top

protein sequence of Gcaud1652.t1

>Gcaud1652.t1 ID=Gcaud1652.t1|Name=Gcaud1652.t1|organism=Gracilaria caudata M_176_S67 male|type=polypeptide|length=663bp
MSVPSFKRQTAFFLLFASLIIACTATTENVGTVIGIDLGTTYSCVGVMQN
GQVEIIANDQGNRITPSYVAFTSEERLIGDAAKNQAAMNPVNTVFDVKRL
IGRKYTDATVQRDKKLLPYKIVNQGDKPMISIDVKGEEKTFSPEQISAMV
LGKMKKTAEEYLGKEVKNAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRII
NEPTAAAIAYGLNKKGEKNILVFDLGGGTFDVTLLTIDDGVFEVLATNGD
THLGGEDFDQRVMDYMMKLFKRKYGKDLSKDKRALAKLRRECEKAKRALS
SQTQVRIEIESLFDGQDFSETLTRARFEELNSDLFRRTLKPVEKVLKDAD
MTKGQVHEVVLVGGSTRIPKVQQLVSDFFNGKAPSKGINPDEAVAYGAAV
QAGILSGDGGETTDNIVLVDVAPLSLGIETVGGVMSKIIPRNSKVPASKS
QTFTTYQDNQEVVSIQVYEGERAMTKDCHMLGKFDLSGIRKAPRGDPQIL
VTFDVDANGILSVAAEEKGASNKESITITNDKGRLSEEEIERMVREAEEM
KEEDEKIKKKVEAKNHLENFIFTVKGTLEEKEKLEDKVDDGDIEALESAV
KEAQEWLDTEADDADAEDIESRLNDLKEIAEPIMKKVGGGQGGAGGAPEE
EDDDDDDAHEEL*
back to top

mRNA from alignment at NODE_34_length_72082_cov_4.421108:37951..39939-

Legend: polypeptideCDSexonstart_codonstop_codon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Gcaud1652.t1 ID=Gcaud1652.t1|Name=Gcaud1652.t1|organism=Gracilaria caudata M_176_S67 male|type=mRNA|length=1989bp|location=Sequence derived from alignment at NODE_34_length_72082_cov_4.421108:37951..39939- (Gracilaria caudata M_176_S67 male)
ATGTCCGTTCCTTCGTTCAAACGCCAAACGGCGTTCTTTTTGTTGTTCGC
TTCTCTCATTATCGCCTGTACGGCCACTACCGAAAATGTAGGTACCGTCA
TCGGGATTGATCTGGGAACCACCTACTCATGCGTCGGCGTAATGCAAAAT
GGTCAGGTTGAAATCATCGCTAATGACCAGGGCAACCGCATCACCCCTTC
ATATGTAGCCTTCACCTCTGAAGAGCGATTAATCGGAGATGCCGCCAAGA
ACCAGGCCGCCATGAATCCCGTCAACACTGTGTTCGATGTCAAGCGTCTC
ATCGGGCGCAAGTACACTGACGCCACTGTGCAACGCGACAAGAAACTCTT
GCCGTACAAGATCGTTAACCAGGGTGACAAGCCTATGATTTCTATCGACG
TCAAGGGAGAGGAGAAAACTTTCTCTCCGGAACAGATTTCCGCTATGGTT
CTTGGAAAGATGAAGAAGACCGCCGAAGAGTACCTTGGTAAGGAGGTTAA
GAACGCAGTCGTTACCGTCCCGGCCTACTTCAATGATGCCCAGAGACAGG
CCACCAAAGATGCGGGTACAATTGCTGGCCTTAACGTCATGCGTATTATC
AACGAACCCACTGCGGCCGCTATCGCTTACGGCCTCAACAAGAAGGGTGA
GAAGAACATTCTGGTCTTCGATCTCGGTGGCGGTACCTTTGATGTCACTC
TTCTCACCATCGATGACGGAGTGTTCGAAGTGCTTGCTACCAACGGAGAT
ACTCACCTTGGTGGAGAAGATTTCGATCAGAGAGTCATGGACTACATGAT
GAAGCTCTTCAAGCGCAAGTACGGAAAGGACTTGTCCAAGGACAAGCGTG
CTCTTGCCAAGCTTCGCCGTGAATGTGAGAAGGCTAAGCGCGCTCTTTCT
TCCCAGACTCAGGTGCGCATTGAAATTGAGTCTCTCTTCGACGGTCAGGA
CTTCTCCGAGACTCTCACTCGCGCTAGGTTTGAGGAACTCAACTCTGACT
TGTTCAGACGTACGCTGAAGCCCGTCGAAAAGGTGCTCAAGGATGCTGAC
ATGACCAAGGGCCAGGTCCACGAAGTTGTGCTTGTCGGAGGTTCCACTCG
TATCCCGAAGGTGCAGCAGCTTGTCAGTGACTTCTTCAATGGAAAGGCTC
CGAGCAAGGGTATCAATCCCGATGAGGCTGTTGCCTACGGCGCCGCTGTT
CAGGCCGGTATCCTCTCTGGTGATGGCGGTGAGACTACTGACAACATCGT
GTTAGTTGACGTTGCCCCGCTCTCTCTCGGTATTGAGACTGTTGGTGGTG
TCATGAGCAAGATTATTCCGCGTAACTCAAAGGTGCCTGCCAGCAAAAGT
CAGACTTTCACCACTTACCAGGACAACCAGGAAGTCGTCAGTATCCAGGT
GTATGAGGGTGAACGTGCCATGACCAAGGACTGTCATATGCTGGGTAAGT
TTGACCTGAGCGGTATCCGCAAGGCACCACGAGGGGATCCTCAGATCCTT
GTTACCTTTGATGTTGATGCGAATGGTATCCTCAGTGTAGCTGCTGAAGA
GAAGGGCGCATCCAACAAGGAAAGCATCACTATCACAAACGACAAGGGCA
GACTCTCTGAGGAAGAGATCGAACGTATGGTTCGTGAAGCCGAGGAAATG
AAGGAGGAAGACGAAAAGATCAAGAAGAAGGTGGAGGCGAAGAACCACCT
TGAGAACTTCATCTTCACTGTCAAGGGTACTCTGGAAGAGAAGGAAAAGC
TCGAGGACAAGGTCGATGACGGAGATATCGAAGCGCTCGAGTCTGCCGTG
AAGGAAGCGCAGGAATGGTTGGACACCGAAGCTGATGATGCCGATGCTGA
GGACATTGAGTCACGGTTGAACGACCTTAAGGAAATAGCGGAACCTATTA
TGAAGAAGGTTGGTGGTGGTCAAGGAGGCGCTGGTGGCGCTCCTGAAGAA
GAGGACGATGATGATGATGATGCCCATGAGGAATTGTAG
back to top

Coding sequence (CDS) from alignment at NODE_34_length_72082_cov_4.421108:37951..39939-

>Gcaud1652.t1 ID=Gcaud1652.t1|Name=Gcaud1652.t1|organism=Gracilaria caudata M_176_S67 male|type=CDS|length=1989bp|location=Sequence derived from alignment at NODE_34_length_72082_cov_4.421108:37951..39939- (Gracilaria caudata M_176_S67 male)
ATGTCCGTTCCTTCGTTCAAACGCCAAACGGCGTTCTTTTTGTTGTTCGC
TTCTCTCATTATCGCCTGTACGGCCACTACCGAAAATGTAGGTACCGTCA
TCGGGATTGATCTGGGAACCACCTACTCATGCGTCGGCGTAATGCAAAAT
GGTCAGGTTGAAATCATCGCTAATGACCAGGGCAACCGCATCACCCCTTC
ATATGTAGCCTTCACCTCTGAAGAGCGATTAATCGGAGATGCCGCCAAGA
ACCAGGCCGCCATGAATCCCGTCAACACTGTGTTCGATGTCAAGCGTCTC
ATCGGGCGCAAGTACACTGACGCCACTGTGCAACGCGACAAGAAACTCTT
GCCGTACAAGATCGTTAACCAGGGTGACAAGCCTATGATTTCTATCGACG
TCAAGGGAGAGGAGAAAACTTTCTCTCCGGAACAGATTTCCGCTATGGTT
CTTGGAAAGATGAAGAAGACCGCCGAAGAGTACCTTGGTAAGGAGGTTAA
GAACGCAGTCGTTACCGTCCCGGCCTACTTCAATGATGCCCAGAGACAGG
CCACCAAAGATGCGGGTACAATTGCTGGCCTTAACGTCATGCGTATTATC
AACGAACCCACTGCGGCCGCTATCGCTTACGGCCTCAACAAGAAGGGTGA
GAAGAACATTCTGGTCTTCGATCTCGGTGGCGGTACCTTTGATGTCACTC
TTCTCACCATCGATGACGGAGTGTTCGAAGTGCTTGCTACCAACGGAGAT
ACTCACCTTGGTGGAGAAGATTTCGATCAGAGAGTCATGGACTACATGAT
GAAGCTCTTCAAGCGCAAGTACGGAAAGGACTTGTCCAAGGACAAGCGTG
CTCTTGCCAAGCTTCGCCGTGAATGTGAGAAGGCTAAGCGCGCTCTTTCT
TCCCAGACTCAGGTGCGCATTGAAATTGAGTCTCTCTTCGACGGTCAGGA
CTTCTCCGAGACTCTCACTCGCGCTAGGTTTGAGGAACTCAACTCTGACT
TGTTCAGACGTACGCTGAAGCCCGTCGAAAAGGTGCTCAAGGATGCTGAC
ATGACCAAGGGCCAGGTCCACGAAGTTGTGCTTGTCGGAGGTTCCACTCG
TATCCCGAAGGTGCAGCAGCTTGTCAGTGACTTCTTCAATGGAAAGGCTC
CGAGCAAGGGTATCAATCCCGATGAGGCTGTTGCCTACGGCGCCGCTGTT
CAGGCCGGTATCCTCTCTGGTGATGGCGGTGAGACTACTGACAACATCGT
GTTAGTTGACGTTGCCCCGCTCTCTCTCGGTATTGAGACTGTTGGTGGTG
TCATGAGCAAGATTATTCCGCGTAACTCAAAGGTGCCTGCCAGCAAAAGT
CAGACTTTCACCACTTACCAGGACAACCAGGAAGTCGTCAGTATCCAGGT
GTATGAGGGTGAACGTGCCATGACCAAGGACTGTCATATGCTGGGTAAGT
TTGACCTGAGCGGTATCCGCAAGGCACCACGAGGGGATCCTCAGATCCTT
GTTACCTTTGATGTTGATGCGAATGGTATCCTCAGTGTAGCTGCTGAAGA
GAAGGGCGCATCCAACAAGGAAAGCATCACTATCACAAACGACAAGGGCA
GACTCTCTGAGGAAGAGATCGAACGTATGGTTCGTGAAGCCGAGGAAATG
AAGGAGGAAGACGAAAAGATCAAGAAGAAGGTGGAGGCGAAGAACCACCT
TGAGAACTTCATCTTCACTGTCAAGGGTACTCTGGAAGAGAAGGAAAAGC
TCGAGGACAAGGTCGATGACGGAGATATCGAAGCGCTCGAGTCTGCCGTG
AAGGAAGCGCAGGAATGGTTGGACACCGAAGCTGATGATGCCGATGCTGA
GGACATTGAGTCACGGTTGAACGACCTTAAGGAAATAGCGGAACCTATTA
TGAAGAAGGTTGGTGGTGGTCAAGGAGGCGCTGGTGGCGCTCCTGAAGAA
GAGGACGATGATGATGATGATGCCCATGAGGAATTGTAG
back to top