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Homology
BLAST of mRNA_F-serratus_M_contig1122.1126.1 vs. uniprot
Match: A0A6H5JG30_9PHAE (Protein kinase domain-containing protein n=1 Tax=Ectocarpus sp. CCAP 1310/34 TaxID=867726 RepID=A0A6H5JG30_9PHAE) HSP 1 Score: 95.5 bits (236), Expect = 3.410e-17 Identity = 100/281 (35.59%), Postives = 125/281 (44.48%), Query Frame = 1
Query: 517 LFLPRGLLDDISMGHSKRLKPALKSHSI-------SAQDDSQKLSQRELELEAMEICDRAAQLRELEDLVRLERLDRFKQEDFLRGALCGEGKHALVYRAV-----GIANPVRGARGAKHMGISATFEEVLIAT-ASSVTDEIVSAA---LSMMSCTFTSETVRNAEVPAVVAATCAAMAAVVVAHIIDKATAEAVVREAEEGVH-SLVFAAKEFRCGRPQTPASILWDARREVGMHLRLRDCDRVVALRGVWFTPRVTLLFDLMEEGSLFHFIHDYTDKG 1308
L LP G L+DI + LKP + + + QRE +E E DRAA L EL LVR + LDR+ +DF R AL GEG+H++VYR G G G + A E AT A V I++AA + M T S+ E+ V AE + V AAKEFR R P SIL A REV MHLR+ DC VVALRGVW PRVT+L + M EG+L F+ +G
Sbjct: 787 LGLPLGFLNDI-VERRASLKPVTTAQITPMEVKIGGGKSEVASRLQREWGVER-EARDRAAALLELTALVRAKALDRYDPDDFSREALFGEGRHSVVYRVSATRPWGATGRFEGHPGGRPATKGARLREAAAATMARKVNTAILTAAETGVVSMEVTNLSKAAVAEEITVVXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXSAENDENIGTVLAAKEFRYMRADAPESILRQAHREVCMHLRVSDCVNVVALRGVWVLPRVTILLEPMHEGNLHGFVRARAAEG 1065
BLAST of mRNA_F-serratus_M_contig1122.1126.1 vs. uniprot
Match: D7G881_ECTSI (Amino acid-binding ACT n=1 Tax=Ectocarpus siliculosus TaxID=2880 RepID=D7G881_ECTSI) HSP 1 Score: 86.7 bits (213), Expect = 1.770e-14 Identity = 81/223 (36.32%), Postives = 110/223 (49.33%), Query Frame = 1
Query: 658 EICDRAAQLRELEDLVRLERLDRFKQEDFLRGALCGEGKHALVYRAVGIANPVRGARGAKH-MGISATFEEVLIATASSVTDEIVSAALSMMSCTFTSETVRNAEVPAVVAATCAAMAAVVVAH------------IIDKATAEAVVREAEEGVHSLVFAAKEFRCGRPQTPASILWDARREVGMHLRLRDCDRVVALRGVWFTPRVTLLFDLMEEGSLFHFI 1287
E DRAA L EL LVR + L+R+ DF R + GEG+H++VYR + R H G AT +L A+++ E+ +A L+ S ++ V VV A ++ TA A RE ++ + + V AAKEFR R P SIL A REV MHLR+ DC VVA+RGVW PRVT+L + M G+L F+
Sbjct: 204 EARDRAAALLELTALVRAKALNRYDPGDFSREVVFGEGRHSVVYRVSATRSCGATGRLEDHPCGRPATKGAMLREAAATMAREVSTAILAAAEXXXVS--MKETNVSKVVVAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXVVIPVTAVAS-RENDKNIGT-VLAAKEFRYTRADAPESILRQAHREVCMHLRVSDCAHVVAVRGVWVLPRVTILLEPMHGGNLHGFL 422
The following BLAST results are available for this feature:
Alignments
The following features are aligned
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Taxonomic scope | Eukaryota |
| Seed ortholog score | 89.0 |
| Seed ortholog evalue | 6.2e-15 |
| Seed eggNOG ortholog | 2880.D7G881 |
| Preferred name | NTRK2 |
| KEGG ko | ko:K01315,ko:K02355,ko:K03176,ko:K04360,ko:K05101,ko:K05122,ko:K05123,ko:K05127,ko:K05129,ko:K08252,ko:K08899,ko:K16353 |
| KEGG Pathway | ko04010,ko04014,ko04080,ko04151,ko04210,ko04610,ko04722,ko04750,ko05034,ko05150,ko05164,ko05200,ko05202,ko05216,ko05230,map04010,map04014,map04080,map04151,map04210,map04610,map04722,map04750,map05034,map05150,map05164,map05200,map05202,map05216,map05230 |
| Hectar predicted targeting category | other localisation |
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2060,GO:0042063,GO:0042113,GO:0042127,GO:0042221,GO:0042325,GO:0042326,GO:0042327,GO:0042330,GO:0042461,GO:0042462,GO:0042471,GO:0042472,GO:0042490,GO:0042493,GO:0042592,GO:0042641,GO:0042733,GO:0042802,GO:0042803,GO:0042813,GO:0042981,GO:0042995,GO:0043005,GO:0043009,GO:0043010,GO:0043025,GO:0043065,GO:0043066,GO:0043067,GO:0043068,GO:0043069,GO:0043085,GO:0043087,GO:0043113,GO:0043121,GO:0043122,GO:0043123,GO:0043170,GO:0043195,GO:0043197,GO:0043200,GO:0043204,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043235,GO:0043405,GO:0043406,GO:0043408,GO:0043410,GO:0043412,GO:0043506,GO:0043507,GO:0043523,GO:0043524,GO:0043525,GO:0043547,GO:0043549,GO:0043583,GO:0043679,GO:0044003,GO:0044068,GO:0044087,GO:0044089,GO:0044093,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044297,GO:0044298,GO:0044306,GO:0044309,GO:0044403,GO:0044419,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044430,GO:0044431,GO:0044433,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044456,GO:0044459,GO:0044463,GO:0044464,GO:0045137,GO:0045165,GO:0045196,GO:0045197,GO:0045198,GO:0045200,GO:0045202,GO:0045211,GO:0045321,GO:0045334,GO:0045471,GO:0045595,GO:0045596,GO:0045597,GO:0045637,GO:0045639,GO:0045649,GO:0045651,GO:0045664,GO:0045666,GO:0045685,GO:0045686,GO:0045765,GO:0045766,GO:0045773,GO:0045859,GO:0045860,GO:0045887,GO:0045893,GO:0045927,GO:0045935,GO:0045936,GO:0045937,GO:0045995,GO:0046328,GO:0046330,GO:0046530,GO:0046546,GO:0046548,GO:0046578,GO:0046579,GO:0046649,GO:0046660,GO:0046661,GO:0046677,GO:0046716,GO:0046717,GO:0046777,GO:0046903,GO:0046928,GO:0046942,GO:0046982,GO:0046983,GO:0048011,GO:0048013,GO:0048015,GO:0048017,GO:0048103,GO:0048167,GO:0048265,GO:0048266,GO:0048403,GO:0048406,GO:0048468,GO:0048483,GO:0048485,GO:0048511,GO:0048513,GO:0048514,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0048534,GO:0048545,GO:0048562,GO:0048563,GO:0048568,GO:0048569,GO:0048583,GO:0048584,GO:0048585,GO:0048588,GO:0048589,GO:0048592,GO:0048598,GO:0048608,GO:0048638,GO:0048639,GO:0048646,GO:0048663,GO:0048665,GO:0048666,GO:0048667,GO:0048668,GO:0048670,GO:0048672,GO:0048678,GO:0048679,GO:0048680,GO:0048686,GO:0048687,GO:0048690,GO:0048691,GO:0048699,GO:0048705,GO:0048707,GO:0048708,GO:0048709,GO:0048710,GO:0048712,GO:0048729,GO:0048731,GO:0048736,GO:0048749,GO:0048786,GO:0048803,GO:0048804,GO:0048805,GO:0048806,GO:0048807,GO:0048808,GO:0048812,GO:0048839,GO:0048856,GO:0048858,GO:0048869,GO:0048870,GO:0048934,GO:0048935,GO:0050730,GO:0050731,GO:0050767,GO:0050768,GO:0050769,GO:0050770,GO:0050772,GO:0050773,GO:0050789,GO:0050790,GO:0050793,GO:0050794,GO:0050803,GO:0050804,GO:0050806,GO:0050807,GO:0050808,GO:0050839,GO:0050877,GO:0050890,GO:0050896,GO:0050900,GO:0050906,GO:0050920,GO:0050921,GO:0050926,GO:0050927,GO:0050951,GO:0050954,GO:0050961,GO:0050965,GO:0050966,GO:0050974,GO:0050982,GO:0051046,GO:0051049,GO:0051056,GO:0051057,GO:0051090,GO:0051091,GO:0051092,GO:0051093,GO:0051094,GO:0051128,GO:0051130,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051173,GO:0051174,GO:0051179,GO:0051216,GO:0051234,GO:0051239,GO:0051240,GO:0051241,GO:0051246,GO:0051247,GO:0051248,GO:0051252,GO:0051254,GO:0051270,GO:0051272,GO:0051301,GO:0051336,GO:0051338,GO:0051345,GO:0051347,GO:0051384,GO:0051385,GO:0051403,GO:0051412,GO:0051493,GO:0051495,GO:0051588,GO:0051599,GO:0051602,GO:0051606,GO:0051641,GO:0051668,GO:0051674,GO:0051701,GO:0051704,GO:0051716,GO:0051817,GO:0051896,GO:0051960,GO:0051961,GO:0051962,GO:0051963,GO:0051965,GO:0051966,GO:0051968,GO:0052026,GO:0052312,GO:0055057,GO:0055059,GO:0055085,GO:0060008,GO:0060009,GO:0060026,GO:0060041,GO:0060070,GO:0060071,GO:0060076,GO:0060089,GO:0060173,GO:0060175,GO:0060191,GO:0060193,GO:0060249,GO:0060255,GO:0060284,GO:0060291,GO:0060322,GO:0060341,GO:0060384,GO:0060385,GO:0060395,GO:0060429,GO:0060484,GO:0060485,GO:0060541,GO:0060548,GO:0060560,GO:0060562,GO:0060606,GO:0060828,GO:0060976,GO:0061024,GO:0061053,GO:0061097,GO:0061098,GO:0061162,GO:0061245,GO:0061339,GO:0061351,GO:0061366,GO:0061368,GO:0061387,GO:0061448,GO:0061458,GO:0061564,GO:0065007,GO:0065008,GO:0065009,GO:0070302,GO:0070304,GO:0070306,GO:0070372,GO:0070374,GO:0070570,GO:0070572,GO:0070727,GO:0070848,GO:0070887,GO:0071229,GO:0071230,GO:0071300,GO:0071310,GO:0071316,GO:0071340,GO:0071345,GO:0071356,GO:0071363,GO:0071396,GO:0071417,GO:0071495,GO:0071702,GO:0071704,GO:0071705,GO:0071772,GO:0071773,GO:0071840,GO:0071900,GO:0071902,GO:0071936,GO:0071944,GO:0072089,GO:0072175,GO:0072358,GO:0072359,GO:0072499,GO:0072657,GO:0080090,GO:0080134,GO:0080135,GO:0090066,GO:0090090,GO:0090102,GO:0090103,GO:0090162,GO:0090175,GO:0090178,GO:0090179,GO:0090263,GO:0090596,GO:0090598,GO:0090630,GO:0097060,GO:0097237,GO:0097305,GO:0097447,GO:0097458,GO:0097485,GO:0097517,GO:0097529,GO:0097708,GO:0098552,GO:0098588,GO:0098590,GO:0098722,GO:0098743,GO:0098791,GO:0098793,GO:0098794,GO:0098805,GO:0098984,GO:0099080,GO:0099081,GO:0099173,GO:0099175,GO:0099177,GO:0099512,GO:0099513,GO:0099536,GO:0099537,GO:0099538,GO:0099540,GO:0099550,GO:0099551,GO:0099572,GO:0120025,GO:0120035,GO:0120036,GO:0120038,GO:0120039,GO:0140096,GO:0150034,GO:0198738,GO:1900019,GO:1900020,GO:1900274,GO:1901214,GO:1901215,GO:1901216,GO:1901342,GO:1901564,GO:1901626,GO:1901628,GO:1901654,GO:1901698,GO:1901699,GO:1901700,GO:1901701,GO:1902105,GO:1902107,GO:1902531,GO:1902533,GO:1902680,GO:1903034,GO:1903036,GO:1903506,GO:1903508,GO:1903530,GO:1903706,GO:1903708,GO:1903827,GO:1903829,GO:1903859,GO:1903909,GO:1903911,GO:1903995,GO:1903997,GO:1904018,GO:1904393,GO:1904395,GO:1904396,GO:1904398,GO:1904929,GO:1905114,GO:1905276,GO:1905330,GO:1905475,GO:1905477,GO:1905517,GO:1990089,GO:1990090,GO:1990416,GO:1990782,GO:2000026,GO:2000027,GO:2000112,GO:2000145,GO:2000147,GO:2000209,GO:2000249,GO:2000251,GO:2000322,GO:2000324,GO:2000539,GO:2000541,GO:2000811,GO:2001141 |
| EggNOG free text desc. | transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity |
| EggNOG OGs | COG0515@1,KOG1026@2759 |
| Ec32 ortholog description | Amino acid-binding ACT |
| Ec32 ortholog | Ec-12_001120.1 |
| EC | 2.7.10.1,3.4.21.7 |
| COG Functional cat. | KLT |
| Best tax level | Eukaryota |
| Best eggNOG OG | NA|NA|NA |
| BRITE | ko00000,ko00001,ko01000,ko01001,ko01002,ko01009,ko01020,ko03012,ko03029,ko04050,ko04147,ko04516 |
| Exons | 1 |
| Model size | 1333 |
| Cds size | 1329 |
| Stop | 0 |
| Start | 0 |
Relationships
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type | Position |
|---|
| 1622929017.5589123-CDS-F-serratus_M_contig1122:161312..162641 | 1622929017.5589123-CDS-F-serratus_M_contig1122:161312..162641 | Fucus serratus male | CDS | F-serratus_M_contig1122 161313..162641 + |
| 1690962667.8804104-CDS-F-serratus_M_contig1122:161312..162641 | 1690962667.8804104-CDS-F-serratus_M_contig1122:161312..162641 | Fucus serratus male | CDS | F-serratus_M_contig1122 161313..162641 + |
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of mRNA_F-serratus_M_contig1122.1126.1 >prot_F-serratus_M_contig1122.1126.1 ID=prot_F-serratus_M_contig1122.1126.1|Name=mRNA_F-serratus_M_contig1122.1126.1|organism=Fucus serratus male|type=polypeptide|length=443bp
KYKLNDANSIPEMELVDQYVDEDISKGLRAKPGTVVDDEKTPGQLTEKVR
TDIEQTSTRENLVVENRNNVAAGEISLPTKEKSRTGSDGSGISIPLTYYD
SVADREQLEHDQTLSELAPERHVCHIDGNDRRNLELLLDVTRSMAMSAIA
VIIDRAVHSVAFQPRRDEQGAALFLPRGLLDDISMGHSKRLKPALKSHSI
SAQDDSQKLSQRELELEAMEICDRAAQLRELEDLVRLERLDRFKQEDFLR
GALCGEGKHALVYRAVGIANPVRGARGAKHMGISATFEEVLIATASSVTD
EIVSAALSMMSCTFTSETVRNAEVPAVVAATCAAMAAVVVAHIIDKATAE
AVVREAEEGVHSLVFAAKEFRCGRPQTPASILWDARREVGMHLRLRDCDR
VVALRGVWFTPRVTLLFDLMEEGSLFHFIHDYTDKGGVIKYRP back to topmRNA from alignment at F-serratus_M_contig1122:161313..162643+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >mRNA_F-serratus_M_contig1122.1126.1 ID=mRNA_F-serratus_M_contig1122.1126.1|Name=mRNA_F-serratus_M_contig1122.1126.1|organism=Fucus serratus male|type=mRNA|length=1331bp|location=Sequence derived from alignment at F-serratus_M_contig1122:161313..162643+ (Fucus serratus male)
AAATATAAACTCAACGATGCAAACTCAATCCCTGAGATGGAGCTGGTGGA
CCAATATGTCGACGAGGATATATCAAAAGGCCTACGCGCGAAACCCGGCA
CAGTTGTCGACGACGAAAAAACACCTGGGCAACTAACAGAAAAGGTGCGT
ACAGATATCGAGCAAACCAGCACACGAGAAAACCTTGTCGTGGAGAACAG
GAACAATGTCGCCGCAGGCGAAATATCCCTCCCTACAAAAGAAAAGTCAA
GGACAGGTTCAGATGGAAGCGGTATCTCGATACCCTTGACATATTATGAC
TCCGTGGCCGACAGGGAGCAGCTGGAACACGATCAGACTCTGAGCGAGCT
AGCACCCGAACGGCACGTTTGTCATATCGACGGTAATGACCGCCGCAACT
TGGAGCTTTTACTGGATGTGACACGTTCGATGGCGATGAGTGCCATTGCA
GTCATTATCGATCGGGCAGTCCATTCTGTTGCCTTTCAGCCGCGTCGTGA
CGAGCAGGGCGCAGCGCTGTTTTTACCTCGCGGCCTCTTGGACGACATTT
CGATGGGCCATAGTAAACGTCTCAAGCCTGCATTAAAATCCCACAGTATA
TCAGCGCAAGACGACTCCCAGAAGCTTTCACAACGGGAGCTAGAGCTGGA
GGCAATGGAAATATGCGACAGAGCCGCACAGCTACGTGAGCTCGAGGATC
TCGTGCGCCTAGAGCGTTTGGATCGTTTCAAACAAGAGGATTTTTTGCGC
GGTGCGCTATGCGGTGAGGGTAAGCACGCCTTGGTGTACCGTGCAGTAGG
GATTGCCAATCCGGTACGGGGAGCGAGAGGGGCCAAACATATGGGAATCA
GTGCGACTTTCGAGGAGGTGCTCATAGCGACGGCCTCGTCTGTAACGGAC
GAGATAGTTTCAGCGGCATTGTCCATGATGTCTTGCACGTTCACGTCGGA
GACAGTGAGGAATGCTGAGGTGCCTGCGGTGGTAGCAGCGACCTGTGCGG
CCATGGCGGCCGTCGTAGTCGCACATATTATTGACAAGGCCACTGCGGAG
GCAGTTGTGAGAGAGGCTGAGGAAGGCGTGCATAGTCTCGTCTTTGCCGC
AAAGGAGTTTCGTTGCGGTCGCCCGCAGACCCCCGCATCGATCTTGTGGG
ACGCTCGTCGAGAAGTGGGGATGCACCTGCGCCTCCGCGACTGCGATCGA
GTTGTTGCGCTCCGAGGAGTGTGGTTCACCCCTCGGGTCACTCTCCTCTT
CGACCTCATGGAAGAGGGCAGCCTGTTTCATTTCATCCACGATTATACTG
ATAAAGGCGGGGTAATAAAATACCGTCCGGG back to topCoding sequence (CDS) from alignment at F-serratus_M_contig1122:161313..162643+ >mRNA_F-serratus_M_contig1122.1126.1 ID=mRNA_F-serratus_M_contig1122.1126.1|Name=mRNA_F-serratus_M_contig1122.1126.1|organism=Fucus serratus male|type=CDS|length=2658bp|location=Sequence derived from alignment at F-serratus_M_contig1122:161313..162643+ (Fucus serratus male)
AAATATAAACTCAACGATGCAAACTCAATCCCTGAGATGGAGCTGGTGGA
CCAATATGTCGACGAGGATATATCAAAAGGCCTACGCGCGAAACCCGGCA
CAGTTGTCGACGACGAAAAAACACCTGGGCAACTAACAGAAAAGGTGCGT
ACAGATATCGAGCAAACCAGCACACGAGAAAACCTTGTCGTGGAGAACAG
GAACAATGTCGCCGCAGGCGAAATATCCCTCCCTACAAAAGAAAAGTCAA
GGACAGGTTCAGATGGAAGCGGTATCTCGATACCCTTGACATATTATGAC
TCCGTGGCCGACAGGGAGCAGCTGGAACACGATCAGACTCTGAGCGAGCT
AGCACCCGAACGGCACGTTTGTCATATCGACGGTAATGACCGCCGCAACT
TGGAGCTTTTACTGGATGTGACACGTTCGATGGCGATGAGTGCCATTGCA
GTCATTATCGATCGGGCAGTCCATTCTGTTGCCTTTCAGCCGCGTCGTGA
CGAGCAGGGCGCAGCGCTGTTTTTACCTCGCGGCCTCTTGGACGACATTT
CGATGGGCCATAGTAAACGTCTCAAGCCTGCATTAAAATCCCACAGTATA
TCAGCGCAAGACGACTCCCAGAAGCTTTCACAACGGGAGCTAGAGCTGGA
GGCAATGGAAATATGCGACAGAGCCGCACAGCTACGTGAGCTCGAGGATC
TCGTGCGCCTAGAGCGTTTGGATCGTTTCAAACAAGAGGATTTTTTGCGC
GGTGCGCTATGCGGTGAGGGTAAGCACGCCTTGGTGTACCGTGCAGTAGG
GATTGCCAATCCGGTACGGGGAGCGAGAGGGGCCAAACATATGGGAATCA
GTGCGACTTTCGAGGAGGTGCTCATAGCGACGGCCTCGTCTGTAACGGAC
GAGATAGTTTCAGCGGCATTGTCCATGATGTCTTGCACGTTCACGTCGGA
GACAGTGAGGAATGCTGAGGTGCCTGCGGTGGTAGCAGCGACCTGTGCGG
CCATGGCGGCCGTCGTAGTCGCACATATTATTGACAAGGCCACTGCGGAG
GCAGTTGTGAGAGAGGCTGAGGAAGGCGTGCATAGTCTCGTCTTTGCCGC
AAAGGAGTTTCGTTGCGGTCGCCCGCAGACCCCCGCATCGATCTTGTGGG
ACGCTCGTCGAGAAGTGGGGATGCACCTGCGCCTCCGCGACTGCGATCGA
GTTGTTGCGCTCCGAGGAGTGTGGTTCACCCCTCGGGTCACTCTCCTCTT
CGACCTCATGGAAGAGGGCAGCCTGTTTCATTTCATCCACGATTATACTG
ATAAAGGCGGGGTAATAAAATACCGTCCGAAATATAAACTCAACGATGCA
AACTCAATCCCTGAGATGGAGCTGGTGGACCAATATGTCGACGAGGATAT
ATCAAAAGGCCTACGCGCGAAACCCGGCACAGTTGTCGACGACGAAAAAA
CACCTGGGCAACTAACAGAAAAGGTGCGTACAGATATCGAGCAAACCAGC
ACACGAGAAAACCTTGTCGTGGAGAACAGGAACAATGTCGCCGCAGGCGA
AATATCCCTCCCTACAAAAGAAAAGTCAAGGACAGGTTCAGATGGAAGCG
GTATCTCGATACCCTTGACATATTATGACTCCGTGGCCGACAGGGAGCAG
CTGGAACACGATCAGACTCTGAGCGAGCTAGCACCCGAACGGCACGTTTG
TCATATCGACGGTAATGACCGCCGCAACTTGGAGCTTTTACTGGATGTGA
CACGTTCGATGGCGATGAGTGCCATTGCAGTCATTATCGATCGGGCAGTC
CATTCTGTTGCCTTTCAGCCGCGTCGTGACGAGCAGGGCGCAGCGCTGTT
TTTACCTCGCGGCCTCTTGGACGACATTTCGATGGGCCATAGTAAACGTC
TCAAGCCTGCATTAAAATCCCACAGTATATCAGCGCAAGACGACTCCCAG
AAGCTTTCACAACGGGAGCTAGAGCTGGAGGCAATGGAAATATGCGACAG
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