EsuBft995_5a-0001 (mRNA) Ectocarpus subulatus male Bft15b

You are viewing an mRNA, more information available on the corresponding polypeptide page

Overview
NameEsuBft995_5a-0001
Unique NameEsuBft995_5a-0001
TypemRNA
OrganismEctocarpus subulatus male Bft15b (Ectocarpus subulatus male Bft15b)
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Scaffold_444contigScaffold_444:113604..120122 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
OGS1.0 of Ectocarpus subulatus male Bft15b2020-06-19
Properties
Property NameValue
Seed ortholog2880.D7G016
ProteomeIdEsuBft995_5
Protein domainsTMhelix
Protein domainsPTHR11349
Protein domainsIPR001564
Ownerapollo_admin@sb-roscoff.fr
Notenucleoside diphosphate kinase 1 os:saccharum officinarum gn:ndpk1 pe:1 sv:1 [Automatic annotation]
Nb exon5
Max annot lvl2759|Eukaryota
Length1294
Hectar predicted targeting categoryother localisation
Evalue6.84e-103
EggNOG OGsCOG0105@1|root,KOG0888@2759|Eukaryota
Ec32 ortholog descriptionNucleoside diphosphate kinase
Ec32 orthologEc-22_003280.1
Date last modified2016-06-14
Date creation2016-06-14
Preferred nameNME3
KEGG rclassRC00002
KEGG koko:K00940
KEGG ReactionR00124,R00139,R00156,R00330,R00570,R00722,R01137,R01857,R02093,R02326,R02331,R03530,R11894,R11895
KEGG Pathwayko00230,ko00240,ko00983,ko01100,ko01110,ko01130,ko04016,map00230,map00240,map00983,map01100,map01110,map01130,map04016
KEGG ModuleM00049,M00050,M00052,M00053
GOsGO:0000166,GO:0000278,GO:0000287,GO:0000976,GO:0000977,GO:0001012,GO:0001067,GO:0001101,GO:0001667,GO:0001678,GO:0001726,GO:0001775,GO:0001882,GO:0001883,GO:0001932,GO:0001934,GO:0002009,GO:0002252,GO:0002263,GO:0002274,GO:0002275,GO:0002283,GO:0002366,GO:0002376,GO:0002443,GO:0002444,GO:0002446,GO:0002682,GO:0002683,GO:0002761,GO:0002762,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0003697,GO:0003700,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004536,GO:0004550,GO:0004672,GO:0004674,GO:0005488,GO:0005504,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005525,GO:0005575,GO:0005576,GO:0005615,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005739,GO:0005740,GO:0005741,GO:0005758,GO:0005813,GO:0005815,GO:0005829,GO:0005856,GO:0005874,GO:0005880,GO:0005886,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006165,GO:0006183,GO:0006213,GO:0006220,GO:0006221,GO:0006228,GO:0006241,GO:0006259,GO:0006355,GO:0006357,GO:0006464,GO:0006468,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006810,GO:0006887,GO:0006915,GO:0006928,GO:0006950,GO:0006955,GO:0006979,GO:0007017,GO:0007049,GO:0007154,GO:0007155,GO:0007163,GO:0007165,GO:0007166,GO:0007186,GO:0007187,GO:0007188,GO:0007189,GO:0007229,GO:0007275,GO:0007399,GO:0007417,GO:0007420,GO:0007424,GO:0007427,GO:0007589,GO:0007595,GO:0008017,GO:0008092,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008219,GO:0008284,GO:0008285,GO:0008289,GO:0009058,GO:0009116,GO:0009117,GO:0009119,GO:0009132,GO:0009141,GO:0009142,GO:0009144,GO:0009145,GO:0009147,GO:0009148,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009163,GO:0009165,GO:0009199,GO:0009201,GO:0009205,GO:0009206,GO:0009208,GO:0009209,GO:0009218,GO:0009220,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009653,GO:0009719,GO:0009725,GO:0009743,GO:0009746,GO:0009749,GO:0009888,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009892,GO:0009893,GO:0009966,GO:0009967,GO:0009987,GO:0010033,GO:0010243,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010562,GO:0010604,GO:0010605,GO:0010628,GO:0010629,GO:0010631,GO:0010646,GO:0010647,GO:0010720,GO:0010941,GO:0010975,GO:0010976,GO:0012501,GO:0012505,GO:0014070,GO:0014074,GO:0014075,GO:0015630,GO:0015631,GO:0015949,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016049,GO:0016192,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016333,GO:0016334,GO:0016477,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0016776,GO:0016787,GO:0016788,GO:0017076,GO:0018105,GO:0018130,GO:0018193,GO:0018209,GO:0019001,GO:0019205,GO:0019215,GO:0019219,GO:0019220,GO:0019222,GO:0019438,GO:0019538,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019725,GO:0019867,GO:0019899,GO:0019900,GO:0019901,GO:0019932,GO:0019933,GO:0019935,GO:0021537,GO:0021543,GO:0021761,GO:0021766,GO:0022008,GO:0022607,GO:0022610,GO:0023051,GO:0023052,GO:0023056,GO:0030027,GO:0030100,GO:0030141,GO:0030154,GO:0030334,GO:0030554,GO:0030856,GO:0030858,GO:0030879,GO:0030900,GO:0031090,GO:0031252,GO:0031253,GO:0031256,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0031344,GO:0031346,GO:0031399,GO:0031401,GO:0031406,GO:0031410,GO:0031966,GO:0031967,GO:0031968,GO:0031970,GO:0031974,GO:0031975,GO:0031982,GO:0031983,GO:0032268,GO:0032270,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032549,GO:0032550,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032561,GO:0032587,GO:0032879,GO:0032940,GO:0033293,GO:0033500,GO:0033554,GO:0033574,GO:0033993,GO:0034284,GO:0034330,GO:0034332,GO:0034404,GO:0034599,GO:0034641,GO:0034654,GO:0034774,GO:0035152,GO:0035556,GO:0035639,GO:0035690,GO:0036094,GO:0036211,GO:0036230,GO:0040007,GO:0040011,GO:0040012,GO:0040026,GO:0040028,GO:0042119,GO:0042127,GO:0042221,GO:0042278,GO:0042325,GO:0042327,GO:0042451,GO:0042455,GO:0042493,GO:0042592,GO:0042593,GO:0042802,GO:0042981,GO:0042995,GO:0043015,GO:0043021,GO:0043024,GO:0043066,GO:0043067,GO:0043069,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043177,GO:0043209,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043233,GO:0043299,GO:0043312,GO:0043388,GO:0043408,GO:0043410,GO:0043412,GO:0043434,GO:0043565,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044093,GO:0044212,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044421,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044428,GO:0044429,GO:0044430,GO:0044433,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044459,GO:0044463,GO:0044464,GO:0044877,GO:0045055,GO:0045216,GO:0045321,GO:0045595,GO:0045596,GO:0045597,GO:0045604,GO:0045606,GO:0045616,GO:0045618,GO:0045637,GO:0045638,GO:0045664,GO:0045666,GO:0045682,GO:0045684,GO:0045893,GO:0045935,GO:0045937,GO:0045944,GO:0046036,GO:0046039,GO:0046051,GO:0046128,GO:0046129,GO:0046131,GO:0046132,GO:0046134,GO:0046390,GO:0046483,GO:0046683,GO:0046777,GO:0046872,GO:0046903,GO:0046939,GO:0048471,GO:0048513,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0048580,GO:0048582,GO:0048583,GO:0048584,GO:0048699,GO:0048729,GO:0048731,GO:0048732,GO:0048856,GO:0048869,GO:0048870,GO:0048878,GO:0050678,GO:0050679,GO:0050764,GO:0050767,GO:0050769,GO:0050789,GO:0050793,GO:0050794,GO:0050878,GO:0050896,GO:0051049,GO:0051093,GO:0051094,GO:0051098,GO:0051099,GO:0051101,GO:0051128,GO:0051130,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051174,GO:0051179,GO:0051211,GO:0051234,GO:0051239,GO:0051240,GO:0051241,GO:0051246,GO:0051247,GO:0051252,GO:0051254,GO:0051259,GO:0051270,GO:0051591,GO:0051674,GO:0051716,GO:0051960,GO:0051962,GO:0055082,GO:0055086,GO:0060099,GO:0060205,GO:0060255,GO:0060284,GO:0060322,GO:0060416,GO:0060429,GO:0060541,GO:0060548,GO:0060627,GO:0061062,GO:0061063,GO:0061508,GO:0065003,GO:0065007,GO:0065008,GO:0065009,GO:0070013,GO:0070542,GO:0070887,GO:0071229,GO:0071310,GO:0071322,GO:0071326,GO:0071331,GO:0071333,GO:0071396,GO:0071398,GO:0071704,GO:0071840,GO:0071944,GO:0072521,GO:0072522,GO:0072527,GO:0072528,GO:0080090,GO:0090130,GO:0090132,GO:0090304,GO:0090305,GO:0090407,GO:0097159,GO:0097367,GO:0097708,GO:0098588,GO:0098590,GO:0098805,GO:0099080,GO:0099081,GO:0099503,GO:0099512,GO:0099513,GO:0101002,GO:0120025,GO:0120035,GO:0120038,GO:0140096,GO:0140097,GO:0140110,GO:1901068,GO:1901070,GO:1901074,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901265,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901652,GO:1901654,GO:1901657,GO:1901659,GO:1901698,GO:1901700,GO:1901701,GO:1902105,GO:1902106,GO:1902531,GO:1902533,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903508,GO:1903706,GO:1903707,GO:1904813,GO:1905153,GO:1990837,GO:2000026,GO:2000112,GO:2000145,GO:2000425,GO:2001141
EC2.7.4.6
DescriptionNucleoside diphosphate kinase
COG categoryF
BRITEko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko04131
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
GO0005524
GO0010017
GO0006165
GO0006241
GO0004550
GO0006183
GO0006228
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
EsuBft995_5aEsuBft995_5aEctocarpus subulatus male Bft15bgeneScaffold_444 113604..120122 +


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
EsuBft995_5a-0001EsuBft995_5Ectocarpus subulatus male Bft15bpolypeptideScaffold_444 114212..119339 +


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
EsuBft995_5a-0001-exonagat-exon-15826Ectocarpus subulatus male Bft15bexonScaffold_444 113604..113660 +
EsuBft995_5a-0001-exonagat-exon-15825Ectocarpus subulatus male Bft15bexonScaffold_444 114190..114301 +
EsuBft995_5a-0001-exonEsuBft995_5a-0001-exonEctocarpus subulatus male Bft15bexonScaffold_444 116981..117067 +
EsuBft995_5a-0001-exonagat-exon-15828Ectocarpus subulatus male Bft15bexonScaffold_444 117622..117749 +
EsuBft995_5a-0001-exonagat-exon-15824Ectocarpus subulatus male Bft15bexonScaffold_444 118478..118552 +
EsuBft995_5a-0001-exonagat-exon-15827Ectocarpus subulatus male Bft15bexonScaffold_444 119288..120122 +


The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
EsuBft995_5a-0001-exonagat-five_prime_utr-15577Ectocarpus subulatus male Bft15bfive_prime_UTRScaffold_444 113604..113660 +
EsuBft995_5a-0001-exonagat-five_prime_utr-15578Ectocarpus subulatus male Bft15bfive_prime_UTRScaffold_444 114190..114211 +


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
EsuBft995_5a-0001-cdsEsuBft995_5a-0001-cdsEctocarpus subulatus male Bft15bCDSScaffold_444 114212..114301 +


The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesTypePosition
EsuBft995_5a-0001-exonagat-three_prime_utr-23884Ectocarpus subulatus male Bft15bthree_prime_UTRScaffold_444 119340..120122 +


Sequences
The following sequences are available for this feature:

spliced messenger RNA

>EsuBft995_5a-0001 ID=EsuBft995_5a-0001|Name=EsuBft995_5a-0001|organism=Ectocarpus subulatus male Bft15b|type=mRNA|length=1294bp|location=Sequence derived from alignment at Scaffold_444:113604..120122+ (Ectocarpus subulatus male Bft15b)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.  
CACACCGACCCCCTCCCTCTCTCTCCCCGTCTCGTCTCTCTCACCCCCTC
CAACAAGCACCATGGAGCGCACCTACATCATGATCAAGCCTGACGGCGTC
CAGCGCAACCTGGTGGGCGAGATCATCGCTCGCTTCGAGAAGAAGGGGTA
CAAGCTCGCCGCTCTCAAGATGGCGCGGCCCGAGCGATCGCACCTCGAGG
AGCACTACGCCGACCTCAGCGGCAAGAGCTTCTTCGCGGGCCTCATCGAC
TACATGGCGTCTGGCCCCGTGGTGTGCATGGTGTGGACGGGCGTGAACGT
GGTGCTTGAGGGGCGCAAGATGCTCGGAGCCACCAAGCCGTCTGAGTCGG
CCATGGGGACCATCCGCGGGGACTTCTGCGTGGAGGTGGGACGCAACGTC
TGCCACGGCTCCGACTCCACGGACTCGGCTGAGCACGAGATCAAGCTCTG
GTTCCCAGAGGGTGTGTGCGAGTGGGACGCGTGCACCAAGGCCTGGATCT
ACGAGAAGTGAAGGATGAATGGATCATGTCCGCAAACCACGGCGGAAGGG
GGCCTTGTTCTTTTGGAGTCCGGGGTTTCGACACCGTGCATGTCCACCGC
ACAAGACGGTTCTTGGATGGTCGTGGCTTGTAAACGCATGCCTCGTGAAC
TTGACAGTCCGATGGCCTGACAGTCTCGTTACTAGAAAGTCTCCTGCCGT
GTGGCGCTCTGGGGGTCGCCGATCGATCGCCTCGATGTACAGAGAACAAG
AGACCTTGAAGTTGTGTAGGGCTCACAAACCTCTTGCTGATTTCACGCGA
GCGTGGAGCTTGGGGTAACCACAGCTGGGGTCGATTGAATTCATTCACCG
AGCGTGTTTCGCCAGTGTTGCAGTATGACGGTACTGGTACCATCGGCATG
AGAGTTGGGGACTCTGGGCTCAGTTGAAGTCATGTTTGGGGTGAACTGCA
CCTGCGTTTCGCGCGAGTTCGGACACATGACAACCACCTTGCGCCCCAAA
CCTAAGCAGAGAACACTACCACACTCGGGCTCAGGTGAAGTGATAGTGGG
GGTTAACGACACCTACCGTCGTACGAGTTCGGACACATAAAATACAGAGA
GTAATGACACACCAGGGGCACCGCTCAGAGGGGTGGTGCGCGGTTAAGAG
AGAACCCTTGGACGTGAACTTGGTGTTTTCACGCACGATTTAGCTCTCTG
TGCGACAGTGAAAAAAGTGTCACGGTGATGAGCAGTGCTATTTTTTTTTA
TCCCATCATTGGACTCTGTCGTCTGCCCCTCTGGCCCCTATCCT
back to top

protein sequence of EsuBft995_5a-0001

>EsuBft995_5 ID=EsuBft995_5|Name=EsuBft995_5a-0001|organism=Ectocarpus subulatus male Bft15b|type=polypeptide|length=143bp
MIKPDGVQRNLVGEIIARFEKKGYKLAALKMARPERSHLEEHYADLSGKS
FFAGLIDYMASGPVVCMVWTGVNVVLEGRKMLGATKPSESAMGTIRGDFC
VEVGRNVCHGSDSTDSAEHEIKLWFPEGVCEWDACTKAWIYEK
back to top

mRNA from alignment at Scaffold_444:113604..120122+

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EsuBft995_5a-0001 ID=EsuBft995_5a-0001|Name=EsuBft995_5a-0001|organism=Ectocarpus subulatus male Bft15b|type=mRNA|length=6519bp|location=Sequence derived from alignment at Scaffold_444:113604..120122+ (Ectocarpus subulatus male Bft15b)
CACACCGACCCCCTCCCTCTCTCTCCCCGTCTCGTCTCTCTCACCCCCTC CAACAAGGTAAGCATCGGTACCTGTAACTAGCCTTGCTGTGATATTCTCG CCGAATCGGCAAATCTTGCCCGTCTGCTGCTGCACTTTGGCTTCGCTCTC GGCCTGATTGGCAGATCTTATCAGAACATTTTCCCAGTGGTCTCTTTGTC CGTGTGTGTGGACCATATTGCGTCGAAGGTAGCGCAACTCTGTATGCCTA CCCCACCAGTGCATTCCCTCGCGGACACGATACCTCGTGAGATCAGGGCA GCTGTACAACACGCATCCTTTTCGTATACCAACCATGTAGAGAGTTCGCA GGCGCGAATGACGATGAACATGGCGGTGTGCAGCAGGCAGTATCGCAGCA GCAGTGAGCCAAGATGGTGGGTCCAACAGACCAAGATGAAGAGGAAGGTA CTGCTGCAGTCGATGACAACTCGGAAATATTCCCCGCTCCTGTGCATCTC CCTTCACCGCTACACCTGGCATGTGATGTGCTGCTGGTGCGTGCTGCGTT TCAAATTCTTCATTACCTCCTTTGAAAAACCAACAGCACCATGGAGCGCA CCTACATCATGATCAAGCCTGACGGCGTCCAGCGCAACCTGGTGGGCGAG ATCATCGCTCGCTTCGAGAAGAAGGGGTACAAGCTCGCCGCTCTCAAGGT ACAGTGCTGCCATTGGTGCATCGGACAAAATGGATAAAGTTCCATGGGTA AATGTAAAATTCTTATTTTCCTCTTGGCTTACCATGGGCTGGCTCCGAAA CTATGCCCCATGTGCACCTACTGCCTACTACCCCCGTCACGTCCCGGCGT GAAACGGTGTAGAGCCGTGGAGCGGACGAGACCCTGTTCGTCTCACCCGC CTGAACATATTCCGTGTAGCCACCACAGCAGCAGTAAATAACGAGATATG GAACACCAAATATTGACCGGAGAGATGCTCGCACTGCTGTATTTTTTGGA ACATATCTGGCGGGTTTCCGCGATATCAGCATTCCGCGTGTTGCGGAAAA CCATACCATGAGAACCGCGAGGATTACGGAATCCCACAGCACACCAACTT GCGTCATGAATAACCCACGGCGCGTCTCTCGTGCTTCCGTTTCATGCACG GCATCTACCTGATCGTAATACCGTCCGTAGGTGCCAATAAGATATCACAC CCCATATCACACCCCTGGACCTTTTCTCACAGCCCGATTATCGTATATGG CGATTATCGTATGACACAAGATAACACACCCCCTGGAATAATTCTCAAAG CTCGATTACGCCTTGTCAAAGAGGATGCATAAATGAAAAAGCATATGTTT GGCAAGCTCTCGATAGGACAGCTTCAACGTCTCCTTTCTCGGCGCTGTGA CTCTCTGATGTTGAGAAATCGGGATTTGAAAATCGGTCCAGGGGGGGGGG GGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCTAAAGGTNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNACACTTCCCTCTCCTTCTTGTACAACGGACATTCCGCGA CTACATGAACGCGGTCTTCGCATTCGAAGCCGCAATCACATTTGAACTCG TTGTCTTCGTTGTCTGCCGTCCTATGTCTTCGTCGACGTTCTCGAAGGCC TATGTCCCCGGTCCTGAATTTGACCTTAAGCTTTGTTCCTGCATCCATTG GTCCATGTAGGTAGTCCTTGAACCCTATTCCTTCCTTCAACATTCCGTAC ACTTCTAGACCCTCCTTATCCTTGGATTCTTTCCTCAGATTCTGTTCTTC TCTCTCGGCACAAGCAACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTGCTGCCAAAACTGAGCA ACTTCCTCTGGGTCCATGATGATGGTAGTGATTGGGTTACTTCTGCTGCT GCTGTTGTGCCTAAAGGTAGAGAGGTAGGAGCGGCAAGGAGACTATCGTC CCTGGCCACTTTTCGCTCACAATAGCAAGGGTTTTCGGGACTACAACTCT GATCACAGCTCCGATCTTCCCCCTCTATCTGTAGTATAGAAATTGATAAT TTGGCACGATTTTATTCTATTTGACCCGATATTCAGTTCACGCCCAGCTC GTACAGCAGTCACCGATGAGAGCCCTGATGTGTGTTGGTCTGCTGTTACA TACCAAAGATTTGTGTGAGCAAGGGAGCGGCGTGTGGATGCGACCATGTG TACTCGAGTGCATGTGGGAGATACCGGTAGGGTGTGTAAAGAACGGGAGA CGGTGGTTGAAATATTTGTGTTCCATAGCCTTGGCCTTGATGATGTCAGC GGTCTCTTCGCCCAGTGTAGAAAAAAAAGACCCTCGGAAGATCCAGGGAA AACCCAGTCACGTAAGGGTTAAGCTTTGTTCCTGCATCCATTGGTCCAGG GGGTCTGTTTTCTCGTGTAATTTACGGTACTCCAAGAAGATAGTGGCATA TAACCACATCGTACGTTATCTTGAAAGCTCTGGACGAGGCGGCTCCAACG CCGCCATTTTGGGCACCTTGGCTGTGTGTTCCCTCCAGGGTAGTCTACCT TTGAACGTCGGTCGAGGGGGTGTGGTATCTCATGTAATGTGCCTTGTTTT CGGCTCGCACACACTGGAATATCAAGTCGTTCTGTACGTTGAATAGTGCC GGTGCACGGTACTGTGCTGGTAAAATTTTTGCGCACACCCCGGCACCAAA CAGGGACCTCTACTGTAATGGGATTATGAAATACTGCTCAGCGGTGGGTC CGAAACCTACTCTTCCAATAGCCTGTGCTAGACAGCAACAGTGGCCATGA AACAAGAGAGAGAAACTAAGCCTCGACGCGACGGTGACGTTTACTTATCT CCGGGCCCGTCCTGTCAATGCGAGCAGATGGCGCGGCCCGAGCGATCGCA CCTCGAGGAGCACTACGCCGACCTCAGCGGCAAGAGCTTCTTCGCGGGCC TCATCGACTACATGGTAAGCTTCGACCGAACCGGATGCACCCTTGTTGTT GTTGTTGATGGAAGATAAGAAACGCTGCTGTGCGGCGCATCGTTGCTTGA TGAGGAAGGAACTTGCTGCTGCGCCGTTCTCGCTGGCCGCTTGGCCTCGT TTTCGCGTGCGTGTTCCATGTCTTCGACGTAATGTAGACGTTTGTTCTTA TTGATGCATTTAAGGTTTGGACGACCCTCTTGCCAGCCCTGATGTGCTCG CTTCTTAGCGGTAGTGCCGTGTGTGTTGCCGTTCCCTGAGTTATGAACGT CAAATAACGTTAAACCGTTGGGAGTGTTTGGACGGCCCAAGCAGCCAGTA CGGTTCTTTTTGTCCCGAGCTTTCCTCTCCGGCAGCTCTCGCCTCAGCCT TGGTTGGCATCGCGAGGAGATTGCCTCCGTTGCGATCCCTCCGCGACCAT GCAGTCTTTTTTCCCCACCAGTTCCATCACCAAAGTTGAGCCTGATGTGA ACGCGCCGAAATTCGACATGTAGTAACCTTTGAAAAGATTTATTCATGTC CGTACGTACTCGTCCCAGGCGTCTGGCCCCGTGGTGTGCATGGTGTGGAC GGGCGTGAACGTGGTGCTTGAGGGGCGCAAGATGCTCGGAGCCACCAAGC CGTCTGAGTCGGCCATGGGGACCATCCGCGGGGACTTCTGCGTGGAGTGA GTCGACAATGTAAACCCTTCGCATACAAGCTTATGGAGAGCCTACATGCT CATGTACAAGAGTTGTGCCGCACTCGGATGATTTCTTACCCTTTGCCTCG AACAGACCTTTCACCACAGGTCCTGGGAAAGAGCATCTACATCGAAGAGG CCGACGTAGTTATCACAGCGAGTTTACAAGACCAAAGAAATAAAGAGAGT TGAAAATTGTGACGACAATAAAACTTGCCACGCTACCGCTCGACGAGGAA CTACAACTGGCAGGATAAACATGACACGCCTCGCACACGCAGCGTGCATC TTCAAACTGGCGATGTATACATATTTTTGGTGTTTTTTCGATGACAAACC ACTTGCCGGATACGGCATCCAAAACACAAGCAGACGGAGAGGAAGCTCGC TGCACTGCACTATCGGCTTTCAAATCCGGAATTGACATGGTGCTTCGCCC TGTCGGCGCCCGCTTGGCAGCTTGGAATGCATGAACGCACGCACCGGAAA TCGCATTCTTGAGCAATCTGATCTGTCCAAGCTAGTCGTGTTCCCTTTCC TTCCGTAGCATAGCTTTACCCTCGTGCTCGTGTTCCCGCACGTGGTCCAA TGCGTCATCAACAAACTCACCACCTTTGTTTCTGCTTGCAACCCGCAACT CACTCGTTCTTGCCCTTGCCCCGGTCCAATCCCGTGAACGAAATGGAATG GGACGGGATGGGTCCCAACCGTAGGGTGGGACGCAACGTCTGCCACGGCT CCGACTCCACGGACTCGGCTGAGCACGAGATCAAGCTCTGGTTCCCAGAG TGAGTACACAGACACGGCAGACACAACCATGACCTCGGCTGTAGTCTCTT TTTAAGAGCACCATGGCGTTGCTGTCCTACGTTGCCAACGTCGAGACATG CCTGCCTAGGGCGCGCTACGGTGTAGTTGCGCTCCAGTGTTGGGCACAAT TTCTTGTTGGTGCAAGTTGCACCTAGATATGAAGATCGCAGTACCGCGTG TTCTTTTATGCTGTGGCATTTGATGATACGCCAGCTCAAAACGCATTGCG AGTTGCGTAGGCTGAGCACGTAGCAGTAGATTAACGTTCACAGCATTCTC TTTGTCTTGCTGGCCGTGTTCCGTCAACCATTCGTGCTTGCGGTAAACAA TACAACCTCGGGTCCAGGTAATGCTTGCGGTTCATCCATGTTCCTTCCTA CGCACGATAGATACCTCTTTGACCTCACTCTTTTTGGTGTGTGATGCTCC TGTCCGTCGTATCCAGTAGCCTTTTTCTATTCTGTGAACATGTTGGGTAT AACGTGCAATCGGGGTAGTTGGATTAGAGTTAGGGCTAGGGTCTGCGTGC CCCCTGCCTGTTTTATTTCCTCATCAAATTCACTTCTCGCGAAGGCGGTC GCCAGCCTTCACAGGGTTTTCTGCGAAGAGAACTTGTTGTATACGGGATA AATCGGGGAAGTTGGATTACGGAAGCAGCTTACATGTAACGTGATGTCTT CCTCCCCCGGCAAAATGTCGATCGTCCTTGACAGGGGTGTGTGCGAGTGG GACGCGTGCACCAAGGCCTGGATCTACGAGAAGTGAAGGATGAATGGATC ATGTCCGCAAACCACGGCGGAAGGGGGCCTTGTTCTTTTGGAGTCCGGGG TTTCGACACCGTGCATGTCCACCGCACAAGACGGTTCTTGGATGGTCGTG GCTTGTAAACGCATGCCTCGTGAACTTGACAGTCCGATGGCCTGACAGTC TCGTTACTAGAAAGTCTCCTGCCGTGTGGCGCTCTGGGGGTCGCCGATCG ATCGCCTCGATGTACAGAGAACAAGAGACCTTGAAGTTGTGTAGGGCTCA CAAACCTCTTGCTGATTTCACGCGAGCGTGGAGCTTGGGGTAACCACAGC TGGGGTCGATTGAATTCATTCACCGAGCGTGTTTCGCCAGTGTTGCAGTA TGACGGTACTGGTACCATCGGCATGAGAGTTGGGGACTCTGGGCTCAGTT GAAGTCATGTTTGGGGTGAACTGCACCTGCGTTTCGCGCGAGTTCGGACA CATGACAACCACCTTGCGCCCCAAACCTAAGCAGAGAACACTACCACACT CGGGCTCAGGTGAAGTGATAGTGGGGGTTAACGACACCTACCGTCGTACG AGTTCGGACACATAAAATACAGAGAGTAATGACACACCAGGGGCACCGCT CAGAGGGGTGGTGCGCGGTTAAGAGAGAACCCTTGGACGTGAACTTGGTG TTTTCACGCACGATTTAGCTCTCTGTGCGACAGTGAAAAAAGTGTCACGG TGATGAGCAGTGCTATTTTTTTTTATCCCATCATTGGACTCTGTCGTCTG CCCCTCTGGCCCCTATCCT
back to top

Coding sequence (CDS) from alignment at Scaffold_444:113604..120122+

>EsuBft995_5a-0001 ID=EsuBft995_5a-0001|Name=EsuBft995_5a-0001|organism=Ectocarpus subulatus male Bft15b|type=CDS|length=432bp|location=Sequence derived from alignment at Scaffold_444:113604..120122+ (Ectocarpus subulatus male Bft15b)
ATGATCAAGCCTGACGGCGTCCAGCGCAACCTGGTGGGCGAGATCATCGC
TCGCTTCGAGAAGAAGGGGTACAAGCTCGCCGCTCTCAAGATGGCGCGGC
CCGAGCGATCGCACCTCGAGGAGCACTACGCCGACCTCAGCGGCAAGAGC
TTCTTCGCGGGCCTCATCGACTACATGGCGTCTGGCCCCGTGGTGTGCAT
GGTGTGGACGGGCGTGAACGTGGTGCTTGAGGGGCGCAAGATGCTCGGAG
CCACCAAGCCGTCTGAGTCGGCCATGGGGACCATCCGCGGGGACTTCTGC
GTGGAGGTGGGACGCAACGTCTGCCACGGCTCCGACTCCACGGACTCGGC
TGAGCACGAGATCAAGCTCTGGTTCCCAGAGGGTGTGTGCGAGTGGGACG
CGTGCACCAAGGCCTGGATCTACGAGAAGTGA
back to top