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Alignments
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Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Symbol | HSP70 |
| Status | Manually annotated |
| Seed ortholog | 6211.A0A068YEZ5 |
| ProteomeId | EsuBft983_5 |
| Protein domains | PTHR19375 |
| Protein domains | IPR018181 |
| Protein domains | IPR013126 |
| Protein domains | G3DSA |
| Protein domains | SSF53067 |
| Owner | apollo_admin@sb-roscoff.fr |
| Note | heat shock 70 kda protein os:leishmania major gn:hsp70 pe:3 sv:1 [Automatic annotation] |
| Nb exon | 6 |
| Max annot lvl | 33208|Metazoa |
| Length | 1701 |
| Hectar predicted targeting category | other localisation |
| Evalue | 8.68e-80 |
| EggNOG OGs | COG0443@1|root,KOG0101@2759|Eukaryota,38BSZ@33154|Opisthokonta,3BA18@33208|Metazoa,3CWU8@33213|Bilateria |
| Ec32 ortholog description | Heat shock protein 70 |
| Ec32 ortholog | Ec-27_006620.1 |
| Date last modified | 2016-08-22 |
| Date creation | 2016-06-14 |
| Preferred name | HSPA8 |
| KEGG ko | ko:K03283 |
| KEGG TC | 1.A.33.1 |
| KEGG Pathway | ko03040,ko04010,ko04141,ko04144,ko04213,ko04612,ko04915,ko05134,ko05145,ko05162,ko05164,ko05169,map03040,map04010,map04141,map04144,map04213,map04612,map04915,map05134,map05145,map05162,map05164,map05169 |
| KEGG Module | M00353,M00355 |
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O:0098796,GO:0098797,GO:0098805,GO:0098852,GO:0098857,GO:0098916,GO:0098984,GO:0099003,GO:0099080,GO:0099081,GO:0099086,GO:0099111,GO:0099503,GO:0099504,GO:0099512,GO:0099513,GO:0099522,GO:0099523,GO:0099524,GO:0099536,GO:0099537,GO:0099572,GO:0099643,GO:0101002,GO:0101031,GO:0106030,GO:0120025,GO:0120036,GO:0120038,GO:0120039,GO:0140013,GO:0140110,GO:0150034,GO:1900034,GO:1900407,GO:1900408,GO:1901019,GO:1901021,GO:1901028,GO:1901029,GO:1901031,GO:1901032,GO:1901099,GO:1901135,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901567,GO:1901575,GO:1901654,GO:1901673,GO:1901698,GO:1901700,GO:1901800,GO:1901894,GO:1901896,GO:1901987,GO:1901989,GO:1901990,GO:1901992,GO:1902115,GO:1902235,GO:1902236,GO:1902380,GO:1902495,GO:1902531,GO:1902532,GO:1902533,GO:1902679,GO:1902749,GO:1902751,GO:1902882,GO:1902883,GO:1902903,GO:1902904,GO:1902905,GO:1902946,GO:1903046,GO:1903047,GO:1903050,GO:1903052,GO:1903169,GO:1903201,GO:1903202,GO:1903205,GO:1903206,GO:1903214,GO:1903265,GO:1903311,GO:1903313,GO:1903320,GO:1903321,GO:1903332,GO:1903334,GO:1903362,GO:1903364,GO:1903506,GO:1903507,GO:1903533,GO:1903561,GO:1903573,GO:1903706,GO:1903708,GO:1903747,GO:1903749,GO:1903827,GO:1903829,GO:1903844,GO:1903845,GO:1903900,GO:1903902,GO:1903955,GO:1904062,GO:1904064,GO:1904427,GO:1904589,GO:1904592,GO:1904593,GO:1904764,GO:1904813,GO:1904951,GO:1905710,GO:1905897,GO:1990124,GO:1990351,GO:1990832,GO:1990833,GO:1990834,GO:1990836,GO:1990904,GO:2000026,GO:2000058,GO:2000060,GO:2000112,GO:2000113,GO:2000116,GO:2000117,GO:2001023,GO:2001024,GO:2001038,GO:2001039,GO:2001141,GO:2001233,GO:2001234,GO:2001236,GO:2001237,GO:2001239,GO:2001240,GO:2001242,GO:2001243 |
| Description | heat shock protein 70 |
| Description | protein refolding |
| COG category | O |
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Cross References
External references for this mRNA
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Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
spliced messenger RNA >EsuBft983_5a-0001 ID=EsuBft983_5a-0001|Name=EsuBft983_5a-0001|organism=Ectocarpus subulatus male Bft15b|type=mRNA|length=1701bp|location=Sequence derived from alignment at Scaffold_233:373146..380032- (Ectocarpus subulatus male Bft15b)|Notes=Excludes all bases but those of type(s): exon.
GTCTCCGCTGTTTTGCTGCCCCTGCTGTAGTTGCTATGCCTGTCGCTGTT
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CGTCCCCCTTCAGATGCAGCGTGGATTCGAAGGGCGAGGCCCGAGTAACA
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CCGTGGGGCGGTGCGTTATCTCGGTGCCGGCAGGCTTTGGCCCAGAGCAG
AGGGAGGCCCTCCGTACGGTGGGGAAGCAGGTCGGGCTACCGTTCTCCCT
GGTGGTGTCGGACCCGGTTGCGGCCGCCATCGCGTACGGGTTGGATAGAC
CCGACCACGAAATGGTTGGGACAAGTCGGGAAGGAGGGGAGTTCAAGCCA
AAACGGAATATCTTGGTTGTTGACTGGGGGGGCGGCGGGGTTGAGTCCAC
GGTGCTGAAGCGCACAGACGGCGTGCTCAGCATCGTGGGGAGGGCGTCCG
ACGCTTCCGTCGGGGGAGGGGTTTTCACGGAAAGATTGGTGGCGTTTTGC
GCCAAGGACTTCAAGCGTCGGACTGGTGGACTGGACATTTTTGAGAGCAA
GAGATCTGTGCTCAAGGTAACTCGTGCCTGCGAAGAGGCTGTTCGCACCC
TGTCCGCGTCGGCCCAGGCGGACGTGTACATCGAGGCCGCGCACGAGGGG
TGCGACATGAACGTGAAGATCTCCCGCACGCGCTTCGAGGACCTCTGCTT
CGACCTGTACAAGGCGGCGGGAGGGGTAATCTCTAAGGCGCTGGCGGAGG
CGGGAATGGCAACGGACGCGGTGGACACTGTGCTATTGGCCGGCGGAATC
ACGCAGATGCCGAAGGTGAACTCTTCAGTTAAGGCTACCTTCCCGGCAGG
GACGCACTTCGAAGCGGGCCTTTTCCCGGACGAGGCCGTGGCTATCGGCG
CAACAACACAGGCCTTCCTGCTGCAGGAGCATGGCTCGTTCGTCGCGCCC
GGAGCGCCGCCCCTGCCCGTCGCCGTGCGAACGTGCCCCGCGAGCCTCGG
CGTGCGTTGCGGGGGGAGCGGAGGCAACGCCGCCGAGGACGCGGCCGTCG
CCATCATCTCCAAGGGGTGCATCCTACCTGCCCAGGGAAACACCACCGTC
AAGCTGGGGGGTGGGGGGGGTGGGGGCCCCGCGACGGAGGCCTACCTGGA
GGTGGTAGAGATCGGCCAGGCGGAGGGAGAGGGGGGCGCGCAGACGGCGC
GACTGCTGGGTACCCTGGCGTTCGACGAGGCTGCGGTCCCGGCGGACGGC
AGCGCGGAGGTGGACGTGAAGGTTGGCTTCACGCTCAGGTCGGAGGGCGT
CCTCAAGATCGAGGCGGTTACCCCCGGCGGGGTGTCGAAGGAGCTTGTCA
TCGGCCACGACGGGACAGAGACTAGTTAGCGCCTGCCAGACTCGTTGGGG
G back to topprotein sequence of EsuBft983_5a-0001 >EsuBft983_5 ID=EsuBft983_5|Name=EsuBft983_5a-0001|organism=Ectocarpus subulatus male Bft15b|type=polypeptide|length=547bp
MPVAVGVDLGSTHCNVGVWHQGRPEVIANHHGLRSTPTMVAFTDSEVLVG
EAALSQMPKNVANTVTGFKWMVGQNHDQIEPRIKAMLESSPFRCSVDSKG
EARVTVKHKGEEKVVGAETLCRYLFEHLKDIAEAFAGEPVGRCVISVPAG
FGPEQREALRTVGKQVGLPFSLVVSDPVAAAIAYGLDRPDHEMVGTSREG
GEFKPKRNILVVDWGGGGVESTVLKRTDGVLSIVGRASDASVGGGVFTER
LVAFCAKDFKRRTGGLDIFESKRSVLKVTRACEEAVRTLSASAQADVYIE
AAHEGCDMNVKISRTRFEDLCFDLYKAAGGVISKALAEAGMATDAVDTVL
LAGGITQMPKVNSSVKATFPAGTHFEAGLFPDEAVAIGATTQAFLLQEHG
SFVAPGAPPLPVAVRTCPASLGVRCGGSGGNAAEDAAVAIISKGCILPAQ
GNTTVKLGGGGGGGPATEAYLEVVEIGQAEGEGGAQTARLLGTLAFDEAA
VPADGSAEVDVKVGFTLRSEGVLKIEAVTPGGVSKELVIGHDGTETS back to topmRNA from alignment at Scaffold_233:373146..380032- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EsuBft983_5a-0001 ID=EsuBft983_5a-0001|Name=EsuBft983_5a-0001|organism=Ectocarpus subulatus male Bft15b|type=mRNA|length=6887bp|location=Sequence derived from alignment at Scaffold_233:373146..380032- (Ectocarpus subulatus male Bft15b)
GTCTCCGCTGTTTTGCTGCCCCTGCTGTAGTTGCTATGCCTGTCGCTGTT
GGTGTAGATCTCGGCAGCACGCACTGCAATGTCGGTGTGTGGCATCAGGG
ACGACCAGAGGTCATCGCGAACCACCATGGCCTGAGGTCCACTCCCACAA
TGGTAGCCTTCACCGACAGCGAAGTCTTGGTTGGGGAGGCTGCCCTGTCG
CAGATGCCCAAGAACGTGGCTAACACCGTGACTGGCTTCAAGTGGATGGT
CGGGCAGAATCACGACCAGATAGAGCCTCGCATCAAGGCGATGCTGGGTG
AGTGGCTCTGGCGAGCAAATGCTGTCGCGACGAGTACAAGAAGTTTAGAC
ATCCCTAGCGACCGCTGATCTCGCAGCCACTGATGATGATACCACCGAGT
GATGTACGTGTACGTCTCTCCCCCACAAGTGGAGAAGTGGCACCTGTACC
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AGGCGCTGGCGGAGGCGGGAATGGCAACGGACGCGGTGGACACTGTGCTA
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GGAAACACCACCGTCAAGCTGGGGGGTGGGGGGGGTGGGGGCCCCGCGAC
GGAGGCCTACCTGGAGGTGGTAGAGATCGGCCAGGCGGAGGGAGAGGGGG
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CAGGTCGGAGGGCGTCCTCAAGATCGAGGCGGTTACCCCCGGCGGGGTGT
CGAAGGAGCTTGTCATCGGCCACGACGGGACAGAGACTAGTTAG back to top
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