mRNA_Ecto-sp8_S_contig1056.879.1 (mRNA) Ectocarpus species8 EcLAC_412

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Overview


Name	mRNA_Ecto-sp8_S_contig1056.879.1
Unique Name	mRNA_Ecto-sp8_S_contig1056.879.1
Type	mRNA
Organism	Ectocarpus species8 EcLAC_412 (Ectocarpus species8 EcLAC_412)

Homology

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BLAST of mRNA_Ecto-sp8_S_contig1056.879.1 vs. uniprot
Match: D7G8I4_ECTSI (Uncharacterized protein n=2 Tax=Ectocarpus TaxID=2879 RepID=D7G8I4_ECTSI)

HSP 1 Score: 782 bits (2020), Expect = 2.290e-282
Identity = 395/408 (96.81%), Postives = 402/408 (98.53%), Query Frame = 1

Query:    1 MRRCRPCALAAAATTCCCLRFSQGWNPVAILNPGLASAAARATPWSRAARVASARPSQHTRARAAIAAAVAPRDPWEAAGEEAKEGDEKGEKKVMPRLKMDDSPIPEYLIDMLKESGDVDEDGKPVNDFFDPDEDDTFGTQRERDCLKEEELYYNDVPFGDMLFEGKAGGENAQDTGSLMDTSINNAVFEYGFPVEFFLDMLCRWGVTLPINQDRRLGDMIDAEQAAALCEALTGLDAADVRDNYLDDSLDDLSFDLNIPLPDLFQACAAQKINLPKGGDTHITIDEYKLLLDTVVEGGETSRARKLFDESRVTNRWTGQKEANSRELNQEDIAREIQKNNAGFGWREGPPILGDGEGELPLEQAHIGGRIFGEEIFASGYADSQHPGGWEEGEDEDGEEVFVFDDFG 1224
            MRRCRPCALAAAATTCCCLRFSQGWNPVA LNPGL SAAARATPWSRAARVASARPSQHTRARAAIAAAVAPRDPWEAAG+EAKEGDEKG+KK MPRLKMDDSPIPEYLIDMLKESGDVDEDGKPVNDFFDPDEDDTFGTQRERD LKEEELYYNDVPFGDMLFEGKAGGENAQDTGSLMDTSINNAVFEYGFPVEFFLDMLCRWGVTLPINQDRRLGDMIDAEQAAALCEALTGLDAADVRDNYLDDSL+DLSFDL+IPLPDLFQACAAQKINLPKGGDTHITIDEYKLLLDTVV+GGETSRARKLFDESRVTNRWTGQKEANSRELNQEDIAREIQKNNAGFGWREGPPILGDGEGELPLEQAHIGGRIFGEEIFASGYADSQHPGGWEEGEDEDG++ F FDDFG
Sbjct:    1 MRRCRPCALAAAATTCCCLRFSQGWNPVATLNPGLTSAAARATPWSRAARVASARPSQHTRARAAIAAAVAPRDPWEAAGQEAKEGDEKGKKKAMPRLKMDDSPIPEYLIDMLKESGDVDEDGKPVNDFFDPDEDDTFGTQRERDRLKEEELYYNDVPFGDMLFEGKAGGENAQDTGSLMDTSINNAVFEYGFPVEFFLDMLCRWGVTLPINQDRRLGDMIDAEQAAALCEALTGLDAADVRDNYLDDSLEDLSFDLDIPLPDLFQACAAQKINLPKGGDTHITIDEYKLLLDTVVDGGETSRARKLFDESRVTNRWTGQKEANSRELNQEDIAREIQKNNAGFGWREGPPILGDGEGELPLEQAHIGGRIFGEEIFASGYADSQHPGGWEEGEDEDGDDGFFFDDFG 408

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BLAST of mRNA_Ecto-sp8_S_contig1056.879.1 vs. uniprot
Match: A0A835ZEP7_9STRA (Uncharacterized protein n=1 Tax=Tribonema minus TaxID=303371 RepID=A0A835ZEP7_9STRA)

HSP 1 Score: 127 bits (318), Expect = 5.300e-30
Identity = 60/137 (43.80%), Postives = 90/137 (65.69%), Query Frame = 1

Query:  466 DVPFGDMLFEGKAGGENAQDTGSLMDTSINNAVFEYGFPVEFFLDMLCRWGVTLPINQDRRLGDMIDAEQAAALCEALTGLDAADVRDNYLDDSLDDLSFDLNIPLPDLFQACAAQKINLPKGGDTHITIDEYKLLL 876
            D+P G +L  G       +D G L D ++ +   +Y FPVEF  D+LCRWGV+ PI  D +LG +++ EQA A+ EALT +D A V D YLDD++++L++ L++P  D+F  C  ++ NLP G +TH+T +EY+ LL
Sbjct:    2 DIPSGSLL--GNMAFNPERDEGGLGDVTLADIADDYNFPVEFIYDVLCRWGVSPPIKLDDKLGSLVNGEQAFAVVEALTSVDPATVHDFYLDDTIEELAWALDVPPADIFAVCGRRRFNLPLGAETHLTNEEYRFLL 136

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BLAST of mRNA_Ecto-sp8_S_contig1056.879.1 vs. uniprot
Match: F0YKG5_AURAN (Uncharacterized protein n=1 Tax=Aureococcus anophagefferens TaxID=44056 RepID=F0YKG5_AURAN)

HSP 1 Score: 81.6 bits (200), Expect = 1.700e-12
Identity = 40/111 (36.04%), Postives = 67/111 (60.36%), Query Frame = 1

Query:  541 DTSINNAVFEYGFPVEFFLDMLCRWGVTLPINQDRRLGDMIDAEQAAALCEALTGLDAADVRDNYLDDSLDDLSFDLNIPLPDLFQACAAQKINLPKGGDTHITIDEYKLL 873
            D+++ +   +Y FP+ +  D +  +G+  PI  D R+ D++DA+QA AL EA+T LDAA+V D Y+   L  ++  L  PL ++F AC  +   LP G +T +  ++Y+ L
Sbjct:  167 DSTVADVADDYRFPISYVADAILGFGIPPPIRDDARIADILDADQAFALLEAVTSLDAAEVEDAYVAFDLARVAGLLEAPLAEVFAACVDEGFGLPHGVETQLRREQYEAL 277

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BLAST of mRNA_Ecto-sp8_S_contig1056.879.1 vs. uniprot
Match: B7FWK0_PHATC (Predicted protein (Fragment) n=2 Tax=Phaeodactylum tricornutum TaxID=2850 RepID=B7FWK0_PHATC)

HSP 1 Score: 75.9 bits (185), Expect = 1.510e-11
Identity = 38/114 (33.33%), Postives = 66/114 (57.89%), Query Frame = 1

Query:  520 QDTGSLMDTSINNAVFEYGFPVEFFLDMLCRWGVTLPINQDRRLGDMIDAEQAAALCEALTGLDAADVRDNYLDDSLDDLSFDLNIPLPDLFQACAAQKINLPKGGDTHITIDE 861
            ++ G L D+++N    +YG PV +  D+LC WGV +PI    RLGD++  EQA ++ EA+  LD + + D Y + +L  L  + +I L   F+    +  +LP G +T + +++
Sbjct:  156 REQGFLGDSTLNEIATDYGVPVCYLADVLCMWGVPVPIQVHDRLGDLVTGEQAFSILEAINSLDISALHDRYSNHNLIQLCAEYDIELQTAFEMAMKEGWSLPFGVNTCLRVEQ 269

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BLAST of mRNA_Ecto-sp8_S_contig1056.879.1 vs. uniprot
Match: A0A7S4A635_9STRA (Hypothetical protein n=1 Tax=Pelagomonas calceolata TaxID=35677 RepID=A0A7S4A635_9STRA)

HSP 1 Score: 74.3 bits (181), Expect = 4.770e-11
Identity = 42/128 (32.81%), Postives = 68/128 (53.12%), Query Frame = 1

Query:  541 DTSINNAVFEYGFPVEFFLDMLCRWGVTLPINQDRRLGDMIDAEQAAALCEALTGLDAADVRDNYLDDSLDDLSFDLNIPLPDLFQACAAQKINLPKGGDTHITIDEYKLLLDTVVEGGETSRARKLF 924
            D ++     +Y FPV +  D++  +GV  PI+    + D++DA+QA AL EA+T LDA++V D Y+   LD  +  L   L ++F  C      LP G +T +  D++  +  T+  G  +  AR  F
Sbjct:  107 DLTVEQVAVDYRFPVAYVADVITGFGVQPPISDAAVIRDLLDADQAFALLEAVTSLDASEVDDAYVSFGLDGCARRLEADLAEVFALCVDNNFALPHGVETRLRRDQFDTIARTL--GWRSDEARLPF 232

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BLAST of mRNA_Ecto-sp8_S_contig1056.879.1 vs. uniprot
Match: A0A7R9WWR6_9STRA (Hypothetical protein n=1 Tax=Craspedostauros australis TaxID=1486917 RepID=A0A7R9WWR6_9STRA)

HSP 1 Score: 74.7 bits (182), Expect = 8.040e-11
Identity = 40/123 (32.52%), Postives = 68/123 (55.28%), Query Frame = 1

Query:  520 QDTGSLMDTSINNAVFEYGFPVEFFLDMLCRWGVTLPINQDRRLGDMIDAEQAAALCEALTGLDAADVRDNYLDDSLDDLSFDLNIPLPDLFQACAAQKINLPKGGDTHITIDEYKLLLDTVV 888
            ++ G L D+++ +   +Y  P+ +  D+LC WGV +PI+ + +LGD++  EQA A+ EA+  LD   ++D Y + +L  +     I L D FQ    +  +LP G  TH+  ++   L  T V
Sbjct:  221 REPGYLGDSTLTDIATDYSVPICYLADVLCMWGVPVPIDPNSQLGDLVTGEQAFAILEAVYSLDVGVLQDRYSNQNLVQVCDLYEIELKDAFQFAMKEGWSLPFGVQTHLRTEQEDELKRTYV 343

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of mRNA_Ecto-sp8_S_contig1056.879.1 vs. uniprot

BLAST of mRNA_Ecto-sp8_S_contig1056.879.1 vs. uniprot
Analysis Date: 2022-09-19 (Diamond blastx: OGS1.0 vs UniRef90)
Total hits: 6


Match Name	E-value	Identity	Description
D7G8I4_ECTSI	2.290e-282	96.81	Uncharacterized protein n=2 Tax=Ectocarpus TaxID=2...	[more]
A0A835ZEP7_9STRA	5.300e-30	43.80	Uncharacterized protein n=1 Tax=Tribonema minus Ta...	[more]
F0YKG5_AURAN	1.700e-12	36.04	Uncharacterized protein n=1 Tax=Aureococcus anopha...	[more]
B7FWK0_PHATC	1.510e-11	33.33	Predicted protein (Fragment) n=2 Tax=Phaeodactylum...	[more]
A0A7S4A635_9STRA	4.770e-11	32.81	Hypothetical protein n=1 Tax=Pelagomonas calceolat...	[more]
A0A7R9WWR6_9STRA	8.040e-11	32.52	Hypothetical protein n=1 Tax=Craspedostauros austr...	[more]

Alignments

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
Ecto-sp8_S_contig1056	contig	Ecto-sp8_S_contig1056:10867..14753 +

Analyses

This mRNA is derived from or has results from the following analyses


Analysis Name	Date Performed
Diamond blastx: OGS1.0 vs UniRef90	2022-09-19
Ectocarpus species8 EcLAC_412 OGS1.0	2022-07-08

Properties


Property Name	Value
Taxonomic scope	Eukaryota
Stop	1
Start	1
Seed ortholog score	81.6
Seed ortholog evalue	9.1e-13
Seed eggNOG ortholog	44056.XP_009040959.1
Preferred name	PSEN1
Model size	1741
KEGG ko	ko:K04505,ko:K04522,ko:K06060
KEGG Pathway	ko04310,ko04330,ko04722,ko05010,ko05165,map04310,map04330,map04722,map05010,map05165
KEGG Module	M00682
Hectar predicted targeting category	signal peptide
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:0042221,GO:0042303,GO:0042306,GO:0042307,GO:0042325,GO:0042326,GO:0042327,GO:0042391,GO:0042461,GO:0042462,GO:0042500,GO:0042582,GO:0042592,GO:0042633,GO:0042659,GO:0042802,GO:0042803,GO:0042886,GO:0042981,GO:0042982,GO:0042987,GO:0042995,GO:0043005,GO:0043009,GO:0043010,GO:0043011,GO:0043025,GO:0043065,GO:0043066,GO:0043067,GO:0043068,GO:0043069,GO:0043085,GO:0043086,GO:0043170,GO:0043198,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043254,GO:0043269,GO:0043270,GO:0043292,GO:0043299,GO:0043312,GO:0043392,GO:0043393,GO:0043405,GO:0043406,GO:0043408,GO:0043410,GO:0043412,GO:0043413,GO:0043473,GO:0043523,GO:0043524,GO:0043549,GO:0043588,GO:0043589,GO:0043603,GO:0043949,GO:0044057,GO:0044070,GO:0044085,GO:0044087,GO:0044092,GO:0044093,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044297,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044427,GO:0044428,GO:0044429,GO:0044430,GO:0044433,GO:0044437,GO:0044441,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044449,GO:0044459,GO:0044463,GO:0044464,GO:0044671,GO:0045055,GO:0045121,GO:0045137,GO:0045165,GO:0045176,GO:0045177,GO:0045184,GO:0045202,GO:0045296,GO:0045321,GO:0045595,GO:0045596,GO:0045597,GO:0045664,GO:0045665,GO:0045666,GO:0045732,GO:0045747,GO:0045859,GO:0045860,GO:0045861,GO:0045862,GO:0045892,GO:0045893,GO:0045934,GO:0045935,GO:0045936,GO:0045937,GO:0046530,GO:0046649,GO:0046822,GO:0046824,GO:0046873,GO:0046903,GO:0046907,GO:0046983,GO:0048066,GO:0048143,GO:0048167,GO:0048190,GO:0048286,GO:0048468,GO:0048471,GO:0048489,GO:0048513,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0048534,GO:0048538,GO:0048562,GO:0048563,GO:0048568,GO:0048569,GO:0048580,GO:0048583,GO:0048584,GO:0048585,GO:0048592,GO:0048598,GO:0048608,GO:0048609,GO:0048646,GO:0048666,GO:0048699,GO:0048705,GO:0048708,GO:0048729,GO:0048731,GO:0048732,GO:0048736,GO:0048837,GO:0048854,GO:0048856,GO:0048869,GO:0048870,GO:0048878,GO:0050435,GO:0050673,GO:0050730,GO:0050732,GO:0050767,GO:0050768,GO:0050769,GO:0050770,GO:0050771,GO:0050773,GO:0050776,GO:0050778,GO:0050789,GO:0050790,GO:0050793,GO:0050794,GO:0050801,GO:0050804,GO:0050806,GO:0050808,GO:0050818,GO:0050820,GO:0050839,GO:0050851,GO:0050852,GO:0050877,GO:0050890,GO:0050896,GO:0050931,GO:0051049,GO:0051050,GO:0051093,GO:0051094,GO:0051098,GO:0051099,GO:0051100,GO:0051101,GO:0051128,GO:0051129,GO:0051130,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051173,GO:0051174,GO:0051179,GO:0051222,GO:0051223,GO:0051234,GO:0051239,GO:0051240,GO:0051241,GO:0051246,GO:0051247,GO:0051248,GO:0051252,GO:0051253,GO:0051254,GO:0051336,GO:0051338,GO:0051340,GO:0051347,GO:0051348,GO:0051352,GO:0051402,GO:0051438,GO:0051444,GO:0051563,GO:0051580,GO:0051582,GO:0051588,GO:0051590,GO:0051604,GO:0051606,GO:0051640,GO:0051641,GO:0051648,GO:0051649,GO:0051650,GO:0051656,GO:0051674,GO:0051703,GO:0051704,GO:0051716,GO:0051952,GO:0051954,GO:0051955,GO:0051957,GO:0051960,GO:0051961,GO:0051962,GO:0051966,GO:0052547,GO:0052548,GO:0055037,GO:0055065,GO:0055074,GO:0055080,GO:0055082,GO:0055085,GO:0060041,GO:0060047,GO:0060048,GO:0060070,GO:0060075,GO:0060173,GO:0060249,GO:0060255,GO:0060284,GO:0060291,GO:0060322,GO:0060341,GO:0060429,GO:0060541,GO:0060548,GO:0060562,GO:0060828,GO:0060998,GO:0060999,GO:0061053,GO:0061062,GO:0061097,GO:0061099,GO:0061136,GO:0061371,GO:0061458,GO:0061900,GO:0061919,GO:0065007,GO:0065008,GO:0065009,GO:0070001,GO:0070011,GO:0070050,GO:0070085,GO:0070201,GO:0070482,GO:0070588,GO:0070765,GO:0070838,GO:0070887,GO:0070925,GO:0070997,GO:0071310,GO:0071417,GO:0071495,GO:0071702,GO:0071704,GO:0071705,GO:0071840,GO:0071900,GO:0071902,GO:0071944,GO:0072358,GO:0072359,GO:0072503,GO:0072507,GO:0072511,GO:0080090,GO:0090087,GO:0090092,GO:0090287,GO:0090316,GO:0090596,GO:0090647,GO:0090702,GO:0097028,GO:0097447,GO:0097458,GO:0097479,GO:0097480,GO:0097708,GO:0098588,GO:0098589,GO:0098590,GO:0098609,GO:0098655,GO:0098657,GO:0098660,GO:0098662,GO:0098687,GO:0098771,GO:0098773,GO:0098796,GO:0098797,GO:0098805,GO:0098852,GO:0098857,GO:0098916,GO:0099003,GO:0099080,GO:0099081,GO:0099120,GO:0099177,GO:0099503,GO:0099504,GO:0099512,GO:0099536,GO:0099537,GO:0099568,GO:0099643,GO:0106027,GO:0120025,GO:0120035,GO:0120036,GO:0120038,GO:0140029,GO:0140096,GO:0150034,GO:0198738,GO:1900006,GO:1900180,GO:1900182,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901184,GO:1901185,GO:1901214,GO:1901215,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901652,GO:1901653,GO:1901698,GO:1901699,GO:1901700,GO:1901701,GO:1901800,GO:1902041,GO:1902042,GO:1902043,GO:1902531,GO:1902533,GO:1902679,GO:1902680,GO:1902903,GO:1902905,GO:1903050,GO:1903051,GO:1903052,GO:1903320,GO:1903321,GO:1903362,GO:1903363,GO:1903364,GO:1903506,GO:1903507,GO:1903508,GO:1903522,GO:1903789,GO:1903793,GO:1903827,GO:1903829,GO:1903844,GO:1903959,GO:1903961,GO:1904589,GO:1904591,GO:1904645,GO:1904646,GO:1904796,GO:1904797,GO:1904951,GO:1905037,GO:1905114,GO:1905906,GO:1905908,GO:1990535,GO:2000026,GO:2000058,GO:2000059,GO:2000060,GO:2000112,GO:2000113,GO:2000272,GO:2000677,GO:2000678,GO:2001023,GO:2001025,GO:2001141,GO:2001233,GO:2001234,GO:2001235,GO:2001236,GO:2001237,GO:2001238
Exons	6
EggNOG free text desc.	subunit of the gamma-secretase complex, an endoprotease complex that catalyzes the intramembrane cleavage of integral membrane proteins such as Notch receptors
EggNOG OGs	KOG2736@1,KOG2736@2759
Ec32 ortholog description	conserved unknown protein
Ec32 ortholog	Ec-14_003130.1
Cds size	1230
COG Functional cat.	O
Best tax level	Eukaryota
Best eggNOG OG	NA\|NA\|NA
BRITE	ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01002

Relationships

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
mRNA_Ecto-sp8_S_contig1056.879.1	prot_Ecto-sp8_S_contig1056.879.1	Ectocarpus species8 EcLAC_412	polypeptide	Ecto-sp8_S_contig1056 10867..14242 +

The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
1681143154.0908058-CDS-Ecto-sp8_S_contig1056:10866..11156	1681143154.0908058-CDS-Ecto-sp8_S_contig1056:10866..11156	Ectocarpus species8 EcLAC_412	CDS	Ecto-sp8_S_contig1056 10867..11156 +
1681143154.1176357-CDS-Ecto-sp8_S_contig1056:11768..11928	1681143154.1176357-CDS-Ecto-sp8_S_contig1056:11768..11928	Ectocarpus species8 EcLAC_412	CDS	Ecto-sp8_S_contig1056 11769..11928 +
1681143154.1278718-CDS-Ecto-sp8_S_contig1056:12286..12447	1681143154.1278718-CDS-Ecto-sp8_S_contig1056:12286..12447	Ectocarpus species8 EcLAC_412	CDS	Ecto-sp8_S_contig1056 12287..12447 +
1681143154.1369994-CDS-Ecto-sp8_S_contig1056:12707..12816	1681143154.1369994-CDS-Ecto-sp8_S_contig1056:12707..12816	Ectocarpus species8 EcLAC_412	CDS	Ecto-sp8_S_contig1056 12708..12816 +
1681143154.1459672-CDS-Ecto-sp8_S_contig1056:13165..13260	1681143154.1459672-CDS-Ecto-sp8_S_contig1056:13165..13260	Ectocarpus species8 EcLAC_412	CDS	Ecto-sp8_S_contig1056 13166..13260 +
1681143154.1554863-CDS-Ecto-sp8_S_contig1056:13827..14242	1681143154.1554863-CDS-Ecto-sp8_S_contig1056:13827..14242	Ectocarpus species8 EcLAC_412	CDS	Ecto-sp8_S_contig1056 13828..14242 +

The following UTR feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type	Position
1681143154.1647646-UTR-Ecto-sp8_S_contig1056:14242..14753	1681143154.1647646-UTR-Ecto-sp8_S_contig1056:14242..14753	Ectocarpus species8 EcLAC_412	UTR	Ecto-sp8_S_contig1056 14243..14753 +

Sequences

The following sequences are available for this feature:

protein sequence
mRNA from alignment at Ecto-sp8_S_contig1056:10867..14753+
coding sequence from alignment at Ecto-sp8_S_contig1056:10867..14753+

protein sequence of mRNA_Ecto-sp8_S_contig1056.879.1

>prot_Ecto-sp8_S_contig1056.879.1 ID=prot_Ecto-sp8_S_contig1056.879.1|Name=mRNA_Ecto-sp8_S_contig1056.879.1|organism=Ectocarpus species8 EcLAC_412|type=polypeptide|length=410bp
MRRCRPCALAAAATTCCCLRFSQGWNPVAILNPGLASAAARATPWSRAAR
VASARPSQHTRARAAIAAAVAPRDPWEAAGEEAKEGDEKGEKKVMPRLKM
DDSPIPEYLIDMLKESGDVDEDGKPVNDFFDPDEDDTFGTQRERDCLKEE
ELYYNDVPFGDMLFEGKAGGENAQDTGSLMDTSINNAVFEYGFPVEFFLD
MLCRWGVTLPINQDRRLGDMIDAEQAAALCEALTGLDAADVRDNYLDDSL
DDLSFDLNIPLPDLFQACAAQKINLPKGGDTHITIDEYKLLLDTVVEGGE
TSRARKLFDESRVTNRWTGQKEANSRELNQEDIAREIQKNNAGFGWREGP
PILGDGEGELPLEQAHIGGRIFGEEIFASGYADSQHPGGWEEGEDEDGEE
VFVFDDFGT*

mRNA from alignment at Ecto-sp8_S_contig1056:10867..14753+

Legend: polypeptideCDSUTR

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>mRNA_Ecto-sp8_S_contig1056.879.1 ID=mRNA_Ecto-sp8_S_contig1056.879.1|Name=mRNA_Ecto-sp8_S_contig1056.879.1|organism=Ectocarpus species8 EcLAC_412|type=mRNA|length=3887bp|location=Sequence derived from alignment at Ecto-sp8_S_contig1056:10867..14753+ (Ectocarpus species8 EcLAC_412)
ATGCGTCGGTGTAGACCTTGCGCCCTTGCAGCAGCGGCAACGACGTGCTG
CTGCTTGAGGTTCAGCCAAGGGTGGAACCCCGTTGCCATTCTGAACCCCG
GTTTGGCCTCTGCGGCAGCGAGAGCTACACCATGGTCTCGTGCGGCTCGG
GTGGCTTCAGCTCGGCCATCCCAACATACCCGAGCGAGAGCAGCAATTGC
AGCAGCGGTAGCGCCACGTGATCCCTGGGAAGCAGCTGGCGAGGAAGCGA
AGGAGGGCGATGAGAAAGGGGAAAAGAAGGTTATGCCACGGTGAGTGTGA
GGGTCGTGTACATAGTTGAAGTTGGTGCGTATTCTGGTTGGCTCGGGCAG
CAACTCCTAACCGCCTCACCAAGGGCCCACAGCTCGATATCACCGTTGCG
AAGGCGCTACGGCTCGCCACTGCAATACTAGTACAATGGTAGTCAGAAGT
ATGGGGCAAGCGTAGTGAAACCAGGGCGGTGTTGGTCTAGAATGCTGCGT
CGCGCTCGCTGTTGGCTTCACTGGATGTAATTGCTGTAAGGTGTTCGTGG
CTGCTGACCTGACCGCATCCTTGCGCCGTCCAAGCCGTATGCCACTGCTG
CGAACGCGTCGCACCAGGCACGTGCAATGTTGACATGAATGGATTGCAGG
ACCCCACATGCAATAACCTACCTGATATTGTCAGAAAGAATGGAACCTTC
CGCCTGTTCGTATGTTTACGTTGTAAACTCCTCAACTTGTTTGACGGAAT
TCAGTCACGTAGTCTCGCTCTGTTGACGTCGTTTCGTGTCGTCGACATAC
AGGGGGGCAGCGCCTCCGCAGCTGGTCTCATAGAACGACCCCCCCGTGTT
CCACACCGTGCCACCACCCCCTCCTCACACAACAAAACAAATGCGAAACC
AGCTTGAAGATGGACGACTCTCCCATCCCGGAATACCTGATCGACATGCT
CAAAGAGTCGGGAGACGTCGACGAAGACGGCAAACCCGTGAACGATTTCT
TCGATCCGGATGAGGACGACACGTTCGGGACTCAGAGAGAACGGGATTGC
CTCAAGGAAGAGGTAACACGTTTGTTTGTGAATGAAGCGCTTCGAAATTT
GAGGGCGTGCCGAGCGGGCTATGTTGTTACTGCTGTTGTTGGAGGTTTTT
GTCCTTATTTGGTAGTAGGGCGCAATGTAGCTGCCAGCTTCACGTTAATC
CCGACACACGAAAGCTTTTGAAGGTCACGAGGGATTCCTGACGATGGGCT
CGACGGCGTGATAGTGAAACTGCTGCACACTTTGAAAGGGTGACTGGTAG
AGCATCAACGGGGTGTTCCGTCCCACATTCCGATGTGCGTGGCATGTTTC
CCAATTTCGTGGATTCTGCTCCGTTCGGCCTTTCCAACAATAAACAATAC
CCACCGCACGCGGATGGCAGGAACTCTACTACAACGACGTGCCGTTTGGG
GACATGCTCTTCGAGGGCAAGGCTGGCGGCGAGAATGCGCAGGACACGGG
CAGTCTCATGGATACCTCTATCAACAACGCGGTCTTCGAATATGGTTTTC
CGGTGGAATTCTTCCTCGACATGCTCTGCAGGTATATACGATGCCACAAA
GAGCCCGTTCTCCTCTCAAGAGGTGTTACGAATGGCAAAGGACGTCATCG
TTACTGAGACCCTTTGCCGTGGCTGAGAAAAATTGGGCGCGGAAACACAA
CCACAATGCAGCTGTAACTCAGCTTGGGGAGTGTTTGGCCCCATAAACAC
CAAACACGATGGGGTCATTTAAGCCACGTGGACGGTTTCGCACCCCCCCC
CTTTCCATATTGCTGTTGTATTTCTGCTGTGTTTACCGAAGGTGGGGAGT
TACCCTGCCGATCAATCAAGACCGTCGGCTGGGGGATATGATCGACGCGG
AGCAGGCGGCGGCACTTTGCGAAGCTCTCACGGGCTTGGATGCTGCGGAT
GTAAGCCAAAAGTAGTGTCGACAAGAGACAATCCAGAGCGGAAAAGATAG
ACAGAGATGCGAGGGGCGGGGAGTACCGAGAGAGGGAGACAAGAGACCAA
GGCGCATGAGACAAGCATTAGAGAGTTTAGTGGGAGCAGACAAACAGAGA
AAACACGACAGTTTATACATATTGTCGAGGGAGCCTAATAATATGGGTGA
GTCACAACAGCTACCACAATACCCATTTGTACTTGTTTCCTTGGAGATTT
CAGTGAGGTACACGCGAGATCATTTCGTTGTCTTCCTTGCGCTCGCCTTT
TCTTGCTCTTCGCTCTTGGGTCGGTTGACTGGCATCGTCTCCAAACAAGG
TTCGAGATAACTACCTCGACGACTCCCTGGACGACCTGTCGTTCGACCTG
AACATCCCGCTGCCGGATCTTTTCCAGGCTTGCGCCGCACAAAAGTGAGC
GCTGACGGCTTGCTTGCTTTGTCGGCCTGGTTGGTGAACGGCCATGTATC
GGTGGGATGCCACTCCCAGAACCACGATCTGGAGCGGCTCACGTACATTG
CTCGATCACGCGGTAATGCCCAAGTGCCACGTGTTCATGGACTTGCTGGT
AGGCTTGGCTCGCACGAAAGGATTGTGTCCATGCGTCTTTGCATGGAGAA
GATTGTAGTTCGAGACCGAAATATTCACGTTGAACCTGGGCACAGGTTTT
GCCAGAATCCTGTACCGCGTCCTCACGCATATTCACAACTTTGTCGTCGT
CTTCCAAGATTCTGGTTGACACGTGTTGTCAACCACCCCAACCCAACCCA
TTTCTAAACGCTGGATCCTAACGTACCAATCCACCTTCCGGACTCATCAA
CCCTAAGTTCCACCGCTGCTCTCAACACAAACAGCACCCCCTTATGATTA
TGTGTTTCAAGTGACTCTTTCCAGGACAAGAGCTGGCCCATGATCCGCTC
CTTAACACTAGGTTTGATGTTCGGACCTACACCCCCGCTCACCCCGCTCT
GCCTCGAACAGAATCAACCTCCCGAAGGGCGGGGACACGCACATCACGAT
CGACGAGTACAAGCTTCTCCTCGACACCGTAGTCGAGGGCGGGGAGACGA
GCCGCGCCCGCAAGCTCTTCGACGAGAGCCGCGTGACCAACCGCTGGACC
GGACAGAAGGAGGCCAACAGCAGGGAGCTCAACCAGGAGGACATCGCGAG
GGAGATACAGAAGAACAACGCCGGGTTCGGCTGGAGAGAAGGTCCCCCCA
TCCTGGGAGATGGGGAGGGAGAGCTCCCCCTCGAGCAGGCCCACATCGGG
GGCAGGATTTTCGGGGAAGAGATCTTCGCGTCGGGGTACGCAGATTCGCA
GCATCCCGGGGGGTGGGAGGAAGGGGAGGATGAGGATGGAGAAGAGGTTT
TTGTTTTTGACGACTTCGGTACATAAAAGCAGATGGAGAGATGCATGCAG
CTACCACGGAGTTCCTCGTTTCGGATACAAGTACGCATGCAGGGGCAAAT
GGTCTTGGGACGGGAGCTTTTTGATTTGAGTTTCCCGAGTTTACCCGGGC
GACCTTGTGTTTGATGGAGGCCCGGATGACTGGATGCACGACGCTACCCT
TGGCGTGCGTTATCAAATTGGTTGTCTCCATGAGCTTTGCGGGAGAAAAA
GCAGTGTCCGGATTCTATGTAGTGTCGGGATTCTAGTACATACTTTCATA
GACTTAGTTGTGAGTTTGGTGTTTCATTATTAGATAGCACGTGGTGTTTT
CTTTCTCTTGCGTTCACGAGGCTTGTTCAGCCAACAACGTCAGTACTGAC
CCAGCGGGCATCGTAGTGCAAGCACTTATGACGTTCTGCCTCGCATCACC
TCTCCGAAACGTAGGATCCCCCCAGCGGGGGTGTGCCCCAGTCTCCCCGC
GGACACGAGTCGTCTTTTCAACGTATCTCCATTGCCC

Coding sequence (CDS) from alignment at Ecto-sp8_S_contig1056:10867..14753+

>mRNA_Ecto-sp8_S_contig1056.879.1 ID=mRNA_Ecto-sp8_S_contig1056.879.1|Name=mRNA_Ecto-sp8_S_contig1056.879.1|organism=Ectocarpus species8 EcLAC_412|type=CDS|length=1230bp|location=Sequence derived from alignment at Ecto-sp8_S_contig1056:10867..14753+ (Ectocarpus species8 EcLAC_412)
ATGCGTCGGTGTAGACCTTGCGCCCTTGCAGCAGCGGCAACGACGTGCTG
CTGCTTGAGGTTCAGCCAAGGGTGGAACCCCGTTGCCATTCTGAACCCCG
GTTTGGCCTCTGCGGCAGCGAGAGCTACACCATGGTCTCGTGCGGCTCGG
GTGGCTTCAGCTCGGCCATCCCAACATACCCGAGCGAGAGCAGCAATTGC
AGCAGCGGTAGCGCCACGTGATCCCTGGGAAGCAGCTGGCGAGGAAGCGA
AGGAGGGCGATGAGAAAGGGGAAAAGAAGGTTATGCCACGCTTGAAGATG
GACGACTCTCCCATCCCGGAATACCTGATCGACATGCTCAAAGAGTCGGG
AGACGTCGACGAAGACGGCAAACCCGTGAACGATTTCTTCGATCCGGATG
AGGACGACACGTTCGGGACTCAGAGAGAACGGGATTGCCTCAAGGAAGAG
GAACTCTACTACAACGACGTGCCGTTTGGGGACATGCTCTTCGAGGGCAA
GGCTGGCGGCGAGAATGCGCAGGACACGGGCAGTCTCATGGATACCTCTA
TCAACAACGCGGTCTTCGAATATGGTTTTCCGGTGGAATTCTTCCTCGAC
ATGCTCTGCAGGTGGGGAGTTACCCTGCCGATCAATCAAGACCGTCGGCT
GGGGGATATGATCGACGCGGAGCAGGCGGCGGCACTTTGCGAAGCTCTCA
CGGGCTTGGATGCTGCGGATGTTCGAGATAACTACCTCGACGACTCCCTG
GACGACCTGTCGTTCGACCTGAACATCCCGCTGCCGGATCTTTTCCAGGC
TTGCGCCGCACAAAAAATCAACCTCCCGAAGGGCGGGGACACGCACATCA
CGATCGACGAGTACAAGCTTCTCCTCGACACCGTAGTCGAGGGCGGGGAG
ACGAGCCGCGCCCGCAAGCTCTTCGACGAGAGCCGCGTGACCAACCGCTG
GACCGGACAGAAGGAGGCCAACAGCAGGGAGCTCAACCAGGAGGACATCG
CGAGGGAGATACAGAAGAACAACGCCGGGTTCGGCTGGAGAGAAGGTCCC
CCCATCCTGGGAGATGGGGAGGGAGAGCTCCCCCTCGAGCAGGCCCACAT
CGGGGGCAGGATTTTCGGGGAAGAGATCTTCGCGTCGGGGTACGCAGATT
CGCAGCATCCCGGGGGGTGGGAGGAAGGGGAGGATGAGGATGGAGAAGAG
GTTTTTGTTTTTGACGACTTCGGTACATAA